Heatmap: Cluster_2 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
26695
26695,R.hpyAII-M2.hpyAII gene deletion
BCM-300,GCGC-MTase JHP1050 mutant
BCM-300,wild type,wild type
G27,Homo sapiens
G27,Homo sapiens,gastric disease
J99,Homo sapiens
NCTC 11637
P12
CBI65567 (HPB8_10)
0.43 1.0 0.26 0.32 0.67 0.69 0.21 0.11 0.27
CBI65569 (HPB8_12)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 1.0 0.0 0.77 0.0
CBI65575 (HPB8_18)
0.71 0.73 0.37 0.4 1.0 0.91 0.58 0.29 0.47
CBI65576 (folB)
0.25 0.23 0.02 0.02 0.9 1.0 0.75 0.09 0.2
CBI65588 (HPB8_31)
0.0 0.0 1.0 0.98 0.37 0.52 0.0 0.03 0.0
CBI65615 (HPB8_58)
0.02 0.02 0.02 0.02 1.0 0.54 0.1 0.27 0.06
CBI65622 (HPB8_65)
0.59 0.33 0.98 1.0 0.58 0.68 0.19 0.21 0.17
CBI65623 (HPB8_66)
0.7 0.31 0.91 1.0 0.37 0.85 0.18 0.21 0.24
CBI65639 (HPB8_82)
0.15 0.12 0.0 0.0 0.4 1.0 0.16 0.0 0.2
CBI65651 (csrA)
0.88 0.85 0.0 0.0 0.07 0.81 1.0 0.16 0.07
CBI65669 (HPB8_112)
0.2 1.0 0.17 0.3 0.31 0.92 0.07 0.19 0.12
CBI65674 (HPB8_117)
0.57 1.0 0.02 0.02 0.55 0.78 0.46 0.31 0.16
CBI65700 (HPB8_143)
0.33 0.24 0.53 0.53 1.0 0.69 0.25 0.1 0.2
CBI65753 (HPB8_196)
0.19 0.51 0.35 0.28 1.0 0.33 0.5 0.26 0.28
CBI65754 (HPB8_197)
0.4 0.69 0.14 0.14 1.0 0.66 0.2 0.16 0.31
CBI65773 (nuoE)
0.36 0.4 0.64 0.59 1.0 0.74 0.86 0.34 0.11
CBI65782 (secG)
0.61 0.48 0.5 0.45 1.0 0.95 0.08 0.2 0.64
CBI65783 (bioC)
0.81 0.14 0.5 0.5 1.0 0.88 0.12 0.07 0.15
CBI65784 (trpS)
1.0 0.65 0.55 0.55 0.88 0.83 0.57 0.52 0.42
CBI65805 (HPB8_248)
0.48 0.34 1.0 0.91 0.97 0.83 0.87 0.62 0.1
CBI65818 (hemD)
0.3 0.53 0.29 0.3 1.0 0.47 0.17 0.25 0.32
CBI65854 (tas1)
0.09 0.06 0.0 0.0 1.0 0.72 0.0 0.04 0.11
CBI65882 (glnH)
0.29 0.52 0.4 0.3 1.0 0.47 0.37 0.41 0.24
CBI65884 (glnP1)
0.48 0.19 0.95 0.95 1.0 0.58 0.07 0.1 0.08
CBI65889 (HPB8_332)
0.64 0.52 0.68 0.71 0.37 0.39 1.0 0.3 0.04
CBI65894 (fldA)
0.24 0.56 0.52 0.79 0.7 1.0 0.55 0.56 0.19
CBI65896 (fic1)
0.8 0.41 0.0 0.0 0.13 1.0 0.19 0.08 0.29
CBI65905 (valS)
0.94 0.96 0.89 0.95 1.0 1.0 0.48 0.79 0.75
CBI65920 (parB)
0.77 0.79 0.97 0.97 0.98 1.0 0.46 0.57 0.53
CBI65921 (atpF')
0.84 0.69 1.0 0.9 0.48 0.9 0.7 0.31 0.31
CBI65923 (atpH)
0.53 0.16 0.98 1.0 0.42 0.66 0.3 0.17 0.14
CBI65932 (pal)
0.38 1.0 1.0 0.89 0.97 0.82 0.65 0.25 0.24
CBI65933 (HPB8_376)
0.4 1.0 0.7 0.73 0.62 0.77 0.53 0.18 0.42
CBI65959 (devB)
0.17 0.29 0.4 0.55 1.0 0.34 0.24 0.5 0.21
CBI65960 (zwf)
0.31 0.56 0.92 0.91 1.0 0.63 0.6 0.62 0.42
CBI65970 (nrdB)
0.46 0.45 0.56 0.46 1.0 0.74 0.2 0.35 0.33
CBI65973 (HPB8_416)
0.51 0.06 0.35 0.36 1.0 0.68 0.09 0.01 0.16
CBI65977 (dcd)
0.87 0.59 0.94 0.91 1.0 0.93 0.35 0.39 0.36
CBI65990 (HPB8_433)
0.4 0.21 1.0 0.95 0.49 0.42 0.25 0.16 0.12
CBI65992 (HPB8_435)
1.0 0.2 0.16 0.15 0.07 0.85 0.6 0.3 0.15
CBI65994 (priA)
0.38 0.27 0.57 0.63 0.48 1.0 0.21 0.09 0.19
CBI65999 (cheA)
0.28 1.0 0.51 0.49 0.94 0.7 0.36 0.69 0.48
CBI66022 (HPB8_465)
0.69 0.49 0.91 0.77 0.58 1.0 0.43 0.7 0.49
CBI66050 (HPB8_493)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.26 0.0 0.01 0.01
CBI66058 (HPB8_501)
0.66 0.15 0.0 0.0 0.55 1.0 0.0 0.13 0.35
CBI66060 (HPB8_503)
0.52 0.17 0.0 0.0 1.0 0.59 0.0 0.27 0.16
CBI66062 (parA3)
0.54 0.06 0.0 0.0 1.0 0.53 0.0 0.24 0.28
CBI66063 (HPB8_506)
0.01 0.0 0.02 0.02 0.71 0.68 1.0 0.45 0.13
CBI66125 (ppiD)
0.44 0.39 0.86 0.8 1.0 0.67 0.41 0.21 0.31
CBI66130 (HPB8_573)
0.33 0.5 0.15 0.14 1.0 0.48 0.23 0.29 0.28
CBI66137 (HPB8_580)
0.18 0.11 0.06 0.07 1.0 0.51 0.16 0.01 0.04
CBI66138 (HPB8_581)
0.03 0.03 0.0 0.0 1.0 0.34 0.0 0.01 0.0
CBI66144 (HPB8_587)
0.45 0.3 0.35 0.34 1.0 0.76 0.38 0.28 0.43
CBI66168 (HPB8_611)
0.63 0.16 0.53 0.55 1.0 0.69 0.13 0.05 0.07
CBI66181 (recR)
0.4 0.18 0.6 0.58 1.0 0.86 0.15 0.09 0.18
CBI66202 (flgD)
0.31 0.43 0.56 0.45 1.0 0.71 0.28 0.36 0.31
CBI66216 (HPB8_659)
0.23 0.17 0.0 0.0 0.14 1.0 0.01 0.22 0.09
CBI66226 (HPB8_669)
0.56 0.42 1.0 0.89 0.61 0.87 0.2 0.13 0.44
CBI66234 (hpaA3)
0.08 0.05 0.0 0.0 1.0 0.48 0.05 0.03 0.18
CBI66238 (HPB8_681)
0.63 0.24 0.88 1.0 0.54 0.69 0.77 0.11 0.16
CBI66257 (cagF)
0.28 0.42 1.0 0.85 0.4 0.41 0.75 0.25 0.27
CBI66262 (cagN)
0.06 0.15 0.53 0.55 1.0 0.61 0.16 0.09 0.18
CBI66263 (cagM)
0.18 0.21 1.0 0.97 0.69 1.0 0.56 0.19 0.19
CBI66267 (cagS)
0.18 0.2 1.0 0.85 0.65 0.54 0.41 0.23 0.11
CBI66268 (cagT)
0.2 0.56 0.63 0.66 1.0 0.81 0.32 0.45 0.31
CBI66269 (cagU)
0.13 0.35 0.35 0.29 0.47 1.0 0.21 0.26 0.2
CBI66270 (cagV)
0.11 0.25 0.61 0.53 1.0 0.9 0.2 0.28 0.23
CBI66271 (cagW)
0.15 0.35 0.92 1.0 0.65 0.69 0.22 0.41 0.38
CBI66272 (cagX)
0.2 0.63 0.86 0.79 1.0 0.86 0.27 0.28 0.33
CBI66274 (cagZ)
0.13 0.31 1.0 0.89 0.64 0.97 0.27 0.35 0.44
CBI66279 (cag4)
0.19 0.37 0.92 0.92 1.0 0.63 0.24 0.16 0.34
CBI66314 (rpsU)
0.87 0.82 0.0 0.0 0.05 1.0 0.91 0.05 0.01
CBI66326 (HPB8_769)
0.69 0.58 0.35 0.27 0.98 1.0 0.28 0.26 0.2
CBI66343 (oorD)
0.14 0.27 0.74 0.71 0.2 1.0 0.74 0.41 0.24
CBI66354 (mcpA)
0.33 0.39 0.61 0.58 1.0 0.63 0.41 0.44 0.47
CBI66369 (HPB8_812)
0.11 0.2 0.44 0.45 1.0 0.57 0.77 0.21 0.15
CBI66372 (aspS)
0.27 0.34 0.88 0.95 0.7 1.0 0.36 0.38 0.43
CBI66395 (oipA)
0.29 0.34 0.49 0.52 1.0 0.51 0.34 0.34 0.14
CBI66410 (fucT5)
0.55 0.35 1.0 0.91 0.58 0.71 0.36 0.04 0.18
CBI66438 (wbpB)
0.24 0.38 0.84 0.77 0.56 1.0 0.57 0.7 0.45
CBI66444 (fecA1)
0.13 0.46 1.0 0.8 0.51 0.38 0.19 0.03 0.2
CBI66496 (HPB8_939)
0.05 0.02 0.0 0.0 0.04 0.73 1.0 0.0 0.03
CBI66497 (HPB8_940)
0.01 0.0 0.0 0.01 0.47 1.0 0.17 0.0 0.02
CBI66500 (serC)
0.37 0.35 0.82 0.84 1.0 0.48 0.47 0.3 0.21
CBI66501 (pgpA)
0.19 0.24 0.2 0.24 0.29 1.0 0.06 0.36 0.2
CBI66514 (HPB8_957)
0.61 0.54 1.0 0.91 0.89 0.69 0.7 0.5 0.41
CBI66518 (HPB8_961)
0.78 0.17 0.79 0.91 0.08 1.0 0.47 0.75 0.19
CBI66526 (HPB8_969)
0.33 1.0 0.47 0.41 0.71 0.77 0.52 0.28 0.47
CBI66549 (HPB8_992)
0.61 0.64 0.9 0.98 1.0 0.91 0.44 0.65 0.42
CBI66558 (def)
0.58 0.73 1.0 1.0 0.71 0.92 0.55 0.31 0.16
CBI66560 (tig)
0.28 0.4 0.78 0.72 1.0 0.85 0.69 0.45 0.41
CBI66570 (lex2B1)
1.0 0.63 0.13 0.33 0.55 0.86 0.32 0.1 0.44
CBI66573 (acpS)
0.56 0.14 0.08 0.07 1.0 0.79 0.33 0.17 0.27
CBI66574 (fliL)
0.6 0.4 0.45 0.44 0.9 1.0 0.22 0.14 0.07
CBI66576 (HPB8_1019)
0.97 0.09 0.24 0.24 0.71 1.0 0.48 0.05 0.01
CBI66585 (HPB8_1028)
0.28 0.31 0.0 0.0 1.0 0.42 0.14 0.0 0.04
CBI66590 (trxA)
0.25 0.61 0.6 0.52 0.35 1.0 0.67 0.82 0.25
CBI66598 (speE)
0.28 0.26 0.75 0.65 1.0 0.61 0.59 0.28 0.21
CBI66600 (HPB8_1043)
0.36 0.35 0.7 0.54 1.0 0.73 0.15 0.15 0.28
CBI66601 (engA)
0.27 0.33 0.44 0.38 1.0 0.66 0.21 0.14 0.2
CBI66602 (hupB)
0.57 0.21 1.0 0.83 0.78 0.95 0.1 0.63 0.26
CBI66604 (HPB8_1047)
0.13 0.64 0.19 0.19 1.0 0.3 0.22 0.19 0.19
CBI66611 (thi)
0.92 0.81 0.85 1.0 0.84 0.65 0.95 0.58 0.0
CBI66613 (hsdR1)
0.27 0.14 0.6 0.59 0.83 0.39 1.0 0.91 0.0
CBI66614 (hsdS_4)
0.34 0.4 0.43 0.48 0.82 1.0 0.29 0.27 0.18
CBI66630 (HPB8_1073)
0.51 0.78 0.39 0.44 0.8 1.0 0.66 0.27 0.24
CBI66657 (dam3)
0.88 0.49 0.1 0.11 1.0 0.65 0.58 0.58 0.0
CBI66658 (HPB8_1101)
0.72 0.71 0.02 0.03 0.37 1.0 0.22 0.13 0.0
CBI66663 (gltX3)
0.26 0.89 0.48 0.47 1.0 0.62 0.27 0.63 0.33
CBI66670 (pepF)
0.25 0.58 0.5 0.48 1.0 0.68 0.57 0.6 0.25
CBI66672 (HPB8_1115)
0.18 0.4 0.22 0.22 1.0 0.4 0.24 0.36 0.28
CBI66673 (HPB8_1116)
0.21 0.8 0.41 0.46 1.0 0.92 0.16 0.2 0.36
CBI66697 (HPB8_1140)
1.0 0.48 0.72 0.71 0.71 0.87 0.24 0.27 0.5
CBI66736 (tatB)
0.76 0.93 0.72 0.64 0.41 1.0 0.3 0.09 0.34
CBI66743 (cheY)
0.54 0.18 0.31 0.29 1.0 0.76 0.58 0.33 0.46
CBI66760 (pyrB)
0.31 0.42 0.39 0.35 1.0 0.61 0.54 0.43 0.41
CBI66761 (HPB8_1204)
0.7 0.15 0.6 0.65 0.43 1.0 0.35 0.09 0.21
CBI66764 (tktA)
0.51 1.0 0.52 0.54 0.98 0.72 0.75 0.61 0.57
CBI66768 (flgG1)
0.2 0.13 0.29 0.28 1.0 0.53 0.18 0.14 0.19
CBI66776 (fliG)
0.48 0.68 0.74 0.77 1.0 0.6 0.27 0.25 0.26
CBI66777 (fliF)
0.49 0.57 0.85 1.0 0.78 0.86 0.17 0.32 0.43
CBI66797 (HPB8_1240)
0.63 0.72 0.57 0.57 0.61 1.0 0.23 0.43 0.44
CBI66800 (HPB8_1243)
0.42 0.8 0.25 0.23 1.0 0.69 0.21 0.26 0.41
CBI66802 (tatA)
1.0 0.65 0.3 0.32 0.34 0.81 0.46 0.51 0.17
CBI66842 (fer)
0.21 0.41 0.41 0.33 0.78 1.0 0.29 0.18 0.12
CBI66850 (miaB)
0.56 0.64 0.8 0.78 0.96 1.0 0.57 0.59 0.53
CBI66853 (pyrC3)
0.26 0.59 0.45 0.42 1.0 0.64 0.69 0.43 0.39
CBI66895 (HPB8_1338)
0.12 0.36 0.06 0.05 1.0 0.3 0.1 0.03 0.06
CBI66904 (HPB8_1347)
0.25 0.08 0.31 0.31 1.0 0.26 0.13 0.2 0.16
CBI66913 (htpG)
0.35 0.58 0.41 0.42 1.0 0.78 0.43 0.51 0.33
CBI66926 (ndk)
1.0 0.43 0.05 0.04 0.08 0.73 0.31 0.39 0.32
CBI66938 (HPB8_1381)
0.28 0.54 0.21 0.22 1.0 0.59 0.23 0.45 0.4
CBI66945 (neuB)
0.26 0.25 0.25 0.29 1.0 0.48 0.18 0.12 0.3
CBI66948 (HPB8_1391)
0.6 0.45 0.75 0.62 1.0 0.75 0.71 0.46 0.37
CBI66985 (ykgG)
0.38 0.43 0.98 1.0 0.68 0.83 0.37 0.66 0.45
CBI66991 (sdaA)
0.71 0.53 0.59 0.85 0.57 0.75 0.65 1.0 0.48
CBI66998 (rplT)
0.21 0.23 0.32 0.35 1.0 0.6 0.24 0.14 0.13
CBI67004 (HPB8_1447)
0.67 0.4 0.32 0.27 1.0 0.55 0.05 0.19 0.12
CBI67006 (topA5)
0.23 0.35 0.6 0.53 1.0 0.53 0.2 0.25 0.24
CBI67024 (tlpA)
0.34 0.45 0.85 0.76 1.0 0.49 0.31 0.92 0.34
CBI67034 (rpoD)
0.58 0.87 0.86 0.81 1.0 0.71 0.34 0.75 0.41
CBI67045 (rpsT)
0.45 0.28 0.88 1.0 0.86 0.44 0.36 0.11 0.06
CBI67053 (ureE)
0.24 0.44 0.94 1.0 0.73 0.84 0.26 0.39 0.34
CBI67111 (HPB8_1554)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.0 0.0 0.01
CBI67119 (HPB8_1562)
0.06 0.08 0.0 0.0 0.01 0.25 0.0 1.0 0.06
CBI67120 (HPB8_1563)
0.12 0.12 0.02 0.02 0.05 0.37 0.01 1.0 0.27
CBI67121 (HPB8_1564)
0.32 0.22 0.06 0.07 0.16 0.38 0.03 1.0 0.18
CBI67122 (HPB8_1565)
1.0 0.45 0.12 0.15 0.06 0.59 0.07 0.66 0.19
CBI67123 (HPB8_1566)
1.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.62 0.04 0.1 0.12
CBI67124 (HPB8_1567)
1.0 0.74 0.23 0.24 0.14 0.76 0.16 0.67 0.22
CBI67127 (queF)
0.54 0.47 0.33 0.33 0.3 0.74 0.73 1.0 0.24
CBI67146 (HPB8_1589)
0.39 0.77 0.89 1.0 0.23 0.51 0.19 0.27 0.18
CBI67149 (clpS)
0.58 0.54 0.0 0.0 1.0 0.72 0.11 0.28 0.46
CBI67168 (HPB8_1611)
0.85 1.0 0.42 0.34 0.67 0.69 0.57 0.43 0.33
CBI67192 (pdxJ)
0.3 1.0 0.69 0.58 0.71 0.53 0.45 0.16 0.2
CBI67197 (metI)
0.61 0.3 0.68 0.76 1.0 0.68 0.23 0.08 0.45
CBI67202 (dniR)
0.57 0.17 0.62 0.62 1.0 0.66 0.48 0.3 0.42
CBI67241 (HPB8_1684)
0.68 0.85 0.06 0.06 1.0 0.99 0.06 0.0 0.14
CBI67242 (HPB8_1685)
0.2 0.07 0.82 0.86 1.0 0.77 0.12 0.0 0.0
CBI67244 (HPB8_1687)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.12 0.02
CBI67245 (fbp)
0.29 0.42 0.41 0.35 1.0 0.48 0.5 0.3 0.26
CBI67254 (HPB8_1697)
0.32 0.2 0.05 0.06 0.55 1.0 0.04 0.02 0.0
CBI67255 (HPB8_1698)
0.24 0.15 0.25 0.24 1.0 0.37 0.01 0.0 0.04
CBI67256 (HPB8_1699)
0.78 0.36 0.43 0.36 0.69 1.0 0.16 0.55 0.1
CBJ23781 (HPB8_p0009)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)