Heatmap: Cluster_10 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	0.02% arabinose,A1552	0.5mM indole,N16961	37C,C6706	arabinose-,A1552	E-exponential,5uM AI-2,C6706	E-exponential,5uM CAI-1,C6706	E-exponential,5uM DPO,C6706	E-exponential,Water,C6706	empty Tn	E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706	LB(2% NaCl),30C,N16961	LB,C7258	Log,0.2% L-arabinose,C6706	Methanol,N16961	O395	Polymyxin,C6706	Polymyxin,VC1639	riboflavin-,N16961	riboflavin+,N16961	TnqstR	TntfoY	TntoX-strep	Water,Rich,N16961
KNA46672 (VCV51_033904)	0.03	0.77	0.01	0.02	0.13	0.09	0.1	0.13	0.09	0.12	1.0	0.49	0.35	0.76	0.24	0.54	0.32	1.0	0.99	0.07	0.09	0.09	0.92
KNA46673 (VCV51_033905)	0.07	0.59	0.02	0.04	0.24	0.24	0.22	0.24	0.08	0.17	0.63	0.31	0.17	0.62	0.0	0.29	0.17	1.0	0.91	0.09	0.27	0.08	0.29
KNA46674 (VCV51_033906)	0.36	0.5	0.05	0.23	0.23	0.28	0.25	0.21	0.32	0.25	0.84	0.02	0.21	0.57	0.0	0.6	0.57	0.97	1.0	0.31	0.32	0.3	0.24
KNA47630 (VCV51_033876)	0.09	0.28	0.03	0.08	0.19	0.12	0.12	0.19	0.14	0.2	0.17	0.45	0.45	0.25	0.35	0.85	0.5	0.25	0.27	0.13	0.29	0.15	1.0
KNA47631 (VCV51_033877)	0.19	0.1	0.14	0.16	0.16	0.15	0.12	0.23	0.07	0.4	0.14	0.63	0.45	0.13	1.0	0.11	0.11	0.3	0.21	0.05	0.04	0.05	0.54
KNA47632 (VCV51_033878)	0.12	0.2	0.04	0.1	0.13	0.11	0.11	0.12	0.18	0.11	0.24	0.52	0.32	0.29	0.24	0.53	0.34	0.33	0.34	0.16	0.18	0.18	1.0
KNA50253 (VCV51_030285)	0.76	0.17	0.46	0.5	0.03	0.03	0.03	0.03	1.0	0.48	0.94	0.97	0.91	0.15	0.1	0.55	0.78	0.18	0.23	0.94	0.94	0.97	0.79
KNA52732 (VCV51_033373)	0.1	0.09	0.16	0.12	0.23	0.23	0.2	0.2	0.3	0.13	0.08	0.1	0.1	0.09	0.1	0.09	0.09	1.0	0.75	0.23	0.18	0.21	0.22
KNA52733 (VCV51_033374)	0.31	0.14	0.23	0.22	0.23	0.28	0.24	0.24	0.59	0.24	0.25	0.21	0.24	0.14	0.15	0.41	0.37	1.0	0.87	0.49	0.58	0.65	0.59
KNA53007 (VCV51_031568)	0.47	0.03	0.25	0.34	0.03	0.05	0.05	0.02	0.83	0.8	0.16	0.6	1.0	0.02	0.1	0.64	0.69	0.1	0.09	0.64	0.47	0.66	0.16
KNA53846 (VCV51_030787)	0.39	0.11	0.13	0.42	0.08	0.09	0.08	0.09	1.0	0.11	0.14	0.09	0.09	0.12	0.06	0.27	0.2	0.32	0.26	0.74	0.7	0.9	0.32
KNA53847 (VCV51_030788)	0.4	0.11	0.14	0.39	0.08	0.11	0.08	0.09	1.0	0.21	0.18	0.18	0.16	0.11	0.09	0.29	0.21	0.41	0.32	0.66	0.61	0.77	0.5
KNA53848 (VCV51_030789)	0.47	0.18	0.32	0.38	0.16	0.21	0.18	0.17	1.0	0.41	0.32	0.37	0.38	0.18	0.15	0.51	0.51	0.92	0.72	0.77	0.66	0.86	0.5
KNA53849 (VCV51_030790)	0.55	0.25	0.32	0.5	0.2	0.28	0.25	0.24	0.96	0.59	0.32	0.41	0.6	0.24	0.39	0.57	0.52	0.81	0.69	0.87	0.74	0.99	1.0
KNA53850 (VCV51_030791)	0.51	0.16	0.28	0.41	0.18	0.22	0.18	0.2	0.73	0.48	0.34	0.45	0.53	0.15	0.13	0.62	0.58	1.0	0.8	0.64	0.54	0.74	0.57
KNA53851 (VCV51_033233)	0.56	0.18	0.28	0.45	0.17	0.22	0.18	0.16	0.55	0.56	0.22	0.42	0.49	0.21	0.17	0.97	1.0	0.94	0.72	0.46	0.44	0.53	0.59
KNA53906 (VCV51_033251)	0.44	0.01	0.34	0.48	0.02	0.02	0.02	0.01	1.0	0.58	0.08	0.32	0.7	0.01	0.02	0.29	0.3	0.07	0.06	0.74	0.57	0.72	0.17
KNA53907 (VCV51_030834)	0.86	0.01	0.47	0.94	0.03	0.04	0.03	0.03	0.85	1.0	0.11	0.83	0.97	0.01	0.05	0.65	0.69	0.12	0.1	0.66	0.55	0.65	0.23
KNA54829 (VCV51_031690)	0.81	0.02	0.27	0.71	0.01	0.02	0.02	0.01	0.61	0.32	0.06	0.36	0.48	0.02	0.02	0.57	0.41	0.37	0.3	0.55	0.38	0.75	1.0
KNA54954 (VCV51_031754)	0.68	0.01	0.9	0.45	0.38	0.38	0.37	0.44	0.86	0.51	0.25	0.82	1.0	0.01	0.01	0.21	0.33	0.8	0.95	0.65	0.56	0.53	0.22
KNA54955 (VCV51_031753)	0.82	0.01	0.77	0.56	0.13	0.12	0.13	0.15	0.95	0.4	0.26	0.84	1.0	0.01	0.02	0.21	0.33	0.25	0.32	0.85	0.66	0.67	0.24
KNA54956 (VCV51_031752)	0.75	0.01	0.77	0.57	0.09	0.09	0.09	0.1	0.63	0.46	0.15	1.0	0.61	0.0	0.03	0.15	0.25	0.29	0.3	0.64	0.59	0.53	0.12
KNA54957 (VCV51_031751)	0.53	0.0	0.27	0.46	0.12	0.11	0.11	0.13	0.68	0.35	0.08	1.0	0.51	0.0	0.01	0.08	0.14	0.16	0.15	0.68	0.63	0.52	0.14
KNA55213 (VCV51_031061)	0.26	0.07	0.17	0.19	0.37	0.29	0.29	0.32	0.28	0.22	0.17	0.26	0.15	0.06	0.1	0.24	0.18	1.0	0.78	0.22	0.21	0.29	0.29
KNA55214 (VCV51_031062)	0.25	0.3	0.14	0.19	0.4	0.31	0.32	0.35	0.23	0.27	0.23	0.59	0.18	0.33	0.25	1.0	0.8	0.86	0.71	0.2	0.19	0.26	0.39
KNA55242 (VCV51_033055)	0.59	0.04	1.0	0.73	0.04	0.04	0.03	0.03	0.46	0.16	0.03	0.22	0.25	0.03	0.01	0.34	0.33	0.02	0.02	0.58	0.37	0.44	0.15
KNA55666 (VCV51_030982)	0.69	0.04	0.47	0.5	0.14	0.19	0.19	0.12	0.47	0.97	0.09	0.96	1.0	0.04	0.08	0.87	0.76	0.32	0.3	0.44	0.47	0.63	0.64
KNA55670 (VCV51_030986)	0.27	0.03	0.44	0.3	0.05	0.06	0.05	0.05	0.56	1.0	0.04	0.45	0.79	0.02	0.05	0.19	0.22	0.13	0.12	0.37	0.32	0.38	0.13
KNA55671 (VCV51_030987)	0.27	0.02	0.26	0.28	0.04	0.05	0.04	0.03	0.3	1.0	0.04	0.53	0.59	0.02	0.04	0.23	0.26	0.16	0.18	0.26	0.25	0.25	0.16
KNA55672 (VCV51_030988)	0.52	0.04	0.36	0.58	0.07	0.07	0.08	0.06	0.45	1.0	0.05	1.0	0.58	0.04	0.03	0.47	0.58	0.24	0.25	0.44	0.45	0.42	0.16
KNA55673 (VCV51_030990)	0.92	0.05	0.54	1.0	0.13	0.15	0.14	0.12	0.86	0.92	0.09	0.83	0.56	0.04	0.07	0.6	0.62	0.39	0.42	0.81	0.81	0.78	0.47
KNA55710 (Cry2)	0.29	0.31	1.0	0.2	0.12	0.14	0.11	0.12	0.31	0.19	0.25	0.51	0.22	0.27	0.45	0.54	0.44	0.43	0.43	0.31	0.34	0.34	0.5
KNA55997 (VCV51_030916)	0.16	0.11	0.19	0.15	0.66	1.0	0.59	0.64	0.23	0.17	0.17	0.19	0.12	0.12	0.14	0.15	0.12	0.56	0.62	0.19	0.21	0.21	0.21
KNA56290 (VCV51_030608)	0.43	0.47	0.12	0.36	0.17	0.19	0.2	0.16	0.54	0.41	0.87	1.0	0.59	0.39	0.23	0.79	0.51	0.32	0.31	0.41	0.51	0.52	0.87
KNA56897 (VCV51_030532)	0.48	0.55	0.2	0.23	0.25	0.29	0.33	0.2	0.46	0.48	0.74	0.75	1.0	0.41	0.26	0.38	0.41	0.63	0.61	0.41	0.43	0.49	0.39
KNA57806 (VCV51_032819)	0.36	0.5	0.05	0.23	0.23	0.28	0.25	0.21	0.32	0.25	0.67	0.02	0.21	0.57	0.0	0.6	0.57	0.97	1.0	0.31	0.32	0.3	0.24
KNA57846 (VCV51_032817)	0.36	0.5	0.05	0.23	0.23	0.28	0.25	0.21	0.32	0.25	0.67	0.02	0.21	0.57	0.0	0.6	0.57	0.97	1.0	0.31	0.32	0.3	0.24
KNA58915 (VCV51_031260)	0.31	0.03	0.7	0.16	0.62	0.55	0.56	0.58	1.0	0.16	0.18	0.19	0.53	0.03	0.03	0.29	0.24	0.42	0.4	0.7	0.5	0.67	0.17
KNA58916 (VCV51_031259)	0.28	0.01	0.44	0.17	1.0	0.97	0.97	0.85	0.39	0.1	0.07	0.25	0.34	0.01	0.01	0.15	0.14	0.46	0.38	0.35	0.2	0.3	0.13
KNA58917 (VCV51_031258)	0.57	0.02	0.51	0.36	0.9	0.92	1.0	0.9	0.56	0.28	0.15	0.43	0.81	0.02	0.03	0.57	0.46	0.41	0.4	0.57	0.35	0.46	0.4
KNA58918 (VCV51_031257)	0.57	0.1	0.46	0.34	0.95	0.86	1.0	0.98	0.38	0.3	0.18	0.54	0.72	0.1	0.08	0.76	0.57	0.36	0.34	0.45	0.28	0.35	0.43
KNA58956 (VCV51_031243)	0.58	0.1	0.31	0.43	0.24	0.28	0.28	0.22	1.0	0.57	0.27	0.59	0.92	0.08	0.11	0.71	0.63	0.46	0.49	0.9	0.75	0.85	0.46
KNA58957 (VCV51_032635)	0.23	0.42	0.16	0.19	0.88	0.9	0.87	1.0	0.23	0.32	0.65	0.32	0.34	0.37	0.63	0.72	0.62	0.17	0.19	0.2	0.22	0.21	0.29
KNA58958 (VCV51_031242)	0.25	0.26	0.18	0.18	0.29	0.25	0.28	0.28	0.23	0.24	0.27	0.52	0.23	0.25	0.7	0.61	0.5	1.0	0.96	0.19	0.19	0.23	0.69
KNA58959 (VCV51_031241)	0.42	0.17	0.21	0.27	0.35	0.44	0.36	0.4	0.6	0.39	0.19	0.47	0.3	0.17	0.23	0.78	0.58	1.0	0.87	0.46	0.5	0.55	0.87
KNA58960 (VCV51_032636)	0.43	0.1	0.15	0.27	0.31	0.4	0.27	0.3	0.36	0.24	0.12	0.21	0.26	0.08	0.08	1.0	0.89	0.48	0.48	0.44	0.38	0.42	0.29
KNA58961 (VCV51_032637)	0.67	0.29	0.5	0.43	0.52	0.54	0.54	0.47	0.78	0.46	0.27	0.53	0.44	0.26	0.52	0.89	0.87	0.47	0.59	0.73	0.8	0.78	1.0
KNA59644 (VCV51_032541)	0.69	0.4	0.69	0.73	0.46	0.44	0.45	0.42	0.7	0.41	0.39	0.63	0.39	0.37	0.9	0.96	0.78	0.94	1.0	0.71	0.78	0.69	0.93
KNA59757 (VCV51_032452)	0.28	0.02	0.41	0.24	0.02	0.02	0.03	0.02	1.0	0.15	0.09	0.31	0.43	0.02	0.01	0.1	0.18	0.07	0.06	0.73	0.7	0.71	0.07
KNA59773 (VCV51_032468)	0.53	0.28	0.3	0.48	0.71	0.84	0.7	0.73	1.0	0.61	0.26	0.51	0.41	0.25	0.3	0.4	0.67	0.5	0.56	0.98	0.77	0.83	0.77
KNA59792 (VCV51_032487)	0.51	0.45	0.22	0.56	0.64	0.57	0.46	0.67	0.63	0.83	0.31	0.81	0.44	0.46	0.5	0.32	0.52	1.0	0.85	0.56	0.51	0.67	0.65
KNA59912 (VCV51_032323)	0.52	0.02	0.19	0.37	0.01	0.01	0.01	0.01	0.76	0.37	0.11	0.53	1.0	0.01	0.01	0.18	0.45	0.02	0.03	0.61	0.61	0.77	0.2
KNA60726 (VCV51_032165)	0.3	0.25	0.17	0.23	0.63	0.65	0.67	0.51	0.26	0.83	0.27	0.95	0.83	0.24	0.55	0.69	1.0	0.45	0.48	0.25	0.25	0.27	0.69
KNA60727 (VCV51_032166)	0.62	0.62	0.38	0.54	0.2	0.18	0.18	0.18	0.78	0.58	0.67	0.54	0.55	0.59	0.32	0.35	0.62	1.0	1.0	0.73	0.61	0.81	0.82
KNA60728 (VCV51_032167)	0.4	0.61	0.27	0.3	0.2	0.19	0.21	0.24	0.54	0.94	1.0	0.57	0.93	0.56	0.36	0.44	0.62	0.92	0.93	0.42	0.38	0.51	0.68
KNA60729 (VCV51_032168)	0.25	0.39	0.07	0.2	0.35	0.4	0.36	0.44	0.49	1.0	0.7	0.28	0.98	0.37	0.45	0.28	0.46	0.49	0.45	0.4	0.37	0.48	0.5
KNA60901 (VCV51_031875)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.18	0.0	0.35	0.0	0.46	0.0	1.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.96	0.76	0.34	0.0	0.25	0.0
KNA60902 (VCV51_031876)	0.36	0.5	0.05	0.23	0.23	0.28	0.25	0.21	0.32	0.25	0.84	0.02	0.21	0.57	0.0	0.6	0.57	0.97	1.0	0.31	0.32	0.3	0.24
KNA60942 (VCV51_031917)	0.1	0.02	0.03	0.13	0.65	0.93	0.74	1.0	0.18	0.11	0.02	0.06	0.07	0.02	0.04	0.06	0.12	0.16	0.13	0.16	0.15	0.16	0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)