Heatmap: Cluster_39 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
strain_5001420,control,fromUrine
strain_5001420,fromUrine
ch1034,13h_old_biofilm,biofilm_dispersed
ch1034,13h_old_biofilm,sessile
ch1034,7h_old_biofilm,sessile
ch1034,Log,planktonic
ch1034,Stationary,planktonic
control,fromNasalSwab,fromSwine
dmc1097
dmc1097,control,fromBlood
dmc1097,fromBlood
ekp16,fromSputum
eugenol,fromNasalSwab,fromSwine
fromBlood
fromHospitalPatients
fromRectalSwab
fromUrine
je01
k26,mero_susceptible,fromHospitalPatients
k56,mero_resistant,fromHospitalPatients
kctc2242
kp4,FeLimited,fromRespiratoryTract
kpr1,+CTX
kpr1,+gent
kpr1,+mero
kpr1,+TMP/SMX
kpr1,control
kpr2,+CTX
kpr2,+gent
kpr2,+mero
kpr2,+TMP/SMX
kpr2,control
kps1,+CTX
kps1,+gent
kps1,+mero
kps1,+TMP/SMX
kps1,control
kps2,+CTX
kps2,+gent
kps2,+mero
kps2,+TMP/SMX
kps2,control
mrsn 1319
ms6671
njst258-1,FeLimited,fromUrine
njst258-1,fromUrine
rb011,+mero,mero_resistant
rb011,control,mero_resistant
rb012,+gent,gent_resistant
rb012,control,gent_resistant
rb013,+cip,cip_resistant
rb013,control,cip_resistant
rb039,+cip,cip_resistant
rb039,+mero,mero_susceptible
rb039,control,cip_resistant
rb039,control,mero_susceptible
rb040,+cip,cip_susceptible
rb040,+gent,gent_susceptible
rb040,control,cip_susceptible
rb040,control,gent_susceptible
rb041,+cip,cip_susceptible
rb041,control,cip_susceptible
rb121,+gent,gent_susceptible
rb121,+mero,mero_susceptible
rb121,control,gent_susceptible
rb121,control,mero_susceptible
rb122,+gent,gent_resistant
rb122,control,gent_resistant
rb257,+mero,mero_resistant
rb257,control,mero_resistant
uhkpc05,FeLimited,fromBlood
uhkpc05,fromBlood
uhkpc07
uhkpc07,control,fromUrine
uhkpc07,fromUrine
uhkpc18
uhkpc18,control,fromUrine
uhkpc18,fromUrine
uhkpc33
uhkpc33,control,fromUrine
uhkpc33,fromUrine
uhkpc48
uhkpc48,FeLimited,fromUrine
uhkpc67
uhkpc67,control,fromBlood
uhkpc67,fromBlood
vakpc297
vakpc297,FeLimited,fromUrine
AGT21935 (N559_0109)
-0.65 -0.58 0.1 0.42 0.56 -0.09 -0.16 -0.12 -2.37 -0.37 -0.7 -1.06 -0.14 -0.82 2.36 -1.19 -0.51 -4.01 0.23 0.59 1.09 -2.39 -0.67 -0.59 0.33 -0.66 -0.33 -0.26 0.22 -0.5 -0.89 -0.39 0.04 1.05 1.74 -0.17 -0.74 0.75 0.8 1.13 0.82 -0.38 -0.1 -1.78 -1.23 -0.58 0.99 0.25 0.22 0.15 -0.37 -0.28 0.15 1.72 0.2 -0.4 0.93 1.29 0.01 0.09 0.03 0.02 1.05 0.95 -0.86 -0.76 -0.59 -0.66 -0.41 -0.66 0.3 -3.66 -1.61 -0.24 -0.63 -2.8 -0.55 -0.79 -1.7 -0.77 -0.59 -1.53 -1.38 -2.27 -0.44 -0.48 -2.54 -0.96
AGT21936 (N559_0110)
0.57 0.86 -1.48 -1.76 -1.44 -1.36 -1.9 -1.57 -3.28 0.43 0.47 -0.58 -0.37 -1.37 2.52 -1.65 -1.02 -4.49 0.16 0.22 1.3 -2.57 -2.03 -1.48 -0.49 -1.91 -1.55 -1.23 -0.96 0.1 -1.83 -1.23 0.28 -0.6 3.11 -2.18 -2.05 -0.46 -1.65 2.2 -1.09 -1.94 -1.08 -0.51 -0.28 -1.47 1.42 -1.0 -0.96 -1.63 -0.88 -0.81 -1.29 2.7 -1.38 -1.69 -1.44 -1.03 -2.22 -1.68 -2.44 -1.95 -0.6 1.55 -2.06 -2.08 -1.48 -1.98 -0.09 -0.44 1.83 -3.64 -3.23 0.67 0.97 -3.19 0.7 0.72 -2.58 0.55 1.14 -1.93 0.06 -1.11 0.99 1.06 -2.52 -0.4
AGT21937 (N559_0111)
-1.93 -2.01 -1.1 -0.37 -0.39 -1.73 -1.07 0.54 -3.76 -2.03 -1.95 -0.29 1.14 -0.41 0.68 -0.2 -0.45 -4.43 0.19 0.54 1.11 -1.54 0.5 0.67 -0.05 0.25 0.24 0.65 0.75 0.69 0.21 0.45 0.73 0.12 1.91 -0.88 0.14 0.8 -0.14 1.26 -0.26 0.26 0.22 -0.96 -1.58 -1.5 0.43 0.12 0.75 0.6 0.23 0.11 0.33 1.8 0.32 0.02 -0.2 0.12 0.32 0.7 -0.77 -0.05 0.12 0.94 0.58 0.09 0.67 0.53 0.69 0.5 -1.83 -2.9 -1.68 -1.87 -1.79 -2.34 -1.86 -1.34 -0.19 -1.61 -1.49 -1.91 -1.82 -0.32 -1.69 -1.49 -2.03 -1.55
AGT22047 (N559_0225)
-1.24 -1.08 -2.14 1.47 -1.51 -0.62 0.28 -0.73 0.31 -1.31 -0.87 -0.86 -0.52 1.45 2.41 2.17 2.13 -1.23 0.19 -0.22 0.53 -0.86 -0.25 -0.51 1.02 -0.63 -0.04 -0.72 -0.54 -0.25 -0.52 -0.51 0.4 -0.44 2.1 -0.04 -0.81 0.81 -0.39 0.47 -0.15 -0.52 0.25 -0.51 -1.86 1.49 0.95 0.6 -0.54 -0.21 -1.12 -1.25 -1.44 1.64 -1.34 -0.36 -0.68 -0.2 -0.95 -0.32 -0.73 -0.79 -0.44 0.39 -1.25 -1.41 -0.51 -0.41 -0.18 -0.29 -0.91 -0.87 - -1.46 0.61 -3.55 -1.19 -0.63 -2.09 -1.67 -0.89 -3.51 -0.88 0.48 -1.36 -0.8 -1.29 -1.85
AGT22070 (N559_0248)
-1.65 -1.53 0.5 0.02 -0.41 -0.74 -0.17 -0.36 -2.01 -1.5 -1.32 0.18 0.53 -0.29 1.31 -0.84 0.25 - 0.28 0.28 1.93 0.63 -0.11 0.33 1.02 -0.52 0.21 -0.47 -0.15 -0.08 0.08 -0.22 1.27 0.76 2.15 0.33 -0.41 1.33 -0.34 1.41 0.58 -0.65 0.06 0.3 -2.5 -0.62 1.26 0.67 -0.15 -0.11 -1.22 -1.07 -0.6 1.99 -0.65 -0.12 -1.16 0.06 -1.76 -1.03 -0.83 -0.25 0.76 1.01 -0.38 -0.16 0.33 0.29 -0.15 -0.41 -1.92 -1.12 -1.35 -2.21 -1.13 -1.13 -1.41 -1.09 -1.53 -1.63 -1.36 -1.19 -1.65 -0.23 -1.16 -1.09 -2.82 -2.25
AGT22136 (N559_0317)
-2.8 -2.43 0.14 0.39 -1.44 -1.36 0.63 -1.07 -1.54 -2.6 -2.57 0.74 -0.83 -1.18 2.49 -2.26 -0.1 -3.94 -0.17 0.76 1.69 -1.62 -0.52 -0.79 1.01 -0.32 -0.22 0.04 -0.16 -0.6 -0.36 -0.38 2.01 1.38 0.69 0.21 -0.46 1.8 0.44 0.68 0.76 -0.46 -0.98 -0.46 -2.27 0.11 1.03 0.52 -0.16 -0.03 -0.88 -0.8 -0.84 0.97 -0.43 -0.89 2.03 1.4 -0.53 -0.36 0.33 -0.96 1.38 1.34 -0.47 0.67 -0.79 -1.12 0.51 1.02 -2.14 -2.68 -4.27 -2.17 -2.2 -2.82 -3.0 -2.53 -1.68 -2.47 -2.3 -6.1 -1.86 -1.85 -2.43 -2.05 -2.71 -2.05
AGT22186 (N559_0372)
-0.98 -0.26 -0.35 -0.44 -0.28 -2.06 -0.73 -0.05 -0.22 -0.47 0.13 -0.39 -0.07 0.52 0.29 -1.33 1.13 -5.34 -0.76 -0.1 0.26 0.86 -0.52 -0.06 0.64 -0.6 -0.19 -0.32 0.06 -0.89 -0.91 -0.39 0.27 1.3 -0.24 0.09 -0.52 0.5 1.23 0.07 0.6 -0.55 0.27 -0.87 0.48 1.04 0.54 0.29 0.06 0.12 -0.33 -0.26 -0.4 0.53 -0.27 -1.0 0.23 1.75 -0.38 0.0 -1.04 -0.44 1.3 0.27 -0.01 -0.67 -0.06 -0.09 -0.97 -1.29 -0.0 -0.37 -0.03 -0.93 -0.13 -0.11 -0.55 0.0 -0.97 -0.64 -0.02 -0.7 0.78 0.17 -0.69 -0.03 -0.89 0.35
AGT22313 (N559_0509)
- -5.03 -1.99 0.81 -1.35 0.29 2.01 2.15 - -5.05 - 0.73 2.56 -1.45 3.31 -2.26 0.37 -0.74 2.53 1.43 1.87 - -0.35 -1.63 1.38 -1.53 0.08 -1.2 - 1.0 -0.41 -0.44 -0.16 -1.04 1.7 0.4 -0.5 -0.18 -0.53 0.94 -1.24 -0.23 1.9 -1.39 -4.07 -1.4 1.12 0.93 - -1.51 -2.45 -2.31 -1.61 1.38 -2.79 -1.25 -2.07 -0.65 -2.82 -0.84 -1.12 - -1.04 0.34 -0.45 -0.19 -1.63 -0.21 0.68 0.6 - - - -4.42 -2.24 - - - - - -4.26 - - -2.43 - - -2.11 -
AGT22550 (N559_0759)
-0.44 0.01 -0.33 -0.32 -0.48 0.18 -0.71 -0.91 -0.49 -0.56 0.14 -1.6 -0.55 -0.37 -1.18 -1.11 0.12 -2.28 -0.58 -0.35 0.6 0.66 -0.58 -0.08 0.09 -0.04 -0.02 -0.53 0.24 -0.3 0.05 -0.18 0.64 1.19 0.34 0.65 -0.13 0.21 1.62 0.62 1.38 -0.2 -0.42 0.37 -0.28 0.29 0.09 0.17 0.24 0.2 -0.04 -0.14 0.04 0.13 -0.01 -0.05 0.58 1.85 0.17 0.15 0.05 -0.24 1.19 0.2 0.11 -0.47 -0.08 0.05 -0.41 -0.55 -0.52 -1.46 -1.13 -0.4 0.24 -2.1 -0.49 0.17 -0.44 -0.77 -0.22 -0.83 -0.24 -0.97 -0.98 -0.16 -1.27 -0.51
AGT22674 (N559_0886)
-0.15 0.03 -0.43 0.3 -0.03 -1.02 -0.26 0.89 -0.67 -0.1 -0.03 -0.15 1.63 -0.07 1.56 -0.13 0.07 -2.68 0.88 0.78 -0.89 -1.3 -0.13 0.16 0.06 -0.5 -0.13 -0.45 -0.35 0.35 -0.21 -0.23 0.73 0.22 1.18 -0.45 -0.45 0.38 0.28 0.81 -0.83 -0.25 0.42 1.14 -1.06 -0.15 0.56 0.05 -0.35 -0.31 -0.51 -0.61 -0.46 1.25 -0.43 -0.08 -0.74 0.23 -0.49 0.07 0.09 -0.13 0.22 0.42 -0.53 -0.5 0.16 0.02 0.28 -0.1 -1.14 -0.9 -2.51 -1.24 -0.2 -2.03 0.37 0.45 -2.12 -0.21 0.07 -1.91 -0.78 -0.36 0.15 0.2 -0.7 -0.75
AGT22997 (N559_1233)
-0.65 -0.76 -0.88 -0.03 -1.38 -0.25 1.65 -1.45 -2.44 -1.44 -1.32 -1.27 -0.31 0.54 1.35 1.1 0.27 -1.29 1.1 0.62 0.88 -3.32 0.15 -0.28 0.76 -0.34 -0.1 0.11 -0.65 1.71 -0.35 0.26 1.02 -0.68 2.58 -0.8 -0.54 -0.0 0.08 1.92 -0.55 -0.43 0.03 0.05 -2.63 -0.72 1.07 0.3 -0.65 -0.47 -1.33 -1.33 -1.21 2.24 -1.19 -0.05 -0.53 0.0 -1.14 -0.37 -0.77 -0.96 -0.68 1.47 -1.08 -0.06 -0.28 -0.54 1.47 1.31 -1.65 -3.06 -4.59 -1.96 -0.46 -4.4 -1.07 -1.22 - -1.19 -0.9 -5.68 -2.2 -2.15 -1.12 -1.28 -2.97 -2.4
AGT23192 (N559_1437)
-0.48 -0.21 0.01 0.92 0.17 -0.61 0.58 0.21 -0.49 -0.43 -0.02 -0.47 0.78 0.49 0.98 -0.87 0.87 -3.7 1.01 0.74 -0.18 -0.43 -0.16 0.12 0.03 -0.46 -0.15 -0.33 -0.15 0.49 -0.01 -0.3 0.12 0.65 0.6 -0.12 -0.42 0.38 0.03 0.13 -0.32 -0.23 -0.14 -0.79 -0.12 0.19 0.34 0.12 -0.15 -0.34 -0.53 -0.57 -0.26 0.87 -0.37 -0.09 -0.24 0.23 -0.68 0.02 -0.03 -0.23 0.65 0.35 -0.18 -0.45 0.12 0.01 0.5 0.0 -0.53 -0.2 -1.79 -0.75 -0.24 -0.99 -0.4 0.11 -0.35 -0.32 0.07 -1.02 -0.34 0.59 -0.52 -0.05 0.31 -0.24
AGT23206 (N559_1451)
-1.04 -0.86 -0.24 0.51 0.58 -0.69 0.56 0.61 -1.88 -1.31 -0.88 1.65 1.31 -0.12 1.03 -0.41 0.51 -2.89 0.52 1.53 1.45 -1.06 -0.09 0.21 0.39 -0.44 -0.15 -0.2 0.04 0.28 -0.03 -0.14 0.62 0.59 1.44 -0.32 0.01 0.18 0.28 1.12 0.03 0.11 -0.44 -0.72 -1.44 -0.46 0.72 0.31 0.04 -0.05 -0.91 -0.72 -0.63 1.26 -0.67 -0.33 -0.76 0.64 -0.67 0.15 -1.36 -0.38 0.59 0.73 0.63 0.19 0.21 -0.09 0.25 -0.1 -1.15 -1.83 -1.51 -1.26 -0.3 -2.62 -0.97 -0.33 -1.95 -1.34 -0.84 -2.34 -1.54 -1.3 -1.13 -1.02 -1.26 -1.39
AGT23209 (N559_1454)
-0.76 -0.42 -0.82 -0.17 -1.57 -1.19 1.64 -1.93 -3.17 -0.53 -0.42 -0.4 -0.48 -0.29 2.15 0.62 -0.15 -8.13 2.21 1.34 0.97 -2.57 0.73 -0.58 1.08 -1.73 0.18 0.5 -0.73 0.5 -1.89 -0.37 1.12 -0.59 1.58 -0.19 -0.94 1.1 -1.33 0.99 0.01 -0.45 0.51 -2.08 -1.87 -0.95 1.14 0.66 -0.73 -0.82 -1.67 -1.48 -1.66 1.62 -1.74 -1.04 -1.36 -0.72 -1.69 -0.96 -1.15 -1.32 -0.59 1.58 -1.09 1.64 -0.58 -0.98 0.7 1.02 -0.85 -4.94 -1.15 -1.01 0.07 -2.0 -0.32 -0.3 0.32 -0.84 0.0 -1.48 -1.06 -1.7 -0.65 -0.42 -3.5 -1.69
AGT23262 (N559_1509)
-1.61 -1.7 -1.43 0.52 -1.93 -0.56 -1.14 -1.92 -4.31 -1.91 -1.4 0.94 -0.84 -1.06 1.14 -0.51 -1.05 -3.2 -0.35 -0.14 -1.76 -0.37 -0.79 -0.67 0.23 -1.18 -0.57 -0.27 -0.12 0.56 -0.72 -0.35 2.06 0.29 2.53 -0.56 -0.65 1.85 -0.66 3.55 -0.17 -0.8 -1.7 -0.37 -1.62 -1.76 1.77 -0.03 -0.12 -0.06 -1.23 -1.38 -1.87 2.33 -2.06 -1.09 -1.58 -0.29 -0.99 -0.78 -0.59 -0.9 0.29 2.88 -0.13 -0.75 -0.67 -0.77 0.31 -0.7 -0.69 -6.67 -6.85 -1.96 0.15 -4.39 -1.84 -1.49 -5.93 -1.9 -1.74 -5.35 -1.89 -4.06 -1.7 -1.77 -3.85 -1.69
AGT23555 (N559_1821)
-2.16 -2.09 0.64 -0.52 -0.63 -0.62 0.07 0.31 -2.67 -1.96 -2.25 0.79 0.57 -1.02 1.55 -3.48 -0.46 -4.54 -0.42 0.12 1.24 -0.42 0.14 0.76 0.58 0.02 0.41 -0.2 0.12 -0.86 -0.03 -0.2 1.52 1.1 1.24 -0.88 -0.13 1.29 0.27 1.42 -1.31 0.29 0.31 0.1 -2.68 -1.33 0.98 0.62 0.12 0.01 -0.3 -0.25 0.48 1.16 0.4 -0.03 0.22 1.4 0.83 1.32 -0.86 -0.07 1.1 0.8 -0.05 -0.04 0.76 0.57 -0.37 -0.42 -2.02 -2.08 -1.97 -2.99 -2.51 -1.51 -2.42 -1.79 -2.37 -1.99 -2.03 -2.01 -1.73 -0.79 -2.13 -1.76 -1.99 -2.15
AGT23598 (N559_1865)
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AGT23622 (N559_1889)
-0.75 -0.57 0.6 0.42 0.26 0.38 0.45 0.37 -0.3 -0.61 -0.35 -0.19 0.64 0.43 0.61 -1.78 1.16 -3.15 0.84 0.71 0.43 -0.9 -0.32 0.05 0.27 -0.55 -0.1 -0.42 0.22 -0.45 -0.48 -0.37 0.26 0.33 0.34 -0.38 -0.4 0.16 -0.07 0.29 0.33 -0.47 0.2 -0.21 -0.58 0.47 0.23 0.09 0.22 0.08 -0.38 -0.39 0.03 0.35 -0.08 -0.36 0.2 0.25 -0.04 0.01 -0.78 -0.47 0.33 0.1 -0.09 -0.56 0.05 0.05 -0.29 -0.46 -0.42 -0.77 1.41 -0.78 -0.7 0.34 -0.49 -0.42 0.72 -0.76 -0.58 0.8 -0.34 -0.64 -0.72 -0.58 -0.67 -0.51
AGT23654 (N559_1921)
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AGT23761 (N559_2040)
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AGT23967 (N559_2264)
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AGT24011 (N559_2309)
0.31 0.37 -0.48 0.91 -0.78 -1.04 -0.36 0.17 -1.17 0.59 0.48 0.73 1.69 0.31 0.81 0.12 -0.74 -2.1 -0.64 -0.72 -1.05 -2.7 -0.65 -0.58 0.98 -0.88 -0.33 -0.38 -0.06 1.09 -1.36 -0.25 1.09 0.08 1.95 -1.06 -0.95 0.68 -1.63 1.5 -1.12 -0.88 -2.5 0.48 -1.58 -1.27 1.35 0.4 -0.06 0.1 -0.14 -0.04 -0.98 1.99 -1.08 -1.0 -1.01 -1.18 -0.87 -0.35 -0.5 -0.72 0.08 0.86 -0.89 -1.21 -0.58 -0.81 0.9 0.12 -0.52 -1.87 -4.12 0.29 0.8 -2.84 0.35 0.52 -1.57 0.29 0.26 -2.62 -0.96 -1.04 0.24 0.63 -1.75 -1.22
AGT24035 (N559_2334)
-1.6 -1.75 -0.56 -0.18 -0.11 -2.06 -0.82 0.92 0.49 -1.56 -1.64 -1.25 0.54 0.08 1.56 -2.01 0.55 -3.24 -0.16 0.16 -0.27 -1.63 -0.48 -0.0 0.5 -0.55 -0.27 -0.37 0.05 0.62 -0.35 -0.14 -0.1 1.79 -0.37 -0.67 -0.58 -0.1 1.53 0.06 -0.44 -0.26 -0.42 0.34 -0.4 0.66 0.39 -0.11 0.05 -0.14 -0.54 -0.46 -0.2 -0.61 -0.35 -0.83 0.3 1.91 -1.05 0.2 -0.28 -0.76 1.79 -0.4 -0.38 -0.67 -0.0 -0.43 0.42 0.11 -0.39 0.04 -1.02 -1.1 -1.6 0.28 -1.44 -1.01 -1.39 -1.69 -1.45 -1.17 -0.26 1.88 -1.13 -1.23 1.56 0.06
AGT24111 (N559_2415)
-1.34 -0.93 -1.89 -0.38 -0.28 -3.5 0.28 -0.93 -2.15 -1.2 -0.8 -0.23 -0.5 -1.44 2.0 -1.9 -1.56 -9.2 0.18 0.27 1.06 -1.77 0.14 0.32 0.72 -1.19 0.13 1.24 1.25 -0.33 0.44 0.68 -0.07 1.54 -0.38 1.54 -0.61 2.19 0.79 -0.6 0.46 -0.36 -0.27 -1.26 -1.79 -1.54 0.57 0.57 1.25 1.12 -1.49 -1.24 -0.77 0.37 -0.8 -0.68 0.97 1.73 -1.19 -0.61 0.99 0.76 1.54 1.19 -1.11 -0.8 0.32 0.11 -0.22 -0.47 -2.24 -2.02 -3.87 -1.21 -1.26 -3.16 -1.08 -0.68 -2.28 -1.29 -0.81 -1.89 -1.77 -1.51 -1.19 -0.92 -2.44 -1.83
AGT24140 (N559_2447)
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AGT24434 (N559_2761)
-0.25 -0.28 0.42 0.23 -0.17 0.25 0.95 -0.29 -2.21 -0.13 -0.18 0.04 0.11 0.07 0.91 0.65 0.7 -10.76 0.59 0.15 0.43 -0.38 0.07 0.32 0.97 -0.25 0.19 -0.34 -0.26 0.67 0.17 -0.17 0.46 1.17 0.44 -0.41 -0.11 0.17 1.01 0.65 -0.09 0.03 0.0 0.15 -0.77 0.24 0.99 0.72 -0.26 -0.51 -0.34 -0.47 -0.78 0.33 -0.64 -0.24 -0.38 1.2 -0.72 0.23 -1.53 -0.72 1.17 0.32 0.17 -0.09 0.32 0.02 0.53 0.39 -0.36 -2.9 -3.81 -0.73 -0.24 -3.94 -0.32 -0.08 -3.9 -0.64 -0.36 -2.99 -0.46 -2.41 -0.55 -0.3 -2.45 -0.95
AGT24673 (N559_3010)
-0.88 -0.41 0.76 1.06 1.24 -1.22 0.45 0.33 -0.37 -0.9 -0.36 -0.38 0.56 -0.94 1.39 -1.64 -0.58 -2.79 0.4 0.78 0.04 -0.47 -0.25 0.13 0.22 -0.67 -0.23 0.22 0.46 -0.07 -0.23 -0.11 0.83 0.41 1.09 -1.07 -0.41 0.77 0.28 0.92 -1.01 -0.24 0.12 0.29 -0.55 -0.55 0.79 0.18 0.46 0.36 -0.42 -0.43 -0.13 1.41 -0.22 -0.54 0.32 0.53 -0.23 0.12 0.14 -0.21 0.41 0.51 -0.04 -0.53 0.13 -0.03 -0.08 -0.85 -0.66 -0.66 -2.62 -0.72 -0.22 -1.95 -0.72 -0.03 -1.92 -0.91 -0.4 -2.62 -0.5 0.22 -0.82 -0.41 -0.31 -0.36
AGT24674 (N559_3011)
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AGT24701 (N559_3038)
-0.42 0.01 0.14 1.08 0.31 0.08 1.11 -0.43 -1.78 -0.22 -0.23 0.01 -0.3 -0.39 1.1 -0.23 -0.14 -1.19 0.79 0.21 0.32 -0.19 -0.2 0.08 0.66 -0.15 -0.01 -0.09 0.45 0.15 -0.23 0.01 0.51 0.88 0.54 0.67 0.11 0.33 0.17 0.48 -0.15 -0.35 0.04 -0.43 -0.17 0.04 0.69 0.45 0.45 0.39 -0.38 -0.28 -0.21 0.39 -0.26 0.23 -0.1 0.3 -0.79 -0.6 0.09 -0.1 0.88 0.58 0.36 0.04 0.08 -0.05 0.15 -0.04 -0.16 -3.19 -4.31 -0.75 -0.64 -3.6 -0.21 0.05 -3.14 -0.68 -0.17 -2.82 0.13 -1.8 -0.56 -0.11 -2.64 -0.15
AGT24841 (N559_3181)
-2.57 -2.21 -0.32 1.45 -2.4 -0.6 -0.65 -0.2 -1.72 -2.21 -2.38 0.9 2.87 -0.49 2.32 -1.06 0.21 -4.75 1.61 1.68 1.06 -3.99 -0.76 -0.69 0.2 -1.21 -0.75 -0.42 -0.66 0.76 -1.12 -0.6 1.2 -0.4 2.64 -1.24 -1.43 1.0 -1.49 2.38 -0.97 -1.43 -0.32 -0.16 -2.79 -0.27 0.92 -0.52 -0.66 -0.62 -0.9 -1.06 -0.9 2.38 -1.0 -1.46 -1.5 -1.17 -1.3 -1.05 -1.59 -1.49 -0.4 1.72 -1.37 -1.22 -0.69 -0.9 0.54 -0.16 -2.14 -2.27 -1.62 -2.12 -1.57 -2.06 -2.11 -1.69 -0.93 -2.41 -2.02 -1.95 -2.34 -1.6 -1.85 -1.73 -1.43 -1.96
AGT24852 (N559_3192)
-1.86 -1.74 0.16 -0.03 -0.27 -1.5 0.28 0.39 -0.36 -1.77 -1.17 0.2 0.65 0.25 1.37 -1.07 0.27 -4.45 0.68 0.41 0.39 -0.25 -0.27 0.31 0.17 -0.92 -0.09 -0.37 -0.03 -0.74 -0.77 -0.47 0.24 0.32 0.2 -0.65 -0.52 0.33 0.7 0.15 -0.57 -0.42 -0.37 -0.58 -0.66 0.26 0.29 -0.02 -0.03 0.06 0.34 0.43 0.32 0.45 0.56 -1.01 0.28 1.04 0.53 0.27 -0.48 0.16 0.32 0.29 -0.01 -0.56 0.31 0.35 -0.23 -0.79 -0.91 -0.0 1.39 -2.27 -1.41 1.14 -1.72 -1.31 1.01 -1.71 -1.62 1.39 0.06 0.95 -2.13 -1.46 -1.3 -0.52
AGT24853 (N559_3193)
-1.2 -0.99 1.11 0.31 0.15 -0.29 0.35 -0.19 -0.42 -0.76 -0.37 0.31 0.33 0.12 1.24 -1.24 0.52 -3.58 0.06 -0.2 0.42 -0.25 -0.23 0.32 0.19 -0.81 -0.06 -0.71 -0.2 -0.5 -0.52 -0.66 0.4 0.81 0.17 -0.59 -0.41 0.08 0.96 0.29 -0.52 -0.45 -0.4 -1.09 -0.7 0.73 0.32 0.11 -0.2 -0.33 0.07 0.01 0.24 0.25 0.14 -0.89 0.34 1.44 0.06 0.02 -0.65 -0.02 0.81 0.17 -0.01 -0.46 0.32 0.29 -0.66 -0.93 -0.57 -0.43 0.85 -1.0 -0.57 0.9 -1.05 -0.69 0.73 -1.09 -0.87 0.45 -0.09 0.92 -1.04 -0.53 -1.0 -0.77
AGT24997 (N559_3341)
-0.93 -0.74 0.5 0.29 0.02 0.23 -0.22 1.06 0.82 -0.6 -0.18 0.94 1.17 -0.64 1.44 -0.94 -0.1 -1.59 0.04 0.07 -0.03 -0.35 -0.68 -0.38 -0.09 -0.54 -0.43 -0.47 0.11 -0.54 -0.8 -0.52 0.31 0.91 0.14 -1.13 -0.52 0.17 0.93 0.12 -0.63 -0.55 0.22 -0.37 -0.46 0.2 0.02 -0.17 0.11 -0.08 -0.05 0.01 0.05 0.11 0.03 -0.61 0.61 1.08 -0.06 -0.19 0.26 -0.12 0.91 -0.2 -0.34 -0.56 -0.38 -0.47 -0.51 -0.68 0.23 -0.03 0.77 -0.76 -0.27 0.37 -1.0 -0.62 0.2 -0.9 -0.81 0.5 0.01 -0.29 -1.16 -0.67 0.14 -0.34
AGT25228 (TolR)
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AGT25229 (TolQ)
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AGT25457 (N559_3821)
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AGT25458 (N559_3822)
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AGT25621 (N559_3990)
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AGT25672 (N559_4044)
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AGT25717 (N559_4091)
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AGT25718 (N559_4092)
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AGT25845 (N559_4221)
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AGT25847 (RseP)
-1.21 -0.85 1.53 1.21 0.6 1.08 0.73 -0.12 0.57 -1.02 -0.77 -0.1 0.33 0.43 0.49 -0.53 0.77 -1.51 0.21 -0.09 -0.17 -1.13 -0.74 -0.12 0.02 -0.69 -0.38 -1.02 -0.31 -0.87 -0.78 -0.7 0.08 0.97 0.42 -0.36 -0.47 0.07 0.64 0.22 -0.14 -0.71 -0.07 -0.93 -1.04 0.43 0.02 -0.19 -0.31 -0.36 -0.42 -0.23 -0.29 0.35 -0.31 -0.54 -0.18 1.06 -0.58 -0.32 -0.7 -0.39 0.97 -0.04 -0.26 -0.84 -0.12 -0.18 -0.99 -0.99 -0.83 0.55 0.71 -1.14 -0.67 0.98 -0.93 -0.68 0.75 -1.03 -0.64 1.03 -0.27 1.15 -1.03 -0.65 0.51 -0.88
AGT25860 (N559_4238)
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AGT25997 (KefF)
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AGT25998 (N559_4388)
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AGT26020 (N559_4413)
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AGT26246 (N559_4652)
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AGT26376 (N559_4785)
0.27 0.39 -1.84 0.16 -0.71 -3.16 -0.1 -0.71 -1.22 -0.12 0.11 -0.09 -0.24 -0.81 2.04 -1.41 -0.47 -5.42 -0.39 0.24 0.25 0.42 0.65 0.5 0.58 -0.91 0.26 0.23 -0.08 0.37 0.06 0.08 0.4 -0.3 0.1 -0.25 -0.29 0.55 -0.71 0.51 0.31 -0.03 0.73 -0.27 -0.07 - 0.72 0.57 -0.08 -0.05 -0.29 -0.15 -0.64 0.81 -0.68 -0.33 -0.57 -0.05 -1.09 -0.08 -0.31 -0.59 -0.3 1.25 0.18 0.14 0.5 0.19 0.72 0.33 0.25 -1.45 -1.78 -0.04 0.19 -0.93 0.24 0.58 -0.91 0.0 0.52 -0.8 -0.0 -1.18 0.26 0.33 -2.37 -0.33
AGT26377 (ParM)
-0.83 -0.57 -0.55 0.68 0.65 -1.72 -0.34 0.09 0.06 -0.89 -0.83 -1.86 0.1 0.46 1.79 -0.11 0.78 -2.72 0.08 0.53 -0.31 -0.79 0.07 0.17 0.56 -0.51 0.14 0.26 0.24 0.32 0.07 0.09 0.63 0.31 0.48 0.62 -0.03 0.52 -0.3 0.78 0.87 0.21 -0.12 0.52 -0.94 -8.45 0.65 0.64 0.24 0.24 -0.28 -0.4 -0.44 0.65 -0.42 0.04 -0.56 0.13 -0.69 0.15 0.21 -0.27 0.31 0.77 0.45 0.21 0.17 0.16 0.34 0.01 -0.88 -0.17 -1.78 -0.88 -0.58 -0.94 -0.75 -0.3 -1.4 -1.03 -0.39 -1.18 -1.01 0.22 -0.84 -0.54 0.09 -0.96
AGT26391 (PhnM)
-1.47 -1.32 -1.09 0.52 -0.98 -2.32 1.08 -1.28 -3.05 -1.56 -1.21 -0.4 -0.15 -0.75 2.11 -0.41 0.36 -7.3 1.38 0.85 1.88 -2.09 -0.28 -0.29 1.22 -0.89 0.25 -0.66 -0.87 0.36 -0.68 -0.81 2.56 1.14 0.85 0.89 -0.78 2.49 0.0 0.7 1.38 -0.54 -0.16 -1.43 -1.48 - 1.01 1.21 -0.87 -0.88 -1.07 -1.6 -1.44 1.01 -1.26 -0.46 0.02 0.7 -1.01 -0.55 -0.55 -1.18 1.14 0.8 -0.58 0.17 -0.29 -0.76 0.29 -0.01 -1.15 -2.77 -2.04 -1.75 -1.03 -4.91 -1.37 -0.87 -3.45 -1.62 -1.09 -4.87 -1.45 -1.38 -1.55 -1.38 -3.48 -2.01
AGT26393 (N559_4803)
-0.94 -0.87 -1.35 1.53 -1.16 -1.36 1.89 -1.99 -4.65 -1.19 -0.53 -1.72 -1.04 -0.77 2.09 -0.83 -0.55 -4.79 1.1 0.42 0.79 -3.25 -0.62 -1.1 1.04 -1.84 -0.46 -0.8 -1.16 0.39 -1.52 -1.18 2.46 0.59 2.84 -0.24 -1.88 2.51 -0.81 2.01 -0.8 -1.35 -0.01 -2.53 -1.54 -7.95 1.36 0.54 -1.16 -1.59 -2.27 -2.39 -2.24 2.68 -2.42 -1.67 -1.26 -0.3 -2.3 -1.22 -1.91 -1.61 0.59 1.61 -1.57 -0.61 -1.1 -1.53 0.25 -0.28 -0.82 -3.98 -2.92 -1.94 -0.05 -3.93 -0.76 -0.75 -2.88 -0.56 -0.21 -4.3 -1.38 -3.23 -1.06 -1.11 -2.76 -1.42
AGT26571 (YifK)
-2.05 -1.56 0.94 0.6 0.37 -0.77 -0.34 -0.5 -2.08 -1.89 -1.78 -0.72 -0.36 -0.79 0.44 -0.08 -0.44 -3.04 -1.38 -0.97 0.34 -1.27 0.31 0.81 0.64 0.03 0.4 0.17 0.54 -0.35 -0.04 0.22 0.92 1.08 0.27 0.68 0.57 1.01 0.92 0.77 0.94 0.5 0.51 0.49 -2.27 -1.19 0.6 0.29 0.54 0.6 0.34 0.43 0.19 0.38 0.32 -0.23 0.09 1.15 0.67 1.07 -0.7 0.19 1.08 0.53 0.82 0.28 0.81 0.74 -0.06 0.09 -2.17 -1.83 -1.44 -1.48 -1.45 -2.14 -1.83 -1.35 -2.31 -1.79 -1.32 -2.14 -2.17 -1.38 -1.78 -1.46 -1.85 -1.88
AGT26636 (CpxR)
-0.22 -0.12 0.12 0.52 0.34 -0.76 0.37 0.42 -1.3 -0.6 -0.38 -0.93 0.82 -0.0 0.91 -0.17 0.6 -1.97 0.25 0.29 0.18 -1.1 0.08 0.02 0.25 -0.31 -0.03 0.02 -0.12 0.62 0.13 -0.02 -0.09 0.7 0.65 0.23 -0.14 0.17 0.59 0.44 0.58 0.05 -0.09 0.6 -0.95 0.34 0.68 0.43 -0.12 -0.09 -0.29 -0.35 -0.36 1.02 -0.43 -0.16 -0.85 0.5 -0.52 0.03 -0.64 -0.03 0.7 0.44 0.13 -0.01 0.02 -0.08 0.59 0.28 -0.7 -0.41 -1.05 -0.45 -0.3 -1.46 -0.44 -0.09 -1.36 -0.43 -0.05 -1.26 -1.05 0.1 -0.7 -0.55 -0.54 -0.87

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.