1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA49669 (VCV51_030213)
 0.37 0.0 0.19 0.17 0.0 0.01 0.01 0.0 0.32 1.0 0.01 0.35 0.31 0.0 0.0 0.51 0.74 0.01 0.01 0.25 0.26 0.37 0.13
KNA51543 (VCV51_033585)
 0.32 0.06 0.26 0.33 0.21 0.31 0.35 0.18 0.24 1.0 0.14 0.72 0.52 0.05 0.15 0.32 0.42 0.1 0.09 0.2 0.14 0.21 0.21
KNA52277 (VCV51_033443)
 0.47 0.03 0.24 0.39 0.17 0.28 0.3 0.12 0.31 1.0 0.03 0.53 0.57 0.03 0.02 0.1 0.14 0.42 0.67 0.28 0.32 0.3 0.87
KNA53031 (VCV51_031598)
 0.38 0.09 0.14 0.23 0.05 0.11 0.1 0.05 0.25 0.91 0.2 1.0 0.63 0.08 0.2 0.38 0.27 0.08 0.11 0.24 0.36 0.43 0.8
KNA53590 (VCV51_030068)
 0.65 0.0 0.12 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.88 0.01 0.3 0.53 0.0 0.01 0.18 0.46 0.03 0.03 0.27 0.11 0.23 0.66
KNA53598 (VCV51_030075)
 0.79 0.05 0.28 0.88 0.08 0.13 0.12 0.07 0.69 1.0 0.08 0.54 0.37 0.05 0.09 0.41 0.65 0.52 0.48 0.47 0.65 0.64 0.45
KNA53922 (VCV51_030845)
 0.09 0.0 0.14 0.07 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.67 0.04 1.0 0.73 0.0 0.02 0.47 0.25 0.04 0.04 0.06 0.09 0.08 0.09
KNA53923 (VCV51_030846)
 0.08 0.01 0.16 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.68 0.06 1.0 0.85 0.01 0.02 0.63 0.34 0.03 0.03 0.06 0.08 0.08 0.1
KNA53924 (VCV51_033257)
 0.07 0.03 0.12 0.06 0.01 0.01 0.02 0.01 0.06 0.51 0.13 0.62 1.0 0.02 0.02 0.64 0.34 0.04 0.04 0.06 0.1 0.08 0.16
KNA53925 (VCV51_030848)
 0.09 0.04 0.22 0.08 0.02 0.01 0.02 0.01 0.05 0.46 0.23 0.4 1.0 0.03 0.05 0.87 0.43 0.05 0.07 0.07 0.08 0.08 0.34
KNA54951 (VCV51_031756)
 0.25 0.14 0.24 0.3 0.18 0.18 0.19 0.16 0.31 0.66 0.46 0.71 1.0 0.11 0.18 0.39 0.5 0.24 0.27 0.25 0.58 0.18 0.3
KNA55016 (VCV51_031722)
 0.27 0.18 0.22 0.21 0.07 0.12 0.12 0.07 1.0 0.89 0.35 0.89 0.51 0.17 0.1 0.32 0.31 0.18 0.18 0.78 0.62 0.88 0.32
KNA55128 (VCV51_031815)
 0.71 0.0 0.49 0.42 0.01 0.01 0.01 0.0 0.51 1.0 0.0 0.24 0.28 0.0 0.0 0.08 0.18 0.01 0.01 0.4 0.33 0.45 0.03
KNA55721 (VCV51_031025)
 0.25 0.01 0.09 0.58 0.04 0.09 0.07 0.02 0.92 1.0 0.01 0.55 0.33 0.01 0.01 0.18 0.24 0.26 0.23 0.59 0.07 0.3 0.21
KNA56012 (VCV51_030927)
 0.59 0.01 0.6 0.36 0.03 0.03 0.03 0.02 0.96 0.05 0.23 0.78 0.04 0.01 0.06 0.24 0.22 0.08 0.55 0.85 0.54 1.0 0.05
KNA56013 (VCV51_030928)
 0.19 0.03 0.06 0.12 0.03 0.07 0.05 0.02 0.28 1.0 0.08 0.38 0.11 0.03 0.03 0.18 0.14 0.04 0.05 0.23 0.26 0.34 0.26
KNA56015 (VCV51_030930)
 0.23 0.05 0.08 0.16 0.08 0.2 0.16 0.06 0.24 1.0 0.07 0.49 0.17 0.05 0.03 0.23 0.19 0.11 0.11 0.22 0.26 0.34 0.39
KNA56016 (VCV51_030931)
 0.36 0.13 0.09 0.21 0.14 0.19 0.18 0.04 0.81 0.97 0.17 0.73 0.2 0.17 0.09 0.26 0.19 0.3 0.33 0.77 0.82 1.0 0.41
KNA56017 (VCV51_030933)
 0.56 0.13 0.21 0.41 0.24 0.34 0.33 0.18 0.52 1.0 0.18 0.68 0.39 0.14 0.18 0.59 0.55 0.47 0.51 0.44 0.55 0.62 0.43
KNA58558 (VCV51_032727)
 0.47 0.66 0.8 0.46 0.71 0.62 1.0 0.52 0.47 0.5 0.42 0.52 0.32 0.67 0.23 0.79 0.72 0.82 0.74 0.51 0.48 0.49 0.37
KNA58955 (VCV51_031244)
 0.07 0.02 0.21 0.05 0.05 0.05 0.05 0.04 0.11 1.0 0.02 0.27 0.28 0.03 0.04 0.46 0.52 0.1 0.1 0.09 0.08 0.16 0.13
KNA59393 (VCV51_032576)
 0.13 0.0 0.42 0.12 0.01 0.01 0.01 0.0 0.33 1.0 0.0 0.49 0.47 0.0 0.0 0.22 0.38 0.01 0.01 0.25 0.18 0.14 0.06
KNA59394 (DctQ)
 0.26 0.01 0.5 0.2 0.01 0.01 0.01 0.01 0.53 1.0 0.01 0.53 0.56 0.01 0.01 0.18 0.24 0.02 0.03 0.4 0.28 0.24 0.08
KNA59395 (VCV51_031297)
 0.21 0.01 0.46 0.22 0.01 0.02 0.02 0.02 0.22 1.0 0.01 0.7 0.4 0.01 0.01 0.21 0.34 0.03 0.03 0.21 0.14 0.13 0.07
KNA59759 (VCV51_032454)
 0.4 0.12 0.33 0.38 0.04 0.08 0.07 0.04 0.91 0.33 0.21 1.0 0.18 0.15 0.16 0.57 0.91 0.16 0.24 0.89 0.6 0.86 0.12
KNA59760 (VCV51_032455)
 0.35 0.16 0.41 0.34 0.08 0.11 0.09 0.06 0.66 0.56 0.3 1.0 0.24 0.19 0.24 0.23 0.31 0.32 0.54 0.56 0.38 0.61 0.11
KNA59761 (VCV51_032456)
 0.65 0.23 0.96 0.82 0.24 0.28 0.23 0.22 0.99 0.86 0.34 1.0 0.38 0.33 0.49 0.37 0.46 0.6 0.78 0.88 0.7 0.91 0.27
KNA59762 (VCV51_032457)
 0.53 0.17 0.52 0.59 0.26 0.33 0.32 0.24 0.74 0.76 0.33 0.93 0.45 0.18 0.47 0.39 0.72 0.8 1.0 0.64 0.57 0.6 0.37
KNA59770 (VCV51_032465)
 0.38 0.07 0.21 0.64 0.03 0.04 0.04 0.03 0.41 0.79 0.03 1.0 0.14 0.08 0.05 0.09 0.17 0.09 0.08 0.32 0.21 0.33 0.09
KNA59771 (VCV51_032466)
 0.27 0.03 0.15 0.42 0.03 0.03 0.03 0.03 0.53 1.0 0.03 0.74 0.2 0.03 0.02 0.06 0.09 0.2 0.19 0.38 0.24 0.34 0.08
KNA59831 (VCV51_030886)
 0.79 0.01 0.28 0.92 0.02 0.04 0.04 0.01 0.53 1.0 0.02 0.49 0.28 0.01 0.01 0.05 0.11 0.04 0.04 0.37 0.19 0.53 0.16
KNA59866 (VCV51_032277)
 0.48 0.37 0.29 0.22 0.49 0.48 0.48 0.5 0.46 0.4 0.15 0.82 0.4 0.36 0.1 1.0 0.73 0.23 0.26 0.47 0.32 0.54 0.97
KNA59867 (VCV51_032278)
 0.25 0.1 0.32 0.16 0.13 0.15 0.15 0.13 0.22 0.58 0.09 1.0 0.31 0.09 0.07 0.67 0.41 0.21 0.25 0.23 0.15 0.22 0.33
KNA59868 (VCV51_032279)
 0.32 0.11 0.41 0.21 0.08 0.09 0.08 0.06 0.29 0.46 0.09 1.0 0.24 0.1 0.07 0.58 0.28 0.16 0.19 0.26 0.16 0.27 0.45
KNA59917 (VCV51_032328)
 0.1 0.03 0.07 0.12 0.11 0.18 0.17 0.09 0.39 1.0 0.01 0.26 0.25 0.03 0.05 0.15 0.28 0.24 0.14 0.26 0.18 0.28 0.14
KNA59924 (VCV51_032335)
 0.26 0.0 0.19 0.4 0.01 0.03 0.03 0.01 0.47 1.0 0.0 0.27 0.13 0.0 0.0 0.06 0.14 0.1 0.08 0.39 0.33 0.35 0.5
KNA59988 (VCV51_032400)
 0.41 0.07 0.46 0.61 0.13 0.19 0.18 0.12 0.82 1.0 0.03 0.43 0.4 0.06 0.07 0.22 0.46 0.42 0.36 0.51 0.39 0.49 0.54
KNA60013 (VCV51_032425)
 0.56 0.0 0.46 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.58 0.58 0.0 0.52 0.03 0.0 0.01 0.03 0.05 0.02 0.02 0.42 0.31 0.44 0.06
KNA60743 (VCV51_032183)
 0.28 0.01 0.05 0.45 0.04 0.07 0.07 0.03 0.49 1.0 0.01 0.52 0.49 0.01 0.03 0.1 0.24 0.08 0.07 0.31 0.2 0.28 0.15
KNA60773 (VCV51_032035)
 0.87 0.21 0.97 0.96 0.42 0.41 0.38 0.29 0.9 0.22 0.28 0.97 0.24 0.27 1.0 0.84 0.97 0.51 0.53 0.86 0.65 0.87 0.89
KNA60828 (VCV51_032018)
 0.15 0.01 0.3 0.15 0.01 0.03 0.02 0.01 0.12 0.97 0.03 1.0 0.4 0.01 0.01 0.06 0.08 0.04 0.04 0.31 0.63 0.18 0.07
KNA60830 (VCV51_032020)
 0.48 0.02 0.23 0.72 0.07 0.08 0.08 0.06 0.64 0.88 0.04 1.0 0.81 0.03 0.08 0.15 0.35 0.18 0.14 0.49 0.31 0.43 0.1
KNA60963 (VCV51_031938)
 1.0 0.02 0.33 0.96 0.04 0.06 0.06 0.03 0.45 0.82 0.05 0.62 0.47 0.01 0.14 0.21 0.4 0.13 0.13 0.44 0.49 0.74 0.49
KNA60964 (VCV51_031939)
 0.7 0.02 0.26 0.52 0.03 0.05 0.04 0.02 0.39 1.0 0.05 0.66 0.54 0.01 0.21 0.17 0.31 0.09 0.09 0.33 0.35 0.7 0.7
KNA60983 (VCV51_031958)
 0.27 0.2 0.39 0.17 0.16 0.35 0.33 0.12 0.25 1.0 0.17 0.91 0.65 0.13 0.6 0.44 0.51 0.05 0.05 0.25 0.21 0.24 0.21
KNA61005 (VCV51_031980)
 0.16 0.0 0.29 0.23 0.0 0.05 0.04 0.0 0.27 1.0 0.0 0.64 0.04 0.0 0.0 0.04 0.09 0.02 0.02 0.19 0.13 0.24 0.52
KNA61007 (VCV51_031982)
 0.52 0.0 0.33 0.7 0.0 0.11 0.06 0.0 0.49 1.0 0.0 0.6 0.04 0.0 0.0 0.03 0.07 0.01 0.01 0.4 0.24 0.51 0.34
KNA61008 (VCV51_031983)
 0.55 0.0 0.34 0.71 0.0 0.13 0.08 0.0 0.43 1.0 0.0 0.52 0.04 0.0 0.0 0.03 0.07 0.01 0.01 0.37 0.2 0.46 0.64

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)