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Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
10403S,Log
10403S,WT
10403S,LMRG 00730 deleted
10403S,delta sigB,Log
10403S,WT,Log
10403S,virR deleted,Log
10403S,WT,Bile
10403S,WT,ctrl
10403S,delta sigB,Bile
10403S,delta sigB,ctrl
10403S
ATCC 19115,Lactic acid(1h)
ATCC 19115,ctrl
WT
EGD
ATCC 19115,linalool
EDGe,37C(20min)
EDGe,20C(20min)
EDGe,20C(3h)
EDGe,Light
EDGe,Dark
EGD,MQ Water(0h)
EGD,MW Water(10min)
EGD,0.1875% L.plantarum(10min)
EGD,MQ Water(1h)
EGD,0.1875% L.plantarum(1h)
EGD,0.1875% L.plantarum+1mg/ml Pro-K(1h)
EGD,MQ Water(at 0h)
EGD,MQ Water(at 3h)
EGD,Ampicillin 0.03g/ml(at 3h)
EGD,Tetracycline 0.035g/ml(at 3h)
EGD,Gentamicin 0.3g/ml(at 3h)
EGD,Co-trimoxazole 0.2g/ml(at 3h)
EGDe
EGD,WT
37C,Late-Log
EGD,delta Lmo1408
EGD,delta Lmo0422
EGD,delta Lmo0599
EGDe,Lincomycin 0.25g/ml
EGDe,Chloramphenicol 0.4g/ml
EGDe,Erythromycin 0.03125g/ml
EGDe,Kanamycin 0.5g/ml
EGDe,Ofloxacin 2g/ml
EGDe,Ampicillin 1g/ml
EGDe,Bacitracin 8g/ml
EGDe,ctrl
EGDe,Lincomycin 0.5g/ml
EGDe,WT
EGDe,delta lftR
EGDe,37C,Late-Log
EGDe,WT,Light
EGDe,WT,Dark
EGDe,Light
EGDe,Dark
FFH,30C
FFH,10C
H1,37C,Late-Log
H2,37C,Late-Log
H3,37C,Late-Log
H5,37C,Late-Log
H6,37C,Late-Log
H7,37C,Late-Log
H8,37C,Late-Log
H10,37C,Late-Log
H11,37C,Late-Log
H17,37C,Late-Log
H19,37C,Late-Log
H27,37C,Late-Log
H28,37C,Late-Log
H31,37C,Late-Log
H32,37C,Late-Log
568
H7858,Log
H7858,WT,Bile
H7858,WT,ctrl
H7858,delta sigB,Bile
H7858,delta sigB,ctrl
LL195,ctrl
LL195,acid
Lm1,4C,Late-Stationary
Lm1,4C,Late-Log
Lm1,4C,Log
Lm1,WT,4C,Log
Lm1,4C,Lag
Lm1,20C,Late-Stationary
Lm1,20C,Late-Log
Lm1,20C,Log
Lm1,WT,20C,Log
Lm1,20C,Lag
LO28,37C,Late-Log
N12-0605,ctrl
N12-0605,acid
N13-0047,ctrl
N13-0047,acid
N13-1507,ctrl
N13-1507,acid
rli47,Log
WT,Log
Scott A,37C,Late-Log
AKI48030 (dnaC)
 -0.47 -0.39 0.32 -0.13 -0.08 -0.18 -0.52 -0.44 -0.29 -1.01 -1.41 0.97 -1.01 -0.9 0.25 -0.45 -0.29 -1.13 -1.36 0.16 0.24 0.16 0.31 0.08 -0.07 0.26 0.05 0.2 0.26 0.52 0.4 0.35 0.45 0.45 -0.28 -0.08 -0.76 -0.39 -0.69 0.31 0.19 0.23 0.3 0.37 0.29 0.31 0.28 0.13 -0.31 -0.41 0.82 0.49 0.25 0.17 0.15 -0.22 -0.6 0.57 -0.21 -0.32 -0.31 -0.32 -0.41 0.26 0.94 0.19 0.13 -0.31 0.03 -0.36 0.02 -0.08 -0.71 -2.24 -0.91 -0.89 -0.95 -1.29 0.1 0.14 0.03 0.2 0.16 0.07 0.41 -0.22 -0.03 -0.46 -0.48 -0.13 -0.1 0.36 0.1 0.5 0.66 0.21 -0.1 0.44 0.61 -0.02
AKI48221 (rtcB)
 -0.51 -0.44 -0.6 -0.49 -1.73 -1.78 0.46 0.44 0.29 0.57 -0.06 0.61 0.55 1.21 0.78 -1.3 -0.19 -0.65 -1.21 0.16 0.28 0.88 0.44 0.74 0.61 1.43 0.37 0.71 1.92 0.78 0.76 1.85 0.54 -1.41 -1.3 -0.17 -1.42 -0.67 -1.43 0.13 -0.08 -0.46 -1.1 -0.92 -0.94 -0.96 -0.13 1.05 -0.64 -0.84 0.1 -0.26 0.18 0.58 0.21 -0.08 -0.11 -1.26 -0.27 -1.66 -1.85 -1.13 -1.52 0.14 0.49 1.35 0.22 0.17 -0.05 -1.56 -1.1 -0.08 1.02 -0.31 0.05 0.77 0.1 0.37 -0.58 -0.72 -2.65 -1.52 -0.48 -0.03 -0.71 -1.72 -1.85 -0.24 0.19 0.5 -1.03 -0.64 -0.76 -0.4 -1.27 -0.57 -1.45 -1.01 -1.39 0.13
AKI48240 (L2625_00292)
 -0.03 0.76 1.95 0.13 -0.01 -0.16 -0.97 -1.24 -0.73 -1.14 -0.31 -1.42 -2.48 0.46 -0.24 -4.41 -1.61 -0.68 -0.64 -0.22 -0.56 -0.57 -0.76 -0.94 -1.3 -1.01 -1.21 -0.56 -0.82 -0.18 -0.43 -0.83 -0.68 -1.38 0.31 0.14 0.6 0.59 0.87 -0.43 -0.1 -0.21 -0.64 -0.45 -0.56 0.11 -0.28 -1.09 -0.23 0.69 0.14 -0.81 -0.21 -0.28 -0.46 0.24 0.21 -0.2 -0.76 -0.77 -1.15 -1.48 -0.8 0.2 -0.86 -0.98 0.01 -0.43 -0.36 -0.97 0.15 -0.43 -0.14 -0.45 -0.48 -0.81 -0.62 -0.86 0.49 -0.41 1.21 1.6 1.84 1.46 1.65 -0.32 0.54 0.71 0.36 -0.61 0.71 0.68 0.03 0.6 0.03 0.98 -0.69 1.01 0.6 -0.32
AKI48481 (L2625_00543)
 -0.37 0.23 0.3 -0.02 -0.42 -0.47 0.32 0.43 0.36 0.06 0.24 -2.61 -3.37 0.36 -0.73 -4.61 -0.41 -0.17 -0.35 0.51 0.49 0.63 0.17 0.43 0.32 0.35 0.29 0.51 0.13 0.76 0.68 0.07 0.19 0.31 -0.18 -0.38 -0.27 -0.1 -0.16 0.02 -0.11 -0.06 -0.18 -0.17 -0.56 0.32 0.54 -0.14 -0.44 -0.39 0.94 0.94 0.56 0.36 0.12 -0.52 0.09 0.29 -2.02 -1.76 -2.25 -1.83 -1.52 0.58 -2.27 -0.15 0.63 -1.86 -3.04 -1.71 0.2 0.63 -0.72 0.19 -0.03 -0.92 -0.23 -0.67 -0.51 -1.45 -1.63 1.7 1.0 0.65 -0.36 0.18 0.55 0.5 0.29 0.1 0.76 -0.9 -1.26 -0.41 -1.42 -0.37 -1.88 1.17 1.01 -1.66
AKI48483 (L2625_00545)
 -0.52 0.13 0.65 -0.34 0.23 0.05 -0.5 -0.71 -0.18 -1.0 -0.84 -3.02 -2.56 -0.67 -0.51 -3.63 -0.48 -0.49 -0.78 0.45 0.41 -0.13 -0.13 -0.37 -0.33 -0.28 -0.22 0.11 0.32 0.66 0.33 0.38 0.24 -0.22 -0.26 -0.38 -0.32 -0.32 -0.51 0.17 0.11 0.35 0.3 0.16 0.28 0.49 0.2 -0.05 -0.69 -0.99 0.95 0.22 0.59 0.54 0.34 -0.09 -0.68 0.41 -3.2 -1.43 -1.22 -2.03 -2.64 1.18 -1.41 0.72 0.55 -2.47 -2.51 -1.61 0.27 0.43 -0.77 -1.66 -0.45 -1.9 -0.29 -1.28 0.45 -1.09 -0.05 1.42 1.21 1.12 0.63 0.25 1.35 1.1 0.51 0.03 0.57 0.26 -0.87 0.62 -0.62 0.73 -2.21 1.17 0.69 -2.54
AKI48521 (L2625_00585)
 -0.38 0.42 0.24 -0.33 0.41 0.36 0.26 -0.27 -0.13 0.1 0.29 -2.97 -1.64 0.04 -0.35 -2.63 -0.16 -0.39 -0.01 0.32 0.26 0.29 0.34 0.07 0.11 0.44 0.09 0.57 0.4 0.88 0.62 0.47 0.53 -0.54 0.16 -0.1 0.35 0.18 0.26 -0.24 -0.19 -0.35 -0.01 -0.3 -0.08 0.04 0.16 -0.17 0.31 0.31 0.56 -0.02 0.51 0.38 0.22 -0.73 -0.33 0.48 -1.95 -0.8 -0.7 -2.43 -1.68 0.47 -1.21 0.36 0.61 -1.33 -1.79 -1.74 0.26 0.14 0.4 -1.07 -0.45 -0.84 -0.49 -0.55 -0.22 -1.41 0.88 0.7 0.39 0.08 0.56 0.54 0.83 -0.23 -0.09 -0.34 0.96 -0.32 -1.5 0.26 -1.74 -0.38 -2.01 0.88 0.72 -1.18
AKI48789 (L2625_00861)
 -1.1 0.04 0.5 -0.56 -0.86 -0.83 -0.78 -0.26 -0.7 -0.88 0.02 -2.74 -2.66 -0.85 0.08 -2.29 -0.64 -0.96 -1.18 -0.08 -0.2 0.19 0.54 0.43 0.4 0.79 0.42 0.41 0.43 0.75 0.6 0.56 0.61 0.2 -0.37 0.1 -0.7 -0.51 -0.49 0.18 0.22 0.16 0.23 0.26 0.3 0.52 0.14 -0.08 0.07 -0.44 0.53 0.87 0.2 0.19 0.14 -0.52 -0.26 0.39 -0.46 -1.13 -1.35 -1.39 -1.01 0.31 -1.3 -0.27 -0.26 -0.45 -0.02 -0.81 0.17 0.09 -0.33 -0.18 -0.57 -0.04 -0.9 -0.53 0.29 0.51 -1.47 -0.27 0.52 0.33 0.92 0.29 -0.69 -0.06 -0.41 0.52 0.69 0.64 0.65 0.04 -0.19 0.36 -0.63 1.17 1.08 0.05
AKI48793 (L2625_00866)
 -0.15 0.61 1.61 0.02 -1.11 -1.14 -0.9 -0.9 -0.9 -1.02 -0.11 -2.21 -1.84 0.02 0.13 -3.92 -0.33 -0.49 -0.1 -0.12 -0.34 -0.66 -0.35 -0.46 -0.7 -0.32 -0.59 -0.27 -0.39 0.24 -0.31 -0.41 -0.32 -0.25 -0.31 0.21 -0.27 -0.32 -0.28 -0.72 -0.6 -1.06 -0.86 -0.75 -0.46 -0.09 -0.4 -1.02 -0.55 -0.69 -0.1 -0.62 -0.13 -0.23 -0.5 0.6 0.93 0.51 -1.08 -0.09 0.09 -1.25 -0.92 0.52 -0.42 -0.16 0.74 -0.65 -1.24 -0.82 0.34 0.15 0.32 -0.64 -1.07 -1.79 -1.09 -1.28 0.72 -0.04 0.97 1.52 1.24 1.33 0.84 0.63 0.85 0.03 -0.31 -0.13 1.07 0.62 0.4 0.64 0.73 0.35 -0.55 1.7 1.17 -0.88
AKI48834 (alr)
 -0.27 0.81 1.21 0.07 0.38 0.27 0.33 0.49 0.22 0.16 0.19 -2.54 -1.8 -0.57 -0.28 -3.83 -0.97 -1.02 -1.04 0.18 0.23 -0.13 0.24 0.24 0.19 0.59 0.33 0.44 0.42 0.73 0.51 0.41 0.55 -0.84 -0.76 0.17 -1.0 -0.79 -0.92 -0.11 -0.01 0.0 -0.08 -0.16 0.13 0.24 0.26 -0.05 -0.73 -0.63 0.62 0.2 0.21 0.13 0.12 -0.6 -0.8 0.81 -1.79 -0.45 -0.61 -2.06 -1.59 1.07 -2.15 -1.16 -0.74 -1.44 -1.51 -1.51 1.0 -0.84 0.3 -0.49 -0.82 -0.92 -1.07 -1.01 0.23 -0.32 -0.55 0.93 0.65 0.41 0.57 1.09 0.78 0.48 0.37 0.53 0.69 0.36 -0.52 0.6 -0.74 0.27 -1.4 0.32 0.15 -0.61
AKI48847 (L2625_00921)
 -0.68 0.24 0.46 -0.3 -1.25 -1.13 0.36 0.33 -0.13 0.12 -0.18 -0.35 -1.35 -0.21 -0.2 -1.28 -0.57 -1.04 -1.0 -0.03 0.04 0.05 0.13 -0.11 -0.16 -0.24 0.03 -0.13 0.02 0.48 -0.02 -0.1 0.38 -1.35 -0.23 0.25 -0.35 -0.1 -0.35 -0.07 -0.47 -0.02 0.19 0.36 -0.33 0.07 -0.34 -0.58 -0.47 -0.59 1.56 0.68 0.3 -0.23 -0.08 -0.13 -0.26 0.34 -1.0 -2.09 -1.78 -1.14 -1.69 0.4 -0.6 0.45 0.25 -0.16 -0.29 -1.01 -0.2 0.68 0.02 0.47 -0.13 -0.38 -0.56 -0.63 0.95 -0.06 -1.57 0.86 0.63 0.54 1.7 -0.14 -0.35 0.37 0.02 0.45 0.17 0.89 -0.03 0.83 -0.61 -0.29 -1.81 0.64 0.43 0.65
AKI48954 (L2625_01036)
 0.5 1.13 0.55 0.84 0.3 0.37 -0.0 0.45 0.2 0.17 1.56 -3.4 -2.07 0.14 0.58 -4.51 -0.16 0.0 0.12 0.28 0.03 -0.05 0.16 -0.08 0.01 0.45 0.11 0.29 0.21 0.28 0.42 0.21 0.13 -0.84 0.22 -0.07 0.38 0.03 0.55 0.3 0.25 0.51 0.43 0.2 0.27 0.57 0.52 0.21 0.96 0.5 0.4 0.36 0.36 0.19 0.16 -1.89 -1.85 0.13 -3.34 -1.08 -1.3 -3.0 -2.98 0.35 -3.23 -0.2 0.23 -2.8 -3.96 -2.93 0.35 0.33 0.93 -0.68 -1.08 -0.87 -1.19 -1.01 -1.37 -1.75 -1.8 0.61 0.94 0.76 0.63 -0.34 -0.15 0.25 0.47 0.43 0.73 -1.32 -1.57 -1.41 -1.7 -1.35 -3.12 0.62 0.51 -3.04
AKI49020 (pycA)
 -0.58 0.11 0.69 -0.12 -0.07 -0.15 -0.27 -0.29 -0.39 -0.53 -0.64 -2.87 -2.74 -1.18 -0.03 -4.02 -0.61 -0.68 -0.71 0.39 0.38 -0.06 0.08 -0.04 -0.18 0.2 -0.04 0.26 0.21 0.35 0.36 0.23 0.18 -0.83 0.12 0.06 0.21 0.34 0.3 0.07 -0.03 0.13 0.12 0.07 0.16 0.34 0.06 -0.06 0.1 0.24 0.33 0.46 0.45 0.32 0.45 -0.22 0.9 0.31 -1.69 -1.92 -2.18 -1.9 -1.56 0.7 -1.1 0.6 0.25 -1.44 -1.6 -1.1 0.25 -0.08 0.32 0.69 -10.63 -11.78 -11.3 -11.68 0.64 -0.58 -1.04 0.82 1.25 1.38 1.55 -0.56 0.08 0.11 0.14 0.41 0.31 0.6 -0.73 0.43 -0.72 0.66 -1.3 0.92 1.01 -0.67
AKI49273 (xerC)
 -0.73 0.04 1.12 -0.55 -0.78 -0.79 -0.88 -0.03 -0.71 -0.7 -0.59 -2.72 -2.24 -0.36 0.52 -2.06 -0.38 -0.33 -0.22 0.26 0.13 0.35 0.43 0.38 0.28 0.46 0.23 0.13 0.41 0.72 0.26 0.35 0.42 0.49 0.21 0.23 0.07 0.28 0.07 -0.04 -0.18 -0.34 -0.23 -0.31 -0.16 0.17 0.12 -0.16 -0.25 0.22 0.59 0.57 0.4 0.23 0.19 -0.43 -0.46 0.5 -0.51 -0.68 -0.89 -0.89 -0.84 0.65 -1.01 -0.07 0.44 -0.59 -0.84 -1.1 0.49 0.29 -1.38 -0.43 0.25 0.9 -0.08 0.21 -0.23 0.28 -0.47 -0.0 -0.5 -0.72 -0.03 0.55 -0.73 -0.42 -0.43 0.62 0.78 -0.08 0.16 -0.06 -0.72 0.18 -0.08 0.73 0.39 0.57
AKI49349 (L2625_01446)
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AKI49402 (glpP)
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AKI49431 (L2625_01532)
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AKI49432 (dapA)
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AKI49445 (ppaC)
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AKI49616 (dat)
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AKI49620 (L2625_01730)
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AKI49621 (L2625_01731)
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AKI49648 (L2625_01760)
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AKI49649 (L2625_01761)
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AKI49841 (norM)
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AKI49850 (L2625_01997)
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AKI49951 (fur)
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AKI50026 (L2625_02181)
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AKI50027 (ftsZ)
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AKI50028 (ftsA)
 -0.33 -0.36 -0.06 0.09 0.18 0.09 -0.09 0.03 0.04 -0.24 -0.42 -2.51 -3.36 -1.38 -0.32 -3.23 -0.83 -0.72 -0.67 0.1 -0.1 0.12 0.22 0.03 -0.01 0.12 0.09 0.23 0.12 0.3 0.27 0.11 0.07 -0.21 -0.41 0.16 -0.45 -0.44 -0.37 0.07 0.04 0.21 0.16 -0.1 0.17 0.24 -0.01 -0.27 -0.58 -0.54 -0.36 0.17 0.21 -0.12 -0.04 -0.39 0.11 0.06 -0.21 -1.23 -1.35 -1.26 -0.46 0.0 -0.46 -0.55 -0.1 -0.34 -0.05 -0.57 -0.16 -0.41 -0.83 0.88 0.35 0.47 0.43 0.37 0.7 0.67 -2.1 0.93 0.59 0.31 0.21 0.55 0.38 0.13 0.15 0.37 0.47 0.65 0.45 0.74 0.51 0.72 0.03 0.35 0.31 0.43
AKI50044 (L2625_02199)
 -0.58 0.41 0.17 -0.29 -0.33 -0.46 -0.49 -0.26 -0.39 -0.53 0.35 -2.22 -1.62 0.35 0.24 -4.13 -0.81 -0.55 -0.7 0.32 0.25 0.2 0.06 0.09 0.19 0.47 0.2 0.44 0.62 0.65 0.66 0.74 0.5 0.43 -0.47 -0.03 -0.74 -0.65 -0.87 0.09 0.1 -0.12 0.06 0.02 0.2 0.34 0.31 0.1 -0.35 -0.32 0.7 0.55 0.31 0.44 0.16 -0.34 0.12 -0.06 -1.59 -1.34 -0.76 -1.19 -1.11 -0.22 -0.77 0.22 0.01 -0.66 -1.09 -0.69 -0.09 0.39 0.19 0.29 -0.3 -0.61 -0.46 -0.61 0.33 0.11 -1.48 0.47 0.53 0.85 0.42 -0.41 -0.37 -0.12 0.11 0.22 0.57 0.4 0.17 0.1 0.72 0.28 -0.67 0.84 0.67 -0.5
AKI50068 (L2625_02223)
 -0.39 0.49 0.02 0.01 -0.01 0.15 0.02 -0.06 0.13 -0.17 0.93 -2.16 -1.99 -0.68 -0.38 -2.46 -0.67 -1.03 -1.0 0.26 0.13 0.27 0.22 0.22 0.19 0.53 0.25 0.45 0.4 0.68 0.57 0.31 0.6 -1.01 -0.12 0.38 0.03 -0.01 0.14 -0.57 -0.78 -0.68 -0.57 -0.58 -0.62 -0.6 -0.21 -0.43 -0.0 0.36 0.32 0.16 0.26 0.17 0.11 -0.72 -0.17 0.71 -0.7 -0.71 -0.91 -0.98 -0.74 0.6 -1.29 0.13 0.56 -0.69 -0.61 -1.04 0.14 -0.01 0.96 -0.14 -0.49 -0.5 -0.7 -0.58 0.07 -0.21 0.3 0.87 0.83 0.66 0.93 0.46 0.33 -0.21 0.06 -0.02 0.75 0.13 -0.32 0.09 -1.0 0.01 -0.93 0.31 0.32 0.27
AKI50069 (L2625_02224)
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AKI50194 (oppA)
 0.41 1.01 1.83 0.74 -0.94 -0.97 0.73 -1.0 0.6 -0.2 0.91 -3.03 -2.76 -1.94 -0.01 -3.88 -0.6 -0.45 -0.41 0.47 0.47 -0.24 -0.24 0.01 -0.41 -0.12 -0.41 -0.3 -0.34 -0.14 -0.34 -0.59 -0.3 -1.57 0.91 -0.55 1.37 0.89 1.26 -0.91 -0.94 -1.03 -0.8 -0.99 -0.89 -0.9 -0.46 -0.68 0.15 0.83 0.04 -0.32 0.37 0.41 0.6 -0.14 -0.7 0.15 -1.61 -1.99 -1.16 -0.57 -0.63 0.03 1.12 0.11 0.37 -1.5 -1.2 -0.07 -0.5 -0.61 -0.29 -0.38 0.46 -1.57 0.34 -0.71 1.29 -1.08 -1.87 -0.52 0.37 0.18 -0.73 -1.03 0.62 0.45 0.05 -0.28 -0.19 1.07 -1.39 1.11 0.04 1.04 -1.29 0.79 0.89 -1.63
AKI50300 (pgi)
 -0.04 0.3 0.45 0.22 -0.12 -0.08 0.12 -0.13 0.13 -0.13 0.67 -2.96 -2.74 -0.77 0.22 -4.17 -0.34 -0.82 -0.83 0.26 0.23 0.26 0.46 0.33 0.22 0.46 0.28 0.48 0.41 0.57 0.51 0.45 0.54 -0.85 0.32 -0.23 0.59 0.32 0.53 -0.23 -0.31 -0.03 0.05 -0.07 -0.07 0.06 0.16 -0.22 0.44 0.19 0.9 0.49 0.24 0.24 0.28 -0.54 -0.38 0.35 -1.14 -1.48 -1.6 -0.91 -0.94 0.89 -0.64 0.06 0.25 -1.29 -0.96 -0.6 0.19 0.07 0.37 -0.19 0.24 -0.39 0.02 -0.24 0.26 -0.4 -1.76 0.42 -0.03 -0.29 -0.21 0.05 0.27 -0.32 -0.64 -0.65 0.23 0.23 -0.4 0.27 -0.37 0.51 -0.75 0.58 0.54 -0.78
AKI50307 (L2625_02494)
 -0.07 1.31 1.97 0.01 0.56 0.39 -0.32 -1.29 -0.56 -1.12 0.46 -2.72 -0.9 -0.2 0.45 -4.05 -1.42 -0.42 -0.12 -0.19 -0.13 -0.92 -1.18 -1.06 -1.37 -1.08 -1.18 -0.74 -0.45 0.14 -0.62 -0.35 -0.45 -0.76 0.11 -0.08 0.24 0.03 0.3 -1.03 -1.4 -1.24 -1.28 -1.23 -0.84 -0.6 -0.94 -0.97 -0.31 -0.34 -0.09 -1.17 -0.17 0.2 -0.07 0.7 1.3 -0.68 -1.88 -2.12 -1.91 -1.22 -1.13 -0.22 -1.2 -1.32 -0.62 -0.84 -2.37 -1.07 0.15 -1.21 0.99 2.05 -0.63 -1.44 -0.57 -0.92 0.27 -0.73 -1.57 1.69 2.13 1.94 2.27 -0.99 0.1 0.48 0.16 0.05 0.12 0.31 -0.62 0.45 -0.9 0.98 -1.46 1.24 0.24 -1.21
AKI50345 (L2625_02532)
 -0.25 0.74 0.53 0.25 0.62 0.5 0.07 0.01 -0.22 0.15 1.34 -1.46 -1.16 -0.73 -0.17 -3.06 -0.41 0.01 0.22 0.6 0.71 -0.03 -0.03 -0.05 -0.11 0.05 -0.07 -0.08 0.31 0.34 -0.01 0.31 0.01 -1.48 0.14 -0.21 0.36 0.35 0.2 -0.66 -0.64 -0.4 -0.5 -0.37 -0.25 -0.2 -0.69 -0.77 0.22 -0.1 0.63 0.15 0.7 0.8 0.64 -0.02 -0.64 0.17 -2.03 -1.39 -1.52 -1.59 -1.32 0.35 -0.75 -0.32 0.38 -0.95 -1.52 -1.28 -0.01 -0.31 0.85 1.12 -0.51 -0.71 -0.74 -0.31 -0.45 -0.72 -2.44 -0.42 -0.42 0.16 0.28 -0.69 0.48 1.22 1.2 0.95 0.81 -0.37 -0.49 -0.48 0.55 -0.07 -0.77 0.49 0.3 -1.11
AKI50377 (vacB)
 -1.43 0.55 0.89 -0.72 1.04 1.04 -0.61 0.1 -0.82 -0.15 -0.22 -1.8 -1.48 -0.55 0.78 -1.91 -0.41 -0.31 -0.96 0.43 0.47 0.18 0.14 -0.09 -0.02 0.16 0.14 0.29 0.09 0.08 0.37 0.08 0.15 -0.51 -0.9 0.1 -1.06 -0.64 -1.05 0.14 0.18 0.43 0.1 0.27 0.15 0.23 0.2 0.18 -0.48 -0.4 0.5 0.71 0.36 0.23 0.31 0.05 -0.64 0.44 -0.04 0.01 -0.05 -1.14 -0.41 -0.05 -1.96 0.57 -0.18 0.02 0.62 -0.29 0.2 0.38 0.48 -0.75 -0.34 -0.0 -0.52 -0.22 -0.54 -0.62 -1.76 -0.07 -0.04 0.3 1.37 0.06 -0.25 -0.06 0.33 0.73 -0.62 -0.03 -0.89 -0.7 -2.11 -0.4 -0.84 0.57 0.65 0.31
AKI50398 (L2625_02588)
 -0.47 0.5 1.96 -0.59 -0.58 -0.58 0.45 -0.78 0.26 -0.43 -1.16 -2.04 -3.1 -0.97 0.73 -2.0 -0.98 -1.55 -1.65 0.78 0.68 0.23 0.2 0.17 -0.23 -0.47 -0.27 -0.1 0.24 0.68 -0.09 0.22 0.17 0.07 0.87 0.17 1.15 0.65 0.61 -0.19 -0.23 -0.34 -0.31 -0.37 -0.46 -0.38 -0.15 -0.21 -0.06 -0.15 0.69 -1.06 0.89 0.77 0.61 -0.75 -0.46 0.15 -1.34 -1.66 -2.1 -1.11 -1.08 -0.2 -0.5 0.37 0.31 -1.1 -1.2 -1.42 0.39 -0.21 -1.4 -0.85 0.18 -1.56 0.14 -0.21 0.83 -0.04 -2.3 0.48 1.08 0.65 -1.31 -2.49 -0.74 -0.13 -0.09 -0.95 0.05 0.79 0.18 1.16 0.38 1.16 -0.42 0.92 -0.02 -0.43
AKI50409 (L2625_02599)
 -0.17 0.02 0.72 0.12 0.66 0.62 -0.34 -0.27 -0.3 -0.52 -1.43 -3.04 -2.32 -1.42 -0.11 -2.16 0.09 0.17 -0.11 0.19 0.29 -0.15 -0.02 -0.45 -0.58 -0.25 -0.34 -0.41 -0.48 -0.39 -0.56 -0.5 -0.24 0.45 -0.28 -0.33 -0.71 -0.57 -0.59 0.22 0.15 0.23 0.21 0.33 0.13 0.5 0.25 -0.01 -0.01 -0.31 -0.16 0.3 0.31 0.39 0.27 0.15 0.93 -0.18 -0.78 -2.1 -2.64 -1.25 -1.01 0.22 -1.31 -0.67 -0.38 -0.85 -1.16 -1.94 -0.16 -0.47 0.21 -1.29 -0.77 -0.68 -0.87 -0.81 0.21 -0.32 0.19 1.59 1.65 1.75 1.51 0.04 0.35 0.32 0.41 0.58 -0.1 -0.18 0.08 0.32 -0.01 0.3 -0.78 0.71 0.81 0.19
AKI50411 (lgt)
 -0.58 -0.14 0.03 -0.22 -0.09 -0.15 -0.07 -0.31 -0.01 -0.39 -0.75 -3.57 -3.39 -0.71 -0.23 -2.46 -0.66 -0.61 -0.73 0.44 0.37 0.47 0.53 0.48 0.3 0.73 0.46 0.58 0.48 0.84 0.57 0.44 0.61 0.11 -0.05 0.23 -0.05 -0.07 -0.16 -0.09 -0.32 -0.19 -0.29 -0.23 -0.11 0.09 0.1 -0.31 0.02 0.14 0.55 0.49 0.5 0.38 0.33 -0.96 -0.25 0.62 -0.95 -0.9 -1.48 -1.5 -0.99 0.51 -1.82 -0.38 0.42 -0.81 -1.1 -2.1 0.16 -0.12 -0.66 -0.96 -0.49 -1.04 -0.58 -0.99 -0.54 -0.38 -0.68 1.06 1.16 0.97 0.98 0.19 -0.04 -0.09 0.19 0.27 1.05 -0.86 -0.27 -0.09 -0.77 -0.32 -1.41 1.21 1.36 -0.02
AKI50465 (atpB)
 -0.99 0.06 0.54 -0.53 -0.27 -0.35 -0.71 -0.47 -0.77 -0.38 -0.76 -3.46 -3.56 -1.73 -0.35 -2.78 -0.88 -0.92 -1.08 1.0 0.81 0.01 0.05 0.14 -0.17 -0.15 -0.08 -0.01 -0.25 0.54 0.05 -0.31 -0.03 -1.19 -0.4 0.21 -0.28 -0.31 -0.52 -0.14 -0.24 -0.14 -0.12 -0.09 -0.12 -0.25 -0.09 -0.6 -0.2 -0.3 1.96 0.26 0.9 0.75 0.86 -0.34 -0.02 0.9 -1.15 -0.08 -0.44 -1.86 -1.48 1.0 -1.52 -0.38 -0.23 -1.3 -0.83 -1.88 0.94 -0.29 -0.53 -0.42 -0.1 -0.04 -0.41 0.11 0.31 -0.49 0.56 1.66 0.86 0.07 -0.43 0.68 0.67 0.32 0.27 -0.24 0.73 0.08 -0.65 0.46 -1.05 0.67 -1.08 0.98 0.86 -0.47
AKI50466 (atpI)
 -1.37 -2.27 -1.45 -1.39 -9.94 -9.88 -4.38 -3.33 -4.36 -3.96 -6.33 -4.66 -3.93 -0.58 -0.47 -3.53 -0.16 -0.1 -0.1 0.87 0.76 0.87 0.71 0.59 0.64 0.58 0.65 0.97 0.73 1.55 1.0 0.75 1.02 -0.39 -0.05 0.61 0.08 0.06 -0.12 -0.63 -0.71 -0.74 -0.7 -0.78 -0.54 -0.76 -0.32 -0.73 0.34 0.32 2.1 0.25 0.76 0.55 0.65 -0.98 -0.75 1.21 -0.07 -1.05 -1.51 -0.5 -0.27 1.18 0.4 -0.09 0.22 0.05 0.3 -0.17 1.1 -0.07 0.08 -1.92 -1.5 -1.64 -1.67 -1.39 0.52 -0.49 -0.73 0.61 -0.29 -1.27 -1.82 -0.25 -0.26 -1.0 -1.03 -1.5 1.05 0.2 -0.79 0.74 -1.17 0.7 -0.75 0.99 0.92 0.8
AKI50477 (hom)
 -0.21 1.05 1.47 0.12 0.05 -0.14 -0.25 -1.55 -0.19 -1.1 0.95 -2.6 -2.36 -0.71 0.57 -4.82 -0.69 -1.18 -0.95 0.68 0.63 0.08 0.03 -0.03 -0.19 -0.19 -0.04 0.3 0.46 0.95 0.42 0.56 0.17 -0.4 0.34 -0.12 0.53 0.27 0.3 0.18 0.07 0.26 0.23 0.02 0.21 0.55 0.18 -0.04 0.05 0.15 1.01 -1.02 0.74 0.66 0.58 0.07 -0.14 0.14 -2.18 -2.1 -2.29 -2.37 -1.95 0.69 -1.6 -0.34 0.33 -1.63 -2.55 -2.23 0.28 -0.04 -0.18 0.12 -0.7 -2.4 -0.72 -1.26 -0.1 -1.05 -1.28 1.43 1.44 0.55 -0.07 -1.6 -0.23 0.21 -0.14 -0.22 0.55 -0.39 -1.28 0.18 -1.64 0.57 -2.25 1.31 0.64 -1.4
AKI50760 (L2625_02976)
 0.83 0.12 1.22 1.23 -1.6 -1.54 -0.61 0.16 -0.54 -0.42 0.22 -4.41 -3.19 -0.88 0.77 -3.19 -0.37 -0.66 -0.25 -0.61 -0.83 -0.32 -0.15 -0.09 -0.56 0.2 -0.15 0.06 -0.3 0.16 0.23 -0.24 0.15 -0.42 -0.68 -0.12 -0.72 -0.59 -0.58 -0.95 -1.3 -1.14 -1.04 -1.0 -0.93 -0.67 -0.5 -0.96 -0.54 -0.12 -1.16 -0.94 -0.72 -0.74 -0.86 -1.12 1.09 -0.05 0.07 -0.64 -0.7 0.13 0.42 -0.23 1.12 -1.41 -0.49 0.07 -0.14 0.17 0.08 -0.94 -0.25 1.31 -0.49 -0.01 -0.64 -0.09 0.48 1.08 -1.12 0.85 0.95 0.69 0.47 -0.63 0.51 -0.69 -0.43 -0.34 -0.46 0.6 1.43 0.51 1.98 0.43 0.75 0.84 1.0 -0.1
AKI50761 (L2625_02977)
 0.02 0.74 2.02 0.66 -1.0 -1.25 -0.94 -0.16 -0.69 -0.98 0.25 -2.85 -1.84 -0.82 0.7 -2.92 -0.46 -0.43 0.03 -0.2 -0.37 -0.42 -0.15 -0.25 -0.4 0.19 -0.11 0.27 -0.02 0.4 0.35 0.13 0.38 -0.22 -0.44 0.01 -0.43 -0.41 -0.18 -0.68 -0.71 -0.7 -0.42 -0.7 -0.44 0.01 -0.18 -0.45 -0.08 0.42 -0.05 -0.08 -0.31 -0.47 -0.31 -0.91 1.24 -0.01 0.0 0.33 0.08 -0.38 0.21 -0.27 0.63 -0.61 -0.17 0.12 -0.06 0.22 0.29 -0.54 0.45 0.2 -2.34 -1.72 -2.32 -1.87 -0.95 0.49 -1.31 0.89 0.8 0.72 1.36 -0.42 0.44 -0.9 -0.82 -0.24 0.18 -0.8 0.44 -0.92 1.06 -1.25 0.2 1.48 1.52 -0.24
AKI50762 (serC)
 -0.61 -0.11 0.91 0.04 -2.6 -2.66 -1.38 -0.44 -1.22 -1.25 -0.81 -1.86 -0.92 -0.71 0.59 -3.08 -0.52 -0.36 0.15 -0.67 -1.12 0.17 0.17 -0.08 -0.03 0.61 0.28 0.96 0.79 1.15 1.0 0.83 1.08 -0.36 -0.71 0.38 -0.79 -0.64 -0.56 -0.7 -1.06 -0.91 -0.89 -0.66 -0.56 0.0 -0.4 -1.03 -0.49 0.19 -0.43 -0.28 -0.67 -0.83 -0.63 -0.68 1.12 -0.61 0.69 0.07 -0.21 0.68 0.99 -0.08 0.99 -0.16 -0.37 0.59 0.02 1.03 0.16 -0.92 0.7 0.88 -1.81 -0.94 -1.94 -1.25 -0.86 0.38 -1.83 0.78 0.7 0.62 1.3 -0.53 0.22 -1.17 -0.93 -0.43 0.25 -0.77 0.24 -0.8 0.1 -0.71 -0.01 1.3 1.23 0.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.