Heatmap: Cluster_5 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
26695
26695,R.hpyAII-M2.hpyAII gene deletion
BCM-300,GCGC-MTase JHP1050 mutant
BCM-300,wild type,wild type
G27,Homo sapiens
G27,Homo sapiens,gastric disease
J99,Homo sapiens
NCTC 11637
P12
CBI65565 (mod3)
0.18 0.16 1.0 0.98 0.21 0.07 0.11 0.03 0.39
CBI65566 (res)
0.12 0.04 1.0 0.87 0.05 0.04 0.08 0.01 0.34
CBI65578 (HPB8_21)
0.39 0.53 0.95 0.82 1.0 0.37 0.57 0.42 0.66
CBI65586 (HPB8_29)
0.21 0.04 1.0 0.97 0.13 0.08 0.06 0.03 0.19
CBI65587 (dam1)
0.0 0.0 1.0 0.91 0.06 0.11 0.0 0.01 0.0
CBI65612 (coaD)
0.17 0.16 0.92 1.0 0.13 0.07 0.07 0.16 0.27
CBI65695 (tonB1)
0.36 0.38 1.0 0.97 0.15 0.19 0.16 0.28 0.29
CBI65696 (exbD3)
0.23 0.22 1.0 0.88 0.17 0.06 0.33 0.36 0.3
CBI65749 (HPB8_192)
0.07 0.17 0.06 0.08 0.0 0.02 1.0 0.06 0.16
CBI65806 (HPB8_249)
0.18 0.11 0.96 1.0 0.31 0.13 0.38 0.19 0.3
CBI65815 (cytc553)
0.26 0.19 1.0 0.76 0.33 0.06 0.17 0.29 0.15
CBI65816 (hemN1)
0.43 0.15 0.93 1.0 0.16 0.1 0.33 0.12 0.36
CBI65817 (crcB)
0.29 0.2 0.93 1.0 0.15 0.05 0.36 0.28 0.13
CBI65881 (HPB8_324)
0.57 0.61 0.61 0.52 1.0 0.54 0.36 0.45 0.63
CBI65908 (HPB8_351)
0.22 0.07 1.0 0.98 0.07 0.11 0.27 0.08 0.24
CBI65917 (HPB8_360)
0.0 0.0 0.98 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69
CBI65930 (tonB3)
0.27 0.09 1.0 0.96 0.14 0.22 0.13 0.03 0.13
CBI65945 (HPB8_388)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
CBI65955 (HPB8_398)
0.37 0.2 0.98 1.0 0.34 0.19 0.28 0.06 0.37
CBI65958 (glk)
0.19 0.41 0.81 1.0 0.67 0.41 0.43 0.98 0.45
CBI66008 (ispH)
0.15 0.14 0.98 1.0 0.74 0.12 0.66 0.77 0.65
CBI66027 (HPB8_470)
0.26 0.24 1.0 1.0 0.31 0.25 0.17 0.21 0.33
CBI66030 (HPB8_473)
0.0 0.0 0.84 1.0 0.0 0.0 0.51 0.47 0.0
CBI66031 (HPB8_474)
0.0 0.0 0.97 1.0 0.0 0.0 0.13 0.15 0.0
CBI66068 (HPB8_511)
0.0 0.0 0.8 1.0 0.18 0.1 0.02 0.06 0.05
CBI66069 (HPB8_512)
0.0 0.0 0.83 1.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.55
CBI66076 (HPB8_519)
0.13 0.03 1.0 0.97 0.0 0.0 0.09 0.08 0.19
CBI66078 (HPB8_521)
0.07 0.01 0.05 0.06 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02
CBI66081 (HPB8_524)
0.0 0.0 1.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.1 0.35
CBI66084 (trbL1)
0.0 0.0 1.0 0.95 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
CBI66085 (HPB8_528)
0.0 0.0 0.93 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CBI66087 (HPB8_530)
0.0 0.0 0.97 1.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0
CBI66089 (HPB8_532)
0.0 0.0 0.96 0.82 0.0 0.0 1.0 0.59 0.0
CBI66090 (HPB8_533)
0.0 0.0 1.0 0.98 0.0 0.0 0.21 0.33 0.21
CBI66091 (HPB8_534)
0.0 0.0 0.92 1.0 0.0 0.0 0.32 0.15 0.1
CBI66092 (HPB8_535)
0.0 0.0 0.99 1.0 0.0 0.0 0.5 0.2 0.28
CBI66093 (HPB8_536)
0.0 0.0 1.0 0.86 0.0 0.0 0.76 0.89 0.29
CBI66094 (topA3)
0.0 0.0 0.62 0.63 0.0 0.0 1.0 0.71 0.21
CBI66095 (virD4)
0.0 0.0 0.46 0.56 0.0 0.0 1.0 0.0 0.19
CBI66096 (HPB8_539)
0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07
CBI66097 (virB11-3)
0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01
CBI66098 (HPB8_541)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
CBI66099 (HPB8_542)
0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01
CBI66100 (HPB8_543)
0.0 0.0 0.74 0.97 0.0 0.0 1.0 0.0 0.66
CBI66101 (virB10-1)
0.0 0.0 0.83 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4
CBI66102 (virB9-1)
0.0 0.0 0.89 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59
CBI66106 (HPB8_549)
0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0
CBI66111 (HPB8_554)
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
CBI66113 (xerD)
0.0 0.0 1.0 0.95 0.0 0.0 0.07 0.02 0.02
CBI66136 (vapD)
0.14 0.16 1.0 0.77 0.0 0.0 0.02 0.0 0.24
CBI66149 (rdxA)
0.35 0.51 1.0 0.93 0.55 0.43 0.49 0.04 0.99
CBI66172 (HPB8_615)
0.27 0.11 0.96 1.0 0.14 0.06 0.2 0.06 0.22
CBI66173 (nrdG)
0.07 0.09 0.92 1.0 0.1 0.03 0.05 0.05 0.15
CBI66205 (ackA1)
0.13 0.0 0.69 0.76 0.0 0.0 1.0 0.01 0.33
CBI66218 (HPB8_661)
0.46 0.63 1.0 0.86 0.5 0.31 0.34 0.79 0.38
CBI66221 (fecE)
0.31 0.3 1.0 0.93 0.41 0.13 0.5 0.42 0.59
CBI66230 (HPB8_673)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
CBI66233 (rpmB)
0.27 0.04 0.72 1.0 0.02 0.01 0.3 0.0 0.31
CBI66278 (HPB8_721)
0.0 0.0 0.3 0.42 0.0 0.0 1.0 0.2 0.02
CBI66283 (HPB8_726)
0.12 0.07 1.0 0.93 0.05 0.08 0.48 0.06 0.23
CBI66344 (oorA)
0.27 0.35 0.34 0.33 0.38 0.28 1.0 0.48 0.34
CBI66345 (oorB)
0.21 0.24 0.39 0.39 0.17 0.23 1.0 0.39 0.36
CBI66346 (oorC)
0.28 0.54 0.96 1.0 0.26 0.35 1.0 0.68 0.79
CBI66347 (HPB8_790)
0.0 0.0 0.92 1.0 0.0 0.0 0.5 0.13 0.0
CBI66348 (HPB8_791)
0.0 0.0 0.78 1.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0
CBI66374 (HPB8_817)
0.11 0.13 0.99 1.0 0.05 0.06 0.33 0.12 0.02
CBI66393 (HPB8_836)
0.44 0.34 1.0 0.97 0.21 0.02 0.73 0.21 0.25
CBI66394 (HPB8_837)
0.17 0.24 0.99 1.0 0.46 0.15 0.42 0.18 0.16
CBI66422 (rnc)
0.24 0.12 1.0 0.98 0.35 0.17 0.08 0.09 0.33
CBI66466 (uvrA)
0.37 0.15 0.94 1.0 0.29 0.14 0.24 0.13 0.33
CBI66555 (hsdS1)
0.03 0.02 0.92 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.31
CBI66556 (cadA)
0.2 0.63 0.81 0.88 0.4 0.32 0.39 1.0 0.52
CBI66569 (ribBA)
0.31 0.29 1.0 0.84 0.25 0.18 0.36 0.21 0.32
CBI66580 (motA)
0.29 0.31 0.48 1.0 0.91 0.64 0.24 0.51 0.61
CBI66616 (dcmB)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
CBI66617 (HPB8_1060)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
CBI66618 (HPB8_1061)
0.17 0.08 1.0 0.86 0.33 0.04 0.52 0.12 0.19
CBI66619 (HPB8_1062)
0.17 0.11 1.0 1.0 0.28 0.33 0.17 0.03 0.26
CBI66643 (HPB8_1086)
0.05 0.05 0.21 0.24 0.25 0.3 1.0 0.69 0.28
CBI66660 (HPB8_1103)
0.27 0.15 0.97 1.0 0.14 0.22 0.11 0.08 0.2
CBI66754 (HPB8_1197)
0.0 0.0 0.28 0.3 0.0 0.0 1.0 0.09 0.09
CBI66804 (HPB8_1247)
0.06 0.06 1.0 0.97 0.2 0.07 0.54 0.12 0.11
CBI66841 (gppA)
0.39 0.67 0.8 0.72 0.8 0.46 0.62 1.0 0.85
CBI66884 (HPB8_1327)
0.25 0.04 0.95 1.0 0.12 0.19 0.33 0.1 0.3
CBI66888 (HPB8_1331)
0.34 0.31 1.0 0.99 0.27 0.25 0.18 0.24 0.46
CBI66902 (nifU)
0.33 0.22 1.0 0.87 0.12 0.59 0.32 0.28 0.57
CBI66903 (nifS)
0.64 0.31 1.0 0.81 0.3 0.47 0.33 0.48 0.46
CBI66968 (eno)
0.24 0.49 0.94 1.0 0.89 0.54 0.74 0.41 0.69
CBI67015 (cysM)
0.66 0.42 0.5 0.35 0.79 0.46 0.53 0.67 1.0
CBI67025 (thrC)
0.7 0.49 1.0 0.9 0.95 0.44 0.43 0.64 0.74
CBI67049 (ureA)
0.1 0.18 1.0 0.92 0.24 0.38 0.16 0.61 0.47
CBI67050 (ureC)
0.12 0.23 0.98 1.0 0.32 0.31 0.26 0.73 0.54
CBI67073 (HPB8_1516)
0.0 0.0 0.72 0.66 0.0 0.0 1.0 0.59 0.0
CBI67074 (HPB8_1517)
0.0 0.0 1.0 0.97 0.0 0.0 0.37 0.11 0.0
CBI67075 (HPB8_1518)
0.0 0.0 1.0 0.98 0.0 0.0 0.56 0.25 0.0
CBI67110 (res_1)
0.0 0.0 0.47 1.0 0.19 0.22 0.55 0.66 0.87
CBI67112 (bioB)
0.3 0.14 1.0 0.99 0.1 0.08 0.11 0.2 0.36
CBI67126 (HPB8_1569)
0.0 0.0 0.72 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CBI67178 (cynT)
0.43 0.13 1.0 0.92 0.34 0.16 0.17 0.1 0.45
CBI67213 (tsaA)
0.11 0.2 0.21 0.22 0.24 0.33 1.0 0.63 0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)