Heatmap: Cluster_23 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	10P129H1,ModA15 OFF	10P129H1,ModA15 ON	10P129H1,ModA15ON	1209,ModA9 OFF	1209,ModA9 ON	1209,ModA9ON	477,ModA5 OFF	477,ModA5 OFF	477,ModA5 ON	84P36H1,ModA18 OFF	84P36H1,ModA18 OFF	84P36H1,ModA18 ON	84P36H1,ModA18ON	86-028NP,nasopharynx	86-028NP,rpsL,nasopharynx	86-028NP,rspL/fur-,nasopharynx	86-028NP,rspL/pT-fur,nasopharynx	C486,ModA4 OFF	C486,ModA4 ON	C486,ModA4ON	GE47,WT,sBHI,37C	GE47,WT,sBHI,42C	R2866,ModA10 OFF	R2866,ModA10 OFF	R2866,ModA10 OFF	R2866,ModA10 ON	R2866,ModA10ON	RdKW20,BHI	RdKW20,HI0628-,mid-log,50ÂµM beclomethasone	RdKW20,HI0628-,mid-log,DMSO	RdKW20,HI0659-,MIV	RdKW20,HI0659-,MM	RdKW20,HI0659-/HI0660-,MIV	RdKW20,HI0660-,MIV	RdKW20,MIV	RdKW20,WT	RdKW20,WT,mid-log,50ÂµM beclomethasone	RdKW20,WT,mid-log,DMSO	RdKW20,beclomethasone	RdKW20,comN-,MIV	RdKW20,crp-,BHI	RdKW20,crp-,MIV	RdKW20,hfq-,MIV	RdKW20,murE749,BHI	RdKW20,prednisolone	RdKW20,rpoD753,BHI	RdKW20,sxy-,BHI	RdKW20,sxy-,MIV	RdKW20,sxy-1,BHI	bronchoalveolar lavage	nasopharynx
EDJ89911 (CGSHi22421_00632)	-	-	-	-	-	-	-	-0.02	-1.23	1.32	1.46	1.38	-1.94	-	-	-	-	2.46	2.73	2.72	-	-	-	0.5	0.46	-	-	-1.09	0.95	-	-	-	-2.99	-1.93	0.27	0.1	0.58	-0.83	1.45	-0.87	-0.07	-	-	-1.05	1.15	-	-	-1.52	-0.73	1.54	1.03
EDJ89913 (CGSHi22421_00642)	-	-	-	-2.9	-3.12	-2.79	-0.41	-0.67	-0.74	1.73	1.72	1.57	1.47	-	-2.97	-	-2.35	1.99	1.89	1.84	1.39	1.67	0.8	0.62	0.44	0.19	0.46	-0.94	-1.07	-0.36	-1.54	-1.27	-1.97	-2.24	-1.52	-1.68	-1.38	-1.52	-0.3	-1.6	-1.02	-1.64	-2.57	-1.08	-0.82	-1.46	-1.2	-1.12	-1.31	0.22	0.42
EDJ89944 (CGSHi22421_01092)	-0.41	-0.36	-0.32	-0.86	-1.04	-1.03	-0.66	-0.65	-0.63	0.64	0.64	0.78	0.73	2.0	-0.07	-0.51	-0.1	-1.11	-1.26	-1.36	0.36	0.71	-0.73	-0.55	-0.45	-0.73	-0.77	0.2	-0.15	0.03	0.0	-0.48	-0.33	-0.28	-0.23	0.66	-0.07	0.12	0.67	-0.27	0.15	0.0	-0.38	0.17	0.61	0.26	0.2	0.03	0.27	-0.61	-0.55
EDJ89956 (CGSHi22421_05747)	-0.3	-0.06	-0.04	-0.88	-0.57	-0.64	-0.15	-0.2	-0.34	-0.01	0.01	-0.06	-0.0	1.15	-0.04	-0.27	-0.4	0.56	0.56	0.61	0.61	0.34	0.37	0.19	0.07	0.2	0.36	0.3	-0.03	0.07	-0.39	-0.49	-0.82	-0.53	-0.22	-0.14	-0.91	-0.62	-0.11	-0.37	0.37	-0.77	-0.95	0.33	-0.56	0.2	0.44	-0.49	0.36	0.34	0.25
EDJ89962 (CGSHi22421_05777)	0.51	0.45	0.53	-0.73	-0.8	-0.84	-0.71	-0.61	-0.88	-	-	-	-	0.1	0.77	0.29	0.11	-0.42	0.19	0.22	-	-	-0.63	-0.42	-0.35	-0.71	-0.34	-1.07	-6.04	-6.23	0.06	0.04	0.45	0.38	-0.02	1.37	-1.36	-1.85	1.83	0.08	-1.2	0.26	0.69	-1.02	2.76	-0.69	-1.38	0.25	-1.2	1.05	1.15
EDJ90062 (CGSHi22421_09726)	-0.83	-1.26	-1.24	0.11	0.08	-0.01	0.53	0.6	1.03	0.51	0.58	0.72	0.82	-	-1.08	-11.95	-0.54	-0.18	-0.57	-0.52	-0.26	0.33	-0.27	-0.21	-0.14	-0.24	-0.43	0.43	-0.62	-0.52	0.73	0.37	-0.51	0.14	0.36	-0.3	-0.76	-0.83	-0.01	0.3	0.65	0.5	-0.07	0.31	-0.08	0.56	0.43	0.26	0.33	-0.79	-0.86
EDJ90242 (CGSHi22421_05122)	0.07	-0.15	-0.13	-0.98	-0.64	-0.6	-0.08	-0.04	-0.06	0.64	0.69	0.78	0.73	-	0.15	-0.17	-0.09	-0.14	-0.05	-0.03	-0.3	0.09	0.27	0.05	-0.22	0.25	0.33	0.2	-0.19	-0.03	-0.17	-0.21	-0.07	-0.25	-0.06	-0.13	-0.27	-0.33	-0.8	-0.12	0.55	0.29	-0.26	0.33	-0.65	0.02	0.45	-0.22	0.25	0.24	0.15
EDJ90257 (CGSHi22421_06439)	0.22	-0.09	0.11	-0.49	-0.39	-0.26	0.22	0.37	0.36	-0.57	-0.79	-0.75	-0.6	-	0.24	0.04	0.27	-0.74	-0.9	-1.12	0.6	0.43	0.39	0.37	0.43	0.39	0.31	0.11	0.64	0.72	0.1	-0.43	-0.25	-0.16	0.01	-0.02	-0.48	-0.25	0.26	-0.15	0.31	0.17	-0.4	0.18	-0.05	-0.17	0.41	-0.08	0.21	-0.06	-0.14
EDJ90324 (CGSHi22421_02311)	-0.51	-0.64	-0.53	0.63	-0.26	-0.24	-0.12	-0.21	0.22	0.08	0.16	0.38	0.38	-	-1.87	-	-2.66	0.02	-0.51	-0.61	-0.2	0.0	0.07	0.13	0.18	-0.02	0.02	0.26	0.48	0.29	0.34	-0.13	-0.09	0.09	0.19	0.75	-0.27	-0.25	0.24	-0.09	0.4	0.22	0.19	0.23	0.31	0.17	0.29	0.21	0.33	0.35	0.43
EDJ90327 (modB)	-0.0	-0.15	-0.22	-1.86	-1.24	-1.18	0.19	0.27	-0.19	1.57	1.68	1.29	1.56	-	-2.34	-	-1.58	0.19	0.52	0.54	-0.01	0.43	-0.63	-0.43	-0.47	-0.66	-0.66	0.67	-0.75	-0.59	-0.18	-0.98	-0.29	-0.07	-0.47	-0.71	-0.95	-0.89	-0.09	-0.12	0.74	-1.12	-0.8	0.57	-1.06	0.44	0.86	-0.44	0.67	-0.34	-0.34
EDJ90328 (CGSHi22421_02331)	-0.72	-1.08	-1.0	-1.55	-0.92	-1.28	0.67	0.65	0.37	1.51	1.52	1.36	1.48	-	-1.25	-	-0.94	0.2	0.34	0.34	0.5	0.93	0.14	0.18	0.11	0.08	-0.04	0.18	-0.82	-0.55	-0.17	-0.44	-0.56	-0.3	-0.44	-0.69	-1.26	-1.08	-0.19	-0.56	0.35	-0.85	-0.85	0.13	-0.96	-0.02	0.36	-0.43	0.14	-0.07	-0.06
EDJ90344 (CGSHi22421_09860)	0.05	-0.02	-0.04	-0.56	-1.45	-1.5	-0.11	-0.12	-0.06	0.1	0.13	0.27	0.15	-	0.23	0.19	-0.27	0.05	-0.49	-0.49	0.74	0.51	0.06	-0.15	-0.28	0.11	0.16	0.24	0.47	0.6	0.08	-0.02	-0.34	-0.12	-0.07	0.29	-0.59	-0.26	-0.15	-0.11	0.41	0.0	-0.29	0.32	-0.48	0.2	0.49	-0.17	0.31	0.34	0.36
EDJ90476 (CGSHi22421_06247)	0.12	0.11	0.13	-0.89	-0.53	-0.43	-0.56	-0.64	-0.99	0.28	0.34	0.41	0.47	0.78	0.41	0.1	0.03	-0.89	-0.7	-0.73	0.61	1.02	0.55	0.54	0.57	0.49	0.37	0.18	-0.81	-0.69	-0.62	-0.68	-0.33	-0.47	-0.16	-0.45	-0.57	-0.52	-0.32	-0.17	0.37	-0.09	-0.08	0.1	-0.93	-0.09	0.35	-0.43	0.23	0.35	0.29
EDJ90625 (CGSHi22421_01432)	-0.45	-0.75	-0.86	-1.42	-1.0	-1.1	-0.52	-0.52	-0.09	-1.12	-1.0	-0.99	-1.09	0.83	0.43	0.28	-0.24	-0.56	-0.23	-0.21	0.27	1.08	0.18	0.35	0.32	-0.04	-0.09	0.09	-0.73	-0.51	0.28	-0.54	-0.01	-0.14	-0.16	0.63	0.21	0.2	1.35	0.04	0.59	-0.1	0.06	0.12	1.28	-0.0	-0.02	0.02	0.25	-0.5	-0.59
EDJ90850 (CGSHi22421_05475)	-0.22	-0.94	-0.88	-0.95	0.14	0.53	-0.26	-0.3	-0.61	0.08	0.09	0.2	0.01	1.36	-0.11	-0.27	-0.35	0.21	0.16	0.0	0.73	0.41	0.3	0.22	0.15	0.12	0.38	0.03	-0.6	-0.33	-0.37	-0.89	-0.47	-0.74	-0.33	0.26	-0.63	-0.28	1.01	-0.58	0.21	-0.42	-0.4	0.11	0.65	-0.36	0.04	-0.3	-0.02	0.0	0.0
EDJ90969 (CGSHi22421_03933)	-	-	-	-1.87	-1.21	-1.38	-0.75	-0.54	-0.91	0.92	1.11	0.7	0.33	-	-5.07	-	-5.45	1.24	0.61	0.7	-1.89	-1.34	0.91	1.15	0.95	0.83	0.85	0.58	-0.2	-0.31	-0.44	-1.1	-0.79	-0.7	-0.04	0.59	-0.46	-0.44	1.23	-0.42	0.89	-0.6	-1.1	0.61	0.46	0.57	0.83	-0.69	0.58	-0.37	-0.53
EDJ90995 (CGSHi22421_02696)	-0.28	-0.51	-0.53	0.19	0.37	0.18	0.29	0.29	0.42	0.13	0.11	0.3	0.36	-	-1.32	-	-1.57	-0.36	-0.71	-0.63	0.62	0.58	0.5	0.49	0.31	0.36	0.43	0.12	-0.24	-0.24	0.34	0.59	0.03	0.15	0.22	-0.15	-0.51	-0.39	-0.14	0.31	0.26	0.3	-0.18	0.06	-0.4	-0.09	0.19	0.1	0.12	-0.39	-0.34
EDJ90996 (CGSHi22421_02701)	0.26	0.14	0.23	-0.4	-0.01	0.04	0.29	0.31	0.28	0.72	0.76	0.87	0.81	-	-1.57	-	-0.95	-0.42	-0.51	-0.52	1.05	1.12	0.75	0.63	0.57	0.49	0.6	-0.03	-0.62	-0.45	-0.21	-0.19	-0.27	-0.35	-0.32	-0.65	-0.54	-0.68	-0.68	-0.14	-0.05	0.31	-0.79	-0.15	-0.89	-0.24	-0.05	-0.36	-0.14	-0.36	-0.41
EDJ91011 (CGSHi22421_02776)	0.01	-0.02	-0.02	0.1	-0.19	-0.17	-0.12	-0.17	-0.11	0.57	0.61	0.68	0.69	-	-1.48	-11.71	-1.28	-0.44	-1.06	-1.14	0.28	0.64	-0.08	-0.23	-0.26	-0.18	-0.13	0.47	0.45	0.61	0.08	0.32	0.1	-0.01	0.06	-0.06	-1.06	-0.59	-0.38	0.03	0.59	0.09	0.09	0.43	-1.06	0.4	0.46	0.25	0.41	0.24	0.21
EDJ91019 (CGSHi22421_02816)	-0.01	-0.01	0.02	-0.6	-0.91	-0.92	0.81	0.85	0.96	0.01	0.04	0.06	0.07	-	-0.45	-11.33	-0.08	-0.51	-0.58	-0.44	0.31	1.1	0.45	0.42	0.45	0.51	0.51	0.43	-0.75	-0.27	-0.58	-1.09	-0.54	-0.62	-0.54	-0.3	-0.06	-0.0	-0.27	-0.65	0.41	-0.56	-0.6	0.42	-1.17	0.18	0.58	-0.71	0.52	0.74	0.69
EDJ91066 (CGSHi22421_10007)	0.8	0.7	0.61	0.7	1.66	1.64	-3.47	-3.05	-3.42	0.16	0.17	0.48	0.45	-	-6.13	-	-5.77	0.93	0.59	0.57	0.37	0.46	-4.06	-3.67	-3.6	-3.57	-4.14	0.68	-0.24	-0.07	-0.21	-0.36	-0.64	-0.76	-0.25	0.26	-0.12	-0.38	0.38	-0.62	0.98	-0.68	-1.45	0.82	-0.05	0.76	1.02	-0.4	0.53	-0.58	-0.52
EDJ91126 (CGSHi22421_10307)	-1.47	-1.16	-1.17	-0.28	0.5	0.65	0.18	0.2	0.12	0.46	0.42	0.44	0.38	-	-3.19	-	-3.2	-0.35	0.22	0.09	-0.73	-0.66	-1.11	-0.88	-0.72	-1.22	-1.15	0.22	-0.87	-1.2	0.54	-0.07	-0.1	0.13	0.1	1.04	-0.46	-0.54	1.2	-0.11	0.29	0.49	-0.74	0.07	1.22	0.06	0.37	0.37	0.26	1.0	1.3
EDJ91150 (CGSHi22421_10427)	-0.97	-0.41	-0.42	0.34	0.37	0.67	0.39	0.31	0.07	-0.73	-0.8	-0.68	-0.73	-	-0.84	-	-0.3	-0.12	-0.04	-0.21	-0.18	-0.17	-0.12	-0.49	-0.58	-0.17	-0.31	0.44	0.19	0.34	0.25	0.17	-0.33	0.12	0.21	0.3	-0.16	0.04	0.46	-0.16	0.51	0.59	0.1	0.52	-0.43	0.53	0.33	0.21	0.47	0.5	0.63
EDJ91206 (CGSHi22421_01769)	-0.42	-0.53	-0.51	-0.29	-0.45	-0.47	-0.39	-0.35	-0.44	0.6	0.59	0.58	0.43	0.16	-0.78	-0.25	-1.15	0.07	0.73	0.66	0.39	1.9	0.49	0.45	0.43	0.33	0.33	-0.76	0.16	0.15	-0.39	-0.54	-0.46	-0.54	-0.35	-0.22	-0.77	-0.74	0.45	-0.68	-0.4	0.07	-0.66	-0.5	0.57	-0.83	-0.58	-0.65	-0.65	-0.06	-0.14
EDJ91254 (CGSHi22421_02009)	0.55	0.79	0.81	-0.97	-1.08	-0.85	0.19	0.08	-0.14	0.28	0.39	0.4	0.23	0.68	-0.33	-0.76	-1.17	-0.38	-0.64	-0.8	0.72	0.56	0.26	0.19	-0.04	0.07	0.2	-0.13	0.46	0.51	-0.18	-0.45	-0.42	-0.46	-0.32	-0.2	-0.64	-0.37	-0.47	-0.54	-0.05	-0.09	-0.63	0.01	-0.79	-0.01	0.07	-0.32	-0.01	0.61	0.63
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EDJ91848 (CGSHi22421_08833)	-1.45	1.02	0.86	-2.95	0.62	0.85	-1.98	-1.9	1.9	-0.85	-0.99	2.2	2.14	-	-6.27	-	-6.86	-2.16	0.73	0.63	1.47	1.28	-0.88	-0.83	-0.86	1.29	1.41	-2.02	-1.28	-1.31	-1.22	-1.23	-1.57	-1.42	-1.47	-0.6	-1.87	-1.63	-1.36	-2.08	0.22	-0.01	-2.21	-1.89	-1.07	0.3	-1.77	-1.79	-2.14	0.78	0.9
EDJ91849 (CGSHi22421_08838)	-1.23	1.49	1.43	-3.03	0.61	0.62	-2.42	-2.69	1.59	-1.5	-1.46	1.56	1.6	-	-6.32	-	-6.83	-3.14	0.41	0.4	1.67	1.53	-0.83	-0.91	-0.94	1.17	1.22	-1.03	-1.31	-1.23	-0.34	-0.2	-0.84	-0.74	-0.7	-0.97	-1.64	-1.93	-1.65	-1.36	0.85	0.57	-1.42	-0.78	-1.87	1.01	-1.02	-1.03	-1.03	0.21	0.16
EDJ91850 (CGSHi22421_08843)	-1.03	1.57	1.55	-3.46	0.88	0.91	-2.75	-2.65	1.98	-1.17	-0.94	1.98	1.9	-	-6.61	-	-6.34	-3.05	0.78	0.69	1.6	0.99	0.03	0.18	0.2	1.26	1.34	-1.55	-1.35	-1.36	-1.06	-0.82	-2.07	-1.34	-1.45	-1.68	-1.58	-2.03	-2.54	-1.76	0.29	0.13	-1.94	-1.32	-2.82	0.4	-1.44	-1.62	-1.71	-0.61	-0.89
EDJ91852 (CGSHi22421_08853)	-0.19	-0.02	0.03	-1.09	-0.4	-0.37	0.34	0.43	0.45	0.74	0.74	1.16	1.18	-	-2.52	-	-2.42	-0.37	0.31	0.22	0.41	0.26	0.98	1.05	1.14	-0.19	-0.1	-0.21	-0.04	0.06	0.18	0.24	-0.86	-0.38	-0.29	-0.54	-0.58	-0.68	-1.12	-0.47	0.08	-0.0	-0.78	-0.17	-0.78	0.04	-0.15	-0.29	-0.25	-0.01	-0.01
EDJ91921 (CGSHi22421_09198)	0.08	-0.26	-0.29	-0.15	-0.42	-0.41	0.25	0.24	0.35	0.81	0.78	1.01	0.98	-	-1.35	-10.74	-1.13	0.07	0.02	0.08	-1.41	-0.87	0.28	0.5	0.55	0.35	0.3	-0.37	0.1	0.1	0.41	0.42	-0.49	-0.02	0.11	0.04	-0.06	-0.18	-0.27	-0.29	-0.24	0.08	-0.62	-0.48	-0.13	0.22	-0.31	-0.05	-0.35	0.34	0.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.