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Heatmap: Cluster_42 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
strain_5001420,control,fromUrine
strain_5001420,fromUrine
ch1034,13h_old_biofilm,biofilm_dispersed
ch1034,13h_old_biofilm,sessile
ch1034,7h_old_biofilm,sessile
ch1034,Log,planktonic
ch1034,Stationary,planktonic
control,fromNasalSwab,fromSwine
dmc1097
dmc1097,control,fromBlood
dmc1097,fromBlood
ekp16,fromSputum
eugenol,fromNasalSwab,fromSwine
fromBlood
fromHospitalPatients
fromRectalSwab
fromUrine
je01
k26,mero_susceptible,fromHospitalPatients
k56,mero_resistant,fromHospitalPatients
kctc2242
kp4,FeLimited,fromRespiratoryTract
kpr1,+CTX
kpr1,+gent
kpr1,+mero
kpr1,+TMP/SMX
kpr1,control
kpr2,+CTX
kpr2,+gent
kpr2,+mero
kpr2,+TMP/SMX
kpr2,control
kps1,+CTX
kps1,+gent
kps1,+mero
kps1,+TMP/SMX
kps1,control
kps2,+CTX
kps2,+gent
kps2,+mero
kps2,+TMP/SMX
kps2,control
mrsn 1319
ms6671
njst258-1,FeLimited,fromUrine
njst258-1,fromUrine
rb011,+mero,mero_resistant
rb011,control,mero_resistant
rb012,+gent,gent_resistant
rb012,control,gent_resistant
rb013,+cip,cip_resistant
rb013,control,cip_resistant
rb039,+cip,cip_resistant
rb039,+mero,mero_susceptible
rb039,control,cip_resistant
rb039,control,mero_susceptible
rb040,+cip,cip_susceptible
rb040,+gent,gent_susceptible
rb040,control,cip_susceptible
rb040,control,gent_susceptible
rb041,+cip,cip_susceptible
rb041,control,cip_susceptible
rb121,+gent,gent_susceptible
rb121,+mero,mero_susceptible
rb121,control,gent_susceptible
rb121,control,mero_susceptible
rb122,+gent,gent_resistant
rb122,control,gent_resistant
rb257,+mero,mero_resistant
rb257,control,mero_resistant
uhkpc05,FeLimited,fromBlood
uhkpc05,fromBlood
uhkpc07
uhkpc07,control,fromUrine
uhkpc07,fromUrine
uhkpc18
uhkpc18,control,fromUrine
uhkpc18,fromUrine
uhkpc33
uhkpc33,control,fromUrine
uhkpc33,fromUrine
uhkpc48
uhkpc48,FeLimited,fromUrine
uhkpc67
uhkpc67,control,fromBlood
uhkpc67,fromBlood
vakpc297
vakpc297,FeLimited,fromUrine
AGT21857 (N559_0024)
 0.03 0.39 -0.2 0.89 1.31 -0.29 -0.36 -0.44 -2.37 0.07 0.19 -1.61 -0.36 0.47 -0.13 -0.29 0.67 -2.48 0.51 0.35 -0.1 -0.49 -0.45 -0.3 1.42 -0.39 0.24 -0.35 -0.1 0.49 -0.28 -0.16 -0.02 -0.09 -0.15 0.75 0.02 -0.21 0.09 0.17 1.18 -0.13 0.37 0.47 0.25 0.11 1.25 1.16 -0.1 -0.01 -0.68 -0.65 -0.61 0.1 -0.77 -0.01 -1.49 0.27 -0.64 0.05 -1.3 -0.48 -0.09 0.15 0.39 -0.13 -0.3 -0.37 0.32 -0.03 0.22 -2.46 -3.37 0.03 -0.01 -3.6 0.32 0.62 -1.65 -0.19 0.35 -1.63 0.11 -1.45 0.06 0.46 -1.47 -0.28
AGT21919 (N559_0093)
 0.22 0.6 -1.26 0.17 -0.42 -2.54 -0.55 -0.42 -1.13 0.2 0.5 -1.61 -0.13 -0.79 0.25 -0.56 -0.11 -4.32 0.3 0.56 0.3 -1.15 -0.08 -0.12 0.21 -0.47 -0.08 0.13 0.09 0.69 -0.29 -0.06 0.21 0.47 0.34 0.11 -0.37 0.3 0.27 0.08 0.76 -0.06 -0.5 -0.46 -0.22 -0.45 0.36 0.18 0.09 -0.01 -0.5 -0.41 -0.19 0.71 -0.38 -0.45 0.56 0.61 -0.53 0.2 -0.33 -0.24 0.47 0.58 -0.12 -0.17 -0.12 -0.03 0.52 0.34 -0.41 -1.01 -2.45 0.62 0.96 -3.35 0.45 1.08 -5.59 0.32 0.99 -2.25 -0.25 0.01 0.44 0.77 -0.21 -0.24
AGT21946 (N559_0120)
 0.51 0.63 -1.39 -0.12 -0.53 -2.52 1.27 -0.53 -3.19 0.5 0.8 -0.98 -0.13 -1.16 1.08 -0.82 -1.09 -5.68 1.38 0.78 1.15 0.32 0.29 -0.07 0.69 -0.36 -0.08 -0.03 -0.48 -0.29 -0.68 -0.51 -0.6 0.2 0.05 0.51 -0.7 0.29 0.11 -0.77 1.16 -0.43 0.25 -1.44 -0.1 -1.44 0.64 0.24 -0.48 -0.27 -1.66 -1.45 -0.31 1.22 -0.21 -0.38 0.72 0.77 -0.91 -0.33 -0.38 -0.5 0.2 1.12 -0.52 0.4 -0.07 -0.55 0.14 -0.21 0.26 -3.59 -3.92 0.39 0.5 -5.05 0.68 0.86 -3.59 0.58 0.84 -3.59 -0.02 -2.52 0.44 0.59 -3.79 -0.26
AGT21965 (N559_0140)
 0.08 0.13 2.15 0.24 -0.1 -0.61 0.83 -1.55 -3.14 -0.16 0.28 0.55 -0.98 -0.44 2.2 -1.51 -0.07 -5.0 0.49 0.64 1.48 0.14 -0.36 -0.2 0.01 -0.62 -0.24 -0.34 -0.12 -0.49 -0.71 -0.43 -0.29 0.4 -0.24 -0.35 -0.81 0.29 0.34 -0.65 -0.02 -0.64 1.49 -1.71 0.55 -0.27 -0.02 0.19 -0.12 -0.08 -0.78 -1.29 -0.89 0.48 -0.67 -0.61 0.43 0.97 -0.81 -0.15 -0.81 -0.6 0.4 0.55 -0.82 -0.7 -0.2 -0.32 -0.36 -0.74 0.38 -3.08 -2.86 0.04 0.05 -2.41 0.41 0.57 -0.76 -0.11 0.2 -5.18 0.6 -1.52 0.24 0.53 -1.79 0.1
AGT22103 (N559_0281)
 0.28 0.28 -1.02 -0.36 -0.99 -1.35 0.67 -0.28 -2.56 -0.31 -0.29 -1.32 0.17 -0.21 0.06 0.0 0.2 -4.13 1.69 1.46 -0.31 -0.55 0.47 0.23 0.24 -0.22 0.1 0.35 0.22 1.0 -0.16 0.29 -0.07 0.3 -0.21 0.74 -0.24 0.32 -0.03 -0.38 0.69 0.22 0.43 -0.05 -0.64 -0.43 0.39 0.44 0.22 0.24 -0.39 -0.42 -0.32 0.23 -0.32 -0.02 0.11 0.43 0.17 0.65 0.08 0.12 0.3 0.34 -0.08 0.35 0.23 0.03 1.03 0.89 -0.81 -2.98 -4.21 -0.6 -0.5 -4.18 0.11 -0.01 -2.71 0.09 0.41 -2.91 -0.64 -2.22 -0.1 -0.16 -1.97 -0.69
AGT22105 (N559_0283)
 0.02 0.23 -0.4 0.23 0.37 0.39 1.55 -0.78 -2.18 0.4 0.59 -1.05 0.64 0.12 0.6 0.59 0.8 -3.51 -0.34 -0.05 2.37 -1.39 0.35 0.39 0.66 -1.04 0.11 0.05 -0.1 -0.42 -0.92 -0.21 -0.24 0.24 -0.18 -0.09 -0.68 0.15 0.17 -0.25 0.47 -0.23 0.2 -1.24 -0.83 -0.38 0.56 0.46 -0.1 -0.17 -1.18 -1.3 -0.81 0.6 -0.39 -0.86 -0.86 0.49 -0.7 0.14 -0.86 -0.81 0.24 0.35 -0.15 -0.28 0.39 0.15 0.13 0.37 -1.39 -2.67 -1.91 0.59 0.42 -1.57 0.41 0.42 -0.49 0.32 0.11 -0.77 -1.02 -0.69 0.07 -0.17 -1.96 -0.61
AGT22106 (N559_0284)
 0.61 0.55 -1.54 0.1 -0.34 -2.2 0.63 -0.68 -3.66 0.63 0.93 -0.46 0.71 -1.7 0.28 -1.03 -1.89 -5.01 0.65 0.51 1.73 -0.24 0.11 -0.09 1.08 -0.65 0.08 -0.06 -0.24 0.57 -0.38 -0.35 -0.15 -0.22 -0.11 0.4 -0.55 0.08 -0.2 -0.01 0.49 -0.2 -0.46 -2.21 0.25 -2.96 1.04 0.94 -0.24 -0.32 -0.77 -1.0 -1.27 0.44 -1.07 -0.65 -0.49 0.15 -0.6 0.28 -1.0 -0.75 -0.22 0.94 -0.05 0.2 -0.09 -0.31 0.38 0.69 0.77 -3.31 - 0.38 0.68 -5.26 0.77 0.65 - 0.88 0.96 -4.21 0.37 -1.87 0.84 0.65 -3.24 0.52
AGT22107 (N559_0285)
 0.93 0.88 -0.76 0.7 0.29 0.08 1.34 -0.53 -2.08 0.78 0.98 -1.7 1.01 -0.71 0.35 -0.16 -0.43 -2.56 1.64 1.21 2.0 -0.24 -0.38 -1.1 0.56 -1.1 -0.51 -0.9 -1.34 0.24 -1.3 -0.86 -0.99 -1.14 -0.27 0.16 -1.15 -0.82 -1.29 -0.46 0.4 -0.86 -0.19 -1.03 0.42 -1.13 0.45 0.23 -1.34 -1.31 -1.69 -1.61 -1.38 0.02 -1.62 -1.05 -1.34 -0.94 -1.77 -0.84 -0.96 -1.19 -1.14 0.43 -0.89 -0.12 -1.1 -1.47 0.24 0.28 1.01 -2.14 -3.52 0.4 0.66 -1.32 1.25 0.9 -1.25 1.11 1.37 -1.24 0.6 -0.22 1.08 0.8 -0.91 0.73
AGT22139 (N559_0320)
 -0.51 -0.57 -1.51 0.01 -0.83 -2.58 -0.13 -0.17 -2.07 -1.02 -0.72 -0.61 0.03 -0.13 0.74 0.29 -0.16 -3.16 1.12 0.85 -0.27 -0.08 0.33 0.12 0.14 0.32 0.12 0.45 0.14 1.34 0.38 0.55 -0.26 -0.48 0.03 -0.23 0.11 0.44 -0.11 0.32 0.5 0.32 0.28 0.28 0.9 -0.18 0.18 0.3 0.14 0.17 -0.41 -0.42 -0.54 0.22 -0.59 0.27 0.49 0.08 -0.42 0.13 0.73 -0.1 -0.48 0.64 0.12 0.81 0.12 -0.06 1.28 1.31 0.27 -2.03 -2.31 -1.06 -1.11 -2.89 -0.66 -0.46 -2.02 -0.72 -0.45 -1.35 0.02 -1.57 -0.85 -1.19 -0.6 0.9
AGT22144 (FtsE)
 0.53 0.67 0.18 0.1 0.29 -0.76 -0.12 0.06 -1.95 0.59 0.47 0.24 0.26 -0.99 0.27 -0.68 -1.15 -4.49 0.37 0.5 0.37 0.01 -0.18 -0.08 -0.13 -0.77 -0.29 -0.03 0.1 -0.2 -0.55 -0.2 -0.26 0.44 -0.03 -0.15 -0.52 0.22 0.73 -0.37 -0.01 -0.48 -0.28 0.44 0.36 -1.39 -0.02 -0.22 0.1 0.18 -0.66 -0.51 -0.57 0.47 -0.58 -0.61 0.65 0.9 -0.65 -0.02 0.2 -0.62 0.44 0.05 -0.22 -0.82 -0.08 -0.1 -0.21 -0.55 0.73 -1.54 -1.14 0.82 0.86 -0.95 0.6 0.67 -1.1 0.52 0.82 -1.52 0.16 -1.06 0.76 0.8 -1.82 0.26
AGT22193 (N559_0380)
 0.12 0.21 -0.61 0.26 -0.04 -1.39 0.55 -0.62 -1.26 -0.2 -0.08 -0.89 1.42 0.71 0.51 0.73 1.0 -4.27 0.8 0.65 0.31 -1.14 -0.07 -0.0 0.17 -0.65 -0.22 0.12 -0.08 0.27 -0.4 -0.1 -0.4 -0.0 0.34 -0.59 -0.55 0.29 0.65 0.02 -0.25 -0.36 -0.23 -1.07 -0.57 0.98 0.2 -0.06 -0.08 0.1 -0.46 -0.4 -0.44 0.4 -0.49 -0.59 -0.22 0.86 -0.51 0.07 -0.81 -0.41 -0.0 0.16 -0.35 -0.35 -0.0 -0.2 0.24 0.13 -0.33 -0.9 -0.22 0.19 0.27 -0.29 0.2 0.26 -0.03 0.2 0.18 -0.08 -0.51 0.19 -0.07 -0.1 -0.22 -0.35
AGT22216 (N559_0403)
 0.41 0.46 0.58 1.57 2.17 0.28 1.76 -0.51 -3.08 0.34 0.43 -1.7 0.8 -0.46 0.61 -0.08 -0.05 -1.91 0.75 1.2 1.49 -0.68 -0.16 -0.08 0.27 -1.15 -0.38 -0.65 -0.62 -0.26 -0.29 -0.69 -0.5 -0.19 -0.32 -0.72 -0.51 -0.79 0.22 0.01 -0.37 -0.65 -0.04 -0.08 0.42 -0.39 0.28 0.15 -0.62 -0.99 -1.12 -1.18 -0.63 0.39 -0.67 -1.22 -1.19 0.31 -0.71 -0.06 -1.49 -1.37 -0.19 0.1 0.07 -0.8 -0.08 -0.31 -0.32 -0.66 0.18 -2.67 -3.8 0.14 -0.25 -1.77 0.86 0.77 -0.92 0.19 0.35 -1.18 0.05 -0.59 0.38 0.38 -2.01 0.58
AGT22276 (N559_0468)
 0.49 0.52 -0.44 0.92 0.2 0.11 0.53 -1.11 -2.14 0.76 0.61 -1.39 0.21 -0.27 -0.62 0.48 -0.43 -1.39 -0.35 -0.67 1.24 -0.31 -0.11 0.0 0.65 -0.17 0.06 -0.09 -0.01 -0.17 -0.24 -0.15 -0.16 -0.02 -0.01 0.6 -0.14 0.21 -0.05 -0.11 0.64 -0.09 -0.61 -1.78 -0.31 -0.61 0.55 0.4 -0.01 0.02 -1.18 -1.06 -1.33 0.31 -1.12 -0.43 -0.17 0.37 -1.11 -0.05 -0.56 -0.74 -0.02 0.22 0.11 -0.22 0.0 -0.07 -0.32 -0.43 0.05 -1.65 -0.94 0.83 0.52 -1.03 0.97 0.82 -0.09 0.45 0.6 -0.71 -0.37 0.12 0.95 0.91 -1.65 -0.31
AGT22331 (N559_0529)
 -0.12 0.33 -0.18 0.24 0.11 -0.98 0.33 -0.13 -1.42 -0.36 0.33 -0.08 0.39 -0.43 -0.07 -0.23 0.39 -3.74 0.09 0.05 -0.03 0.15 -0.0 0.1 0.73 -0.27 0.07 0.61 0.5 0.35 -0.1 0.18 0.08 -0.48 0.11 0.34 -0.16 0.18 -0.4 -0.25 0.42 -0.01 -0.48 -0.31 0.44 -0.46 0.73 0.54 0.5 0.54 -0.32 -0.3 -0.09 0.56 -0.09 -0.23 0.43 -0.23 -0.19 0.2 -0.09 -0.09 -0.48 0.18 0.16 -0.06 0.1 -0.01 0.41 0.12 0.74 -1.45 -3.67 0.06 0.48 -2.97 -0.2 0.35 -1.49 0.14 0.41 -2.88 0.38 -0.42 -0.32 0.13 -1.14 0.22
AGT22523 (N559_0730)
 0.17 0.35 -1.09 -0.5 -0.9 -2.83 -0.38 0.17 -0.63 0.07 0.34 -1.84 0.22 -1.04 1.49 -1.42 -0.26 -5.79 0.65 1.25 -0.97 -1.17 -0.21 -0.44 0.5 -1.1 -0.2 0.26 -0.02 0.76 -0.6 -0.09 -0.34 0.64 0.12 -0.43 -0.71 0.28 1.88 -0.1 -1.22 -0.37 0.34 -0.55 -0.84 -0.25 0.58 0.35 -0.02 -0.06 -0.59 -0.62 -1.0 0.61 -1.12 -0.75 -0.4 1.67 -0.02 0.26 -0.72 -0.38 0.64 0.43 -0.69 -0.32 -0.44 -0.52 0.74 0.16 -0.42 -0.05 -0.1 -0.36 0.09 -0.71 0.47 0.7 -0.39 0.07 0.36 -0.75 -0.6 0.09 0.18 0.24 0.62 -1.09
AGT22535 (N559_0742)
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AGT22560 (N559_0769)
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AGT22627 (N559_0837)
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AGT22672 (MscS)
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AGT22721 (N559_0933)
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AGT22918 (N559_1149)
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AGT22931 (N559_1162)
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AGT22995 (N559_1231)
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AGT23024 (N559_1260)
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AGT23136 (N559_1374)
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AGT23151 (N559_1391)
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AGT23181 (N559_1423)
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AGT23208 (N559_1453)
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AGT23248 (N559_1495)
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AGT23259 (N559_1506)
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AGT23339 (N559_1588)
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AGT23373 (N559_1627)
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AGT23442 (N559_1700)
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AGT23469 (BaeR)
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AGT23470 (BaeS)
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AGT23471 (MdtE)
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AGT23472 (MdtC)
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AGT23473 (MdtB)
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AGT23474 (MdtA)
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AGT23527 (N559_1791)
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AGT23528 (YeeA)
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AGT23549 (N559_1815)
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AGT23647 (N559_1914)
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AGT23693 (N559_1961)
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AGT23769 (N559_2048)
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AGT23771 (N559_2050)
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AGT23793 (RpoS)
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AGT23833 (N559_2115)
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AGT23834 (N559_2116)
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AGT23835 (N559_2117)
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AGT23858 (N559_2142)
 1.01 1.28 -0.48 0.48 0.89 -0.28 0.78 -0.31 -2.72 1.07 1.23 -1.22 0.93 -1.04 0.78 -1.29 -1.05 - 0.7 0.8 1.18 0.57 -8.6 -6.68 0.45 - -1.6 -0.45 -0.14 0.07 - -0.76 -0.21 0.93 - -0.68 -1.18 -0.51 0.74 -0.3 - -0.9 0.04 - 0.78 -1.92 0.56 0.51 -0.14 -0.47 -0.66 -0.52 - - - - -0.59 0.82 -0.38 -0.2 -1.7 -0.92 0.93 -0.32 -0.49 -0.61 -6.68 - -0.25 -0.26 0.76 -4.02 - 1.4 1.42 -5.16 1.37 1.51 - 1.19 1.38 - 1.02 -4.31 1.35 1.56 -3.51 0.95
AGT23868 (N559_2154)
 1.76 1.58 -1.67 -0.55 -0.31 0.4 0.15 -3.32 -5.91 1.56 1.57 0.03 -3.05 -0.37 -1.89 -0.22 -0.86 0.52 -0.8 -0.85 -2.4 0.71 -0.09 -0.65 -0.2 -0.01 -0.2 0.22 -0.72 -0.1 -0.05 -0.22 -1.16 -2.78 -0.8 -0.12 -0.12 -0.54 -2.27 -0.78 0.07 -0.47 -0.55 0.41 0.86 -0.75 -0.42 -0.25 -0.72 -0.71 -0.82 -0.67 -0.47 -0.97 -0.48 -0.23 -1.36 -2.37 -0.66 -0.87 -0.34 -0.38 -2.78 -0.74 -0.41 -0.3 -0.65 -0.6 -0.09 -0.05 0.86 -6.08 -7.29 1.66 1.59 -8.24 1.57 1.26 -7.42 1.74 1.3 -7.85 0.68 -5.4 1.65 1.41 -6.35 0.68
AGT23910 (N559_2198)
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AGT24014 (N559_2313)
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AGT24015 (N559_2314)
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AGT24033 (N559_2332)
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AGT24044 (N559_2343)
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AGT24059 (N559_2360)
 0.31 0.54 -0.34 -0.18 -0.08 -1.16 0.39 -0.6 -2.58 0.4 0.54 -0.78 -0.13 -0.82 1.18 -0.82 -1.0 -5.68 0.91 0.84 0.46 0.32 -0.02 0.1 0.41 -0.61 -0.15 0.3 0.27 -0.03 -0.47 -0.05 -0.2 0.41 -0.45 -0.76 -0.57 0.14 0.2 -0.45 -0.12 -0.27 -0.01 -1.09 0.86 -1.3 0.29 0.16 0.27 0.28 -0.47 -0.62 -0.44 -0.12 -0.46 -0.55 -0.06 0.72 -0.3 0.16 -0.51 -0.39 0.41 -0.23 -0.4 -0.28 0.1 -0.05 -0.03 -0.15 0.83 -1.91 -0.89 0.4 0.56 -1.39 0.45 0.66 -0.09 0.47 0.65 -0.95 0.75 -1.37 0.32 0.54 -1.77 0.94
AGT24068 (N559_2369)
 -1.03 -0.94 -1.41 1.02 -1.82 -2.73 2.15 -1.36 -1.78 -0.92 -0.74 0.6 -0.63 -0.77 1.93 -0.6 -0.17 -6.37 1.64 1.59 0.73 -2.44 0.39 -0.02 1.17 -0.64 0.24 0.44 -0.51 0.18 -0.29 -0.11 -0.71 -0.76 -1.18 1.42 -0.54 -0.2 -1.44 -1.6 0.65 -0.24 0.28 -0.64 -1.74 -0.48 0.94 0.94 -0.51 -0.55 -1.5 -1.34 -1.61 1.1 -1.52 -0.63 0.3 -0.54 -0.9 -0.12 1.85 -0.53 -0.76 2.26 -0.33 1.07 -0.02 -0.26 0.66 0.77 -1.47 -0.83 -4.13 -1.09 -1.17 -2.31 -0.73 -0.62 -1.0 -0.94 -0.86 -2.9 -1.95 0.01 -1.04 -0.86 -0.78 -2.28
AGT24077 (N559_2378)
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AGT24153 (N559_2461)
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AGT24235 (N559_2553)
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AGT24266 (N559_2588)
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AGT24306 (N559_2630)
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AGT24354 (N559_2678)
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AGT24367 (MarC)
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AGT24382 (FtrA)
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AGT24441 (N559_2768)
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AGT24442 (N559_2769)
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AGT24484 (N559_2811)
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AGT24502 (N559_2831)
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AGT24517 (N559_2846)
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AGT24536 (N559_2867)
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AGT24537 (N559_2868)
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AGT24552 (N559_2883)
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AGT24571 (N559_2904)
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AGT24574 (N559_2909)
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AGT24692 (N559_3029)
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AGT24699 (FepA)
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AGT24702 (N559_3039)
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AGT24810 (N559_3150)
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AGT24914 (N559_3256)
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AGT24942 (N559_3284)
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AGT24948 (N559_3290)
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AGT24949 (N559_3291)
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AGT24951 (N559_3293)
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AGT24972 (N559_3314)
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AGT24985 (N559_3329)
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AGT25030 (N559_3377)
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AGT25108 (DeoR)
 0.16 0.39 0.78 0.73 0.75 0.14 0.88 0.16 -1.47 -0.02 0.49 -0.67 0.57 -0.39 0.95 -0.73 0.2 -3.81 0.26 0.4 0.08 0.09 -0.69 -0.44 0.84 -1.05 -0.2 -0.37 0.05 -0.53 -0.89 -0.61 -0.03 1.19 -0.05 -0.45 -0.9 0.19 1.31 -0.34 -0.53 -0.67 -0.45 -0.79 0.5 0.05 0.79 0.58 0.05 -0.17 -0.72 -0.87 -0.63 0.18 -0.78 -0.88 0.39 1.34 -0.82 -0.3 -0.63 -0.62 1.19 -0.1 -0.72 -0.87 -0.44 -0.5 -0.53 -0.68 0.36 -2.0 -2.38 0.17 0.49 -3.01 0.25 0.71 -3.09 0.22 0.6 -2.6 0.46 -0.4 -0.05 0.31 -1.58 0.63
AGT25112 (N559_3461)
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AGT25136 (N559_3485)
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AGT25137 (MntR)
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AGT25186 (N559_3538)
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AGT25259 (N559_3617)
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AGT25316 (N559_3674)
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AGT25337 (N559_3697)
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AGT25338 (N559_3698)
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AGT25339 (N559_3699)
 -1.91 -1.92 0.79 1.57 0.77 -1.31 1.66 -0.47 -2.42 -1.99 -1.61 1.15 0.39 -1.2 2.26 -1.4 0.9 -3.01 1.19 1.14 0.82 -0.79 -0.43 -0.71 0.93 -1.56 -0.26 -0.45 -0.48 -0.74 -1.97 -0.86 -0.62 1.62 -0.93 0.1 -1.12 0.19 1.08 -1.0 1.24 -0.96 0.55 -0.14 0.95 -1.75 0.68 0.57 -0.48 -0.9 -0.8 -0.69 -0.55 -0.07 -0.53 -0.83 0.41 1.74 0.0 -0.13 -0.45 -0.96 1.62 0.39 -0.98 -0.9 -0.71 -0.86 -0.24 -0.21 0.54 -2.73 -0.93 -2.04 -1.79 -1.7 -1.51 -1.11 -2.41 -2.05 -1.47 -3.02 0.79 -1.38 -1.68 -1.3 -3.44 0.69
AGT25420 (N559_3784)
 -0.14 -0.15 -0.69 0.25 0.48 -1.77 1.01 0.45 -2.09 0.14 0.42 0.5 0.56 -0.79 2.04 -2.32 -0.19 -7.42 0.67 0.62 1.92 0.12 0.32 0.39 - -0.51 -0.48 -0.26 0.04 -0.03 0.21 -0.19 -0.43 0.61 0.04 -0.03 -0.96 0.2 0.34 -0.57 0.8 -0.49 -0.62 -1.66 0.51 -0.85 -3.46 -2.86 0.04 -0.2 -0.33 -0.58 0.07 0.92 -0.18 -0.52 0.6 1.1 -0.1 -0.15 0.22 -0.19 0.61 0.04 -0.99 -0.96 0.39 0.35 0.01 -0.31 0.62 -2.64 -3.82 0.45 0.12 -3.04 0.0 0.26 -0.9 -0.01 0.39 -3.0 0.06 -1.66 -0.15 0.07 -2.52 0.29
AGT25422 (N559_3786)
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AGT25452 (N559_3816)
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AGT25465 (N559_3829)
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AGT25561 (N559_3926)
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AGT25562 (YbbA)
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AGT25563 (N559_3928)
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AGT25570 (N559_3935)
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AGT25577 (N559_3942)
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AGT25614 (N559_3983)
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AGT25615 (N559_3984)
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AGT25625 (N559_3996)
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AGT25696 (N559_4070)
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AGT25714 (N559_4088)
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AGT25731 (N559_4105)
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AGT25732 (N559_4106)
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AGT25733 (N559_4107)
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AGT25758 (N559_4132)
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AGT25793 (CsiR)
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AGT25823 (N559_4198)
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AGT25861 (N559_4239)
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AGT25936 (N559_4323)
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AGT25942 (N559_4329)
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AGT26075 (BglJ)
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AGT26201 (N559_4602)
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AGT26202 (N559_4603)
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AGT26247 (RelB)
 0.53 0.85 -1.05 0.01 -1.26 -1.21 -0.51 -0.93 -0.63 0.44 1.16 0.28 -0.06 0.94 0.66 0.99 1.12 -8.03 -0.35 -0.94 2.03 0.6 -1.93 -1.16 -0.52 -1.48 -0.83 0.07 0.18 -0.52 -1.4 -0.06 -1.33 -0.33 -0.67 0.78 -0.52 0.65 -0.11 -0.61 - -0.72 -1.08 -0.36 0.58 1.14 -0.58 -0.46 0.18 0.73 -2.59 -1.93 -1.43 -1.2 -1.97 -0.84 -1.04 0.84 -3.04 -0.94 0.05 -0.3 -0.33 -0.32 -1.1 -0.83 -1.16 -1.37 -0.54 -1.0 0.14 -0.52 - 0.68 1.08 0.09 0.97 1.15 -0.83 0.94 0.99 -1.4 0.36 0.85 0.91 1.05 -0.6 0.83
AGT26302 (UlaR)
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AGT26318 (N559_4727)
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AGT26327 (N559_4736)
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AGT26547 (N559_4963)
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AGT26549 (N559_4967)
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AGT26550 (N559_4968)
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AGT26562 (N559_4980)
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AGT26566 (N559_4984)
 0.64 0.69 -0.43 -0.14 0.46 -0.24 0.47 -0.65 -2.74 0.49 0.49 -0.84 0.52 -0.55 -0.22 -0.72 0.08 -2.52 0.11 0.01 1.65 0.12 -0.4 -0.41 0.75 -0.43 -0.07 -0.46 -0.28 0.06 -0.21 -0.38 -0.57 -0.95 -0.22 0.95 -0.41 -0.36 -0.89 -0.27 0.96 -0.28 -0.67 -1.07 0.49 -0.63 0.71 0.66 -0.28 -0.29 -0.58 -0.54 -0.48 0.64 -0.48 -0.26 -0.47 -0.77 -0.59 -0.49 -0.15 -0.28 -0.95 0.68 -0.21 -0.04 -0.41 -0.46 0.12 -0.05 0.84 -2.49 -2.68 1.06 0.74 -2.4 0.82 0.85 -1.22 0.72 0.84 -1.75 0.24 -1.27 0.88 0.78 -1.84 0.26
AGT26618 (N559_5041)
 0.6 0.52 -1.34 1.14 0.04 -1.73 0.21 -0.94 -3.49 0.2 0.25 -1.77 -0.38 -1.14 0.61 -0.86 -0.54 -2.4 1.32 0.99 0.88 -1.19 0.33 0.37 -0.08 -0.6 -0.05 0.99 0.86 0.39 -0.11 0.45 0.01 0.68 -0.37 -0.41 -0.21 0.33 0.31 0.06 0.5 0.04 0.29 -0.56 -0.73 -1.78 0.16 0.08 0.86 0.76 -0.59 -0.75 -0.76 0.2 -0.87 -0.78 0.38 0.72 -0.46 0.3 -0.78 -0.28 0.68 0.44 0.3 -0.15 0.37 0.18 0.28 0.14 -0.74 -3.15 -4.22 0.76 0.46 -5.94 0.38 0.35 -2.89 0.26 0.56 -4.57 -1.11 -1.3 0.36 0.36 -1.63 -0.87
AGT26619 (N559_5042)
 -0.61 -1.02 -0.46 -0.25 -0.76 -0.66 0.77 -0.9 -1.51 -1.41 -0.8 0.08 -0.42 0.4 0.8 -0.89 0.78 -0.03 0.27 0.11 2.26 -1.54 -0.61 -0.68 1.72 -0.76 0.28 -0.34 -0.64 1.11 -0.74 -0.38 0.46 1.14 0.17 1.4 -0.34 0.45 -0.31 0.74 0.99 -0.35 0.28 -0.42 -1.13 0.56 1.54 1.23 -0.64 -0.48 -0.1 -0.13 -0.73 0.53 -0.95 -0.59 -0.31 0.28 -1.43 -1.14 -0.08 -0.71 1.14 1.04 -0.03 0.3 -0.68 -0.51 0.93 0.15 -0.96 -2.65 - -0.96 -0.76 -3.11 -0.71 -0.66 -2.65 -0.78 -0.89 -4.07 -1.41 -0.26 -0.95 -0.8 -0.57 -0.54
AGT26637 (N559_5060)
 0.44 0.62 0.26 -0.06 0.19 -1.62 -0.01 -0.05 -2.08 0.1 0.66 -1.42 0.54 -0.58 0.62 -0.29 -0.2 -4.42 0.37 0.45 0.32 -0.3 0.02 0.06 0.26 -0.64 -0.07 -0.14 -0.1 0.23 -0.06 -0.2 -0.02 0.29 0.67 -0.03 -0.41 0.26 0.06 0.48 0.11 -0.23 0.11 -0.65 0.01 -0.71 0.55 0.2 -0.1 -0.13 -0.34 -0.28 -0.46 0.84 -0.51 -0.5 -0.51 0.08 -0.53 0.08 -0.63 -0.23 0.29 0.37 -0.1 -0.35 0.06 0.03 0.19 -0.14 0.23 -1.03 -0.38 0.18 0.77 -1.32 0.48 0.86 -0.84 0.51 0.78 -1.24 -0.09 -0.42 0.05 0.45 -0.78 -0.02
AGT26675 (N559_5099)
 0.53 0.34 -0.27 0.51 0.77 -0.9 0.44 -0.19 -0.62 0.45 0.46 -1.84 -0.27 0.11 -1.44 0.16 0.62 -2.28 0.0 0.16 0.87 -0.84 -0.15 0.06 -0.37 -0.32 -0.21 -0.65 -0.23 0.52 0.02 -0.1 -0.17 -0.88 0.11 0.04 -0.05 0.4 -0.93 0.35 0.41 0.07 -0.63 -0.54 -0.31 -0.08 -0.06 -0.22 -0.23 0.07 -0.95 -0.72 -0.61 0.61 -0.67 -0.2 -1.59 -0.79 -0.52 0.33 -1.14 0.07 -0.88 0.11 0.49 -0.07 0.06 0.21 0.32 0.03 -0.41 -0.24 -1.93 0.94 0.7 -0.2 0.78 0.71 -0.88 0.54 0.29 -0.51 -0.51 1.27 0.44 0.48 0.42 -0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.