1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_32 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA47891 (VCV51_033873)
 0.62 0.36 0.42 0.44 0.43 0.4 0.41 0.42 0.44 0.46 0.48 0.64 0.5 0.35 0.57 0.58 0.67 1.0 0.98 0.46 0.45 0.47 0.95
KNA47892 (VCV51_030228)
 0.62 0.55 0.32 0.46 0.24 0.22 0.24 0.2 0.61 0.38 0.52 0.62 0.47 0.57 0.4 0.73 0.89 1.0 0.99 0.63 0.56 0.64 0.68
KNA50934 (VCV51_031638)
 0.2 0.47 0.2 0.15 0.23 0.21 0.22 0.22 0.13 0.41 0.38 0.98 0.41 0.41 0.36 0.89 0.55 0.88 1.0 0.13 0.14 0.14 0.57
KNA51131 (LepA)
 0.08 0.42 0.12 0.07 0.26 0.27 0.3 0.25 0.15 0.3 0.36 0.8 0.41 0.44 0.47 1.0 0.55 0.54 0.6 0.12 0.1 0.13 0.4
KNA51132 (VCV51_031658)
 0.04 0.62 0.16 0.02 0.51 0.53 0.54 0.51 0.05 0.4 0.57 0.56 0.42 0.65 0.41 1.0 0.51 0.36 0.43 0.05 0.04 0.05 0.65
KNA51171 (VCV51_033621)
 0.28 0.61 0.24 0.21 0.4 0.37 0.39 0.37 0.42 0.35 0.57 0.65 0.38 0.61 0.98 0.37 0.27 0.93 1.0 0.41 0.52 0.46 0.63
KNA51539 (VCV51_033579)
 0.18 0.05 0.04 0.16 0.02 0.02 0.02 0.01 0.48 0.02 0.02 0.36 0.02 0.04 0.04 0.1 0.19 0.71 1.0 0.41 0.39 0.45 0.24
KNA51807 (VCV51_033546)
 0.14 0.55 0.13 0.08 0.27 0.25 0.29 0.27 0.08 0.65 0.59 0.66 0.61 0.68 1.0 0.39 0.31 0.84 0.87 0.09 0.12 0.13 0.5
KNA51856 (VCV51_033533)
 0.44 0.34 0.2 0.28 0.22 0.22 0.22 0.21 0.54 0.37 0.28 0.53 0.36 0.34 0.25 0.87 1.0 0.81 0.84 0.51 0.57 0.62 0.6
KNA53340 (VCV51_031635)
 0.43 0.47 0.1 0.11 0.29 0.3 0.32 0.29 0.21 0.51 0.53 0.58 0.57 0.43 0.46 1.0 0.62 0.77 0.88 0.19 0.22 0.58 0.57
KNA53341 (VCV51_031634)
 1.0 0.38 0.23 0.19 0.63 0.67 0.67 0.6 0.21 0.82 0.5 0.98 0.69 0.37 0.47 0.64 0.37 0.84 0.89 0.17 0.21 0.69 0.81
KNA53588 (TatB)
 0.24 0.25 0.35 0.19 0.3 0.3 0.32 0.31 0.32 0.3 0.4 0.44 0.3 0.23 0.41 0.35 0.38 1.0 0.98 0.33 0.37 0.34 0.91
KNA53635 (FtsY)
 0.61 0.8 0.41 0.42 0.48 0.38 0.43 0.39 0.6 0.46 0.55 0.53 0.54 0.74 0.44 0.77 0.92 1.0 0.97 0.5 0.5 0.62 0.99
KNA53804 (VCV51_031866)
 0.45 0.61 0.32 0.29 0.36 0.37 0.37 0.32 0.43 0.42 0.31 0.55 0.46 0.62 0.42 0.56 0.5 0.97 1.0 0.44 0.5 0.46 0.77
KNA53805 (VCV51_031867)
 0.45 0.43 0.3 0.27 0.38 0.46 0.47 0.36 0.24 0.78 0.46 0.69 0.77 0.4 0.79 0.59 0.53 0.93 1.0 0.28 0.34 0.32 0.65
KNA54615 (VCV51_030716)
 0.25 0.17 0.07 0.18 0.18 0.22 0.22 0.19 0.51 0.24 0.35 0.6 0.36 0.18 1.0 0.43 0.3 0.73 0.93 0.42 0.48 0.51 0.49
KNA54889 (VCV51_031803)
 0.63 0.55 0.25 0.33 0.46 0.39 0.42 0.37 0.44 0.73 0.59 0.84 0.61 0.47 0.49 0.46 0.58 0.88 1.0 0.42 0.46 0.79 0.7
KNA54899 (VCV51_031795)
 0.45 0.45 0.25 0.23 0.3 0.29 0.31 0.26 0.32 0.5 0.52 0.82 0.43 0.47 0.75 0.44 0.58 0.85 1.0 0.27 0.3 0.48 0.8
KNA54924 (VCV51_033140)
 0.33 0.5 0.2 0.2 0.22 0.25 0.26 0.22 0.18 0.71 0.53 1.0 0.62 0.54 0.55 0.37 0.4 0.75 0.81 0.18 0.19 0.26 0.41
KNA54961 (VCV51_031747)
 0.42 0.39 0.31 0.3 0.26 0.28 0.29 0.26 0.4 0.57 0.59 0.9 0.53 0.34 0.95 0.48 0.61 0.69 0.73 0.41 0.37 0.45 1.0
KNA54963 (VCV51_033148)
 0.35 0.9 0.24 0.25 0.39 0.36 0.38 0.37 0.33 0.5 0.62 1.0 0.4 0.89 0.54 0.39 0.45 0.49 0.53 0.31 0.29 0.34 0.37
KNA55030 (VCV51_031710)
 0.42 0.61 0.14 0.28 0.33 0.29 0.31 0.31 0.41 0.43 0.61 0.92 0.53 0.52 0.78 0.55 0.45 0.89 1.0 0.33 0.31 0.42 0.9
KNA55031 (VCV51_031709)
 0.22 0.48 0.13 0.13 0.15 0.16 0.16 0.1 0.11 0.47 0.35 0.75 0.51 0.42 0.39 0.61 0.43 0.95 1.0 0.11 0.09 0.13 0.43
KNA55032 (VCV51_031708)
 0.2 0.42 0.13 0.14 0.22 0.24 0.25 0.21 0.18 0.71 0.48 0.87 0.65 0.39 1.0 0.88 0.73 0.84 0.83 0.17 0.14 0.19 0.7
KNA55033 (PtsN)
 0.27 0.65 0.14 0.19 0.47 0.49 0.5 0.5 0.18 0.73 0.65 0.67 0.72 0.62 0.5 0.74 0.67 0.73 0.67 0.16 0.16 0.2 1.0
KNA55036 (VCV51_031705)
 0.24 0.32 0.09 0.17 0.25 0.26 0.27 0.25 0.27 0.24 0.36 0.39 0.33 0.3 0.36 0.69 0.59 1.0 0.9 0.3 0.26 0.23 0.36
KNA55037 (LptA)
 0.36 0.53 0.14 0.25 0.38 0.34 0.36 0.37 0.48 0.21 0.4 0.47 0.38 0.51 0.47 0.65 0.59 1.0 0.91 0.55 0.46 0.39 0.59
KNA55038 (VCV51_033192)
 0.41 0.53 0.15 0.26 0.23 0.21 0.22 0.24 0.73 0.15 0.28 0.23 0.25 0.54 0.22 0.66 0.6 1.0 0.8 0.99 0.77 0.64 0.66
KNA55124 (VCV51_031819)
 0.23 0.74 0.29 0.17 0.4 0.4 0.43 0.4 0.18 0.72 0.54 1.0 0.57 0.76 0.8 0.55 0.64 0.71 0.84 0.16 0.15 0.19 0.78
KNA55132 (VCV51_031812)
 0.21 0.25 0.19 0.17 0.25 0.26 0.26 0.26 0.26 0.32 0.42 0.75 0.35 0.26 0.23 0.43 0.47 0.83 1.0 0.22 0.22 0.25 0.57
KNA55218 (VCV51_033050)
 0.04 0.21 0.01 0.02 0.07 0.07 0.08 0.07 0.06 0.17 0.33 0.45 0.27 0.27 0.06 0.7 0.65 0.67 1.0 0.04 0.04 0.04 0.06
KNA55219 (VCV51_033051)
 0.04 0.51 0.01 0.04 0.1 0.1 0.12 0.1 0.11 0.19 0.55 0.73 0.29 0.62 0.09 0.87 0.75 0.91 1.0 0.08 0.08 0.08 0.11
KNA55291 (VCV51_033104)
 0.29 0.42 0.14 0.19 0.26 0.25 0.29 0.27 0.2 0.34 0.6 0.41 0.45 0.41 0.39 0.91 0.71 0.87 1.0 0.2 0.31 0.23 0.26
KNA56146 (VCV51_032986)
 0.14 0.66 0.07 0.09 0.27 0.25 0.29 0.23 0.12 0.56 0.75 0.43 0.31 0.6 0.6 0.27 0.21 0.83 1.0 0.09 0.08 0.13 0.18
KNA56410 (VCV51_032965)
 0.31 0.15 0.27 0.21 0.34 0.3 0.28 0.29 0.32 0.26 0.31 0.4 0.24 0.17 0.33 0.6 0.42 0.99 1.0 0.27 0.27 0.3 0.64
KNA57623 (VCV51_030437)
 0.08 0.5 0.09 0.05 0.23 0.24 0.26 0.24 0.1 0.33 0.51 0.57 0.27 0.47 0.58 0.44 0.45 0.81 1.0 0.08 0.07 0.09 0.36
KNA57724 (VCV51_030417)
 0.31 0.51 0.36 0.25 0.45 0.47 0.5 0.44 0.4 0.51 0.91 0.78 0.39 0.47 0.7 0.4 0.39 0.89 1.0 0.3 0.26 0.37 0.37
KNA59805 (VCV51_032495)
 0.24 0.26 0.14 0.1 0.14 0.14 0.15 0.15 0.21 0.36 0.51 0.57 0.28 0.24 0.18 0.16 0.2 0.91 1.0 0.17 0.17 0.33 0.32
KNA59962 (VCV51_032374)
 0.14 0.31 0.08 0.09 0.35 0.35 0.36 0.36 0.14 0.49 0.21 0.51 0.33 0.27 0.32 0.25 0.32 0.88 1.0 0.14 0.12 0.17 0.45
KNA60574 (VCV51_032245)
 0.1 0.21 0.07 0.08 0.37 0.37 0.37 0.36 0.32 0.2 0.14 0.21 0.22 0.2 0.14 0.13 0.22 0.87 1.0 0.27 0.27 0.29 0.73
KNA60798 (VCV51_032060)
 0.02 0.33 0.01 0.02 0.1 0.13 0.14 0.1 0.05 0.4 0.52 0.47 0.61 0.37 0.14 0.24 0.3 1.0 0.96 0.04 0.04 0.04 0.25
KNA60799 (VCV51_032061)
 0.05 0.46 0.02 0.05 0.1 0.13 0.13 0.1 0.09 0.24 0.39 0.41 0.4 0.52 0.15 0.39 0.59 0.84 1.0 0.09 0.07 0.09 0.21
KNA60826 (VCV51_032016)
 0.27 0.27 0.12 0.2 0.42 0.36 0.38 0.37 0.3 0.35 0.27 0.35 0.23 0.27 0.43 0.2 0.3 0.91 1.0 0.28 0.3 0.3 0.66
KNA60949 (VCV51_031924)
 0.12 1.0 0.06 0.08 0.15 0.14 0.15 0.14 0.11 0.42 0.39 0.55 0.49 0.81 0.44 0.24 0.36 0.22 0.2 0.12 0.12 0.13 0.17
KNA60950 (VCV51_031925)
 0.1 0.85 0.07 0.08 0.17 0.15 0.16 0.18 0.08 0.48 0.38 1.0 0.46 0.68 0.3 0.32 0.42 0.39 0.39 0.08 0.08 0.09 0.19
KNA60952 (VCV51_031927)
 0.21 0.28 0.13 0.17 0.14 0.18 0.19 0.16 0.43 0.23 0.38 0.63 0.27 0.27 0.52 0.21 0.35 0.8 1.0 0.33 0.31 0.37 0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)