1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_36 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA49056 (VCV51_033831)
 0.36 0.48 0.27 0.37 1.0 0.93 0.95 0.99 0.28 0.68 0.54 0.63 0.57 0.42 0.53 0.62 0.62 0.46 0.49 0.29 0.29 0.28 0.45
KNA49073 (VCV51_033846)
 0.32 0.26 0.21 0.25 1.0 0.89 0.89 0.95 0.27 0.55 0.42 0.56 0.42 0.23 0.41 0.52 0.65 0.1 0.12 0.24 0.22 0.24 0.64
KNA49087 (VCV51_033816)
 0.12 0.21 0.12 0.1 1.0 0.91 0.94 1.0 0.09 0.64 0.67 0.43 0.51 0.17 0.43 0.49 0.42 0.35 0.36 0.06 0.07 0.07 0.28
KNA49116 (VCV51_033804)
 0.41 0.82 0.35 0.22 0.99 0.98 0.96 1.0 0.56 0.5 0.74 0.84 0.52 0.84 0.67 0.82 0.89 0.73 0.72 0.44 0.53 0.48 0.87
KNA49208 (VCV51_030327)
 0.17 0.58 0.07 0.11 1.0 0.63 0.77 0.86 0.19 0.16 0.48 0.27 0.21 0.62 0.22 0.3 0.3 0.2 0.21 0.19 0.19 0.18 0.29
KNA49663 (VCV51_033779)
 0.1 1.0 0.07 0.08 0.82 0.68 0.74 0.85 0.29 0.11 0.27 0.3 0.16 0.97 0.44 0.29 0.3 0.04 0.06 0.26 0.22 0.24 0.25
KNA49668 (VCV51_033784)
 0.26 0.49 0.19 0.16 1.0 0.88 0.92 0.98 0.34 0.48 0.54 0.59 0.32 0.49 0.85 0.63 0.7 0.41 0.41 0.27 0.3 0.4 0.7
KNA50264 (VCV51_033695)
 0.21 0.96 0.41 0.2 0.73 0.65 0.63 0.71 0.35 0.22 0.56 0.32 0.21 1.0 0.36 0.27 0.29 0.09 0.09 0.29 0.26 0.29 0.37
KNA50266 (CgtA)
 0.34 0.63 0.77 0.43 0.43 0.48 0.56 0.4 0.54 0.55 0.99 0.76 0.35 0.72 1.0 0.4 0.39 0.33 0.35 0.42 0.38 0.42 0.47
KNA50302 (LolB)
 0.24 1.0 0.11 0.14 0.38 0.37 0.39 0.36 0.65 0.26 0.52 0.94 0.33 0.93 0.35 0.75 0.63 0.28 0.33 0.47 0.4 0.54 0.9
KNA51882 (VCV51_033536)
 0.14 0.48 0.09 0.08 1.0 0.87 0.93 0.97 0.2 0.38 0.48 0.51 0.34 0.44 0.63 0.34 0.33 0.25 0.29 0.17 0.16 0.18 0.46
KNA52422 (VCV51_030198)
 0.27 0.68 0.21 0.18 1.0 0.87 0.86 0.87 0.37 0.4 0.64 0.51 0.44 0.63 0.54 0.4 0.49 0.18 0.2 0.32 0.35 0.34 0.53
KNA52481 (VCV51_033398)
 0.3 0.39 0.14 0.21 1.0 0.87 0.9 0.95 0.24 0.4 0.73 0.56 0.42 0.47 0.63 0.48 0.52 0.27 0.27 0.23 0.2 0.23 0.72
KNA52705 (VCV51_033387)
 0.24 0.85 0.23 0.21 1.0 0.87 0.84 0.99 0.55 0.35 0.46 0.61 0.32 0.75 0.32 0.63 0.52 0.23 0.26 0.49 0.27 0.47 0.7
KNA52707 (VCV51_033389)
 0.32 0.62 0.24 0.31 0.64 0.71 0.74 0.67 0.66 0.56 0.85 0.8 0.44 0.64 0.63 0.58 0.45 0.29 0.35 0.54 0.61 0.53 1.0
KNA53051 (VCV51_031581)
 0.14 0.75 0.06 0.09 0.58 0.47 0.43 0.49 0.16 0.24 1.0 0.8 0.29 0.83 0.69 0.26 0.16 0.13 0.16 0.14 0.15 0.16 0.42
KNA53373 (VCV51_030114)
 0.4 0.92 0.43 0.4 0.69 0.65 0.66 0.67 0.61 0.53 0.78 0.92 0.39 0.77 1.0 0.45 0.53 0.25 0.25 0.5 0.44 0.51 0.59
KNA53856 (VCV51_030794)
 0.37 1.0 0.21 0.24 0.82 0.79 0.82 0.81 0.87 0.36 0.6 0.97 0.4 0.99 0.89 0.64 0.53 0.57 0.63 0.72 0.57 0.79 0.56
KNA54825 (VCV51_031694)
 0.17 0.22 0.29 0.15 0.96 1.0 0.97 1.0 0.12 0.7 0.4 0.29 0.74 0.19 0.25 0.47 0.24 0.14 0.17 0.12 0.09 0.1 0.8
KNA54907 (VCV51_031790)
 0.07 0.2 0.08 0.04 0.81 0.76 0.69 0.82 0.1 0.44 0.42 0.28 0.32 0.18 0.19 0.14 0.14 0.31 0.41 0.08 0.1 0.09 1.0
KNA54916 (VCV51_033137)
 0.18 0.45 0.28 0.14 1.0 0.91 0.89 0.98 0.18 0.37 0.49 0.58 0.3 0.4 0.55 0.3 0.34 0.19 0.2 0.15 0.17 0.17 0.75
KNA55000 (VCV51_033183)
 0.13 0.36 0.21 0.11 0.73 0.73 0.76 0.7 0.12 0.29 1.0 0.53 0.18 0.33 0.18 0.12 0.08 0.13 0.16 0.11 0.12 0.12 0.51
KNA55003 (VCV51_031733)
 0.23 1.0 0.37 0.23 0.49 0.52 0.51 0.48 0.38 0.38 0.92 0.93 0.24 0.85 0.77 0.32 0.24 0.26 0.28 0.31 0.26 0.34 0.6
KNA55241 (VCV51_031086)
 0.39 0.79 0.18 0.27 0.57 0.68 0.71 0.48 0.55 0.22 0.77 1.0 0.28 0.71 0.4 0.58 0.52 0.34 0.4 0.55 0.38 0.75 0.89
KNA55248 (VCV51_033061)
 0.29 1.0 0.17 0.2 0.69 0.74 0.77 0.66 0.46 0.29 0.66 0.82 0.24 0.95 0.71 0.42 0.34 0.38 0.42 0.39 0.44 0.51 0.7
KNA55258 (VCV51_033071)
 0.19 0.59 0.16 0.17 0.62 0.63 0.65 0.67 0.39 0.19 1.0 0.59 0.17 0.58 0.77 0.28 0.2 0.18 0.22 0.29 0.21 0.33 0.34
KNA55279 (VCV51_033092)
 0.08 0.18 0.05 0.06 0.93 0.91 1.0 1.0 0.07 0.26 0.52 0.26 0.18 0.18 0.39 0.31 0.23 0.17 0.12 0.06 0.06 0.07 0.13
KNA55286 (VCV51_033099)
 0.17 1.0 0.13 0.13 0.75 0.74 0.83 0.72 0.54 0.17 0.72 0.45 0.29 0.94 0.64 0.41 0.35 0.47 0.56 0.47 0.37 0.43 0.76
KNA55294 (VCV51_033107)
 0.28 0.47 0.15 0.17 0.34 0.3 0.32 0.3 0.38 0.24 0.32 1.0 0.24 0.47 0.51 0.38 0.33 0.28 0.34 0.34 0.4 0.44 0.54
KNA55687 (QueE)
 0.18 0.73 0.14 0.16 0.54 0.52 0.53 0.53 0.5 0.21 0.59 0.48 0.11 0.66 1.0 0.23 0.18 0.21 0.23 0.36 0.3 0.41 0.19
KNA56166 (VCV51_032992)
 0.24 0.41 0.18 0.19 0.99 0.92 0.9 1.0 0.22 0.33 0.8 0.75 0.3 0.38 0.47 0.38 0.3 0.17 0.18 0.19 0.19 0.2 0.63
KNA56238 (VCV51_030706)
 0.4 0.5 0.15 0.21 0.7 0.56 0.69 0.7 0.39 0.3 1.0 0.96 0.24 0.59 0.46 0.46 0.36 0.3 0.39 0.35 0.32 0.54 0.5
KNA56239 (VCV51_032975)
 0.49 0.64 0.2 0.28 0.99 0.86 0.85 1.0 0.61 0.32 0.62 0.5 0.28 0.64 0.4 0.8 0.71 0.16 0.18 0.49 0.42 0.65 0.37
KNA56293 (VCV51_030612)
 0.29 0.99 0.19 0.16 0.57 0.58 0.61 0.56 0.44 0.52 0.52 0.73 0.43 1.0 0.61 0.58 0.49 0.46 0.49 0.38 0.45 0.54 0.61
KNA56298 (VCV51_032902)
 0.39 0.49 0.22 0.28 0.8 0.77 0.71 0.8 0.38 0.64 0.72 0.65 0.53 0.5 0.81 0.74 0.65 0.42 0.45 0.34 0.37 0.41 1.0
KNA56882 (VCV51_030517)
 0.02 1.0 0.01 0.01 0.61 0.36 0.26 0.64 0.02 0.01 0.28 0.3 0.03 1.0 0.28 0.03 0.03 0.06 0.06 0.02 0.03 0.03 0.52
KNA57464 (VCV51_032850)
 0.16 0.3 0.1 0.08 0.72 0.97 1.0 0.63 0.19 0.77 0.52 0.43 0.53 0.27 0.4 0.53 0.52 0.38 0.46 0.16 0.15 0.18 0.45
KNA57467 (VCV51_030453)
 0.06 0.12 0.03 0.03 0.84 0.9 1.0 0.85 0.09 0.14 0.23 0.36 0.18 0.1 0.14 0.38 0.27 0.2 0.23 0.07 0.07 0.12 0.02
KNA57468 (VCV51_030454)
 0.44 0.21 0.24 0.32 0.91 0.88 1.0 0.92 0.42 0.4 0.39 0.81 0.44 0.18 0.29 0.7 0.66 0.4 0.47 0.38 0.29 0.46 0.48
KNA58252 (VCV51_032760)
 0.38 0.86 0.26 0.21 0.89 0.89 0.94 0.79 0.6 0.35 0.37 0.99 0.31 0.78 0.59 0.74 0.57 0.39 0.5 0.57 0.32 0.74 1.0
KNA58253 (VCV51_032761)
 0.35 1.0 0.3 0.22 0.88 0.89 0.94 0.78 0.41 0.46 0.38 0.86 0.35 0.91 0.86 0.95 0.71 0.49 0.59 0.45 0.27 0.59 0.94
KNA58610 (VCV51_031101)
 0.2 0.51 0.08 0.1 0.63 0.64 1.0 0.72 0.17 0.11 0.32 0.3 0.09 0.74 0.24 0.22 0.21 0.13 0.14 0.16 0.13 0.21 0.3
KNA58919 (VCV51_032609)
 0.37 0.44 0.24 0.23 0.98 0.84 0.8 1.0 0.32 0.38 0.75 0.51 0.32 0.42 0.41 0.58 0.51 0.37 0.41 0.31 0.28 0.33 0.81
KNA58929 (VCV51_032619)
 0.33 0.83 0.48 0.25 1.0 0.76 0.82 0.85 0.35 0.59 0.71 0.53 0.48 0.77 0.55 0.63 0.49 0.54 0.57 0.3 0.31 0.32 0.92
KNA59589 (VCV51_032517)
 0.16 0.47 0.19 0.12 1.0 0.9 0.94 0.95 0.19 0.41 0.47 0.5 0.4 0.46 0.46 0.39 0.31 0.27 0.26 0.18 0.15 0.19 0.66
KNA59590 (VCV51_032518)
 0.34 0.51 0.42 0.22 0.99 0.95 1.0 0.96 0.29 0.56 0.65 0.52 0.52 0.51 0.39 0.18 0.19 0.36 0.34 0.29 0.28 0.3 0.07
KNA59592 (VCV51_032520)
 0.29 0.69 0.19 0.2 1.0 0.94 0.99 0.98 0.6 0.68 0.63 0.77 0.7 0.62 0.66 0.64 0.53 0.44 0.51 0.54 0.48 0.57 0.95
KNA59877 (VCV51_032288)
 0.13 0.99 0.13 0.15 0.55 0.65 0.68 0.56 0.17 0.26 0.51 0.43 0.22 1.0 0.41 0.2 0.24 0.08 0.12 0.12 0.13 0.13 0.06
KNA59889 (VCV51_032300)
 0.09 0.25 0.05 0.08 1.0 1.0 0.99 0.98 0.17 0.49 0.07 0.23 0.53 0.25 0.24 0.28 0.44 0.11 0.12 0.13 0.13 0.15 0.26
KNA60536 (VCV51_032207)
 0.11 0.67 0.06 0.08 1.0 0.78 0.86 0.9 0.1 0.33 0.35 0.39 0.38 0.65 0.59 0.17 0.21 0.11 0.11 0.09 0.08 0.09 0.43
KNA60537 (VCV51_032208)
 0.11 0.96 0.05 0.07 0.85 0.64 0.73 0.66 0.14 0.24 0.41 0.27 0.3 1.0 0.24 0.1 0.12 0.13 0.12 0.13 0.11 0.12 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)