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Heatmap: Cluster_5 (HCCA)

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Gene
strain_5001420,control,fromUrine
strain_5001420,fromUrine
ch1034,13h_old_biofilm,biofilm_dispersed
ch1034,13h_old_biofilm,sessile
ch1034,7h_old_biofilm,sessile
ch1034,Log,planktonic
ch1034,Stationary,planktonic
control,fromNasalSwab,fromSwine
dmc1097
dmc1097,control,fromBlood
dmc1097,fromBlood
ekp16,fromSputum
eugenol,fromNasalSwab,fromSwine
fromBlood
fromHospitalPatients
fromRectalSwab
fromUrine
je01
k26,mero_susceptible,fromHospitalPatients
k56,mero_resistant,fromHospitalPatients
kctc2242
kp4,FeLimited,fromRespiratoryTract
kpr1,+CTX
kpr1,+gent
kpr1,+mero
kpr1,+TMP/SMX
kpr1,control
kpr2,+CTX
kpr2,+gent
kpr2,+mero
kpr2,+TMP/SMX
kpr2,control
kps1,+CTX
kps1,+gent
kps1,+mero
kps1,+TMP/SMX
kps1,control
kps2,+CTX
kps2,+gent
kps2,+mero
kps2,+TMP/SMX
kps2,control
mrsn 1319
ms6671
njst258-1,FeLimited,fromUrine
njst258-1,fromUrine
rb011,+mero,mero_resistant
rb011,control,mero_resistant
rb012,+gent,gent_resistant
rb012,control,gent_resistant
rb013,+cip,cip_resistant
rb013,control,cip_resistant
rb039,+cip,cip_resistant
rb039,+mero,mero_susceptible
rb039,control,cip_resistant
rb039,control,mero_susceptible
rb040,+cip,cip_susceptible
rb040,+gent,gent_susceptible
rb040,control,cip_susceptible
rb040,control,gent_susceptible
rb041,+cip,cip_susceptible
rb041,control,cip_susceptible
rb121,+gent,gent_susceptible
rb121,+mero,mero_susceptible
rb121,control,gent_susceptible
rb121,control,mero_susceptible
rb122,+gent,gent_resistant
rb122,control,gent_resistant
rb257,+mero,mero_resistant
rb257,control,mero_resistant
uhkpc05,FeLimited,fromBlood
uhkpc05,fromBlood
uhkpc07
uhkpc07,control,fromUrine
uhkpc07,fromUrine
uhkpc18
uhkpc18,control,fromUrine
uhkpc18,fromUrine
uhkpc33
uhkpc33,control,fromUrine
uhkpc33,fromUrine
uhkpc48
uhkpc48,FeLimited,fromUrine
uhkpc67
uhkpc67,control,fromBlood
uhkpc67,fromBlood
vakpc297
vakpc297,FeLimited,fromUrine
AGT21873 (N559_0040)
 1.16 1.12 5.2 8.79 3.63 5.55 8.32 2.41 0.83 1.15 1.24 3.25 8.92 6.92 11.17 6.92 7.81 0.16 3.97 3.47 23.37 1.45 4.13 4.2 10.42 4.34 5.85 2.95 4.4 6.22 5.36 4.68 5.11 11.82 5.85 18.59 4.78 5.08 8.54 5.85 35.11 5.7 3.04 2.04 0.77 5.01 9.2 8.77 4.4 3.83 1.86 2.65 2.46 12.51 2.41 4.7 6.19 11.48 2.33 3.78 2.06 3.62 11.82 10.12 5.14 5.14 4.2 3.73 5.41 5.42 0.6 0.63 0.75 1.23 0.95 1.14 1.24 1.57 0.94 1.11 0.98 0.35 0.78 1.98 1.54 1.78 1.64 0.69
AGT21874 (N559_0041)
 2.81 2.78 5.11 13.35 5.49 4.93 9.07 2.83 0.79 2.88 2.85 2.79 10.71 5.52 12.94 4.1 6.33 0.35 6.34 4.99 25.97 1.48 4.14 4.75 8.56 3.65 5.39 3.44 3.25 5.86 4.04 3.83 4.84 10.4 5.14 15.23 4.12 6.55 6.16 5.63 36.4 5.29 5.33 1.86 1.7 4.08 7.83 9.01 3.25 3.64 2.45 2.77 3.09 8.45 3.03 3.94 3.64 9.92 2.27 3.89 2.12 3.41 10.4 9.67 5.15 5.27 4.75 4.08 5.12 5.02 1.26 0.18 1.34 2.88 2.43 1.3 3.39 3.12 4.16 2.49 3.14 2.56 1.84 1.64 3.01 2.8 1.45 1.51
AGT21901 (N559_0072)
 0.77 1.06 5.82 3.5 3.18 3.6 4.77 1.48 0.21 1.29 1.43 2.2 1.46 5.27 8.53 1.95 11.34 0.41 3.29 3.4 17.65 0.89 3.09 2.97 10.4 2.56 4.38 2.69 2.43 3.48 3.01 2.71 6.64 8.29 3.75 7.05 2.91 4.78 6.41 3.07 13.37 3.59 1.6 1.72 1.14 7.18 9.21 7.5 2.43 2.64 2.17 2.64 2.63 7.23 2.49 3.5 12.31 12.04 2.08 2.99 3.44 2.8 8.29 7.04 3.45 2.9 2.97 3.05 3.73 3.78 1.49 0.42 0.0 0.9 1.0 0.08 1.14 1.33 0.7 0.83 1.5 0.35 1.15 1.1 0.9 0.99 0.76 1.46
AGT21906 (N559_0077)
 1.03 1.57 6.13 4.25 2.46 1.86 3.98 1.53 0.81 1.28 1.53 3.7 2.4 2.92 7.41 2.65 3.78 0.05 3.29 2.54 13.67 1.22 2.45 2.38 8.27 2.46 4.18 1.98 3.16 4.62 2.86 2.93 4.37 7.03 3.66 9.3 2.6 4.83 5.86 3.21 10.73 3.18 2.08 0.98 1.04 3.72 7.57 7.16 3.16 2.91 2.48 2.1 1.95 7.77 2.46 3.14 6.09 7.19 1.83 3.37 3.89 3.04 7.03 5.3 2.53 3.3 2.38 2.57 4.05 4.13 0.94 0.98 0.73 0.93 1.48 0.67 1.06 1.44 0.0 1.06 1.34 0.92 1.69 1.13 1.4 1.72 0.4 1.12
AGT21908 (N559_0079)
 0.1 0.34 1.83 1.07 0.99 1.06 1.55 0.45 0.45 0.46 0.51 0.91 0.75 1.01 4.77 0.41 3.27 0.08 1.95 1.33 11.28 0.14 0.38 0.63 3.49 0.3 1.22 0.54 0.58 1.02 0.88 0.6 1.58 2.47 1.06 1.25 0.52 1.38 3.1 1.01 1.68 0.53 0.5 0.29 0.35 1.88 2.84 2.81 0.58 0.69 1.52 1.07 0.36 1.95 0.69 0.6 2.72 4.44 0.33 0.51 1.88 0.77 2.47 1.37 0.41 0.66 0.63 0.73 0.82 0.66 0.26 0.14 0.82 0.35 0.51 0.5 0.64 0.51 3.41 0.55 0.48 0.77 0.48 1.25 0.19 0.47 0.45 0.31
AGT21909 (N559_0080)
 0.64 0.76 1.63 2.48 1.73 1.05 2.46 0.75 0.27 0.49 0.94 1.24 0.98 1.73 5.04 1.44 1.5 0.63 2.64 2.3 15.43 0.61 1.35 1.95 4.73 1.59 2.34 1.82 1.79 1.95 1.51 1.72 2.35 2.32 3.37 8.01 1.88 4.69 2.92 2.1 4.35 2.22 0.92 0.43 0.37 1.06 3.97 3.84 1.79 1.65 1.74 1.37 1.44 3.78 1.24 2.05 2.24 4.21 0.65 1.37 2.35 3.32 2.32 3.4 1.24 2.23 1.95 1.85 2.26 1.85 0.66 0.18 0.89 0.51 0.93 0.22 0.85 0.89 2.13 0.87 0.98 1.14 0.78 0.56 0.71 0.86 0.79 0.82
AGT21913 (N559_0087)
 0.0 0.0 0.68 2.04 0.27 0.63 2.28 0.67 2.35 0.0 0.25 0.64 0.0 3.73 12.34 4.82 2.5 0.0 0.46 0.58 24.92 0.2 3.23 0.0 1.4 0.39 0.87 1.87 0.0 0.5 1.17 0.52 1.14 1.33 0.36 0.0 2.1 1.32 2.13 0.74 1.12 0.59 4.78 0.77 0.0 2.14 1.12 0.37 0.0 0.0 0.38 0.0 1.06 1.17 1.48 1.9 0.0 4.24 0.0 0.77 0.17 0.5 1.33 3.26 1.65 3.11 0.0 0.99 0.4 3.75 0.21 1.07 0.0 0.3 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.42 1.0 0.0 4.91 0.0 0.15 4.36 0.26
AGT21917 (N559_0091)
 0.9 0.71 2.12 7.79 2.45 1.0 5.66 1.06 0.0 1.24 0.87 1.18 1.55 2.11 7.77 1.22 2.98 0.47 4.69 3.6 14.17 0.44 1.52 1.65 5.16 1.39 2.19 1.89 1.88 2.25 1.62 1.78 3.64 4.81 1.82 3.72 1.46 4.95 5.09 1.54 4.36 1.84 1.5 0.76 0.74 2.11 4.5 3.47 1.88 2.02 0.86 0.94 1.17 2.72 1.01 1.28 8.5 11.31 1.33 2.58 1.55 1.13 4.81 4.92 1.42 1.65 1.65 1.73 2.06 1.12 0.87 0.19 0.39 1.07 0.87 0.09 0.97 1.16 0.24 0.84 0.87 0.0 1.04 0.57 0.93 0.83 0.55 0.76
AGT21918 (N559_0092)
 2.48 2.56 6.09 18.74 7.06 10.1 12.73 4.0 0.55 2.22 2.87 3.15 6.81 5.27 7.4 6.36 6.59 0.9 5.52 5.72 17.32 2.43 4.62 4.93 9.16 3.66 5.56 4.9 5.71 7.31 3.67 5.16 6.47 5.02 5.74 6.63 4.46 7.48 5.88 6.36 12.27 7.01 3.69 1.98 1.79 3.38 8.3 8.02 5.71 5.56 2.55 3.13 4.0 9.57 3.85 3.79 7.67 9.44 4.05 7.36 4.39 4.44 5.02 10.61 5.51 6.7 4.93 4.92 6.86 5.79 2.0 0.65 0.33 2.47 2.85 0.45 2.26 3.4 0.75 2.48 2.86 1.31 2.48 1.84 2.76 2.77 1.06 2.32
AGT21920 (N559_0094)
 1.27 0.87 2.32 5.51 3.02 1.65 3.24 2.51 0.45 1.18 1.56 2.24 2.66 3.74 8.74 2.51 4.76 1.06 3.86 3.05 23.32 0.56 3.46 3.97 7.38 2.41 3.48 3.63 2.36 4.54 2.6 3.06 3.95 5.19 3.14 5.54 2.7 4.07 5.87 3.49 7.46 3.82 2.13 1.7 1.05 4.71 6.61 5.03 2.36 3.13 1.45 1.42 1.37 6.45 1.34 1.99 5.17 8.78 2.77 5.45 2.59 2.17 5.19 8.49 3.24 3.86 3.97 2.64 5.64 3.83 0.68 0.41 1.36 0.76 0.93 0.37 2.04 1.49 0.51 1.28 1.12 1.34 0.96 2.56 1.4 1.44 0.84 1.12
AGT21921 (N559_0095)
 1.06 1.42 2.77 4.49 3.53 0.98 4.29 1.79 0.71 1.01 1.58 3.01 1.85 3.2 6.06 1.85 5.61 0.11 3.51 4.37 16.42 1.01 2.17 1.94 3.48 1.23 2.2 1.11 1.31 2.37 2.19 1.91 2.84 3.34 1.56 2.65 1.43 2.57 1.79 2.61 4.51 1.5 2.6 0.95 1.32 3.94 3.61 3.03 1.31 2.23 1.5 1.28 1.34 2.99 1.47 1.2 4.04 5.31 1.91 1.99 1.65 1.15 3.34 3.18 1.8 1.13 1.94 2.18 3.18 1.81 1.2 0.86 0.43 1.12 1.44 1.57 1.21 1.98 1.62 1.19 1.49 1.82 1.12 1.42 1.57 1.69 0.7 0.87
AGT21922 (N559_0096)
 0.78 1.13 1.78 3.43 2.49 0.86 3.83 0.48 0.43 1.26 0.92 3.56 1.4 1.28 4.23 0.87 2.58 0.3 3.33 3.37 11.5 0.33 0.71 0.6 2.62 0.36 1.44 0.78 0.98 2.01 0.56 1.05 1.61 2.29 0.94 1.05 0.65 1.47 1.81 1.0 3.04 1.27 1.38 0.44 0.76 1.56 2.56 2.62 0.98 1.04 0.61 0.74 0.78 2.22 0.6 0.59 3.52 3.08 1.22 2.31 0.5 0.65 2.29 1.67 0.88 0.94 0.6 1.16 1.91 2.11 0.82 0.13 0.69 1.15 1.16 1.41 1.42 1.37 1.95 1.06 1.43 0.85 0.86 0.68 1.08 1.24 0.0 1.07
AGT21930 (EefB)
 0.22 0.19 0.58 0.73 0.78 0.28 0.74 0.79 0.13 0.2 0.27 2.3 0.93 0.87 3.76 0.47 1.67 0.05 1.16 1.14 10.41 0.29 0.68 1.11 1.62 0.64 1.05 1.01 1.03 0.73 0.92 0.84 1.24 1.3 1.02 1.13 0.53 1.13 0.64 0.94 1.55 0.87 5.46 0.27 0.21 1.04 1.49 1.67 1.03 1.15 0.58 0.68 0.81 1.51 1.07 0.46 2.4 1.69 1.02 1.15 0.73 0.99 1.3 1.16 0.59 0.66 1.11 1.02 0.77 0.74 0.18 0.13 0.38 0.27 0.26 0.35 0.2 0.26 0.57 0.29 0.21 0.21 0.21 0.28 0.26 0.25 0.22 0.28
AGT21931 (N559_0105)
 0.35 0.4 0.92 2.08 1.45 0.71 2.0 0.95 0.44 0.34 0.27 2.28 1.57 1.44 4.76 0.75 2.6 0.04 1.7 1.76 11.99 0.43 1.35 2.3 4.72 1.2 1.74 1.73 1.69 0.93 1.51 1.24 2.26 6.46 2.16 2.11 1.28 2.06 4.71 1.59 4.26 1.65 5.77 0.39 0.37 1.25 4.07 2.66 1.69 1.33 0.67 0.93 1.71 4.2 1.42 1.0 3.96 7.95 1.4 2.28 1.59 1.23 6.46 2.5 1.62 1.34 2.3 1.68 1.18 0.89 0.31 0.07 0.09 0.21 0.31 0.61 0.45 0.35 1.01 0.33 0.44 0.5 0.25 0.26 0.35 0.27 0.76 0.39
AGT21945 (N559_0119)
 6.51 6.83 3.14 9.25 7.33 2.33 11.22 10.64 3.79 6.31 7.83 4.5 14.79 10.67 12.52 4.69 16.29 0.53 16.77 21.56 24.35 1.85 5.66 6.47 13.81 5.72 7.54 8.46 8.62 10.05 6.21 6.88 9.79 16.6 9.43 17.0 6.57 11.99 13.92 10.05 25.8 7.6 7.69 3.31 2.37 10.31 13.71 13.76 8.62 7.56 3.7 4.0 5.55 16.57 6.25 5.5 13.91 21.12 4.08 7.24 8.0 6.14 16.6 9.74 8.35 8.58 6.47 5.85 9.47 8.13 2.35 1.82 1.02 6.65 6.7 1.04 6.94 10.06 7.18 6.33 8.32 2.69 2.15 7.28 7.21 6.65 2.97 3.3
AGT21948 (N559_0122)
 1.03 1.12 3.95 9.32 3.66 5.26 5.87 2.35 2.45 1.27 2.15 4.11 9.26 8.19 8.71 3.93 15.03 0.0 6.91 6.41 21.75 4.35 2.06 2.33 9.26 3.99 4.0 2.52 3.35 5.62 1.75 2.23 0.25 1.38 4.52 5.87 2.17 3.56 9.94 0.3 20.45 3.77 7.06 6.3 2.41 12.97 7.49 7.23 3.35 2.39 3.61 4.0 4.8 16.74 4.86 5.17 8.49 15.06 3.22 3.49 2.11 2.19 1.38 6.88 0.87 0.84 2.33 2.13 5.05 6.41 0.46 0.45 1.33 0.89 0.81 2.22 1.56 2.17 2.78 1.01 1.41 2.29 2.21 2.92 0.97 1.83 2.0 1.69
AGT21952 (N559_0126)
 0.48 0.4 1.1 4.8 1.37 0.5 3.23 1.27 0.61 0.45 0.68 1.13 1.26 2.1 4.04 1.69 3.24 0.0 3.64 3.52 8.8 0.23 1.81 1.91 2.21 1.66 1.77 1.78 1.27 3.08 1.7 1.74 1.7 2.92 1.47 2.16 1.54 2.73 2.66 1.84 3.39 1.89 1.16 1.42 0.22 1.82 2.15 2.42 1.27 1.75 0.82 0.71 0.89 2.9 0.73 1.29 1.94 4.52 0.9 1.8 0.66 1.84 2.92 2.62 1.8 2.22 1.91 1.92 2.89 2.15 0.28 0.51 0.12 0.42 0.45 0.42 0.69 0.65 0.47 0.39 0.48 0.87 0.25 0.91 0.45 0.66 1.21 0.14
AGT21953 (N559_0127)
 1.77 1.78 2.48 5.48 3.52 1.84 6.62 2.69 1.85 2.06 1.92 1.96 3.38 5.24 5.76 9.38 6.26 0.0 10.55 11.3 11.27 1.26 4.98 4.49 6.34 1.86 4.13 3.37 1.63 5.89 3.53 3.13 2.09 2.97 2.55 2.73 2.19 4.66 1.71 1.82 3.93 2.98 2.51 2.23 0.99 4.15 5.46 5.96 1.63 1.88 2.66 3.01 1.66 3.1 1.78 1.78 2.55 2.71 1.72 4.08 0.66 2.31 2.97 3.19 2.46 3.06 4.49 3.84 5.98 4.5 1.04 2.15 1.5 1.53 1.32 2.33 2.26 2.39 2.23 1.7 2.24 5.84 1.01 4.78 2.01 2.08 6.55 1.22
AGT21956 (N559_0130)
 0.49 0.65 2.24 3.56 2.56 2.67 3.29 1.66 0.81 0.47 0.65 1.26 1.17 5.33 10.6 5.47 7.85 0.69 3.69 3.56 28.86 0.39 2.25 2.86 2.91 1.79 2.63 2.09 1.87 1.92 2.11 2.15 2.3 3.48 2.27 2.49 2.64 3.7 6.47 1.98 3.37 2.44 2.91 3.61 0.56 4.07 2.91 3.37 1.87 2.25 1.0 0.78 1.16 2.41 1.4 2.09 2.78 12.4 1.08 2.81 1.61 1.39 3.48 2.11 2.9 2.97 2.86 2.92 1.87 2.41 0.46 0.49 0.22 0.67 0.5 0.52 0.8 0.62 2.25 0.65 0.67 0.23 0.65 2.04 0.57 0.75 1.0 0.78
AGT21985 (N559_0160)
 1.19 1.22 2.85 0.85 1.21 4.61 0.64 0.14 1.42 1.37 1.27 0.52 0.62 7.51 4.84 1.38 16.63 0.0 0.54 0.72 19.36 0.45 1.22 1.16 5.52 1.23 2.08 1.02 1.28 0.67 1.97 1.13 1.96 7.47 1.79 2.56 1.08 1.04 4.32 1.07 3.69 1.06 0.63 0.8 0.54 6.58 4.65 3.82 1.28 1.19 1.01 1.37 1.32 3.21 1.28 1.19 5.58 11.03 1.2 1.11 4.91 1.53 7.47 2.6 1.11 0.82 1.16 1.3 0.54 0.74 0.3 0.65 2.36 0.86 0.86 1.76 1.48 1.42 5.65 1.25 1.15 4.68 0.75 2.01 1.38 1.63 0.79 0.31
AGT21986 (N559_0163)
 0.53 0.72 9.64 8.79 5.4 17.63 5.5 1.79 1.5 0.79 0.56 3.98 1.88 16.17 6.18 5.41 21.76 0.0 2.26 1.48 28.74 0.85 4.92 5.82 8.71 6.47 6.69 3.08 5.6 6.08 8.05 5.28 9.66 21.44 7.86 11.08 7.33 5.81 16.79 9.61 6.8 7.78 2.25 0.8 0.67 10.45 7.7 7.98 5.6 4.23 2.77 2.69 3.25 6.16 3.64 5.57 8.98 24.85 5.34 9.62 4.18 4.07 21.44 8.56 8.38 9.8 5.82 5.63 5.34 6.05 0.35 0.81 1.32 0.48 0.56 1.8 0.97 0.7 6.83 0.69 0.7 3.95 0.74 2.44 1.13 0.98 1.82 0.62
AGT22040 (N559_0218)
 0.7 0.69 2.28 6.29 3.06 2.8 13.06 0.89 0.46 0.77 0.97 1.63 1.43 2.81 7.99 4.29 5.3 0.13 8.36 5.79 13.54 0.62 3.71 3.29 7.94 2.34 4.35 2.6 2.27 3.62 3.13 2.73 4.1 8.22 3.89 5.27 3.72 4.13 4.27 4.08 8.13 3.48 2.52 1.39 0.42 2.42 6.94 7.14 2.27 2.21 1.43 1.13 1.4 6.25 1.57 3.3 3.79 8.25 1.41 2.49 1.24 1.96 8.22 4.47 4.02 4.58 3.29 3.95 5.58 3.53 0.53 0.83 0.44 0.73 0.82 0.83 0.94 1.1 1.24 0.69 0.87 1.09 0.53 1.41 0.98 1.02 2.03 0.54
AGT22045 (N559_0223)
 5.78 6.82 6.23 8.08 6.56 12.75 7.95 5.33 1.78 5.45 6.47 2.99 6.69 8.71 12.49 6.77 12.56 0.41 6.35 5.3 25.96 7.08 7.03 8.02 14.67 5.57 6.63 3.27 6.59 6.86 8.27 6.26 9.83 16.07 11.2 19.82 4.89 12.61 9.41 10.04 19.42 5.89 3.85 3.08 7.52 9.98 13.18 7.66 6.59 8.88 4.89 5.35 4.97 13.41 6.59 4.41 8.65 13.6 4.7 6.11 7.19 5.55 16.07 9.24 4.42 7.69 8.02 7.36 5.49 7.42 7.76 2.16 0.72 3.75 8.66 4.41 6.98 6.88 4.05 6.28 7.01 4.04 11.12 5.31 4.64 6.29 3.08 7.04
AGT22046 (YiaH)
 8.33 7.64 6.5 10.87 5.85 8.02 8.41 3.89 5.53 6.51 9.05 4.05 5.39 12.48 14.98 23.72 10.29 3.28 7.63 6.78 19.66 6.76 9.98 11.92 27.59 8.8 15.22 10.38 14.38 10.35 12.51 10.94 19.22 23.89 18.47 27.29 9.65 13.19 18.57 15.51 28.86 11.97 4.13 4.95 7.42 10.93 25.22 26.24 14.38 12.92 5.91 8.31 6.63 18.91 6.82 8.86 17.72 23.16 7.37 13.03 13.12 8.0 23.89 21.35 10.42 12.24 11.92 11.16 10.1 8.24 9.26 3.7 2.41 8.04 10.93 5.07 7.22 7.82 6.98 5.67 7.71 3.4 9.05 7.87 7.69 7.94 5.12 6.96
AGT22151 (N559_0333)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.67 0.0 0.0 4.84 0.0 0.0 20.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AGT22205 (HofQ)
 1.78 1.98 7.14 7.77 5.68 4.36 8.19 2.15 1.46 1.82 1.94 4.95 4.23 5.63 11.21 2.43 6.39 0.12 4.29 3.85 21.4 1.54 3.09 2.35 9.38 2.47 4.26 3.78 3.32 4.11 2.67 3.41 5.04 6.77 4.66 5.66 2.65 4.77 6.54 3.0 7.45 3.09 3.2 1.88 1.36 5.6 7.89 7.16 3.32 3.93 1.74 1.88 2.19 7.06 2.11 2.52 7.15 10.21 2.36 3.66 2.96 1.54 6.77 6.35 2.99 2.71 2.35 3.2 3.74 2.83 2.31 1.79 2.24 1.57 1.7 1.58 2.25 2.13 3.58 1.81 2.16 3.92 2.0 3.75 2.33 2.06 2.08 2.04
AGT22282 (BpeB)
 7.74 7.8 35.27 16.89 11.41 13.38 14.12 4.91 2.35 8.13 10.09 15.42 10.25 10.21 16.71 9.75 9.48 0.64 16.32 14.64 25.05 3.1 6.55 7.89 23.29 9.33 11.02 8.55 8.24 11.21 7.74 8.6 9.86 10.31 11.09 16.99 7.51 10.4 9.15 7.63 16.07 8.2 4.5 4.33 4.78 7.8 19.9 19.08 8.24 7.91 5.64 6.23 8.35 11.98 8.56 9.01 5.33 13.86 6.82 9.85 4.25 5.84 10.31 11.44 7.68 7.69 7.89 6.74 10.79 10.27 4.96 1.61 5.88 8.99 9.13 1.77 9.55 9.31 2.77 7.67 7.81 3.15 4.1 3.03 8.74 7.88 3.61 4.6
AGT22283 (N559_0475)
 1.22 1.61 14.29 3.78 2.62 3.11 3.14 0.81 1.86 1.79 2.1 7.75 3.2 2.59 6.62 3.09 3.1 0.31 2.28 2.41 18.05 0.52 1.22 1.88 4.98 1.5 2.28 1.64 1.61 1.82 1.47 1.6 3.4 5.19 2.65 3.78 1.58 2.53 3.25 1.83 3.77 1.55 1.56 1.16 0.9 2.07 4.46 3.92 1.61 1.72 1.85 1.73 2.31 2.82 2.4 1.3 2.57 6.22 1.46 1.72 1.53 1.45 5.19 3.39 1.96 2.04 1.88 1.32 1.71 1.26 0.62 0.42 1.04 1.3 1.11 0.66 1.88 1.8 0.0 1.13 1.56 0.23 1.37 1.11 1.68 1.97 1.57 1.28
AGT22284 (EnvR)
 0.27 0.34 9.87 0.81 0.67 1.09 0.61 0.24 0.54 0.03 0.18 4.66 1.5 3.26 3.15 0.82 6.9 0.34 0.99 0.81 14.15 0.04 0.94 0.95 4.51 1.75 2.3 0.8 1.71 2.14 0.95 1.54 2.68 6.27 2.26 4.11 1.5 2.16 5.43 1.63 1.86 1.39 0.31 0.74 0.05 2.57 3.85 3.32 1.71 1.14 1.4 1.01 2.45 2.69 2.92 1.87 3.34 9.7 1.97 1.52 1.76 1.71 6.27 1.22 0.92 2.02 0.95 1.36 2.61 3.41 0.18 0.0 0.0 0.15 0.27 0.0 0.06 0.24 0.0 0.21 0.32 0.23 0.04 0.48 0.34 0.24 0.6 0.0
AGT22638 (N559_0849)
 1.1 1.65 1.33 2.68 2.92 0.83 2.42 0.85 0.0 1.14 2.19 1.2 1.09 2.71 3.75 1.06 6.18 0.09 1.45 1.49 11.05 0.94 1.53 1.95 3.77 1.09 2.22 1.4 1.56 2.22 2.09 1.61 3.43 3.67 1.68 2.56 1.17 1.9 3.5 1.81 3.76 1.67 1.43 0.45 2.63 4.27 4.29 3.86 1.56 2.04 1.06 0.91 1.05 4.61 1.32 1.0 3.11 5.82 1.06 2.02 1.52 0.98 3.67 2.24 1.53 1.21 1.95 1.92 2.35 1.38 1.46 0.36 0.09 1.2 1.92 0.77 1.61 2.25 0.71 2.01 2.18 0.13 1.8 1.12 1.11 1.99 0.0 2.78
AGT22712 (N559_0924)
 2.32 2.41 2.02 4.52 3.37 3.77 8.48 2.13 2.25 3.01 3.98 3.15 3.32 4.42 7.39 3.64 6.13 0.0 7.37 5.65 22.54 0.74 3.25 3.45 9.25 2.04 4.03 2.94 2.89 3.47 2.27 2.3 4.87 6.16 3.2 6.6 2.36 4.37 4.88 2.99 5.23 2.99 2.81 1.82 1.16 2.6 7.92 7.36 2.89 2.36 1.56 1.45 2.05 3.09 1.63 2.75 2.85 6.72 2.01 3.54 2.21 1.27 6.16 4.6 2.08 2.1 3.45 2.51 3.11 3.42 1.4 0.73 0.97 2.08 2.08 0.53 2.27 3.1 2.56 2.47 2.73 2.05 1.06 2.59 2.13 2.72 3.46 0.85
AGT22713 (N559_0925)
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AGT22818 (N559_1037)
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AGT22849 (N559_1074)
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AGT22855 (N559_1081)
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AGT22857 (N559_1083)
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AGT22859 (N559_1085)
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AGT22860 (N559_1086)
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AGT22861 (N559_1087)
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AGT22862 (N559_1088)
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AGT22932 (N559_1163)
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AGT23022 (N559_1258)
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AGT23023 (N559_1259)
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AGT23025 (N559_1261)
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AGT23027 (N559_1263)
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AGT23143 (N559_1381)
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AGT23144 (N559_1382)
 2.41 2.72 2.91 5.67 5.05 3.91 6.55 1.1 0.56 2.73 2.91 2.58 1.86 4.34 11.93 2.88 8.1 0.29 9.09 8.38 23.25 1.52 2.76 3.05 8.78 1.98 3.94 4.98 3.96 4.5 2.69 3.78 4.09 6.76 3.33 5.48 3.15 4.85 3.83 4.68 5.89 3.34 2.48 1.62 1.97 3.56 7.72 7.29 3.96 3.28 1.35 1.38 1.22 2.56 1.62 2.58 1.97 7.51 1.54 2.57 1.45 1.8 6.76 5.33 3.72 4.6 3.05 2.22 4.03 4.0 2.8 0.56 0.85 2.25 2.38 0.16 2.47 2.67 3.21 2.57 3.13 0.88 2.32 0.73 1.94 2.23 0.63 2.47
AGT23464 (DppB)
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AGT23725 (N559_1999)
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AGT23726 (N559_2000)
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AGT23727 (ImpK)
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AGT23729 (N559_2003)
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AGT23749 (N559_2027)
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AGT23750 (N559_2028)
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AGT23776 (N559_2055)
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AGT23777 (NasE)
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AGT23778 (N559_2057)
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AGT23881 (N559_2167)
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AGT23885 (N559_2173)
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AGT23895 (N559_2183)
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AGT23932 (N559_2220)
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AGT24100 (N559_2404)
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AGT24114 (N559_2418)
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AGT24144 (N559_2451)
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AGT24311 (N559_2635)
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AGT24312 (N559_2636)
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AGT24343 (N559_2667)
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AGT24577 (N559_2912)
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AGT24580 (N559_2915)
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AGT24799 (N559_3138)
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AGT24974 (N559_3316)
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AGT24975 (N559_3317)
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AGT24994 (N559_3338)
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AGT25070 (N559_3418)
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AGT25115 (LacY)
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AGT25129 (N559_3478)
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AGT25157 (N559_3509)
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AGT25235 (N559_3588)
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AGT25287 (HlyB)
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AGT25288 (N559_3646)
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AGT25318 (N559_3676)
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AGT25386 (N559_3750)
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AGT25387 (N559_3751)
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AGT25388 (N559_3752)
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AGT25390 (N559_3754)
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AGT25391 (N559_3755)
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AGT25394 (N559_3758)
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AGT25490 (N559_3854)
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AGT25491 (N559_3855)
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AGT25492 (N559_3856)
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AGT25493 (N559_3857)
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AGT25556 (N559_3920)
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AGT25609 (N559_3978)
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AGT25655 (N559_4026)
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AGT25723 (N559_4097)
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AGT25737 (N559_4111)
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AGT25745 (N559_4119)
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AGT25746 (N559_4120)
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AGT25747 (N559_4121)
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AGT25751 (N559_4125)
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AGT25752 (N559_4126)
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AGT25753 (PhnE)
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AGT25754 (PhnE)
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AGT25813 (N559_4188)
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AGT25822 (N559_4197)
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AGT25928 (N559_4313)
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AGT25933 (N559_4320)
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AGT25965 (N559_4355)
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AGT25967 (N559_4357)
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AGT25979 (N559_4369)
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AGT25980 (N559_4370)
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AGT26001 (N559_4391)
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AGT26079 (N559_4474)
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AGT26102 (N559_4497)
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AGT26103 (N559_4498)
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AGT26147 (N559_4544)
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AGT26148 (N559_4545)
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AGT26161 (CusC)
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AGT26162 (N559_4561)
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AGT26163 (CusB)
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AGT26164 (N559_4563)
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AGT26177 (N559_4578)
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AGT26178 (N559_4579)
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AGT26203 (N559_4607)
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AGT26204 (N559_4608)
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AGT26206 (N559_4610)
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AGT26227 (N559_4633)
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AGT26229 (N559_4635)
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AGT26230 (N559_4636)
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AGT26340 (N559_4749)
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AGT26343 (N559_4752)
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AGT26345 (N559_4754)
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AGT26346 (N559_4755)
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AGT26365 (PgaA)
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AGT26366 (N559_4775)
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AGT26367 (N559_4776)
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AGT26386 (N559_4795)
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AGT26387 (N559_4796)
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AGT26388 (N559_4797)
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AGT26389 (N559_4798)
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AGT26390 (N559_4800)
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AGT26395 (N559_4805)
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AGT26396 (N559_4806)
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AGT26403 (N559_4817)
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AGT26407 (N559_4821)
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AGT26408 (N559_4822)
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AGT26409 (N559_4823)
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AGT26410 (N559_4824)
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AGT26423 (N559_4839)
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AGT26424 (N559_4840)
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AGT26425 (N559_4841)
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AGT26426 (N559_4842)
 0.49 0.5 1.23 2.02 2.28 0.57 1.99 2.28 0.15 0.44 0.37 3.25 2.6 0.9 6.13 0.61 2.06 0.0 3.07 3.26 10.91 0.26 0.94 0.92 2.73 1.05 1.65 1.29 1.49 1.8 1.3 1.54 1.73 2.27 3.37 2.45 1.04 1.87 2.02 1.93 2.7 1.43 1.42 1.04 0.27 1.31 2.52 2.55 1.49 1.8 0.79 0.43 0.7 2.95 0.82 1.27 1.53 3.48 0.78 1.21 1.21 0.92 2.27 2.22 1.02 1.04 0.92 1.17 1.52 1.38 0.1 0.14 0.0 0.36 0.63 0.0 0.61 0.47 0.34 0.5 0.75 0.0 0.21 0.27 0.3 0.46 0.33 0.39
AGT26428 (N559_4844)
 1.82 1.93 2.27 8.24 5.57 5.0 6.69 1.2 0.44 1.92 2.32 0.96 1.4 6.58 7.61 5.96 8.07 0.0 6.77 6.11 18.99 1.81 1.86 2.34 6.25 1.86 2.98 1.36 1.9 2.9 2.41 2.02 2.86 6.61 3.0 4.74 2.22 2.95 4.73 3.37 4.99 2.48 1.76 1.25 1.82 6.38 5.56 4.61 1.9 2.04 1.26 1.45 1.63 3.25 1.39 1.82 1.54 7.19 1.42 2.13 0.97 1.72 6.61 3.09 2.79 2.75 2.34 2.43 2.64 2.15 1.3 0.43 0.53 2.14 1.85 0.54 2.5 2.3 0.88 2.24 1.9 0.47 1.58 0.92 2.17 2.05 0.57 1.91
AGT26429 (N559_4845)
 4.51 2.73 3.68 2.56 1.73 8.57 0.0 1.95 0.0 3.49 0.34 3.59 2.44 15.22 7.18 1.16 17.24 0.0 0.0 0.0 27.49 0.56 2.11 2.49 6.06 4.15 4.62 2.55 1.27 2.5 3.96 3.71 3.23 6.2 6.61 0.0 1.49 0.7 4.7 0.0 1.88 2.36 2.54 1.74 0.0 8.62 4.85 5.96 1.27 2.82 5.47 0.0 1.42 13.65 5.07 1.74 0.0 9.68 0.84 2.33 3.94 1.34 6.2 0.0 0.0 0.36 2.49 2.4 2.0 7.29 0.65 1.62 0.0 2.75 2.88 0.0 0.0 2.02 0.0 1.89 1.82 0.0 1.76 2.12 0.65 2.13 0.0 0.0
AGT26431 (N559_4847)
 3.07 4.26 4.02 10.26 5.22 4.83 17.41 4.49 1.78 2.61 3.7 4.79 8.23 5.27 10.81 5.22 7.33 0.0 0.0 0.0 20.13 2.33 4.8 3.97 10.9 3.4 5.36 4.98 4.88 7.98 4.71 4.9 4.95 9.16 3.63 9.1 3.98 5.69 5.88 4.1 10.04 4.71 3.99 2.12 2.44 5.56 9.83 8.47 4.88 4.56 2.14 2.71 2.42 7.28 2.31 3.95 6.59 9.72 3.04 5.19 5.06 3.92 9.16 7.0 3.75 6.12 3.97 3.39 8.82 6.51 2.79 1.05 0.48 2.53 2.65 1.39 3.51 4.17 2.02 3.7 4.51 2.65 2.91 4.08 3.64 3.92 2.04 3.06
AGT26433 (FepA)
 5.01 7.52 4.07 6.98 5.27 6.31 5.3 1.82 1.07 4.86 8.85 2.98 2.2 6.75 23.41 6.46 10.82 0.0 6.49 6.18 23.27 0.86 3.98 4.65 16.42 3.14 6.68 2.65 3.94 6.87 3.94 4.0 6.38 9.85 4.44 6.51 3.63 5.64 6.97 5.89 8.79 3.94 2.15 2.09 10.27 7.9 13.88 13.17 3.94 3.64 6.28 6.79 2.61 4.94 2.77 3.11 4.79 11.59 3.72 4.14 2.66 3.6 9.85 5.48 4.61 3.96 4.65 4.2 5.73 6.04 7.64 0.3 0.32 4.57 8.41 0.64 5.12 7.68 1.89 6.66 6.52 1.11 11.59 1.45 4.35 6.23 0.75 12.82
AGT26435 (N559_4851)
 1.94 2.14 15.01 17.38 4.37 5.47 22.51 2.23 0.97 1.78 2.53 9.39 3.68 6.24 15.64 7.36 5.46 1.17 8.46 5.41 28.13 2.77 6.81 3.94 12.51 5.21 7.24 5.14 5.37 6.51 4.02 5.19 6.36 11.95 4.91 10.57 4.71 5.95 11.22 5.63 12.2 5.86 3.88 2.02 3.15 4.0 10.83 11.83 5.37 4.83 3.42 3.39 3.25 9.88 3.88 4.71 16.72 17.33 3.7 4.86 4.73 4.46 11.95 16.14 5.36 7.62 3.94 3.36 5.84 7.23 2.86 1.37 0.16 1.55 1.55 0.73 2.96 2.44 1.01 1.87 2.36 0.38 3.47 2.06 2.39 2.23 1.12 3.1
AGT26478 (N559_4894)
 1.65 1.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.77 1.21 1.39 1.58 0.07 2.23 0.58 6.75 0.0 3.58 0.0 4.35 4.46 12.6 1.86 2.74 2.44 4.5 0.03 2.53 0.0 0.0 2.76 3.04 1.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 3.65 1.37 2.67 3.21 0.32 1.88 3.6 3.21 0.0 0.0 1.62 2.16 0.0 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 2.44 2.25 2.2 2.64 0.89 0.55 0.49 1.28 1.43 0.5 1.01 1.43 1.84 1.55 2.03 0.86 0.62 1.81 1.26 1.2 1.8 0.5
AGT26479 (N559_4895)
 1.07 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 1.76 1.16 0.98 0.0 0.79 0.59 4.08 0.0 2.15 0.0 4.5 2.6 12.43 1.1 1.83 1.3 5.32 0.0 1.72 0.0 0.0 2.14 1.19 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.31 0.71 1.33 1.23 0.46 2.01 4.25 3.7 0.0 0.0 1.04 1.76 0.0 2.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 1.3 1.17 1.71 1.64 0.33 1.06 0.71 0.74 0.63 0.0 1.09 0.89 0.0 0.97 1.08 1.49 0.59 1.4 1.34 1.4 2.6 0.51
AGT26481 (N559_4897)
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AGT26482 (N559_4898)
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AGT26597 (N559_5020)
 2.75 2.56 70.31 15.04 3.42 8.77 18.05 1.26 1.85 2.35 2.0 8.68 2.84 9.18 14.35 9.97 12.57 0.29 16.46 9.47 22.92 2.11 3.61 2.89 7.48 2.59 3.7 1.98 2.46 5.12 3.11 3.01 10.72 7.65 3.5 12.83 2.64 8.06 5.66 3.78 10.79 3.54 2.97 2.45 1.37 9.66 6.65 5.64 2.46 3.16 1.79 1.45 2.61 5.33 2.38 2.81 4.32 8.07 3.32 6.42 1.76 2.96 7.65 6.03 2.56 2.89 2.89 2.59 5.39 5.67 1.38 1.3 0.73 2.17 1.94 2.37 2.33 2.57 2.52 3.02 2.95 1.65 1.84 2.7 2.24 1.99 1.58 1.01
AGT26620 (N559_5043)
 0.88 0.62 8.45 8.61 5.95 3.57 7.18 3.13 0.54 0.98 0.8 5.71 2.07 13.82 7.83 12.3 17.84 0.0 3.98 4.42 40.42 3.06 2.65 3.2 5.52 3.08 3.94 3.42 2.88 4.15 2.78 3.23 7.63 16.02 4.48 3.24 4.96 6.5 8.5 5.65 5.24 4.42 2.16 3.85 1.09 4.39 5.11 4.9 2.88 3.13 1.99 1.39 1.71 3.64 2.61 3.83 2.58 18.97 2.26 4.44 1.57 3.24 16.02 5.16 6.14 5.17 3.2 3.5 4.61 3.95 0.76 0.66 0.38 0.73 0.68 1.64 0.95 1.09 0.61 0.68 0.84 1.15 0.91 1.4 0.68 1.18 2.2 1.11
AGT26660 (N559_5083)
 2.54 1.51 7.21 5.89 0.65 0.67 9.48 0.42 5.17 0.75 1.89 0.57 2.06 10.37 14.59 22.72 33.24 1.13 10.29 7.38 34.74 0.0 4.07 6.68 5.35 0.0 4.0 4.3 0.57 3.88 3.35 5.81 0.0 0.0 0.0 2.29 0.69 6.49 12.6 0.0 2.35 3.64 0.0 2.54 0.0 8.37 4.28 4.84 0.57 4.04 2.31 1.35 0.0 4.7 0.0 0.21 4.12 35.38 2.51 5.04 5.17 3.53 0.0 6.41 0.0 0.0 6.68 6.41 3.11 4.06 0.0 1.57 0.0 0.64 1.38 4.26 2.7 1.37 3.92 2.44 1.84 2.93 1.92 3.08 2.46 3.81 3.83 1.47

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)