Heatmap: Cluster_7 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
26695
26695,R.hpyAII-M2.hpyAII gene deletion
BCM-300,GCGC-MTase JHP1050 mutant
BCM-300,wild type,wild type
G27,Homo sapiens
G27,Homo sapiens,gastric disease
J99,Homo sapiens
NCTC 11637
P12
CBI65580 (gltS)
0.52 0.66 0.85 0.98 0.23 0.36 0.63 0.38 1.0
CBI65596 (HPB8_39)
0.77 0.78 0.75 0.79 0.31 0.27 0.49 0.51 1.0
CBI65617 (HPB8_60)
0.02 0.01 0.0 0.0 0.4 0.29 0.0 0.01 1.0
CBI65629 (dnaE)
0.53 1.0 0.7 0.63 0.96 0.72 0.67 0.87 0.88
CBI65631 (HPB8_74)
0.1 0.54 0.22 0.25 0.12 0.1 0.56 0.77 1.0
CBI65632 (HPB8_75)
0.17 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.48
CBI65634 (HPB8_77)
0.63 0.5 0.89 0.82 0.77 1.0 0.94 0.43 0.95
CBI65635 (lpp20)
0.31 0.43 0.7 0.64 0.43 1.0 0.64 0.93 0.61
CBI65636 (HPB8_79)
0.32 1.0 0.26 0.24 0.19 0.23 0.25 0.3 0.35
CBI65637 (HPB8_80)
0.54 1.0 0.71 0.64 0.64 0.94 0.77 0.97 0.93
CBI65676 (HPB8_119)
0.35 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
CBI65694 (HPB8_137)
0.28 0.89 0.5 0.44 1.0 0.41 0.57 0.24 0.5
CBI65710 (HPB8_153)
0.07 0.09 0.06 0.08 0.27 0.01 0.2 0.75 1.0
CBI65711 (fumC)
0.23 0.42 0.34 0.29 0.33 0.18 0.62 1.0 0.75
CBI65713 (rnhB)
0.79 1.0 0.31 0.3 0.45 0.62 0.53 0.56 0.91
CBI65714 (HPB8_157)
0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.03 1.0
CBI65750 (HPB8_193)
0.17 1.0 0.14 0.23 0.0 0.03 0.24 0.33 0.44
CBI65751 (tenA)
0.18 0.25 0.23 0.21 0.07 0.05 1.0 0.14 0.77
CBI65823 (HPB8_266)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
CBI65888 (pgi)
0.22 0.48 0.76 0.61 1.0 0.39 0.45 0.49 0.39
CBI65903 (fliW)
0.21 0.07 0.66 0.63 0.24 0.44 0.53 0.39 1.0
CBI65936 (HPB8_379)
0.05 0.09 0.0 0.0 0.23 0.03 0.53 1.0 0.48
CBI65957 (adh)
0.38 1.0 0.66 0.59 0.96 0.32 0.51 0.9 0.51
CBI65962 (eda)
0.32 0.39 0.37 0.54 0.24 0.43 0.34 1.0 0.94
CBI65986 (gdhA)
0.54 0.75 1.0 0.9 0.34 0.49 0.41 1.0 0.79
CBI65996 (sodB)
0.48 0.8 0.97 0.81 0.92 0.97 0.93 1.0 0.78
CBI65997 (tpx)
0.19 0.25 0.23 0.2 0.61 0.26 1.0 0.3 0.7
CBI66034 (HPB8_477)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.41
CBI66064 (HPB8_507)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
CBI66065 (HPB8_508)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.23
CBI66066 (HPB8_509)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 1.0
CBI66067 (HPB8_510)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 1.0
CBI66140 (acpP1)
0.93 0.47 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 1.0
CBI66150 (HPB8_593)
0.28 0.17 0.56 0.52 0.48 0.21 0.48 1.0 0.29
CBI66153 (accD)
0.5 0.75 0.78 0.93 0.35 0.51 0.66 0.31 1.0
CBI66161 (HPB8_604)
0.66 0.78 0.49 0.66 0.42 0.3 1.0 0.82 0.66
CBI66162 (dadA)
0.28 0.37 0.3 0.44 0.25 0.26 0.63 0.8 1.0
CBI66163 (dagA)
0.32 0.38 0.6 0.59 0.11 0.24 0.38 0.45 1.0
CBI66186 (HPB8_629)
0.29 0.46 0.4 0.54 0.15 0.3 0.86 1.0 0.55
CBI66197 (HPB8_640)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 1.0 0.0
CBI66206 (ackA3)
0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 1.0 0.01
CBI66207 (ackA5)
0.01 0.0 0.02 0.03 0.01 0.01 0.03 1.0 0.01
CBI66209 (hypB)
0.42 0.71 0.58 0.49 0.43 1.0 0.26 0.73 0.53
CBI66284 (HPB8_727)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.78
CBI66293 (HPB8_736)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
CBI66294 (HPB8_737)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
CBI66295 (HPB8_738)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
CBI66298 (cagA)
0.05 0.6 0.12 0.11 0.12 0.18 0.5 1.0 0.92
CBI66318 (HPB8_761)
0.1 0.14 0.02 0.07 0.12 0.07 0.15 1.0 0.17
CBI66319 (dapF)
0.79 0.74 0.78 0.72 0.32 0.54 0.55 0.91 1.0
CBI66323 (pepA)
0.21 0.68 0.12 0.33 0.14 0.22 1.0 0.53 0.64
CBI66325 (apt)
0.64 0.95 0.9 1.0 0.48 0.55 0.58 0.35 0.79
CBI66357 (flaA)
0.09 0.12 0.21 0.18 0.11 0.18 0.1 0.54 1.0
CBI66365 (HPB8_808)
0.44 1.0 0.59 0.63 0.44 0.47 0.36 0.74 0.73
CBI66368 (HPB8_811)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
CBI66382 (dapD)
0.54 0.88 0.75 0.81 0.75 0.31 1.0 0.5 0.68
CBI66383 (HPB8_826)
0.52 1.0 0.59 0.63 0.28 0.47 0.36 0.68 0.82
CBI66388 (hydA)
0.69 0.95 0.94 1.0 0.55 0.32 0.86 0.95 0.98
CBI66389 (hydB)
0.28 0.5 0.54 0.63 0.3 0.33 0.57 1.0 0.74
CBI66390 (hydC)
0.19 0.4 0.28 0.28 0.2 0.27 0.38 1.0 0.63
CBI66401 (frxA)
0.09 0.08 0.34 0.33 0.11 0.3 0.2 0.21 1.0
CBI66408 (aspA)
0.34 1.0 0.82 0.77 0.87 0.4 0.97 0.53 0.66
CBI66427 (HPB8_870)
0.14 0.16 0.16 0.15 1.0 0.51 0.31 0.65 0.74
CBI66428 (HPB8_871)
0.25 0.11 0.26 0.26 0.15 0.11 0.17 1.0 0.19
CBI66440 (HPB8_883)
0.11 0.75 0.13 0.18 0.0 0.0 1.0 0.03 0.6
CBI66441 (HPB8_884)
0.25 0.57 0.1 0.21 0.01 0.09 0.04 0.28 1.0
CBI66447 (atoB)
0.69 0.78 0.31 0.45 0.26 0.42 1.0 0.51 0.78
CBI66448 (scoA)
0.39 0.57 0.31 0.37 0.09 0.45 1.0 0.79 0.78
CBI66449 (scoB)
0.18 0.37 0.24 0.29 0.05 0.33 0.23 1.0 0.87
CBI66450 (atoE)
0.13 0.26 0.24 0.34 0.04 0.11 1.0 0.45 0.43
CBI66479 (HPB8_922)
0.39 0.98 0.95 1.0 0.15 0.15 0.25 0.65 0.85
CBI66481 (HPB8_924)
0.57 0.72 0.37 0.45 0.86 0.28 0.4 0.96 1.0
CBI66485 (ansA)
0.41 0.69 0.06 0.05 0.4 0.38 0.11 1.0 0.61
CBI66486 (dcuA)
1.0 0.64 0.48 0.49 0.79 0.5 0.66 0.71 0.92
CBI66545 (acnB)
0.29 0.86 0.45 0.47 0.33 0.34 0.65 0.75 1.0
CBI66553 (HPB8_996)
0.58 1.0 0.69 0.71 0.44 0.38 0.55 0.84 0.72
CBI66595 (guaB)
0.39 1.0 0.54 0.61 0.27 0.38 0.43 0.3 0.71
CBI66644 (katA)
0.03 0.05 0.29 0.31 0.25 0.29 1.0 0.72 0.51
CBI66668 (HPB8_1111)
0.12 0.08 0.55 0.41 0.08 0.57 0.41 1.0 0.95
CBI66712 (pepP)
0.25 0.92 0.36 0.34 0.62 0.44 0.44 0.57 1.0
CBI66745 (ftsH1)
0.38 0.48 0.65 0.71 0.3 0.4 0.62 0.89 1.0
CBI66786 (hcpC3)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.12 0.0 1.0
CBI66808 (HPB8_1251)
0.41 0.86 0.0 0.0 0.19 0.07 0.08 0.09 1.0
CBI66809 (HPB8_1252)
0.39 0.98 0.33 0.4 0.26 0.56 0.75 1.0 0.92
CBI66825 (aimE3)
0.05 0.34 0.23 0.24 0.03 0.21 0.18 0.1 1.0
CBI66852 (HPB8_1295)
0.47 0.79 0.86 0.82 0.46 0.4 1.0 0.65 0.63
CBI66854 (ccdA)
0.5 0.92 0.5 0.48 0.31 0.5 0.62 0.68 1.0
CBI66855 (clpB)
0.51 0.96 0.46 0.42 0.7 0.52 1.0 0.53 0.71
CBI66877 (dps)
0.06 0.06 0.12 0.09 0.13 0.1 0.2 1.0 0.59
CBI66878 (HPB8_1321)
0.17 0.21 0.53 0.47 0.3 0.61 0.6 0.62 1.0
CBI66911 (hcpA)
0.35 1.0 0.25 0.24 0.23 0.23 0.23 0.9 0.52
CBI66919 (HPB8_1362)
0.58 0.78 0.36 0.32 0.25 0.24 0.3 1.0 0.97
CBI66950 (fliR)
0.52 0.72 0.32 0.31 0.46 0.09 0.18 0.55 1.0
CBI66951 (moeA)
0.65 0.69 0.32 0.27 0.37 0.2 0.27 0.46 1.0
CBI66988 (aroF)
0.47 0.65 0.58 0.51 0.3 0.31 0.94 1.0 0.51
CBI67016 (metB)
0.24 0.34 0.5 0.46 1.0 0.21 0.6 0.84 0.47
CBI67017 (luxS)
0.48 0.57 0.28 0.28 1.0 0.46 0.75 0.77 0.71
CBI67027 (HPB8_1470)
0.61 0.85 0.66 0.69 0.5 0.53 1.0 0.56 0.74
CBI67031 (hrgA)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.0
CBI67042 (HPB8_1485)
0.16 0.07 0.15 0.14 0.27 0.22 0.13 0.62 1.0
CBI67070 (putP)
0.29 0.66 0.5 0.49 0.16 0.46 0.76 0.88 1.0
CBI67081 (HPB8_1524)
0.12 0.0 0.51 0.68 1.0 0.52 0.19 0.06 0.25
CBI67182 (HPB8_1625)
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.25 1.0 0.08
CBI67183 (HPB8_1626)
0.13 0.0 0.55 0.44 0.58 0.31 0.81 0.84 1.0
CBI67214 (ceuE1)
0.35 1.0 0.5 0.41 0.95 0.38 0.28 0.25 0.47
CBI67257 (ald)
0.55 0.23 0.63 1.0 0.12 0.14 0.57 0.98 0.93
CBI67258 (rocF)
0.94 0.43 0.2 0.28 0.03 0.15 1.0 0.41 0.99
CBI67263 (HPB8_1706)
0.15 0.18 0.01 0.0 0.08 0.27 0.01 1.0 0.17
CBI67264 (HPB8_1707)
0.05 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)