Heatmap: Cluster_45 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
strain_5001420,control,fromUrine
strain_5001420,fromUrine
ch1034,13h_old_biofilm,biofilm_dispersed
ch1034,13h_old_biofilm,sessile
ch1034,7h_old_biofilm,sessile
ch1034,Log,planktonic
ch1034,Stationary,planktonic
control,fromNasalSwab,fromSwine
dmc1097
dmc1097,control,fromBlood
dmc1097,fromBlood
ekp16,fromSputum
eugenol,fromNasalSwab,fromSwine
fromBlood
fromHospitalPatients
fromRectalSwab
fromUrine
je01
k26,mero_susceptible,fromHospitalPatients
k56,mero_resistant,fromHospitalPatients
kctc2242
kp4,FeLimited,fromRespiratoryTract
kpr1,+CTX
kpr1,+gent
kpr1,+mero
kpr1,+TMP/SMX
kpr1,control
kpr2,+CTX
kpr2,+gent
kpr2,+mero
kpr2,+TMP/SMX
kpr2,control
kps1,+CTX
kps1,+gent
kps1,+mero
kps1,+TMP/SMX
kps1,control
kps2,+CTX
kps2,+gent
kps2,+mero
kps2,+TMP/SMX
kps2,control
mrsn 1319
ms6671
njst258-1,FeLimited,fromUrine
njst258-1,fromUrine
rb011,+mero,mero_resistant
rb011,control,mero_resistant
rb012,+gent,gent_resistant
rb012,control,gent_resistant
rb013,+cip,cip_resistant
rb013,control,cip_resistant
rb039,+cip,cip_resistant
rb039,+mero,mero_susceptible
rb039,control,cip_resistant
rb039,control,mero_susceptible
rb040,+cip,cip_susceptible
rb040,+gent,gent_susceptible
rb040,control,cip_susceptible
rb040,control,gent_susceptible
rb041,+cip,cip_susceptible
rb041,control,cip_susceptible
rb121,+gent,gent_susceptible
rb121,+mero,mero_susceptible
rb121,control,gent_susceptible
rb121,control,mero_susceptible
rb122,+gent,gent_resistant
rb122,control,gent_resistant
rb257,+mero,mero_resistant
rb257,control,mero_resistant
uhkpc05,FeLimited,fromBlood
uhkpc05,fromBlood
uhkpc07
uhkpc07,control,fromUrine
uhkpc07,fromUrine
uhkpc18
uhkpc18,control,fromUrine
uhkpc18,fromUrine
uhkpc33
uhkpc33,control,fromUrine
uhkpc33,fromUrine
uhkpc48
uhkpc48,FeLimited,fromUrine
uhkpc67
uhkpc67,control,fromBlood
uhkpc67,fromBlood
vakpc297
vakpc297,FeLimited,fromUrine
AGT21834 (GidA)
-1.99 -1.48 1.06 0.01 0.11 0.66 -0.0 0.08 -0.9 -1.51 -1.1 -0.19 0.43 -0.58 0.17 -0.52 -0.32 -4.6 -1.04 -0.54 -0.5 -0.16 -0.4 0.12 1.37 -0.42 0.3 -0.12 0.39 -0.49 -0.42 -0.19 0.55 0.73 -0.01 1.33 -0.24 -0.04 0.68 0.0 2.04 -0.32 -0.56 -0.78 -0.72 -0.51 1.22 1.02 0.39 0.37 0.44 0.54 0.32 0.71 0.3 -0.67 -0.02 0.73 0.15 0.13 -0.68 -0.05 0.73 0.74 0.25 -0.42 0.12 0.11 -0.5 -0.82 -0.36 -1.64 -0.38 -1.39 -1.08 -0.46 -1.61 -1.12 0.7 -1.57 -1.39 0.09 -0.42 -0.67 -1.72 -1.15 -1.94 -0.5
AGT21835 (GidB)
-1.53 -0.78 0.3 -0.77 -0.36 -0.51 -0.88 -0.18 -1.0 -0.87 -0.51 -0.73 0.0 -1.53 -0.07 -1.55 -1.17 -3.92 -2.06 -1.28 -1.26 0.92 -0.02 0.48 1.05 0.16 0.44 -0.19 0.4 -0.5 -0.0 -0.03 0.58 0.1 0.36 1.29 0.13 0.56 0.22 0.32 2.25 -0.08 -0.66 -1.77 0.44 -1.21 0.95 0.75 0.4 0.43 0.18 0.13 0.15 0.77 0.22 0.01 1.15 0.32 0.12 0.11 0.87 -0.16 0.1 0.77 0.23 -0.2 0.48 0.46 -0.49 -0.53 0.54 -1.78 -1.5 -0.91 -0.33 -2.11 -1.29 -0.61 -0.87 -0.95 -0.53 -1.25 0.72 -2.42 -1.15 -0.53 -2.29 0.52
AGT21868 (DnaA)
-1.28 -0.73 1.61 0.18 0.22 -0.42 0.25 -0.12 -0.24 -0.56 -0.39 0.7 0.67 0.08 0.94 -0.56 0.78 -3.12 0.17 0.27 -0.74 -0.07 -0.56 -0.21 0.67 -0.88 -0.22 0.01 0.3 -0.52 -0.73 -0.31 -0.18 0.4 -0.46 0.47 -0.71 -0.11 0.47 -0.69 1.08 -0.68 -0.19 -0.45 -0.38 0.8 0.58 0.35 0.3 0.2 -0.31 -0.21 -0.27 0.45 -0.26 -0.96 1.21 0.62 -0.46 -0.14 0.1 -0.7 0.4 0.41 -0.34 -0.5 -0.21 -0.32 -0.3 -0.54 -0.08 -0.88 -0.4 -1.08 -0.79 0.24 -0.9 -0.48 0.83 -1.18 -0.57 0.73 0.03 0.75 -0.95 -0.41 -1.33 -0.35
AGT21870 (N559_0037)
-1.61 -1.13 1.74 0.29 0.17 0.12 -0.16 0.32 -0.01 -1.05 -0.75 0.35 0.89 -0.34 0.53 -1.72 0.16 -3.42 -0.49 -0.27 -0.01 -1.1 -0.2 0.23 0.67 -0.59 0.07 -0.2 0.52 -0.56 -0.44 -0.01 0.4 0.08 0.05 1.0 -0.33 0.37 0.33 0.05 1.7 -0.19 -0.36 -0.69 -0.89 -0.17 0.62 0.5 0.52 0.61 0.27 0.26 0.04 0.71 0.18 -0.31 1.35 0.43 0.23 0.17 0.46 0.13 0.08 0.72 -0.01 -0.33 0.23 0.11 -0.52 -0.34 -0.49 -0.63 -0.75 -1.25 -1.15 -1.06 -1.55 -0.93 -1.24 -1.46 -0.98 -1.52 -0.33 0.17 -1.37 -0.88 -0.6 -1.16
AGT21899 (UhpB)
-2.51 -1.49 0.94 -0.72 -0.92 -1.25 1.11 -0.12 -2.95 -1.59 -1.28 -0.12 -0.01 -1.04 1.22 -2.25 -0.19 -7.57 -0.17 1.5 0.22 0.11 -0.44 0.5 0.88 -0.37 0.17 0.0 0.71 -0.24 0.14 0.22 0.55 0.74 0.56 0.32 -0.56 0.91 0.31 0.09 0.41 -0.36 -0.78 -1.6 -0.35 -0.48 0.72 0.64 0.71 0.78 0.15 0.2 0.02 1.02 0.2 -0.52 1.27 1.08 0.07 0.12 0.11 -0.15 0.74 0.96 -0.51 -0.44 0.5 0.19 -0.3 -0.39 -0.26 -2.34 -0.74 -1.62 -1.22 -0.57 -2.01 -1.19 -1.18 -1.94 -1.5 0.31 0.03 -0.23 -1.4 -0.83 -2.86 -0.25
AGT21904 (N559_0075)
-1.05 -0.73 1.57 -1.11 -0.79 0.99 -0.96 -0.52 -3.54 -0.96 -0.28 0.1 0.93 -1.3 1.05 -2.73 -0.61 -3.08 -0.7 -0.36 0.76 0.87 -0.48 -0.19 1.28 -0.68 0.24 -0.23 0.54 -0.0 -1.06 -0.02 0.29 0.61 0.28 0.26 -0.91 0.56 0.73 -0.26 1.65 -1.05 -0.91 -1.56 -0.02 -0.98 1.1 1.04 0.54 0.47 0.63 0.67 -0.1 0.57 -0.15 -1.04 1.37 0.97 0.15 -0.68 0.02 -0.49 0.61 0.37 -0.7 -1.21 -0.19 -0.14 -0.01 -0.34 0.13 -4.45 -3.53 -0.52 -0.22 -1.94 -0.7 -0.18 -2.61 -1.05 -0.44 -2.18 1.19 -1.78 -0.76 -0.18 -3.38 0.02
AGT21905 (N559_0076)
-1.34 -1.43 2.48 -0.21 -0.65 0.99 0.02 -1.09 -4.17 -1.81 -1.01 0.91 0.84 -1.49 1.56 -4.12 -0.85 -6.33 -0.61 -0.23 1.6 -1.36 -0.96 -1.08 1.59 -1.2 0.23 -0.26 0.56 -0.27 -1.78 -0.07 -0.02 0.3 -0.56 1.09 -1.26 0.14 0.35 -0.49 1.43 -1.05 -0.61 -2.08 -0.97 -0.95 1.38 1.4 0.56 0.81 0.81 0.65 -0.14 0.81 0.4 -1.31 1.7 0.65 0.72 -0.44 -0.15 -0.24 0.3 1.29 -1.09 -0.91 -1.08 -0.62 -0.19 -0.24 -0.64 -2.3 -1.89 -0.96 -1.15 -3.44 -1.5 -0.78 - -1.85 -0.83 -2.4 -0.52 -1.1 -0.66 -0.77 -2.28 -1.61
AGT21975 (N559_0150)
-0.64 -0.6 -0.35 -0.37 -1.04 -1.52 -0.67 -0.22 -0.93 -0.97 -0.29 0.03 0.26 -0.77 0.12 -0.57 -0.81 -1.56 -0.84 -1.05 1.36 0.66 -0.56 -0.37 0.68 -0.11 0.02 -0.03 0.38 -0.45 -0.31 -0.05 -0.32 1.46 -0.22 1.11 -0.35 -0.37 1.46 -0.5 0.8 -0.28 -1.01 -2.03 0.81 -0.29 0.54 0.49 0.38 0.39 -0.35 -0.35 -0.23 0.36 -0.22 -0.52 1.27 1.59 -0.33 -0.15 0.7 -0.26 1.46 0.41 -0.17 -0.38 -0.37 -0.23 -0.54 -0.66 0.75 -1.13 -1.21 -0.6 -0.38 -1.12 -0.78 -0.51 -0.32 -0.28 -0.44 -0.99 0.47 -0.38 -0.73 -0.84 -1.41 0.83
AGT22021 (YibK)
-1.02 -0.86 -0.3 -1.05 -0.97 -1.19 -1.28 1.32 -1.58 -1.02 -0.56 -0.02 1.22 -0.6 1.14 -1.42 -0.28 -3.91 -0.27 0.11 -0.76 -1.07 0.08 0.36 0.67 -0.21 0.25 -0.76 -0.26 -0.29 -0.02 -0.42 0.69 1.12 0.53 -0.43 -0.16 0.18 1.38 0.3 1.58 -0.14 -0.58 -1.15 -0.61 0.32 0.7 0.6 -0.26 -0.26 0.12 0.28 0.27 0.96 0.28 -0.11 0.86 1.48 0.2 0.3 -0.43 -0.24 1.12 0.17 0.25 -0.67 0.36 0.35 -0.31 -0.46 -0.48 -0.99 -3.65 -0.64 -0.4 -1.54 -1.28 -0.93 -3.44 -0.82 -0.64 -1.05 -0.46 1.01 -0.9 -0.69 -0.55 -0.75
AGT22037 (N559_0215)
-1.64 -0.9 1.33 -0.22 -0.86 0.9 0.24 -0.61 -4.6 -1.33 -0.86 -0.82 0.04 0.1 1.5 0.05 0.34 -2.31 -0.08 -0.48 0.81 -0.18 -0.45 -0.39 -0.27 -0.88 -0.48 -0.12 0.37 -0.33 -0.49 -0.2 0.99 0.76 1.51 -0.33 -0.33 0.66 -0.54 1.03 -0.79 -0.43 0.41 -1.41 0.15 -0.04 0.16 -0.48 0.37 0.21 -0.03 -0.12 0.0 1.23 -0.37 -0.66 2.95 0.0 0.01 -0.34 0.5 -0.18 0.76 0.83 -0.06 0.03 -0.39 -0.4 -0.12 -0.13 0.29 -4.79 -3.81 -1.91 -0.63 -3.6 -1.1 -0.5 -2.83 -1.65 -1.03 -3.57 0.25 -2.72 -1.39 -0.66 -4.2 -0.03
AGT22052 (N559_0230)
-2.54 -2.31 2.54 -0.46 -1.99 -0.36 -1.08 -1.84 -3.85 -2.05 -1.63 3.03 -0.89 -2.2 0.79 -3.13 -1.57 -7.36 -1.18 -0.78 1.05 -1.33 -1.1 -0.83 0.52 -1.25 -0.42 -0.99 -0.3 -1.3 -1.7 -1.11 0.96 2.63 -0.45 -0.65 -1.23 1.07 2.95 -0.7 -0.22 -0.91 -1.93 -3.27 -1.73 -1.71 0.34 0.29 -0.3 -0.45 -1.19 -1.14 -0.41 0.53 -0.54 -1.5 0.26 3.11 -0.14 -0.34 -1.39 -0.66 2.63 0.55 -0.88 -1.26 -0.83 -0.68 -1.16 -1.35 -1.77 -3.36 -3.63 -2.32 -2.28 -4.82 -2.1 -1.67 -2.55 -2.2 -1.71 -3.19 -1.27 -2.71 -1.88 -1.69 -3.33 -1.66
AGT22111 (N559_0289)
-1.5 -1.47 -0.37 -0.09 -0.94 -2.17 -0.36 0.83 -0.18 -1.75 -1.46 -0.22 1.05 -0.8 -0.9 -2.24 -0.28 -4.53 -0.41 -0.41 1.32 -0.82 0.31 0.37 0.43 0.17 0.26 0.43 0.71 0.19 0.28 0.4 0.27 -0.21 0.0 0.58 0.16 0.49 0.21 -0.14 0.59 0.27 -0.95 -0.54 -0.75 -0.24 0.52 0.58 0.71 0.74 0.39 0.3 0.25 0.76 0.26 0.15 1.64 0.15 0.47 0.27 0.99 0.45 -0.21 0.52 0.4 0.1 0.37 0.3 0.23 0.15 -0.34 -0.21 -1.48 -1.2 -1.28 -0.99 -1.68 -1.55 0.0 -1.18 -1.31 -1.02 -1.19 0.06 -1.51 -1.73 0.1 -1.03
AGT22200 (NudE)
-0.38 -0.29 0.07 0.42 0.08 1.35 -0.21 -0.61 -3.17 -0.26 -0.19 -0.47 0.26 -0.66 0.48 -0.54 -0.33 -1.59 -0.2 -0.21 0.81 -0.09 -0.42 -0.22 0.85 -0.3 0.13 -0.34 0.04 -0.24 -0.27 -0.16 -0.29 0.54 0.17 1.02 -0.28 0.16 1.36 0.19 1.6 -0.06 -0.15 -0.67 -0.33 -0.69 0.67 0.72 0.04 -0.09 -0.34 -0.08 -0.29 0.78 -0.28 -0.31 0.17 1.4 -0.07 -0.05 0.38 0.02 0.54 0.44 -0.21 -0.16 -0.22 -0.2 -0.31 -0.26 0.09 -2.47 -1.51 -0.15 0.05 -2.96 -0.0 0.15 -1.83 -0.46 -0.29 -1.66 0.03 -1.85 -0.01 0.04 -2.76 -0.44
AGT22338 (N559_0536)
-0.51 -0.17 1.05 0.33 0.51 -1.08 -0.37 0.15 -2.23 -0.61 -0.47 -0.27 0.04 -0.26 1.71 -0.45 0.02 -2.66 1.57 1.45 0.82 -0.03 -0.56 -0.31 0.2 -0.52 -0.2 -0.33 0.02 -0.45 -0.77 -0.44 0.05 0.5 0.15 -0.53 -0.47 0.01 0.63 -0.08 -0.35 -0.74 0.49 -0.47 -0.02 -0.17 0.21 0.25 0.02 0.04 0.12 0.06 -0.06 0.29 -0.03 -0.27 2.27 0.73 -0.3 -0.4 0.71 -0.36 0.5 -0.04 -0.25 -0.71 -0.31 -0.23 -0.41 -0.78 0.16 -1.76 -0.78 -0.52 -0.47 -1.85 -0.47 -0.2 -1.31 -0.52 0.01 -1.68 -0.03 -1.25 -0.65 -0.28 -2.55 -0.11
AGT22444 (N559_0647)
-1.22 -0.89 0.82 -0.12 -0.28 -0.53 0.38 0.49 -0.76 -1.08 -0.89 0.26 0.58 -0.77 1.01 -1.48 0.35 -5.95 -0.33 -0.06 0.86 -2.21 -0.35 -0.42 1.42 -0.58 0.12 -0.24 0.13 0.58 -0.64 -0.34 -0.13 1.02 0.81 0.4 -0.64 0.11 1.16 0.41 1.2 -0.44 -0.34 -1.72 -1.69 0.11 1.46 1.08 0.13 -0.03 -0.28 -0.47 -0.55 1.48 -0.54 -0.64 0.92 1.01 -0.44 -0.24 0.03 -0.43 1.02 0.93 -0.22 -0.33 -0.42 -0.58 0.42 0.01 -1.21 -1.52 0.48 -1.46 -1.05 -1.33 -1.09 -0.45 -0.33 -1.56 -1.05 -0.7 -1.77 -0.19 -0.94 -0.75 -0.31 -1.83
AGT22491 (EvgA)
-4.07 -4.43 1.62 0.15 -0.22 -2.14 -1.18 -0.22 -1.85 -3.57 -3.84 2.78 0.13 1.45 -0.08 -0.81 2.74 -3.18 0.26 0.12 2.22 -1.78 -0.86 -0.98 -0.31 -0.9 -0.68 -0.51 -0.57 -0.14 -0.32 -0.41 -0.73 1.92 -0.93 -2.0 -1.11 -1.04 1.64 -1.11 -1.64 -0.53 -2.32 -3.37 -2.52 2.19 -0.24 -0.02 -0.57 -0.49 -0.87 -1.09 -0.75 -0.09 -0.73 -0.94 2.86 2.24 -0.61 -0.3 -0.69 -1.25 1.92 -0.78 -0.95 -0.23 -0.98 -0.74 -0.07 -0.82 -2.91 -2.33 -4.06 -4.2 -5.28 -2.61 -3.69 -3.17 -1.01 -4.3 -3.58 -4.3 -3.42 -2.15 -3.51 -3.0 -2.63 -4.24
AGT22520 (ZupT)
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AGT22521 (N559_0728)
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AGT22637 (N559_0848)
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AGT22679 (N559_0891)
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AGT22691 (N559_0903)
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AGT22700 (FldB)
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AGT22709 (N559_0921)
-2.28 -2.32 2.66 0.12 -1.45 0.32 -0.87 -1.94 -3.42 -2.09 -2.01 1.78 -0.79 -0.84 0.83 -1.53 -0.01 -3.08 -1.18 -0.94 1.29 -2.79 -1.06 -0.9 0.67 -1.0 -0.29 -0.51 -0.41 -0.92 -1.16 -0.89 2.23 2.38 -0.31 -0.28 -1.36 1.49 2.17 0.41 -0.86 -1.15 -2.4 -2.44 -2.83 -2.03 0.52 0.64 -0.41 -0.67 -1.87 -1.6 -1.01 -0.55 -1.08 -1.42 2.43 3.28 -1.53 -0.84 -1.27 -1.36 2.38 0.49 -1.05 -0.74 -0.9 -1.19 -1.03 -1.28 -2.62 -3.44 -4.41 -2.64 -2.46 -5.28 -1.82 -1.98 -1.82 -2.35 -2.09 -4.65 -2.45 -2.67 -2.36 -2.06 -2.27 -2.07
AGT22737 (N559_0950)
-1.78 -1.45 -1.77 -3.25 -3.75 -1.41 -3.4 -2.62 -2.05 0.14 0.35 -1.32 -1.59 -2.02 -0.35 -3.68 -0.93 -2.95 -3.71 -3.21 -0.9 -0.69 -1.52 -1.1 0.83 -0.11 -0.39 -0.33 0.51 1.16 -0.83 0.01 0.42 2.92 -0.32 2.61 -0.62 0.17 1.33 -0.1 1.26 -0.96 -2.69 -2.98 -0.87 -0.79 0.71 0.51 0.51 0.06 -1.09 -1.05 -0.72 0.61 -0.72 -1.05 0.06 2.03 -2.01 -2.11 0.55 -0.48 2.92 1.73 -0.21 -0.54 -1.1 -1.28 0.95 0.79 -1.26 -4.09 -3.59 -1.52 -1.01 -2.61 -0.33 -0.01 -3.09 -1.64 -1.55 -0.61 0.11 -1.18 0.22 0.25 -2.12 -0.32
AGT22841 (N559_1062)
-0.16 -0.02 0.1 -0.25 -0.23 -0.3 0.21 -0.36 -1.62 -0.36 0.18 1.96 0.68 -0.22 0.06 -1.57 -0.25 -4.86 0.3 0.42 2.07 -0.3 -0.68 -0.53 1.02 -0.7 -0.07 0.17 -0.01 -0.16 -1.03 -0.25 -0.11 -0.13 -0.02 0.32 -0.86 0.29 -0.05 -0.75 0.97 -0.59 -0.7 -2.31 -0.39 -0.22 0.83 0.7 -0.01 0.19 -0.45 -0.22 -0.07 1.29 -0.22 -0.74 1.37 0.46 -0.16 -0.17 -0.07 -0.13 -0.13 0.75 -0.6 -0.86 -0.53 -0.48 -0.19 0.1 -0.16 -1.57 -1.81 -0.18 -0.0 -1.4 -0.05 0.35 -1.57 0.22 0.29 -1.36 -0.32 -0.52 0.1 0.09 -2.42 -0.37
AGT22842 (CsdA)
-0.56 -0.45 -1.26 -0.21 -0.92 -3.25 -0.5 0.24 -2.51 -0.78 -0.43 1.78 0.91 -1.81 0.64 -2.43 -1.51 -6.89 1.02 1.21 2.04 -1.64 -0.36 -0.43 0.85 -0.8 -0.15 0.41 -0.08 -0.02 -0.75 -0.19 0.23 0.42 -0.26 0.06 -0.83 0.54 0.56 -0.63 0.88 -0.56 -0.34 -1.57 -0.84 -1.79 0.72 0.63 -0.08 -0.11 -0.43 -0.4 -0.21 1.48 -0.32 -0.68 2.76 1.01 -0.25 -0.35 0.06 -0.29 0.42 1.4 -0.75 -0.54 -0.43 -0.65 0.07 -0.04 -0.28 -2.18 -3.27 -0.25 -0.36 -3.13 -0.54 -0.27 -2.33 -0.3 -0.05 -2.94 -1.18 -1.39 -0.32 -0.33 -2.28 -0.91
AGT22884 (N559_1110)
-2.16 -2.08 1.2 0.11 -0.04 0.71 -0.09 0.72 -0.67 -1.74 -1.76 1.42 1.46 0.35 1.03 -1.4 0.83 -1.47 -0.64 -0.85 2.1 -1.47 -0.31 0.0 0.21 -0.05 -0.09 0.1 0.41 0.07 -0.33 0.12 -0.45 0.47 0.23 0.22 -0.3 0.04 0.67 -0.41 0.05 -0.26 -0.42 -0.88 -1.25 0.35 0.13 0.04 0.41 0.5 0.35 0.4 0.22 0.29 0.16 -0.08 1.03 0.96 0.08 0.05 0.49 0.03 0.47 0.0 -0.29 -0.41 0.0 -0.01 0.0 -0.08 -0.92 -1.12 -0.8 -2.14 -2.15 -0.91 -1.72 -1.43 0.44 -1.85 -1.72 -0.41 -1.03 -0.53 -1.74 -1.56 -1.53 -0.91
AGT22896 (FtsB)
-1.72 -1.32 0.9 1.14 0.03 0.6 0.15 0.75 0.08 -1.85 -1.08 0.52 1.39 0.63 0.11 0.22 0.89 -1.86 0.21 -0.05 -0.32 -0.67 -0.04 0.24 0.72 -0.4 0.25 -0.16 0.45 -0.07 -0.07 0.05 0.14 0.49 0.18 0.7 -0.06 -0.44 0.14 -0.24 0.54 0.04 -0.68 -1.28 -1.21 0.8 0.54 0.51 0.45 0.47 -0.18 0.05 0.05 0.23 0.12 -0.39 0.27 0.23 0.01 0.33 -0.36 -0.05 0.49 -0.1 0.41 -0.19 0.24 0.36 -0.3 -0.51 -1.09 0.31 -0.93 -1.9 -1.08 -0.65 -2.03 -1.11 -0.94 -1.43 -1.13 -0.97 -0.91 0.9 -2.12 -1.47 -0.34 -0.94
AGT22980 (N559_1216)
-1.4 -0.95 1.32 -0.46 -0.51 -0.19 0.4 -0.99 -1.64 -1.32 -0.13 1.36 -0.02 -0.57 1.16 -0.67 0.21 -3.47 -0.47 -0.17 2.41 -0.6 -0.12 0.17 1.32 -0.6 0.25 -0.1 0.36 -0.98 -0.55 -0.35 0.44 0.5 0.25 0.25 -0.61 0.39 0.28 -0.64 0.71 -0.77 -0.9 -1.58 -0.36 -0.56 1.14 0.92 0.36 -0.12 -0.05 -0.12 0.18 0.87 0.29 -0.92 -0.21 1.42 0.13 -0.14 -1.04 -0.18 0.5 0.73 -0.32 -0.59 0.17 0.03 -0.53 0.08 -0.12 -1.77 -1.78 -1.25 -1.22 -2.24 -1.1 -0.56 -0.07 -1.03 -1.0 -1.87 0.51 -0.21 -1.21 -0.61 -1.58 -0.06
AGT23092 (N559_1330)
-2.13 -2.07 1.25 -0.0 0.23 -0.45 0.02 0.59 -1.84 -1.86 -1.68 -0.0 0.86 -0.84 1.22 -1.66 0.01 -2.51 -1.19 -0.7 -0.08 -0.46 -0.27 0.31 0.85 -0.35 0.16 -1.39 -0.57 -0.81 -0.21 -0.74 1.08 1.16 0.66 1.26 -0.12 0.88 0.49 0.36 0.38 -0.26 -0.84 -1.82 -0.61 -0.49 0.88 0.52 -0.57 -0.65 -0.47 -0.25 0.01 0.83 0.02 -0.43 2.33 1.01 -0.26 0.1 0.15 0.45 1.16 0.99 0.23 -0.44 0.31 0.36 -0.94 -1.22 -2.1 -1.52 -1.59 -2.08 -1.76 -0.74 -0.78 -0.4 -0.8 -2.2 -1.98 -0.22 -0.2 0.58 -0.85 -0.46 -0.54 -0.7
AGT23128 (N559_1366)
-1.68 -1.88 0.57 -0.61 -0.34 -0.63 -0.56 -0.99 -1.06 -1.46 -0.91 0.77 0.85 0.5 0.62 0.78 0.33 -1.74 -1.02 -0.9 1.94 -1.19 -0.13 0.37 0.85 0.28 0.3 -0.39 0.25 -0.23 0.13 -0.14 -0.18 1.54 0.54 0.45 -0.06 0.01 0.94 0.11 0.89 0.06 -1.28 -2.02 -0.51 0.37 0.65 0.42 0.25 -0.0 -0.16 -0.31 0.17 0.4 0.23 0.01 0.76 1.5 0.01 0.57 0.01 0.1 1.54 -0.05 0.29 -0.14 0.37 0.42 -0.41 -0.63 -1.16 -1.35 -1.05 -1.59 -1.46 -1.11 -1.83 -1.65 -0.2 -1.8 -1.74 -1.34 -1.22 -0.67 -1.74 -1.86 -1.4 -1.35
AGT23135 (N559_1373)
-1.08 -0.94 0.9 0.6 0.64 0.87 0.76 -0.06 -1.38 -0.83 -0.48 -0.37 0.73 0.45 0.62 0.33 0.74 -3.0 0.58 0.56 2.53 -1.16 -0.5 -0.22 0.8 -0.64 0.01 -0.14 -0.14 0.05 -0.45 -0.18 0.28 0.06 0.39 0.12 0.02 0.56 -0.44 0.52 0.46 0.0 -0.44 -0.76 -1.18 0.05 0.88 0.76 -0.14 0.09 -0.71 -0.68 -0.48 0.53 -0.58 -0.49 -0.05 0.23 -0.69 -0.11 -0.83 -0.19 0.06 0.21 0.53 0.11 -0.22 -0.11 -0.09 -0.28 -1.04 -0.59 -0.71 -1.08 -0.82 -0.44 -0.88 -0.43 -0.52 -1.04 -0.87 -1.04 -1.07 0.39 -1.09 -0.78 -1.28 -1.13
AGT23230 (N559_1476)
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AGT23275 (N559_1522)
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AGT23289 (N559_1537)
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AGT23291 (N559_1539)
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AGT23292 (N559_1540)
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AGT23340 (N559_1589)
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AGT23370 (N559_1624)
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AGT23377 (N559_1631)
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AGT23393 (N559_1647)
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AGT23415 (N559_1671)
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AGT23428 (N559_1684)
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AGT23429 (N559_1685)
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AGT23438 (N559_1696)
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AGT23441 (N559_1699)
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AGT23530 (N559_1794)
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AGT23531 (N559_1795)
-1.67 -1.35 0.39 1.26 0.83 -1.95 0.62 0.87 -1.25 -1.07 -1.04 1.42 0.96 0.6 0.85 -1.69 1.11 -6.87 1.42 1.25 1.83 -1.72 -0.76 -0.5 0.64 -0.91 -0.46 -0.21 0.08 -0.3 -1.49 -0.62 -0.6 0.71 -0.15 -0.28 -0.83 0.51 1.04 -0.72 0.72 -0.89 -0.02 -1.5 -1.5 1.01 0.45 0.25 0.08 -0.05 -0.78 -0.66 -0.32 0.75 -0.03 -0.59 1.42 1.42 -0.23 -0.28 -0.65 -0.81 0.71 0.56 -0.66 -0.92 -0.5 -0.86 -0.29 -0.76 -1.24 -1.4 -0.72 -1.09 -1.33 -0.67 -0.97 -0.76 0.72 -1.2 -1.05 -0.11 -1.79 -0.48 -1.25 -0.96 -2.26 -1.63
AGT23533 (N559_1797)
-0.68 -0.48 -1.96 -1.32 -3.42 0.34 -0.13 -3.69 -2.9 -1.01 -0.24 -1.65 -1.95 -2.55 1.41 -1.47 -2.1 -7.36 -0.78 -1.19 -0.46 -1.45 -1.02 -0.4 1.24 -1.28 -0.01 0.05 -0.01 -0.83 -1.98 -0.42 -0.02 1.44 -0.4 0.71 -1.25 0.61 2.12 -0.39 1.65 -1.05 0.3 -0.47 -1.49 -3.29 1.0 1.01 -0.01 0.01 0.04 0.01 -0.71 0.71 -0.5 -1.06 2.59 2.34 0.51 -0.43 1.36 -0.4 1.44 0.58 -1.58 -1.23 -0.4 -0.65 -0.89 -0.62 -0.08 -2.23 -3.85 0.38 0.37 -4.18 -0.25 0.19 -1.62 -0.42 0.04 -3.62 0.42 -1.84 -0.26 0.39 -1.68 -0.89
AGT23554 (TetR)
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AGT23583 (N559_1850)
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AGT23632 (N559_1899)
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AGT23692 (N559_1960)
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AGT23759 (YchM)
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AGT23763 (N559_2042)
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AGT23845 (N559_2129)
-1.29 -1.24 1.28 0.26 0.15 2.05 0.21 -0.73 -0.82 -1.62 -1.25 1.76 0.28 -0.2 1.81 -1.59 0.14 - 0.23 -0.25 1.6 -0.58 0.71 0.69 0.65 -0.69 0.41 -0.48 0.21 -0.74 0.39 -0.31 0.09 0.88 -0.64 -0.31 -0.53 0.28 0.37 -0.25 0.42 -0.24 -0.74 -1.91 -0.82 -0.2 0.51 0.56 0.21 -0.16 -0.96 -0.54 -0.38 -0.07 -0.53 -0.72 0.48 1.15 -0.32 -0.13 -0.96 -0.36 0.88 0.91 -0.24 -0.11 0.69 0.62 -0.84 -0.23 -0.4 -0.96 -2.4 -1.47 -1.53 -2.4 -1.25 -1.2 0.07 -1.04 -1.5 -2.49 -0.37 0.07 -1.65 -1.49 -0.88 -0.52
AGT23941 (N559_2230)
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AGT23942 (N559_2231)
-1.06 -0.95 0.27 0.4 0.57 -1.49 2.08 -0.01 -2.06 -0.72 -1.17 -0.34 1.55 -0.65 1.67 -1.04 -0.73 -4.14 -0.01 0.13 2.6 -1.14 -0.51 -0.12 1.63 -0.52 0.41 -0.01 0.18 0.6 -0.31 -0.14 -1.13 -0.02 -0.2 1.25 -0.91 -0.46 -0.21 -0.41 1.59 -0.59 0.12 -0.87 -1.18 -1.73 1.38 1.4 0.18 0.02 -0.64 -0.61 -0.37 0.55 -0.57 -0.65 -0.35 0.03 -0.02 -0.02 -0.44 -0.02 -0.02 0.78 -0.68 -0.87 -0.12 -0.27 0.39 -0.18 -0.77 -3.37 -4.37 -1.13 -1.39 -2.92 -0.52 -0.58 -4.04 -0.75 -0.99 -2.88 -1.25 -0.39 -0.68 -0.4 -2.49 -1.04
AGT23988 (N559_2285)
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AGT23993 (N559_2290)
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AGT23996 (N559_2293)
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AGT24029 (N559_2328)
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AGT24124 (N559_2431)
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AGT24182 (N559_2496)
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AGT24293 (N559_2617)
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AGT24294 (LysR)
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AGT24421 (DmsD)
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AGT24447 (DcuS)
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AGT24535 (N559_2866)
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AGT24541 (N559_2872)
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AGT24551 (DbpA)
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AGT24572 (N559_2907)
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AGT24677 (N559_3014)
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AGT24679 (N559_3016)
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AGT24704 (N559_3041)
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AGT24780 (N559_3118)
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AGT24797 (N559_3136)
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AGT24812 (N559_3152)
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AGT24813 (N559_3153)
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AGT24920 (N559_3262)
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AGT24921 (N559_3263)
0.02 -0.15 -1.53 -0.57 -1.1 -2.5 -0.3 -1.42 -2.54 0.27 0.43 -0.77 0.02 0.87 -0.45 -0.39 0.87 - 0.41 0.15 1.84 -0.5 -0.56 -0.53 0.95 -0.68 -0.17 -0.49 -0.31 -0.72 -1.03 -0.38 -0.7 1.04 -0.47 -0.19 -0.82 -0.13 1.75 -0.69 0.79 -0.61 -0.72 -0.79 -0.08 0.84 0.69 0.7 -0.31 -0.36 -0.42 -0.67 -1.26 0.53 -0.93 -0.89 1.49 2.05 -0.41 -0.49 0.41 -1.05 1.04 -0.08 -0.53 -0.15 -0.53 -0.51 -0.39 -0.24 0.83 -3.1 -5.27 0.43 0.48 -2.5 0.32 0.18 -1.36 0.29 0.17 -1.45 0.09 -2.48 0.45 0.29 -1.52 0.44
AGT25154 (RhlE)
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AGT25179 (N559_3531)
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AGT25276 (N559_3634)
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AGT25302 (N559_3660)
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AGT25558 (N559_3923)
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AGT25572 (N559_3937)
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AGT25584 (N559_3949)
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AGT25586 (N559_3951)
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AGT25612 (N559_3981)
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AGT25808 (N559_4183)
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AGT25832 (N559_4207)
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AGT25891 (HrpB)
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AGT25934 (N559_4321)
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AGT26046 (N559_4441)
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AGT26047 (N559_4442)
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AGT26065 (N559_4460)
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AGT26066 (N559_4461)
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AGT26082 (DnaI)
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AGT26277 (N559_4685)
-1.42 -0.67 0.41 -0.38 -0.35 1.19 0.42 -0.0 -1.01 -1.01 -0.48 -0.49 0.33 -0.13 -0.14 -0.51 0.36 -1.62 -0.13 -0.34 0.39 0.08 -0.34 -0.18 0.71 -0.2 0.07 -0.09 0.4 -0.02 -0.28 0.01 0.1 0.23 -0.1 0.71 -0.29 0.04 0.17 -0.26 1.38 -0.24 -0.5 -1.13 0.01 -0.04 0.61 0.59 0.4 0.38 0.14 0.11 0.01 0.73 0.08 -0.22 0.89 0.14 0.06 -0.17 0.92 0.03 0.23 0.37 -0.22 0.06 -0.18 -0.16 -0.04 0.05 0.42 -1.81 -0.78 -1.38 -0.92 -0.62 -1.04 -0.43 1.2 -1.15 -0.76 -0.11 0.29 -0.08 -1.22 -0.62 -1.58 -0.17
AGT26322 (N559_4731)
-1.7 -1.69 1.94 -0.06 -0.52 0.32 0.67 -0.42 -1.55 -1.85 -1.51 1.75 0.78 0.07 0.67 0.23 0.62 -3.61 0.26 -0.06 1.75 -1.33 -0.45 -0.24 0.76 -0.29 -0.02 -0.2 0.33 -0.46 -0.36 -0.18 0.6 1.13 -0.27 0.86 -0.53 0.36 0.65 -0.3 1.33 -0.33 -0.97 -2.07 -1.8 0.2 0.6 0.57 0.33 0.31 -0.57 -0.51 -0.46 0.54 -0.48 -0.68 1.96 1.43 -0.59 -0.11 0.29 -0.84 1.13 0.43 -0.13 -0.44 -0.24 -0.29 -0.53 -0.46 -1.25 -1.04 -2.28 -1.64 -1.65 -2.13 -1.83 -1.58 -1.0 -1.51 -1.47 -1.91 -1.81 -0.69 -1.74 -1.68 -0.64 -1.98
AGT26339 (N559_4748)
-1.11 -0.62 0.03 0.03 0.25 0.1 0.16 0.35 -0.37 -0.77 -0.46 -0.58 0.77 -0.1 0.64 -1.22 0.33 -2.11 -0.11 -0.08 0.41 0.26 0.07 0.36 0.87 -0.24 0.28 -0.36 0.14 -0.05 -0.2 -0.11 0.24 -0.13 -0.03 1.01 -0.02 0.28 -0.18 0.04 0.68 -0.12 -0.57 -1.31 -0.33 0.51 0.88 0.74 0.14 0.33 0.28 0.31 0.1 0.48 -0.02 -0.26 0.75 -0.08 0.46 0.24 0.12 0.35 -0.13 0.36 0.36 -0.19 0.36 0.35 -0.13 -0.29 -0.47 -0.48 -1.72 -0.85 -0.68 -1.45 -0.77 -0.23 -0.45 -0.93 -0.24 -1.42 -0.18 0.61 -0.76 -0.35 -0.72 -0.65
AGT26360 (N559_4769)
-0.56 -0.41 0.01 0.03 0.16 -0.77 0.47 0.7 0.28 -0.45 -0.34 -1.04 1.36 0.25 0.79 -0.64 0.47 -4.28 -0.38 -0.11 1.97 -0.97 -0.22 0.08 0.79 -0.71 0.02 -0.41 -0.17 -0.1 -0.19 -0.32 -0.03 0.52 0.11 0.81 -0.64 0.16 0.38 -0.12 1.0 -0.49 -1.07 -0.74 -0.71 0.42 0.73 0.56 -0.17 -0.15 -0.49 -0.59 -0.46 0.7 -0.37 -0.86 0.48 0.69 -0.21 -0.34 -0.27 -0.26 0.52 0.4 -0.28 -0.45 0.08 0.04 -0.12 -0.34 -0.47 0.1 -1.84 -0.51 -0.51 -0.89 -0.56 -0.49 -0.99 -0.51 -0.28 -1.08 -0.55 1.14 -0.34 -0.31 0.24 -1.01
AGT26384 (N559_4793)
-1.67 -1.34 -0.04 0.59 -0.84 -1.15 2.54 -2.05 -4.24 -2.03 -1.22 -0.06 -1.96 -0.98 1.72 -0.01 -1.55 -3.62 2.74 1.91 -0.14 -2.18 -0.09 -0.13 1.16 -0.96 -0.02 -0.35 -0.61 0.99 -1.09 -0.42 -0.85 0.39 -1.22 1.05 -0.68 0.05 0.77 -1.35 1.08 -0.74 0.17 -1.23 -2.47 - 0.93 0.61 -0.61 -0.52 -1.15 -1.43 -1.11 0.3 -1.22 0.07 3.03 0.97 -1.37 -0.39 1.49 -0.79 0.39 0.93 -0.9 -0.29 -0.13 -0.26 0.91 0.61 -1.97 -4.96 -3.97 -2.09 -2.21 -6.1 -2.0 -1.61 - -2.11 -1.57 - -2.6 -3.99 -2.19 -1.59 -3.94 -2.18
AGT26385 (PhnF)
-1.92 -2.1 -0.36 0.41 0.16 -1.88 0.77 -0.32 -3.8 -1.77 -1.76 0.56 -0.13 -0.24 1.37 -1.91 1.0 -5.94 1.04 0.66 2.12 -1.07 -0.3 -0.1 1.46 -0.68 0.11 0.13 0.06 0.43 -0.51 -0.32 0.07 0.55 0.25 0.37 -0.4 0.59 0.81 0.03 1.13 -0.1 0.01 -1.56 -1.46 - 1.26 0.95 0.06 0.01 -0.64 -0.97 -1.12 0.44 -0.44 -0.42 3.02 1.26 -1.0 -0.06 0.5 -0.35 0.55 0.61 -0.23 -0.18 -0.1 -0.54 0.11 0.0 -1.35 -3.35 -3.53 -1.8 -1.63 -2.49 -1.65 -1.24 - -1.83 -1.26 - -1.63 -1.09 -1.85 -1.42 -4.23 -1.11
AGT26564 (N559_4982)
0.21 0.01 -1.58 -0.68 -0.75 -1.62 -1.33 0.7 -2.51 0.01 0.06 -0.33 0.62 -0.83 0.12 0.47 -1.11 -0.79 -0.78 -0.73 0.6 -1.47 0.11 0.28 0.31 0.43 0.21 0.47 0.81 0.68 0.7 0.6 0.08 -0.57 0.53 0.62 0.62 0.03 -1.08 0.23 0.54 0.65 0.54 -1.25 0.12 -1.91 0.24 0.12 0.81 0.69 -0.25 -0.34 -0.26 0.41 -0.3 0.43 -0.38 -1.14 0.01 0.48 -0.24 0.33 -0.57 0.07 0.54 0.57 0.28 0.14 0.41 0.58 0.27 -1.63 -6.41 0.51 0.3 -6.96 0.31 -0.04 -2.69 0.1 0.06 -6.92 -0.12 -0.34 0.26 0.1 -1.5 0.04
AGT26565 (N559_4983)
-0.28 -0.03 -0.1 -0.09 -0.11 0.05 -0.34 -0.26 -1.2 -0.5 0.0 0.19 -0.03 0.42 -0.37 0.55 0.17 -2.15 -0.38 -0.38 1.42 0.8 -0.71 -0.46 0.71 -0.49 -0.11 -0.61 0.07 -0.05 -0.28 -0.23 -0.12 -0.1 0.14 1.09 -0.16 -0.07 0.47 -0.09 1.23 -0.17 -0.3 -1.31 0.65 0.06 0.59 0.53 0.07 0.12 0.28 0.3 0.23 0.8 0.26 -0.24 0.5 0.34 0.25 -0.24 0.7 0.14 -0.1 0.78 -0.07 -0.38 -0.46 -0.45 -0.27 -0.24 0.2 -1.92 -5.76 -0.18 0.21 -4.99 -0.34 0.07 -3.85 0.15 -0.12 -6.26 0.24 -0.53 -0.41 -0.29 -2.04 0.77
AGT26567 (N559_4985)
-1.21 -1.1 0.08 0.5 0.03 -1.6 0.17 0.62 -1.01 -1.35 -1.13 0.28 1.26 -0.31 0.46 -0.67 0.12 -3.18 0.81 0.9 1.17 -0.05 0.3 0.4 -0.07 -0.37 0.01 0.38 0.46 0.07 -0.24 0.18 0.09 -0.1 0.12 -0.65 -0.21 0.74 -0.15 -0.06 0.05 -0.08 0.21 -0.93 -0.56 -0.56 0.1 -0.02 0.46 0.55 -0.21 -0.22 -0.16 0.82 -0.09 -0.38 0.18 0.11 -0.25 0.26 0.38 -0.17 -0.1 0.29 0.27 -0.2 0.4 0.35 0.04 -0.12 -0.22 -0.46 -0.32 -1.41 -1.2 0.06 -1.01 -0.87 0.96 -1.18 -1.02 0.59 -0.34 0.68 -1.21 -1.08 -0.56 -0.27
AGT26626 (PriA)
-1.18 -0.7 0.97 0.02 0.36 -0.96 0.16 0.12 -0.39 -0.95 -0.6 -0.49 0.89 -0.19 0.9 -1.66 0.56 -4.56 -0.12 0.34 0.77 0.16 -0.36 -0.1 0.74 -0.68 0.01 0.02 0.21 0.06 -0.51 -0.11 0.06 -0.12 0.1 0.48 -0.52 0.18 -0.49 -0.43 0.95 -0.46 -0.15 -1.35 -0.12 0.03 0.59 0.57 0.21 0.3 0.16 0.15 0.15 0.67 0.12 -0.44 1.42 -0.02 0.19 -0.07 0.38 0.11 -0.12 0.53 -0.29 -0.37 -0.1 -0.05 0.07 -0.17 -0.11 0.1 -0.99 -0.93 -0.49 -0.15 -0.85 -0.46 -0.6 -0.85 -0.41 -0.45 0.06 0.97 -0.9 -0.24 -0.73 -0.47
AGT26686 (N559_5112)
-1.51 -0.68 1.44 -0.67 -0.47 1.01 -1.1 -0.27 -0.65 -0.95 -0.53 -0.7 0.48 -0.1 -0.47 -0.49 0.37 -2.32 -1.8 -1.79 0.8 0.53 -0.24 0.15 0.19 0.09 0.13 -0.31 0.59 -0.34 0.09 0.1 0.23 0.26 0.12 1.12 0.05 -0.07 0.15 -0.13 1.12 0.01 -0.89 -1.54 -0.16 -0.15 0.22 0.23 0.59 0.65 0.22 0.41 0.14 0.48 0.17 -0.1 1.53 0.25 0.26 0.18 0.33 0.07 0.26 0.41 0.24 -0.04 0.15 0.26 -0.32 -0.41 -0.12 -0.99 -1.62 -1.05 -0.56 -1.21 -1.03 -0.47 0.62 -1.27 -0.8 -0.42 0.1 0.17 -1.0 -0.48 -1.06 -0.36
AGT26702 (N559_5128)
-1.53 -1.37 0.84 0.36 0.49 0.25 0.82 -1.27 -2.21 -1.61 -1.69 -0.16 -0.58 -0.8 0.23 -0.22 -0.49 -3.76 -0.63 -0.66 1.77 -0.53 0.4 0.95 0.68 -0.29 0.4 -0.46 0.61 -0.18 1.4 0.44 0.09 1.36 0.28 0.65 -0.23 0.4 0.87 -0.07 0.38 -0.11 -0.93 -1.06 -1.18 -1.2 0.61 0.52 0.61 0.57 -0.29 -0.19 -0.14 0.27 -0.14 -0.42 0.54 1.43 -0.32 -0.04 -0.44 0.03 1.36 0.35 0.02 -0.33 0.95 0.84 -0.37 -0.32 -0.35 -1.66 -1.56 -1.43 -1.48 -1.11 -1.43 -1.3 -0.46 -1.68 -1.15 -0.81 -0.25 -0.67 -1.28 -1.12 -1.3 -1.41

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.