Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
H37Rv,WT
H37Rv,T4 20 µM, 12h
HS,Ps1_STM_6_A
N0155,WT,7H9
Lab,Tn6:Rv3869
HS,Cr2_00-R1301
Lab,Mp12_209
H37Rv
HS,Ps1_EMB_6_A
CDC1551,WT
N0155,rpoB Ser450Leu,7H9
HS,Cr3_01-R1422
H37Rv,T10 20 µM, 48h
HS,Ps5_OFXS-1
Lab,Cr7_auxRIF-R2
Lab,Cr8_MC26020
HS,Ps2_EMB_6_B
HS,Ps1_STM_6_B
Lab,Mp8_Rv1049
Lab,Mp3_Rv2989
H37Rv,T4 20 µM, 24h
Lab,Mp9_Rv1963c
HS,Ps1_0_A
H37Rv,DMSO 0.4%, 0h
Lab,Tn9:Rv3214
Lab,Tn7:Rv2196
H37Rv,T4 20 µM, 48h
Lab,Mp4_Rv3334
HS,Ps1_CIP_6_A
HS,Ps2_EMB_6_A
HS,Ps1_ND_3_A
H37Rv,WT,Reaeration
Lab,Tn8:Rv1304
HS,Ps3_CIP_6_A
H37Rv,WT,0% DO
Lab,Tn5:Rv3083c
Lab,Mp2_Rv1152
HSTB
HS,Cr1_01-R0348
Lab,Cr6_auxRIF-R1
H37Rv,Log
HS,Cr4_98-01436
HS,Ps1_INH_3_B
Lab
HS,Ps3_CIP_6_B
HS,Ps3_STM_3_A
Lab,Tn4:Rv3323c
HS,Ps4_HN878
Lab,Tn3:Rv1819c
Lab,H37Rv
HS,Ps3_ND_3_B
HS,H37Rv,WT
HS,Cr5_OFXR-17
HS
Lab,Tn12_Tn209_ref
H37Rv,T10 20 µM, 24h
Lab,Tn10:Rv0758
H37Rv,pH 7.0
HS,Ps3_EMB_3_B
H37Rv,mycP1-eccE1 KO
CCP42723 (dnaA)
0.84 -0.09 -0.35 0.46 -0.34 0.73 -0.11 -0.11 -0.11 -0.54 0.51 -0.29 0.15 0.02 -0.23 -0.39 -0.05 -0.13 0.12 0.22 -0.36 -0.09 -0.16 0.04 0.23 -0.06 -0.77 -0.06 0.42 -0.12 -0.38 -0.34 -0.28 0.3 -0.1 -0.03 0.93 -0.6 0.05 -0.32 0.2 -0.29 -0.28 -0.01 0.08 -0.23 -0.04 -0.07 -0.14 -0.18 -0.29 -1.6 -0.03 0.39 0.13 0.37 0.39 -0.02 -0.29 0.34
CCP42833 (Rv0108c)
1.39 0.27 -0.23 -0.23 -0.96 0.18 -1.11 1.93 -0.35 1.07 -0.47 -0.74 0.9 -0.53 -0.87 -1.02 -0.41 0.32 -0.48 -0.4 -0.01 -0.82 -1.04 -0.07 -1.02 -0.8 -0.58 -0.46 0.14 -0.6 -0.86 0.54 -1.22 -0.47 -0.03 -1.6 0.23 0.78 -0.32 -0.31 0.54 -1.49 -0.89 -0.02 -0.37 -0.84 -1.33 -0.34 -1.16 -1.27 -0.7 -2.48 -1.18 2.11 -0.03 0.87 -0.78 0.7 -1.1 1.74
CCP42883 (Rv0157A)
- - - - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.69 - - - - - - - - - - - - - 2.54 - 5.71 - - - - - -
CCP43076 (ansP2)
0.54 0.07 0.1 0.1 -0.0 0.36 0.27 -0.29 -0.44 -0.35 -0.28 0.05 0.09 0.09 -0.19 0.05 0.38 0.16 -0.08 0.23 -0.15 -0.01 0.07 0.07 -0.05 0.33 -0.63 0.25 0.37 0.36 0.1 -0.59 -0.01 0.4 -0.71 -0.46 -0.05 -0.88 0.28 -0.25 0.4 -0.48 -0.03 -0.46 0.42 0.31 -0.34 0.15 -0.34 0.06 0.07 -0.57 -0.05 -0.95 0.28 0.2 0.08 0.36 0.04 -0.93
CCP43080 (dnaK)
1.69 -0.24 2.49 0.76 -1.05 -1.41 -1.4 1.11 0.17 1.29 0.37 -1.41 -0.54 -0.62 -1.72 -1.0 -0.48 2.25 -0.85 0.1 -0.14 -1.11 -0.66 -1.46 0.05 -1.2 0.45 -0.94 -0.18 -0.5 -0.5 -0.21 -0.98 -0.04 0.46 -1.03 -1.22 1.64 -0.61 -1.85 -0.59 -1.65 -0.52 -0.58 -0.06 -0.45 -1.24 -0.13 -1.45 -0.49 -1.42 -1.21 -1.05 -0.3 -0.5 -0.9 -0.24 0.33 -1.4 0.82
CCP43081 (grpE)
0.77 -1.07 2.6 0.27 -0.86 -1.46 -0.96 0.57 0.25 0.86 -0.08 -1.38 -1.24 -0.27 -1.74 -0.9 -0.33 2.41 -0.57 0.19 -0.96 -1.2 -0.44 -2.18 0.25 -1.03 -0.48 -0.94 -0.27 -0.26 -0.39 -0.27 -0.62 0.06 0.91 -0.9 -1.52 1.1 -0.68 -1.89 -1.17 -2.1 -0.45 -1.51 -0.1 -0.14 -1.02 0.24 -0.74 -0.17 -1.36 1.27 -1.7 0.81 -0.14 -1.64 0.14 -0.3 -1.2 1.34
CCP43082 (dnaJ1)
-0.62 -0.83 2.55 -0.21 -0.39 -1.07 -1.22 -0.04 0.52 -0.4 -0.54 -0.71 -1.1 -0.05 -0.96 -0.35 0.03 2.49 -0.2 0.58 -0.74 -0.54 0.04 -1.46 0.38 -0.57 -0.5 -0.58 -0.09 0.06 -0.06 -0.61 -0.36 0.23 -0.51 -0.62 -1.08 0.86 -0.24 -0.94 -1.11 -1.11 -0.15 -0.59 0.12 0.13 -0.74 0.36 -0.78 0.13 -0.69 1.48 -0.84 -1.11 0.02 -1.28 0.18 -0.78 -0.44 0.12
CCP43083 (hspR)
1.05 -0.25 2.21 0.32 -0.57 -0.53 -0.72 0.41 0.24 0.62 -0.05 -0.18 -0.61 -0.24 -0.77 -0.45 -0.36 2.13 -0.45 0.38 -0.36 -0.82 -0.18 -1.02 0.12 -0.69 -0.28 -0.33 -0.58 -0.19 -0.25 -0.73 -0.65 -0.12 -0.04 -0.6 -0.81 0.71 0.12 -0.61 -0.35 -0.63 0.01 -0.4 -0.18 0.18 -0.87 0.24 -0.9 -0.31 -0.93 -1.05 -0.6 0.29 -0.06 -0.76 -0.16 0.08 -0.6 0.85
CCP43171 (groEL2)
0.64 0.03 2.48 1.31 -1.17 -0.66 -1.4 1.14 0.14 1.32 0.61 -0.54 0.32 -0.49 -1.9 -0.54 -0.12 2.33 -0.58 1.3 -0.87 -2.05 -2.19 -0.27 -0.14 -2.48 -0.82 -2.12 0.35 -0.08 -1.02 0.69 -2.58 -0.06 0.23 -1.21 -3.39 0.58 -0.2 -1.75 0.72 -1.64 -0.6 -1.13 -0.34 -0.43 -1.52 0.13 -1.91 -0.94 -2.65 0.22 -1.75 -2.02 -0.29 0.17 -0.07 -0.03 -1.83 0.58
CCP43172 (Rv0441c)
0.05 0.94 1.53 -0.05 -0.76 -0.38 -0.55 0.01 -0.65 0.56 0.27 -0.29 0.99 -0.51 -0.06 -0.28 -0.69 1.13 -0.39 0.09 0.91 -0.66 -1.27 0.89 -0.38 -0.67 0.92 -0.66 -0.47 -0.77 -0.5 0.68 -1.36 -0.16 0.03 -0.76 -0.64 -0.48 -0.2 0.32 0.94 -0.5 -0.75 -0.44 -0.54 -0.35 -0.82 -0.17 -0.56 -0.51 -0.7 0.51 -0.7 -0.32 -0.35 1.04 -0.37 0.1 -0.5 0.14
CCP43237 (Rv0500B)
- - - - - - - 2.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.79 - - - - - -
CCP43268 (Rv0530A)
2.34 - - - - - - 2.47 - 3.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.24 - - -1.03 - - -0.93 - - -1.27 - - - - - - - - - - 0.62 - 3.34 - - - 0.93 - 4.36
CCP43400 (vapB6)
1.39 - - - - - - 2.14 - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.26 - - -0.42 - - 0.68 - - 0.53 - - - - - - - - - - 1.13 - 3.53 - - - -5.48 - 3.28
CCP43403 (mazE2)
-0.08 0.4 -0.69 0.34 -0.16 0.45 0.35 1.4 -0.28 -0.96 0.34 1.05 0.23 -0.08 0.13 -0.01 -1.08 -0.7 -0.32 -0.51 0.67 -0.4 -0.34 0.47 -0.47 -0.77 0.83 -0.3 -1.41 -0.47 -0.41 0.09 -0.11 -1.4 -0.48 -0.06 -0.74 0.52 0.14 -0.18 0.48 0.46 -0.66 0.09 -1.46 -0.29 0.05 -0.18 0.36 -0.24 -0.23 1.11 0.04 -0.02 -0.18 0.13 -1.08 -0.18 0.13 -0.49
CCP43495 (Rv0749A)
-0.75 - - - - - - 1.78 - -3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.01 - - -1.79 - - - - - - - - - - 3.08 - 5.5 - - - - - 0.01
CCP43502 (Rv0755A)
2.97 -0.57 -1.43 -2.99 -2.12 -1.4 -1.69 1.3 -1.71 0.64 -4.5 -1.27 -0.3 -1.46 -0.52 -1.4 -1.87 -2.48 -1.53 -1.88 -0.4 -1.68 -1.07 -1.02 -1.54 -0.95 -0.81 -1.47 -2.27 -1.82 -1.76 1.33 -1.89 -1.79 1.01 -1.3 -0.69 0.14 -1.58 -1.6 0.84 -1.17 -1.77 -1.16 -2.78 -1.78 -1.81 -1.4 -1.05 -1.67 -1.47 1.44 -2.62 3.55 -1.22 -0.02 -1.51 1.43 -2.43 2.31
CCP43646 (Rv0898c)
0.63 0.34 -0.57 -1.57 -0.4 -0.18 -0.06 1.24 -0.35 0.65 -1.54 0.68 -0.28 -0.4 0.57 0.87 -0.25 -0.33 -0.44 -0.61 0.88 -0.38 -0.77 0.07 -0.13 -0.54 1.26 -0.27 -0.37 -0.22 0.02 0.33 -0.04 -0.41 -0.18 -0.45 -1.96 -0.12 0.1 0.38 -0.55 0.34 -0.1 -0.59 -0.39 0.1 -0.56 -0.44 -0.09 -0.26 0.23 -0.93 -0.02 -0.41 -0.46 -0.36 -0.67 0.23 0.01 1.48
CCP43648 (Rv0900)
0.53 - - - - - - 2.05 - 1.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.73 - - - - - 2.6 - - 1.6 - - - - - - - - - - 4.36 - - - - - - - 2.96
CCP43657 (Rv0909)
1.41 -3.81 0.2 -1.27 -0.44 0.06 0.13 1.78 -0.33 -1.21 -1.15 0.38 -3.44 -0.02 0.37 -0.26 -0.72 -0.17 -0.14 -0.47 -3.85 0.38 0.26 - 0.11 0.13 -3.87 0.29 0.07 -0.82 0.4 0.14 -0.57 0.57 -0.17 -0.38 -1.72 1.13 0.29 0.11 -1.37 0.22 0.15 0.03 0.34 -0.11 -0.09 0.2 -0.05 0.05 0.1 0.57 0.1 0.17 0.07 -3.75 0.52 0.9 -0.27 0.51
CCP43741 (Rv0991c)
2.46 0.08 0.94 0.98 -2.12 -1.69 -0.92 1.99 -1.55 2.29 1.46 -1.43 0.6 -1.61 -1.77 -1.96 -1.46 0.55 -1.29 -0.34 -0.43 -1.4 -2.59 -0.87 -0.62 -1.99 0.3 -1.77 -1.9 -1.45 -1.81 -0.22 -2.74 -1.38 0.57 -1.95 -2.15 1.87 -1.65 -1.82 0.16 -1.38 -2.05 1.36 -1.55 -1.67 -2.23 -1.06 -2.63 -1.48 -2.17 2.11 -0.96 0.49 -1.18 0.23 -0.86 0.42 -2.53 0.66
CCP43779 (kdpF)
- - - - - - - -0.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.89 - - - - - -
CCP43824 (Rv1073)
0.79 0.06 0.72 1.06 -0.56 -0.94 -0.23 0.01 0.17 0.2 1.02 -0.51 -0.54 -0.13 -0.72 0.1 -0.14 0.66 -0.07 0.46 0.13 -0.46 -0.28 -0.52 0.3 -0.3 0.46 -0.24 0.61 -0.05 -0.5 0.16 -0.37 -0.01 -0.74 -0.8 -0.02 1.22 -0.36 -0.92 0.47 -0.42 -0.48 0.21 -0.0 -0.38 -0.56 -0.04 -0.53 0.08 -0.84 -0.38 -0.57 -0.23 0.05 -0.51 0.01 0.21 -0.56 0.31
CCP43842 (celA2a)
- - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.88 - - - - - -
CCP43849 (Rv1096)
0.88 0.12 0.17 0.24 -0.05 -0.16 0.05 -0.37 -0.05 0.79 0.4 -0.31 0.32 -0.15 -0.12 0.02 -0.01 0.21 0.18 0.48 -0.11 -0.07 -0.32 0.12 0.47 0.2 -0.4 -0.1 -0.26 -0.09 -0.44 0.33 -0.57 -0.26 0.14 -0.08 -0.45 -1.2 -0.17 -0.11 0.49 -0.14 -0.52 -1.1 -0.55 0.04 -0.16 -0.22 -0.44 0.45 -0.65 0.08 -0.26 -1.31 0.16 0.46 0.36 0.23 -0.41 0.62
CCP43856 (mazE3)
0.91 0.42 -0.2 -1.17 -0.24 -0.11 0.4 0.42 -0.29 1.5 -0.74 0.12 0.57 0.04 -0.68 -0.67 -1.16 -0.33 -0.04 -0.14 0.65 -0.57 -0.82 0.58 0.17 -0.51 1.13 0.14 -0.43 -0.85 -0.61 -0.19 -0.57 -0.39 0.35 0.4 -0.72 -0.69 0.13 -0.36 0.62 -0.68 -0.45 -0.29 -0.19 -0.67 0.31 -0.27 0.47 0.02 -0.33 -0.89 -0.48 -0.23 -0.02 0.66 0.38 0.51 -0.57 -0.17
CCP43925 (lipX)
3.98 0.36 -1.28 -1.26 -2.34 -0.95 -1.88 1.7 -2.25 2.18 -1.04 -1.86 1.11 -1.98 -2.1 -3.05 -1.69 -1.48 -1.82 -2.43 0.51 -2.7 -1.5 0.51 -2.13 -2.37 1.05 -2.13 -1.67 -1.65 -2.68 -0.48 -1.44 -1.83 2.13 -1.89 -1.1 1.55 -1.65 -1.88 -0.83 -2.45 -3.54 0.01 -2.14 -1.93 -2.3 -2.14 -2.01 -1.85 -2.15 -1.08 -2.4 1.13 -2.1 0.82 -1.83 0.3 -2.32 0.67
CCP43928 (PE12)
-0.04 -0.17 -0.15 0.19 0.58 0.75 0.08 -0.39 -0.54 -0.42 0.21 -0.62 0.27 0.09 -0.16 -0.27 0.34 -0.32 0.39 0.74 -0.37 0.2 -0.94 -0.03 0.12 0.56 -0.55 0.18 -0.49 0.27 -0.35 -0.57 -0.21 0.2 0.06 0.52 0.97 -0.3 0.07 -0.08 0.42 -1.38 -0.88 -0.45 0.06 -0.23 0.46 0.11 -0.06 0.27 -0.38 -0.53 -1.41 0.01 0.38 0.31 0.47 -0.32 -0.2 -1.2
CCP44003 (relB)
0.47 0.04 0.25 0.1 -0.52 -0.55 -0.51 0.09 0.32 1.58 0.4 0.18 -0.11 -0.28 -1.25 -0.23 -0.0 0.5 -0.14 0.11 0.17 -0.29 -0.96 -0.31 0.29 0.11 0.28 -0.5 0.31 -0.12 -0.66 -0.01 -1.34 0.44 0.33 -0.66 -0.8 -0.15 -0.1 -0.78 0.17 -0.43 -0.1 0.12 0.35 -0.08 -0.6 -0.2 -1.13 -0.14 -0.03 -0.04 -0.32 0.44 -0.1 -0.14 0.26 -0.14 -0.14 1.12
CCP44127 (lprF)
0.35 0.18 0.07 0.26 0.12 0.5 -0.18 0.47 -0.2 -0.61 0.12 -0.95 0.55 -0.22 -0.99 -0.65 0.09 -0.06 -0.59 -0.63 0.13 -0.3 0.08 0.47 -0.47 -0.1 -0.05 -0.11 0.06 0.07 0.43 0.58 -0.41 0.01 0.09 -0.2 -0.06 0.06 -0.29 -0.9 0.48 -0.58 0.05 -0.62 -0.23 0.1 -0.16 0.04 -0.15 -0.3 -0.23 -0.05 -0.13 0.77 -0.16 0.45 -0.26 0.05 -0.11 0.97
CCP44133 (Rv1374c)
1.03 1.4 -2.02 -1.23 -0.19 -1.05 -0.69 0.82 -1.95 0.14 -0.86 -1.63 1.95 -0.77 0.04 -0.63 -0.25 -2.17 -0.28 -0.15 0.91 -0.78 -2.76 0.92 0.01 -0.34 0.62 -0.95 -1.96 -0.08 -2.0 0.8 -1.98 -1.53 0.48 0.01 -0.56 -1.57 -1.55 0.32 1.67 -2.45 -2.69 -0.67 -1.6 -2.41 0.18 -0.67 -0.53 -0.41 -2.02 1.9 -2.28 -1.4 -0.07 2.06 0.06 0.64 -2.18 1.15
CCP44193 (Rv1434)
-0.3 - - - - - - 3.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.4 - - 0.75 - - - - - - - - - - 5.55 - - - - - - - -
CCP44198 (Rv1439c)
1.26 0.88 -0.42 -0.65 -0.29 0.43 0.22 0.73 -0.85 -0.33 -0.19 -0.23 1.06 -0.35 -0.6 -0.02 -0.44 -0.91 -0.57 -1.1 0.96 -0.22 -0.3 0.92 -0.59 -0.2 0.62 -0.21 -1.02 -0.49 -0.4 -0.52 -0.35 -0.72 0.28 -0.34 -1.1 -1.18 -0.24 -0.23 2.06 -0.77 -0.56 0.01 -0.87 -0.36 -0.28 -0.47 -0.55 -0.34 -0.2 -0.64 -0.39 0.45 -0.32 1.21 -0.37 0.51 -0.53 -0.23
CCP44199 (secG)
1.78 0.37 -0.27 -0.47 -1.15 -0.14 -0.52 1.94 -0.52 1.94 -0.92 -0.9 0.54 -0.73 -1.11 -1.42 -1.24 -0.38 -0.84 -1.1 0.3 -1.06 -0.8 0.21 -0.73 -1.58 -0.18 -1.01 -1.49 -1.05 -1.08 1.24 -1.4 -1.24 -0.42 -1.39 -0.8 -0.55 -1.34 -1.64 0.61 -0.28 -1.07 -0.71 -0.95 -1.27 -1.31 -0.74 -1.24 -1.21 -0.89 -1.08 -0.54 1.48 -0.55 0.8 -0.47 0.13 -1.21 3.06
CCP44203 (Rv1444c)
0.74 0.55 -0.21 0.7 -0.17 -0.13 -0.01 0.37 -0.3 0.27 0.48 -0.07 0.67 -0.13 -0.38 -0.3 -0.26 -0.04 -0.35 -0.28 0.38 -0.38 -0.45 0.5 -0.23 -0.03 0.16 -0.14 -1.15 -0.16 -0.21 -0.39 -0.3 -0.34 -0.12 -0.29 -0.06 0.11 -0.05 -0.17 0.15 -0.25 -0.52 0.02 -0.27 0.01 -0.27 -0.01 -0.34 -0.38 -0.06 -0.28 -0.33 0.17 -0.02 0.75 -0.18 0.57 -0.19 0.73
CCP44336 (Rv1572c)
- - - - - - - 1.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.84 - - - - - -
CCP44344 (Rv1580c)
2.0 0.57 -0.16 - -0.26 0.53 0.48 0.3 -0.12 1.34 - -0.08 0.87 -0.64 0.31 0.77 -0.27 -0.66 -0.17 -0.05 0.26 -0.9 -0.76 0.37 0.13 -0.2 -0.16 -1.14 0.19 -0.24 0.16 -0.28 -0.58 0.34 0.7 -0.24 -0.83 - -0.61 -0.11 0.6 - -0.95 -3.68 0.19 -0.41 -0.02 -0.74 -0.12 0.36 0.11 -1.07 - -1.3 -0.22 1.07 0.11 0.3 -0.26 1.23
CCP44662 (Rv1895)
1.2 -0.05 0.55 0.05 -0.28 0.2 -0.55 0.68 -0.06 0.06 0.25 0.59 0.19 -0.38 -0.13 -0.45 -0.13 0.62 -0.44 -0.21 -0.26 -0.55 -0.33 -0.28 -0.29 0.01 -0.06 -0.21 -0.11 -0.05 0.02 -0.46 -1.07 0.15 0.87 -0.57 -0.49 -0.18 0.02 -0.17 0.43 0.03 -0.44 -0.1 0.16 0.1 -0.33 -0.14 -0.72 -0.05 -0.03 -0.13 0.28 0.28 -0.06 0.28 -0.17 -0.17 0.05 -0.22
CCP44727 (parE1)
1.05 -0.23 1.12 -0.1 -0.27 -0.2 -0.41 0.06 0.58 -0.86 -0.02 0.14 -0.38 0.11 -1.02 -0.48 -0.38 0.79 0.11 -0.03 0.05 -0.45 0.22 -0.61 0.68 0.31 0.49 -0.3 0.51 0.13 0.4 -1.17 -0.05 0.23 -0.49 -0.16 -0.32 -0.32 -0.3 -0.36 -0.1 -0.22 -0.6 0.06 0.32 -0.38 0.03 0.18 -0.01 0.43 -0.13 -0.21 -0.15 -1.35 0.19 -0.34 0.42 -0.04 -0.12 -0.61
CCP44763 (mazE6)
0.35 -0.53 -0.87 0.11 -0.26 0.23 0.44 0.76 -0.49 0.12 -0.02 0.89 -1.08 -0.36 0.03 0.48 -0.32 -0.54 0.02 0.21 -0.44 -0.26 -1.09 -0.44 -0.61 -0.32 0.17 0.35 -0.8 -0.92 -0.83 -2.3 -0.42 -0.78 -0.38 -0.27 0.32 0.88 0.6 -0.14 -0.49 1.16 -1.02 1.35 -0.41 -0.89 -0.33 -0.36 -0.71 -0.48 -0.26 2.44 0.36 -0.19 -0.32 -1.16 -0.24 -0.4 -0.69 -1.43
CCP44830 (rpmG1)
1.02 - 4.86 - - - - 2.3 - - - - - - - - - - - 0.78 - - - - - - - - - - - 1.29 - 1.67 0.15 1.73 - -1.82 - - -0.59 - - -1.48 - - - - - - - 1.4 - 2.06 - - 0.6 1.39 - -
CCP44855 (lppJ)
1.05 0.69 -0.33 -0.12 -0.33 0.34 -0.1 0.29 -0.31 0.16 -0.03 -0.03 0.92 -0.37 -0.16 -0.11 -0.18 -0.23 -0.21 -0.22 0.49 -0.29 -0.69 0.65 -0.24 -0.24 0.23 -0.15 -0.17 -0.2 -0.25 0.22 -0.68 -0.13 0.01 -0.25 -0.11 -0.59 -0.07 -0.19 1.02 -0.95 -0.57 -0.55 -0.17 -0.28 -0.25 -0.27 -0.58 -0.25 -0.26 -0.09 -0.88 -0.23 -0.19 1.02 -0.14 0.31 -0.38 1.01
CCP45070 (Rv2288)
0.92 1.81 -1.01 0.11 -2.75 -1.15 -1.01 1.12 -1.84 1.41 0.11 0.03 2.26 -1.53 -1.3 -0.8 -0.36 -1.84 -1.68 -2.27 1.31 -1.6 -2.03 1.36 -1.31 -2.26 0.84 -0.66 -1.03 -0.7 -1.36 1.28 -3.09 -1.35 1.24 -2.06 -3.92 -0.73 -0.69 -0.75 2.0 -1.66 -2.06 -1.03 -1.5 -2.25 -1.47 -1.3 -1.74 0.39 -1.81 -1.07 -1.47 -1.48 -1.45 2.33 -1.72 1.29 -1.74 0.61
CCP45093 (Rv2307D)
-0.3 -3.36 -0.04 -3.27 0.26 -0.04 -0.98 -0.09 0.08 -1.42 -2.87 -0.37 -3.81 0.29 -0.86 -1.33 -0.74 -0.28 0.31 -0.15 -3.11 -0.05 0.82 -5.15 0.11 0.42 -3.42 0.09 -0.61 -0.89 0.08 -0.81 0.86 -0.7 0.17 0.93 2.13 -0.97 -0.35 -0.5 -1.16 0.44 0.79 0.68 -0.17 0.23 0.48 0.1 0.63 -0.66 0.69 0.67 0.58 1.53 0.11 -3.7 0.89 0.01 0.47 -1.58
CCP45175 (Rv2387)
0.48 -0.47 0.39 0.14 0.28 0.14 0.23 -0.48 0.06 -0.42 -0.06 -0.21 -0.15 0.11 -0.59 -0.28 -0.01 0.26 0.01 0.17 -0.59 0.1 0.06 -0.49 -0.02 0.13 -0.75 0.49 0.18 -0.0 0.18 0.16 -0.16 0.24 0.07 0.21 0.2 -0.48 -0.05 -0.66 -0.09 -0.27 0.2 -0.47 0.24 0.29 0.34 0.19 0.43 -0.17 0.15 -1.17 -0.12 -0.01 0.24 -0.11 0.19 -0.13 0.18 -0.46
CCP45200 (Rv2409c)
1.12 0.65 -0.11 0.73 -0.3 -0.48 0.21 -0.04 0.18 0.52 0.66 0.13 0.18 -0.24 -0.38 -0.01 -0.09 -0.1 0.12 0.22 0.41 -0.07 -0.3 0.13 -0.35 -0.15 0.09 0.28 -0.98 -0.17 -0.47 -0.24 -0.18 -0.67 0.44 -0.27 -0.65 0.16 0.37 -0.12 0.45 -0.59 -0.08 -0.31 -0.66 -0.45 -0.31 -0.09 -0.47 -0.35 -0.14 -1.04 -0.34 -0.09 -0.03 0.23 -0.21 -0.12 -0.28 0.87
CCP45245 (Rv2452c)
-0.22 - - - - - - 1.89 - 2.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.5 - - - - - 1.91 - - -4.23 - - - - - - - - - - 0.0 - 5.31 - - - - - 1.42
CCP45338 (lppA)
1.93 0.94 -0.63 -4.35 -0.31 0.23 0.01 0.71 -0.56 -0.64 -4.62 -0.2 1.31 -0.5 -0.12 -0.61 -0.95 -1.01 -0.56 -1.19 1.06 -1.06 0.54 1.47 -0.54 -0.28 0.92 -1.29 -1.2 -0.56 0.05 0.38 -0.35 -0.52 -0.57 0.07 -0.81 -0.66 -0.34 0.02 0.85 -4.05 -0.7 -1.76 -0.32 0.01 0.14 -1.2 0.17 -0.35 0.37 -0.72 -5.53 -1.86 -0.6 1.25 -0.29 0.96 -0.22 1.42
CCP45344 (Rv2548A)
1.09 1.12 -0.53 0.03 -0.5 -0.16 -0.56 -0.22 -0.43 0.89 0.14 -0.58 1.06 -0.35 -0.85 -0.46 -0.4 -0.66 -0.62 -0.7 0.97 -0.65 -0.74 0.8 0.36 -0.32 0.81 -0.32 -0.81 -0.32 -0.21 0.03 -1.11 -0.17 0.08 -0.02 -0.49 -0.72 -0.5 -0.68 0.52 -0.18 -0.56 0.05 -0.04 -0.53 0.05 -0.22 -0.32 0.13 -0.07 0.25 -0.21 0.2 -0.1 1.09 -0.05 0.01 -0.73 0.63
CCP45506 (Rv2708c)
1.69 0.96 -0.62 -0.24 -0.79 -0.34 -0.47 0.98 -1.04 2.4 -0.01 -0.32 0.57 -0.56 -0.21 -0.47 -0.67 -0.61 -0.8 -1.09 1.04 -0.64 -0.81 0.31 -1.02 -1.3 1.08 -0.47 -1.04 -0.86 -0.36 0.36 -0.7 -0.98 0.04 -0.9 -1.35 1.13 -0.4 -0.29 0.1 -0.55 -0.87 0.19 -1.35 -0.61 -0.69 -0.48 -0.31 -0.81 -0.48 -0.02 -0.29 0.44 -0.47 0.53 -1.29 0.06 -0.68 1.06
CCP45520 (Rv2722)
1.44 0.21 -0.79 0.19 -1.13 -0.08 0.25 0.21 -0.69 1.13 0.21 -0.48 -0.16 -0.19 -0.59 -0.42 -0.94 -1.31 -0.71 -1.34 0.03 -0.06 0.31 -0.03 0.06 -0.89 -0.33 0.25 -1.32 -0.7 -0.25 0.35 0.01 -1.65 2.13 0.4 -1.37 -0.93 -0.38 -0.21 0.14 -1.2 0.23 -0.81 -1.11 -0.66 0.27 -0.07 0.71 -0.07 -1.0 0.45 0.26 0.74 -0.27 -0.09 0.01 0.31 -0.56 0.89
CCP45564 (Rv2765)
0.08 0.28 0.21 -0.73 -0.26 0.21 -0.35 -0.06 -0.59 0.73 -0.61 0.32 0.38 -0.08 0.12 0.44 -0.09 -0.04 0.11 0.31 0.09 0.05 -0.32 -0.27 0.21 -0.04 -0.14 -0.08 -0.39 0.02 -0.28 -0.49 -0.7 0.07 1.08 -0.04 0.11 -1.36 0.24 0.04 0.32 -0.41 -0.62 0.57 -0.02 -0.14 0.13 0.07 -0.17 0.32 -0.23 -0.32 -0.54 0.11 0.29 0.49 0.23 -0.48 -0.39 -0.74
CCP45616 (Rv2816c)
2.57 1.3 0.39 - -0.36 0.36 -0.96 0.22 0.32 -0.41 -12.64 -1.23 1.82 -0.9 -0.82 0.28 0.15 0.38 0.43 0.58 0.38 -1.41 -1.76 0.91 0.29 0.33 0.06 -1.72 -0.11 0.31 -0.61 -0.59 -2.43 -0.8 -0.14 -0.92 -0.28 -1.98 -0.83 -0.55 1.33 -10.14 -1.26 -0.69 -0.99 -1.35 -0.25 -0.82 -1.44 -0.7 -1.37 -1.36 -10.42 -2.49 0.22 2.06 0.03 1.33 -2.01 -1.36
CCP45775 (Rv2970A)
3.06 - -0.93 - -0.07 -0.06 -3.69 0.65 -0.23 -0.18 - -0.6 - -0.59 -1.14 -3.49 -3.8 -0.28 0.02 -0.32 - -0.32 -0.17 - -0.21 -0.65 - -1.65 0.46 -0.36 -2.48 0.52 -1.39 -0.53 0.32 -0.39 -0.42 2.42 -0.44 -5.47 -4.02 -1.63 -0.04 1.06 -0.61 -3.7 0.23 -0.34 0.75 -0.4 - 0.0 -0.04 2.96 -0.24 - -0.06 0.52 -0.13 0.68
CCP45825 (PE27A)
- - - - - - - -1.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.9 - - - - - -
CCP45867 (Rv3058c)
1.07 0.38 -0.07 0.09 -0.41 0.35 -0.46 0.31 -0.06 -0.23 -0.21 -0.29 0.52 -0.28 -0.2 -0.25 -0.14 -0.0 -0.29 -0.52 0.13 -0.22 -0.16 0.44 -0.23 -0.19 -0.42 -0.01 0.15 -0.06 -0.27 0.16 -0.28 0.07 0.22 -0.56 0.02 -0.4 -0.18 -0.1 0.72 -0.6 0.08 -0.24 -0.04 -0.02 -0.32 -0.12 -0.44 -0.39 0.01 -1.26 -0.2 0.63 -0.06 0.64 -0.14 0.85 -0.02 0.35
CCP45891 (virS)
0.53 -0.02 -0.34 -0.55 -1.39 -1.5 -1.04 -0.11 -0.72 0.72 -0.46 0.19 -0.11 -1.13 -0.4 -0.91 -0.94 -0.25 -0.92 -0.73 0.06 -1.15 -1.46 -0.77 -1.09 -1.51 0.75 -1.17 -0.92 -1.12 -1.6 -1.18 -1.87 -0.44 1.74 4.02 -0.67 -0.91 -0.08 -0.44 0.03 - -1.2 0.65 -0.75 -0.9 -1.31 -0.89 -0.98 -1.3 -0.75 0.32 -0.77 0.76 -0.99 -0.25 -1.19 -0.79 -0.36 -0.39
CCP45979 (Rv3168)
1.6 0.05 -0.41 -0.4 -0.6 -0.15 0.19 0.42 -0.43 -0.08 -0.3 0.29 0.49 -0.16 0.79 0.4 -0.47 -0.45 -0.0 -0.15 -0.26 0.05 -0.04 -0.24 -0.21 -0.44 -0.45 -0.51 -0.48 -0.37 -0.27 -0.42 -0.21 -0.68 0.95 -0.33 -0.5 0.42 -0.01 0.47 0.46 0.98 -0.9 0.1 -0.64 -0.24 -0.31 -0.22 -0.3 -0.48 -0.47 -0.47 0.93 -0.08 -0.22 0.43 -0.39 0.24 -0.46 -0.52
CCP45980 (Rv3169)
0.95 0.36 -0.02 0.26 -0.6 0.09 -0.02 0.56 -0.18 -0.16 0.11 -0.14 0.98 -0.17 0.08 -0.07 -0.23 0.2 -0.01 0.22 0.02 -0.45 -0.71 -0.04 -0.06 -0.42 -0.03 -0.3 -0.4 -0.3 -0.65 -0.62 -0.56 -0.66 1.18 -0.44 -0.31 0.16 0.1 0.2 1.1 -0.73 -0.74 -0.09 -0.6 -0.74 -0.12 0.04 0.36 -0.09 -0.66 -0.22 -0.01 0.21 0.17 0.81 -0.16 -0.33 -0.71 -0.05
CCP46239 (groEL1)
0.93 -0.24 2.49 1.1 -1.08 -1.69 -0.82 1.08 -0.61 0.7 0.67 -0.88 0.05 -0.48 -0.83 -0.05 -0.68 2.41 -0.47 1.07 -0.58 -1.21 -1.05 -0.47 0.31 -1.45 -0.43 -1.28 -1.05 -0.67 -0.71 0.36 -1.18 0.08 0.48 -1.15 -2.05 1.24 -0.82 -0.85 -0.27 -0.93 -0.82 -1.27 0.05 0.06 -1.19 0.15 -1.02 -0.49 -1.58 -0.68 -0.92 -1.77 -0.28 -0.14 0.22 -0.51 -1.26 0.52
CCP46240 (groES)
2.16 0.66 1.62 0.48 -2.02 -1.61 -1.95 1.77 -0.64 2.05 0.23 -1.14 0.67 -0.88 -2.34 -0.89 -0.75 1.71 -1.36 -0.31 -0.23 -2.4 -2.15 0.61 -0.18 -2.26 -0.06 -2.15 -0.28 -0.84 -1.29 0.55 -2.85 0.11 1.09 -1.86 -4.92 1.75 -1.04 -2.27 0.03 -2.32 -0.96 -0.74 -0.14 -0.92 -2.07 -0.37 -2.35 -1.26 -2.42 1.44 -2.23 -0.68 -0.66 0.62 -0.29 0.65 -2.22 -0.06
CCP46283 (rpmJ)
- - - - - - - 3.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.99 - - - - - - - - - - - - - -0.13 - 5.58 - - - - - -
CCP46311 (Rv3489)
2.49 - -0.93 - -3.47 0.66 -0.86 1.71 - -0.87 - -0.78 - -0.66 -1.16 -2.21 - - -1.95 -2.93 - - - - -0.97 - - - -0.76 - -0.65 1.81 - -2.08 1.3 -2.89 - -0.1 -1.74 - -0.4 1.64 - -1.99 -0.21 - -2.34 -0.84 -0.1 -0.81 0.57 3.15 2.57 2.17 -0.95 - 0.31 1.61 - 1.77
CCP46436 (Rv3613c)
1.52 - - - - - - 3.8 - -0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.92 - - -0.07 - - 2.14 - - -2.41 - - - - - - - - - - 3.77 - 2.63 - - - 2.95 - 0.85
CCP46503 (Rv3679)
0.53 1.07 -0.75 0.53 -0.37 0.09 -0.49 -0.13 -0.57 1.22 0.54 -0.22 1.25 -0.45 -0.51 -0.48 -0.51 -0.71 -0.33 -0.1 0.73 -0.32 -1.19 0.67 -0.29 -0.31 0.65 -0.27 -0.23 -0.45 -0.63 -0.21 -1.07 0.04 0.05 -0.24 0.12 -0.49 -0.25 -0.47 0.93 -0.89 -0.8 0.38 0.02 -0.99 -0.18 -0.37 -0.87 -0.48 -0.4 -0.07 -0.93 0.87 -0.2 1.32 -0.16 0.21 -0.5 -0.32
CCP46504 (Rv3680)
0.31 0.35 -0.47 0.91 0.02 0.29 0.04 -0.29 -0.21 -0.28 0.74 -0.06 0.44 -0.06 -0.11 -0.26 -0.04 -0.45 0.22 0.33 0.11 -0.03 -0.52 0.18 -0.14 0.09 -0.02 -0.12 -0.11 0.03 -0.43 -0.61 -0.29 0.03 -0.64 0.03 -0.1 -0.04 0.19 0.04 0.83 -0.5 -0.45 -0.24 -0.03 -0.26 0.08 -0.06 -0.08 -0.19 -0.21 -0.36 -0.48 -0.38 0.04 0.64 0.08 0.24 -0.04 -0.09
CCP46577 (Rv3750c)
1.66 1.35 -2.47 -1.55 -0.06 -3.0 -0.71 1.63 -3.2 -1.51 -1.3 -2.65 1.52 -0.1 -0.41 -0.23 0.35 -2.31 0.24 0.5 1.02 -0.65 -2.93 1.0 0.06 -0.11 0.74 -0.59 -3.17 0.09 -2.81 0.52 0.08 -3.0 0.98 0.2 1.41 -1.76 -2.73 -0.39 1.21 -1.95 -2.9 -0.74 -3.36 -2.69 0.13 -0.56 0.23 -0.44 -2.4 -0.6 -2.2 -1.13 0.22 1.49 0.2 1.16 -2.74 1.13
CCP46670 (bfrB)
-1.33 0.0 0.44 -1.56 -0.03 -0.97 0.43 0.93 -0.18 0.26 -2.2 0.34 -1.24 -0.05 0.41 0.9 -0.3 0.57 -0.18 -0.55 0.29 -0.06 -0.9 -0.78 -0.3 -0.44 0.63 0.05 -0.44 -0.47 0.58 0.5 0.87 -0.39 -1.68 -0.07 0.95 1.25 -0.1 0.26 -2.33 -0.38 -0.35 -0.08 0.01 0.67 0.01 0.01 0.35 -0.2 1.07 -1.7 -1.1 -0.31 -0.21 -1.57 -0.96 -0.39 0.49 0.05
CCP46671 (glpQ1)
-1.15 -0.59 0.67 -0.77 0.12 -0.4 0.55 0.13 0.17 -0.43 -0.85 -0.18 -0.88 -0.08 0.28 0.67 -0.02 0.79 0.2 -0.19 -0.25 0.19 0.0 -1.1 -0.39 -0.64 0.05 0.17 0.13 -0.35 0.48 0.61 1.2 -0.42 -0.54 -0.21 1.29 0.96 -0.07 0.15 -1.57 -0.39 0.01 -0.22 -0.42 0.5 -0.28 -0.19 -0.34 -0.59 0.43 -0.21 -0.73 -0.18 -0.29 -1.14 -0.62 -0.74 0.0 0.66
CCP46753 (rpmH)
-1.53 - - - - - - 1.24 - -0.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.8 - - - - - 3.9 - - 2.82 - - - - - - - - - - 2.85 - 4.7 - - - - - -0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.