Heatmap: Cluster_8 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	0.02% arabinose,A1552	0.5mM indole,N16961	37C,C6706	arabinose-,A1552	E-exponential,5uM AI-2,C6706	E-exponential,5uM CAI-1,C6706	E-exponential,5uM DPO,C6706	E-exponential,Water,C6706	empty Tn	E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706	LB(2% NaCl),30C,N16961	LB,C7258	Log,0.2% L-arabinose,C6706	Methanol,N16961	O395	Polymyxin,C6706	Polymyxin,VC1639	riboflavin-,N16961	riboflavin+,N16961	TnqstR	TntfoY	TntoX-strep	Water,Rich,N16961
KNA49060 (VCV51_033835)	0.11	0.93	0.15	0.12	0.22	0.26	0.27	0.24	0.35	0.15	0.56	0.3	0.13	1.0	0.47	0.29	0.26	0.07	0.06	0.3	0.24	0.3	0.16
KNA49061 (VCV51_033836)	0.11	0.86	0.11	0.12	0.2	0.24	0.25	0.21	0.29	0.15	0.62	0.11	0.13	1.0	0.47	0.08	0.07	0.08	0.07	0.24	0.2	0.24	0.08
KNA49130 (VCV51_033810)	0.09	0.76	0.18	0.08	0.55	0.56	0.57	0.58	0.12	0.58	0.81	0.55	0.36	0.73	1.0	0.52	0.44	0.18	0.2	0.11	0.1	0.11	0.15
KNA49131 (VCV51_033811)	0.12	0.62	0.21	0.11	0.64	0.62	0.64	0.66	0.12	0.47	0.72	0.63	0.36	0.61	1.0	0.45	0.41	0.22	0.24	0.1	0.1	0.11	0.21
KNA49132 (VCV51_033812)	0.07	1.0	0.12	0.06	0.39	0.38	0.39	0.4	0.18	0.24	0.59	0.31	0.21	0.96	0.57	0.37	0.34	0.2	0.22	0.15	0.14	0.16	0.08
KNA49134 (VCV51_033814)	0.1	0.85	0.1	0.07	0.55	0.57	0.59	0.58	0.26	0.28	0.52	0.42	0.3	1.0	0.56	0.27	0.25	0.29	0.27	0.19	0.21	0.21	0.27
KNA51823 (RimM)	0.13	0.72	0.24	0.14	0.42	0.52	0.55	0.48	0.3	0.46	0.69	0.69	0.3	0.8	1.0	0.39	0.34	0.12	0.13	0.24	0.2	0.26	0.24
KNA51824 (VCV51_033511)	0.11	0.72	0.2	0.12	0.34	0.48	0.52	0.4	0.3	0.44	0.69	0.75	0.28	0.76	1.0	0.32	0.25	0.1	0.1	0.24	0.2	0.26	0.19
KNA51829 (VCV51_033517)	0.14	1.0	0.17	0.13	0.44	0.49	0.51	0.47	0.53	0.25	0.56	0.38	0.25	0.99	0.56	0.33	0.33	0.11	0.12	0.4	0.32	0.45	0.31
KNA52215 (VCV51_033473)	0.2	0.41	0.28	0.2	0.5	0.45	0.44	0.51	0.16	0.24	0.52	0.03	0.19	0.44	1.0	0.0	0.0	0.1	0.09	0.16	0.1	0.16	0.08
KNA52216 (VCV51_033474)	0.5	0.29	0.51	0.62	0.98	0.89	0.83	1.0	0.45	0.33	0.67	0.2	0.32	0.28	0.91	0.33	0.36	0.12	0.11	0.43	0.29	0.41	0.3
KNA52492 (VCV51_030150)	0.3	0.59	0.25	0.3	0.98	0.86	0.82	0.99	0.3	0.4	1.0	0.0	0.24	0.69	0.34	0.0	0.0	0.07	0.08	0.35	0.26	0.36	0.34
KNA52712 (VCV51_031518)	0.09	0.48	0.1	0.09	0.49	0.53	0.56	0.53	0.17	0.29	0.57	0.49	0.27	0.46	1.0	0.32	0.19	0.08	0.09	0.14	0.12	0.15	0.22
KNA53275 (VCV51_031625)	0.09	0.99	0.07	0.09	0.45	0.43	0.44	0.5	0.16	0.21	0.47	0.55	0.2	1.0	0.49	0.21	0.15	0.2	0.13	0.13	0.1	0.15	0.18
KNA54971 (VCV51_033154)	0.1	0.78	0.16	0.1	0.65	0.62	0.61	0.7	0.29	0.31	0.74	0.43	0.26	0.73	1.0	0.08	0.08	0.1	0.1	0.23	0.16	0.29	0.15
KNA54972 (VCV51_033155)	0.06	0.93	0.12	0.06	0.53	0.53	0.54	0.56	0.28	0.27	0.72	0.57	0.26	1.0	0.88	0.08	0.07	0.09	0.09	0.21	0.14	0.26	0.11
KNA54973 (VCV51_033156)	0.06	0.54	0.12	0.06	0.46	0.48	0.5	0.5	0.2	0.31	0.73	0.63	0.28	0.51	1.0	0.11	0.1	0.1	0.1	0.16	0.11	0.2	0.07
KNA54974 (VCV51_033157)	0.05	0.93	0.08	0.04	0.21	0.22	0.24	0.22	0.32	0.2	0.55	0.35	0.18	1.0	0.69	0.05	0.05	0.07	0.07	0.25	0.17	0.31	0.03
KNA54975 (VCV51_033158)	0.08	1.0	0.15	0.07	0.29	0.38	0.43	0.31	0.34	0.51	0.87	0.71	0.36	0.96	0.95	0.11	0.09	0.16	0.16	0.27	0.21	0.34	0.08
KNA54976 (VCV51_033159)	0.05	0.96	0.04	0.04	0.15	0.17	0.18	0.17	0.21	0.19	0.4	0.17	0.13	1.0	0.24	0.09	0.06	0.07	0.06	0.16	0.12	0.19	0.04
KNA54977 (VCV51_033160)	0.06	0.98	0.07	0.05	0.24	0.26	0.28	0.27	0.3	0.23	0.65	0.27	0.18	1.0	0.46	0.11	0.07	0.09	0.08	0.24	0.18	0.29	0.03
KNA54978 (VCV51_033161)	0.09	0.73	0.14	0.09	0.46	0.48	0.5	0.5	0.24	0.46	0.82	0.53	0.33	0.71	1.0	0.19	0.12	0.13	0.12	0.21	0.17	0.25	0.08
KNA54979 (VCV51_033162)	0.11	1.0	0.11	0.1	0.5	0.52	0.53	0.54	0.21	0.47	0.91	0.63	0.34	0.93	0.98	0.26	0.17	0.14	0.12	0.17	0.13	0.21	0.11
KNA54980 (VCV51_033163)	0.08	1.0	0.07	0.06	0.52	0.51	0.54	0.55	0.25	0.43	0.84	0.21	0.33	0.86	0.28	0.11	0.09	0.13	0.13	0.21	0.16	0.25	0.11
KNA54981 (VCV51_033164)	0.15	0.59	0.14	0.16	0.72	0.67	0.66	0.75	0.23	0.75	0.67	0.44	0.51	0.58	1.0	0.1	0.06	0.08	0.07	0.22	0.18	0.26	0.1
KNA54982 (VCV51_033165)	0.26	1.0	0.43	0.26	0.78	0.76	0.75	0.83	0.35	0.47	0.73	0.55	0.36	0.84	0.69	0.3	0.25	0.24	0.28	0.29	0.23	0.31	0.18
KNA54983 (VCV51_033166)	0.25	1.0	0.34	0.27	0.7	0.68	0.68	0.76	0.46	0.45	0.74	0.52	0.35	0.99	0.97	0.37	0.3	0.2	0.22	0.38	0.29	0.41	0.27
KNA54984 (VCV51_033167)	0.17	0.54	0.27	0.16	0.69	0.7	0.7	0.76	0.35	0.57	0.72	0.64	0.38	0.54	1.0	0.23	0.16	0.21	0.26	0.27	0.21	0.29	0.17
KNA54985 (VCV51_033168)	0.16	0.79	0.16	0.16	0.66	0.69	0.7	0.72	0.23	0.59	0.84	0.46	0.4	0.75	1.0	0.28	0.18	0.18	0.21	0.18	0.14	0.21	0.05
KNA54986 (VCV51_033169)	0.07	0.87	0.09	0.06	0.23	0.25	0.26	0.26	0.29	0.17	0.46	0.25	0.15	1.0	0.45	0.23	0.16	0.1	0.11	0.23	0.16	0.26	0.05
KNA54987 (VCV51_033170)	0.09	1.0	0.12	0.08	0.32	0.36	0.39	0.35	0.22	0.36	0.58	0.49	0.26	0.98	0.54	0.18	0.12	0.15	0.17	0.18	0.12	0.21	0.09
KNA54988 (VCV51_033171)	0.13	0.76	0.19	0.12	0.48	0.57	0.63	0.52	0.26	0.62	0.84	0.87	0.43	0.66	1.0	0.13	0.07	0.21	0.23	0.2	0.14	0.24	0.1
KNA54989 (VCV51_033172)	0.13	0.46	0.17	0.12	0.44	0.48	0.52	0.48	0.22	0.46	0.76	0.76	0.38	0.43	1.0	0.22	0.14	0.19	0.2	0.17	0.12	0.2	0.09
KNA54990 (VCV51_033173)	0.13	0.29	0.14	0.1	0.53	0.6	0.67	0.58	0.3	0.54	1.0	0.0	0.4	0.24	0.26	0.0	0.0	0.27	0.26	0.26	0.18	0.3	0.1
KNA54991 (VCV51_033174)	0.19	0.96	0.22	0.19	0.3	0.32	0.35	0.34	0.41	0.29	0.65	0.44	0.23	1.0	0.65	0.08	0.05	0.2	0.17	0.35	0.27	0.38	0.1
KNA54992 (VCV51_033175)	0.33	0.85	0.42	0.34	0.48	0.51	0.55	0.55	0.54	0.55	0.88	0.71	0.37	0.81	1.0	0.27	0.21	0.35	0.3	0.47	0.41	0.51	0.19
KNA54994 (VCV51_033177)	0.27	0.66	0.27	0.25	0.62	0.74	0.78	0.66	0.46	0.73	0.85	0.88	0.6	0.58	1.0	0.3	0.18	0.38	0.42	0.35	0.27	0.39	0.33
KNA54995 (VCV51_033178)	0.15	1.0	0.19	0.12	0.38	0.51	0.56	0.42	0.4	0.55	0.74	0.82	0.43	0.97	0.67	0.28	0.19	0.26	0.29	0.32	0.23	0.35	0.14
KNA54996 (VCV51_033179)	0.08	0.87	0.09	0.07	0.26	0.29	0.3	0.29	0.38	0.21	0.46	0.33	0.19	1.0	0.61	0.18	0.12	0.13	0.13	0.3	0.2	0.32	0.07
KNA54997 (VCV51_033180)	0.14	0.63	0.17	0.13	0.5	0.53	0.53	0.56	0.31	0.43	0.63	0.58	0.32	0.62	1.0	0.36	0.24	0.18	0.2	0.25	0.17	0.27	0.23
KNA54998 (VCV51_033181)	0.1	0.46	0.24	0.1	0.58	0.58	0.59	0.64	0.25	0.33	0.64	0.41	0.28	0.43	1.0	0.3	0.2	0.13	0.14	0.21	0.14	0.22	0.19
KNA56385 (VCV51_032949)	0.1	0.46	0.07	0.06	0.89	0.75	0.77	1.0	0.11	0.2	0.97	0.0	0.36	0.59	0.84	0.0	0.0	0.32	0.52	0.08	0.08	0.11	0.0
KNA58149 (VCV51_032766)	0.07	0.67	0.06	0.05	0.39	0.35	0.46	0.33	0.11	0.33	0.42	0.49	0.2	0.79	1.0	0.24	0.14	0.21	0.24	0.09	0.08	0.11	0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)