Heatmap: Cluster_5 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL17594 (BN171_160010)	0.06	0.08	0.08	0.16	0.08	0.02	1.0	0.04	0.12	0.82	0.22	0.81	0.15	0.04	0.06	0.13	0.11	0.04	0.48	0.04	0.17	0.03	0.17	0.93	0.09	0.02	0.33	0.0	0.16
CCL17595 (BN171_160011)	0.05	0.05	0.06	0.1	0.07	0.02	0.75	0.06	0.02	0.6	0.15	0.46	0.08	0.02	0.04	0.09	0.18	0.04	0.58	0.1	0.14	0.01	0.14	1.0	0.06	0.04	0.61	0.0	0.06
CCL17777 (BN171_180001)	0.02	0.08	0.05	0.09	0.06	0.08	0.18	0.03	0.06	0.62	1.0	0.43	0.3	0.06	0.1	0.16	0.09	0.06	0.49	0.02	0.14	0.31	0.17	0.07	0.17	0.05	0.04	0.0	0.95
CCL18281 (BN171_220033)	0.67	0.97	0.65	0.67	0.31	0.28	0.59	0.3	0.61	0.58	0.49	0.57	0.83	0.4	0.64	1.0	0.31	0.38	0.9	0.58	0.55	0.34	0.77	0.59	0.45	0.18	0.66	0.46	0.33
CCL18282 (splB)	0.56	1.0	0.47	0.58	0.31	0.27	0.65	0.32	0.45	0.66	0.51	0.61	0.7	0.26	0.6	0.85	0.26	0.31	0.67	0.48	0.42	0.27	0.59	0.48	0.38	0.16	0.67	0.46	0.34
CCL18473 (BN171_2380004)	0.03	0.09	0.06	0.16	0.1	0.03	1.0	0.04	0.11	0.35	0.28	0.45	0.15	0.03	0.07	0.06	0.1	0.05	0.33	0.03	0.02	0.16	0.33	0.12	0.04	0.02	0.49	0.05	0.28
CCL18501 (BN171_240006)	0.42	0.49	0.43	0.38	0.31	0.18	0.95	0.37	0.15	0.73	0.63	0.83	0.53	0.31	0.39	0.87	0.27	0.42	0.55	0.38	0.3	1.0	0.16	0.14	0.38	0.17	0.2	0.19	0.54
CCL18877 (ppiB)	0.71	0.46	0.68	0.49	0.73	0.29	0.8	0.5	0.26	0.74	0.7	0.72	0.62	0.67	0.49	0.86	0.44	0.71	0.62	1.0	0.51	0.89	0.38	0.41	0.95	0.39	0.38	0.38	0.69
CCL19017 (ldhA)	0.12	0.22	0.09	0.28	0.1	0.14	0.26	0.1	0.87	0.36	0.5	0.29	0.61	0.07	0.55	0.38	0.3	0.25	0.96	0.11	0.43	0.47	0.92	0.51	0.43	0.13	1.0	0.57	0.61
CCL19472 (BN171_3170006)	0.11	0.01	0.15	0.06	0.1	0.19	1.0	0.01	0.35	0.6	0.35	0.44	0.77	0.14	0.03	0.24	0.26	0.05	0.72	0.12	0.07	0.03	0.42	0.21	0.24	0.04	0.23	0.74	0.32
CCL19504 (xynC)	0.14	0.13	0.18	0.23	0.21	0.34	0.62	0.17	0.07	0.7	0.89	1.0	0.34	0.2	0.36	0.54	0.28	0.35	0.54	0.14	0.22	0.21	0.23	0.32	0.36	0.16	0.4	0.34	0.58
CCL19505 (BN171_3180029)	0.16	0.15	0.24	0.33	0.18	0.24	0.81	0.15	0.22	1.0	0.94	0.99	0.48	0.33	0.46	0.38	0.25	0.3	0.6	0.18	0.22	0.19	0.18	0.34	0.28	0.08	0.35	0.4	0.75
CCL19568 (BN171_3270006)	0.81	0.37	0.76	0.51	0.51	0.35	0.78	0.26	0.78	0.67	0.51	0.41	0.76	0.55	0.39	0.53	0.44	0.45	1.0	0.58	0.25	0.28	0.77	0.5	0.73	0.26	0.83	0.8	0.3
CCL19569 (BN171_3270007)	0.53	0.14	0.43	0.25	0.2	0.33	1.0	0.1	0.66	0.51	0.4	0.55	0.8	0.33	0.2	0.47	0.27	0.3	0.92	0.43	0.17	0.42	0.96	0.38	0.81	0.14	0.8	0.54	0.2
CCL19577 (BN171_3270015)	0.17	0.3	0.14	0.32	0.2	0.5	1.0	0.23	0.14	0.64	0.58	0.62	0.51	0.19	0.3	0.81	0.22	0.28	0.66	0.21	0.51	0.04	0.63	0.22	0.32	0.17	0.24	0.12	0.49
CCL19623 (BN171_3310003)	0.03	0.01	0.05	0.08	0.04	0.06	1.0	0.01	0.06	0.93	0.63	0.73	0.37	0.03	0.02	0.36	0.16	0.02	0.59	0.04	0.07	0.06	0.46	0.09	0.16	0.02	0.14	0.42	0.37
CCL19624 (BN171_3310004)	0.27	0.2	0.23	0.38	0.32	0.05	1.0	0.16	0.09	0.98	0.7	0.68	0.33	0.18	0.14	0.24	0.15	0.27	0.49	0.18	0.24	0.06	0.38	0.06	0.11	0.19	0.08	0.07	0.46
CCL19625 (BN171_3310005)	0.12	0.16	0.09	0.2	0.14	0.06	1.0	0.09	0.1	0.94	0.56	0.62	0.35	0.06	0.12	0.29	0.12	0.14	0.55	0.12	0.2	0.08	0.4	0.08	0.14	0.09	0.06	0.0	0.39
CCL19626 (BN171_3310006)	0.45	0.35	0.45	0.43	0.34	0.36	1.0	0.22	0.22	0.87	0.82	0.99	0.36	0.3	0.28	0.42	0.29	0.34	0.84	0.65	0.56	0.02	0.72	0.22	0.4	0.35	0.19	0.61	0.65
CCL19636 (BN171_3340003)	0.22	0.2	0.21	0.18	0.22	0.13	1.0	0.21	0.15	0.82	0.57	0.58	0.23	0.16	0.2	0.25	0.27	0.26	0.41	0.18	0.12	0.29	0.36	0.09	0.11	0.13	0.04	0.25	0.44
CCL19637 (BN171_3340004)	0.2	0.2	0.19	0.12	0.27	0.09	1.0	0.24	0.21	0.81	0.57	0.68	0.29	0.16	0.19	0.35	0.22	0.27	0.34	0.16	0.06	0.14	0.3	0.07	0.11	0.11	0.04	0.28	0.38
CCL19638 (BN171_3340005)	0.09	0.09	0.09	0.07	0.1	0.06	1.0	0.1	0.17	0.94	0.67	0.7	0.27	0.08	0.09	0.28	0.16	0.11	0.28	0.07	0.04	0.16	0.21	0.05	0.1	0.06	0.03	0.22	0.6
CCL19714 (BN171_3420002)	0.05	0.04	0.09	0.06	0.08	0.15	1.0	0.05	0.08	0.33	0.26	0.33	0.34	0.06	0.05	0.42	0.08	0.08	0.21	0.12	0.14	0.11	0.16	0.06	0.21	0.08	0.31	0.22	0.29
CCL19725 (prdR)	0.37	0.44	0.42	0.45	0.48	0.37	0.88	0.26	0.59	0.64	0.53	0.61	0.82	0.47	0.62	1.0	0.22	0.45	0.65	0.8	1.0	0.69	0.52	0.46	0.38	0.42	0.54	0.58	0.45
CCL19775 (BN171_3470013)	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	1.0	0.01	0.01	0.55	0.36	0.44	0.26	0.0	0.0	0.09	0.03	0.01	0.18	0.0	0.0	0.0	0.24	0.01	0.0	0.0	0.01	0.05	0.43
CCL19776 (BN171_3470014)	0.19	0.13	0.2	0.19	0.18	0.03	1.0	0.26	0.28	0.5	0.25	0.21	0.33	0.15	0.16	0.17	0.13	0.24	0.27	0.22	0.26	0.83	0.12	0.21	0.29	0.12	0.21	0.28	0.2
CCL19777 (BN171_3470015)	0.05	0.02	0.1	0.07	0.09	0.06	1.0	0.02	0.23	0.48	0.21	0.25	0.4	0.13	0.04	0.26	0.11	0.06	0.4	0.15	0.15	0.14	0.2	0.15	0.2	0.06	0.13	0.33	0.22
CCL19778 (BN171_3470016)	0.25	0.16	0.22	0.18	0.18	0.24	1.0	0.12	0.75	0.44	0.31	0.29	0.46	0.24	0.18	0.42	0.16	0.16	0.7	0.32	0.25	0.58	0.43	0.33	0.35	0.2	0.38	0.33	0.3
CCL19779 (BN171_3470017)	0.16	0.07	0.23	0.14	0.17	0.15	1.0	0.06	0.4	0.38	0.23	0.22	0.32	0.28	0.09	0.24	0.12	0.09	0.41	0.42	0.19	0.07	0.24	0.17	0.2	0.19	0.45	0.17	0.23
CCL19808 (BN171_350002)	0.29	0.83	0.24	0.57	0.28	0.18	1.0	0.36	0.1	0.49	0.47	0.42	0.37	0.23	0.63	0.24	0.17	0.28	0.6	0.32	0.9	0.08	0.37	0.48	0.18	0.23	0.4	0.0	0.54
CCL19853 (BN171_3570002)	0.1	0.34	0.07	0.33	0.1	0.08	1.0	0.08	0.07	0.66	0.29	0.18	0.17	0.09	0.24	0.18	0.13	0.17	0.47	0.12	0.28	0.27	0.21	0.11	0.23	0.09	0.09	0.13	0.17
CCL19854 (BN171_3570003)	0.02	0.08	0.01	0.09	0.02	0.04	1.0	0.01	0.02	0.66	0.3	0.17	0.18	0.02	0.07	0.2	0.09	0.05	0.37	0.02	0.09	0.38	0.17	0.09	0.21	0.02	0.12	0.09	0.19
CCL19855 (BN171_3570004)	0.03	0.1	0.02	0.12	0.02	0.05	1.0	0.02	0.01	0.65	0.28	0.17	0.17	0.03	0.08	0.18	0.1	0.06	0.36	0.03	0.12	0.34	0.17	0.05	0.17	0.02	0.13	0.1	0.18
CCL19924 (BN171_3600002)	0.16	0.12	0.2	0.17	0.1	0.11	1.0	0.03	0.27	0.45	0.35	0.27	0.43	0.22	0.2	0.2	0.3	0.12	0.88	0.31	0.51	0.33	0.44	0.43	0.2	0.09	0.5	0.22	0.23
CCL19929 (EndoA)	0.07	0.17	0.06	0.16	0.04	0.06	0.43	0.04	1.0	0.23	0.23	0.18	0.42	0.03	0.07	0.31	0.15	0.05	0.41	0.07	0.2	0.22	0.35	0.72	0.27	0.03	0.91	0.18	0.15
CCL19930 (BN171_3600008)	0.44	0.59	0.35	0.6	0.36	0.19	0.76	0.3	0.95	0.46	0.47	0.36	0.53	0.39	0.42	0.31	0.21	0.39	0.43	0.59	0.86	0.82	0.33	0.87	0.33	0.29	1.0	0.22	0.32
CCL19931 (alr)	0.09	0.4	0.09	0.37	0.1	0.11	0.68	0.06	1.0	0.46	0.36	0.27	0.43	0.05	0.12	0.21	0.08	0.05	0.39	0.13	0.33	0.46	0.29	0.49	0.14	0.08	0.72	0.08	0.18
CCL19932 (BN171_3600010)	0.11	0.32	0.11	0.41	0.14	0.08	0.75	0.07	0.95	0.46	0.32	0.25	0.66	0.06	0.12	0.29	0.11	0.06	0.58	0.18	0.36	0.38	0.46	0.44	0.19	0.08	1.0	0.11	0.16
CCL19933 (BN171_3600011)	0.07	0.08	0.1	0.28	0.1	0.06	0.7	0.01	1.0	0.49	0.35	0.28	0.34	0.04	0.06	0.24	0.1	0.03	0.58	0.16	0.3	0.11	0.5	0.4	0.18	0.06	0.48	0.12	0.21
CCL19934 (acpS)	0.07	0.12	0.1	0.26	0.09	0.2	0.72	0.03	1.0	0.94	0.93	0.61	0.35	0.05	0.05	0.3	0.19	0.03	0.84	0.18	0.35	0.19	0.76	0.45	0.35	0.07	0.62	0.21	0.52
CCL19990 (BN171_3610033)	0.16	0.19	0.13	0.11	0.18	0.16	1.0	0.18	0.15	0.56	0.5	0.53	0.29	0.13	0.17	0.27	0.16	0.24	0.38	0.19	0.22	0.27	0.22	0.25	0.1	0.1	0.36	0.13	0.46
CCL20083 (BN171_3690027)	0.08	0.04	0.05	0.06	0.06	0.02	1.0	0.02	0.12	0.28	0.2	0.11	0.13	0.05	0.07	0.1	0.08	0.03	0.13	0.03	0.07	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.01	0.04	0.17
CCL20084 (BN171_3690028)	0.15	0.09	0.07	0.12	0.11	0.02	1.0	0.05	0.13	0.31	0.2	0.09	0.2	0.08	0.18	0.19	0.1	0.08	0.16	0.04	0.11	0.03	0.05	0.03	0.07	0.03	0.01	0.06	0.15
CCL20156 (BN171_3720001)	0.5	1.0	0.44	0.7	0.36	0.27	0.65	0.39	0.25	0.52	0.41	0.49	0.52	0.35	0.61	0.41	0.27	0.35	0.73	0.45	0.51	0.73	0.54	0.45	0.32	0.26	0.49	0.19	0.35
CCL20429 (BN171_450005)	0.04	0.03	0.17	0.21	0.13	0.32	1.0	0.02	0.12	0.49	0.14	0.54	0.76	0.05	0.05	0.51	0.18	0.07	0.55	0.12	0.18	0.08	0.58	0.3	0.5	0.09	0.53	0.19	0.49
CCL20430 (BN171_450006)	0.21	0.18	0.18	0.14	0.18	0.25	0.54	0.18	0.15	0.57	0.51	0.56	0.33	0.16	0.16	0.33	0.2	0.23	0.53	0.25	0.18	1.0	0.29	0.4	0.21	0.11	0.27	0.15	0.43
CCL20440 (BN171_460004)	0.23	0.2	0.27	0.18	0.21	0.24	1.0	0.19	0.07	0.79	0.4	0.66	0.35	0.17	0.16	0.38	0.12	0.23	0.38	0.3	0.16	0.61	0.4	0.13	0.13	0.14	0.07	0.16	0.36
CCL20441 (sip)	0.19	0.21	0.21	0.15	0.2	0.16	0.7	0.21	0.03	0.52	0.2	0.36	0.16	0.13	0.16	0.14	0.07	0.2	0.22	0.26	0.14	1.0	0.21	0.12	0.11	0.18	0.07	0.1	0.18
CCL20442 (sip)	0.15	0.16	0.23	0.15	0.2	0.12	1.0	0.16	0.02	0.6	0.29	0.48	0.19	0.14	0.13	0.18	0.08	0.14	0.24	0.26	0.15	0.82	0.24	0.12	0.11	0.18	0.09	0.1	0.23
CCL20443 (BN171_460007)	0.08	0.08	0.18	0.13	0.12	0.16	1.0	0.07	0.01	0.6	0.29	0.44	0.32	0.11	0.09	0.22	0.08	0.08	0.23	0.18	0.17	0.37	0.24	0.12	0.14	0.11	0.21	0.14	0.23
CCL20471 (BN171_510003)	0.23	0.16	0.3	0.21	0.22	0.39	1.0	0.14	0.26	0.36	0.25	0.34	0.48	0.26	0.16	0.55	0.13	0.17	0.31	0.48	0.32	0.37	0.32	0.22	0.28	0.22	0.28	0.2	0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)