Heatmap: Cluster_2 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA47915 (VCV51_033862)
0.0 0.01 0.01 0.0 1.0 0.84 0.91 0.84 0.01 0.0 0.2 0.06 0.0 0.01 0.18 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01
KNA47916 (VCV51_033863)
0.07 0.04 0.03 0.04 0.94 0.78 1.0 0.9 0.1 0.04 0.34 0.28 0.03 0.04 0.21 0.04 0.07 0.16 0.14 0.09 0.16 0.14 0.06
KNA47917 (VCV51_033865)
0.03 0.03 0.02 0.02 1.0 0.74 0.91 0.94 0.03 0.04 0.56 0.32 0.02 0.03 0.86 0.02 0.03 0.11 0.08 0.04 0.03 0.04 0.09
KNA47918 (VCV51_033866)
0.09 0.07 0.06 0.06 0.97 0.8 1.0 0.9 0.12 0.15 0.43 0.47 0.1 0.08 0.76 0.1 0.15 0.31 0.15 0.13 0.25 0.15 0.18
KNA47919 (VCV51_033867)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.69 0.79 0.89 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA47920 (VCV51_033868)
0.02 0.01 0.01 0.01 1.0 0.77 0.83 0.9 0.03 0.02 0.06 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.04 0.05 0.02 0.04 0.03 0.03
KNA49075 (VCV51_033848)
0.03 0.12 0.12 0.02 0.85 0.93 1.0 0.82 0.04 0.05 0.02 0.13 0.02 0.15 0.03 0.17 0.16 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.04
KNA49076 (VCV51_033849)
0.03 0.12 0.13 0.02 0.85 0.9 1.0 0.79 0.03 0.08 0.02 0.18 0.03 0.12 0.12 0.15 0.13 0.06 0.06 0.03 0.02 0.05 0.02
KNA49077 (VCV51_033850)
0.05 0.08 0.13 0.05 0.97 0.97 1.0 0.95 0.04 0.04 0.02 0.1 0.02 0.07 0.1 0.21 0.21 0.03 0.03 0.04 0.04 0.05 0.05
KNA49223 (VCV51_030343)
0.1 0.07 0.14 0.02 0.78 0.94 1.0 0.8 0.04 0.06 0.03 0.17 0.04 0.08 0.04 0.17 0.14 0.05 0.06 0.04 0.04 0.17 0.05
KNA49224 (VCV51_030344)
0.24 0.12 0.24 0.07 0.98 0.94 1.0 0.93 0.06 0.13 0.05 0.45 0.09 0.12 0.11 0.28 0.28 0.07 0.08 0.06 0.06 0.22 0.13
KNA49225 (VCV51_030345)
0.22 0.22 0.26 0.06 0.87 0.87 1.0 0.77 0.08 0.11 0.06 0.33 0.07 0.22 0.07 0.24 0.23 0.1 0.11 0.09 0.09 0.29 0.11
KNA49226 (VCV51_030346)
0.18 0.1 0.3 0.07 0.92 0.98 1.0 0.88 0.05 0.11 0.05 0.2 0.08 0.11 0.09 0.18 0.19 0.15 0.15 0.06 0.06 0.15 0.1
KNA50220 (VCV51_030255)
0.13 0.14 0.08 0.09 0.86 0.85 0.81 1.0 0.15 0.26 0.18 0.26 0.31 0.13 0.32 0.33 0.36 0.19 0.22 0.14 0.16 0.17 0.14
KNA51533 (VCV51_033573)
0.16 0.14 0.14 0.17 1.0 0.8 0.78 0.94 0.2 0.18 0.2 0.36 0.15 0.13 0.11 0.11 0.15 0.19 0.19 0.18 0.18 0.18 0.26
KNA51678 (VCV51_031484)
0.04 0.03 0.01 0.03 0.93 0.61 1.0 0.7 0.06 0.04 0.13 0.06 0.05 0.03 0.08 0.07 0.05 0.05 0.05 0.06 0.05 0.05 0.05
KNA51679 (VCV51_031483)
0.02 0.02 0.01 0.01 1.0 0.58 0.69 0.7 0.02 0.03 0.13 0.04 0.02 0.02 0.12 0.04 0.03 0.07 0.05 0.02 0.02 0.02 0.03
KNA51680 (VCV51_031482)
0.07 0.04 0.04 0.06 1.0 0.58 0.89 0.84 0.08 0.08 0.19 0.15 0.08 0.04 0.35 0.15 0.12 0.19 0.14 0.09 0.08 0.09 0.1
KNA51861 (VCV51_033535)
0.01 0.01 0.03 0.01 1.0 0.89 0.96 0.98 0.03 0.04 0.12 0.08 0.01 0.01 0.08 0.1 0.07 0.03 0.01 0.03 0.02 0.03 0.02
KNA53743 (VCV51_033269)
0.13 0.14 0.08 0.11 1.0 0.71 0.88 1.0 0.11 0.21 0.16 0.47 0.15 0.16 0.23 0.54 0.58 0.16 0.17 0.09 0.09 0.1 0.22
KNA53744 (VCV51_033270)
0.2 0.33 0.09 0.17 1.0 0.67 0.85 0.91 0.24 0.3 0.2 0.55 0.18 0.37 0.2 0.91 0.92 0.24 0.23 0.21 0.19 0.23 0.31
KNA53745 (VCV51_033271)
0.05 0.08 0.01 0.02 1.0 0.64 0.82 0.96 0.04 0.03 0.07 0.1 0.03 0.1 0.05 0.27 0.24 0.01 0.02 0.04 0.03 0.06 0.06
KNA53839 (VCV51_033229)
0.1 0.06 0.08 0.08 0.83 0.9 1.0 0.82 0.08 0.19 0.1 0.13 0.11 0.05 0.15 0.07 0.09 0.27 0.2 0.09 0.08 0.11 0.15
KNA53840 (VCV51_030781)
0.05 0.09 0.03 0.03 0.89 0.92 1.0 0.89 0.05 0.11 0.05 0.17 0.07 0.09 0.06 0.09 0.07 0.1 0.11 0.05 0.04 0.05 0.12
KNA53841 (VCV51_033230)
0.1 0.16 0.04 0.08 0.97 0.92 1.0 0.98 0.07 0.16 0.07 0.22 0.1 0.15 0.17 0.19 0.15 0.19 0.21 0.06 0.08 0.09 0.17
KNA54885 (VCV51_031806)
0.1 0.05 0.04 0.07 1.0 0.53 0.95 0.83 0.08 0.03 0.56 0.15 0.06 0.04 0.25 0.12 0.15 0.21 0.12 0.1 0.08 0.1 0.24
KNA54893 (VCV51_031800)
0.04 0.01 0.02 0.05 0.87 0.93 0.87 1.0 0.05 0.07 0.02 0.05 0.05 0.01 0.04 0.03 0.04 0.07 0.08 0.04 0.03 0.05 0.1
KNA55006 (VCV51_031731)
0.03 0.08 0.29 0.01 0.85 0.95 1.0 0.87 0.01 0.04 0.02 0.25 0.02 0.09 0.04 0.13 0.07 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.04
KNA55007 (VCV51_031730)
0.01 0.07 0.17 0.01 0.93 0.99 1.0 0.97 0.01 0.02 0.0 0.1 0.01 0.07 0.01 0.08 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01
KNA55008 (VCV51_031729)
0.04 0.11 0.29 0.03 0.94 0.96 1.0 0.91 0.02 0.05 0.01 0.22 0.03 0.1 0.04 0.12 0.07 0.04 0.04 0.02 0.02 0.04 0.03
KNA55009 (VCV51_033186)
0.05 0.04 0.22 0.04 0.8 0.97 1.0 0.81 0.04 0.05 0.02 0.21 0.03 0.03 0.06 0.13 0.08 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.06
KNA55233 (VCV51_031078)
0.02 0.04 0.02 0.01 1.0 0.72 0.89 0.92 0.03 0.04 0.28 0.15 0.03 0.04 0.24 0.03 0.02 0.05 0.03 0.03 0.02 0.03 0.03
KNA55234 (VCV51_031079)
0.02 0.04 0.02 0.02 1.0 0.73 0.91 0.9 0.05 0.07 0.35 0.26 0.04 0.04 0.42 0.07 0.04 0.11 0.06 0.06 0.05 0.06 0.03
KNA55235 (VCV51_031080)
0.06 0.06 0.04 0.06 1.0 0.73 0.9 0.9 0.15 0.1 0.37 0.21 0.05 0.05 0.59 0.08 0.06 0.15 0.09 0.14 0.12 0.15 0.05
KNA55236 (VCV51_031081)
0.09 0.04 0.06 0.12 1.0 0.68 0.87 0.87 0.15 0.14 0.34 0.22 0.07 0.04 0.55 0.14 0.11 0.23 0.14 0.14 0.12 0.15 0.06
KNA55238 (VCV51_031083)
0.11 0.05 0.07 0.11 1.0 0.74 0.85 0.93 0.16 0.12 0.27 0.33 0.07 0.05 0.54 0.24 0.22 0.22 0.13 0.17 0.13 0.17 0.08
KNA55340 (VCV51_033037)
0.08 0.03 0.03 0.09 0.91 0.73 0.69 1.0 0.14 0.2 0.04 0.09 0.2 0.03 0.04 0.15 0.12 0.05 0.06 0.11 0.09 0.1 0.03
KNA55375 (VCV51_033049)
0.08 0.07 0.05 0.08 1.0 0.45 0.75 0.7 0.13 0.08 0.18 0.1 0.08 0.06 0.09 0.16 0.13 0.16 0.13 0.1 0.08 0.14 0.07
KNA56157 (VCV51_030896)
0.01 0.06 0.01 0.01 1.0 0.96 0.9 0.89 0.02 0.03 0.06 0.19 0.02 0.06 0.08 0.09 0.08 0.04 0.05 0.02 0.02 0.02 0.03
KNA56295 (VCV51_030615)
0.01 0.03 0.0 0.01 0.96 0.76 0.74 1.0 0.01 0.07 0.03 0.07 0.06 0.03 0.01 0.1 0.08 0.02 0.03 0.01 0.01 0.02 0.03
KNA56296 (VCV51_030616)
0.06 0.09 0.06 0.05 0.93 0.82 0.76 1.0 0.05 0.18 0.06 0.14 0.12 0.08 0.16 0.21 0.15 0.09 0.09 0.05 0.05 0.06 0.12
KNA56297 (VCV51_030617)
0.05 0.1 0.02 0.04 0.9 0.84 0.78 1.0 0.05 0.14 0.08 0.13 0.11 0.1 0.18 0.14 0.1 0.04 0.05 0.04 0.04 0.05 0.08
KNA56380 (VCV51_030668)
0.06 0.09 0.04 0.03 0.97 0.79 0.85 1.0 0.06 0.25 0.15 0.18 0.22 0.08 0.08 0.24 0.18 0.14 0.15 0.05 0.05 0.07 0.15
KNA56404 (VCV51_032963)
0.05 0.13 0.2 0.02 0.93 0.97 1.0 0.87 0.06 0.1 0.06 0.18 0.08 0.14 0.03 0.38 0.31 0.13 0.14 0.07 0.06 0.1 0.11
KNA56885 (VCV51_030520)
0.05 0.06 0.05 0.05 0.92 0.67 1.0 0.71 0.1 0.1 0.52 0.35 0.12 0.09 0.4 0.2 0.16 0.24 0.2 0.09 0.12 0.12 0.08
KNA56886 (VCV51_030521)
0.01 0.01 0.03 0.01 0.92 0.53 1.0 0.56 0.02 0.05 0.2 0.09 0.05 0.02 0.15 0.04 0.04 0.04 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02
KNA56887 (VCV51_030522)
0.06 0.05 0.07 0.05 0.96 0.7 1.0 0.79 0.1 0.1 0.28 0.13 0.09 0.06 0.21 0.12 0.13 0.24 0.22 0.13 0.11 0.13 0.09
KNA56888 (VCV51_030523)
0.08 0.02 0.06 0.07 1.0 0.72 0.93 0.81 0.14 0.07 0.14 0.09 0.06 0.02 0.09 0.13 0.16 0.29 0.19 0.14 0.14 0.17 0.05
KNA56889 (VCV51_030524)
0.1 0.05 0.17 0.09 1.0 0.57 0.86 0.66 0.18 0.12 0.18 0.3 0.07 0.04 0.12 0.13 0.14 0.62 0.39 0.18 0.18 0.24 0.12
KNA56890 (VCV51_030525)
0.15 0.05 0.18 0.12 1.0 0.71 0.9 0.86 0.19 0.18 0.22 0.3 0.12 0.05 0.2 0.18 0.23 0.99 0.59 0.21 0.17 0.26 0.13
KNA57816 (VCV51_032785)
0.06 0.03 0.04 0.03 1.0 0.79 0.84 0.93 0.12 0.12 0.05 0.16 0.11 0.03 0.01 0.08 0.06 0.1 0.14 0.11 0.1 0.11 0.22
KNA57853 (VCV51_032777)
0.11 0.08 0.08 0.1 0.95 0.79 0.88 1.0 0.2 0.13 0.07 0.14 0.26 0.07 0.06 0.38 0.25 0.08 0.09 0.19 0.13 0.12 0.19
KNA58565 (VCV51_031138)
0.03 0.0 0.01 0.02 0.84 1.0 0.91 0.84 0.02 0.04 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.05 0.02 0.02 0.03 0.01
KNA58579 (VCV51_031127)
0.03 0.02 0.02 0.02 1.0 0.59 0.83 0.81 0.04 0.03 0.12 0.1 0.03 0.02 0.14 0.08 0.05 0.07 0.03 0.04 0.03 0.05 0.06
KNA58924 (OmpT)
0.06 0.0 0.01 0.06 0.97 1.0 0.92 0.83 0.05 0.26 0.01 0.14 0.04 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.05 0.03 0.04 0.01
KNA59324 (VCV51_031350)
0.07 0.01 0.06 0.09 0.94 0.85 1.0 0.99 0.11 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.08 0.05 0.07 0.04
KNA59341 (VCV51_031338)
0.08 0.17 0.04 0.05 0.98 0.94 0.99 1.0 0.16 0.3 0.39 0.23 0.28 0.19 0.2 0.25 0.21 0.28 0.34 0.11 0.09 0.13 0.4
KNA59927 (VCV51_032338)
0.03 0.02 0.01 0.02 1.0 0.61 0.84 0.91 0.06 0.03 0.11 0.09 0.03 0.02 0.28 0.04 0.06 0.08 0.07 0.05 0.05 0.05 0.05
KNA59928 (VCV51_032339)
0.02 0.02 0.02 0.01 1.0 0.56 0.82 0.82 0.04 0.02 0.17 0.13 0.02 0.01 0.3 0.01 0.02 0.03 0.03 0.04 0.03 0.04 0.04
KNA59933 (VCV51_032344)
0.07 0.02 0.1 0.07 1.0 0.87 0.82 0.94 0.05 0.11 0.03 0.09 0.11 0.02 0.04 0.04 0.04 0.07 0.07 0.05 0.05 0.05 0.15
KNA59977 (VCV51_032389)
0.06 0.03 0.02 0.04 1.0 0.71 0.91 0.91 0.08 0.03 0.32 0.38 0.03 0.03 0.4 0.09 0.11 0.16 0.05 0.07 0.07 0.08 0.09
KNA59978 (VCV51_032390)
0.01 0.04 0.01 0.01 1.0 0.64 0.82 0.88 0.03 0.02 0.46 0.25 0.02 0.03 0.28 0.02 0.02 0.22 0.05 0.03 0.03 0.04 0.03
KNA59979 (VCV51_032391)
0.01 0.03 0.02 0.01 1.0 0.73 0.87 0.94 0.03 0.02 0.29 0.18 0.01 0.04 0.15 0.03 0.02 0.18 0.06 0.06 0.04 0.08 0.02
KNA59981 (VCV51_032393)
0.01 0.02 0.01 0.01 1.0 0.73 0.95 0.85 0.02 0.02 0.16 0.13 0.02 0.03 0.17 0.02 0.01 0.26 0.04 0.02 0.02 0.04 0.02
KNA59983 (VCV51_032395)
0.02 0.04 0.01 0.02 1.0 0.79 0.92 0.95 0.06 0.02 0.38 0.12 0.02 0.04 0.33 0.04 0.05 0.38 0.23 0.07 0.04 0.07 0.02
KNA59984 (VCV51_032396)
0.02 0.01 0.02 0.02 1.0 0.7 0.8 0.95 0.02 0.02 0.25 0.11 0.03 0.01 0.3 0.01 0.02 0.28 0.21 0.03 0.02 0.03 0.03
KNA60909 (VCV51_031883)
0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.44 0.72 1.0 0.01 0.0 0.21 0.03 0.0 0.0 0.12 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)