Heatmap: Cluster_2 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
11168-O,WT,biofilm extract
11168-O,WT,planktonic cell extract
CG8433,WT,mid-log,Mueller Hinton agar plate
CG8433,WT,mid-log,Mueller Hinton broth
CG8433,WT,mid-log,blood agar plate
NCTC11168,CRISPR-tracrRNA-KO
NCTC11168,WT
NCTC11168,WT,Fe limited
NCTC11168,WT,Fe replete
NCTC11168,WT,chicken intestinal mucus
NCTC11168,WT,cow intestinal mucus
NCTC11168,WT,defined media
NCTC11168,WT,pig intestinal mucus
NCTC11168,WT,sheep intestinal mucus
NCTC11168,WT,turkey intestinal mucus
NCTC11168,cas9-KO
NCTC11168,crRNA3-KO
NCTC11168,fur-KO,Fe limited
NCTC11168,fur-KO,Fe replete
NCTC11168,fur-KO,perR-KO,Fe limited
NCTC11168,fur-KO,perR-KO,Fe replete
NCTC11168,perR-KO,Fe limited
NCTC11168,perR-KO,Fe replete
NCTC11168,tracrRNA-KO
NCTC12661,WT,exponential,spiral
NCTC12661,WT,stationary,filamentous
NCTC12661,WT,stationary,spiral
PT14,WT,exponential,spiral
PT14,WT,stationary,filamentous
PT14,WT,stationary,spiral
Sheep Abortion,WT,24h bile inoculate
Sheep Abortion,WT,24h gallbladder inoculate
Sheep Abortion,WT,2h bile inoculate
Sheep Abortion,WT,2h gallbladder inoculate
Sheep Abortion,WT,laboratory culture
AHY39333 (CJ8421_00310)
-0.12 -0.56 -0.09 0.06 -1.08 -0.12 -0.26 0.6 0.04 -0.06 0.33 -0.21 0.34 0.31 -0.11 -0.59 -0.26 0.14 -0.07 0.17 -0.18 0.19 0.21 -0.24 -0.89 -2.69 -1.88 0.28 -0.87 -0.94 0.55 1.18 0.4 0.97 0.22
AHY39334 (fliM)
1.0 -0.35 -0.63 -1.19 -1.98 0.91 0.78 0.61 -0.21 -1.44 -1.12 -0.78 -1.26 -1.07 -1.77 0.51 0.73 0.32 -0.33 0.41 -0.23 0.19 -0.18 0.77 -0.03 -1.72 -0.72 0.4 -0.56 -1.36 0.16 1.46 -0.82 0.83 -0.35
AHY39365 (CJ8421_00470)
0.32 -0.57 -0.68 -0.03 -1.53 -1.73 -1.81 0.73 1.44 0.47 0.26 0.71 0.44 0.47 -0.12 -2.21 -2.53 0.23 1.14 0.06 0.81 0.41 1.0 -2.01 -1.89 -9.83 -9.68 -0.49 -0.99 -1.17 0.23 -0.37 0.26 0.36 0.84
AHY39366 (CJ8421_00475)
0.86 -1.06 -0.47 0.22 -1.16 -1.31 -1.39 0.6 1.39 0.42 0.44 0.57 0.58 0.62 0.11 -1.74 -2.14 0.21 1.15 0.09 0.81 -0.08 0.84 -1.61 -1.65 -5.44 -5.27 -0.56 -1.18 -2.02 -0.1 -0.54 0.08 0.37 0.73
AHY39381 (atpC)
-0.88 -0.99 0.57 -0.07 -0.77 -0.7 -0.49 0.07 0.31 -0.44 -0.25 0.13 -0.33 -0.37 -1.0 -1.0 -0.73 0.24 0.38 0.54 0.61 -0.76 -0.02 -0.88 0.58 -0.29 1.27 0.07 0.27 -1.68 0.11 -0.21 0.05 1.06 0.61
AHY39382 (CJ8421_00555)
-1.4 -1.16 0.16 -0.96 -1.75 -0.01 -0.21 0.45 0.66 -0.61 -0.59 0.06 -0.72 -0.41 -1.35 -0.39 -0.01 0.65 0.65 0.95 0.9 -0.59 0.08 -0.22 0.89 -0.4 1.68 -0.18 0.26 -2.61 -0.57 -0.57 -1.61 0.54 -0.21
AHY39389 (CJ8421_00590)
-0.93 -0.06 0.37 -0.24 -1.07 0.17 -0.06 0.28 0.77 -2.05 -1.42 -0.65 -1.83 -1.43 -2.28 -0.32 0.11 0.23 0.71 0.4 0.53 -0.57 -0.32 -0.21 -0.03 -1.27 0.65 0.49 -0.79 -3.02 0.74 0.6 0.05 1.65 0.64
AHY39390 (CJ8421_00595)
-0.67 0.16 0.49 0.07 -0.9 -1.01 -0.93 0.17 0.91 -1.44 -0.75 -0.4 -1.1 -0.71 -1.61 -1.4 -1.16 0.34 0.83 0.5 0.6 -0.59 0.07 -1.12 0.52 -0.46 1.11 0.57 -0.17 -2.02 0.5 0.02 -0.03 1.38 0.23
AHY39391 (CJ8421_00600)
-1.98 -0.49 0.22 -0.52 -1.33 -0.63 -0.6 0.24 0.84 -1.33 -0.62 -0.37 -0.88 -0.58 -1.62 -1.05 -0.9 0.5 0.78 0.83 0.73 -0.67 -0.12 -0.76 0.66 -0.58 1.22 0.55 -0.1 -1.91 0.51 0.1 -0.17 1.39 0.21
AHY39397 (CJ8421_00640)
-0.02 -1.99 0.47 -1.08 -0.87 0.51 0.33 0.1 -0.14 -0.58 -0.09 -0.05 -0.4 0.14 -0.47 -0.12 0.07 0.72 0.04 1.05 0.52 -0.17 0.37 0.3 0.35 -0.0 -0.25 -0.98 0.02 -0.29 -0.07 -0.21 -0.33 0.16 -0.32
AHY39424 (CJ8421_00775)
0.61 0.62 -0.11 -0.49 -1.37 -0.64 -1.01 0.82 0.34 -0.28 -0.33 0.55 0.06 0.06 -1.03 -1.19 -0.71 0.69 0.32 0.62 0.1 0.39 -0.19 -0.71 0.24 -0.05 0.18 0.19 -0.39 -1.0 0.04 0.92 -0.77 0.02 -0.82
AHY39425 (CJ8421_00780)
-0.58 0.49 0.02 -0.75 -0.3 0.74 0.67 0.27 -0.1 -0.93 0.19 0.23 -0.05 -0.31 -1.47 0.53 0.69 -0.04 -0.08 -0.04 -0.33 -0.26 -0.86 0.53 -0.21 -0.51 -0.29 0.34 -0.6 -1.38 0.44 0.85 -0.4 0.25 -0.39
AHY39454 (CJ8421_00935)
-0.36 -1.02 -1.01 -2.48 -3.13 1.21 1.39 0.21 -0.27 -1.04 -2.02 -0.02 -1.59 -1.38 -2.44 0.53 0.73 0.69 -0.6 1.11 0.42 -0.4 0.08 1.11 0.6 -1.78 0.18 -0.42 -0.18 -0.95 0.12 0.51 -0.79 0.35 0.15
AHY39466 (CJ8421_00995)
0.75 -0.88 0.06 -0.72 -0.87 0.63 0.58 0.62 -0.1 -0.37 -0.21 -0.18 -0.47 -0.24 -0.34 0.33 0.49 0.63 -0.14 0.68 0.07 0.37 -0.09 0.47 -0.16 0.35 -0.78 -0.59 -0.58 -0.81 -0.02 -0.06 -0.81 -0.15 -0.4
AHY39476 (infC)
0.51 -1.4 -0.33 -1.54 -1.43 0.43 0.35 0.27 0.25 -0.21 -0.12 0.27 -0.41 -0.16 -0.55 0.04 0.22 0.78 0.22 0.77 0.55 0.03 0.22 0.4 -0.41 -0.94 -0.95 -0.87 -0.05 -2.27 -0.01 0.12 0.0 0.86 0.26
AHY39532 (fabZ)
0.07 0.09 0.31 -0.9 -0.55 0.46 0.4 0.14 -0.28 -0.89 -0.34 0.08 -0.87 -0.66 -1.01 0.45 0.4 0.21 -0.22 0.33 0.03 -0.74 -0.74 0.49 -0.07 -0.12 -0.12 0.06 -0.44 -1.32 0.47 0.76 0.15 0.8 0.33
AHY39533 (CJ8421_01365)
0.55 -0.59 0.16 -0.98 -0.85 0.63 0.57 0.19 -0.29 -1.47 -0.99 -0.06 -1.34 -1.2 -1.86 0.27 0.69 0.28 -0.18 0.41 0.06 -0.72 -0.65 0.56 0.07 -0.36 0.17 0.4 -0.23 -1.19 0.35 1.05 -0.24 0.91 0.19
AHY39554 (CJ8421_01485)
3.38 0.08 0.99 -0.62 -0.16 -4.6 -3.88 0.62 1.54 -0.3 -1.79 -2.08 -2.01 -0.27 -1.31 -6.4 -4.67 0.28 1.16 0.27 1.17 0.35 1.02 -4.32 -3.49 - - -0.94 -1.36 -3.88 -2.85 -1.17 -3.02 -1.84 -1.91
AHY39555 (CJ8421_01490)
2.4 -0.03 3.88 2.69 2.88 - - - - - - - - - - - - - -5.52 - - - - - - -6.11 - -7.1 - -6.08 - - - -3.3 -
AHY39556 (CJ8421_01495)
3.6 1.73 3.28 2.07 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AHY39557 (CJ8421_01500)
3.32 2.12 2.82 2.07 3.22 - - -7.26 -8.06 -7.92 -9.46 -8.75 -8.8 -7.37 -9.86 - - -9.09 -10.03 - - -7.74 -8.02 - -11.22 -6.46 -9.3 -9.48 -11.64 -8.88 -7.06 - -6.04 -7.65 -7.83
AHY39558 (CJ8421_01505)
4.34 3.4 1.35 -0.26 -0.54 - -3.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AHY39559 (CJ8421_01510)
3.68 2.29 -0.42 -2.89 -2.07 - - 0.15 -0.75 -5.4 -4.04 1.06 -2.84 -4.43 -5.53 -4.01 - 0.26 -0.21 0.41 -0.8 0.02 -0.93 -3.51 0.51 -0.64 0.47 -3.85 -3.65 -5.22 -0.51 0.8 -3.04 -2.37 -4.02
AHY39560 (CJ8421_01515)
3.97 2.86 2.28 0.29 1.3 - - - -7.1 - - - - - -7.46 - - - - - - - - - 0.93 -0.74 -0.05 -7.75 - - - - - - -
AHY39582 (CJ8421_01625)
-0.92 -2.32 -0.19 -0.44 -1.62 -0.12 -0.08 0.23 0.99 -1.73 -1.24 -0.24 -1.68 -1.39 -2.33 -0.35 -0.15 0.91 1.18 1.24 1.14 -0.55 0.07 -0.19 0.46 -0.42 0.29 -0.42 0.43 -1.52 -0.09 1.03 -1.09 1.05 -0.9
AHY39583 (CJ8421_01630)
-1.21 -1.36 -0.44 -0.64 -1.87 -0.12 0.14 -0.06 0.89 -1.47 -1.44 0.14 -1.83 -1.54 -2.7 -0.27 -0.31 0.64 1.06 0.92 0.85 -0.5 0.15 -0.02 0.4 -0.12 0.23 -0.35 0.66 -0.54 0.24 1.31 -1.01 1.07 -0.8
AHY39586 (ndk)
-3.36 -2.33 -0.37 -0.42 -0.71 -0.86 -0.68 -0.61 0.93 -0.75 -0.22 0.18 -0.45 -0.58 -1.25 -0.95 -1.12 0.34 1.07 0.51 0.7 -0.16 0.41 -0.79 0.75 0.79 0.42 0.06 0.64 0.31 -0.01 0.79 -0.7 0.61 -0.42
AHY39598 (uvrA)
1.55 -0.79 0.3 -0.26 -0.58 -0.03 -0.15 0.25 -0.62 -0.22 -0.26 0.04 -0.34 -0.22 -0.44 -0.37 -0.07 0.14 -0.69 0.26 -0.2 0.27 -0.11 -0.07 -0.18 -0.24 -0.72 -0.05 -0.28 -0.74 0.44 0.37 0.31 0.53 0.36
AHY39621 (CJ8421_01830)
0.43 -1.17 0.5 -0.27 -0.4 -1.59 -1.54 0.29 -0.91 0.03 -0.59 0.46 -0.06 -0.55 -0.58 -2.03 -1.72 0.23 -0.56 0.35 -0.35 -0.52 -0.94 -1.68 0.5 -0.32 0.18 -0.19 -0.6 -1.8 1.29 1.37 0.25 1.93 0.3
AHY39622 (CJ8421_01835)
0.94 -0.7 0.64 -0.25 -0.06 -2.32 -2.37 -0.49 -1.22 0.39 -0.11 0.2 0.37 -0.12 0.04 -2.85 -2.49 -0.52 -0.83 -0.33 -0.55 -1.01 -1.17 -2.4 0.2 -1.52 -0.03 -0.62 -1.29 -2.64 1.32 1.47 0.6 2.35 0.23
AHY39623 (CJ8421_01840)
-0.31 -1.52 0.39 -0.59 -0.14 -2.35 -2.58 -0.35 -1.1 0.44 -0.73 0.45 -0.18 -0.46 -0.36 -3.0 -2.49 -0.22 -0.72 -0.16 -0.52 -0.4 -0.96 -2.59 0.1 -1.14 -0.35 -0.69 -1.2 -0.47 1.45 1.89 0.94 2.38 0.24
AHY39659 (CJ8421_02020)
-1.96 -0.19 0.52 -0.03 -0.82 -2.06 -1.92 0.64 0.46 0.24 0.45 0.66 0.59 0.44 0.27 -2.6 -2.16 0.13 -0.01 -0.25 -0.34 0.18 0.15 -2.37 0.41 -1.05 0.92 0.88 -1.14 -1.94 0.5 0.24 0.02 0.64 0.35
AHY39670 (CJ8421_02075)
-0.55 0.45 1.64 1.48 1.63 -1.01 -0.86 -1.45 -2.94 -0.39 -1.67 -0.45 -2.12 -1.63 -0.66 -1.06 -1.33 -1.66 -3.47 -1.44 -1.8 1.02 -0.37 -0.97 0.01 1.93 -0.27 0.25 -0.65 -0.56 0.81 -0.57 0.47 -0.25 0.42
AHY39671 (CJ8421_02080)
-0.23 -0.18 2.34 2.22 2.12 -2.94 -2.71 -1.17 -2.79 -0.87 -1.71 -1.1 -2.2 -1.81 -0.82 -3.2 -3.14 -1.37 -3.55 -1.21 -1.79 0.62 -0.57 -2.78 -0.29 0.99 -0.45 0.36 -0.88 -1.06 1.04 -1.55 0.52 -0.25 0.69
AHY39713 (nusA)
0.07 0.05 -0.67 -1.95 -1.93 0.97 0.75 -0.23 -0.5 -0.89 -0.9 0.31 -1.14 -0.92 -1.46 0.73 0.85 0.02 -0.78 0.01 -0.31 0.2 -0.48 1.0 0.54 -0.09 0.04 -0.34 0.41 -0.9 0.07 1.03 -0.38 0.38 -0.11
AHY39726 (nusG)
-0.41 -1.48 -0.09 -0.64 -1.04 -1.61 -1.43 0.34 -0.04 -0.29 -0.27 0.58 -0.07 -0.33 -0.59 -1.77 -1.97 0.32 -0.41 0.71 0.19 -0.28 -0.34 -1.49 0.39 -0.43 -0.22 0.65 1.47 0.99 0.01 1.23 -0.33 0.71 0.02
AHY39728 (rplA)
-2.14 -2.45 0.15 0.13 -0.8 -2.29 -2.0 0.24 -0.16 0.3 0.24 0.56 0.41 0.18 -0.07 -2.39 -2.73 0.44 -0.42 0.66 0.08 -0.45 -0.1 -2.02 0.55 -0.16 -0.17 0.57 1.53 0.77 -0.01 0.31 -0.1 0.34 0.28
AHY39729 (rplJ)
-0.51 -1.61 0.59 0.82 -0.44 -1.33 -1.06 -0.12 0.17 -0.54 -1.08 0.56 -1.01 -0.84 -1.37 -1.21 -1.65 0.3 -0.23 0.33 0.81 -0.16 0.66 -1.05 0.31 0.49 0.46 0.3 0.56 0.17 0.17 0.07 -0.19 0.95 0.41
AHY39730 (rplL)
0.47 -0.83 0.29 0.55 -0.59 -1.28 -1.22 0.17 0.07 -0.78 -0.85 0.11 -1.18 -1.05 -1.2 -1.63 -1.62 0.41 -0.32 0.48 0.68 -0.02 0.62 -1.11 0.24 0.37 0.26 0.15 0.45 -0.1 -0.01 -0.14 0.75 1.01 0.76
AHY39731 (rpoB)
0.42 -0.73 0.59 0.41 -0.7 -0.36 -0.52 0.1 0.3 0.14 -0.16 0.28 -0.14 -0.07 -0.43 -0.86 -0.75 0.14 0.04 0.31 0.4 -0.49 0.26 -0.36 0.29 -0.32 0.17 0.34 0.24 -1.29 0.14 -0.05 -0.09 0.51 0.08
AHY39732 (CJ8421_02395)
0.09 -1.33 0.75 0.81 -0.33 -1.23 -1.22 0.09 0.19 0.37 0.1 0.3 0.04 0.15 -0.06 -1.56 -1.67 0.04 0.02 0.23 0.29 -0.55 0.19 -1.17 0.39 -0.28 0.06 0.58 -0.51 -2.23 0.28 -0.59 0.65 0.64 0.67
AHY39737 (CJ8421_02420)
2.14 -1.41 -3.12 -4.57 -3.79 1.03 0.74 0.34 -0.74 -3.23 -4.29 0.03 -4.12 -4.05 -5.7 0.61 0.87 0.48 -1.15 0.73 -0.16 -0.94 -1.09 0.92 0.72 -0.55 -0.31 0.18 1.53 -0.46 -0.71 1.4 -2.06 -0.18 -2.4
AHY39747 (CJ8421_02480)
-0.17 -1.2 0.81 -0.34 -0.3 -0.62 -0.43 0.09 0.0 -1.24 -1.07 0.24 -1.19 -1.12 -2.08 -0.64 -0.62 0.48 -0.25 0.65 0.39 -0.33 -0.14 -0.47 0.8 0.67 0.03 0.61 0.67 -0.88 0.55 1.09 -0.59 0.76 -0.22
AHY39790 (CJ8421_02695)
-1.19 -0.16 0.85 -0.03 -0.21 -0.61 -0.74 -0.07 0.44 -0.01 0.43 0.07 0.25 0.31 0.1 -0.72 -0.65 0.32 0.43 0.53 0.52 -0.41 0.21 -0.72 -0.03 0.01 -0.11 -0.61 -0.18 -1.09 0.35 0.31 -0.29 0.07 0.0
AHY39916 (ispG)
0.54 -0.17 0.34 0.19 0.08 -0.42 -0.74 0.35 -0.29 -0.24 0.44 -0.53 0.26 0.17 0.05 -0.57 -0.34 0.21 -0.13 0.24 -0.35 0.16 -0.43 -0.66 0.18 0.03 0.21 -0.01 -0.75 -1.04 0.28 0.42 0.21 0.39 0.15
AHY39932 (CJ8421_03465)
1.43 1.1 -1.09 -1.7 -3.29 0.55 0.36 0.71 0.43 -0.73 -1.46 -0.25 -1.51 -0.73 -1.72 0.09 0.57 0.84 0.42 0.91 0.35 0.14 0.12 0.19 -0.16 -0.34 -0.08 -1.23 -0.5 -2.8 -0.04 0.63 -1.17 -0.14 -0.88
AHY40051 (CJ8421_04120)
1.06 -0.32 0.29 0.17 0.23 -0.38 -0.47 0.9 -0.39 -0.57 -0.45 -0.21 -0.6 -0.48 -0.81 -0.58 -0.25 0.81 -0.38 0.64 -0.27 0.8 0.22 -0.61 -0.01 -0.28 -0.55 0.23 -0.48 -0.8 -0.05 0.01 0.03 0.4 -0.0
AHY40171 (CJ8421_04740)
0.1 -1.22 -0.01 -0.99 -1.8 0.92 0.88 -0.06 0.55 -0.41 -0.92 0.28 -0.9 -0.51 -1.5 0.49 0.73 0.39 0.45 0.86 0.71 -0.59 0.11 0.68 0.34 -1.53 -0.02 -0.75 -0.06 -1.79 -0.1 0.5 -1.1 0.05 -0.59
AHY40172 (CJ8421_04745)
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AHY40251 (thiH)
0.15 -0.25 0.62 0.49 0.2 -0.57 -0.66 0.67 0.16 -0.36 -0.39 0.09 -0.57 -0.39 -0.53 -0.89 -0.47 0.45 0.23 0.58 0.12 0.65 0.43 -0.89 -0.29 -1.45 -1.01 0.26 -0.52 -1.31 0.39 -0.13 0.32 0.69 0.39
AHY40254 (CJ8421_05200)
-2.83 -0.98 -1.89 -1.94 -3.26 -0.09 -0.14 0.81 0.51 -0.47 0.05 0.18 -0.36 0.47 -0.05 -0.24 -0.16 0.81 0.6 0.67 0.38 0.98 0.77 -0.26 -0.36 -0.88 -0.79 0.0 -0.59 -0.58 0.2 0.22 -0.22 0.84 0.08
AHY40296 (CJ8421_05420)
1.05 0.73 -0.76 -1.7 -2.42 0.94 0.71 0.5 0.22 -0.98 -1.92 0.25 -1.79 -1.59 -2.51 0.81 1.0 0.77 0.12 0.86 0.23 -0.05 -0.29 0.74 0.07 -1.55 -0.25 -0.3 -0.95 -2.65 -0.19 0.22 -0.81 0.03 -0.07
AHY40297 (leuS)
0.18 -0.81 0.21 -0.27 -1.2 0.34 0.22 0.36 0.33 -0.31 -0.36 0.07 -0.42 -0.42 -0.79 0.02 0.47 0.62 0.32 0.65 0.38 -0.08 0.14 0.25 0.02 -0.76 -0.19 -0.01 -0.51 -1.56 0.01 -0.01 -0.08 0.25 0.34
AHY40298 (secF)
1.11 -0.15 0.35 -0.31 -1.23 -0.43 -0.61 0.27 0.31 -0.47 -0.74 0.06 -0.73 -0.52 -1.19 -0.86 -0.47 0.56 0.29 0.6 0.51 -0.19 0.14 -0.5 0.08 -0.43 0.08 0.03 0.04 -0.54 0.28 0.46 -0.27 0.57 0.49
AHY40299 (secD)
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AHY40302 (CJ8421_05450)
-0.22 0.26 1.24 0.82 0.77 -1.6 -1.39 0.08 0.67 -0.12 -0.3 -0.02 -0.65 -0.53 -0.43 -1.53 -1.7 0.29 0.41 0.47 0.61 0.23 0.79 -1.4 -0.72 0.25 -0.8 -0.83 -0.34 -0.99 0.3 0.13 -0.21 0.17 0.04
AHY40376 (CJ8421_05830)
1.95 -0.25 0.78 0.53 0.03 -2.85 -2.62 -0.12 -0.18 0.23 0.08 0.16 0.1 -0.18 -0.07 -3.07 -2.84 0.26 -0.5 0.37 0.3 0.05 0.37 -2.61 0.01 0.13 -0.21 -0.45 -0.55 -0.74 -0.1 -0.29 0.06 0.25 0.69
AHY40377 (CJ8421_05835)
2.04 -0.03 0.57 0.36 -0.39 -0.88 -0.73 -0.03 0.03 -0.02 -0.25 -0.24 -0.69 -0.22 -0.19 -1.06 -1.15 0.27 -0.25 0.53 0.48 -0.12 0.43 -0.84 -0.12 0.07 -0.58 -0.84 -0.54 -0.77 0.07 -0.27 -0.31 0.22 0.29
AHY40380 (argS)
1.01 0.5 -0.03 -0.82 -0.78 -0.46 -0.52 0.69 0.29 -0.2 0.07 0.27 -0.12 -0.01 -0.41 -0.83 -0.53 0.64 0.29 0.53 0.15 -0.04 -0.21 -0.56 -0.08 -0.52 0.08 0.05 -0.28 -0.99 -0.08 0.67 -0.7 0.27 -0.21
AHY40388 (CJ8421_05905)
-1.39 -0.29 0.39 1.37 0.12 -1.7 -1.54 -1.43 1.02 -0.74 0.15 -0.09 0.01 0.12 -0.55 -1.85 -1.78 -0.74 0.64 -0.68 0.9 -0.47 1.28 -1.58 0.16 -0.8 0.16 -0.02 -0.96 -1.28 0.74 0.03 0.35 0.65 0.44
AHY40389 (CJ8421_05910)
-0.94 -0.95 0.35 1.32 0.03 -2.39 -2.15 -1.28 1.22 -1.09 -0.45 0.08 -0.73 -0.71 -1.28 -2.51 -2.4 -0.57 0.81 -0.4 1.18 -0.21 1.52 -2.24 0.38 -0.35 0.39 0.14 -0.61 -0.8 0.73 0.18 0.09 0.63 0.31
AHY40390 (CJ8421_05915)
-0.91 -0.67 0.01 1.01 0.06 0.93 0.31 -1.74 0.69 -0.91 0.08 -0.39 -0.29 -0.18 -0.58 0.21 0.75 -1.0 0.28 -0.84 0.62 -0.47 0.87 0.56 -0.2 -0.5 -0.19 -0.72 -1.24 -1.38 0.31 0.08 0.05 0.29 -0.13
AHY40410 (CJ8421_06015)
0.08 -0.5 -0.34 -1.33 -1.16 0.03 -0.09 0.62 0.33 -0.48 0.02 0.06 -0.17 -0.09 -0.19 -0.41 -0.08 0.51 0.3 0.25 0.05 0.57 -0.06 -0.22 -0.4 -0.29 -0.21 -0.39 -0.82 -0.61 0.46 0.27 0.44 0.47 0.8
AHY40413 (CJ8421_06030)
1.38 0.45 -0.62 -0.61 -0.72 -0.51 -0.9 0.1 -0.08 0.11 0.33 0.01 0.27 0.23 -0.13 -0.97 -0.52 0.06 -0.17 0.07 -0.17 -0.18 -0.51 -0.68 0.23 0.27 0.19 -0.04 0.1 -0.64 0.22 0.7 0.01 0.22 -0.37
AHY40457 (CJ8421_06250)
0.81 -0.23 0.38 0.19 -0.65 -1.05 -1.2 -0.42 0.14 -0.31 0.49 -0.58 0.21 0.35 -0.26 -1.52 -1.24 -0.07 0.09 0.3 0.31 -1.44 -0.14 -1.34 0.77 -0.15 1.26 0.23 -0.72 -2.93 0.41 0.05 0.46 0.86 -0.01
AHY40504 (CJ8421_06485)
0.76 -0.25 -0.35 -0.97 -1.93 0.14 0.11 0.21 0.14 -0.71 -0.1 -0.63 -0.71 -0.11 -0.61 0.03 0.43 0.27 0.31 0.44 0.29 -0.23 0.27 0.1 0.53 0.23 0.79 -0.04 -1.63 -3.62 0.45 -0.12 -0.34 0.77 0.11
AHY40558 (ruvB)
0.25 -1.88 -0.13 -1.59 -0.4 0.6 0.72 0.49 -0.29 -0.22 0.3 -0.08 0.36 0.25 -0.07 0.42 0.49 0.37 -0.18 0.66 0.15 -0.33 -0.58 0.5 0.17 0.13 -0.36 -0.67 -0.63 -1.24 -0.08 0.46 -0.6 -0.01 -0.86
AHY40561 (CJ8421_06865)
-1.4 -0.78 -0.48 -1.11 -1.25 1.02 0.79 0.91 0.12 -0.7 -0.41 0.03 -0.35 -0.35 -0.79 0.49 1.08 0.82 0.15 0.63 0.02 0.14 -0.38 0.43 -1.66 -11.15 -10.82 0.63 -0.82 -1.59 0.08 0.18 0.04 0.68 0.5
AHY40599 (acpS)
-2.98 -1.76 -0.25 -1.41 -0.51 -0.16 0.2 -0.18 -0.16 -0.95 0.25 0.37 -0.09 -0.05 -0.89 -0.36 -0.2 -0.21 -0.14 -0.16 -0.09 -0.17 -0.52 -0.35 0.96 -1.26 1.02 0.68 0.01 -1.31 0.56 1.35 -0.49 1.25 0.31
AHY40600 (CJ8421_07095)
-0.14 0.27 0.14 -0.66 -0.83 -0.25 -0.19 0.62 0.3 -0.58 0.54 0.17 0.31 0.35 -0.55 -0.58 -0.09 0.52 0.47 0.63 0.13 -0.29 -0.45 -0.46 0.22 -1.06 -0.1 0.21 -0.31 -1.73 -0.06 0.79 -0.68 0.15 0.05
AHY40616 (CJ8421_07175)
2.37 0.77 3.8 3.39 1.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.24 -3.87 -3.89 - - - - - - -7.34 -
AHY40617 (CJ8421_07180)
- - 4.25 3.65 1.78 - - - - - - - - - -8.22 - - - -8.6 -9.22 - - -9.2 - - - - - - - - - - - -
AHY40618 (CJ8421_07195)
-3.67 -3.43 2.84 2.3 1.2 -0.86 -0.81 0.05 0.57 0.07 0.87 -0.71 0.68 0.7 0.41 -1.1 -0.99 0.21 0.57 0.3 0.5 -0.44 0.34 -0.98 - - - - - - - - - - -
AHY40619 (CJ8421_07200)
- - 4.04 3.57 2.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AHY40620 (CJ8421_07205)
2.95 1.15 3.13 1.75 1.21 0.81 0.23 -3.5 -3.47 -6.21 - -2.05 - - - 0.28 0.86 -3.17 -3.44 -3.39 -4.08 -2.55 -3.51 0.56 -4.48 - - -1.45 -2.18 -3.82 -1.94 -0.96 -2.11 -1.5 -4.18
AHY40621 (CJ8421_07210)
2.77 -0.16 1.86 1.05 0.89 1.56 1.56 -0.43 -0.78 -2.4 -4.37 -1.32 -4.97 -3.68 -4.8 1.15 1.37 -0.35 -0.93 -0.25 -0.7 -1.07 -0.91 1.48 -6.49 - - -4.68 -5.52 -5.56 -4.62 -3.6 -5.99 -4.17 -5.9
AHY40622 (CJ8421_07215)
- - 3.98 3.31 3.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AHY40623 (CJ8421_07220)
-9.38 -9.93 4.15 3.45 2.64 -11.86 -11.87 -11.92 -11.65 -12.36 -10.34 -11.42 -11.14 -11.81 -11.49 -12.06 -11.91 -11.9 -11.59 -11.87 -11.72 -11.74 -11.77 -11.56 -11.15 -11.24 -10.74 -11.14 -11.35 -11.26 -9.47 -9.9 -9.43 -9.39 -9.5
AHY40624 (CJ8421_07225)
- - 4.43 2.76 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AHY40658 (rpsI)
1.21 0.18 0.41 -0.01 -0.42 0.36 0.46 -0.19 0.53 -0.89 -1.09 -1.13 -1.31 -1.1 -1.33 0.21 -0.1 0.57 0.19 0.88 0.99 0.16 0.85 0.53 -0.61 0.8 -1.76 -2.58 0.16 -1.02 -0.6 -0.9 -0.51 -0.88 -0.05
AHY40659 (rplM)
-0.14 -0.24 -0.24 -0.75 -1.67 0.85 1.15 -0.37 0.53 -0.1 -0.7 -0.81 -0.97 -0.44 -0.58 0.9 0.51 0.46 0.17 0.79 0.88 -0.03 0.68 1.01 -0.69 0.73 -1.8 -2.66 0.13 -1.1 -0.32 -0.45 -1.27 -1.2 -0.83
AHY40663 (CJ8421_07430)
0.64 -1.25 0.86 0.33 -0.99 -1.17 -1.14 -0.67 1.43 -1.01 -0.87 0.3 -1.4 -0.96 -1.73 -1.41 -1.46 -0.38 1.29 -0.17 1.2 -0.72 1.13 -1.27 0.32 -0.38 0.48 -0.27 -0.05 -1.18 0.43 0.52 -0.79 0.71 -0.43
AHY40665 (CJ8421_07440)
-1.05 0.49 0.63 1.03 -0.18 -2.25 -2.39 -1.03 0.89 0.42 0.9 0.1 0.75 0.96 0.63 -2.73 -2.23 -0.92 0.84 -0.94 0.46 -0.84 0.92 -2.24 -0.46 -0.2 -0.36 -1.04 -0.87 -1.27 0.36 -0.18 -0.07 0.2 0.18
AHY40667 (CJ8421_07450)
-2.95 -0.39 0.16 0.03 -1.58 -1.84 -1.32 -0.4 1.64 0.15 -1.64 0.88 -1.67 -1.17 -1.88 -1.62 -1.47 -0.23 1.5 -0.14 1.27 -0.03 1.87 -1.56 -0.27 0.02 -0.14 -0.56 -0.25 -0.64 0.56 -0.21 -0.77 0.22 0.18
AHY40668 (CJ8421_07455)
-0.63 0.09 0.77 1.08 0.17 -3.0 -2.93 -1.02 1.01 0.45 0.8 0.21 0.53 0.63 0.63 -3.13 -2.96 -0.88 0.89 -0.79 0.59 -0.5 1.09 -2.91 -0.74 -0.72 -0.61 -0.9 -0.87 -1.18 0.5 -0.22 0.2 0.31 0.06
AHY40669 (CJ8421_07460)
0.4 0.18 0.55 0.9 -0.03 -1.11 -1.08 -0.9 1.02 0.26 0.51 0.1 0.19 0.3 0.29 -1.21 -1.21 -0.8 0.94 -0.58 0.71 -0.27 1.04 -0.95 -0.6 -0.42 -0.69 -0.77 -0.52 -1.09 0.29 -0.4 -0.24 -0.1 -0.24
AHY40687 (CJ8421_07550)
0.02 2.19 -0.16 1.57 -1.34 -1.87 -1.81 -1.16 -2.52 -0.78 -0.79 -0.94 -0.97 -0.55 -0.9 -1.79 -1.37 -1.04 -2.91 -0.95 -2.66 -0.4 -0.89 -1.69 0.73 -0.62 -0.13 1.37 0.32 -0.33 1.58 1.11 -0.14 0.78 0.45
AHY40688 (CJ8421_07555)
0.58 1.29 0.29 2.11 -0.41 -1.58 -1.31 -1.69 -2.88 -0.52 0.15 -1.34 -0.18 -0.02 -0.03 -1.44 -0.81 -1.65 -3.23 -1.46 -2.85 -0.92 -1.35 -1.31 0.56 -0.33 0.18 0.97 -0.2 -0.63 1.19 0.86 0.43 0.82 0.31
AHY40689 (CJ8421_07560)
0.33 1.63 0.21 2.1 -0.4 -2.73 -2.5 -1.52 -2.09 -0.55 0.14 -0.89 -0.28 -0.06 -0.01 -2.56 -2.41 -1.3 -2.44 -1.14 -2.35 -0.77 -1.27 -2.36 0.47 0.2 0.17 0.45 -0.15 -0.91 1.29 1.28 0.49 0.82 0.19
AHY40690 (CJ8421_07565)
0.78 1.89 0.43 1.81 -0.42 -2.6 -2.51 -0.66 -0.99 -1.1 -0.9 0.01 -1.21 -1.13 -0.86 -2.49 -2.08 -0.2 -1.14 -0.19 -1.12 0.38 -0.05 -2.31 0.33 0.78 0.27 0.28 -0.1 -0.67 0.61 0.89 -0.37 0.45 0.03
AHY40691 (CJ8421_07570)
-0.03 -0.31 -0.01 1.43 -0.6 -6.23 -6.24 -0.06 -0.75 -0.42 -0.7 0.46 -1.01 -0.8 -0.53 -6.86 -5.71 0.14 -0.86 0.18 -0.75 0.9 0.25 -5.35 0.72 1.21 0.61 0.34 -0.17 -0.99 0.86 1.66 -0.32 0.46 0.01
AHY40740 (CJ8421_07840)
1.48 0.9 -0.2 0.01 -1.15 -0.61 -0.72 0.0 0.38 -0.53 -0.15 -0.27 -0.56 -0.34 -0.63 -1.15 -0.6 -0.01 0.3 0.12 0.22 -0.09 0.23 -0.8 0.88 -0.56 1.15 0.49 -1.13 -2.89 0.28 -0.72 -0.12 0.29 -0.09
AHY40741 (CJ8421_07845)
0.96 0.46 0.39 0.69 -0.56 -0.86 -1.05 0.15 0.49 -0.42 0.29 -0.53 -0.22 -0.06 -0.33 -1.48 -0.87 0.13 0.43 0.23 0.19 0.12 0.32 -1.16 0.37 -0.32 0.76 -0.24 -1.65 -2.75 0.26 -0.64 0.36 0.38 0.35
AHY40743 (CJ8421_07855)
-0.05 0.64 -0.0 0.25 -0.98 -0.33 -0.43 -0.23 0.17 0.22 0.93 -0.38 0.65 0.95 0.66 -0.95 -0.2 -0.24 0.15 -0.3 -0.33 -0.19 -0.03 -0.6 -0.35 -1.48 -0.18 0.17 -1.24 -2.1 0.4 -0.62 0.58 0.37 0.38
AHY40744 (CJ8421_07860)
1.7 0.43 -0.27 -0.07 -1.17 -0.52 -0.6 -0.03 0.31 -0.34 0.21 -0.48 -0.23 0.07 -0.18 -1.01 -0.62 -0.02 0.27 -0.0 -0.02 0.16 0.16 -0.76 0.63 -0.56 0.76 0.31 -0.89 -2.48 0.16 -0.78 0.17 0.31 0.09
AHY40745 (CJ8421_07865)
0.71 0.84 -0.39 -0.21 -1.26 -0.08 -0.29 -0.08 0.4 0.0 0.32 -0.26 0.03 0.47 0.04 -0.56 0.08 0.05 0.36 -0.01 -0.08 0.13 0.14 -0.49 0.41 -0.19 0.76 0.16 -0.65 -2.41 0.0 -0.82 -0.35 -0.03 -0.1
AHY40746 (CJ8421_07870)
-0.03 0.63 -1.04 -1.0 -1.88 0.93 0.63 0.12 0.4 -0.72 -0.83 -0.16 -1.29 -0.75 -1.42 0.59 1.12 0.17 0.36 0.12 -0.08 0.26 0.1 0.66 0.49 0.23 0.67 0.11 -0.24 -1.45 -0.18 -0.19 -1.11 -0.23 -1.27
AHY40747 (CJ8421_07875)
1.55 1.45 -1.92 -1.89 -2.93 -0.12 0.03 0.2 0.45 -0.81 -2.35 -0.06 -2.14 -1.76 -2.98 -0.46 -0.16 0.22 0.58 0.17 0.08 0.36 0.23 -0.27 0.69 0.25 0.99 0.45 -0.15 -0.98 0.18 0.23 -1.02 0.09 -0.61
AHY40748 (CJ8421_07880)
1.01 0.66 0.26 0.65 -0.17 -0.16 -0.38 -0.11 0.13 -0.26 0.29 -0.52 -0.11 0.22 -0.05 -0.63 -0.12 -0.17 0.17 -0.18 -0.24 0.08 -0.06 -0.44 0.36 0.47 0.65 -0.11 -0.44 -1.11 -0.16 -0.83 -0.44 -0.15 -0.46
AHY40749 (CJ8421_07885)
-0.16 0.64 -0.39 0.08 -0.9 -0.1 -0.33 0.04 0.18 -0.22 0.46 -0.33 0.05 0.47 0.08 -0.53 -0.22 -0.13 0.24 -0.13 -0.32 0.12 -0.01 -0.39 0.15 0.46 0.39 0.01 -0.1 -0.43 0.22 -0.09 0.11 0.05 -0.18
AHY40768 (CJ8421_07980)
-0.67 -0.75 0.13 -0.01 -1.06 -1.62 -1.16 -0.62 0.71 0.11 -0.42 0.73 -0.33 -0.21 -0.82 -1.6 -1.92 0.12 0.21 0.39 0.88 -0.9 0.49 -1.39 0.28 -0.29 0.09 -0.08 1.01 -0.12 0.59 0.97 -0.32 0.96 -0.08
AHY40775 (CJ8421_08015)
-0.02 -1.61 -0.03 -1.03 -2.31 1.4 1.33 0.15 0.47 -1.71 -1.9 -0.24 -2.36 -1.67 -2.19 1.15 1.47 0.69 0.45 0.7 0.45 -0.06 0.23 1.19 -2.15 - -11.31 0.3 -0.4 -2.66 -0.28 0.07 -0.85 0.32 -0.32
AHY40785 (prfA)
1.39 -0.27 0.11 -0.93 -0.87 0.07 0.29 -0.08 -0.56 -0.83 -1.28 0.62 -1.66 -1.26 -1.68 -0.19 -0.21 0.22 -0.48 0.52 0.42 -0.5 -0.38 0.13 0.02 -0.36 -0.5 -0.2 1.34 -0.39 0.15 0.9 -0.54 0.71 0.03
AHY40873 (secY)
0.51 -1.37 0.69 0.94 -0.87 -0.9 -0.36 0.24 0.54 -0.41 -1.17 0.62 -1.27 -1.07 -1.5 -0.82 -1.5 0.9 0.22 1.19 1.07 -0.81 0.26 -0.51 0.36 0.28 -0.33 -0.22 0.81 -1.42 -0.51 -0.54 -0.97 0.46 -0.25
AHY40874 (rplO)
-0.55 0.24 0.11 0.39 -1.57 -1.33 -0.96 0.11 0.47 -0.43 -2.95 0.87 -2.8 -2.02 -3.16 -1.22 -1.94 0.62 0.13 0.89 0.79 -0.48 0.7 -1.04 -0.23 0.61 -1.0 -0.52 1.43 0.64 0.29 0.51 -0.12 0.73 0.07
AHY40876 (rplR)
-1.01 -0.65 0.22 0.54 -1.53 -1.41 -0.86 -0.23 0.15 -0.14 -0.63 0.47 -0.68 -0.35 -0.8 -1.31 -1.99 0.26 -0.26 0.51 0.44 -0.93 0.35 -0.95 0.09 0.92 -0.48 -0.25 1.54 0.8 0.38 0.17 0.14 0.59 0.15
AHY40901 (leuD)
2.09 0.73 -0.64 -0.57 -0.44 -0.92 -0.88 -1.12 -0.85 -2.12 -1.14 -0.66 -0.64 -1.47 -1.77 -1.11 -1.55 -1.31 -1.17 -1.07 -0.6 -0.74 -0.2 -0.79 0.88 -0.09 -1.04 1.34 0.99 1.3 -0.03 0.07 0.75 0.69 0.94
AHY40902 (CJ8421_08650)
2.82 0.43 0.12 0.23 0.23 -2.18 -1.69 -1.61 -1.15 -1.76 -0.71 -0.9 -0.46 -0.94 -0.98 -2.24 -2.71 -1.82 -1.45 -1.63 -0.97 -0.93 -0.35 -1.69 -0.06 -1.94 -3.29 -0.1 -0.82 0.19 1.02 -0.3 1.76 1.02 1.59
AHY40903 (CJ8421_08655)
3.25 -0.59 -0.53 -0.45 -0.49 -2.76 -2.19 -2.39 -1.78 -2.02 -1.15 -0.99 -0.83 -1.25 -1.19 -2.86 -2.91 -2.45 -2.18 -2.19 -1.39 -1.24 -0.84 -2.1 0.18 -1.09 -2.01 0.61 -0.1 1.18 1.01 0.13 1.54 0.88 1.22
AHY40904 (CJ8421_08660)
2.12 1.16 -0.8 -0.72 -0.21 -2.72 -2.24 -2.46 -1.85 -1.57 -0.56 -0.68 -0.28 -0.92 -1.03 -2.86 -2.9 -2.35 -2.26 -2.15 -1.52 -1.04 -1.06 -2.36 -0.31 -1.07 -1.25 1.16 0.4 1.49 0.89 1.03 1.46 1.33 1.29
AHY40912 (ruvC)
0.8 -0.85 -0.5 -2.15 -1.22 0.75 1.08 0.05 -0.04 -0.84 -0.61 0.08 -0.53 -0.64 -1.22 0.94 0.6 0.31 -0.19 0.65 0.53 -0.25 -0.07 0.91 0.56 -1.22 -0.54 0.02 -0.25 -1.2 -0.38 0.45 -1.03 0.24 -0.77

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.