Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL16971 (BN171_1030021)	0.08	0.1	0.03	0.14	0.1	0.13	0.1	0.08	0.13	0.05	0.19	0.09	0.49	0.07	0.17	1.0	0.25	0.1	0.7	0.05	0.18	0.14	0.7	0.2	0.16	0.06	0.44	0.59	0.12
CCL16972 (BN171_1030022)	0.09	0.13	0.06	0.13	0.11	0.13	0.39	0.1	0.1	0.23	0.33	0.17	0.66	0.05	0.16	1.0	0.31	0.17	0.77	0.12	0.12	0.59	0.35	0.2	0.22	0.13	0.79	0.64	0.4
CCL16973 (BN171_1030023)	0.14	0.27	0.09	0.23	0.19	0.18	0.52	0.21	0.11	0.16	0.15	0.09	0.49	0.03	0.18	0.79	0.3	0.16	0.64	0.09	0.17	1.0	0.3	0.18	0.18	0.13	0.75	0.47	0.19
CCL16974 (etfB)	0.2	0.24	0.12	0.17	0.2	0.27	0.21	0.16	0.07	0.24	0.08	0.32	0.64	0.06	0.26	0.67	0.31	0.18	0.92	0.16	0.3	1.0	0.51	0.22	0.22	0.13	0.86	0.7	0.25
CCL16975 (etfA)	0.68	0.53	0.48	0.81	0.59	0.25	0.56	0.48	0.19	0.41	0.33	0.31	0.6	0.35	0.48	0.86	0.42	0.57	0.91	0.51	0.45	1.0	0.95	0.33	0.27	0.33	0.82	0.86	0.23
CCL17030 (BN171_1090011)	0.19	0.16	0.18	0.45	0.2	0.19	0.29	0.1	0.78	0.35	0.34	0.13	0.71	0.18	0.24	0.75	0.18	0.29	0.69	0.16	0.42	1.0	0.5	0.2	0.17	0.08	0.44	0.94	0.11
CCL18434 (BN171_2320011)	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.01	1.0	0.03	0.02	0.07	0.04	0.05	0.08	0.01	0.03	0.06	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.29	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.07	0.05
CCL18435 (BN171_2320012)	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03	0.03	1.0	0.03	0.02	0.12	0.07	0.08	0.09	0.01	0.05	0.05	0.04	0.04	0.06	0.03	0.05	0.33	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.06	0.05
CCL18436 (pyrD)	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	1.0	0.04	0.01	0.09	0.07	0.07	0.15	0.01	0.05	0.11	0.07	0.05	0.05	0.04	0.04	0.45	0.03	0.02	0.07	0.04	0.04	0.07	0.07
CCL18437 (BN171_2320014)	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	1.0	0.02	0.01	0.08	0.06	0.07	0.16	0.01	0.04	0.09	0.05	0.04	0.05	0.03	0.03	0.33	0.04	0.02	0.07	0.03	0.04	0.06	0.06
CCL18438 (BN171_2320015)	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	1.0	0.02	0.01	0.07	0.06	0.06	0.13	0.01	0.02	0.06	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.21	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.07
CCL18439 (BN171_2320016)	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.05	1.0	0.04	0.02	0.07	0.06	0.08	0.13	0.02	0.04	0.06	0.06	0.04	0.06	0.05	0.04	0.2	0.04	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.09
CCL18440 (BN171_2320017)	0.04	0.04	0.04	0.06	0.07	0.05	1.0	0.05	0.01	0.08	0.08	0.09	0.21	0.04	0.05	0.08	0.08	0.06	0.11	0.07	0.04	0.35	0.07	0.03	0.06	0.07	0.26	0.1	0.11
CCL18502 (BN171_240007)	0.23	0.27	0.26	0.26	0.16	0.13	1.0	0.2	0.13	0.41	0.42	0.52	0.67	0.25	0.28	0.57	0.38	0.24	0.72	0.23	0.33	0.76	0.37	0.41	0.41	0.09	0.96	0.49	0.41
CCL18988 (adhE)	0.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.0	1.0	0.0	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.02	0.01
CCL19027 (BN171_2810002)	0.05	0.05	0.05	0.1	0.05	0.02	1.0	0.02	0.05	0.05	0.04	0.02	0.09	0.04	0.05	0.06	0.08	0.02	0.04	0.04	0.08	0.02	0.05	0.04	0.02	0.01	0.12	0.26	0.02
CCL19028 (BN171_2810003)	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	1.0	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.05	0.21	0.01
CCL19029 (BN171_2810004)	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	1.0	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.04	0.14	0.02	0.02	0.01	0.08	0.04	0.07	0.04	0.01	0.01	0.08	0.04	0.02
CCL19030 (BN171_2810005)	0.03	0.04	0.03	0.06	0.04	0.01	1.0	0.02	0.04	0.06	0.05	0.07	0.09	0.02	0.04	0.08	0.23	0.03	0.04	0.02	0.09	0.03	0.08	0.03	0.03	0.02	0.03	0.1	0.06
CCL19304 (BN171_3020016)	0.06	0.09	0.05	0.17	0.06	0.02	1.0	0.04	0.06	0.26	0.17	0.09	0.12	0.04	0.11	0.14	0.06	0.04	0.08	0.04	0.14	0.1	0.09	0.04	0.03	0.02	0.06	0.21	0.08
CCL19305 (garR)	0.03	0.09	0.03	0.15	0.03	0.0	1.0	0.01	0.03	0.05	0.06	0.02	0.06	0.03	0.16	0.06	0.01	0.04	0.02	0.01	0.09	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.06	0.12	0.03
CCL19535 (BN171_3220004)	0.2	0.42	0.27	0.36	0.33	0.22	1.0	0.42	0.09	0.41	0.41	0.73	0.43	0.24	0.35	0.36	0.16	0.41	0.73	0.63	0.25	0.14	0.44	0.47	0.09	0.32	0.04	0.55	0.34
CCL19554 (BN171_3260005)	0.75	0.99	0.62	0.77	0.59	0.76	0.98	0.73	0.56	0.58	0.28	0.47	0.7	0.42	0.65	0.84	0.43	0.68	0.84	0.85	1.0	0.73	0.41	0.44	0.44	0.74	0.77	0.57	0.02
CCL19760 (BN171_3460004)	0.02	0.24	0.07	0.99	0.11	0.0	1.0	0.01	0.01	0.41	0.19	0.42	0.13	0.03	0.13	0.04	0.04	0.07	0.23	0.01	0.13	0.0	0.04	0.01	0.01	0.0	0.03	0.16	0.03
CCL19911 (ord)	0.14	0.36	0.18	0.25	0.12	0.07	1.0	0.11	0.07	0.52	0.12	0.38	0.34	0.08	0.27	0.36	0.1	0.07	0.46	0.08	0.15	0.39	0.14	0.03	0.03	0.05	0.07	0.35	0.05
CCL19912 (ortA)	0.05	0.12	0.05	0.13	0.04	0.03	1.0	0.0	0.01	0.6	0.21	0.2	0.19	0.01	0.06	0.16	0.02	0.07	0.13	0.06	0.07	0.0	0.04	0.03	0.02	0.01	0.1	0.24	0.05
CCL19913 (ortB)	0.04	0.14	0.05	0.11	0.04	0.03	1.0	0.03	0.04	0.41	0.07	0.29	0.15	0.03	0.09	0.15	0.04	0.03	0.14	0.04	0.09	0.24	0.06	0.03	0.02	0.02	0.12	0.14	0.07
CCL19914 (oraS)	0.04	0.34	0.04	0.22	0.08	0.02	1.0	0.02	0.0	0.25	0.0	0.4	0.13	0.01	0.13	0.09	0.04	0.04	0.11	0.02	0.05	0.05	0.05	0.01	0.0	0.03	0.14	0.11	0.11
CCL19915 (oraE)	0.04	0.1	0.03	0.1	0.03	0.02	1.0	0.04	0.03	0.32	0.11	0.27	0.15	0.01	0.08	0.17	0.05	0.04	0.25	0.02	0.07	0.24	0.3	0.08	0.05	0.03	0.14	0.18	0.11
CCL19916 (BN171_360010)	0.02	0.1	0.02	0.13	0.02	0.06	1.0	0.02	0.04	0.37	0.1	0.33	0.22	0.02	0.07	0.22	0.04	0.02	0.33	0.05	0.11	0.27	0.55	0.13	0.06	0.04	0.22	0.28	0.1
CCL19917 (orr)	0.03	0.1	0.03	0.11	0.06	0.1	0.73	0.02	0.02	0.36	0.08	0.35	0.19	0.02	0.08	0.25	0.03	0.02	0.49	0.09	0.13	0.33	1.0	0.11	0.09	0.05	0.16	0.37	0.06
CCL19918 (BN171_360012)	0.08	0.17	0.07	0.14	0.07	0.08	0.58	0.05	0.04	0.3	0.07	0.15	0.24	0.06	0.09	0.33	0.08	0.1	0.53	0.12	0.16	0.46	1.0	0.25	0.18	0.09	0.31	0.42	0.07
CCL20094 (BN171_3690038)	0.09	0.06	0.07	0.06	0.11	0.07	1.0	0.11	0.04	0.22	0.11	0.19	0.11	0.08	0.07	0.16	0.09	0.1	0.16	0.07	0.06	0.17	0.14	0.06	0.09	0.06	0.09	0.14	0.1
CCL20095 (dapA)	0.09	0.05	0.07	0.07	0.08	0.07	1.0	0.09	0.02	0.21	0.1	0.24	0.13	0.03	0.06	0.2	0.07	0.06	0.15	0.06	0.04	0.07	0.14	0.04	0.09	0.04	0.02	0.03	0.08
CCL20096 (BN171_3690040)	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	1.0	0.01	0.01	0.15	0.08	0.11	0.06	0.01	0.02	0.11	0.03	0.03	0.1	0.02	0.03	0.02	0.07	0.03	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02
CCL20097 (BN171_3690041)	0.04	0.02	0.05	0.03	0.03	0.04	1.0	0.03	0.04	0.2	0.07	0.17	0.15	0.02	0.03	0.23	0.06	0.05	0.16	0.03	0.04	0.09	0.13	0.07	0.13	0.04	0.02	0.15	0.04
CCL20098 (BN171_3690042)	0.08	0.01	0.09	0.07	0.07	0.12	1.0	0.01	0.03	0.13	0.16	0.04	0.13	0.05	0.04	0.17	0.09	0.08	0.22	0.13	0.08	0.06	0.14	0.06	0.11	0.08	0.01	0.2	0.16
CCL20099 (BN171_3690043)	0.04	0.02	0.05	0.03	0.05	0.11	1.0	0.02	0.03	0.15	0.08	0.11	0.12	0.04	0.02	0.19	0.05	0.04	0.19	0.06	0.04	0.05	0.12	0.05	0.09	0.04	0.02	0.14	0.05
CCL20241 (BN171_3870002)	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.12	1.0	0.05	0.01	0.07	0.05	0.06	0.51	0.02	0.06	0.2	0.15	0.05	0.29	0.09	0.05	0.48	0.13	0.05	0.12	0.05	0.67	0.18	0.13
CCL20255 (BN171_390009)	0.02	0.08	0.06	0.16	0.13	0.02	1.0	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.17	0.04	0.08	0.35	0.07	0.04	0.24	0.06	0.18	0.09	0.06	0.01	0.01	0.06	0.17	0.4	0.0
CCL20256 (BN171_390010)	0.41	0.44	0.69	0.73	0.54	0.82	1.0	0.31	0.18	0.4	0.2	0.16	0.42	0.15	0.27	0.65	0.22	0.33	0.71	0.51	0.35	0.07	0.52	0.14	0.3	0.46	0.37	0.42	0.16
CCL20257 (BN171_390011)	0.17	0.16	0.21	0.3	0.32	0.32	1.0	0.11	0.03	0.22	0.13	0.08	0.21	0.08	0.15	0.4	0.11	0.17	0.43	0.32	0.22	0.13	0.33	0.09	0.17	0.33	0.22	0.27	0.08
CCL20258 (BN171_390012)	0.11	0.16	0.16	0.29	0.17	0.26	1.0	0.08	0.02	0.15	0.19	0.14	0.2	0.06	0.14	0.32	0.09	0.11	0.31	0.19	0.28	0.13	0.22	0.14	0.17	0.12	0.29	0.15	0.12
CCL20259 (BN171_390013)	0.11	0.22	0.14	0.32	0.16	0.23	1.0	0.12	0.02	0.32	0.17	0.18	0.18	0.06	0.19	0.34	0.1	0.13	0.4	0.23	0.52	0.2	0.24	0.23	0.22	0.21	0.5	0.26	0.1
CCL20511 (BN171_60002)	0.12	0.46	0.11	0.48	0.12	0.06	0.57	0.14	0.1	0.75	0.77	0.62	0.51	0.09	0.56	0.72	0.22	0.16	0.66	0.09	0.28	0.35	0.6	0.14	0.08	0.08	0.22	1.0	0.46
CCL20519 (BN171_60010)	0.15	0.78	0.08	0.61	0.08	0.08	0.67	0.2	0.08	0.56	0.06	0.31	0.27	0.07	0.78	0.47	0.1	0.16	0.65	0.19	1.0	0.09	0.22	0.09	0.13	0.08	0.27	0.4	0.66
CCL20521 (BN171_60012)	0.08	0.33	0.07	0.36	0.07	0.04	0.62	0.05	0.06	0.31	0.19	0.44	0.28	0.06	0.26	0.45	0.08	0.08	0.53	0.07	1.0	0.19	0.22	0.15	0.11	0.05	0.27	0.39	0.2
CCL20522 (BN171_60013)	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.18	0.93	0.0	0.0	1.0	0.14	0.73	0.49	0.0	0.0	0.78	0.06	0.0	0.78	0.05	0.0	0.0	0.4	0.03	0.03	0.0	0.04	0.54	0.53
CCL20523 (BN171_60014)	0.1	0.33	0.06	0.33	0.05	0.04	1.0	0.06	0.06	0.44	0.03	0.58	0.18	0.05	0.14	0.26	0.06	0.08	0.36	0.1	0.74	0.16	0.13	0.11	0.11	0.07	0.22	0.37	0.12
CCL20625 (BN171_770002)	0.15	0.19	0.1	0.29	0.12	0.12	0.54	0.1	0.07	1.0	0.35	0.52	0.38	0.08	0.27	0.63	0.15	0.16	0.53	0.15	0.22	0.5	0.54	0.16	0.16	0.1	0.39	0.54	0.45
CCL20742 (BN171_970001)	0.03	0.0	0.02	0.0	0.0	0.06	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.1	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0
CCL20743 (glpK)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
CCL20744 (BN171_970003)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)