Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
10403S,Log
10403S,WT
10403S,LMRG 00730 deleted
10403S,delta sigB,Log
10403S,WT,Log
10403S,virR deleted,Log
10403S,WT,Bile
10403S,WT,ctrl
10403S,delta sigB,Bile
10403S,delta sigB,ctrl
10403S
ATCC 19115,Lactic acid(1h)
ATCC 19115,ctrl
WT
EGD
ATCC 19115,linalool
EDGe,37C(20min)
EDGe,20C(20min)
EDGe,20C(3h)
EDGe,Light
EDGe,Dark
EGD,MQ Water(0h)
EGD,MW Water(10min)
EGD,0.1875% L.plantarum(10min)
EGD,MQ Water(1h)
EGD,0.1875% L.plantarum(1h)
EGD,0.1875% L.plantarum+1mg/ml Pro-K(1h)
EGD,MQ Water(at 0h)
EGD,MQ Water(at 3h)
EGD,Ampicillin 0.03g/ml(at 3h)
EGD,Tetracycline 0.035g/ml(at 3h)
EGD,Gentamicin 0.3g/ml(at 3h)
EGD,Co-trimoxazole 0.2g/ml(at 3h)
EGDe
EGD,WT
37C,Late-Log
EGD,delta Lmo1408
EGD,delta Lmo0422
EGD,delta Lmo0599
EGDe,Lincomycin 0.25g/ml
EGDe,Chloramphenicol 0.4g/ml
EGDe,Erythromycin 0.03125g/ml
EGDe,Kanamycin 0.5g/ml
EGDe,Ofloxacin 2g/ml
EGDe,Ampicillin 1g/ml
EGDe,Bacitracin 8g/ml
EGDe,ctrl
EGDe,Lincomycin 0.5g/ml
EGDe,WT
EGDe,delta lftR
EGDe,37C,Late-Log
EGDe,WT,Light
EGDe,WT,Dark
EGDe,Light
EGDe,Dark
FFH,30C
FFH,10C
H1,37C,Late-Log
H2,37C,Late-Log
H3,37C,Late-Log
H5,37C,Late-Log
H6,37C,Late-Log
H7,37C,Late-Log
H8,37C,Late-Log
H10,37C,Late-Log
H11,37C,Late-Log
H17,37C,Late-Log
H19,37C,Late-Log
H27,37C,Late-Log
H28,37C,Late-Log
H31,37C,Late-Log
H32,37C,Late-Log
568
H7858,Log
H7858,WT,Bile
H7858,WT,ctrl
H7858,delta sigB,Bile
H7858,delta sigB,ctrl
LL195,ctrl
LL195,acid
Lm1,4C,Late-Stationary
Lm1,4C,Late-Log
Lm1,4C,Log
Lm1,WT,4C,Log
Lm1,4C,Lag
Lm1,20C,Late-Stationary
Lm1,20C,Late-Log
Lm1,20C,Log
Lm1,WT,20C,Log
Lm1,20C,Lag
LO28,37C,Late-Log
N12-0605,ctrl
N12-0605,acid
N13-0047,ctrl
N13-0047,acid
N13-1507,ctrl
N13-1507,acid
rli47,Log
WT,Log
Scott A,37C,Late-Log
AKI48047 (L2625_00072)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.48 1.72 3.18 - 4.49 4.63 - - 1.61 - 4.82 1.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AKI48235 (inlE)
-2.96 -1.08 -0.39 -1.24 -1.13 -0.9 -1.46 -0.21 -1.76 -1.02 -1.15 -3.24 -1.57 2.07 0.33 -3.26 -0.85 -0.08 -0.26 -0.45 -0.91 -0.41 -0.39 -0.44 -0.6 -0.44 -0.99 -1.75 -1.57 -2.25 -1.21 -1.4 -0.83 -1.56 -0.77 2.13 -0.64 -0.4 -0.26 -0.66 -1.19 -1.73 -0.96 -2.0 -1.48 -1.41 -0.27 0.08 0.6 -0.01 0.98 0.8 -0.28 -0.71 -1.07 -1.63 -1.72 -0.89 -1.24 -1.91 -2.42 0.51 0.32 -0.67 -2.12 4.02 1.01 -0.17 -1.01 -0.11 -1.08 4.3 -0.09 -6.51 -3.06 -4.19 -4.91 -4.21 -2.44 -1.69 -1.1 -0.5 -1.23 -1.7 -1.07 -1.7 -2.39 -0.86 -1.09 -0.35 -0.35 -2.25 -1.68 -2.09 -2.91 -4.15 -4.5 0.6 0.66 -0.39
AKI48296 (L2625_00350)
-0.92 0.11 -0.06 -0.44 -3.87 -4.29 -0.24 -1.09 0.15 -0.53 -0.57 -0.77 -0.75 2.2 0.97 -0.11 0.15 0.58 0.07 -1.63 -1.47 -0.11 0.1 -1.14 0.23 -0.43 -0.58 -0.57 -0.22 0.39 0.26 -0.2 -0.06 0.48 -0.19 0.77 -1.3 -0.43 -1.36 -0.52 0.11 0.35 -1.4 0.14 -0.59 -0.27 -0.22 -0.87 -0.26 -0.61 0.65 0.11 -1.42 0.42 -1.3 -1.56 -3.06 - -0.63 1.59 0.7 0.43 1.22 -1.05 -2.49 -0.04 -2.24 0.28 -0.93 - 1.72 0.41 1.29 -1.56 0.28 -0.97 -0.67 -1.53 -1.11 -1.02 2.15 1.12 0.54 -0.68 -0.03 2.03 1.19 -0.61 -1.14 -1.67 1.33 -0.47 -0.61 -1.85 -1.9 -1.92 -1.01 -0.27 -0.84 0.63
AKI48297 (L2625_00351)
-2.22 -1.26 0.09 0.18 -2.62 -2.57 -2.33 -1.04 -3.21 -2.76 -3.16 -0.79 -1.6 1.06 0.75 -0.41 -0.89 -0.08 -0.87 -0.99 -2.52 - - -27.52 -1.02 -2.75 -10.66 - -10.69 -2.7 -26.49 -0.47 -20.34 -6.96 -3.35 1.19 -2.02 -2.05 -2.28 -2.71 - -2.09 -0.84 -2.87 - - -0.64 -1.24 -1.76 -4.32 -0.38 0.54 -2.66 -1.1 -0.81 0.68 -1.17 - 0.53 1.55 1.09 0.93 1.35 1.09 0.29 2.95 2.43 -1.18 -0.03 0.26 2.37 3.29 1.74 -2.39 -4.17 -4.32 -29.86 -21.99 -3.03 -3.81 2.66 1.55 0.53 -0.38 -0.18 2.23 1.42 -0.72 -1.35 -1.14 -0.04 -3.26 -5.49 -4.46 -4.92 -3.38 -3.1 -0.29 0.45 0.51
AKI48333 (L2625_00388)
-1.67 -1.71 -1.45 -1.06 -1.27 -1.33 -2.11 -2.85 -1.42 -2.51 -1.06 -0.04 3.42 0.71 -0.08 -4.83 -2.49 -2.72 -2.68 -1.38 -1.39 -1.48 -1.32 -1.41 -1.58 -1.26 -1.5 -1.16 -1.35 -0.49 -1.74 -1.39 -0.26 -2.79 -2.39 -1.08 -2.39 -1.52 -2.07 -1.9 -2.48 -2.66 -3.25 -3.03 -2.45 -2.57 -1.52 -1.13 -1.4 -0.77 -0.14 -2.43 -1.6 -1.81 -1.61 -1.27 -2.42 -0.88 -0.86 -0.38 -0.72 0.67 5.28 -0.3 -0.56 -1.96 0.56 1.83 -1.06 -1.35 -0.84 0.15 -2.39 -3.66 -1.42 -3.84 -1.91 -2.91 -1.33 -1.74 3.26 -2.74 -2.35 -2.23 -2.69 -1.94 -1.97 -3.22 -2.2 -3.25 -1.28 -1.23 -1.7 -1.34 -2.11 -2.8 -1.47 -2.51 -2.18 -2.11
AKI48334 (L2625_00389)
-1.58 -2.49 -1.88 -1.21 -2.71 -2.55 -3.01 -2.89 -2.47 -3.43 -2.04 -0.33 2.2 -0.58 -0.89 -5.61 -3.04 -3.45 -3.28 -2.08 -2.16 -1.82 -2.02 -2.02 -2.06 -2.27 -1.86 -1.89 -1.94 -1.33 -1.88 -2.05 -1.38 -4.01 -3.09 -1.12 -2.49 -2.42 -2.37 -3.34 -2.73 -3.5 -2.66 -2.91 -3.3 -2.62 -2.07 -2.34 -1.54 -1.57 -0.42 -2.46 -2.22 -2.2 -2.24 -1.32 -3.27 -0.97 -0.55 -0.26 -0.83 0.82 5.79 -0.97 0.05 -2.02 0.32 1.7 -1.27 -1.12 -1.53 -0.48 -3.04 -3.64 -2.4 -3.83 -2.86 -3.67 -1.2 -1.41 2.98 -3.49 -3.25 -2.7 -3.42 -2.44 -2.21 -3.17 -2.82 -3.11 -1.94 -1.19 -1.34 -1.5 -1.27 -2.42 -1.02 -2.42 -2.38 -2.44
AKI48335 (L2625_00390)
-0.44 -2.24 -1.88 -0.3 -1.83 -2.17 -1.37 -2.03 -0.88 -2.35 -1.15 0.97 2.64 -0.5 -0.3 -4.34 -1.91 -2.78 -2.55 -2.21 -2.16 -1.02 -2.39 -2.63 -2.26 -2.04 -2.43 -2.15 -2.11 -1.36 -1.79 -2.28 -0.81 -4.48 -2.84 -1.41 -2.94 -2.15 -3.49 -2.8 -3.97 -4.15 - -2.93 - -2.76 -1.76 -1.97 -1.77 -1.67 -0.88 -2.13 -3.34 -3.83 -2.98 -1.23 -2.84 -0.72 -1.39 -0.69 -0.71 1.0 5.65 -0.72 -0.35 -1.95 0.44 1.28 -2.14 -1.07 -1.04 0.02 -2.16 -6.12 -2.68 -2.95 -2.37 -3.08 -1.17 -1.23 3.05 -3.5 -3.02 -2.68 -4.68 -2.97 -1.86 -3.02 -2.56 -3.39 -1.97 -1.35 -1.08 -1.43 -0.28 -1.66 -0.56 -3.62 -2.72 -1.1
AKI48339 (L2625_00394)
-1.41 0.29 -0.73 -0.78 -1.31 -1.36 -0.04 -0.71 -0.81 0.28 0.74 - - 0.83 -0.61 - -0.17 0.27 0.98 -0.99 -1.71 1.33 0.54 1.21 0.89 1.43 1.05 -0.12 0.44 0.69 -0.38 0.26 1.05 -3.55 0.22 1.07 0.61 0.78 1.05 - - - - -2.0 - - -1.59 -1.08 0.37 1.07 -0.12 -0.18 -0.62 -1.05 -1.26 0.87 0.37 -0.72 - 1.49 1.45 2.41 1.52 -1.61 - -0.39 0.2 - - 1.19 0.51 -0.57 0.84 0.92 -0.43 -1.26 -0.93 -1.01 - - 0.73 1.24 0.71 -0.29 -0.1 0.7 0.06 -1.5 -0.48 -0.34 0.1 - - - - -0.45 0.92 -0.81 -0.66 -
AKI48340 (L2625_00395)
-0.35 -0.11 -1.19 -0.15 0.26 0.42 0.2 -0.01 -0.31 0.74 0.54 - - 1.65 0.74 - 0.12 0.16 0.42 -0.39 -0.74 0.28 0.63 0.92 1.03 0.64 -0.0 0.02 0.06 0.68 0.36 -0.05 0.51 -1.75 0.71 0.71 0.81 0.36 1.19 -1.76 -2.41 - -1.34 -1.38 - - -1.22 -2.26 0.81 1.1 1.23 -0.68 -0.06 0.36 0.02 0.43 -0.23 1.34 - 1.6 0.93 1.17 0.45 0.22 - -0.23 0.03 - - 0.23 1.0 -0.79 0.18 0.34 -2.06 -1.74 -2.63 -1.79 - - 0.29 0.94 0.36 0.16 0.65 0.64 0.05 -1.01 0.13 0.34 0.13 - - - - -2.67 -0.5 0.55 0.78 -
AKI48341 (L2625_00396)
-0.93 0.22 0.37 -0.87 -0.99 -0.84 0.28 -0.92 -1.29 0.36 -0.16 - - 1.58 0.04 - 0.31 0.43 0.99 -0.46 -0.85 0.21 0.8 0.66 0.23 0.24 -0.3 -0.48 -0.52 -0.36 -0.28 -0.79 -0.32 -0.72 -0.49 0.58 0.28 -0.12 0.02 -0.64 -1.48 -2.65 -2.4 -2.44 -1.6 -0.53 -0.4 -0.74 -0.13 -0.16 -0.17 -1.18 -0.51 -0.08 -0.71 0.24 -0.96 1.29 - 1.38 1.54 1.77 1.7 -1.54 - 0.08 1.59 - - 1.41 -0.54 0.4 0.9 -0.12 -1.25 -1.92 -1.79 -2.27 - - 1.59 1.04 0.76 0.98 1.76 1.08 0.65 -0.38 0.21 0.59 0.73 - - - - -2.04 0.11 0.21 0.15 -
AKI48588 (L2625_00655)
-0.89 -0.15 -0.66 0.01 -3.45 -2.13 0.69 -0.16 0.08 -0.01 0.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.45 - -1.08 -0.32 -1.88 0.36 - - 3.56 4.15 - - -0.84 - 3.93 0.35 - - - - - - - -3.74 0.08 0.76 0.45 0.88 1.13 0.29 0.94 -0.56 -0.12 - - - - - - - - - -
AKI48589 (L2625_00656)
-0.68 0.44 -0.36 0.23 -0.21 -0.71 1.56 0.95 0.41 1.12 0.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.56 - -0.79 -1.35 0.36 0.18 - - 3.55 3.97 - - 0.97 - 3.07 0.61 - - - - - - - -2.51 0.01 0.47 0.45 0.53 0.62 -0.26 0.76 -0.55 -0.31 - - - - - - - - - -
AKI48590 (L2625_00657)
-0.73 0.19 -0.53 1.26 -2.64 -2.35 1.44 0.71 0.27 1.03 0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.39 - -0.83 -0.8 1.92 2.35 - - 3.53 3.72 - - 1.97 - 3.51 -0.28 - - - - - - - - -0.2 -0.01 -0.36 -0.0 -1.0 -0.16 -0.12 -0.86 -0.79 - - - - - - - - - -
AKI48716 (L2625_00785)
0.54 0.28 0.13 0.26 -0.37 -0.21 0.14 -1.1 0.47 -0.7 0.58 - - 1.58 -1.21 - -0.74 -0.82 -1.02 -0.31 -0.39 -0.18 -0.49 -0.45 -0.36 -1.01 -1.2 -0.61 -1.58 -1.47 -0.95 -1.36 -1.72 -2.36 0.45 0.39 0.85 -0.23 0.6 -1.65 -0.41 -1.46 -1.48 - -2.41 -0.79 -0.66 -1.52 0.75 0.73 0.23 -1.47 -0.2 -0.25 -0.47 -0.22 -1.0 0.89 - 2.4 2.15 3.59 1.6 2.25 - -0.76 1.13 - - 0.96 1.06 0.62 -0.61 -2.16 -1.07 -1.67 -1.09 -1.75 -5.75 - -3.07 -2.26 -2.27 -1.69 -2.87 1.45 0.73 -0.01 0.16 -1.03 1.45 - - - - -0.72 0.41 -0.82 -1.18 -
AKI48717 (L2625_00786)
0.84 0.05 -0.04 0.79 -0.61 -0.67 -0.15 -0.98 0.63 -0.82 0.19 - - 1.73 -0.65 - -1.03 -1.04 -1.19 -0.07 -0.23 -0.42 -0.95 -0.46 -0.29 -1.19 -0.57 -0.34 -1.14 -0.57 -0.31 -0.99 -1.11 -1.57 -0.39 0.63 0.23 -0.76 -0.27 -0.63 -1.11 -0.97 -0.71 -1.49 -0.64 -0.49 0.1 -0.54 0.19 0.26 0.1 -0.57 0.29 0.16 -0.45 0.13 -1.62 1.04 - 1.81 1.26 3.41 1.51 2.72 - -0.55 1.42 - - 1.26 1.1 0.37 -0.21 -2.41 -0.36 -1.65 -0.57 -1.22 - - -2.5 -2.65 -2.5 -2.1 -2.52 1.02 0.18 -0.46 -0.18 -1.44 1.89 - - - - -0.15 1.03 -1.1 -0.77 -
AKI48718 (L2625_00787)
0.43 0.01 0.02 0.31 0.0 0.08 0.2 -1.05 0.86 -0.56 -0.19 - - 1.79 -1.13 - -1.3 -1.27 -1.42 -0.08 0.09 -0.36 -0.89 -0.13 -0.23 -1.27 -0.64 -0.5 -0.42 -0.75 -0.04 -1.22 -1.63 -1.33 -0.54 0.58 -0.71 -0.93 -0.54 -0.95 -2.05 -0.91 -0.17 -3.02 -0.59 -2.43 -0.23 -0.15 0.13 -0.08 0.48 -0.27 0.41 0.08 -0.34 0.14 -1.51 0.36 - 1.6 1.98 3.68 1.79 2.63 - -0.55 1.49 - - 1.02 1.32 0.45 -0.9 -1.24 -0.22 -1.44 -0.69 -0.81 -5.34 - -2.44 -2.42 -2.72 -2.86 -2.57 0.44 -0.25 -1.31 -0.67 -1.4 1.85 - - - - -0.79 0.72 -0.66 -0.63 -
AKI48719 (L2625_00788)
-0.39 0.06 -0.08 -0.29 0.38 0.38 0.86 -0.77 1.02 -0.11 0.26 - - 1.88 -1.96 - -1.29 -1.38 -1.51 -0.45 -0.23 0.64 0.19 0.41 0.43 0.11 0.34 0.58 -0.0 0.2 0.16 0.1 0.03 -2.08 -1.51 0.62 -0.93 -1.32 -1.95 -1.11 -1.16 -0.45 -0.44 -1.13 -0.51 -0.76 -0.38 -0.25 -0.28 -0.21 -0.27 -1.15 -0.25 -0.49 -0.49 -0.02 -1.6 0.55 - 1.62 1.24 3.31 2.14 2.58 - -0.68 1.43 - - 1.26 0.59 0.33 -1.14 -1.84 0.46 -1.0 -0.11 -0.9 -5.85 - -2.32 -2.54 -2.27 -2.42 -2.56 0.64 -0.16 -1.02 -1.04 -1.47 1.23 - - - - -1.1 1.11 -1.09 -0.83 -
AKI48720 (L2625_00789)
-0.16 -0.04 -0.39 -0.34 -0.65 -0.5 0.58 -0.4 0.96 -0.06 0.15 - - 1.43 -0.94 - -0.24 -0.77 -0.55 -0.33 -0.82 0.78 1.05 1.09 1.05 0.54 0.59 1.13 0.72 0.89 1.02 0.48 0.97 -1.95 -1.26 0.69 -0.71 -1.41 -1.02 -0.28 -0.88 0.1 -1.17 -0.69 -0.26 -0.97 0.17 -0.03 -0.43 -0.39 -0.68 -1.33 -0.75 -0.88 -0.99 -0.62 -1.67 0.46 - 1.03 0.71 3.14 1.57 2.04 -5.07 0.47 1.44 - - 1.42 1.32 0.23 -1.19 -0.65 0.17 -0.18 -0.21 -0.49 -6.93 - -2.49 -2.1 -2.11 -2.52 -2.26 0.32 -0.48 -1.08 -0.82 -1.4 0.24 - - - - -0.91 0.57 -1.31 -1.51 -
AKI48721 (L2625_00790)
0.33 -0.39 -0.63 0.77 -1.72 -1.62 -0.1 0.4 -0.12 0.1 0.41 - - -1.14 0.42 - -0.31 -0.97 -0.82 -0.32 -0.49 0.31 0.32 0.29 0.25 0.49 0.3 0.29 0.36 0.59 0.26 0.42 0.73 -0.63 0.44 0.62 0.73 0.31 0.88 -1.59 -1.54 -1.63 -1.35 -1.56 -1.3 -1.29 -0.84 -1.27 1.12 0.27 0.59 -0.05 -0.16 -0.1 -0.28 -1.68 -1.02 1.0 -7.32 1.34 1.2 2.02 1.63 0.76 -7.05 0.25 1.21 - - 1.43 0.88 0.77 -0.13 0.67 0.41 0.73 0.23 0.57 -5.55 - -1.88 0.13 -0.45 -1.39 -1.41 1.07 -0.7 -1.1 -0.87 -1.5 1.13 - - - - 0.2 1.03 -0.37 -0.57 -8.72
AKI49169 (L2625_01260)
-7.44 - - -6.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.17 -5.44 -4.49 - -6.94 3.12 - -3.3 4.64 3.59 - 2.53 - -5.66 3.38 -12.09 - - - - - - - 0.36 0.83 1.25 1.22 2.22 -0.16 0.34 0.19 1.02 0.45 3.49 - - - - - - - - -
AKI49170 (L2625_01261)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.39 - - - - - - -9.7 - - - - - - - 1.46 3.3 3.8 2.96 3.13 2.39 4.58 3.62 2.43 0.75 - - - - - - - - - -
AKI49171 (L2625_01262)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.71 - - - - - - - 1.19 2.18 - 1.8 - - 2.32 - - - - - - - - 2.51 3.1 3.11 3.11 3.87 2.19 2.8 1.94 2.27 1.18 -4.46 - - - - - - - - -
AKI49172 (L2625_01263)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.84 - - - - -2.35 - - 2.7 2.63 - - - - 2.61 - - - - - - - - 2.25 2.82 2.89 3.01 3.82 2.41 3.0 2.16 2.43 1.34 2.14 - - - - - - - - -
AKI49173 (L2625_01264)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.16 - - - - - - - - -
AKI49174 (L2625_01265)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.38 - - - - - - - - -
AKI49175 (L2625_01266)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.76 - - - - - - - 3.78 3.26 - - - - 1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - -
AKI49176 (L2625_01267)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.58 - - - - 2.26 - - 3.33 2.08 - 3.19 - - 3.11 - - - - - - - - 1.77 1.64 2.21 2.46 2.09 2.18 1.33 2.02 1.85 1.91 2.73 - - - - - - - - -
AKI49177 (L2625_01268)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.4 2.72 2.51 2.88 3.14 3.64 1.36 2.56 1.49 1.11 4.61 - - - - - - - - -
AKI49182 (L2625_01273)
- - - - - - - - - - - - - 0.65 1.39 - -3.54 -0.8 -1.0 -1.62 -1.57 - - - -1.86 -1.52 - - -3.36 - - - - -2.78 -3.69 4.09 -4.48 -2.53 -1.81 -2.23 - - - - -1.1 -0.36 -0.15 - -4.25 -2.45 1.33 - - - - - - 0.02 2.43 - - 4.07 2.92 -0.99 3.06 1.26 -0.3 0.45 - - 1.69 - - -2.13 0.55 -0.0 0.21 -1.63 - - - - - - - - - - - - 3.98 - - - - - - 0.94 0.15 -
AKI49183 (L2625_01274)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AKI49185 (L2625_01276)
- - - - - - - - - - - - - 3.02 1.96 - -0.58 1.63 1.56 -0.48 -0.25 2.04 1.57 1.33 1.38 1.31 1.56 1.58 0.83 0.6 0.97 0.9 0.51 -3.12 -5.12 3.65 -3.82 -1.97 -0.7 -0.12 2.0 1.08 - -0.29 - -0.7 1.97 1.28 -1.67 -0.65 3.33 - -2.81 - - - - - - - - - 1.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.02 2.21 -
AKI49189 (L2625_01280)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.07 4.12 - - 1.13 4.72 - - 4.25 - 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AKI49192 (L2625_01283)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6.39 - - - - - - - - - - - -3.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AKI49194 (L2625_01285)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.9 - - - - - - - - -2.47 - 4.66 - - 4.87 - - - - - - - - 1.94 1.34 2.46 1.0 0.88 2.84 1.38 0.96 1.52 0.18 - - - - - - - - - -
AKI49195 (L2625_01286)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.59 - - - - - - - - - - 3.31 - - - - - - - - - - - 2.91 2.29 3.34 2.4 1.54 3.49 2.44 2.46 2.02 1.25 - - - - - - - - - -
AKI49196 (L2625_01287)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.72 - -3.49 - -3.49 -0.37 - - 3.47 2.32 - 4.68 - - - - - - - - - - - 2.53 1.84 2.61 1.58 1.19 2.99 1.67 1.75 1.45 0.81 - - - - - - - - - -
AKI49197 (L2625_01288)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.73 - - - - - -1.03 - 4.58 3.4 - 3.64 - - - - - - - - - - - 2.88 1.68 2.33 1.59 0.61 2.81 1.42 1.86 1.13 0.56 - - - - - - - - - -
AKI49198 (L2625_01289)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AKI49199 (L2625_01290)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6.51 - - - - - - - - - - 3.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AKI49200 (L2625_01291)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.8 - - - - - - -1.19 4.0 2.17 - 3.6 - - - - - - - - - - - 3.86 2.93 2.78 2.09 1.46 3.39 2.37 2.14 1.52 0.8 - - - - - - - - - -
AKI49201 (L2625_01292)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.63 1.63 0.64 1.57 -0.3 3.18 1.65 -0.14 0.42 -1.14 - - - - - - - - - -
AKI49202 (L2625_01293)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.46 - - - - 2.96 - - - - - - - - 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - -3.36 - - 4.4 - - - - - - - - -
AKI49203 (L2625_01294)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.18 - -2.54 4.22 2.97 - -0.32 - - 3.63 - - - - - - - - 2.19 1.16 2.12 1.94 1.36 2.78 1.85 2.08 0.94 0.84 1.72 - - - - - - - - -
AKI49206 (L2625_01297)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.77 4.41 - - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.37 - - - - - - - - -
AKI49207 (L2625_01298)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.52 - - - - 3.79 - - 3.79 3.39 - - - - 1.02 - - - - - - - - 2.06 1.25 2.6 1.64 2.03 2.1 2.0 3.62 2.08 2.43 0.47 - - - - - - - - -
AKI49208 (L2625_01299)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.03 - - - - 4.77 - - 2.96 3.01 - - - - 1.18 - - - - - - - - 2.26 1.52 2.61 1.1 0.85 1.87 1.41 3.13 1.28 1.3 0.76 - - - - - - - - -
AKI49209 (L2625_01300)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.91 -4.11 - - - 4.46 - - 4.45 3.09 - - - - 0.48 -1.43 - - - - - - - 2.65 1.42 2.32 1.73 0.69 1.99 1.5 2.47 1.03 0.97 1.24 - - - - - - - - -
AKI49210 (L2625_01301)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.06 -2.97 - - - 5.29 - -4.06 2.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.11 - - - - - - - - -
AKI49211 (L2625_01302)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.97 -2.66 - - - 4.79 - -3.76 4.74 3.48 - - - - 0.37 - - - - - - - - 2.23 0.72 1.62 1.14 -0.64 1.15 0.35 1.23 0.14 -0.36 1.34 - - - - - - - - -
AKI49212 (clpP)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.29 -4.96 - - - 5.16 - -4.05 4.13 3.18 - - - - 0.78 - - - - - - - - 2.53 1.09 1.94 1.57 -0.28 1.61 0.97 1.79 0.5 -0.23 - - - - - - - - - -
AKI49213 (L2625_01304)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.94 -2.77 -4.65 - - 0.75 - - 5.39 3.63 - - - - 0.18 - - - - - - - - 1.99 0.67 1.21 1.03 -1.2 1.27 0.3 1.15 0.12 -0.94 2.48 - - - - - - - - -5.03
AKI49214 (L2625_01305)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AKI49215 (L2625_01306)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.79 - - - - 5.24 - - 3.41 4.36 - - - - 1.32 - - - - - - - - 1.45 -0.35 0.71 0.15 -3.12 0.58 -0.26 0.62 -0.22 -1.17 0.3 - - - - - - - - -
AKI49216 (L2625_01307)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.92 - - - - 5.4 - - 3.93 3.54 - - - - 1.35 - - - - - - - - 1.79 0.23 0.86 0.55 -2.36 0.82 -0.08 0.98 -0.01 -1.09 0.73 - - - - - - - - -
AKI49217 (L2625_01308)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.31 - - - - 4.98 - -3.8 4.53 2.25 - - - - 1.52 - - - - - - - - 2.53 1.05 1.66 1.32 -1.1 1.65 0.65 1.78 0.7 -0.46 1.46 - - - - - - - - -
AKI49218 (L2625_01309)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.74 - - - - - - -1.72 5.28 - - - - - - - - - - - - - - 3.34 2.37 2.7 2.15 -0.44 2.84 1.63 2.51 2.08 0.35 2.19 - - - - - - - - -
AKI49219 (L2625_01310)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.9 - - - - - - - - - - - - - -7.53 - - - - - - - 1.76 -3.75 - - - 3.88 - -3.84 4.75 1.94 - - - - 0.44 -9.4 - - - - - - - 2.9 1.55 2.53 1.99 0.17 2.2 1.43 2.58 1.48 0.17 1.92 - - - - - - - - -
AKI49220 (L2625_01311)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.11 - - - - - - - 5.71 - - - - - - - - - - - - - - 2.92 2.19 3.09 1.48 -0.96 1.92 0.79 1.82 1.51 -0.29 0.62 - - - - - - - - -
AKI49222 (L2625_01313)
-2.84 -3.33 -4.48 -2.97 -5.21 -4.89 -2.68 -4.02 -2.23 -3.98 -4.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.34 -4.03 - - - 4.34 - -3.96 4.78 2.95 - - - - 1.3 - - - - - - - - 2.61 1.31 1.88 1.33 -0.56 1.77 0.48 1.51 1.03 -0.23 0.23 - - - - - - - - -
AKI49223 (L2625_01314)
-9.72 - - - - - - - -8.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.89 - -4.21 - - 3.95 - -2.86 4.65 3.96 - - - -5.14 2.36 - - - - - - - - 2.14 0.72 1.53 0.8 -1.16 0.96 -0.43 1.09 0.76 -0.89 0.27 - - - - - - - - -
AKI49224 (L2625_01315)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.98 - - - - - - - - - - - - - - -6.26 - - - - - - 2.23 -3.37 -5.25 - - 4.03 - -5.05 4.71 3.81 - - - - 2.36 - - - - - - - - 1.71 0.54 1.42 1.0 -1.12 0.7 -0.36 1.12 0.69 -0.75 0.14 - - - - - - - - -
AKI49225 (L2625_01316)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.99 - -2.81 - 3.39 3.03 1.59 -4.05 4.28 2.91 - - - 2.86 1.69 - - - - - - - - -1.54 -1.87 -1.22 -0.85 -0.31 0.59 -2.01 -1.01 -1.47 -0.99 - - - - - - - - - -4.64
AKI49226 (L2625_01317)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.99 - -2.02 - - 3.77 2.27 -1.61 - - - - - 3.29 - - - - - - - - - 0.77 -0.27 0.23 0.78 0.47 1.32 -1.06 0.36 0.28 0.61 - - - - - - - - - 5.68
AKI49227 (L2625_01318)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.64 - - - - - - 4.19 - - - - - - - - - 1.0 -0.36 0.45 0.63 0.29 0.94 -1.17 0.21 -0.06 -0.17 -2.15 - - - - - - - - 5.47
AKI49228 (L2625_01319)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AKI49231 (L2625_01322)
- - - - - - - - - - - - - -0.52 0.07 - 0.64 1.28 1.71 - - 2.18 2.39 1.15 2.81 1.02 1.78 0.14 0.58 0.8 -0.07 1.01 - 1.37 0.34 -0.15 -3.26 -1.41 -1.46 - - - - - - - -2.26 - -1.32 -1.68 -0.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.49 -0.43 0.35 0.27 -0.66 -1.05 -0.68 -0.88 -0.35 -0.46 5.45 - - - - - - -2.07 - -
AKI50338 (L2625_02525)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.32 - - - - - - - 3.2 3.77 - - - - 5.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AKI50519 (lmrB-2)
-3.38 -2.43 -1.48 -2.45 -3.01 -2.72 -2.42 1.51 -2.68 0.48 -3.68 -3.61 0.25 -0.78 -0.6 -5.83 -1.31 0.24 -0.43 -0.8 -0.9 -0.5 -0.39 -0.97 -0.5 -0.92 -0.27 -0.58 -0.5 -1.11 -0.58 -0.49 -0.88 -1.24 -2.05 -0.13 -2.46 -2.06 -2.16 -0.53 -0.47 -0.68 -0.43 -0.29 -0.48 -0.34 -0.37 -0.89 -1.08 -2.34 -0.35 0.36 -0.55 -0.69 -0.78 -2.24 -1.26 -2.13 -1.06 -2.82 -3.19 -3.13 -2.92 -1.68 -0.72 -2.41 -2.67 1.65 -3.52 -0.76 -0.48 -1.57 -0.99 -0.84 -1.45 2.26 -1.78 1.19 -2.63 -4.07 -3.38 -1.79 -2.74 -1.79 -0.99 -2.41 -2.9 -2.29 -1.32 -0.0 5.49 -2.94 -3.09 -2.64 -3.46 -2.12 -3.82 -0.75 -0.75 -3.7
AKI50525 (L2625_02724)
- - - - - - - - - - - - - 0.52 -0.57 - 0.54 0.31 0.48 -0.77 -1.5 -1.68 -0.89 -1.13 -1.61 -1.59 -2.16 -2.14 -3.05 -2.29 -3.8 -3.79 -1.63 - -1.73 1.3 -0.73 -0.8 -0.54 -1.07 - -0.91 -0.65 -0.02 -0.36 -2.43 -0.59 -0.35 -0.68 -0.82 0.09 -1.16 -1.37 -1.92 -1.85 - - - - -4.01 - 0.03 0.86 -0.44 -4.07 4.47 4.45 - - 1.95 -0.72 4.03 0.29 -3.53 -3.74 -3.95 -4.69 -3.75 - - - - - - - - - - - - -0.04 - - - - -2.96 0.77 0.8 0.77 -
AKI50526 (csn2)
0.34 0.61 -0.41 -0.23 1.42 1.3 1.64 -0.37 1.32 0.16 -0.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.99 1.27 0.72 1.25 - -5.29 3.89 3.63 - - 1.5 -5.69 3.58 - - - - - - - - 1.35 2.42 1.53 0.28 1.01 2.47 2.57 1.53 -0.41 -0.36 - - - - - - - - - -
AKI50527 (cas2-2)
0.17 -0.64 -1.94 -0.55 -2.58 -1.88 0.9 -1.13 0.27 -0.9 -2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.29 0.35 -3.95 -4.48 - -3.21 4.52 4.19 - - - - 3.88 - - - - - - - - 1.36 2.42 1.1 -1.23 -0.06 2.88 3.11 1.87 -0.88 -0.55 - - - - - - - - - -
AKI50528 (cas1)
-6.85 -3.37 -3.04 -6.72 -7.16 -6.03 -7.53 -7.94 -6.09 -8.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.22 -2.0 -1.33 -3.07 -1.91 - -4.78 5.26 4.79 - - -2.58 - 4.64 - - - - - - - - -1.05 -0.21 -1.24 -4.05 -2.75 0.5 0.67 -0.61 -3.67 -2.91 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.