1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
BHI
Basal Medium
CD196,BHI
CD196,Basal Medium
CD196,Log,BHI
ClnR mutant
LB-CD16
Log,BHI
LuxS KO
ND-CD12
ND-CD13
ND-CD17
R20291
R20291,BHI
R20291,Basal Medium
R20291,Heme+
R20291,Log
R20291,Log,BHI
Strain 630
Strain 630,BHI
Strain 630,Basal Medium
Strain 630,Faecal water+
Strain 630,HPUra+
Strain 630,Lag
Strain 630,Log
Strain 630,Log,BHI
Strain 630,Sporulating
TW11
UK1
CCL17047 (glgC)
 0.06 0.18 0.07 0.13 0.03 0.05 1.0 0.02 0.41 0.62 0.18 0.48 0.19 0.02 0.09 0.1 0.14 0.02 0.2 0.07 0.22 0.23 0.22 0.16 0.06 0.02 0.44 0.04 0.11
CCL17048 (glgD)
 0.03 0.05 0.06 0.1 0.03 0.04 1.0 0.01 0.25 0.56 0.17 0.46 0.19 0.02 0.04 0.07 0.11 0.01 0.16 0.05 0.18 0.08 0.18 0.11 0.04 0.01 0.26 0.04 0.11
CCL17049 (glgA)
 0.04 0.09 0.06 0.1 0.03 0.05 1.0 0.02 0.35 0.63 0.2 0.51 0.23 0.02 0.06 0.13 0.12 0.01 0.19 0.04 0.15 0.12 0.26 0.2 0.08 0.02 0.24 0.04 0.13
CCL17050 (glgP)
 0.07 0.16 0.11 0.2 0.06 0.05 1.0 0.03 0.35 0.6 0.18 0.48 0.22 0.03 0.1 0.11 0.13 0.03 0.22 0.07 0.22 0.17 0.34 0.2 0.07 0.02 0.21 0.06 0.11
CCL17051 (BN171_1130005)
 0.07 0.15 0.09 0.14 0.05 0.06 1.0 0.03 0.17 0.63 0.19 0.55 0.18 0.03 0.07 0.14 0.12 0.02 0.18 0.05 0.15 0.21 0.35 0.16 0.08 0.02 0.14 0.06 0.12
CCL17078 (leuC)
 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.09 1.0 0.03 0.01 0.62 0.06 0.42 0.06 0.01 0.02 0.11 0.12 0.02 0.07 0.02 0.01 0.14 0.07 0.03 0.03 0.02 0.42 0.11 0.03
CCL17079 (leuD)
 0.04 0.01 0.04 0.04 0.04 0.08 1.0 0.03 0.01 0.94 0.08 0.31 0.06 0.01 0.02 0.12 0.06 0.02 0.06 0.05 0.01 0.1 0.08 0.04 0.03 0.02 0.22 0.1 0.01
CCL17080 (leuB)
 0.13 0.05 0.13 0.17 0.14 0.14 1.0 0.1 0.04 0.97 0.09 0.57 0.16 0.07 0.06 0.25 0.09 0.07 0.13 0.17 0.1 0.18 0.18 0.06 0.05 0.1 0.31 0.2 0.05
CCL17655 (cwp)
 0.37 0.21 0.34 0.14 0.24 0.28 0.83 0.15 0.16 1.0 0.83 0.92 0.42 0.1 0.05 0.68 0.28 0.11 0.61 0.49 0.26 0.28 0.74 0.6 0.5 0.18 0.78 0.38 0.59
CCL17765 (BN171_1780001)
 0.02 0.0 0.01 0.03 0.03 0.02 0.4 0.0 0.07 0.27 0.04 1.0 0.06 0.0 0.01 0.07 0.07 0.01 0.11 0.04 0.02 0.0 0.22 0.17 0.11 0.01 0.69 0.05 0.05
CCL17785 (hisD)
 0.28 0.31 0.31 0.34 0.27 0.19 0.73 0.24 0.09 1.0 0.55 0.22 0.38 0.19 0.17 0.62 0.3 0.29 0.26 0.3 0.14 0.3 0.28 0.21 0.33 0.19 0.54 0.37 0.38
CCL17849 (BN171_1840009)
 0.23 0.31 0.19 0.28 0.13 0.2 0.94 0.06 0.17 1.0 0.51 0.13 0.36 0.07 0.08 0.69 0.21 0.04 0.32 0.17 0.41 0.17 0.24 0.39 0.49 0.07 0.23 0.18 0.27
CCL17850 (BN171_1840010)
 0.11 0.14 0.11 0.12 0.06 0.21 0.95 0.03 0.08 1.0 0.5 0.15 0.25 0.04 0.03 0.55 0.19 0.02 0.24 0.11 0.28 0.09 0.18 0.32 0.37 0.04 0.17 0.16 0.32
CCL18225 (BN171_2170012)
 0.12 0.18 0.15 0.19 0.12 0.38 0.78 0.05 0.19 1.0 0.89 0.84 0.27 0.06 0.08 0.26 0.13 0.06 0.33 0.23 0.4 0.04 0.37 0.55 0.34 0.13 0.27 0.23 0.55
CCL18226 (BN171_2170013)
 0.09 0.12 0.11 0.13 0.06 0.22 0.7 0.04 0.26 1.0 0.65 0.53 0.28 0.07 0.06 0.28 0.18 0.04 0.28 0.13 0.27 0.1 0.33 0.5 0.28 0.06 0.37 0.21 0.27
CCL18360 (BN171_2230010)
 0.05 0.09 0.06 0.16 0.06 0.11 0.71 0.04 0.15 0.6 0.4 0.53 0.33 0.04 0.1 0.55 0.2 0.05 0.19 0.13 0.31 0.25 0.2 0.35 0.43 0.05 1.0 0.27 0.28
CCL18361 (BN171_2240001)
 0.05 0.04 0.07 0.08 0.05 0.1 0.95 0.02 0.08 1.0 0.61 0.73 0.4 0.03 0.04 0.63 0.17 0.03 0.21 0.22 0.2 0.03 0.24 0.26 0.34 0.07 0.58 0.25 0.43
CCL18478 (thrC)
 0.11 0.03 0.13 0.07 0.15 0.19 0.56 0.06 0.02 0.93 0.77 0.41 0.76 0.1 0.05 0.94 0.16 0.13 0.14 0.07 0.03 0.05 0.21 0.24 0.25 0.03 1.0 0.25 0.7
CCL18479 (thrB)
 0.14 0.03 0.14 0.1 0.13 0.23 0.33 0.07 0.02 0.47 0.45 0.22 0.58 0.12 0.04 0.81 0.18 0.13 0.14 0.15 0.06 0.04 0.2 0.39 0.37 0.08 1.0 0.29 0.34
CCL18539 (BN171_2420006)
 0.5 0.23 0.51 0.25 0.48 0.44 0.81 0.36 0.27 0.79 0.85 0.67 0.52 0.31 0.29 0.78 0.57 0.59 0.86 0.63 0.23 0.53 1.0 0.31 0.59 0.52 0.66 0.89 0.72
CCL18540 (BN171_2420007)
 0.15 0.04 0.18 0.09 0.16 0.32 0.72 0.06 0.21 0.94 1.0 0.83 0.64 0.14 0.08 0.86 0.31 0.16 0.6 0.32 0.13 0.21 0.7 0.3 0.54 0.19 0.62 0.76 1.0
CCL18541 (bioB)
 0.28 0.11 0.27 0.16 0.26 0.38 0.68 0.15 0.19 1.0 0.98 0.8 0.58 0.21 0.18 0.83 0.34 0.33 0.61 0.4 0.16 0.26 0.63 0.29 0.51 0.25 0.64 0.6 0.88
CCL18542 (thiH)
 0.2 0.29 0.24 0.26 0.27 0.26 0.84 0.2 0.12 0.94 0.99 0.8 0.35 0.2 0.36 0.39 0.21 0.39 0.37 0.39 0.21 0.22 0.12 0.1 0.21 0.27 0.77 0.64 1.0
CCL18544 (gabT)
 0.01 0.11 0.01 0.05 0.01 0.01 1.0 0.0 0.13 0.29 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.12 0.01 0.02 0.02 0.11 0.02 0.01 0.06 0.02 0.01 0.32 0.01 0.01
CCL18551 (ldh)
 0.31 0.42 0.22 0.41 0.16 0.04 1.0 0.11 0.33 0.97 0.62 0.35 0.31 0.07 0.09 0.55 0.22 0.06 0.17 0.09 0.11 0.06 0.27 0.21 0.2 0.03 0.5 0.1 0.27
CCL18945 (leuS)
 0.39 0.11 0.23 0.09 0.3 0.45 0.91 0.25 0.02 0.98 0.75 0.58 0.63 0.31 0.08 1.0 0.41 0.43 0.26 0.34 0.09 0.55 0.29 0.22 0.5 0.26 0.78 0.32 0.49
CCL19167 (brnQ)
 0.04 0.05 0.03 0.07 0.03 0.02 1.0 0.02 0.02 0.3 0.11 0.12 0.09 0.02 0.03 0.1 0.1 0.03 0.05 0.02 0.06 0.08 0.06 0.06 0.11 0.02 0.25 0.07 0.08
CCL19203 (cwp)
 0.58 0.46 0.5 0.22 0.32 0.3 0.87 0.29 0.47 1.0 0.71 0.7 0.68 0.33 0.29 0.85 0.32 0.36 0.32 0.44 0.22 0.32 0.46 0.55 0.28 0.18 0.69 0.59 0.52
CCL19259 (cwp)
 0.58 0.26 0.51 0.24 0.32 0.38 0.3 0.32 0.04 0.38 0.38 0.4 0.49 0.37 0.23 1.0 0.24 0.45 0.52 0.77 0.26 0.61 0.76 0.52 0.7 0.38 0.59 0.42 0.32
CCL19386 (atpD)
 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.55 0.08 0.22 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.05 0.01 0.07 0.03 0.03 0.01 0.03 0.01 0.6 0.02 0.02
CCL19387 (atpB)
 0.01 0.09 0.01 0.1 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.55 0.08 0.22 0.02 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.05 0.02 0.1 0.06 0.03 0.0 0.02 0.02 0.44 0.02 0.02
CCL19388 (atpA)
 0.01 0.09 0.01 0.1 0.01 0.01 1.0 0.0 0.0 0.65 0.09 0.23 0.01 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.05 0.02 0.08 0.06 0.02 0.0 0.02 0.02 0.34 0.02 0.03
CCL19389 (atpF)
 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.78 0.08 0.23 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.07 0.0 0.03 0.06 0.03 0.0 0.02 0.01 0.43 0.03 0.01
CCL19390 (atpC)
 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.73 0.1 0.25 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.06 0.01 0.05 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.36 0.02 0.03
CCL19391 (atpE)
 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.56 0.09 0.21 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.04 0.01 0.04 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.23 0.01 0.03
CCL19392 (atpK)
 0.01 0.08 0.01 0.08 0.01 0.01 1.0 0.0 0.0 0.66 0.09 0.23 0.02 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.05 0.01 0.07 0.05 0.02 0.0 0.02 0.01 0.45 0.02 0.02
CCL19393 (atpI)
 0.01 0.1 0.01 0.1 0.01 0.01 1.0 0.0 0.01 0.64 0.12 0.23 0.02 0.01 0.04 0.02 0.02 0.01 0.08 0.02 0.09 0.04 0.04 0.01 0.02 0.02 0.3 0.02 0.03
CCL19394 (BN171_3090013)
 0.04 0.28 0.04 0.19 0.04 0.04 1.0 0.04 0.07 0.61 0.12 0.21 0.03 0.02 0.11 0.04 0.04 0.05 0.12 0.06 0.15 0.13 0.06 0.02 0.04 0.05 0.51 0.04 0.04
CCL19627 (rnr)
 0.87 0.68 0.71 0.63 0.56 0.47 0.79 0.59 0.43 0.78 0.69 0.6 0.73 0.57 0.47 0.89 0.47 0.44 0.53 0.65 0.4 0.43 0.54 0.28 0.54 0.44 1.0 0.53 0.55
CCL19890 (BN171_3590011)
 0.06 0.01 0.08 0.04 0.07 0.21 0.77 0.02 0.11 0.42 0.41 0.4 0.79 0.06 0.03 1.0 0.19 0.04 0.29 0.17 0.11 0.08 0.22 0.39 0.48 0.04 0.57 0.5 0.39
CCL19926 (BN171_3600004)
 0.02 0.2 0.02 0.11 0.02 0.03 0.79 0.01 0.07 1.0 0.23 0.1 0.1 0.01 0.08 0.04 0.1 0.01 0.18 0.03 0.35 0.19 0.06 0.07 0.05 0.02 0.35 0.07 0.06
CCL20455 (fusA)
 0.03 0.19 0.06 0.18 0.01 0.01 1.0 0.01 0.25 0.51 0.14 0.19 0.11 0.01 0.08 0.02 0.08 0.01 0.08 0.05 0.33 0.51 0.02 0.1 0.01 0.01 0.45 0.01 0.04
CCL20476 (BN171_540001)
 0.06 0.07 0.05 0.07 0.05 0.03 1.0 0.04 0.03 0.74 0.14 0.1 0.06 0.03 0.03 0.11 0.1 0.05 0.14 0.04 0.04 0.03 0.1 0.02 0.08 0.04 0.13 0.07 0.05
CCL20702 (BN171_950003)
 0.15 0.22 0.23 0.26 0.18 0.34 0.34 0.2 0.19 0.34 0.25 0.28 0.35 0.1 0.16 0.28 0.11 0.13 0.36 0.28 0.21 1.0 0.32 0.42 0.28 0.26 0.3 0.17 0.25
CCL20703 (BN171_950004)
 0.24 0.34 0.5 0.46 0.42 0.77 0.81 0.32 0.29 0.79 0.56 0.65 0.63 0.15 0.26 0.66 0.22 0.23 0.77 0.42 0.39 1.0 0.78 0.93 0.66 0.39 0.75 0.29 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)