Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
26695
26695,R.hpyAII-M2.hpyAII gene deletion
BCM-300,GCGC-MTase JHP1050 mutant
BCM-300,wild type,wild type
G27,Homo sapiens
G27,Homo sapiens,gastric disease
J99,Homo sapiens
NCTC 11637
P12
CBI65570 (HPB8_13)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 1.0 0.0 0.08 0.0
CBI65590 (pth)
0.7 0.46 0.5 0.53 0.9 1.0 0.18 0.12 0.58
CBI65624 (HPB8_67)
0.49 0.53 0.96 1.0 0.6 0.67 0.23 0.56 0.65
CBI65663 (pspA)
0.99 0.48 1.0 0.91 0.58 0.81 0.24 0.16 0.49
CBI65698 (nikR)
0.34 0.24 0.83 0.69 1.0 0.52 0.26 0.33 0.72
CBI65716 (rpsJ)
0.14 0.13 1.0 0.89 0.68 0.79 0.15 0.12 0.32
CBI65717 (rplC)
0.38 0.22 1.0 0.89 0.49 0.62 0.2 0.19 0.37
CBI65718 (rplD)
0.71 0.15 1.0 0.89 0.26 0.33 0.15 0.18 0.5
CBI65719 (rplW)
0.37 0.1 1.0 0.84 0.41 0.38 0.24 0.11 0.7
CBI65720 (rplB)
0.44 0.2 0.97 1.0 0.57 0.43 0.22 0.19 0.93
CBI65721 (rpsS)
0.34 0.16 0.96 1.0 1.0 0.44 0.35 0.17 0.44
CBI65722 (rplV)
0.23 0.2 0.91 0.91 0.93 1.0 0.4 0.21 0.86
CBI65723 (rpsC)
0.18 0.2 1.0 0.94 0.56 0.38 0.19 0.12 0.59
CBI65724 (rplP)
0.53 0.17 1.0 0.93 0.81 0.61 0.25 0.24 0.78
CBI65726 (rpsQ)
0.24 0.19 1.0 0.86 0.72 0.77 0.38 0.22 0.29
CBI65727 (rplN)
0.19 0.2 0.99 1.0 0.42 0.62 0.49 0.24 0.74
CBI65729 (rplE)
0.13 0.12 1.0 0.92 0.44 0.23 0.17 0.19 0.55
CBI65731 (rpsH)
0.18 0.15 1.0 0.95 0.38 0.38 0.32 0.23 0.71
CBI65732 (rplF)
0.21 0.15 0.92 0.88 0.24 0.35 0.24 0.28 1.0
CBI65733 (rplR)
0.13 0.11 1.0 0.99 0.07 0.41 0.12 0.14 0.43
CBI65734 (rpsE)
0.23 0.15 1.0 0.9 0.19 0.75 0.12 0.26 0.67
CBI65735 (rplO)
0.24 0.17 1.0 0.98 0.34 0.38 0.53 0.22 0.51
CBI65736 (secY)
0.29 0.18 1.0 0.98 0.24 0.23 0.28 0.22 0.7
CBI65737 (map)
0.38 0.18 0.75 0.72 0.35 0.39 0.39 0.2 1.0
CBI65738 (infA)
0.32 0.2 0.06 0.05 0.59 0.53 0.32 0.12 1.0
CBI65740 (rpsM)
0.2 0.12 0.73 0.67 0.62 0.97 0.26 0.29 1.0
CBI65741 (rpsK)
0.22 0.14 1.0 0.95 0.37 0.51 0.09 0.19 1.0
CBI65742 (rpsD)
0.34 0.2 0.97 0.93 0.9 0.93 0.32 0.25 1.0
CBI65743 (rpoA)
0.19 0.15 1.0 0.94 0.88 0.8 0.28 0.21 0.7
CBI65744 (rplQ)
0.18 0.08 0.87 0.82 1.0 0.7 0.15 0.2 0.66
CBI65791 (rpsF)
0.48 0.54 0.83 0.75 0.72 1.0 0.54 0.38 0.85
CBI65792 (ssb)
0.21 0.2 0.35 0.37 1.0 0.67 0.23 0.32 0.69
CBI65793 (rpsR)
0.78 0.24 0.5 0.61 0.78 1.0 0.5 0.21 0.62
CBI65809 (HPB8_252)
0.27 0.02 0.72 0.7 1.0 0.61 0.68 0.53 0.34
CBI65822 (yhcG)
0.53 0.44 1.0 1.0 0.64 0.85 0.32 0.25 0.55
CBI65840 (HPB8_283)
0.41 1.0 0.32 0.33 0.43 0.95 0.35 0.33 0.4
CBI65846 (rplK)
0.4 0.37 0.97 1.0 0.66 0.49 0.32 0.3 0.97
CBI65847 (rplA)
0.49 0.39 0.92 0.96 0.8 0.53 0.27 0.55 1.0
CBI65848 (rplJ)
0.34 0.21 1.0 0.95 0.74 0.52 0.8 0.24 0.83
CBI65849 (rplL)
0.48 0.25 1.0 0.9 0.38 0.4 0.4 0.21 0.55
CBI65852 (rpsG)
0.36 0.42 1.0 0.96 0.3 0.81 0.22 0.27 0.51
CBI65868 (HPB8_311)
0.79 0.73 1.0 0.89 0.39 0.54 0.12 0.13 0.53
CBI65902 (murG)
0.42 0.52 1.0 0.92 0.84 0.61 0.48 0.46 0.82
CBI65911 (rplS)
0.29 0.18 0.94 1.0 0.08 0.49 0.1 0.13 0.18
CBI65924 (atpA)
0.4 0.57 0.9 0.93 0.55 0.54 0.43 0.41 1.0
CBI65925 (atpG)
0.36 0.38 0.95 0.84 0.54 1.0 0.58 0.31 0.84
CBI65926 (atpD)
0.5 0.58 1.0 1.0 0.43 0.69 0.69 0.47 0.61
CBI65927 (atpC)
0.16 0.34 1.0 0.92 0.11 0.45 0.09 0.27 0.49
CBI65934 (slyD)
0.4 0.37 1.0 0.98 0.3 0.7 0.25 0.41 0.73
CBI65937 (dcm1)
0.55 0.05 0.34 0.53 0.12 1.0 0.58 0.12 0.31
CBI65938 (HPB8_381)
0.29 0.01 0.82 0.74 0.6 0.65 1.0 0.71 0.34
CBI65939 (flgK)
0.19 0.03 0.94 0.82 1.0 0.76 0.46 0.48 0.44
CBI65972 (HPB8_415)
0.3 0.25 0.58 0.55 0.48 1.0 0.91 0.79 0.2
CBI65982 (dsbC1)
0.26 0.17 1.0 0.94 0.92 0.48 0.63 0.18 0.41
CBI66006 (HPB8_449)
0.44 0.4 0.59 0.53 0.36 0.77 0.43 0.42 1.0
CBI66018 (guaA)
0.18 0.24 0.9 1.0 0.21 0.53 0.21 0.1 0.35
CBI66033 (HPB8_476)
0.0 0.0 0.84 0.92 0.85 0.84 0.44 0.58 1.0
CBI66155 (HPB8_598)
0.39 0.35 0.76 0.7 0.91 0.48 1.0 0.26 0.51
CBI66182 (dmpI)
0.47 0.23 0.01 0.01 0.03 1.0 0.1 0.21 0.07
CBI66183 (HPB8_626)
0.61 0.73 0.81 0.75 0.81 0.88 0.56 0.5 1.0
CBI66189 (frpB3)
0.16 0.03 1.0 0.95 0.14 0.26 0.01 0.03 0.21
CBI66193 (HPB8_636)
0.4 0.57 0.63 0.67 0.57 1.0 0.38 0.28 0.9
CBI66203 (HPB8_646)
0.06 0.02 0.24 0.22 1.0 0.49 0.21 0.15 0.37
CBI66237 (HPB8_680)
0.23 0.18 0.16 0.2 0.29 1.0 0.16 0.15 0.65
CBI66239 (HPB8_682)
0.52 0.61 0.95 1.0 0.19 0.49 0.99 0.42 0.71
CBI66248 (nudT14)
0.44 0.23 0.65 0.82 0.31 1.0 0.6 0.26 0.76
CBI66250 (glcD1)
0.46 0.38 0.86 0.92 0.4 1.0 0.27 0.29 0.91
CBI66256 (cagE)
0.18 0.44 0.8 0.83 0.77 0.92 0.67 0.3 1.0
CBI66265 (HPB8_708)
0.38 0.26 0.0 0.0 0.57 1.0 0.4 0.16 0.29
CBI66266 (cagQ)
0.27 0.55 0.8 0.69 0.0 1.0 0.46 0.0 0.06
CBI66285 (glnA)
0.83 0.82 0.73 0.64 1.0 0.78 0.22 0.52 0.45
CBI66289 (hslU)
0.47 0.44 0.98 1.0 0.61 0.89 0.35 0.39 0.93
CBI66299 (HPB8_742)
0.34 0.35 0.0 0.0 0.03 1.0 0.03 0.08 0.0
CBI66310 (accA)
0.41 0.26 0.87 0.95 0.56 0.92 0.51 0.21 1.0
CBI66312 (acpP3)
0.32 0.44 0.89 1.0 0.34 0.5 0.38 0.57 0.34
CBI66313 (fabG)
0.57 0.49 0.95 0.94 0.45 1.0 0.97 0.82 0.81
CBI66321 (HPB8_764)
0.06 0.09 0.04 0.1 1.0 0.23 0.05 0.03 0.22
CBI66358 (nth3)
0.69 0.18 0.67 0.61 0.19 0.82 0.21 0.08 1.0
CBI66362 (HPB8_805)
0.29 0.44 1.0 0.95 0.36 0.82 0.28 0.37 0.52
CBI66437 (HPB8_880)
0.32 0.61 0.68 1.0 0.13 0.33 0.2 0.27 0.53
CBI66465 (HPB8_908)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.77 0.0 1.0 0.0
CBI66478 (HPB8_921)
0.47 0.16 0.21 0.18 0.23 1.0 0.15 0.21 0.28
CBI66495 (HPB8_938)
0.42 0.3 0.0 0.0 0.51 1.0 0.0 0.01 0.2
CBI66515 (flaG)
0.19 0.05 0.25 0.2 0.28 1.0 0.1 0.37 0.31
CBI66521 (HPB8_964)
0.35 0.27 0.92 1.0 0.54 0.5 0.31 0.32 0.85
CBI66529 (HPB8_972)
0.0 0.0 0.75 0.79 0.16 0.36 1.0 0.54 0.0
CBI66539 (HPB8_982)
0.44 0.52 0.96 1.0 0.3 0.73 0.19 0.32 0.63
CBI66540 (tyrS)
0.3 0.46 0.97 1.0 0.42 0.68 0.21 0.42 0.44
CBI66543 (pyrH)
0.17 0.17 0.98 1.0 0.26 0.42 0.64 0.14 0.33
CBI66559 (clpP)
0.34 0.54 0.96 1.0 0.17 0.59 0.45 0.59 0.44
CBI66563 (moaC)
0.49 0.28 0.7 0.65 0.22 1.0 0.27 0.25 0.82
CBI66566 (moaD)
0.29 0.05 1.0 0.9 0.25 0.4 0.13 0.0 0.72
CBI66593 (HPB8_1036)
0.3 0.08 1.0 0.95 0.48 0.48 0.17 0.2 0.31
CBI66615 (hsdM1)
0.65 0.97 0.64 0.58 1.0 0.74 0.43 0.56 0.5
CBI66634 (HPB8_1077)
0.29 0.15 1.0 0.89 0.65 0.33 0.44 0.17 0.23
CBI66635 (hypA)
0.3 0.38 0.38 0.35 0.79 0.95 1.0 0.41 0.87
CBI66656 (HPB8_1099)
0.29 0.35 0.16 0.12 0.05 1.0 0.09 0.46 0.0
CBI66659 (typA)
0.55 0.59 1.0 0.95 0.32 0.87 0.49 0.68 0.54
CBI66705 (fliN3)
0.36 0.2 0.46 0.52 0.69 1.0 0.32 0.29 0.81
CBI66707 (fliA)
0.49 0.35 0.56 0.61 0.81 1.0 0.32 0.39 0.63
CBI66715 (rpsO)
0.18 0.19 1.0 0.92 0.83 0.71 0.24 0.26 0.29
CBI66717 (HPB8_1160)
0.48 0.43 1.0 1.0 0.61 0.65 0.25 0.72 0.68
CBI66718 (ompR1)
0.71 0.6 0.72 0.68 0.56 1.0 0.51 0.68 0.7
CBI66728 (lpxC)
0.54 0.27 0.47 0.41 0.23 0.58 1.0 0.56 0.47
CBI66752 (HPB8_1195)
0.27 0.02 0.71 0.72 0.38 0.65 1.0 0.53 0.15
CBI66753 (nixA)
0.86 1.0 0.62 0.56 0.99 0.97 0.8 0.45 0.68
CBI66822 (rpmA)
0.17 0.15 0.62 0.51 0.39 1.0 0.11 0.24 0.24
CBI66823 (rplU)
0.15 0.16 0.99 0.79 0.82 1.0 0.14 0.15 0.49
CBI66824 (flgL)
0.19 0.01 0.78 0.71 1.0 0.68 0.36 0.75 0.45
CBI66867 (HPB8_1310)
0.31 0.5 0.94 1.0 0.47 0.54 0.48 0.34 0.62
CBI66892 (kdsB)
0.45 0.24 0.68 0.68 1.0 0.7 0.22 0.34 0.75
CBI66921 (HPB8_1364)
0.26 0.09 0.77 1.0 0.39 0.74 0.27 0.12 0.14
CBI66925 (HPB8_1368)
0.15 0.29 0.77 1.0 0.05 0.44 0.24 0.1 0.52
CBI66939 (HPB8_1382)
0.24 0.5 0.99 1.0 0.53 0.7 0.1 0.26 0.42
CBI66940 (glyA)
0.25 0.4 0.91 1.0 0.26 0.62 0.28 0.28 0.81
CBI66993 (HPB8_1436)
0.75 0.31 0.56 0.52 0.82 1.0 0.54 0.3 0.23
CBI67003 (ppsA)
0.57 0.85 1.0 1.0 0.66 0.72 0.49 0.65 0.61
CBI67007 (fliC)
0.19 0.0 1.0 0.9 0.26 0.82 0.47 0.83 0.52
CBI67008 (HPB8_1451)
0.24 0.02 1.0 0.93 0.56 0.54 0.59 0.46 0.59
CBI67019 (tlpB)
0.31 0.27 0.83 0.85 1.0 0.95 0.47 0.23 0.89
CBI67020 (HPB8_1463)
0.27 0.16 0.62 0.74 0.38 0.96 0.19 0.27 1.0
CBI67038 (rplM)
0.21 0.27 0.88 0.78 1.0 0.67 0.26 0.19 0.28
CBI67039 (rpsI)
0.68 0.45 1.0 0.87 0.58 0.52 0.33 0.23 0.24
CBI67047 (lspA)
0.59 0.41 0.99 1.0 0.13 0.45 0.05 0.27 0.57
CBI67104 (comL)
0.51 0.26 1.0 0.97 0.61 0.59 0.91 0.47 0.63
CBI67109 (mod_1)
0.0 0.0 0.3 0.32 0.85 1.0 0.05 0.1 0.99
CBI67148 (clpA)
0.62 0.74 0.79 0.93 1.0 0.91 0.32 0.43 0.79
CBI67205 (HPB8_1648)
0.4 0.14 0.45 0.45 0.8 1.0 0.15 0.13 0.91
CBI67218 (flgB)
0.44 0.32 0.66 0.64 0.97 1.0 0.39 0.21 0.47
CBI67227 (HPB8_1670)
0.21 0.32 1.0 0.96 0.08 0.63 0.06 0.32 0.91
CBI67235 (secD)
0.55 0.61 0.9 1.0 0.39 0.91 0.49 0.58 0.8
CBI67239 (rpsB)
0.27 0.5 1.0 0.98 0.8 0.69 0.4 0.16 0.63
CBI67247 (HPB8_1690)
0.0 0.0 0.21 0.24 0.54 1.0 0.13 0.43 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)