Heatmap: Cluster_7 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
10403S,Log
10403S,WT
10403S,LMRG 00730 deleted
10403S,delta sigB,Log
10403S,WT,Log
10403S,virR deleted,Log
10403S,WT,Bile
10403S,WT,ctrl
10403S,delta sigB,Bile
10403S,delta sigB,ctrl
10403S
ATCC 19115,Lactic acid(1h)
ATCC 19115,ctrl
WT
EGD
ATCC 19115,linalool
EDGe,37C(20min)
EDGe,20C(20min)
EDGe,20C(3h)
EDGe,Light
EDGe,Dark
EGD,MQ Water(0h)
EGD,MW Water(10min)
EGD,0.1875% L.plantarum(10min)
EGD,MQ Water(1h)
EGD,0.1875% L.plantarum(1h)
EGD,0.1875% L.plantarum+1mg/ml Pro-K(1h)
EGD,MQ Water(at 0h)
EGD,MQ Water(at 3h)
EGD,Ampicillin 0.03g/ml(at 3h)
EGD,Tetracycline 0.035g/ml(at 3h)
EGD,Gentamicin 0.3g/ml(at 3h)
EGD,Co-trimoxazole 0.2g/ml(at 3h)
EGDe
EGD,WT
37C,Late-Log
EGD,delta Lmo1408
EGD,delta Lmo0422
EGD,delta Lmo0599
EGDe,Lincomycin 0.25g/ml
EGDe,Chloramphenicol 0.4g/ml
EGDe,Erythromycin 0.03125g/ml
EGDe,Kanamycin 0.5g/ml
EGDe,Ofloxacin 2g/ml
EGDe,Ampicillin 1g/ml
EGDe,Bacitracin 8g/ml
EGDe,ctrl
EGDe,Lincomycin 0.5g/ml
EGDe,WT
EGDe,delta lftR
EGDe,37C,Late-Log
EGDe,WT,Light
EGDe,WT,Dark
EGDe,Light
EGDe,Dark
FFH,30C
FFH,10C
H1,37C,Late-Log
H2,37C,Late-Log
H3,37C,Late-Log
H5,37C,Late-Log
H6,37C,Late-Log
H7,37C,Late-Log
H8,37C,Late-Log
H10,37C,Late-Log
H11,37C,Late-Log
H17,37C,Late-Log
H19,37C,Late-Log
H27,37C,Late-Log
H28,37C,Late-Log
H31,37C,Late-Log
H32,37C,Late-Log
568
H7858,Log
H7858,WT,Bile
H7858,WT,ctrl
H7858,delta sigB,Bile
H7858,delta sigB,ctrl
LL195,ctrl
LL195,acid
Lm1,4C,Late-Stationary
Lm1,4C,Late-Log
Lm1,4C,Log
Lm1,WT,4C,Log
Lm1,4C,Lag
Lm1,20C,Late-Stationary
Lm1,20C,Late-Log
Lm1,20C,Log
Lm1,WT,20C,Log
Lm1,20C,Lag
LO28,37C,Late-Log
N12-0605,ctrl
N12-0605,acid
N13-0047,ctrl
N13-0047,acid
N13-1507,ctrl
N13-1507,acid
rli47,Log
WT,Log
Scott A,37C,Late-Log
AKI48038 (L2625_00063)
-0.69 1.33 0.6 0.18 0.09 -0.13 2.77 1.15 2.34 1.72 0.78 1.29 0.15 - - -0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.11 -0.74 - - - 1.32 - - - 1.96 - - 0.19 1.72 - 0.8 - 0.99 1.32 2.44 1.65 1.46 1.28 - - 1.11 1.9 1.66 0.8 1.07 1.64 1.9 1.35 1.3 1.73 - - - - - 0.4 2.13 - - -0.29
AKI48039 (L2625_00064)
-2.17 1.06 0.53 0.24 0.55 0.57 2.37 1.45 1.66 1.72 0.42 1.61 1.2 - - -0.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.16 1.16 - 1.94 1.47 0.61 - - - 1.73 - - 2.24 2.17 - 1.92 - 0.66 - 1.55 0.72 1.16 0.06 - - 1.12 1.78 0.88 -0.08 0.98 0.9 1.51 1.01 1.17 1.2 - - - - - 0.61 1.75 - - 1.35
AKI48040 (L2625_00065)
-1.26 1.27 0.38 1.95 -1.7 -0.95 2.37 1.56 1.08 1.39 0.62 -0.86 1.45 - - -1.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.31 -0.57 1.03 2.36 1.79 - - - 1.6 0.47 -0.73 2.06 2.47 1.9 - 0.48 - 0.76 -1.13 2.65 0.86 0.63 -0.54 - - 0.95 1.15 0.46 -0.51 0.86 0.63 0.88 0.91 0.74 0.74 - - - - - -0.23 2.62 - - 1.21
AKI48057 (L2625_00083)
-0.66 -0.79 -0.26 -0.13 -1.03 -1.0 -0.5 -0.59 -0.19 -0.72 -0.66 -0.63 -1.27 0.2 -0.58 -3.08 -1.05 -1.45 -0.92 -0.52 -0.61 -0.54 0.11 -0.07 -0.24 0.13 -0.22 -0.01 0.11 0.28 0.05 0.19 0.17 -1.56 -0.79 0.6 -0.48 -0.27 -0.7 -1.03 -1.2 -0.85 -0.68 -0.81 -1.03 -0.81 -0.71 -1.47 -0.67 -0.82 1.12 -0.32 -0.24 -0.25 -0.84 1.17 1.11 0.49 -0.21 -0.57 0.17 0.91 1.0 -0.38 1.25 1.05 0.21 -0.23 0.18 1.27 0.32 0.16 -0.01 1.6 0.32 -0.61 0.2 -0.23 0.64 0.14 1.24 1.09 -0.17 -0.5 -0.47 -0.11 0.29 -0.92 -1.4 -0.59 1.09 0.59 -0.04 0.27 0.04 0.05 -0.86 0.5 0.59 0.07
AKI48069 (manL)
-10.02 -0.01 -0.62 -8.29 -3.06 -2.77 0.14 -0.9 1.14 -1.04 -7.97 -2.04 -6.55 -0.85 -0.46 -0.11 -0.39 -1.2 -1.27 0.01 -0.38 -0.82 -0.25 -0.2 0.49 0.53 0.74 -0.34 0.53 0.71 -0.36 0.44 0.21 -1.0 -0.22 -0.13 -0.08 -0.12 -0.47 -0.36 -0.53 -0.4 -0.16 -0.21 -0.46 -0.56 -2.06 -2.27 -0.83 -0.64 0.58 -1.31 0.4 0.21 0.15 1.47 -0.07 -6.09 -2.99 -3.26 -1.47 -1.98 -1.83 0.82 1.48 1.12 0.4 -3.05 -1.18 0.46 0.12 0.6 -2.67 0.48 0.65 -1.52 -0.23 -1.14 2.7 -1.96 1.12 1.37 0.16 -4.28 -6.99 -3.58 2.47 0.54 -0.65 -4.52 -4.0 2.59 -3.06 2.12 -3.91 0.83 -2.29 -0.64 -0.82 -3.39
AKI48070 (manM)
-9.13 -0.3 -1.13 -8.44 -3.15 -2.87 -0.8 -1.52 0.8 -1.54 -7.94 -4.29 -8.22 -1.5 -0.32 -2.19 -0.59 -1.47 -1.62 0.32 -0.07 -1.15 -0.73 -0.69 0.03 0.02 0.32 -0.79 0.11 0.36 -0.69 0.08 -0.18 -0.69 -0.48 0.11 -0.47 -0.52 -0.84 -0.05 -0.11 0.04 0.13 0.12 -0.04 -0.32 -1.75 -2.3 -1.0 -1.18 0.73 -0.99 0.67 0.52 0.54 1.61 -0.22 -5.75 -2.43 -2.86 -1.05 -1.27 -1.05 0.9 1.95 1.38 0.4 -2.57 -0.51 1.02 0.37 0.65 -3.16 0.09 0.78 -1.32 -0.02 -1.03 2.79 -1.73 0.97 1.09 -0.15 -4.55 -7.61 -3.68 2.28 0.31 -0.85 -4.85 -4.06 2.88 -2.63 2.13 -4.35 1.09 -2.33 -0.49 -0.6 -2.91
AKI48071 (manN)
-8.95 -0.65 -0.65 -7.94 -2.19 -1.87 -0.75 -1.48 0.25 -1.53 -8.36 0.32 -5.82 -0.6 -0.29 -1.23 -0.05 -1.01 -0.97 0.09 -0.13 -1.34 -0.73 -0.67 -0.05 -0.05 0.3 -0.89 0.06 0.19 -0.86 -0.04 -0.3 -0.72 -0.24 0.03 -0.13 -0.31 -0.54 0.13 0.02 0.13 0.31 0.21 0.11 -0.23 -1.85 -2.33 -0.66 -0.88 0.48 -1.02 0.39 0.43 0.38 1.78 -0.25 -6.3 -1.75 -1.98 -0.46 -0.25 0.04 0.61 2.21 1.18 -0.02 -1.81 -0.16 1.3 0.07 0.52 -2.28 -0.44 -0.07 -1.99 -1.0 -1.71 2.53 -1.79 1.48 1.27 -0.11 -4.59 -6.6 -3.28 2.5 0.27 -0.82 -4.46 -3.88 2.58 -2.43 1.87 -4.4 0.71 -1.95 -0.81 -0.83 -2.79
AKI48072 (L2625_00098)
-3.96 -0.56 -0.32 -3.75 -3.87 -3.82 -1.01 -1.32 -0.38 -1.63 -2.93 -0.18 -2.73 0.02 0.12 -0.87 0.49 -0.35 -0.44 0.26 -0.04 -0.98 -0.41 -0.42 0.13 0.13 0.45 -0.54 0.25 0.39 -0.43 0.31 0.05 -0.27 0.06 0.17 0.1 -0.02 -0.08 0.24 0.25 0.24 0.47 0.32 0.25 0.13 -0.82 -1.0 0.1 -0.2 1.07 -0.66 0.58 0.25 0.37 1.34 -0.01 -1.91 -1.66 -2.4 -1.12 -1.69 -1.41 1.0 0.79 1.15 0.22 -1.3 -1.27 0.45 0.37 0.78 -0.55 -0.96 -0.87 -1.7 -1.68 -1.73 2.24 -1.58 0.02 1.52 0.4 -2.53 -2.16 -2.2 1.76 0.06 -0.81 -2.28 -1.46 2.18 -1.64 2.53 -2.22 0.41 -1.91 -0.13 -0.23 -1.45
AKI48249 (L2625_00301)
-1.79 -0.33 -0.5 -1.65 -1.47 -1.43 -2.15 -5.01 -0.78 -5.28 -1.75 -0.91 -0.86 -2.95 -1.75 -6.03 -1.47 -1.91 -1.85 -0.7 -0.98 -1.57 -1.75 -0.97 -2.33 -2.22 -2.49 -2.53 -2.45 -2.71 -2.53 -2.54 -2.24 -3.42 -1.57 0.96 -1.23 -1.24 -1.13 -1.79 -1.76 -1.83 -1.7 -1.8 -1.87 -1.74 -1.99 -1.86 1.29 0.83 -1.3 -2.63 -0.56 -0.12 -1.0 -0.78 1.17 0.06 0.97 0.8 0.47 1.66 0.81 -0.77 1.38 1.17 -0.52 0.75 1.8 1.78 -0.62 -0.08 0.08 -1.59 -1.46 -3.27 -1.05 -3.08 3.04 0.87 -0.82 -1.1 -1.08 -2.88 -4.13 -0.74 0.81 -1.72 -1.48 -4.49 0.13 3.14 1.03 2.96 1.54 -0.04 1.52 -2.07 -2.25 1.07
AKI48250 (nrdD)
-1.04 -1.73 -1.54 -0.57 -2.12 -2.04 0.78 -0.11 0.86 0.4 -2.08 -0.53 -3.55 -2.65 -2.39 -2.89 -0.98 -2.05 -2.0 -1.85 -1.82 -0.92 -0.98 -0.88 -1.17 -0.63 -1.51 -1.32 -0.3 0.13 -1.18 -0.38 -0.58 -2.1 -0.1 0.73 0.08 -0.21 -0.23 0.62 0.13 0.24 0.37 -1.25 0.18 0.14 -1.53 -1.21 -1.74 -2.18 2.73 -1.82 -0.96 -0.89 -1.45 0.24 -3.16 1.31 0.05 0.3 0.31 -0.21 -0.77 -0.2 1.06 0.9 0.8 -0.03 1.59 -0.43 0.86 0.44 -1.41 -0.74 1.4 0.2 1.2 0.18 0.7 0.52 0.25 1.19 -0.54 -2.52 -1.93 1.43 0.55 0.27 -1.43 -1.03 0.7 1.1 0.35 0.74 -1.05 0.25 0.21 0.49 -0.26 0.67
AKI48251 (nrdG)
-1.58 -2.08 -1.62 -1.29 -3.19 -3.03 -0.49 -1.04 -0.64 -0.39 -2.71 1.18 -2.91 -1.83 -1.76 -1.37 -0.37 -1.6 -1.41 -1.6 -1.51 -1.32 -1.28 -1.43 -1.61 -1.0 -1.91 -1.88 -1.0 -0.61 -1.69 -1.18 -1.56 -2.88 0.42 0.27 0.56 0.28 0.22 1.04 0.67 0.79 0.98 -0.49 0.67 0.62 -0.98 -0.96 -1.29 -1.87 2.85 -1.61 -0.66 -1.27 -1.16 0.16 -2.41 0.94 -0.25 -0.32 -0.1 -0.12 -0.95 -0.46 1.2 1.09 0.67 -0.38 1.19 -0.25 0.59 0.33 -0.46 -2.81 0.24 -1.13 0.0 -0.95 1.32 0.72 1.17 1.1 -0.84 -2.32 -1.36 1.01 0.52 0.47 -1.28 -0.55 -0.58 1.9 0.77 1.16 -0.08 1.01 0.26 0.62 0.1 0.64
AKI48316 (L2625_00370)
0.55 0.21 -0.93 0.36 0.92 0.91 0.18 -1.68 0.59 -0.9 -0.36 -3.61 -3.89 -1.37 -1.14 -4.3 -0.5 -1.17 -1.16 -0.55 -0.58 -0.66 -0.52 -0.5 -0.81 -0.71 -0.81 -0.56 -0.32 0.82 -0.39 -0.43 0.19 -0.16 1.24 0.25 1.55 0.97 1.13 -0.17 -0.4 -0.27 0.09 0.05 0.04 -0.17 -0.58 -1.2 -0.23 -0.37 1.64 -1.66 -0.09 0.21 -0.47 -0.05 -1.68 1.65 -1.64 0.26 0.31 -0.83 -1.88 1.72 -0.76 1.14 0.89 -1.33 -0.74 -1.55 0.45 0.42 -0.53 -1.02 -0.69 -2.7 -0.78 -1.89 0.9 -0.33 -2.02 0.14 -0.33 -1.55 -2.63 0.55 1.44 0.72 -0.99 -1.78 1.51 0.86 -0.33 0.96 -0.17 0.59 -1.03 -0.33 -0.8 -1.16
AKI48317 (frdC)
-0.79 -0.62 -3.06 -1.52 -0.09 -0.16 2.35 0.39 2.36 0.93 -2.81 -0.98 -2.04 -3.09 -3.36 -2.58 -0.94 -2.74 -3.0 -2.7 -2.69 -1.97 -1.82 -2.1 -2.05 -1.63 -1.37 -2.34 -1.35 0.36 -2.17 -1.72 -0.9 -2.88 0.15 0.55 0.48 0.01 -0.08 -1.65 -1.72 -1.72 -1.51 -1.52 -1.66 -1.88 -2.12 -2.38 -2.73 -3.12 1.97 -3.6 -1.88 -1.36 -2.33 0.8 -6.77 1.18 -2.04 -1.24 0.8 -0.25 -1.59 1.35 2.24 2.0 0.81 -1.33 0.36 0.55 0.79 0.7 -3.1 -2.42 1.83 0.01 1.72 0.29 1.87 -0.89 -2.58 -0.61 -1.36 -4.98 -5.03 -0.28 1.73 1.11 -3.11 -4.09 1.05 1.62 -1.72 1.98 -0.2 1.39 -1.47 -2.91 -4.4 -1.7
AKI48371 (L2625_00427)
-2.57 -1.39 -1.51 -2.29 -1.58 -1.44 -0.97 -2.67 -0.82 -2.52 -3.02 0.85 -1.29 -0.56 -1.4 -2.38 0.59 0.22 -0.3 -1.08 -1.33 -0.23 -0.07 -0.38 -0.13 -0.31 -0.36 -0.74 1.02 2.01 -0.13 0.89 1.54 0.99 0.41 -0.49 0.13 -0.89 -0.34 0.34 0.38 0.99 0.44 0.3 0.24 -0.04 -0.18 -0.19 -0.45 -1.87 1.56 -1.48 -0.49 0.06 -1.1 0.33 -3.1 0.79 -2.46 -3.6 -3.72 -2.17 -2.37 0.38 0.67 0.5 1.27 -0.98 -0.41 -0.92 0.06 1.19 -1.32 -1.39 0.84 -1.66 0.92 -1.77 1.25 -0.58 -1.0 0.45 -0.5 -2.29 -2.56 0.07 1.17 1.18 -1.75 -1.63 0.38 1.09 -1.08 1.95 -0.91 2.09 -1.23 -0.34 -1.1 -2.16
AKI48425 (L2625_00483)
0.4 0.45 -0.56 0.31 -0.63 -0.76 0.84 0.81 1.09 0.66 -0.2 -0.97 0.46 0.42 -0.99 -3.77 -0.69 -0.59 -0.54 -1.12 -1.28 -1.49 -1.22 -1.11 -1.19 -0.89 -1.06 -1.2 -1.31 -0.82 -1.22 -1.09 -0.97 -1.58 -1.21 0.32 -0.9 -1.34 -1.36 -1.06 -1.98 -1.45 -1.67 0.15 -0.86 -1.36 -0.73 -0.81 -0.8 -1.4 0.38 -1.82 -0.57 -1.35 -1.59 0.15 -0.27 0.61 -0.74 0.22 0.15 1.16 0.6 0.42 -0.54 0.49 0.84 -0.25 -0.95 1.3 0.71 0.83 0.81 -0.73 1.8 1.26 1.76 1.5 0.54 0.04 -1.93 0.6 0.52 0.15 -0.81 -0.13 0.77 0.4 0.69 -0.2 -0.1 0.61 0.29 0.65 -0.02 0.68 0.64 -0.34 -1.04 -0.97
AKI48439 (aroE-1)
0.21 0.02 -0.61 -0.2 1.07 1.0 0.57 -1.59 0.91 -1.14 -1.65 -1.47 1.31 -0.36 -2.17 -3.44 -0.93 -0.8 -0.92 -1.32 -1.65 -2.44 -1.45 -2.05 -1.57 -2.07 -2.06 -1.85 -0.74 0.48 -1.11 -0.62 -0.27 -1.96 0.34 0.29 0.67 0.22 0.37 -0.55 -0.37 -0.57 -0.46 -0.05 -0.32 -0.22 -1.62 -1.46 -1.06 -2.21 1.28 -1.59 -1.03 -0.25 -0.99 0.73 -0.44 1.19 -1.33 -0.86 -0.78 -1.08 -0.85 1.22 0.96 0.02 -0.07 -0.6 0.64 -0.26 0.04 -0.52 0.07 0.98 0.63 -1.16 0.61 -0.79 1.18 -0.07 0.29 1.79 1.33 -0.04 0.26 0.68 1.62 0.95 -0.95 -0.61 1.14 0.92 -0.39 1.26 -0.55 0.69 -1.51 -0.6 -1.84 -0.34
AKI48440 (aroD)
-1.04 -1.14 -1.14 -0.96 0.02 0.03 -0.53 -0.77 -0.55 -1.19 -1.38 -2.24 0.65 -0.48 -0.4 -2.29 -0.0 -0.15 -0.31 -0.28 -0.34 -1.01 -0.57 -0.69 -1.11 -1.0 -0.78 -0.95 -0.91 -0.38 -0.84 -0.82 -0.68 0.16 0.33 0.56 0.32 0.07 0.17 -0.24 -0.24 -0.04 -0.18 0.09 -0.27 0.28 -0.74 -0.86 0.71 -1.13 1.33 0.02 -0.0 0.14 -0.23 0.43 0.03 1.15 -0.31 -1.03 -0.87 -0.38 -0.22 1.34 0.99 0.19 0.21 0.51 0.68 0.23 0.17 0.14 -0.06 -0.74 -0.89 -0.92 -0.99 -1.22 1.19 0.35 -0.17 0.88 0.53 -0.36 -0.25 0.13 0.95 0.58 -0.84 -0.28 1.31 1.12 0.41 1.21 0.14 0.66 -0.98 0.11 -0.11 0.4
AKI48737 (L2625_00807)
0.3 0.8 -1.22 0.33 0.21 0.31 1.01 -0.33 0.71 0.81 0.81 -2.14 -2.48 -1.23 -0.59 1.77 0.1 -0.08 -0.06 0.1 0.09 0.38 0.03 0.45 0.28 -0.08 -0.08 0.11 0.4 0.83 0.14 0.47 0.57 -0.83 0.62 0.19 0.92 0.4 0.65 -1.01 -1.2 -0.81 -0.85 -0.85 -0.86 -1.19 -0.9 -1.06 0.04 -0.29 1.18 -1.29 0.36 0.46 -0.02 0.36 -2.12 1.15 -1.15 -1.06 -1.03 -0.02 -1.15 1.09 -0.91 0.55 0.48 -1.05 -0.88 -1.01 0.34 -0.33 -1.26 -0.2 -0.58 -1.64 -0.55 -0.29 0.26 -0.73 -1.43 0.25 -0.24 -1.27 -3.03 -0.67 0.96 0.42 -0.12 -0.96 1.29 0.24 -0.87 0.7 -1.35 -0.05 -1.96 -0.65 -0.91 0.1
AKI48739 (L2625_00809)
-0.61 -0.02 -0.43 -0.76 -0.14 0.04 -0.41 -1.34 -0.47 -1.65 -3.13 -0.25 -2.86 -1.12 -2.44 -1.32 -0.34 -0.71 -0.64 -2.13 -1.95 -0.78 -0.45 -0.71 -0.31 -0.16 -0.73 -0.93 0.34 1.38 -0.5 0.11 0.71 -0.28 0.11 0.03 0.21 -0.14 -0.02 0.33 0.28 0.4 0.4 0.33 0.3 0.46 -1.02 -1.43 -1.0 -2.21 1.29 -0.25 -0.71 -0.22 -1.19 0.68 -3.61 1.11 -1.55 -0.6 -0.48 -0.96 -1.34 1.43 -0.77 1.48 0.16 -0.93 -0.09 -0.96 0.63 0.54 -2.03 -0.47 -0.23 -0.95 -0.67 -1.81 1.0 0.97 2.23 1.44 0.48 -2.81 -2.61 1.1 0.07 0.23 -2.35 -2.22 0.8 1.27 0.73 0.79 0.92 0.67 0.29 0.45 -1.65 -0.27
AKI48764 (L2625_00835)
0.22 0.65 -0.65 0.22 -0.31 -0.66 1.5 -0.19 1.76 0.51 0.22 -1.73 -2.16 -1.22 -1.51 -3.42 -0.38 -1.28 -1.5 -0.86 -1.12 -0.32 -0.46 -0.62 -0.53 -0.69 -0.73 -0.63 0.05 0.71 -0.35 -0.12 0.26 -0.42 0.16 0.03 0.23 0.05 0.09 -0.48 -0.76 -0.45 -0.35 -0.84 -0.36 -0.72 -0.96 -1.07 -1.06 -1.76 0.79 -1.92 -0.2 0.16 -0.68 0.23 -2.13 0.91 -1.33 -1.14 -1.42 -0.12 -1.14 1.03 -0.67 0.86 0.77 -0.94 -0.03 -0.49 -0.03 0.59 -0.9 -0.06 1.64 -0.03 1.67 0.81 1.17 0.27 -2.68 0.24 0.33 -0.54 -1.23 -0.54 0.49 0.93 -0.04 -0.54 0.27 1.15 0.27 1.29 -0.76 1.51 -0.16 -1.2 -2.11 -0.72
AKI48860 (fnt)
1.07 0.01 -0.89 0.32 -0.69 -0.68 0.48 -0.58 1.04 -0.29 -1.87 -1.78 -2.58 -1.08 -1.79 -2.93 -0.75 -0.91 -0.91 -2.46 -2.43 -2.07 -2.04 -2.35 -1.9 -2.1 -2.15 -2.36 -1.04 0.35 -1.94 -1.16 -0.23 0.59 0.74 0.17 0.99 0.43 0.43 -0.85 -0.84 -0.91 -0.53 -0.77 -0.8 -0.86 -1.48 -1.22 -0.37 -3.14 1.43 -1.94 -1.51 -0.47 -2.05 0.41 -2.91 1.44 -1.59 -1.61 -1.72 -0.68 -1.76 1.32 -1.13 0.62 0.57 -0.83 0.38 -1.48 0.62 0.77 -0.55 -0.12 1.37 0.07 1.47 0.11 1.76 0.49 0.41 1.51 -0.11 -1.92 -2.03 1.03 1.44 1.45 -1.2 -1.49 0.8 1.6 0.12 1.55 -0.78 1.91 0.07 -0.49 -1.66 -0.11
AKI48909 (lemA)
0.29 -0.14 -0.22 0.39 -0.02 0.14 0.12 -0.18 -0.0 0.1 -0.51 -1.29 -1.42 -0.32 -0.37 -3.2 -0.89 -1.2 -1.24 0.02 0.07 -0.1 0.22 0.3 -0.05 0.29 -0.1 -0.23 0.37 0.11 -0.31 0.28 0.05 -0.5 -0.12 0.1 -0.17 0.05 0.24 0.3 -0.11 0.48 0.15 0.03 -0.07 0.48 -0.23 0.0 -0.15 -0.33 0.5 -0.37 0.47 0.36 0.17 -0.19 0.14 0.19 -0.38 -0.66 -0.4 -0.43 -0.31 0.36 0.57 0.45 0.34 -0.51 -0.33 -0.05 0.03 -0.28 0.15 -0.04 -0.65 -1.01 -0.65 -0.5 0.12 -0.17 0.6 1.27 1.19 0.83 0.44 -0.64 0.37 0.33 0.24 0.05 0.15 -0.19 -0.39 0.25 0.22 -0.26 -0.67 -0.2 -0.28 -0.34
AKI48910 (htpX)
0.36 0.03 0.11 0.45 0.29 0.43 0.4 0.06 0.4 0.02 -0.39 -1.91 -1.88 -0.92 -0.21 -3.96 -0.7 -1.12 -1.25 0.16 0.24 -0.44 -0.21 -0.28 -0.62 -0.23 -0.54 -0.55 -0.1 -0.27 -0.67 -0.05 -0.3 -0.2 -0.15 -0.03 -0.29 -0.07 0.12 0.52 0.25 0.61 0.24 0.23 0.29 0.73 -0.11 0.1 -0.11 -0.71 0.5 -0.25 0.61 0.57 0.39 -0.19 0.12 0.23 -0.77 -0.42 -0.24 -0.32 -0.74 0.28 0.34 0.67 0.36 -0.89 -0.65 -0.55 0.19 -0.04 0.13 -0.32 0.08 -0.65 0.02 -0.17 -0.23 -0.23 0.76 1.12 1.1 0.86 0.62 -0.56 0.39 0.29 0.19 0.05 0.25 -0.24 -0.39 -0.19 0.31 -0.07 -0.98 -0.11 -0.14 -0.66
AKI48951 (ptsI)
0.87 -0.19 -0.42 1.09 0.5 0.46 0.38 0.04 0.91 0.2 0.23 -2.76 -2.39 -1.69 -0.27 -1.35 -0.84 -1.0 -1.21 0.14 0.16 -0.57 -0.45 -0.45 -0.72 -0.56 -0.68 -0.59 -0.2 -0.38 -0.54 -0.1 -0.46 -0.36 0.19 -0.03 0.31 0.39 0.32 -0.1 -0.17 -0.23 -0.25 -0.25 -0.31 -0.24 -0.53 -0.29 0.09 -0.0 -0.07 -0.04 0.11 0.17 0.31 0.49 -0.12 0.14 -0.52 -1.12 -0.61 -0.02 -0.54 0.23 0.25 0.18 -0.16 -0.51 -0.35 0.01 -0.22 -0.51 -0.14 -0.11 0.57 0.04 0.71 0.37 0.99 0.54 -1.49 0.23 0.08 0.17 -0.04 0.41 0.48 0.3 0.16 -0.08 0.29 0.93 0.28 0.9 0.4 0.45 -0.21 -0.46 -0.48 0.27
AKI49385 (tcsA)
0.95 -0.31 -2.04 0.75 -0.4 -0.29 0.82 -0.99 1.61 0.12 1.41 -3.39 -1.75 -2.42 -0.56 -4.22 -0.45 -0.7 -1.0 0.28 0.16 -0.65 -0.41 -0.34 -0.74 -1.07 -0.7 -0.86 -1.3 -1.1 -0.93 -1.38 -1.18 -1.09 0.2 0.04 0.54 0.63 0.12 -0.53 -0.88 -0.78 -0.5 -0.67 -0.85 -1.33 -0.45 -0.73 -0.32 0.13 -0.47 -1.51 0.19 0.09 0.11 0.39 0.36 0.59 0.17 -0.58 -1.03 0.77 0.17 0.09 1.07 -0.23 0.5 0.09 0.2 0.01 -0.4 -0.63 -0.57 0.89 0.82 -1.38 1.12 0.04 0.87 0.75 -2.11 -0.14 0.6 -0.08 -2.22 0.35 1.58 0.92 -0.13 -0.58 0.9 0.48 0.46 -0.3 -0.45 1.03 0.14 -0.28 0.25 -0.9
AKI49568 (pfk)
1.04 -0.38 -0.92 1.1 0.53 0.51 0.41 -0.14 0.78 0.28 0.31 -3.28 -3.26 -1.15 -0.13 -2.64 -0.36 -0.52 -0.34 -0.1 -0.16 -1.31 -1.06 -1.15 -1.49 -1.23 -1.26 -1.61 -1.23 -1.09 -1.53 -1.12 -1.15 0.57 0.36 0.1 0.22 0.24 0.14 -0.23 -0.55 -0.28 -0.35 -0.37 -0.3 -0.14 -0.49 -0.35 0.26 -0.73 0.51 -0.45 -0.02 0.1 -0.08 0.6 0.41 0.59 -1.05 -2.02 -1.85 -0.85 -0.98 0.7 -0.1 0.39 0.04 -1.12 -0.99 -0.67 -0.16 0.01 0.16 1.62 0.92 0.42 1.07 0.72 1.08 0.29 -1.66 1.02 -0.04 -0.23 0.14 0.13 0.48 0.01 -0.68 -0.23 0.6 0.98 0.2 1.03 0.02 1.22 -0.46 -0.08 -0.16 -0.23
AKI49584 (argF)
-3.02 0.85 -0.47 -2.21 4.1 3.84 -1.0 -0.13 -0.41 -0.83 -2.52 -1.96 -1.41 0.24 -0.98 -2.0 -1.56 -1.06 -0.9 -1.86 -1.47 -1.15 -0.88 -0.67 -0.26 -0.32 -0.5 -0.52 -0.22 -0.31 -0.26 -0.4 -0.34 -1.96 -2.68 -0.32 -3.14 -2.2 -2.23 -1.01 -1.13 -1.14 -0.89 -1.86 -0.87 -1.2 -0.94 -0.98 -1.53 -1.74 0.38 -0.52 -1.01 -1.67 -1.64 3.25 -1.66 -2.35 -0.93 -2.07 -0.09 -0.45 -0.51 -1.18 1.93 0.34 -2.0 -0.85 -0.42 -0.82 0.33 -1.14 -0.82 -1.02 -1.06 -0.27 -1.13 -0.66 -1.6 -0.97 -0.79 -0.45 -0.77 -0.91 -0.41 -1.6 0.79 -2.59 -2.17 -1.19 0.03 -1.29 -1.16 -1.77 -1.21 -1.11 -0.47 0.58 -0.43 -0.31
AKI49585 (argD)
-3.68 0.81 -0.45 -1.78 3.63 3.34 -0.86 -0.81 -0.1 -1.49 -4.23 -3.53 -2.16 1.44 -0.77 -4.04 -1.95 -1.17 -1.04 -2.04 -2.15 -0.06 -0.66 -1.32 0.01 -0.6 -0.25 0.01 0.03 0.74 -0.32 -0.01 0.5 -2.72 -3.77 -0.34 -4.93 -3.07 -4.12 -1.26 -1.43 -2.09 -1.16 -1.62 -1.36 -1.15 -0.87 -0.79 -2.4 -2.02 1.23 0.08 -1.36 -1.42 -1.7 3.82 -1.04 -1.46 -1.85 -1.54 0.67 -0.75 -1.15 -1.6 2.55 1.51 -2.62 -2.02 -3.69 -1.11 0.08 -0.75 -1.55 -0.49 -0.79 -1.77 -1.35 -1.74 -2.24 -2.4 -0.48 -0.68 -1.14 -1.18 -0.73 -2.54 1.45 -3.25 -2.51 -2.61 0.31 -2.4 -1.8 -1.64 -1.25 -1.63 -1.51 1.09 -0.37 -1.29
AKI49587 (argJ)
-1.08 0.16 -0.97 -1.88 3.79 3.58 0.49 -2.18 0.92 -1.56 -3.37 -2.48 -2.19 1.24 -0.86 -3.78 -1.72 -0.85 -0.83 -2.73 -2.61 -0.65 -1.44 -1.4 -0.82 -1.33 -0.97 -0.47 -0.88 1.05 -0.79 -0.87 0.69 -2.12 -2.79 -0.3 -3.34 -2.56 -5.01 -2.59 -3.19 -2.78 -2.11 -2.15 -1.72 -1.56 -1.29 -1.46 -2.22 -2.1 1.83 -1.08 -1.46 -1.57 -1.41 2.92 -0.94 0.75 -4.34 -2.22 0.27 -1.13 -1.59 -1.76 2.32 2.81 -2.67 -2.97 -3.12 -3.39 -0.08 -0.58 -1.45 -1.29 -1.55 -2.9 -1.89 -1.93 -0.28 -2.56 -1.79 -0.89 -1.06 -0.98 -1.28 -3.24 1.98 -2.93 -3.12 -3.34 -0.3 -1.25 -1.58 -0.19 -0.56 -0.62 -2.45 1.51 0.72 -2.24
AKI49601 (ampS-1)
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AKI49631 (adhE)
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AKI49866 (L2625_02013)
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AKI49912 (L2625_02063)
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AKI49948 (punA)
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AKI49949 (deoB)
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AKI49950 (xerD)
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AKI49988 (pyn)
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AKI50108 (manA)
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AKI50234 (L2625_02401)
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AKI50235 (L2625_02402)
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AKI50236 (L2625_02403)
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AKI50248 (L2625_02415)
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AKI50249 (L2625_02416)
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AKI50250 (aspB-2)
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AKI50269 (fruA)
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AKI50270 (fruB)
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AKI50271 (fruR)
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AKI50375 (L2625_02564)
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AKI50383 (eno)
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AKI50384 (pgm)
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AKI50385 (tpi)
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AKI50386 (pgk)
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AKI50387 (gap)
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AKI50458 (atpC)
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AKI50459 (atpD)
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AKI50460 (atpG)
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AKI50461 (atpA)
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AKI50462 (atpH)
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AKI50486 (fbaA)
0.32 0.09 -0.08 0.32 0.65 0.58 0.11 -0.69 0.3 -0.34 -0.75 -1.8 -2.45 -1.94 -0.65 -2.28 -0.66 -0.85 -1.1 -0.06 -0.06 -0.8 -0.49 -0.55 -0.82 -0.62 -0.79 -0.83 -0.84 -0.43 -0.79 -0.79 -0.56 -0.56 0.28 -0.24 0.52 0.25 0.39 0.22 0.21 0.44 0.36 0.47 0.34 0.4 -0.24 -0.3 -0.14 -0.33 0.54 -0.84 0.01 0.03 0.05 0.38 0.2 -0.31 -1.17 -1.51 -1.21 -0.74 -1.4 -0.4 0.23 0.07 -0.13 -0.98 -0.9 -0.41 -0.39 -0.3 0.33 -0.56 0.38 -1.08 0.36 -0.13 1.1 0.45 -0.43 1.49 1.42 1.13 -0.05 -0.38 0.76 1.0 0.62 0.03 0.23 0.92 0.43 1.08 0.46 1.17 -0.23 -0.63 -0.75 -0.59
AKI50572 (L2625_02782)
0.47 1.37 0.83 0.23 1.82 1.89 0.72 -2.67 0.56 -1.47 -0.4 -0.78 -1.16 -1.21 -2.53 -2.46 -0.3 -0.21 -0.37 -1.66 -1.6 -1.22 -1.5 -0.96 -0.95 -1.2 -1.65 -1.82 -0.03 0.39 -1.2 -0.28 0.31 -1.84 0.72 -0.2 1.25 0.88 1.11 -0.12 -0.52 -0.32 -0.38 -0.53 -0.44 -0.43 -1.08 -0.42 -0.47 -0.95 0.11 -1.64 -0.88 -0.15 -1.14 1.18 -1.42 0.05 -0.1 -0.2 -0.23 0.84 -0.03 0.11 0.8 -0.14 0.58 -0.07 0.26 -0.22 -0.1 0.06 -1.75 0.37 -0.26 -3.06 -0.18 -2.32 0.93 0.65 -0.52 0.81 1.29 -2.09 -3.57 0.16 0.98 1.26 -1.67 -3.02 -0.3 0.71 0.66 0.95 -0.06 -0.16 0.34 -0.15 -1.67 -0.31
AKI50577 (L2625_02787)
0.7 0.72 0.16 0.55 0.85 0.78 0.68 -0.07 0.6 0.0 -0.37 -1.06 -1.83 -1.1 -1.86 -1.93 -1.25 -1.65 -1.85 -0.94 -0.86 -0.79 -0.63 -0.67 -0.7 -0.8 -0.95 -1.07 0.02 0.53 -0.56 -0.09 0.44 -2.24 -0.34 0.15 -0.08 0.03 -0.08 0.18 0.18 0.33 0.26 0.29 0.35 0.38 -0.77 -1.01 -0.44 -0.98 1.53 -0.37 0.03 -0.17 -0.4 0.66 -2.43 1.38 -1.01 -0.77 -0.87 -0.62 -1.58 1.02 -0.01 0.91 0.64 -0.28 0.25 -0.99 0.42 0.64 -1.07 -1.26 0.41 -0.34 0.23 -0.44 1.17 -0.31 0.7 0.85 0.09 -0.94 -0.75 0.51 0.57 0.46 -0.55 -0.87 0.11 1.21 -0.2 1.13 0.12 0.29 -1.14 -0.54 -1.62 0.12
AKI50684 (serS)
0.09 -0.29 -0.75 0.43 0.0 0.13 -0.06 -0.1 -0.11 -0.03 -0.09 -0.5 -1.83 -1.19 0.13 -2.67 -0.32 -0.38 -0.67 0.69 0.63 0.36 0.28 0.0 0.15 -0.22 0.08 0.39 0.19 0.35 0.39 0.24 0.36 -0.29 0.14 -0.08 0.27 0.33 0.25 -0.14 -0.36 -0.01 0.02 0.03 -0.07 -0.03 -0.13 -0.54 0.39 0.13 0.67 0.53 0.71 0.65 0.55 0.38 -0.41 0.43 -0.55 -0.09 0.35 -0.59 0.33 0.2 0.32 1.39 -0.02 -0.32 -0.03 0.56 0.24 0.19 -0.78 -0.31 -0.01 -0.27 -0.28 -0.28 -0.36 -0.83 -0.26 -0.63 -0.4 -0.98 -2.02 -1.13 0.13 -0.17 -0.13 -0.52 0.0 0.06 -0.88 -0.17 -0.66 0.22 -1.7 0.91 0.37 -0.73
AKI50768 (L2625_02984)
-0.29 -0.93 -1.07 -0.01 1.99 1.86 0.12 -0.48 0.63 -0.52 -0.42 -1.31 -2.92 -1.21 -0.79 -4.04 -1.06 -0.55 -0.74 0.09 -0.19 -0.08 -0.22 -0.33 -0.25 -0.29 -0.36 -0.21 -0.09 0.15 -0.08 -0.15 -0.22 -1.36 -1.06 -0.16 -1.05 -0.81 -1.1 -0.78 -0.85 -0.71 -0.71 -0.53 -0.79 -0.46 -0.94 -1.03 -0.74 -0.36 -0.21 -0.47 0.12 0.24 -0.39 0.16 0.6 1.22 1.07 -1.41 -1.69 0.72 0.87 0.81 -1.02 -0.79 -0.72 0.72 0.94 0.54 -0.3 -0.47 -1.03 0.36 -0.57 -1.2 -0.54 -0.94 0.34 0.49 -0.15 1.55 1.47 0.73 -0.5 1.03 1.44 0.17 -0.19 -1.0 0.12 0.42 0.32 0.79 -0.71 -1.28 -0.7 -0.73 -0.9 0.87

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.