View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | BHI | Basal Medium | CD196,BHI | CD196,Basal Medium | CD196,Log,BHI | ClnR mutant | LB-CD16 | Log,BHI | LuxS KO | ND-CD12 | ND-CD13 | ND-CD17 | R20291 | R20291,BHI | R20291,Basal Medium | R20291,Heme+ | R20291,Log | R20291,Log,BHI | Strain 630 | Strain 630,BHI | Strain 630,Basal Medium | Strain 630,Faecal water+ | Strain 630,HPUra+ | Strain 630,Lag | Strain 630,Log | Strain 630,Log,BHI | Strain 630,Sporulating | TW11 | UK1 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CCL17047 (glgC) | 0.06 | 0.18 | 0.07 | 0.13 | 0.03 | 0.05 | 1.0 | 0.02 | 0.41 | 0.62 | 0.18 | 0.48 | 0.19 | 0.02 | 0.09 | 0.1 | 0.14 | 0.02 | 0.2 | 0.07 | 0.22 | 0.23 | 0.22 | 0.16 | 0.06 | 0.02 | 0.44 | 0.04 | 0.11 |
CCL17048 (glgD) | 0.03 | 0.05 | 0.06 | 0.1 | 0.03 | 0.04 | 1.0 | 0.01 | 0.25 | 0.56 | 0.17 | 0.46 | 0.19 | 0.02 | 0.04 | 0.07 | 0.11 | 0.01 | 0.16 | 0.05 | 0.18 | 0.08 | 0.18 | 0.11 | 0.04 | 0.01 | 0.26 | 0.04 | 0.11 |
CCL17049 (glgA) | 0.04 | 0.09 | 0.06 | 0.1 | 0.03 | 0.05 | 1.0 | 0.02 | 0.35 | 0.63 | 0.2 | 0.51 | 0.23 | 0.02 | 0.06 | 0.13 | 0.12 | 0.01 | 0.19 | 0.04 | 0.15 | 0.12 | 0.26 | 0.2 | 0.08 | 0.02 | 0.24 | 0.04 | 0.13 |
CCL17050 (glgP) | 0.07 | 0.16 | 0.11 | 0.2 | 0.06 | 0.05 | 1.0 | 0.03 | 0.35 | 0.6 | 0.18 | 0.48 | 0.22 | 0.03 | 0.1 | 0.11 | 0.13 | 0.03 | 0.22 | 0.07 | 0.22 | 0.17 | 0.34 | 0.2 | 0.07 | 0.02 | 0.21 | 0.06 | 0.11 |
CCL17051 (BN171_1130005) | 0.07 | 0.15 | 0.09 | 0.14 | 0.05 | 0.06 | 1.0 | 0.03 | 0.17 | 0.63 | 0.19 | 0.55 | 0.18 | 0.03 | 0.07 | 0.14 | 0.12 | 0.02 | 0.18 | 0.05 | 0.15 | 0.21 | 0.35 | 0.16 | 0.08 | 0.02 | 0.14 | 0.06 | 0.12 |
CCL17078 (leuC) | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.04 | 0.09 | 1.0 | 0.03 | 0.01 | 0.62 | 0.06 | 0.42 | 0.06 | 0.01 | 0.02 | 0.11 | 0.12 | 0.02 | 0.07 | 0.02 | 0.01 | 0.14 | 0.07 | 0.03 | 0.03 | 0.02 | 0.42 | 0.11 | 0.03 |
CCL17079 (leuD) | 0.04 | 0.01 | 0.04 | 0.04 | 0.04 | 0.08 | 1.0 | 0.03 | 0.01 | 0.94 | 0.08 | 0.31 | 0.06 | 0.01 | 0.02 | 0.12 | 0.06 | 0.02 | 0.06 | 0.05 | 0.01 | 0.1 | 0.08 | 0.04 | 0.03 | 0.02 | 0.22 | 0.1 | 0.01 |
CCL17080 (leuB) | 0.13 | 0.05 | 0.13 | 0.17 | 0.14 | 0.14 | 1.0 | 0.1 | 0.04 | 0.97 | 0.09 | 0.57 | 0.16 | 0.07 | 0.06 | 0.25 | 0.09 | 0.07 | 0.13 | 0.17 | 0.1 | 0.18 | 0.18 | 0.06 | 0.05 | 0.1 | 0.31 | 0.2 | 0.05 |
CCL17655 (cwp) | 0.37 | 0.21 | 0.34 | 0.14 | 0.24 | 0.28 | 0.83 | 0.15 | 0.16 | 1.0 | 0.83 | 0.92 | 0.42 | 0.1 | 0.05 | 0.68 | 0.28 | 0.11 | 0.61 | 0.49 | 0.26 | 0.28 | 0.74 | 0.6 | 0.5 | 0.18 | 0.78 | 0.38 | 0.59 |
CCL17765 (BN171_1780001) | 0.02 | 0.0 | 0.01 | 0.03 | 0.03 | 0.02 | 0.4 | 0.0 | 0.07 | 0.27 | 0.04 | 1.0 | 0.06 | 0.0 | 0.01 | 0.07 | 0.07 | 0.01 | 0.11 | 0.04 | 0.02 | 0.0 | 0.22 | 0.17 | 0.11 | 0.01 | 0.69 | 0.05 | 0.05 |
CCL17785 (hisD) | 0.28 | 0.31 | 0.31 | 0.34 | 0.27 | 0.19 | 0.73 | 0.24 | 0.09 | 1.0 | 0.55 | 0.22 | 0.38 | 0.19 | 0.17 | 0.62 | 0.3 | 0.29 | 0.26 | 0.3 | 0.14 | 0.3 | 0.28 | 0.21 | 0.33 | 0.19 | 0.54 | 0.37 | 0.38 |
CCL17849 (BN171_1840009) | 0.23 | 0.31 | 0.19 | 0.28 | 0.13 | 0.2 | 0.94 | 0.06 | 0.17 | 1.0 | 0.51 | 0.13 | 0.36 | 0.07 | 0.08 | 0.69 | 0.21 | 0.04 | 0.32 | 0.17 | 0.41 | 0.17 | 0.24 | 0.39 | 0.49 | 0.07 | 0.23 | 0.18 | 0.27 |
CCL17850 (BN171_1840010) | 0.11 | 0.14 | 0.11 | 0.12 | 0.06 | 0.21 | 0.95 | 0.03 | 0.08 | 1.0 | 0.5 | 0.15 | 0.25 | 0.04 | 0.03 | 0.55 | 0.19 | 0.02 | 0.24 | 0.11 | 0.28 | 0.09 | 0.18 | 0.32 | 0.37 | 0.04 | 0.17 | 0.16 | 0.32 |
CCL18225 (BN171_2170012) | 0.12 | 0.18 | 0.15 | 0.19 | 0.12 | 0.38 | 0.78 | 0.05 | 0.19 | 1.0 | 0.89 | 0.84 | 0.27 | 0.06 | 0.08 | 0.26 | 0.13 | 0.06 | 0.33 | 0.23 | 0.4 | 0.04 | 0.37 | 0.55 | 0.34 | 0.13 | 0.27 | 0.23 | 0.55 |
CCL18226 (BN171_2170013) | 0.09 | 0.12 | 0.11 | 0.13 | 0.06 | 0.22 | 0.7 | 0.04 | 0.26 | 1.0 | 0.65 | 0.53 | 0.28 | 0.07 | 0.06 | 0.28 | 0.18 | 0.04 | 0.28 | 0.13 | 0.27 | 0.1 | 0.33 | 0.5 | 0.28 | 0.06 | 0.37 | 0.21 | 0.27 |
CCL18360 (BN171_2230010) | 0.05 | 0.09 | 0.06 | 0.16 | 0.06 | 0.11 | 0.71 | 0.04 | 0.15 | 0.6 | 0.4 | 0.53 | 0.33 | 0.04 | 0.1 | 0.55 | 0.2 | 0.05 | 0.19 | 0.13 | 0.31 | 0.25 | 0.2 | 0.35 | 0.43 | 0.05 | 1.0 | 0.27 | 0.28 |
CCL18361 (BN171_2240001) | 0.05 | 0.04 | 0.07 | 0.08 | 0.05 | 0.1 | 0.95 | 0.02 | 0.08 | 1.0 | 0.61 | 0.73 | 0.4 | 0.03 | 0.04 | 0.63 | 0.17 | 0.03 | 0.21 | 0.22 | 0.2 | 0.03 | 0.24 | 0.26 | 0.34 | 0.07 | 0.58 | 0.25 | 0.43 |
CCL18478 (thrC) | 0.11 | 0.03 | 0.13 | 0.07 | 0.15 | 0.19 | 0.56 | 0.06 | 0.02 | 0.93 | 0.77 | 0.41 | 0.76 | 0.1 | 0.05 | 0.94 | 0.16 | 0.13 | 0.14 | 0.07 | 0.03 | 0.05 | 0.21 | 0.24 | 0.25 | 0.03 | 1.0 | 0.25 | 0.7 |
CCL18479 (thrB) | 0.14 | 0.03 | 0.14 | 0.1 | 0.13 | 0.23 | 0.33 | 0.07 | 0.02 | 0.47 | 0.45 | 0.22 | 0.58 | 0.12 | 0.04 | 0.81 | 0.18 | 0.13 | 0.14 | 0.15 | 0.06 | 0.04 | 0.2 | 0.39 | 0.37 | 0.08 | 1.0 | 0.29 | 0.34 |
CCL18539 (BN171_2420006) | 0.5 | 0.23 | 0.51 | 0.25 | 0.48 | 0.44 | 0.81 | 0.36 | 0.27 | 0.79 | 0.85 | 0.67 | 0.52 | 0.31 | 0.29 | 0.78 | 0.57 | 0.59 | 0.86 | 0.63 | 0.23 | 0.53 | 1.0 | 0.31 | 0.59 | 0.52 | 0.66 | 0.89 | 0.72 |
CCL18540 (BN171_2420007) | 0.15 | 0.04 | 0.18 | 0.09 | 0.16 | 0.32 | 0.72 | 0.06 | 0.21 | 0.94 | 1.0 | 0.83 | 0.64 | 0.14 | 0.08 | 0.86 | 0.31 | 0.16 | 0.6 | 0.32 | 0.13 | 0.21 | 0.7 | 0.3 | 0.54 | 0.19 | 0.62 | 0.76 | 1.0 |
CCL18541 (bioB) | 0.28 | 0.11 | 0.27 | 0.16 | 0.26 | 0.38 | 0.68 | 0.15 | 0.19 | 1.0 | 0.98 | 0.8 | 0.58 | 0.21 | 0.18 | 0.83 | 0.34 | 0.33 | 0.61 | 0.4 | 0.16 | 0.26 | 0.63 | 0.29 | 0.51 | 0.25 | 0.64 | 0.6 | 0.88 |
CCL18542 (thiH) | 0.2 | 0.29 | 0.24 | 0.26 | 0.27 | 0.26 | 0.84 | 0.2 | 0.12 | 0.94 | 0.99 | 0.8 | 0.35 | 0.2 | 0.36 | 0.39 | 0.21 | 0.39 | 0.37 | 0.39 | 0.21 | 0.22 | 0.12 | 0.1 | 0.21 | 0.27 | 0.77 | 0.64 | 1.0 |
CCL18544 (gabT) | 0.01 | 0.11 | 0.01 | 0.05 | 0.01 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.13 | 0.29 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.12 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.11 | 0.02 | 0.01 | 0.06 | 0.02 | 0.01 | 0.32 | 0.01 | 0.01 |
CCL18551 (ldh) | 0.31 | 0.42 | 0.22 | 0.41 | 0.16 | 0.04 | 1.0 | 0.11 | 0.33 | 0.97 | 0.62 | 0.35 | 0.31 | 0.07 | 0.09 | 0.55 | 0.22 | 0.06 | 0.17 | 0.09 | 0.11 | 0.06 | 0.27 | 0.21 | 0.2 | 0.03 | 0.5 | 0.1 | 0.27 |
CCL18945 (leuS) | 0.39 | 0.11 | 0.23 | 0.09 | 0.3 | 0.45 | 0.91 | 0.25 | 0.02 | 0.98 | 0.75 | 0.58 | 0.63 | 0.31 | 0.08 | 1.0 | 0.41 | 0.43 | 0.26 | 0.34 | 0.09 | 0.55 | 0.29 | 0.22 | 0.5 | 0.26 | 0.78 | 0.32 | 0.49 |
CCL19167 (brnQ) | 0.04 | 0.05 | 0.03 | 0.07 | 0.03 | 0.02 | 1.0 | 0.02 | 0.02 | 0.3 | 0.11 | 0.12 | 0.09 | 0.02 | 0.03 | 0.1 | 0.1 | 0.03 | 0.05 | 0.02 | 0.06 | 0.08 | 0.06 | 0.06 | 0.11 | 0.02 | 0.25 | 0.07 | 0.08 |
CCL19203 (cwp) | 0.58 | 0.46 | 0.5 | 0.22 | 0.32 | 0.3 | 0.87 | 0.29 | 0.47 | 1.0 | 0.71 | 0.7 | 0.68 | 0.33 | 0.29 | 0.85 | 0.32 | 0.36 | 0.32 | 0.44 | 0.22 | 0.32 | 0.46 | 0.55 | 0.28 | 0.18 | 0.69 | 0.59 | 0.52 |
CCL19259 (cwp) | 0.58 | 0.26 | 0.51 | 0.24 | 0.32 | 0.38 | 0.3 | 0.32 | 0.04 | 0.38 | 0.38 | 0.4 | 0.49 | 0.37 | 0.23 | 1.0 | 0.24 | 0.45 | 0.52 | 0.77 | 0.26 | 0.61 | 0.76 | 0.52 | 0.7 | 0.38 | 0.59 | 0.42 | 0.32 |
CCL19386 (atpD) | 0.0 | 0.06 | 0.0 | 0.05 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.55 | 0.08 | 0.22 | 0.02 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.05 | 0.01 | 0.07 | 0.03 | 0.03 | 0.01 | 0.03 | 0.01 | 0.6 | 0.02 | 0.02 |
CCL19387 (atpB) | 0.01 | 0.09 | 0.01 | 0.1 | 0.01 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.55 | 0.08 | 0.22 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.05 | 0.02 | 0.1 | 0.06 | 0.03 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 0.44 | 0.02 | 0.02 |
CCL19388 (atpA) | 0.01 | 0.09 | 0.01 | 0.1 | 0.01 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.65 | 0.09 | 0.23 | 0.01 | 0.0 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.05 | 0.02 | 0.08 | 0.06 | 0.02 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 0.34 | 0.02 | 0.03 |
CCL19389 (atpF) | 0.0 | 0.04 | 0.0 | 0.03 | 0.0 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.78 | 0.08 | 0.23 | 0.02 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.07 | 0.0 | 0.03 | 0.06 | 0.03 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.43 | 0.03 | 0.01 |
CCL19390 (atpC) | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.04 | 0.0 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.73 | 0.1 | 0.25 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.06 | 0.01 | 0.05 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.36 | 0.02 | 0.03 |
CCL19391 (atpE) | 0.0 | 0.03 | 0.0 | 0.04 | 0.0 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.56 | 0.09 | 0.21 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.04 | 0.01 | 0.04 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.23 | 0.01 | 0.03 |
CCL19392 (atpK) | 0.01 | 0.08 | 0.01 | 0.08 | 0.01 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.66 | 0.09 | 0.23 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.05 | 0.01 | 0.07 | 0.05 | 0.02 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.45 | 0.02 | 0.02 |
CCL19393 (atpI) | 0.01 | 0.1 | 0.01 | 0.1 | 0.01 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.01 | 0.64 | 0.12 | 0.23 | 0.02 | 0.01 | 0.04 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.08 | 0.02 | 0.09 | 0.04 | 0.04 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.3 | 0.02 | 0.03 |
CCL19394 (BN171_3090013) | 0.04 | 0.28 | 0.04 | 0.19 | 0.04 | 0.04 | 1.0 | 0.04 | 0.07 | 0.61 | 0.12 | 0.21 | 0.03 | 0.02 | 0.11 | 0.04 | 0.04 | 0.05 | 0.12 | 0.06 | 0.15 | 0.13 | 0.06 | 0.02 | 0.04 | 0.05 | 0.51 | 0.04 | 0.04 |
CCL19627 (rnr) | 0.87 | 0.68 | 0.71 | 0.63 | 0.56 | 0.47 | 0.79 | 0.59 | 0.43 | 0.78 | 0.69 | 0.6 | 0.73 | 0.57 | 0.47 | 0.89 | 0.47 | 0.44 | 0.53 | 0.65 | 0.4 | 0.43 | 0.54 | 0.28 | 0.54 | 0.44 | 1.0 | 0.53 | 0.55 |
CCL19890 (BN171_3590011) | 0.06 | 0.01 | 0.08 | 0.04 | 0.07 | 0.21 | 0.77 | 0.02 | 0.11 | 0.42 | 0.41 | 0.4 | 0.79 | 0.06 | 0.03 | 1.0 | 0.19 | 0.04 | 0.29 | 0.17 | 0.11 | 0.08 | 0.22 | 0.39 | 0.48 | 0.04 | 0.57 | 0.5 | 0.39 |
CCL19926 (BN171_3600004) | 0.02 | 0.2 | 0.02 | 0.11 | 0.02 | 0.03 | 0.79 | 0.01 | 0.07 | 1.0 | 0.23 | 0.1 | 0.1 | 0.01 | 0.08 | 0.04 | 0.1 | 0.01 | 0.18 | 0.03 | 0.35 | 0.19 | 0.06 | 0.07 | 0.05 | 0.02 | 0.35 | 0.07 | 0.06 |
CCL20455 (fusA) | 0.03 | 0.19 | 0.06 | 0.18 | 0.01 | 0.01 | 1.0 | 0.01 | 0.25 | 0.51 | 0.14 | 0.19 | 0.11 | 0.01 | 0.08 | 0.02 | 0.08 | 0.01 | 0.08 | 0.05 | 0.33 | 0.51 | 0.02 | 0.1 | 0.01 | 0.01 | 0.45 | 0.01 | 0.04 |
CCL20476 (BN171_540001) | 0.06 | 0.07 | 0.05 | 0.07 | 0.05 | 0.03 | 1.0 | 0.04 | 0.03 | 0.74 | 0.14 | 0.1 | 0.06 | 0.03 | 0.03 | 0.11 | 0.1 | 0.05 | 0.14 | 0.04 | 0.04 | 0.03 | 0.1 | 0.02 | 0.08 | 0.04 | 0.13 | 0.07 | 0.05 |
CCL20702 (BN171_950003) | 0.15 | 0.22 | 0.23 | 0.26 | 0.18 | 0.34 | 0.34 | 0.2 | 0.19 | 0.34 | 0.25 | 0.28 | 0.35 | 0.1 | 0.16 | 0.28 | 0.11 | 0.13 | 0.36 | 0.28 | 0.21 | 1.0 | 0.32 | 0.42 | 0.28 | 0.26 | 0.3 | 0.17 | 0.25 |
CCL20703 (BN171_950004) | 0.24 | 0.34 | 0.5 | 0.46 | 0.42 | 0.77 | 0.81 | 0.32 | 0.29 | 0.79 | 0.56 | 0.65 | 0.63 | 0.15 | 0.26 | 0.66 | 0.22 | 0.23 | 0.77 | 0.42 | 0.39 | 1.0 | 0.78 | 0.93 | 0.66 | 0.39 | 0.75 | 0.29 | 0.41 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)