1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
BHI
Basal Medium
CD196,BHI
CD196,Basal Medium
CD196,Log,BHI
ClnR mutant
LB-CD16
Log,BHI
LuxS KO
ND-CD12
ND-CD13
ND-CD17
R20291
R20291,BHI
R20291,Basal Medium
R20291,Heme+
R20291,Log
R20291,Log,BHI
Strain 630
Strain 630,BHI
Strain 630,Basal Medium
Strain 630,Faecal water+
Strain 630,HPUra+
Strain 630,Lag
Strain 630,Log
Strain 630,Log,BHI
Strain 630,Sporulating
TW11
UK1
CCL16917 (gyrB)
 0.68 0.24 0.49 0.34 0.68 0.54 0.74 0.47 0.05 0.86 0.78 0.81 0.84 0.65 0.32 0.83 0.35 0.68 0.54 0.59 0.16 1.0 0.36 0.24 0.53 0.43 0.18 0.27 0.67
CCL16918 (gyrA)
 0.43 0.2 0.32 0.22 0.39 0.58 0.84 0.32 0.07 0.92 0.86 0.89 0.97 0.43 0.22 1.0 0.36 0.39 0.52 0.41 0.13 0.84 0.37 0.27 0.54 0.28 0.32 0.33 0.76
CCL16934 (BN171_1020001)
 0.43 0.22 0.03 0.03 0.02 0.27 0.44 0.11 0.64 1.0 0.83 0.17 0.61 0.36 0.2 0.9 0.2 0.21 0.28 0.4 0.26 0.11 0.58 0.21 0.24 0.18 0.03 0.0 0.26
CCL16976 (BN171_1030026)
 0.65 0.41 0.76 0.53 0.84 0.59 0.42 0.62 0.29 0.68 0.63 0.6 0.82 0.63 0.36 0.82 0.35 0.6 0.31 0.61 0.29 1.0 0.36 0.27 0.32 0.4 0.13 0.76 0.48
CCL17199 (murA)
 0.85 0.4 0.6 0.49 0.9 0.62 0.51 0.76 0.5 0.62 0.65 0.58 0.77 1.0 0.62 0.73 0.37 0.99 0.55 0.83 0.37 0.57 0.35 0.25 0.42 0.65 0.16 0.22 0.57
CCL17200 (spoIIC)
 0.61 0.17 0.52 0.28 0.79 0.44 0.88 0.45 0.13 0.89 0.76 0.66 1.0 0.9 0.29 0.89 0.3 0.66 0.6 0.77 0.22 0.56 0.42 0.26 0.54 0.5 0.22 0.26 0.67
CCL17279 (coaE)
 1.0 0.61 0.67 0.45 0.66 0.4 0.65 0.61 0.13 0.54 0.38 0.4 0.51 0.82 0.5 0.52 0.26 0.59 0.22 0.33 0.14 0.4 0.26 0.27 0.29 0.26 0.32 0.09 0.33
CCL17326 (ackA)
 0.25 0.13 0.21 0.16 0.34 0.44 0.5 0.29 0.46 0.56 0.56 0.53 0.58 0.17 0.15 1.0 0.34 0.35 0.3 0.31 0.16 0.66 0.25 0.54 0.5 0.26 0.31 0.21 0.47
CCL17434 (BN171_1500010)
 0.42 0.69 0.41 1.0 0.36 0.18 0.31 0.12 0.21 0.44 0.23 0.26 0.72 0.28 0.67 0.66 0.29 0.2 0.19 0.28 0.59 0.16 0.25 0.18 0.24 0.15 0.12 0.88 0.14
CCL17591 (bceA)
 0.76 0.45 0.81 0.98 0.56 0.0 0.85 0.61 0.48 0.59 0.84 0.42 0.8 0.8 1.0 0.35 0.77 0.74 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.96
CCL17592 (BN171_160008)
 0.31 0.16 0.39 0.43 0.32 0.0 0.24 0.24 0.3 0.43 0.18 0.23 0.91 0.38 0.31 0.83 0.88 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.1
CCL17873 (BN171_1910001)
 0.42 0.38 0.48 0.44 0.76 0.13 0.42 1.0 0.31 0.73 0.57 0.6 0.53 0.35 0.54 0.9 0.45 0.86 0.15 0.17 0.14 0.09 0.13 0.63 0.52 0.14 0.05 0.0 0.71
CCL17886 (BN171_1920013)
 0.01 0.0 0.1 0.04 0.06 0.07 0.19 0.01 0.18 0.26 0.37 0.26 0.54 0.09 0.0 1.0 0.38 0.01 0.17 0.11 0.06 0.04 0.38 0.22 0.35 0.02 0.12 0.2 0.33
CCL17887 (BN171_1920014)
 0.24 0.02 0.54 0.79 0.67 0.18 0.08 0.07 0.34 0.34 0.27 0.31 0.62 0.7 0.1 1.0 0.5 0.43 0.24 0.54 0.23 0.14 0.45 0.4 0.59 0.3 0.14 0.2 0.34
CCL17888 (BN171_1920015)
 0.29 0.05 0.62 1.0 0.78 0.27 0.38 0.14 0.21 0.56 0.35 0.33 0.44 0.8 0.14 0.57 0.22 0.38 0.17 0.49 0.18 0.05 0.26 0.29 0.42 0.28 0.1 0.2 0.29
CCL18047 (scrB)
 0.24 0.21 0.32 0.65 0.33 0.25 0.41 0.18 0.24 0.83 0.65 0.26 0.54 0.29 0.74 1.0 0.44 0.13 0.25 0.26 0.23 0.36 0.35 0.21 0.2 0.15 0.07 0.37 0.46
CCL18068 (BN171_210004)
 0.41 0.19 0.39 0.19 0.37 0.26 0.29 0.24 0.13 0.48 0.43 0.47 0.51 0.39 0.19 1.0 0.19 0.37 0.37 0.32 0.11 0.18 0.32 0.24 0.31 0.15 0.06 0.26 0.37
CCL18091 (spsK)
 1.0 0.41 0.72 0.5 0.68 0.0 0.52 0.48 0.44 0.61 0.59 0.61 0.84 0.68 0.44 1.0 0.31 0.74 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.67
CCL18175 (BN171_2140017)
 0.67 0.39 0.62 0.36 0.54 0.0 0.2 1.0 0.34 0.35 0.36 0.44 0.4 0.54 0.32 0.47 0.47 0.66 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32
CCL18239 (BN171_2180002)
 0.7 0.47 0.58 0.53 0.53 0.0 0.53 0.5 0.36 0.59 0.59 0.49 0.62 1.0 0.67 0.4 0.4 0.85 0.04 0.02 0.08 0.03 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.23 0.44
CCL18240 (BN171_2180003)
 0.59 0.43 0.39 0.28 0.43 0.01 0.63 0.55 0.35 1.0 0.78 0.69 0.46 0.72 0.54 0.33 0.36 0.75 0.04 0.02 0.04 0.04 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.18 0.71
CCL18377 (BN171_2260001)
 0.83 0.35 1.0 0.7 0.74 0.05 0.16 0.41 0.16 0.32 0.31 0.15 0.58 0.56 0.33 0.79 0.31 0.56 0.09 0.94 0.07 0.03 0.03 0.15 0.29 0.17 0.02 0.13 0.19
CCL18460 (BN171_2360002)
 0.09 0.01 0.13 0.06 0.12 0.16 0.29 0.03 0.67 0.38 0.41 0.3 0.64 0.09 0.02 1.0 0.29 0.07 0.14 0.13 0.04 0.03 0.31 0.33 0.44 0.06 0.05 0.14 0.42
CCL18461 (BN171_2360003)
 0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.43 0.11 0.01 1.0 0.1 0.14 0.1 0.57 0.01 0.0 0.86 0.4 0.0 0.17 0.02 0.01 0.01 0.42 0.11 0.24 0.0 0.03 0.16 0.07
CCL18558 (BN171_2430004)
 0.71 0.06 0.41 0.04 1.0 0.08 0.05 0.73 0.01 0.42 0.42 0.45 0.35 0.54 0.13 0.81 0.07 0.84 0.03 0.24 0.05 0.02 0.04 0.02 0.07 0.3 0.01 0.05 0.12
CCL18624 (sat)
 0.58 0.32 0.82 0.82 0.49 0.09 1.0 0.22 0.47 0.63 0.43 0.43 0.59 0.43 0.28 0.87 0.25 0.36 0.2 0.32 0.24 0.14 0.2 0.27 0.21 0.08 0.1 0.46 0.3
CCL18733 (BN171_260002)
 0.21 0.13 0.29 0.36 0.46 0.24 0.29 0.3 0.18 0.63 0.44 0.44 0.85 0.21 0.16 1.0 0.64 0.47 0.41 0.18 0.1 0.33 0.45 0.67 0.71 0.18 0.13 0.0 0.41
CCL18734 (BN171_260003)
 0.12 0.05 0.2 0.31 0.33 0.11 0.25 0.06 0.14 0.57 0.41 0.38 0.86 0.13 0.11 1.0 0.36 0.3 0.29 0.13 0.08 0.15 0.38 0.55 0.63 0.12 0.11 0.0 0.36
CCL18735 (BN171_260004)
 0.27 0.15 0.4 0.42 0.72 0.3 0.44 0.43 0.26 0.58 0.58 0.55 0.91 0.3 0.3 1.0 0.77 0.77 0.36 0.16 0.08 0.55 0.33 0.35 0.5 0.22 0.09 0.0 0.46
CCL18737 (BN171_260006)
 0.24 0.07 0.31 0.2 0.5 0.15 0.45 0.24 0.4 0.69 0.7 0.64 0.81 0.27 0.15 1.0 0.57 0.56 0.5 0.23 0.11 0.4 0.43 0.37 0.5 0.17 0.08 0.0 0.42
CCL18738 (BN171_260007)
 0.45 0.16 0.64 0.52 0.92 0.25 0.47 0.51 1.0 0.53 0.52 0.43 0.8 0.56 0.37 0.97 0.7 0.87 0.4 0.45 0.22 0.43 0.37 0.37 0.54 0.37 0.09 0.0 0.37
CCL18806 (BN171_2650003)
 0.48 0.12 0.64 0.16 0.41 0.3 0.25 0.47 0.04 0.27 0.23 0.25 0.4 0.39 0.11 1.0 0.14 0.37 0.11 0.85 0.17 0.18 0.11 0.16 0.32 0.51 0.11 0.18 0.22
CCL18816 (BN171_2660005)
 0.58 0.2 0.45 0.32 0.5 0.52 0.34 0.29 0.42 0.41 0.38 0.39 0.68 0.55 0.23 1.0 0.35 0.59 0.31 0.77 0.17 0.87 0.44 0.33 0.9 0.42 0.19 0.16 0.27
CCL18817 (BN171_2660006)
 0.26 0.08 0.19 0.15 0.22 0.27 0.29 0.12 0.19 0.34 0.36 0.34 0.63 0.21 0.1 1.0 0.25 0.28 0.23 0.3 0.08 0.82 0.37 0.29 0.75 0.16 0.3 0.15 0.25
CCL18818 (BN171_2660007)
 0.3 0.11 0.24 0.19 0.28 0.42 0.36 0.14 0.16 0.48 0.44 0.46 0.65 0.36 0.11 1.0 0.3 0.29 0.27 0.4 0.09 0.66 0.42 0.29 0.66 0.2 0.56 0.33 0.36
CCL18894 (BN171_2700017)
 0.79 0.24 0.85 1.0 0.64 0.21 0.4 0.38 0.83 0.5 0.51 0.39 0.58 0.64 0.28 0.89 0.42 0.48 0.39 0.59 0.55 0.76 0.3 0.55 0.73 0.41 0.18 0.05 0.34
CCL18895 (BN171_2700018)
 0.88 0.39 0.67 1.0 0.78 0.37 0.57 0.56 0.66 0.61 0.47 0.5 0.59 0.53 0.35 0.88 0.31 0.58 0.38 0.61 0.39 0.77 0.39 0.4 0.52 0.4 0.12 0.0 0.5
CCL19078 (BN171_2870008)
 0.26 0.35 0.33 0.54 0.31 0.03 1.0 0.14 0.33 0.57 0.29 0.47 0.5 0.34 0.43 0.43 0.15 0.28 0.07 0.06 0.08 0.04 0.19 0.06 0.05 0.04 0.06 0.16 0.25
CCL19106 (BN171_2870036)
 0.37 0.11 0.32 0.09 0.49 0.0 0.15 0.42 0.08 0.27 0.36 0.34 0.48 0.38 0.15 1.0 0.36 0.7 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.29
CCL19146 (pfo)
 0.18 0.09 0.19 0.11 0.2 0.3 0.73 0.17 0.25 0.69 0.52 0.59 0.56 0.1 0.1 0.93 0.31 0.19 0.39 0.31 0.13 1.0 0.3 0.41 0.83 0.21 0.47 0.21 0.48
CCL19290 (cwp)
 0.21 0.13 0.28 0.3 0.33 0.54 0.18 0.26 0.57 0.17 0.24 0.18 0.61 0.2 0.23 1.0 0.58 0.3 0.25 0.36 0.18 0.38 0.49 0.35 0.42 0.36 0.09 0.39 0.18
CCL19317 (BN171_3020029)
 0.37 0.1 0.47 0.31 0.47 0.01 0.28 0.15 0.16 0.27 0.27 0.17 0.54 0.73 0.19 1.0 0.14 0.62 0.05 0.02 0.05 0.01 0.07 0.04 0.05 0.0 0.01 0.41 0.18
CCL19381 (BN171_3080028)
 0.13 0.08 0.2 0.15 0.19 0.25 0.37 0.12 0.31 0.36 0.45 0.53 0.67 0.26 0.23 1.0 0.29 0.23 0.31 0.12 0.1 0.21 0.52 0.18 0.37 0.07 0.1 0.0 0.42
CCL19547 (BN171_3250007)
 0.77 0.36 0.59 0.21 0.55 0.38 0.36 1.0 0.46 0.36 0.32 0.31 0.67 0.5 0.27 0.61 0.32 0.62 0.41 0.63 0.16 0.13 0.45 0.48 0.41 0.51 0.08 0.33 0.28
CCL19548 (BN171_3250008)
 0.39 0.15 0.57 0.28 0.38 0.13 0.45 0.31 0.59 0.36 0.17 0.24 0.76 0.83 0.19 0.92 0.43 0.22 0.39 1.0 0.44 0.15 0.42 0.26 0.24 0.77 0.17 0.38 0.17
CCL19640 (bceA)
 0.65 0.17 0.42 0.34 0.2 0.0 1.0 0.16 0.84 0.77 0.76 0.73 0.95 0.47 0.2 0.62 0.35 0.31 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.35
CCL19688 (BN171_340005)
 0.76 0.42 0.65 0.45 0.75 0.53 0.51 0.54 0.51 0.7 0.65 0.65 0.74 0.81 0.41 1.0 0.36 0.63 0.57 0.88 0.3 0.17 0.35 0.35 0.41 0.62 0.05 0.19 0.68
CCL19689 (rluA)
 0.57 0.33 0.56 0.35 0.52 0.61 0.65 0.38 0.2 0.68 0.63 0.61 0.77 0.61 0.37 1.0 0.36 0.5 0.54 0.48 0.25 0.13 0.35 0.4 0.49 0.28 0.06 0.2 0.54
CCL19690 (BN171_340007)
 0.31 0.22 0.28 0.21 0.36 0.5 0.55 0.25 0.11 0.66 0.57 0.67 0.69 0.27 0.28 1.0 0.29 0.37 0.42 0.27 0.12 0.31 0.28 0.36 0.49 0.23 0.1 0.11 0.46
CCL19747 (BN171_3440022)
 0.56 0.29 0.6 0.74 0.85 0.06 0.42 0.76 0.17 0.3 0.3 0.5 0.57 0.62 0.35 1.0 0.52 0.94 0.18 0.34 0.62 0.2 0.15 0.07 0.11 0.27 0.13 0.0 0.17
CCL19768 (BN171_3470006)
 0.23 0.09 0.35 0.26 0.77 0.24 0.33 0.5 0.19 0.42 0.39 0.36 0.49 0.49 0.27 1.0 0.41 0.74 0.36 0.81 0.2 0.25 0.26 0.15 0.66 0.7 0.09 0.42 0.33
CCL19804 (BN171_3490007)
 0.61 0.32 0.73 0.55 0.71 0.79 0.4 0.37 0.22 0.52 0.65 0.6 0.64 0.7 0.43 1.0 0.35 0.48 0.47 0.8 0.37 0.18 0.39 0.31 0.46 0.55 0.05 0.77 0.58
CCL19901 (BN171_3590022)
 0.5 0.3 0.84 0.85 0.84 0.19 0.57 0.46 0.57 0.63 0.6 0.48 0.67 0.64 0.41 1.0 0.42 0.59 0.33 0.32 0.21 0.03 0.3 0.15 0.15 0.12 0.04 0.24 0.67
CCL19971 (pth)
 0.34 0.12 0.56 0.38 0.78 0.7 0.62 0.59 0.12 0.68 0.51 0.64 0.62 0.57 0.17 1.0 0.34 0.65 0.47 0.61 0.12 0.76 0.34 0.18 0.35 0.59 0.09 0.27 0.48
CCL20028 (BN171_3670011)
 0.46 0.17 0.32 0.17 0.6 0.19 0.15 0.82 0.02 0.24 0.3 0.27 0.38 0.4 0.14 1.0 0.12 0.56 0.28 0.65 0.15 0.04 0.27 0.19 0.38 0.63 0.02 0.34 0.24
CCL20173 (BN171_3740002)
 0.28 0.49 0.28 0.29 0.86 0.0 0.17 1.0 0.13 0.17 0.21 0.25 0.29 0.27 0.18 0.59 0.18 0.55 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
CCL20179 (BN171_3740008)
 0.38 0.59 0.46 0.71 1.0 0.0 0.35 0.6 0.45 0.54 0.31 0.54 0.51 0.33 0.18 1.0 0.19 0.35 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35
CCL20219 (spaR)
 0.28 0.17 0.29 0.23 0.63 0.44 0.58 0.58 0.07 0.86 0.71 0.82 0.64 0.29 0.29 1.0 0.4 0.76 0.55 0.35 0.11 0.65 0.54 0.51 0.6 0.51 0.18 0.31 0.58
CCL20232 (BN171_3830002)
 0.28 0.7 0.23 0.53 0.36 0.0 0.32 0.44 0.31 0.47 0.43 0.4 0.26 0.22 1.0 0.38 0.39 0.67 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41
CCL20525 (ispD)
 0.85 0.21 0.51 0.2 0.48 0.62 0.49 0.47 0.14 0.53 0.59 0.57 0.53 1.0 0.23 0.69 0.28 0.49 0.44 0.7 0.11 0.21 0.3 0.22 0.5 0.4 0.19 0.28 0.54
CCL20526 (ispF)
 0.81 0.18 0.58 0.22 0.52 0.36 0.42 0.41 0.06 0.4 0.44 0.36 0.36 1.0 0.22 0.5 0.21 0.49 0.37 0.76 0.12 0.09 0.26 0.21 0.5 0.47 0.24 0.31 0.46
CCL20540 (BN171_620001)
 0.32 0.14 0.24 0.15 0.33 0.3 0.55 0.29 0.28 0.85 0.68 0.59 0.73 0.2 0.22 1.0 0.48 0.42 0.62 0.12 0.09 0.48 0.75 0.43 0.43 0.1 0.05 0.24 0.49
CCL20598 (rpsI)
 0.62 0.38 0.49 0.42 0.98 0.45 0.32 0.99 0.06 0.46 0.54 0.57 0.38 0.93 0.54 0.82 0.42 1.0 0.35 0.86 0.27 0.28 0.28 0.34 0.53 0.98 0.1 0.5 0.61
CCL20606 (BN171_720001)
 0.53 0.19 0.64 0.71 1.0 0.85 0.64 0.45 0.2 0.74 0.76 0.79 0.71 0.43 0.26 0.66 0.55 0.83 0.73 0.49 0.17 0.53 0.64 0.7 0.79 0.5 0.27 0.0 0.45
CCL20607 (BN171_720002)
 0.32 0.09 0.41 0.42 0.45 0.51 0.92 0.07 0.44 1.0 0.67 0.74 0.61 0.2 0.14 0.48 0.35 0.3 0.59 0.22 0.17 0.41 0.74 0.56 0.55 0.15 0.3 0.0 0.74
CCL20673 (BN171_880009)
 0.47 0.32 0.36 0.42 0.54 0.33 0.74 0.71 0.52 0.84 0.74 0.79 0.69 0.32 0.41 1.0 0.46 0.71 0.51 0.32 0.25 0.31 0.72 0.46 0.49 0.33 0.18 0.0 0.61
CCL20691 (BN171_930002)
 0.32 0.09 0.32 0.2 0.41 0.49 0.35 0.1 0.16 0.64 0.62 0.42 0.6 0.23 0.16 1.0 0.42 0.3 0.22 0.48 0.19 0.05 0.2 0.21 0.32 0.3 0.06 0.18 0.26
CCL20707 (mutS)
 1.0 0.26 0.59 0.27 0.88 0.73 0.49 0.75 0.15 0.62 0.62 0.61 0.9 0.78 0.28 1.0 0.41 0.87 0.61 0.74 0.18 0.7 0.65 0.29 0.6 0.55 0.16 0.34 0.62
CCL20708 (BN171_950009)
 0.94 0.24 0.62 0.27 0.82 0.66 0.47 0.84 0.04 0.52 0.38 0.5 0.63 0.71 0.29 0.52 0.37 0.79 0.58 1.0 0.3 0.84 0.55 0.29 0.49 0.78 0.38 0.3 0.48
CCL20709 (argS)
 0.54 0.17 0.47 0.22 0.53 0.72 0.47 0.43 0.11 0.63 0.6 0.62 0.72 0.5 0.22 1.0 0.44 0.6 0.51 0.68 0.23 0.6 0.66 0.35 0.61 0.45 0.12 0.38 0.56
CCL20745 (BN171_970004)
 0.12 0.15 0.09 0.15 0.12 0.42 1.0 0.15 0.57 0.37 0.36 0.26 0.46 0.09 0.14 0.76 0.22 0.15 0.25 0.22 0.31 0.23 0.38 0.41 0.44 0.18 0.17 0.3 0.26

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)