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Heatmap: Cluster_24 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
10403S,Log
10403S,WT
10403S,LMRG 00730 deleted
10403S,delta sigB,Log
10403S,WT,Log
10403S,virR deleted,Log
10403S,WT,Bile
10403S,WT,ctrl
10403S,delta sigB,Bile
10403S,delta sigB,ctrl
10403S
ATCC 19115,Lactic acid(1h)
ATCC 19115,ctrl
WT
EGD
ATCC 19115,linalool
EDGe,37C(20min)
EDGe,20C(20min)
EDGe,20C(3h)
EDGe,Light
EDGe,Dark
EGD,MQ Water(0h)
EGD,MW Water(10min)
EGD,0.1875% L.plantarum(10min)
EGD,MQ Water(1h)
EGD,0.1875% L.plantarum(1h)
EGD,0.1875% L.plantarum+1mg/ml Pro-K(1h)
EGD,MQ Water(at 0h)
EGD,MQ Water(at 3h)
EGD,Ampicillin 0.03g/ml(at 3h)
EGD,Tetracycline 0.035g/ml(at 3h)
EGD,Gentamicin 0.3g/ml(at 3h)
EGD,Co-trimoxazole 0.2g/ml(at 3h)
EGDe
EGD,WT
37C,Late-Log
EGD,delta Lmo1408
EGD,delta Lmo0422
EGD,delta Lmo0599
EGDe,Lincomycin 0.25g/ml
EGDe,Chloramphenicol 0.4g/ml
EGDe,Erythromycin 0.03125g/ml
EGDe,Kanamycin 0.5g/ml
EGDe,Ofloxacin 2g/ml
EGDe,Ampicillin 1g/ml
EGDe,Bacitracin 8g/ml
EGDe,ctrl
EGDe,Lincomycin 0.5g/ml
EGDe,WT
EGDe,delta lftR
EGDe,37C,Late-Log
EGDe,WT,Light
EGDe,WT,Dark
EGDe,Light
EGDe,Dark
FFH,30C
FFH,10C
H1,37C,Late-Log
H2,37C,Late-Log
H3,37C,Late-Log
H5,37C,Late-Log
H6,37C,Late-Log
H7,37C,Late-Log
H8,37C,Late-Log
H10,37C,Late-Log
H11,37C,Late-Log
H17,37C,Late-Log
H19,37C,Late-Log
H27,37C,Late-Log
H28,37C,Late-Log
H31,37C,Late-Log
H32,37C,Late-Log
568
H7858,Log
H7858,WT,Bile
H7858,WT,ctrl
H7858,delta sigB,Bile
H7858,delta sigB,ctrl
LL195,ctrl
LL195,acid
Lm1,4C,Late-Stationary
Lm1,4C,Late-Log
Lm1,4C,Log
Lm1,WT,4C,Log
Lm1,4C,Lag
Lm1,20C,Late-Stationary
Lm1,20C,Late-Log
Lm1,20C,Log
Lm1,WT,20C,Log
Lm1,20C,Lag
LO28,37C,Late-Log
N12-0605,ctrl
N12-0605,acid
N13-0047,ctrl
N13-0047,acid
N13-1507,ctrl
N13-1507,acid
rli47,Log
WT,Log
Scott A,37C,Late-Log
AKI47977 (dnaA)
 -0.52 -0.11 -0.64 -0.1 -0.53 -0.56 -0.26 0.24 -0.02 0.24 0.14 -2.37 -2.13 -0.79 -0.29 -3.59 -0.7 -1.04 -0.9 0.36 -0.01 0.29 0.38 0.37 0.18 0.52 0.15 0.42 0.17 0.57 0.44 0.17 0.59 -1.66 -0.23 0.38 0.04 0.23 0.18 0.01 -0.1 0.02 0.13 -0.11 -0.1 0.02 0.18 -0.13 0.13 0.54 1.11 0.05 0.43 -0.0 0.13 -0.11 -0.09 0.75 -0.46 -1.71 -2.27 -0.95 -0.73 0.66 -0.86 -0.48 0.6 -0.55 -0.6 -1.34 0.35 0.24 -0.69 0.45 0.25 0.46 0.01 0.64 0.28 -0.15 -3.12 0.46 0.5 0.42 0.0 -0.45 -0.5 0.01 0.38 -0.57 0.96 0.11 -0.42 0.22 -0.85 0.48 -0.5 0.39 0.38 0.5
AKI47978 (dnaN)
 -0.64 -0.44 -0.29 -0.25 0.6 0.59 -0.77 -0.51 -0.71 -0.51 -0.68 -3.16 -1.51 -0.9 0.2 -2.3 -0.34 -0.96 -0.82 0.84 0.72 -0.26 -0.14 -0.06 -0.3 -0.09 -0.4 -0.35 -0.44 -0.19 -0.33 -0.4 -0.16 -1.2 0.31 0.33 0.59 0.49 0.67 -0.09 -0.31 -0.42 -0.11 -0.39 -0.21 -0.22 0.1 -0.08 0.74 0.73 1.33 0.62 0.79 0.65 0.73 -0.22 -0.55 0.97 -0.28 -1.16 -1.41 -0.92 -0.68 0.72 0.14 0.02 0.69 -0.25 -0.14 -0.78 0.48 0.33 -0.87 -0.18 -0.04 -0.08 -0.25 0.22 0.53 0.09 -2.38 -0.06 -0.18 -0.34 -0.66 -0.67 -0.21 -0.39 -0.14 -0.89 0.84 0.63 0.23 0.43 0.54 0.67 -0.51 0.51 0.43 0.31
AKI47987 (L2625_00011)
 -1.43 -0.27 0.18 -0.86 0.4 0.4 -0.43 0.56 -0.89 -0.03 -1.52 -3.6 -2.18 -0.36 -0.14 -4.03 -0.68 -0.44 -0.71 0.66 0.57 0.58 0.66 0.5 0.61 0.75 0.67 0.69 0.59 0.49 0.87 0.72 0.55 -0.02 -0.77 -0.14 -1.13 -0.59 -1.24 0.98 0.9 1.34 1.18 1.45 1.26 1.5 0.85 0.54 -0.22 -0.09 1.07 0.92 0.6 0.46 0.42 -1.05 -0.65 0.06 -2.07 -1.07 -1.32 -2.29 -2.17 0.57 -1.89 -0.13 0.27 -1.1 -2.22 -1.92 0.25 0.57 0.03 -1.71 -1.5 -0.54 -1.69 -0.94 -1.6 -2.15 -1.35 -0.43 -0.62 -0.45 0.92 -0.4 -0.28 -0.24 0.04 0.34 0.57 -1.89 -2.07 -1.18 -2.54 -1.15 -3.08 0.52 0.59 -1.14
AKI47988 (L2625_00012)
 -1.38 -0.15 0.21 -0.78 0.21 0.1 -0.7 0.58 -0.95 -0.18 -1.15 -2.92 -1.29 -0.46 -0.02 -2.61 -0.48 -0.4 -0.56 0.75 0.77 0.83 0.76 0.44 0.45 0.73 0.7 0.81 0.73 0.62 0.88 0.81 0.74 -0.47 -0.88 -0.12 -0.94 -0.58 -1.13 0.65 0.59 0.86 0.7 0.91 0.77 0.94 0.61 0.14 -0.27 -0.17 1.05 1.04 0.79 0.54 0.48 -0.88 -0.54 0.04 -1.61 -1.77 -1.89 -1.71 -1.36 0.59 -1.17 -0.1 0.17 -0.54 -1.56 -1.06 0.32 0.46 -0.13 -0.86 -0.84 0.24 -0.96 -0.17 -0.66 -1.33 -1.65 -0.74 -1.0 -0.73 0.89 -0.76 -0.43 -0.26 0.05 0.38 0.41 -0.82 -1.1 -0.37 -1.55 -0.27 -2.35 0.57 0.59 -0.38
AKI48018 (L2625_00043)
 -0.96 -0.2 -0.89 -0.59 -1.35 -1.31 0.46 -0.06 -0.04 -0.17 0.33 -2.83 -3.93 -0.05 -0.04 -4.43 0.22 0.66 0.51 0.61 0.43 0.65 0.33 0.81 0.68 0.44 0.26 -0.2 -0.4 -0.3 -0.45 -0.55 -0.44 0.85 0.9 -0.37 0.79 0.7 1.17 0.17 -0.21 -0.28 0.02 0.1 -0.05 0.42 0.11 0.39 0.67 0.29 0.72 0.06 0.85 0.51 0.35 -0.64 0.48 0.2 -2.34 -2.58 -3.26 -2.47 -2.27 0.4 -2.04 -0.34 0.2 -1.83 -2.38 -2.76 -0.08 -0.14 0.2 1.62 0.68 0.27 0.77 0.36 -0.97 -1.76 -3.29 0.72 0.83 0.76 0.63 -1.3 -1.3 0.05 0.18 0.25 0.47 -1.19 -1.8 -0.92 -1.76 -0.06 -2.14 0.4 0.14 -0.77
AKI48107 (L2625_00134)
 -0.95 -1.77 -1.64 -0.08 -4.24 -4.46 -1.03 -6.69 -0.77 -7.15 0.33 -4.61 -3.69 -0.37 0.92 -5.55 0.09 0.15 -0.32 0.91 1.36 0.75 1.46 0.88 1.36 1.19 1.43 1.07 1.36 0.36 1.09 1.31 0.57 -1.97 0.15 -1.11 0.26 0.91 0.36 0.47 0.11 0.54 0.35 0.28 0.1 0.14 0.43 0.49 0.61 0.9 0.32 0.64 1.4 0.8 1.44 -3.97 -1.04 0.68 -2.26 -3.22 -3.53 -1.9 -2.05 0.15 -1.32 -0.66 0.35 -0.98 -2.31 -2.27 -0.55 -0.64 -1.26 -1.12 -0.5 -6.54 -0.87 -6.84 0.35 -2.19 -5.16 -1.51 -3.02 -7.16 -8.42 -3.08 -0.16 -0.18 -4.45 -8.29 2.16 0.03 -1.03 0.7 -0.57 1.07 -2.34 0.19 0.94 -3.27
AKI48108 (L2625_00135)
 0.85 -0.6 -0.57 1.27 -2.61 -2.8 0.42 -4.22 0.39 -4.77 1.03 -4.35 -3.89 0.1 0.66 -4.8 0.02 0.33 -0.46 0.74 1.31 0.77 1.32 0.53 1.06 0.96 1.21 0.97 1.16 0.56 0.98 1.24 0.92 -1.04 -0.62 -0.81 -0.65 0.66 -0.49 0.02 -0.34 -0.15 -0.14 -0.03 -0.21 -0.35 -0.07 -0.12 0.03 0.17 0.88 0.89 1.22 0.61 1.26 -2.99 -1.33 0.34 -2.07 -2.26 -2.29 -1.12 -1.45 -0.29 -0.6 -0.03 0.31 -0.13 -2.04 -1.03 -0.06 -0.2 -0.42 -1.17 0.27 -4.9 -0.16 -5.34 0.52 -2.25 -2.82 -0.84 -2.1 -6.09 -6.8 -2.42 -0.0 0.3 -3.65 -6.39 1.4 0.21 -0.97 0.84 -0.48 0.91 -2.06 0.09 0.69 -2.7
AKI48109 (L2625_00136)
 0.48 -0.73 -0.3 0.93 -2.62 -2.8 -0.07 -4.04 0.26 -4.69 0.37 -3.28 -4.04 0.88 0.54 -3.24 -0.02 0.37 -0.53 0.73 1.35 0.33 0.83 -0.01 0.62 0.44 0.83 0.61 0.78 0.22 0.59 0.94 0.68 0.18 -0.26 -0.97 -0.51 0.7 -0.35 0.54 0.56 0.78 0.65 0.79 0.53 0.58 0.86 0.34 -0.02 -0.02 1.03 0.87 1.21 0.82 1.28 -1.99 -0.85 0.44 -2.34 -2.65 -2.4 -1.26 -1.6 -0.2 -0.65 -0.15 -0.01 -0.37 -2.27 -1.2 -0.17 -0.38 -0.91 -1.82 -0.1 -4.27 -0.14 -4.71 0.6 -1.77 -1.96 -0.92 -1.92 -6.0 -5.87 -2.73 -0.22 -0.03 -3.94 -6.24 1.32 0.45 -0.56 0.85 0.14 1.2 -1.76 0.22 0.71 -2.62
AKI48121 (L2625_00148)
 -1.16 -0.73 -0.63 0.15 -5.32 -5.2 -0.37 -4.8 -0.32 -5.72 0.86 -2.6 -0.42 0.44 1.3 -2.95 0.51 0.74 0.37 0.52 0.99 0.22 1.15 0.46 0.97 0.99 1.04 0.36 0.77 -0.57 0.37 0.79 -0.46 -0.17 -0.18 -0.31 -0.61 -0.06 -0.14 0.51 0.13 0.26 0.38 0.17 0.19 0.36 0.49 0.66 0.03 0.14 0.29 0.65 1.03 0.23 0.89 -3.72 -0.59 0.71 -1.75 -2.56 -2.71 -1.93 -2.13 0.27 -0.44 -0.21 0.19 0.08 -1.85 -1.89 0.23 -0.22 0.69 -1.5 -0.66 -5.21 -0.71 -5.53 0.48 -1.45 -3.5 -1.16 -3.11 -5.87 -5.49 -2.21 -0.31 0.23 -3.35 -5.49 2.75 0.52 -0.26 0.74 0.39 1.22 -1.45 -0.17 0.47 -2.46
AKI48136 (L2625_00163)
 -0.68 0.39 -0.12 -0.3 0.21 0.16 0.13 -0.02 -0.01 0.21 0.78 -1.57 -1.09 0.1 0.2 -3.08 -0.33 -0.61 -0.81 0.6 0.6 0.69 0.68 0.62 0.44 0.63 0.43 0.65 0.52 0.87 0.68 0.62 0.72 0.22 -0.04 -0.51 -0.11 -0.03 -0.3 0.54 0.61 0.6 0.56 0.68 0.6 0.63 0.64 0.58 0.45 0.21 1.13 0.04 0.6 0.47 0.49 -0.34 -0.21 0.39 -1.98 -2.23 -2.02 -2.07 -1.91 0.16 -0.92 0.28 0.16 -1.03 -2.03 -1.52 -0.08 -0.09 -0.14 -0.17 -0.53 -1.0 -0.78 -0.55 -0.49 -1.34 -1.9 -0.23 -0.02 0.1 0.47 -1.63 -0.92 -0.26 0.03 -0.25 0.05 -0.17 -1.26 -0.08 -1.11 0.04 -2.17 0.01 -0.08 -1.08
AKI48156 (ksgA)
 -1.34 0.01 0.25 -0.97 0.1 0.2 -0.6 -0.86 -1.0 -0.8 -0.55 -2.06 -1.09 -0.68 -0.09 -2.3 -0.44 -0.21 -0.3 0.88 0.89 0.63 0.49 0.34 0.21 0.44 0.17 0.6 0.41 0.65 0.61 0.53 0.32 -0.71 -0.04 -0.04 0.09 0.25 -0.1 0.32 0.29 0.59 0.48 0.55 0.31 0.66 0.39 -0.07 0.18 0.25 0.93 0.58 0.85 0.93 0.75 0.06 0.18 -0.07 -1.81 -1.28 -1.5 -2.51 -2.24 0.39 -1.52 -0.05 0.26 -1.61 -2.14 -2.82 -0.0 0.08 0.23 -1.31 -2.04 -2.04 -2.0 -1.92 -0.49 -1.06 -1.08 0.72 1.01 1.07 1.03 -0.55 -0.1 0.52 0.59 0.52 0.75 -0.37 -1.22 -0.18 -1.71 -0.12 -2.66 0.64 0.53 -0.87
AKI48166 (gcaD)
 -0.35 0.84 -0.18 -0.2 0.19 0.07 0.4 0.15 0.18 0.37 1.31 2.78 -2.11 -0.99 -0.16 -1.4 -0.31 -0.36 -0.42 0.61 0.48 -0.13 -0.0 -0.05 -0.28 -0.31 -0.28 -0.3 -0.67 -0.46 -0.26 -0.69 -0.67 0.0 0.13 -0.0 0.23 0.4 0.09 0.1 0.01 0.36 0.22 0.32 0.2 0.14 0.35 -0.18 -0.05 0.28 0.5 0.05 0.59 0.46 0.51 -0.68 -0.17 -0.11 -1.61 -2.25 -2.55 -1.69 -1.55 -0.09 -1.81 -0.64 0.22 -1.56 -1.93 -2.14 -0.14 -0.08 0.33 1.19 0.37 -0.24 0.22 0.2 -0.84 -0.72 -1.94 0.2 0.33 0.28 -0.1 -0.45 -0.8 0.32 0.5 0.39 0.49 -0.87 -0.95 -0.63 -1.67 -0.15 -1.28 0.3 0.29 -0.49
AKI48180 (L2625_00210)
 0.3 0.15 -0.66 0.41 -2.15 -2.29 0.73 0.03 1.04 0.24 1.33 -1.22 -2.31 0.05 0.44 -2.38 0.69 -0.38 -0.19 -0.26 -0.68 0.54 0.74 0.7 0.7 0.91 0.45 0.39 0.45 0.8 0.41 0.62 0.81 1.06 0.89 0.13 0.85 0.64 0.8 -1.0 -0.91 -1.22 -0.88 -0.95 -1.11 -0.85 -0.2 -0.18 1.03 0.4 1.27 -0.55 -0.11 -0.29 -0.44 -0.99 -0.96 1.14 -1.19 0.59 0.29 -1.16 -1.2 0.61 -1.63 0.71 1.2 -1.59 -1.35 -1.5 0.74 1.33 -0.04 -1.92 -2.0 -2.06 -2.24 -2.43 -1.19 -0.96 -1.06 0.11 -0.58 -0.62 -0.11 0.04 0.04 -0.45 -0.83 -0.65 1.01 -1.16 -1.13 -1.29 -2.41 -1.4 -1.19 0.02 -0.04 -1.47
AKI48182 (mfd)
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AKI48183 (L2625_00213)
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AKI48187 (L2625_00217)
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AKI48188 (ftsH)
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AKI48190 (L2625_00220)
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AKI48191 (cysK)
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AKI48195 (L2625_00229)
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AKI48201 (radA)
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AKI48246 (L2625_00298)
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AKI48248 (L2625_00300)
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AKI48253 (L2625_00305)
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AKI48257 (L2625_00310)
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AKI48259 (L2625_00312)
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AKI48260 (L2625_00313)
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AKI48261 (yycI)
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AKI48374 (pgdA)
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AKI48804 (murF)
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AKI48805 (L2625_00878)
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AKI48840 (rsbU)
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AKI48846 (tex)
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AKI48882 (L2625_00962)
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AKI48883 (nrfA)
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AKI48899 (L2625_00980)
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AKI48915 (ppnK)
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AKI48916 (rluD-1)
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AKI48940 (L2625_01022)
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AKI48941 (L2625_01023)
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AKI48959 (L2625_01041)
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AKI48972 (L2625_01054)
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AKI48973 (L2625_01055)
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AKI49013 (L2625_01096)
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AKI49152 (L2625_01242)
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AKI49159 (L2625_01249)
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AKI49160 (L2625_01250)
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AKI49162 (uvrC)
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AKI49163 (L2625_01253)
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AKI49165 (racE)
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AKI49267 (sipZ)
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AKI49268 (L2625_01362)
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AKI49269 (rnhB)
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AKI49272 (gid)
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AKI49292 (hflX)
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AKI49293 (L2625_01387)
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AKI49309 (pyrH)
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AKI49311 (uppS)
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AKI49312 (cdsA)
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AKI49313 (dxr)
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AKI49314 (L2625_01408)
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AKI49325 (ribF)
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AKI49329 (L2625_01425)
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AKI49330 (L2625_01426)
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AKI49333 (L2625_01429)
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AKI49335 (glcK)
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AKI49352 (accB)
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AKI49353 (accC)
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AKI49356 (folD)
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AKI49357 (xseA)
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AKI49358 (xseB)
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AKI49359 (L2625_01456)
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AKI49383 (L2625_01483)
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AKI49393 (pgsA)
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AKI49398 (L2625_01498)
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AKI49400 (mutS)
 -0.77 0.03 -0.25 -0.42 0.24 0.33 -0.3 -0.54 -0.27 -0.7 0.39 -1.99 -1.93 -0.95 -0.53 -2.05 -0.63 -1.29 -1.29 0.24 0.13 0.53 0.61 0.55 0.54 0.72 0.58 0.8 0.93 1.18 0.96 0.85 0.95 -0.67 0.04 0.22 0.15 0.34 0.04 -0.3 -0.39 -0.24 -0.15 -0.19 -0.27 -0.11 -0.01 -0.29 -0.02 0.34 0.3 0.02 0.28 0.1 0.11 0.0 -0.57 0.62 -0.45 -1.18 -1.35 -0.99 -0.57 0.47 -0.99 0.56 0.66 -0.58 -0.4 -1.06 0.06 0.04 -0.52 0.0 -0.22 -0.8 -0.49 -0.64 0.6 0.26 -2.48 -0.09 -0.17 -0.35 -0.18 0.14 -0.35 -0.51 -0.49 -0.19 0.86 0.71 -0.16 0.65 -0.57 0.67 -0.75 -0.03 -0.01 0.3
AKI49414 (btlA)
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AKI49415 (npp)
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AKI49417 (murB)
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AKI49433 (dapG)
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AKI49434 (asd)
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AKI49473 (hemN)
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AKI49480 (comEB)
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AKI49486 (L2625_01588)
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AKI49489 (L2625_01591)
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AKI49492 (L2625_01594)
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AKI49493 (greA)
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AKI49494 (udk)
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AKI49495 (L2625_01597)
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AKI49496 (L2625_01598)
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AKI49506 (recD)
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AKI49507 (L2625_01610)
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AKI49508 (L2625_01611)
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AKI49516 (aspS)
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AKI49517 (hisS)
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AKI49520 (relA)
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AKI49521 (apt)
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AKI49528 (queA)
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AKI49529 (ruvB)
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AKI49530 (ruvA)
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AKI49540 (L2625_01646)
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AKI49542 (minC)
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AKI49548 (folC)
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AKI49552 (hemD)
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AKI49571 (dnaE)
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AKI49590 (L2625_01699)
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AKI49591 (ezrA)
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AKI49612 (trmB)
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AKI49613 (L2625_01723)
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AKI49632 (L2625_01744)
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AKI49641 (L2625_01753)
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AKI49660 (metK)
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AKI49668 (menE)
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AKI49681 (gsaB)
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AKI49684 (fabL)
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AKI49740 (L2625_01882)
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AKI49741 (L2625_01883)
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AKI49745 (L2625_01887)
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AKI49746 (L2625_01888)
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AKI49750 (gatC)
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AKI49754 (pcrB)
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AKI49796 (ffh)
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AKI49797 (L2625_01944)
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AKI49798 (ftsY)
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AKI49799 (smc)
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AKI49800 (rncS)
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AKI49805 (fapR)
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AKI49809 (L2625_01956)
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AKI49810 (L2625_01957)
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AKI49812 (L2625_01959)
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AKI49822 (gmk)
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AKI49823 (L2625_01970)
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AKI49868 (folA)
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AKI49869 (thyA)
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AKI49870 (uup)
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AKI49887 (pbpA-2)
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AKI49892 (aspB-1)
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AKI49893 (L2625_02044)
 -0.76 0.21 -0.23 -0.65 -1.48 -1.39 0.28 -0.24 -0.13 -0.06 0.59 -1.17 -1.55 -0.68 -0.36 -0.86 0.26 -0.22 -0.04 0.38 0.26 0.81 0.71 0.81 0.86 1.0 0.65 0.63 0.63 0.94 0.68 0.48 0.78 -0.59 -0.06 0.15 0.15 0.16 0.03 -0.39 -0.4 -0.5 -0.4 -0.51 -0.46 -0.36 -0.05 -0.05 0.39 0.68 0.36 0.37 0.48 0.24 0.29 -0.71 -1.31 0.5 -0.49 -1.34 -1.3 -0.85 -0.74 0.16 -1.0 0.31 0.54 -0.45 -0.43 -0.95 -0.33 0.04 -0.06 0.19 0.04 -0.07 -0.03 -0.06 -0.01 -0.54 -2.49 -0.25 -0.53 -0.78 0.01 0.27 -0.25 0.03 0.11 0.46 0.58 -0.24 -1.06 -0.11 -1.03 -0.14 -0.63 0.49 0.4 0.54
AKI49894 (dinG)
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AKI49898 (L2625_02049)
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AKI49899 (birA)
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AKI49900 (cca)
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AKI49902 (dapB)
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AKI49913 (L2625_02064)
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AKI49915 (L2625_02066)
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AKI49917 (L2625_02068)
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AKI49933 (rpsA)
 0.26 0.65 0.07 0.51 0.33 0.34 0.72 -0.16 0.55 0.47 0.9 -2.41 -1.97 -0.97 -0.25 -1.51 -0.47 -0.52 -0.34 0.07 0.07 -0.27 -0.25 -0.07 -0.29 -0.13 -0.49 -0.62 0.03 -0.25 -0.56 0.09 -0.43 -0.41 0.38 0.11 0.62 0.33 0.5 -0.39 -0.48 -0.43 -0.44 -0.38 -0.39 -0.36 -0.41 -0.29 0.38 0.39 -0.0 -0.89 0.14 0.14 0.01 0.12 -0.02 0.24 -0.7 -0.85 -0.74 -0.46 -0.75 0.27 0.36 -0.01 0.29 -0.73 -0.24 -0.34 -0.14 -0.24 0.36 0.03 -0.0 -0.81 0.57 0.52 0.1 -0.3 -0.44 0.78 0.28 0.54 0.5 0.2 0.8 0.21 0.05 0.42 0.81 -0.06 -0.67 0.28 -0.8 0.46 -0.92 0.14 -0.04 0.21
AKI49934 (cmk)
 -0.7 0.21 0.08 -0.18 -0.66 -0.59 -0.01 0.05 -0.07 0.18 0.84 -1.6 -1.97 -0.46 0.38 -2.52 0.2 -0.43 -0.7 0.73 0.68 0.52 0.47 0.51 0.42 0.35 0.3 0.34 0.24 0.32 0.44 0.31 0.04 -0.55 0.49 -0.08 0.71 0.58 0.72 -0.05 0.05 0.23 -0.14 0.16 -0.1 0.02 0.37 -0.15 0.59 0.57 0.72 0.53 0.72 0.37 0.51 -0.07 -1.27 0.44 -0.68 -0.84 -0.9 -1.21 -1.18 0.23 -1.2 0.04 0.36 -0.76 -0.65 -1.11 0.14 0.11 -0.94 -1.49 -0.09 -0.29 0.0 -0.18 -0.02 0.13 -3.42 -1.42 -1.05 -0.63 -0.94 -1.13 -1.1 -0.19 -0.06 0.23 0.29 0.27 0.16 -0.07 0.29 0.41 -0.64 0.69 0.81 -0.55
AKI49935 (ansA)
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AKI49937 (L2625_02088)
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AKI49938 (L2625_02089)
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AKI49942 (resE)
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AKI49946 (scpA)
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AKI50015 (divIVA)
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AKI50029 (ftsQ)
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AKI50030 (murG)
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AKI50031 (murD)
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AKI50033 (murE)
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AKI50034 (pbpB)
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AKI50036 (mraW)
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AKI50037 (mraZ)
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AKI50041 (panE)
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AKI50046 (L2625_02201)
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AKI50051 (L2625_02206)
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AKI50065 (L2625_02220)
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AKI50095 (L2625_02253)
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AKI50140 (L2625_02304)
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AKI50199 (fabF)
 -0.58 0.42 0.39 -0.16 0.54 0.65 0.26 0.51 -0.03 0.15 0.11 -2.74 -2.84 -0.45 -0.09 -3.56 -0.24 -0.56 -0.8 0.58 0.51 0.35 0.29 0.2 0.21 0.21 0.25 0.41 0.41 0.5 0.5 0.46 0.43 -0.07 0.3 -0.04 0.44 0.19 0.3 -0.17 -0.25 -0.1 -0.19 -0.25 -0.3 -0.31 0.07 0.22 0.67 -0.04 0.73 0.64 0.64 0.65 0.56 0.03 -0.08 0.25 -1.26 -2.01 -2.6 -1.6 -1.12 0.34 -1.69 0.11 0.27 -1.21 -1.28 -1.49 0.14 0.31 -0.58 -0.04 0.43 0.63 0.31 0.57 0.12 -0.22 -2.6 -0.12 0.11 0.04 -0.94 -1.04 -0.46 -0.02 -0.08 -0.61 0.25 0.22 -0.17 0.04 -0.65 0.43 -1.29 0.34 0.28 0.08
AKI50227 (L2625_02394)
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AKI50231 (L2625_02398)
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AKI50286 (L2625_02454)
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AKI50323 (L2625_02510)
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AKI50344 (L2625_02531)
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AKI50346 (metI)
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AKI50347 (metN)
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AKI50361 (estA)
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AKI50370 (L2625_02558)
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AKI50378 (est-1)
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AKI50392 (L2625_02581)
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AKI50408 (L2625_02598)
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AKI50432 (cls-2)
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AKI50441 (L2625_02631)
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AKI50442 (L2625_02632)
 -2.73 -0.51 -0.64 -1.1 -0.86 -0.89 -0.13 1.23 -0.8 0.6 -0.35 -1.52 -0.42 1.4 -0.07 -2.13 -0.45 -0.26 -0.75 0.71 0.74 0.81 0.97 0.91 0.95 0.98 0.9 0.93 0.91 0.65 0.98 0.73 0.72 -0.77 -0.09 -0.82 -0.27 0.3 0.0 0.34 0.49 0.19 0.1 0.31 0.33 0.36 0.65 0.51 0.46 0.42 1.15 1.54 0.7 0.46 0.77 -0.91 -0.97 0.17 -2.34 -2.27 -2.26 -2.1 -2.11 0.21 -2.79 -0.44 -0.2 -0.86 -1.96 -1.75 -0.28 -0.03 -0.15 -0.3 -0.78 0.73 -1.21 -0.2 -1.66 -1.91 -1.57 -0.36 -0.26 -0.06 0.98 -0.75 -1.7 -1.36 -0.81 -0.22 0.49 -1.84 -1.82 -1.69 -1.39 -1.59 -2.0 0.49 0.43 -0.77
AKI50445 (yigZ)
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AKI50446 (L2625_02636)
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AKI50447 (L2625_02637)
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AKI50449 (menC)
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AKI50454 (fabZ)
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AKI50473 (prf1)
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AKI50474 (tdk)
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AKI50482 (murA-2)
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AKI50483 (L2625_02673)
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AKI50484 (cpoA)
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AKI50485 (L2625_02675)
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AKI50491 (argS)
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AKI50493 (L2625_02683)
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AKI50508 (L2625_02698)
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AKI50522 (L2625_02721)
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AKI50533 (truA)
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AKI50534 (L2625_02744)
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AKI50569 (L2625_02779)
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AKI50575 (L2625_02785)
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AKI50576 (L2625_02786)
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AKI50593 (L2625_02803)
 0.21 0.4 -0.85 0.26 -2.06 -2.15 0.8 0.41 0.81 0.43 1.17 -4.07 -3.32 -0.33 0.07 -2.91 0.09 -0.75 -0.57 -0.03 -0.37 0.32 0.74 0.64 0.47 0.75 0.53 0.76 0.52 0.65 0.67 0.58 0.61 1.43 0.59 0.07 0.15 -0.02 0.08 -0.49 -0.65 -1.03 -0.55 -0.3 -0.36 -0.58 0.25 -0.07 0.17 0.06 0.68 -0.01 0.06 0.19 -0.33 0.31 0.1 0.57 -1.01 0.37 0.4 -2.21 -1.59 0.56 -1.47 0.09 0.37 -1.46 -1.15 -1.2 0.27 0.21 0.92 -1.98 -1.57 -0.76 -1.18 -1.11 0.09 -0.08 -1.89 0.03 0.06 -0.33 -0.34 0.3 0.46 -0.21 -0.19 -0.33 0.79 0.19 -0.02 -0.1 -0.78 -1.13 -1.23 0.36 0.16 -1.63
AKI50639 (recR)
 -0.72 0.2 0.44 -0.34 -0.94 -0.92 -0.22 0.27 -0.39 -0.0 0.18 -1.91 -1.37 -0.65 -0.0 -1.86 -0.45 -0.35 -0.81 0.81 0.86 0.12 0.21 0.08 0.05 0.19 0.05 0.14 0.1 -0.07 0.24 0.1 0.13 -0.16 0.16 -0.21 0.28 0.57 0.2 0.82 0.65 0.72 0.81 0.86 0.91 0.99 0.77 0.77 0.72 0.57 1.11 0.95 0.79 0.8 0.81 -1.07 -0.5 -0.1 -2.45 -0.99 -0.86 -2.54 -2.52 0.22 -1.97 0.16 0.33 -1.68 -2.26 -2.46 0.2 0.19 0.2 -0.39 -1.36 -0.83 -1.46 -1.04 -1.18 -1.63 -0.8 0.55 0.57 0.53 0.94 -0.14 -0.21 0.24 0.21 0.47 0.64 -1.38 -1.72 -1.02 -2.05 -1.65 -2.08 0.34 0.4 -1.36
AKI50691 (dacA)
 -1.94 0.71 0.12 -1.28 -0.18 -0.31 0.43 -0.03 -0.01 0.47 1.09 -2.86 -3.16 -0.1 -0.2 -4.33 -0.17 -0.57 -0.47 0.74 0.5 0.94 0.88 0.85 0.88 0.82 0.76 0.84 0.71 0.75 0.86 0.7 0.6 -0.55 -0.58 -0.44 -0.52 -0.46 -0.9 0.61 0.44 0.74 0.52 0.51 0.48 0.55 0.65 0.75 -0.31 -0.03 0.15 -0.37 0.7 0.46 0.43 -0.57 -0.36 -0.25 -1.92 -2.01 -2.24 -1.85 -1.36 -0.02 -2.23 -0.61 0.0 -1.46 -1.7 -1.72 -0.36 -0.35 -0.59 1.02 -0.91 -0.64 -0.92 -0.31 -0.52 -0.93 -0.86 0.66 0.08 0.3 0.35 -1.13 -1.22 0.28 0.69 1.0 0.25 -0.66 -1.44 -0.42 -1.3 -1.24 -2.38 0.41 0.32 -0.48
AKI50695 (guaB)
 0.02 -0.27 -2.81 0.65 -0.75 -0.56 -0.1 -0.44 -0.09 -0.09 1.19 -2.62 -1.54 -0.27 1.38 -5.53 -0.01 -1.0 -1.04 0.98 0.93 0.62 0.81 0.46 0.44 0.12 0.53 0.88 0.55 0.73 0.87 0.63 0.72 0.22 0.74 -0.34 0.84 0.61 0.64 0.41 0.02 0.23 0.4 0.43 0.31 0.41 0.58 0.44 1.1 0.46 1.33 -0.33 0.97 0.79 0.99 -0.44 -1.23 -0.7 -2.39 -2.33 -2.68 -1.88 -1.72 0.61 -1.63 0.11 0.33 -1.11 -2.38 -1.94 -0.01 -0.27 0.23 -0.75 -0.26 -0.98 -0.2 -0.29 -0.11 -1.61 -5.91 -2.39 -0.95 -0.85 -1.88 -3.48 -1.39 0.2 0.25 0.11 -0.11 -0.53 -1.17 -0.07 -1.94 0.37 -2.53 -0.07 0.19 -2.11
AKI50731 (L2625_02947)
 -1.08 0.14 -0.23 -0.82 -0.13 -0.41 -0.05 0.1 0.08 -0.34 0.1 -2.06 -1.81 -0.59 0.06 -3.03 -0.49 -0.65 -0.7 0.13 -0.39 0.77 0.61 0.63 0.61 0.7 0.6 0.58 0.59 0.86 0.73 0.67 0.77 -0.88 0.12 0.17 0.36 0.31 0.28 -0.12 -0.3 -0.09 -0.13 -0.02 -0.26 -0.14 -0.0 -0.18 0.42 0.56 0.89 -0.39 0.23 -0.17 -0.33 -0.08 -0.21 0.48 -0.71 -0.86 -1.34 -0.92 -0.67 0.38 -1.17 -0.07 0.66 -0.36 -0.59 -1.05 0.23 0.41 -0.26 -1.01 -0.53 -0.61 -0.69 -0.68 0.04 -0.14 -1.74 0.31 0.56 0.28 0.37 0.38 0.0 0.47 0.42 0.43 0.74 -0.23 -0.6 0.12 -1.53 -0.04 -0.36 0.29 0.31 -0.22
AKI50747 (gidA)
 -1.07 -0.62 -0.72 -0.18 -0.83 -0.93 -0.74 -0.38 -0.56 -0.51 0.26 0.36 -1.02 -0.59 0.07 -2.31 -0.24 -0.89 -1.29 0.43 0.42 1.04 1.19 0.85 0.96 0.92 0.93 1.19 0.99 0.98 1.2 1.05 0.95 -2.03 -0.06 -1.06 0.19 0.4 0.14 0.54 0.58 0.84 0.67 0.73 0.59 0.5 0.11 -0.0 0.08 0.21 0.56 0.09 0.51 0.2 0.29 -0.34 -0.43 -0.16 -1.41 -2.1 -2.59 -1.47 -1.41 -0.32 -1.26 -0.08 -0.01 -1.43 -1.17 -1.57 -0.79 -0.42 -0.77 -0.49 0.22 -0.18 -0.04 0.03 0.06 -0.28 -2.08 -0.67 0.07 0.38 0.07 -2.43 -1.39 -0.33 0.43 0.0 -1.03 0.23 -0.03 0.06 -0.18 0.25 -0.94 -0.65 -0.47 -0.75
AKI50748 (trmE)
 -1.33 -0.49 -0.79 -0.32 -0.04 -0.29 -0.1 0.44 -0.02 0.2 -0.01 -2.81 -2.18 -0.06 0.02 -3.37 0.05 -0.3 -0.77 0.69 0.41 0.99 1.04 0.73 0.76 0.7 0.88 0.96 0.83 0.7 0.99 0.91 0.64 -0.38 -0.07 -1.17 -0.23 0.09 -0.22 1.24 1.13 1.23 1.16 1.33 1.06 1.02 0.32 0.33 0.37 0.13 0.51 0.24 0.79 0.39 0.53 -1.04 -0.27 -0.82 -1.9 -1.92 -2.51 -1.71 -1.7 -0.21 -2.55 -0.84 -0.82 -2.05 -2.32 -2.06 -1.13 -1.29 -1.16 -0.84 -0.14 0.04 -0.17 0.14 -1.22 -1.25 -2.46 -0.35 0.56 0.94 0.44 -2.19 -1.51 0.01 0.71 0.1 -0.37 -1.47 -1.02 -1.13 -1.59 -0.07 -1.91 -0.51 -0.3 -1.64

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.