Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
10403S,Log
10403S,WT
10403S,LMRG 00730 deleted
10403S,delta sigB,Log
10403S,WT,Log
10403S,virR deleted,Log
10403S,WT,Bile
10403S,WT,ctrl
10403S,delta sigB,Bile
10403S,delta sigB,ctrl
10403S
ATCC 19115,Lactic acid(1h)
ATCC 19115,ctrl
WT
EGD
ATCC 19115,linalool
EDGe,37C(20min)
EDGe,20C(20min)
EDGe,20C(3h)
EDGe,Light
EDGe,Dark
EGD,MQ Water(0h)
EGD,MW Water(10min)
EGD,0.1875% L.plantarum(10min)
EGD,MQ Water(1h)
EGD,0.1875% L.plantarum(1h)
EGD,0.1875% L.plantarum+1mg/ml Pro-K(1h)
EGD,MQ Water(at 0h)
EGD,MQ Water(at 3h)
EGD,Ampicillin 0.03g/ml(at 3h)
EGD,Tetracycline 0.035g/ml(at 3h)
EGD,Gentamicin 0.3g/ml(at 3h)
EGD,Co-trimoxazole 0.2g/ml(at 3h)
EGDe
EGD,WT
37C,Late-Log
EGD,delta Lmo1408
EGD,delta Lmo0422
EGD,delta Lmo0599
EGDe,Lincomycin 0.25g/ml
EGDe,Chloramphenicol 0.4g/ml
EGDe,Erythromycin 0.03125g/ml
EGDe,Kanamycin 0.5g/ml
EGDe,Ofloxacin 2g/ml
EGDe,Ampicillin 1g/ml
EGDe,Bacitracin 8g/ml
EGDe,ctrl
EGDe,Lincomycin 0.5g/ml
EGDe,WT
EGDe,delta lftR
EGDe,37C,Late-Log
EGDe,WT,Light
EGDe,WT,Dark
EGDe,Light
EGDe,Dark
FFH,30C
FFH,10C
H1,37C,Late-Log
H2,37C,Late-Log
H3,37C,Late-Log
H5,37C,Late-Log
H6,37C,Late-Log
H7,37C,Late-Log
H8,37C,Late-Log
H10,37C,Late-Log
H11,37C,Late-Log
H17,37C,Late-Log
H19,37C,Late-Log
H27,37C,Late-Log
H28,37C,Late-Log
H31,37C,Late-Log
H32,37C,Late-Log
568
H7858,Log
H7858,WT,Bile
H7858,WT,ctrl
H7858,delta sigB,Bile
H7858,delta sigB,ctrl
LL195,ctrl
LL195,acid
Lm1,4C,Late-Stationary
Lm1,4C,Late-Log
Lm1,4C,Log
Lm1,WT,4C,Log
Lm1,4C,Lag
Lm1,20C,Late-Stationary
Lm1,20C,Late-Log
Lm1,20C,Log
Lm1,WT,20C,Log
Lm1,20C,Lag
LO28,37C,Late-Log
N12-0605,ctrl
N12-0605,acid
N13-0047,ctrl
N13-0047,acid
N13-1507,ctrl
N13-1507,acid
rli47,Log
WT,Log
Scott A,37C,Late-Log
AKI48083 (L2625_00109)
-0.72 -0.77 -0.95 -0.47 -0.41 -0.45 -1.52 -0.42 -1.51 -1.28 -0.62 -1.9 -1.49 -0.1 -0.49 -1.9 -0.04 0.23 0.65 -1.06 -1.5 -0.16 0.06 -0.18 -0.29 0.12 -0.17 -0.45 -0.7 -0.2 -0.56 -0.74 -0.18 1.02 0.22 0.82 -0.26 -0.68 -0.11 -0.92 -0.94 -0.82 -1.01 -0.99 -1.51 -0.29 0.01 -0.1 -0.23 -0.7 0.75 -0.68 -0.64 -1.04 -1.23 0.33 1.31 1.16 0.96 0.15 0.07 0.91 0.81 0.64 0.49 0.02 0.81 1.05 0.97 0.63 0.28 0.44 -0.29 0.94 -0.82 -0.24 -1.17 -0.66 0.13 0.44 -0.93 0.61 -0.26 -1.04 -1.9 0.53 -0.44 -0.39 -0.94 -0.99 1.27 0.22 0.5 -0.2 0.36 0.26 0.38 1.05 0.91 0.7
AKI48084 (L2625_00110)
-1.9 -0.96 -0.82 -1.46 -0.15 -0.19 -1.84 -0.98 -1.96 -1.66 -1.38 -2.15 -1.32 -0.3 0.38 -1.62 -0.36 -0.18 0.04 -0.96 -1.29 -0.36 0.04 0.03 -0.39 0.13 -0.07 -0.39 -0.4 -0.19 -0.06 -0.38 -0.25 -0.88 0.21 0.73 0.65 0.21 0.64 -0.24 -0.83 -0.48 -0.15 -0.31 -0.79 -0.41 -0.1 -0.17 0.54 0.55 1.15 -0.55 -0.59 -0.99 -1.1 -0.03 1.15 0.81 0.71 -0.22 -0.36 0.36 0.64 0.23 0.27 -0.04 0.31 0.65 0.53 0.33 0.21 0.42 0.05 0.49 -1.47 -0.74 -1.62 -0.92 0.4 0.77 0.07 0.91 0.11 -0.38 -0.65 0.65 -0.49 -0.43 -0.62 -0.47 1.03 0.38 0.96 0.3 0.2 0.56 0.37 0.84 0.84 0.9
AKI48247 (L2625_00299)
-0.62 0.17 -0.17 -0.72 -0.14 -0.15 -0.81 -0.48 -0.57 -0.67 0.09 -1.08 0.19 -0.33 -0.28 -2.32 -1.0 -0.87 -0.81 0.26 0.02 -0.69 -0.64 -0.37 -0.76 -0.36 -0.77 -0.83 -0.99 -0.56 -0.74 -1.08 -0.88 -0.69 -0.21 0.97 0.04 -0.01 0.05 -0.64 -0.65 -0.29 -0.52 -0.26 -0.61 -0.38 -0.33 -0.49 0.16 0.13 0.75 -0.18 0.26 0.23 0.01 -0.21 0.04 0.61 0.2 0.62 0.81 0.19 0.07 0.57 0.31 -0.46 -0.25 0.69 0.78 0.5 0.2 -0.31 0.25 -0.16 -0.83 -0.37 -1.07 -0.64 -0.16 0.48 -1.14 1.01 1.16 0.64 0.55 0.51 0.5 0.21 0.12 -0.01 1.13 -0.21 0.43 -0.17 0.21 -0.62 0.23 0.74 0.66 1.17
AKI48354 (L2625_00409)
-0.45 0.21 1.13 -0.31 -3.33 -3.81 -0.47 -0.59 -0.32 -0.59 1.16 -0.05 -3.68 0.62 -0.1 -4.59 0.48 -0.52 -0.3 -0.1 -0.5 0.41 0.06 0.54 0.69 0.49 0.05 -0.17 -0.22 -0.03 -0.41 -0.29 0.01 1.04 0.37 0.69 0.0 0.07 0.84 -1.0 -1.05 -0.99 -1.04 -0.94 -0.94 -0.26 0.75 0.51 0.21 0.06 0.72 -0.49 -0.03 -0.93 -0.67 -2.11 -1.94 0.36 -0.97 -2.55 -2.48 -0.84 -0.98 -0.27 -1.7 -0.4 0.18 -1.04 -1.03 -1.34 0.03 0.07 -0.91 -1.89 -1.15 -0.14 -0.99 0.39 0.18 1.18 -4.88 -1.26 -1.28 -1.0 -0.9 -1.8 -1.99 -0.14 -0.33 0.27 1.16 0.64 1.8 -0.08 1.28 0.34 0.4 2.25 1.96 0.51
AKI48376 (L2625_00432)
1.09 0.19 -0.42 1.14 -0.61 -0.55 1.1 0.12 0.26 0.52 1.05 -0.86 0.95 0.05 0.13 -1.52 -0.56 -1.0 -1.16 0.23 -0.62 -0.83 -0.83 -0.28 -0.63 -0.98 -0.79 -1.02 -1.19 -0.9 -1.1 -1.23 -1.36 -1.41 -0.24 0.61 0.04 -1.25 0.33 -1.86 -4.66 -3.25 -3.0 -4.62 -2.19 -3.45 -1.32 -1.38 0.28 -0.39 0.82 -0.55 0.53 0.14 -0.04 0.69 0.25 1.19 0.61 1.15 1.24 0.81 0.8 0.96 0.08 0.61 0.84 1.08 -0.23 0.61 1.07 1.06 -2.5 0.32 0.46 0.06 0.45 0.51 0.93 0.53 -2.84 -1.47 -2.07 -4.0 -4.41 -1.94 -2.95 -3.02 -1.78 -2.58 0.74 0.69 0.45 0.6 0.43 -0.12 0.79 -0.06 -0.21 0.18
AKI48442 (L2625_00501)
0.05 0.46 0.31 0.22 0.41 0.47 0.1 0.17 0.18 0.0 0.94 0.11 -2.08 0.46 -0.11 -2.82 -0.74 -1.77 -1.88 -0.28 -0.37 0.24 0.5 0.28 0.36 0.29 0.28 0.21 0.22 0.4 0.42 0.31 0.33 -0.63 0.04 0.41 0.08 -0.46 0.17 -0.33 -0.1 -0.21 -0.25 -0.03 0.02 -0.02 -0.06 -0.25 0.44 0.2 1.09 -0.36 -0.08 -0.39 -0.32 0.04 -1.27 0.89 -0.45 0.21 0.48 0.08 0.01 0.61 0.4 - - 0.34 0.19 0.86 0.6 -7.07 -0.91 -1.0 0.48 0.25 0.2 0.31 0.61 0.2 -1.22 -0.95 -1.09 -1.57 -1.52 -0.58 -0.7 -1.23 -1.03 -0.83 0.84 0.64 0.2 0.59 0.3 0.03 -0.36 -0.26 -0.16 0.14
AKI48531 (iap)
0.05 0.48 0.56 0.41 -0.88 -0.73 0.18 -0.35 0.41 -0.13 1.24 -3.08 -4.35 -0.53 -0.07 -1.53 -0.69 -1.46 -1.19 -0.22 -0.43 -0.32 -0.25 -0.29 -0.34 -0.21 -0.38 -0.33 -0.1 0.02 -0.22 -0.34 -0.16 -2.13 -0.8 0.71 -0.5 -0.31 -0.18 -0.63 -0.42 -0.5 -0.68 -1.11 -0.82 -0.71 -0.37 -0.45 -0.64 -0.63 -0.14 0.11 -0.27 -0.28 -0.4 -0.39 0.05 0.77 -0.11 -1.04 -0.8 -0.51 -0.47 0.36 -0.91 -0.18 0.42 -0.26 0.3 -0.2 -0.14 -0.26 -0.04 1.27 0.28 -0.04 -0.04 -0.26 0.79 1.7 -1.56 0.25 -0.15 0.1 0.47 0.3 -0.82 -0.83 -0.68 0.04 1.2 0.84 1.52 0.52 1.24 0.35 0.54 0.65 0.69 0.85
AKI48568 (L2625_00634)
-0.3 0.14 -0.1 -0.21 0.48 0.36 -0.79 -0.29 -0.64 -0.63 0.09 -2.7 -2.48 -0.02 -0.09 -2.5 -0.33 -0.43 -0.41 0.28 -0.2 0.02 0.14 0.04 -0.27 0.03 -0.11 -0.04 -0.03 0.15 0.03 -0.13 -0.09 -0.4 -0.01 0.54 0.15 -0.17 -0.13 -0.49 -0.48 -0.16 -0.11 -0.28 -0.24 -0.02 -0.11 -0.32 0.11 0.05 0.73 -0.1 0.34 0.11 -0.13 -0.46 -0.7 0.77 0.13 0.5 0.52 0.77 0.19 0.53 0.47 0.16 0.74 0.33 0.45 0.42 0.44 0.55 -0.23 -0.62 -1.81 -1.54 -1.85 -1.45 -0.14 0.24 -1.22 0.04 0.25 -0.02 -0.25 0.21 0.03 -0.07 0.17 -0.14 1.01 -0.08 0.57 -0.24 0.91 -0.55 -0.0 0.67 0.55 -0.31
AKI48693 (L2625_00762)
-0.86 0.03 -0.33 -0.54 -0.13 -0.07 -0.63 0.7 -0.66 -0.05 0.31 -1.87 -1.43 -0.12 0.13 -0.09 -0.52 -0.73 -0.45 0.1 -0.5 -0.39 -0.26 -0.43 -0.07 0.47 -0.06 -0.04 0.05 -0.05 0.01 -0.09 0.21 -0.84 0.05 1.08 -0.04 -0.39 0.24 -0.68 -1.42 -0.72 -0.35 -0.68 -0.5 -0.72 -0.58 -0.55 0.59 -0.29 0.69 0.37 0.2 0.13 -0.11 -0.0 -0.68 1.44 0.11 0.32 0.24 0.28 0.07 0.9 -0.55 0.23 0.71 0.51 0.18 -0.08 0.3 0.91 -0.28 -1.11 -1.05 -0.1 -1.05 -0.23 0.11 0.59 -2.71 -0.11 -1.08 -1.2 -0.64 -0.13 -1.17 -1.17 -0.71 -0.36 1.58 0.08 0.67 0.0 0.4 -0.16 0.03 0.9 0.77 1.15
AKI48723 (L2625_00792)
-1.01 -0.14 -0.49 -0.78 0.15 0.08 0.38 0.16 -0.39 0.47 -0.04 -1.75 -1.12 -0.12 -0.17 -1.45 -0.2 -0.35 -0.3 0.46 0.32 0.67 0.44 0.55 0.72 0.69 0.6 0.68 0.53 0.96 0.5 0.52 0.68 -0.89 0.17 0.37 0.38 0.28 0.55 -0.18 -0.11 -0.18 -0.11 -0.09 0.2 0.26 0.29 -0.04 0.91 0.4 0.5 0.39 0.59 0.3 0.33 -1.12 -0.42 0.06 0.42 -2.15 -2.42 -1.85 -1.14 -0.03 -0.63 -0.4 0.07 0.8 0.38 -1.83 -0.24 -0.14 -0.33 0.83 -0.22 0.14 -0.45 0.0 -0.44 -0.2 -3.2 -0.13 -0.49 -0.92 0.1 -1.3 -2.02 -1.34 -0.95 -0.78 0.67 -0.46 -0.02 -0.44 -1.49 -0.81 -2.02 0.29 0.15 1.5
AKI48777 (L2625_00848)
0.48 0.68 0.09 0.21 1.39 1.28 -0.21 -0.96 0.12 -0.4 -0.04 -0.74 -2.45 -1.45 -1.25 -0.97 -0.93 -2.0 -2.11 -0.73 -0.73 -0.16 0.02 -0.21 -0.24 0.01 -0.23 0.06 0.38 1.06 0.15 0.4 0.63 -0.6 -0.67 0.58 -0.8 -0.83 -0.94 -0.26 -0.37 -0.22 -0.31 -0.3 -0.32 -0.3 -0.65 -0.79 -1.06 -1.42 0.4 -1.61 -0.17 -0.13 -0.54 -0.25 -2.59 0.59 0.21 1.37 1.31 0.48 -0.01 0.36 0.13 0.72 1.2 0.12 0.38 -0.26 0.94 0.56 -1.64 -1.56 -0.87 -2.17 -0.96 -1.31 0.22 1.16 0.55 -0.29 -0.01 -1.87 -2.57 0.71 -0.23 -0.44 -1.06 -1.45 1.24 0.5 1.05 0.35 0.95 -0.14 0.32 -0.95 -1.52 0.42
AKI48874 (L2625_00953)
-0.6 -0.16 0.53 -0.06 -0.7 -0.58 -0.74 -0.44 -0.59 -1.09 -0.3 -0.62 -1.51 -1.22 0.14 -1.75 -0.21 -0.56 -0.62 0.18 0.18 -0.26 -0.05 -0.11 -0.27 0.01 -0.26 -0.41 -0.58 -0.4 -0.41 -0.58 -0.64 -1.2 0.13 0.58 0.37 0.32 0.59 -0.66 -0.76 -0.6 -0.58 -0.57 -0.62 -0.26 -0.19 -0.56 0.23 0.16 0.7 0.74 0.21 -0.0 0.15 -0.56 -0.37 0.67 0.32 -0.58 -0.87 -0.38 -0.12 0.54 -0.76 -0.06 0.91 0.19 0.26 -0.54 0.37 0.55 0.53 0.55 -0.02 -0.3 -0.31 -0.49 0.7 0.78 -1.75 0.29 -0.58 -0.49 0.37 0.42 -0.78 -0.21 -0.48 0.41 0.89 0.84 0.54 0.31 -0.03 0.43 0.12 1.17 1.03 0.91
AKI48912 (L2625_00993)
-0.42 -0.27 -0.75 0.05 -1.05 -0.86 -0.67 -0.23 -0.28 -0.51 0.79 -0.06 -1.51 -0.96 -0.57 -1.19 -0.75 -0.73 -0.62 -0.55 -0.86 0.35 0.2 0.23 0.13 0.78 0.26 0.57 0.61 0.64 0.6 0.62 0.64 -1.72 -0.34 0.47 -0.06 -0.21 -0.01 -1.16 -1.07 -1.34 -1.09 -1.57 -1.3 -1.13 -0.76 -1.04 -0.18 0.19 0.46 0.26 -0.43 -0.55 -0.54 -0.45 0.2 0.86 0.62 0.01 -0.16 -0.06 0.19 0.56 -0.2 0.29 0.86 0.41 0.49 -0.14 0.17 0.53 -0.46 0.83 0.04 0.47 -0.26 -0.02 -0.03 0.55 -1.27 0.61 0.09 -0.4 -0.75 1.03 -0.2 -0.77 -0.63 -0.38 1.28 -0.02 0.22 -0.34 0.04 -0.78 0.49 0.55 0.66 0.53
AKI48913 (L2625_00994)
-0.43 -0.03 -0.04 -0.01 -1.26 -1.3 -0.67 -0.04 -0.05 -0.6 0.75 -1.57 -1.44 -0.35 -0.67 -1.67 -0.43 -0.22 -0.22 -0.51 -0.83 0.13 0.3 0.34 0.11 0.7 0.28 0.41 0.42 0.74 0.31 0.26 0.48 -0.94 -0.24 0.38 0.0 -0.2 0.09 -0.69 -0.83 -0.6 -0.54 -0.37 -0.46 -0.17 -0.04 -0.27 0.07 0.31 0.48 0.16 -0.31 -0.45 -0.69 -0.17 0.69 1.01 -0.47 0.01 -0.11 -1.05 -0.71 0.5 -1.63 0.0 0.9 -0.78 -0.82 -1.2 0.34 0.57 -0.11 -0.22 -0.1 0.32 -0.57 -0.29 -0.14 0.68 -0.97 0.91 0.45 0.17 -0.13 1.32 0.05 -0.34 -0.37 -0.17 1.31 -0.04 0.32 -0.42 0.08 -0.95 0.35 0.72 0.83 -0.35
AKI48914 (L2625_00995)
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AKI48926 (ilvE)
0.28 -0.17 0.39 0.31 -0.12 -0.32 -0.47 -1.1 -0.57 -0.64 -0.39 -2.29 -2.25 -1.07 0.09 -2.42 -0.22 -0.14 0.09 0.01 -0.06 0.16 0.06 0.19 0.12 0.26 -0.1 0.4 0.65 0.83 0.34 0.63 0.63 0.09 -0.19 0.24 -0.21 -0.19 -0.19 -0.71 -0.7 -0.57 -0.51 -0.54 -0.63 -0.39 -0.12 -0.5 0.59 -0.2 0.36 0.02 0.1 0.36 -0.03 -0.28 0.34 0.08 -0.28 -1.55 -1.53 -0.85 -0.67 0.43 0.31 0.38 0.17 -0.19 -0.42 -0.53 -0.19 -0.08 0.14 0.62 -0.28 -0.24 -0.43 -0.21 0.8 0.6 -3.09 -0.38 -0.09 0.07 0.02 -0.85 -0.34 -0.09 -0.34 -0.42 0.82 0.85 0.89 1.03 0.9 0.66 -0.29 0.71 0.34 0.38
AKI48948 (L2625_01030)
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AKI48969 (L2625_01051)
-0.73 0.16 0.21 -0.19 0.17 0.19 -0.13 -0.1 -0.35 -0.12 0.12 -1.45 -1.09 -0.88 0.29 -1.03 -0.65 -0.59 -0.72 0.27 0.28 0.07 0.08 -0.06 -0.11 0.04 -0.04 0.11 0.13 0.18 0.22 0.08 -0.01 -0.37 -0.16 0.49 -0.2 -0.17 -0.0 -0.21 -0.43 0.11 -0.16 -0.23 -0.14 0.51 -0.21 -0.3 -0.06 -0.02 0.03 0.11 0.37 0.17 0.12 -0.49 -0.04 0.59 0.34 -0.02 -0.41 -0.3 -0.05 0.55 -0.46 0.18 0.38 0.43 0.46 0.03 0.02 0.2 0.11 -0.18 -0.84 -0.51 -0.97 -0.72 -0.33 -0.2 -1.21 0.68 0.65 0.49 0.78 0.53 0.16 -0.09 0.25 0.3 0.6 -0.15 -0.41 -0.33 -0.71 -0.34 -0.68 0.31 0.36 0.94
AKI48970 (L2625_01052)
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AKI48978 (L2625_01060)
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AKI48989 (modA)
-0.72 -0.49 -0.83 -0.39 -1.07 -1.34 -0.94 -0.62 -0.6 -1.03 0.52 -3.33 -2.92 -0.03 -0.38 -4.03 -0.43 -0.59 -0.38 -0.15 -0.29 0.94 0.88 0.73 0.67 1.03 0.7 0.89 0.9 1.36 1.02 0.91 1.16 -0.28 -0.65 0.19 -0.64 -0.42 -0.39 -0.44 -0.81 -0.66 -0.63 -0.67 -0.66 -0.95 -0.07 -0.26 -0.58 0.01 -0.18 0.3 0.08 0.12 -0.23 -0.61 -0.27 1.0 -0.17 0.3 0.06 -0.34 -0.24 0.45 -0.6 -0.47 0.27 -0.32 -0.34 -0.25 -0.2 -0.23 -0.8 -0.78 -0.85 -0.96 -1.32 -1.3 -0.14 0.27 -1.34 0.7 -0.16 -0.8 -1.11 1.76 0.82 -0.26 -0.71 -0.26 1.12 0.08 0.1 -0.16 0.14 -0.23 0.03 1.07 1.06 -0.42
AKI49004 (L2625_01087)
0.21 0.46 0.3 -0.23 -2.47 -2.43 0.08 1.41 -0.47 1.7 0.02 -1.58 -1.19 0.4 -1.2 -0.03 -0.3 0.72 0.94 -1.5 -1.61 -0.71 -0.98 -0.76 -0.79 -1.02 -0.85 -1.45 -1.14 -0.63 -1.13 -1.03 -0.58 -0.49 0.39 0.7 0.48 0.28 0.61 -0.41 -0.42 -1.09 -0.57 -0.95 -0.42 -0.88 -0.51 -0.54 0.46 -0.14 0.27 -1.59 -0.85 -1.56 -1.56 -0.38 -0.03 0.15 0.01 -1.08 -1.72 -0.07 -0.09 0.28 -0.42 -0.36 0.18 0.8 0.64 0.3 0.15 0.38 0.71 -0.64 -1.07 0.33 -1.48 0.22 0.0 0.78 -2.43 1.65 1.21 0.91 1.73 -0.03 -1.17 -1.01 -0.4 -0.05 0.87 0.35 0.54 -0.08 0.18 -1.55 0.0 -0.62 -1.14 1.81
AKI49140 (L2625_01229)
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AKI49158 (L2625_01248)
-0.31 -0.02 0.27 -0.17 -0.52 -0.5 -0.88 -0.54 -0.56 -0.8 -0.38 -2.12 -1.03 -0.47 0.5 -2.01 -0.29 -0.51 -0.46 -0.13 -0.45 -0.59 -0.49 -0.64 -0.9 -0.22 -0.65 -0.92 -0.79 -0.87 -1.0 -0.89 -0.67 -1.3 -0.32 1.09 -0.22 -0.26 0.02 -0.18 -0.3 -0.15 -0.32 -0.13 -0.21 0.04 0.09 0.18 0.63 -0.25 0.14 -0.02 -0.05 -0.28 -0.2 -0.71 0.06 0.43 0.61 0.48 0.49 -0.12 0.16 0.22 -0.45 -0.26 0.46 0.91 0.55 -0.03 0.32 0.01 0.11 -0.25 -6.51 -7.08 -6.37 -7.29 0.6 0.99 0.46 1.27 0.65 0.38 0.88 0.8 -0.17 -0.41 -0.04 0.15 1.27 0.57 0.99 0.43 0.38 0.3 0.56 0.23 0.09 1.35
AKI49305 (L2625_01399)
-1.72 -0.8 -0.31 -1.67 -1.37 -1.31 -0.74 -0.27 -0.77 -0.7 -1.65 -2.35 -0.84 0.04 -0.61 -3.79 -0.62 -0.91 -1.1 -0.16 -0.08 -0.25 -0.15 -0.34 -0.35 -0.06 -0.22 -0.51 -0.14 0.08 -0.37 -0.41 0.02 -1.2 0.5 0.61 0.54 0.49 0.45 -0.14 0.05 0.01 -0.27 -0.34 0.15 0.31 0.3 -0.1 -0.31 -0.26 0.74 -0.37 -0.17 -0.05 -0.44 -0.3 -0.94 1.22 -0.42 -2.24 -2.59 -0.47 -0.4 1.31 0.83 0.28 0.63 -0.52 0.4 -0.18 0.71 0.83 0.93 0.22 -0.27 -0.61 -0.71 -0.71 0.65 0.31 -1.43 1.49 -0.35 0.19 0.92 0.8 0.56 0.37 0.0 0.56 0.8 0.7 0.01 0.68 0.24 0.45 0.37 -0.69 -0.95 0.5
AKI49306 (L2625_01400)
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AKI49307 (L2625_01401)
-1.64 -1.34 -2.2 -1.45 -2.16 -1.93 -0.64 -0.39 -0.76 -0.34 -1.31 -1.3 -1.68 -0.87 -0.81 -2.56 -0.77 -0.95 -0.95 -0.25 -0.62 -0.02 -0.36 -0.17 0.05 -0.02 -0.36 -0.55 -0.41 0.27 -0.36 -0.77 -0.25 -2.68 0.97 1.12 1.51 1.21 1.5 -1.5 -1.84 -1.69 -1.32 -1.24 -1.43 -0.73 -0.67 -1.09 0.17 -0.02 1.25 -0.23 -0.52 -0.88 -0.97 0.06 -3.64 1.5 0.73 -1.27 -1.4 0.13 0.47 1.65 0.46 0.87 1.26 0.7 0.82 0.3 0.97 1.18 -0.31 0.13 0.05 0.32 -0.21 0.22 0.65 0.18 -4.14 0.83 -1.99 -1.06 -0.14 -0.01 -0.4 -0.55 -0.46 -0.14 1.73 0.55 0.26 0.56 0.03 0.36 0.2 -0.83 -0.97 0.54
AKI49308 (L2625_01402)
-2.07 -1.48 -2.2 -1.32 -1.74 -1.77 -0.03 0.08 -0.16 0.05 -1.32 -3.33 -1.57 -0.35 -0.28 -1.42 -0.45 -0.3 -0.26 -0.43 -0.75 -0.86 -0.55 -0.38 -0.52 -0.05 -0.4 -1.74 -0.93 -0.35 -1.15 -1.73 -1.3 -4.18 0.57 1.14 1.41 1.12 1.2 -1.14 - -1.63 -0.79 -1.68 -1.35 -1.61 -0.78 -0.81 0.36 0.1 0.52 0.41 -0.62 -0.9 -0.95 1.0 -1.93 1.36 0.87 -1.02 -1.7 0.48 0.72 1.17 1.06 0.4 0.79 1.06 1.33 0.84 0.78 0.84 -1.95 1.39 0.44 1.16 0.67 0.8 1.1 0.46 -6.65 0.07 -2.71 -2.6 -2.13 -1.03 -1.9 -2.85 -1.47 -1.31 1.06 0.94 0.69 0.74 -0.17 -0.01 0.68 -0.17 -0.07 1.19
AKI49332 (L2625_01428)
-1.6 0.31 0.05 -1.02 -0.81 -0.89 -0.21 -0.05 -0.31 0.72 0.31 0.72 -0.65 0.07 0.01 0.99 0.15 -0.43 -0.29 -0.13 -0.56 0.63 0.71 0.71 0.91 0.74 0.69 0.49 0.71 0.84 0.47 0.47 0.83 -1.52 0.29 0.8 0.42 0.53 0.2 -0.05 -0.23 -0.34 -0.17 -0.19 -0.03 -0.57 0.18 0.34 -0.11 0.1 0.5 -0.86 -0.19 -0.3 -0.28 -0.24 -0.43 0.2 -0.34 -0.98 -1.61 -0.65 -0.85 0.45 -1.16 -0.22 0.85 -0.81 -0.9 -1.8 0.27 -0.08 -0.97 -0.09 -1.13 -1.2 -1.05 -0.78 -1.37 0.26 -4.48 -0.22 0.35 0.3 -0.13 -1.35 -1.52 -0.58 -0.17 0.06 1.4 -1.7 0.14 -0.74 0.27 -0.71 0.11 0.53 0.53 0.62
AKI49374 (lisR)
-0.87 -0.64 -0.11 -0.5 -0.89 -0.98 -0.99 -0.59 -0.99 -0.9 -0.82 -1.21 -0.98 -1.18 0.19 -1.57 -0.64 -0.51 -0.46 -0.49 -0.71 -0.39 -0.31 -0.44 -0.6 -0.34 -0.55 -0.45 -0.29 -0.15 -0.3 -0.13 -0.19 -0.12 -0.23 0.48 -0.18 -0.21 -0.08 -0.79 -1.02 -0.78 -0.78 -0.82 -0.75 -0.32 -0.48 -0.52 0.31 -0.6 -0.4 0.17 -0.36 -0.35 -0.48 0.01 0.77 0.47 1.07 0.69 0.48 0.57 0.68 0.57 0.18 -0.18 0.88 0.93 0.87 0.38 0.25 0.33 -0.03 0.44 -1.16 -0.73 -1.55 -1.09 0.38 1.34 -0.45 0.98 0.09 -0.22 0.27 1.39 0.17 -0.28 -0.82 -0.22 0.77 0.63 1.08 0.55 0.51 0.4 0.54 0.25 0.18 0.83
AKI49375 (lisK)
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AKI49376 (oxaA2)
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AKI49396 (L2625_01496)
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AKI49443 (zurM)
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AKI49444 (zurA)
-2.05 -0.08 -0.18 -1.42 -1.89 -1.85 -0.4 -0.62 -0.71 -0.81 -0.26 0.61 1.13 0.05 1.04 -0.28 -0.51 -0.31 -0.42 -0.2 -0.5 -0.23 -0.14 -0.18 0.01 -0.06 0.01 -0.11 -0.32 -0.32 -0.25 -0.36 -0.11 -0.77 -0.11 1.4 -0.18 -0.07 0.04 -0.63 -0.41 -0.38 -0.24 -0.55 -0.49 -0.55 -0.25 -0.75 0.64 -0.7 -0.01 0.2 -0.06 -0.14 -0.34 0.75 -0.34 0.55 0.37 -0.88 -1.8 -0.88 -0.26 0.45 -0.36 -0.46 -0.03 1.2 0.13 0.08 0.31 -0.31 -0.57 -0.0 0.07 0.9 0.11 0.26 -0.29 0.8 -3.84 -0.88 -1.07 -0.82 1.52 -1.52 -1.26 -0.47 -0.23 0.86 0.69 -0.04 0.6 -0.26 0.03 0.25 0.31 0.67 0.79 1.74
AKI49448 (ispH)
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AKI49459 (era)
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AKI49460 (cdd)
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AKI49461 (dgkA)
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AKI49462 (L2625_01564)
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AKI49463 (L2625_01565)
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AKI49464 (L2625_01566)
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AKI49474 (L2625_01576)
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AKI49504 (L2625_01607)
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AKI49505 (L2625_01608)
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AKI49518 (L2625_01623)
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AKI49583 (L2625_01692)
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AKI49682 (L2625_01822)
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AKI49692 (L2625_01832)
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AKI49715 (L2625_01856)
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AKI49730 (L2625_01871)
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AKI49731 (L2625_01872)
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AKI49744 (L2625_01886)
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AKI49856 (L2625_02003)
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AKI49857 (L2625_02004)
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AKI49889 (nth)
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AKI49890 (dnaD)
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AKI49910 (sfcA)
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AKI50025 (sepF)
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AKI50118 (L2625_02276)
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AKI50137 (L2625_02300)
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AKI50138 (L2625_02301)
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AKI50171 (L2625_02335)
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AKI50214 (L2625_02381)
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AKI50232 (L2625_02399)
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AKI50233 (L2625_02400)
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AKI50237 (L2625_02404)
0.08 0.24 0.48 0.31 -0.6 -0.6 -0.26 -1.06 -0.52 -0.76 0.28 -2.32 -1.19 -0.3 0.62 -1.28 -0.22 -0.76 -0.47 0.18 0.05 0.52 0.34 0.52 0.28 0.55 0.27 0.44 0.42 0.67 0.46 0.44 0.52 -0.91 0.26 0.96 0.47 0.16 0.6 -1.23 -1.13 -1.32 -1.27 -1.51 -1.17 -1.29 -0.32 -0.46 0.72 0.3 1.06 -0.11 0.13 -0.06 -0.05 -0.97 -1.43 0.99 0.33 -0.06 -0.46 -0.16 0.21 0.49 -0.96 0.22 0.85 0.59 0.24 -0.32 0.45 0.23 -1.22 -0.25 0.03 -0.8 0.07 0.01 -0.68 -0.07 -2.75 -0.54 -0.67 -1.21 0.08 -1.05 -1.66 -1.46 -1.03 -0.67 1.08 -0.48 0.62 -0.18 -0.01 -0.54 -0.27 1.07 1.06 1.2
AKI50238 (L2625_02405)
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AKI50239 (L2625_02406)
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AKI50241 (adaA)
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AKI50242 (L2625_02409)
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AKI50434 (spl)
0.06 0.75 1.29 0.5 0.71 0.36 0.71 0.25 0.71 0.74 1.6 -2.97 -4.67 -0.24 -0.34 -4.05 -0.36 -0.87 -0.88 0.45 0.28 -0.4 -0.42 -0.48 -0.4 -0.55 -0.59 -0.56 -0.88 -0.71 -0.55 -1.12 -0.82 -1.26 -0.29 0.37 -0.15 0.55 0.46 -0.57 -0.4 0.02 -0.36 -0.33 -0.47 -0.29 0.19 -0.42 -0.09 0.19 0.68 0.36 0.35 0.17 0.36 -0.7 -0.72 0.97 -1.18 -2.7 -3.33 -1.32 -1.17 0.61 -2.06 -0.03 0.25 -1.29 -1.55 -2.03 0.25 0.17 0.35 0.93 -0.17 0.11 -0.14 0.52 0.38 0.06 -3.71 0.13 -0.21 0.23 -0.03 -0.82 -0.73 0.17 0.21 0.33 0.88 0.41 0.16 0.21 -0.79 0.87 -1.47 1.16 1.19 0.43
AKI50435 (ftsX)
-0.52 0.22 0.89 -0.17 0.28 -0.14 0.02 -0.17 0.12 -0.0 1.14 -2.79 -5.17 -0.52 -0.25 -3.88 -0.79 -1.35 -1.37 0.16 -0.17 -0.49 -0.44 -0.46 -0.31 -0.3 -0.52 -0.25 -0.54 -0.27 -0.21 -0.88 -0.59 -1.21 -0.51 0.81 -0.46 0.24 0.21 -0.64 -0.82 -0.69 -0.69 -0.64 -0.82 -0.61 -0.03 -0.32 -0.47 -0.25 0.59 0.05 0.14 -0.31 0.01 -1.1 -0.55 1.2 -0.31 -2.49 -3.18 -0.49 -0.46 0.75 -1.58 0.04 0.38 -0.43 -0.66 -1.12 0.46 0.19 0.52 0.5 -0.43 -0.09 -0.5 0.37 0.84 0.94 -3.88 0.47 0.06 0.48 0.36 -0.03 -0.44 0.22 0.26 0.45 1.14 0.74 0.74 0.55 -0.81 1.08 -0.2 1.34 1.39 1.44
AKI50436 (ftsE)
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AKI50439 (secA)
-1.08 -0.22 0.02 -0.59 0.44 0.35 -0.34 -0.29 -0.49 -0.61 -0.4 -0.09 -0.8 -1.47 -0.11 -0.34 -0.41 -0.48 -0.52 0.32 0.22 -0.19 -0.06 -0.07 -0.2 0.33 -0.14 -0.09 -0.16 0.11 -0.01 -0.14 0.01 -0.07 -0.06 0.57 -0.01 -0.17 0.0 -0.47 -0.47 -0.44 -0.31 -0.35 -0.35 -0.21 -0.23 -0.68 0.07 0.09 0.6 0.51 0.32 0.4 0.3 -0.16 0.08 0.49 0.27 0.06 0.15 -0.17 -0.02 0.47 -0.19 -0.1 0.46 0.28 0.48 -0.25 0.39 0.38 0.35 0.16 -0.54 -0.43 -0.71 -0.6 0.38 0.09 -0.4 0.23 -0.07 -0.12 0.03 0.17 0.0 -0.3 -0.36 0.04 0.85 0.49 -0.17 0.49 -0.9 0.39 -0.64 0.41 0.31 0.99
AKI50495 (L2625_02685)
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AKI50496 (L2625_02686)
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AKI50510 (ycnE_2)
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AKI50521 (L2625_02720)
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AKI50628 (L2625_02839)
1.24 0.5 0.48 1.03 -0.99 -1.19 0.58 -0.38 1.25 0.31 1.31 -1.27 -3.17 -0.07 -1.07 -1.55 -0.63 -1.24 -0.99 -0.47 -0.71 -0.48 -0.58 -0.47 -0.28 -0.48 -0.52 0.02 0.2 0.24 0.09 -0.05 -0.08 -2.27 -0.14 0.35 0.25 0.26 0.69 -0.79 -1.02 -0.94 -0.94 -0.87 -1.11 -1.05 -0.23 -0.41 -0.7 0.19 1.44 -1.42 -0.38 -0.63 -0.66 -0.5 -1.5 1.05 -1.29 -0.61 -0.59 -0.05 -0.87 0.88 -0.69 0.57 0.38 -1.32 -0.52 -0.14 0.06 -0.33 0.48 -0.24 -0.34 -0.83 -0.37 0.05 0.86 1.02 -0.97 -0.09 -0.38 -0.36 -0.86 -0.7 0.03 -0.28 -0.53 -0.43 1.11 0.68 1.17 0.91 0.9 0.89 0.59 0.78 0.67 -0.86
AKI50669 (L2625_02883)
0.14 -0.41 -0.89 0.42 -2.1 -1.91 -0.22 -0.15 0.43 -0.71 0.51 -1.39 0.23 -0.06 0.93 -2.58 -0.2 -0.44 -0.45 -0.25 -0.31 -0.23 0.17 0.24 -0.36 0.12 -0.26 -0.5 -0.17 -0.43 -0.52 -0.23 -0.04 -0.06 -0.48 0.76 -0.59 -0.48 -0.17 -1.48 -1.87 -1.44 -1.73 -1.14 -1.63 -1.09 -0.7 -0.92 0.66 -0.09 1.22 0.2 -0.06 0.2 -0.35 -0.26 0.1 1.43 0.9 0.31 0.4 1.42 0.69 1.17 1.07 0.37 0.7 0.92 0.89 1.18 0.57 0.69 -1.51 0.49 0.47 0.71 0.35 0.51 -0.21 -0.51 -2.98 -1.07 -1.07 -1.69 -1.48 -0.79 -0.4 -1.59 -1.27 -1.4 0.94 -0.34 -0.7 -0.23 -0.84 -0.44 -0.08 0.17 0.16 0.61
AKI50728 (L2625_02944)
-1.36 -0.41 -0.56 -0.97 -1.82 -1.95 -0.89 -0.46 -0.76 -0.89 -0.24 -0.69 -0.13 -1.99 0.26 -1.0 0.02 -0.23 -0.11 0.48 0.2 -0.32 0.29 0.25 0.01 0.1 -0.12 -0.45 -0.64 -0.5 -0.36 -0.74 -0.42 -0.68 -0.02 0.65 0.17 -0.03 0.19 -0.55 -0.92 -0.45 -0.56 -0.33 -0.61 -0.47 -0.05 -0.67 0.52 0.01 0.67 0.71 0.66 0.65 0.5 -0.09 0.35 0.7 0.23 0.09 -0.01 0.39 0.81 0.54 -0.18 0.09 0.67 0.54 0.22 0.45 0.31 0.37 -0.19 0.47 -0.69 -0.2 -0.71 -0.36 0.44 0.56 0.15 0.35 0.25 -0.16 -0.85 0.1 -0.37 -0.2 -0.06 -0.35 0.94 0.58 0.23 0.53 -0.68 0.4 -0.13 0.34 0.24 0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.