Heatmap: Cluster_14 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
26695
26695,R.hpyAII-M2.hpyAII gene deletion
BCM-300,GCGC-MTase JHP1050 mutant
BCM-300,wild type,wild type
G27,Homo sapiens
G27,Homo sapiens,gastric disease
J99,Homo sapiens
NCTC 11637
P12
CBI65559 (HPB8_2)
0.59 1.0 0.58 0.67 0.9 0.58 0.73 0.35 0.96
CBI65599 (HPB8_42)
0.27 0.28 0.91 1.0 0.47 0.25 0.2 0.19 0.55
CBI65600 (HPB8_43)
0.34 0.22 0.94 1.0 0.8 0.28 0.47 0.19 0.5
CBI65601 (HPB8_44)
0.21 0.21 0.96 1.0 0.63 0.31 0.22 0.21 0.55
CBI65606 (HPB8_49)
0.16 0.22 0.85 1.0 0.28 0.18 0.1 0.1 0.41
CBI65607 (serS)
0.63 0.98 0.83 0.8 1.0 0.39 0.18 0.48 0.84
CBI65609 (uvrD)
0.3 0.22 0.88 1.0 0.5 0.22 0.1 0.26 0.52
CBI65611 (ubiD1)
0.44 0.47 0.95 1.0 0.74 0.19 0.47 0.45 0.8
CBI65706 (HPB8_149)
0.19 0.09 1.0 1.0 0.51 0.19 0.22 0.1 0.57
CBI65755 (trpE)
0.43 0.12 1.0 0.88 0.93 0.56 0.18 0.19 0.75
CBI65757 (trpD)
0.44 0.28 0.94 1.0 0.91 0.43 0.26 0.1 0.55
CBI65762 (algC)
0.31 0.24 1.0 0.96 0.94 0.26 0.19 0.34 0.78
CBI65764 (nuoN)
0.17 0.38 0.99 1.0 0.77 0.28 0.68 0.38 0.58
CBI65765 (nuoM)
0.26 0.68 1.0 0.98 0.65 0.28 0.64 0.54 0.73
CBI65766 (nuoL)
0.41 0.79 1.0 1.0 0.87 0.4 0.45 0.58 0.8
CBI65812 (HPB8_255)
0.24 0.2 0.83 1.0 0.35 0.23 0.14 0.08 0.48
CBI65813 (lysC)
0.42 0.32 0.83 1.0 0.38 0.27 0.31 0.39 0.66
CBI65827 (purD)
0.41 0.47 0.96 1.0 0.77 0.51 0.31 0.23 0.73
CBI65831 (HPB8_274)
0.46 0.29 0.86 1.0 0.64 0.23 0.2 0.16 0.55
CBI65832 (pnp)
0.36 0.16 0.89 1.0 0.52 0.43 0.25 0.18 0.81
CBI65845 (nusG)
0.19 0.12 1.0 0.96 0.4 0.31 0.2 0.14 0.52
CBI65851 (rpsL)
0.3 0.21 1.0 1.0 0.8 0.47 0.38 0.4 0.64
CBI65853 (fusA)
0.32 0.21 1.0 0.91 0.26 0.34 0.18 0.23 0.5
CBI65909 (rimM)
0.22 0.15 0.73 1.0 0.09 0.15 0.22 0.06 0.38
CBI65928 (exbB5)
0.45 0.41 1.0 0.9 0.91 0.95 0.82 0.33 0.71
CBI65929 (exbD5)
0.52 0.23 1.0 0.88 0.77 0.62 0.31 0.13 0.67
CBI65949 (purB)
0.24 0.46 1.0 0.95 0.57 0.3 0.92 0.13 0.49
CBI65968 (HPB8_411)
0.28 0.19 0.65 0.71 1.0 0.47 0.47 0.28 0.74
CBI65975 (accC)
0.6 0.55 0.93 1.0 0.75 0.49 0.4 0.36 0.78
CBI65983 (ycf5)
0.26 0.4 0.87 0.97 1.0 0.31 0.47 0.29 0.77
CBI66009 (aroA)
0.21 0.34 1.0 0.92 0.96 0.25 0.48 0.39 0.7
CBI66014 (HPB8_457)
0.44 0.45 0.85 1.0 0.37 0.35 0.56 0.62 0.68
CBI66026 (cmoB)
0.4 0.56 0.9 1.0 0.69 0.65 0.2 0.33 0.84
CBI66129 (pgm)
0.52 0.69 0.86 1.0 0.92 0.51 0.22 0.41 0.75
CBI66164 (alr)
0.54 0.42 0.81 0.92 0.34 0.44 1.0 0.35 0.97
CBI66178 (folE)
0.21 0.25 0.91 1.0 0.55 0.18 0.1 0.29 0.4
CBI66184 (HPB8_627)
0.65 0.57 1.0 0.92 0.75 0.51 0.32 0.09 0.75
CBI66304 (trmH)
0.28 0.39 0.83 1.0 0.27 0.14 0.17 0.19 0.41
CBI66335 (pyrC1)
0.2 0.17 1.0 0.99 0.7 0.25 0.1 0.27 0.6
CBI66341 (HPB8_784)
0.62 0.36 1.0 0.96 0.88 0.43 0.44 0.36 0.82
CBI66392 (HPB8_835)
0.34 0.3 0.98 1.0 0.41 0.34 0.39 0.34 0.67
CBI66416 (HPB8_859)
0.32 0.35 0.91 1.0 0.67 0.52 0.25 0.73 0.74
CBI66417 (ymxG)
0.35 0.51 0.98 1.0 0.65 0.75 0.33 0.49 0.79
CBI66418 (gatB)
0.34 0.41 1.0 0.98 0.63 0.68 0.33 0.61 0.9
CBI66419 (HPB8_862)
0.32 0.23 0.95 1.0 0.86 0.77 0.21 0.31 0.68
CBI66426 (glpC)
0.53 0.17 0.85 0.94 1.0 0.67 0.41 0.31 0.65
CBI66459 (gyrA)
0.31 0.24 0.97 1.0 0.85 0.64 0.29 0.25 0.87
CBI66503 (HPB8_946)
0.5 0.3 0.81 1.0 0.39 0.54 0.16 0.07 0.68
CBI66506 (prsA)
0.46 0.57 0.97 1.0 0.49 0.5 0.5 0.21 0.62
CBI66511 (trmB)
0.4 0.33 0.74 1.0 0.62 0.29 0.16 0.43 0.52
CBI66512 (ftsE)
0.39 0.23 0.96 1.0 0.84 0.38 0.42 0.62 0.68
CBI66513 (ftsX)
0.19 0.27 1.0 0.93 0.42 0.29 0.27 0.25 0.41
CBI66541 (spoT)
0.46 0.27 0.94 1.0 0.78 0.82 0.24 0.28 0.57
CBI66564 (mog)
0.31 0.12 1.0 0.94 0.58 0.27 0.29 0.19 0.44
CBI66567 (ribA)
0.26 0.16 1.0 0.86 0.33 0.3 0.13 0.25 0.33
CBI66582 (HPB8_1025)
0.48 0.28 0.51 1.0 0.61 0.6 0.4 0.43 0.68
CBI66583 (proWX)
0.36 0.32 1.0 0.98 0.26 0.36 0.74 0.21 0.64
CBI66587 (uvrC)
0.42 0.55 1.0 0.96 0.49 0.23 0.23 0.29 0.6
CBI66633 (lpxB)
0.56 0.29 0.91 1.0 0.86 0.48 0.26 0.22 0.64
CBI66655 (dcm3)
0.2 0.06 0.96 1.0 0.11 0.1 0.06 0.07 0.62
CBI66704 (HPB8_1147)
0.25 0.26 1.0 0.92 0.7 0.68 0.25 0.46 0.63
CBI66706 (fliM)
0.11 0.11 0.87 1.0 0.1 0.27 0.09 0.13 0.44
CBI66722 (rbfA)
0.34 0.19 0.85 1.0 0.15 0.21 0.1 0.1 0.57
CBI66737 (tatC)
0.69 0.41 0.88 0.76 0.58 0.3 0.38 0.47 1.0
CBI66739 (rsmG)
0.18 0.09 1.0 0.87 0.51 0.18 0.23 0.11 0.39
CBI66744 (prmA)
0.66 0.54 0.59 0.72 1.0 0.68 0.77 0.78 0.78
CBI66762 (tlyA)
0.59 0.31 1.0 0.94 0.34 0.24 0.11 0.09 0.82
CBI66772 (HPB8_1215)
0.34 0.21 0.9 1.0 0.52 0.63 0.25 0.09 0.57
CBI66773 (lepA)
0.29 0.37 0.98 1.0 0.99 0.56 0.23 0.26 0.65
CBI66774 (dxs)
0.42 0.39 0.9 1.0 0.8 0.34 0.18 0.29 0.49
CBI66826 (pabBC)
0.7 0.18 0.76 0.82 0.75 0.37 0.19 0.13 1.0
CBI66827 (HPB8_1270)
0.31 0.13 1.0 0.9 0.86 0.48 0.18 0.2 0.63
CBI66830 (vacA5)
0.52 0.31 0.91 1.0 0.77 0.48 0.3 0.26 0.65
CBI66833 (ftsH3)
0.47 0.39 1.0 0.97 0.48 0.46 0.31 0.41 0.62
CBI66834 (HPB8_1277)
0.33 0.39 0.81 0.75 1.0 0.81 0.27 0.59 0.93
CBI66835 (HPB8_1278)
0.32 0.43 0.77 0.8 1.0 0.55 0.44 0.42 0.59
CBI66836 (aroB)
0.49 0.81 0.99 1.0 0.54 0.62 0.4 0.25 0.79
CBI66846 (HPB8_1289)
0.6 0.41 0.79 0.87 1.0 0.95 0.26 0.38 0.86
CBI66872 (HPB8_1315)
0.41 0.85 0.9 1.0 0.7 0.48 0.25 0.56 0.89
CBI66876 (atoS)
0.36 0.43 0.82 1.0 0.75 0.44 0.32 0.39 0.59
CBI66882 (proS)
0.38 0.31 0.7 0.8 0.8 0.84 0.3 1.0 0.92
CBI66883 (hemC)
0.38 0.25 0.92 1.0 0.21 0.37 0.32 0.5 0.67
CBI66941 (lysS)
0.3 0.44 0.93 0.88 1.0 0.6 0.42 0.42 0.73
CBI66944 (lolD)
0.58 0.53 0.88 0.98 1.0 0.67 0.26 0.44 1.0
CBI66956 (HPB8_1399)
0.25 0.18 0.42 0.72 1.0 0.69 0.16 0.18 0.75
CBI66966 (HPB8_1409)
0.47 0.42 1.0 0.84 0.91 0.83 0.64 0.31 0.84
CBI67000 (infC)
0.26 0.23 0.57 0.55 1.0 0.54 0.15 0.14 0.62
CBI67001 (thrS)
0.53 0.36 0.98 1.0 0.84 0.87 0.42 0.32 0.63
CBI67069 (putA)
0.61 0.99 0.6 0.58 1.0 0.48 0.94 0.75 0.83
CBI67098 (mreB3)
0.31 0.22 0.94 1.0 0.15 0.29 0.12 0.23 0.52
CBI67106 (tyrA)
0.75 0.74 0.94 0.99 1.0 0.9 0.28 0.37 0.97
CBI67131 (HPB8_1574)
0.0 0.0 0.94 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.61
CBI67138 (gmd)
0.41 0.59 1.0 0.93 0.96 0.5 0.25 0.25 0.79
CBI67203 (rlpA)
0.54 0.32 0.6 0.66 1.0 0.78 0.24 0.43 0.9
CBI67229 (tagE3)
0.68 0.49 0.92 0.96 1.0 0.64 0.13 0.35 0.77
CBI67237 (nhaA)
0.56 0.48 0.94 1.0 0.66 0.52 0.76 0.34 0.89
CBI67266 (thyX)
0.34 0.29 1.0 0.88 0.28 0.24 0.37 0.38 0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)