Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA47633 (VCV51_033879)
0.16 0.24 0.05 0.12 0.23 0.19 0.2 0.2 0.23 0.24 0.15 0.17 0.33 0.27 0.24 0.44 0.5 0.95 1.0 0.28 0.3 0.26 0.15
KNA49119 (VCV51_033807)
0.23 0.15 0.08 0.14 0.19 0.19 0.19 0.18 0.21 0.13 0.18 0.22 0.11 0.16 0.1 0.28 0.29 1.0 0.98 0.21 0.21 0.24 0.38
KNA49514 (VCV51_030315)
0.25 0.41 0.12 0.18 0.39 0.37 0.36 0.36 0.29 0.33 0.33 0.33 0.27 0.35 0.21 0.4 0.5 0.94 1.0 0.27 0.31 0.29 0.37
KNA50251 (VCV51_030283)
0.22 0.2 0.16 0.19 0.11 0.11 0.12 0.1 0.25 0.21 0.15 0.26 0.19 0.18 0.19 0.29 0.32 1.0 0.96 0.27 0.27 0.3 0.39
KNA50938 (VCV51_033646)
0.35 0.36 0.14 0.27 0.08 0.08 0.08 0.08 0.26 0.24 0.26 0.66 0.3 0.32 0.34 0.65 0.37 0.99 1.0 0.3 0.21 0.3 0.43
KNA50939 (YqiA)
0.43 0.39 0.21 0.31 0.2 0.16 0.13 0.17 0.28 0.32 0.31 0.46 0.45 0.35 0.29 0.88 0.61 0.89 1.0 0.31 0.22 0.29 0.56
KNA51142 (RumA)
0.34 0.33 0.21 0.26 0.16 0.16 0.17 0.15 0.22 0.41 0.26 0.59 0.4 0.32 0.58 0.53 0.34 1.0 0.97 0.23 0.21 0.25 0.51
KNA51143 (VCV51_031646)
0.24 0.29 0.13 0.2 0.15 0.16 0.16 0.14 0.21 0.49 0.28 0.57 0.52 0.29 0.31 0.76 0.5 0.94 1.0 0.2 0.18 0.24 0.42
KNA51144 (VCV51_033635)
0.28 0.33 0.27 0.3 0.18 0.2 0.21 0.16 0.49 0.57 0.34 0.68 0.58 0.31 0.31 1.0 0.62 0.79 0.74 0.36 0.29 0.34 0.32
KNA51172 (VCV51_031667)
0.36 0.37 0.38 0.27 0.31 0.32 0.34 0.3 0.31 0.49 0.47 0.63 0.45 0.33 0.88 0.75 0.49 0.89 1.0 0.29 0.45 0.33 0.65
KNA51173 (VCV51_033622)
0.32 0.28 0.27 0.25 0.23 0.23 0.24 0.21 0.28 0.42 0.27 0.55 0.45 0.27 0.45 1.0 0.67 0.78 0.9 0.28 0.46 0.32 0.66
KNA51540 (VCV51_033580)
0.21 0.27 0.24 0.23 0.16 0.17 0.16 0.14 0.43 0.2 0.27 0.35 0.13 0.25 0.44 0.12 0.18 1.0 1.0 0.36 0.39 0.32 0.31
KNA51650 (VCV51_031509)
0.36 0.51 0.27 0.28 0.31 0.32 0.34 0.29 0.36 0.47 0.42 0.74 0.41 0.49 0.81 0.74 0.65 0.87 1.0 0.36 0.36 0.39 0.53
KNA51659 (VCV51_031501)
0.6 0.57 0.21 0.36 0.24 0.22 0.26 0.2 0.54 0.39 0.41 0.39 0.35 0.62 0.41 0.68 0.59 0.9 1.0 0.52 0.5 0.62 0.63
KNA51669 (VCV51_031492)
0.2 0.24 0.04 0.13 0.14 0.12 0.15 0.13 0.15 0.2 0.26 0.37 0.37 0.2 0.5 0.41 0.31 0.92 1.0 0.14 0.15 0.17 0.43
KNA52719 (VCV51_031554)
0.5 0.31 0.28 0.34 0.25 0.26 0.28 0.22 0.4 0.66 0.38 0.66 0.48 0.29 0.5 0.84 0.75 0.87 1.0 0.41 0.6 0.47 0.69
KNA52720 (VCV51_031553)
0.38 0.32 0.23 0.31 0.17 0.16 0.18 0.15 0.28 0.54 0.27 0.61 0.36 0.31 0.33 0.55 0.49 0.85 1.0 0.29 0.58 0.36 0.33
KNA52721 (VCV51_031552)
0.58 0.18 0.3 0.52 0.23 0.24 0.25 0.2 0.4 0.6 0.22 0.65 0.4 0.16 0.29 0.77 0.71 0.95 1.0 0.41 0.68 0.47 0.55
KNA52734 (VCV51_033375)
0.25 0.08 0.2 0.21 0.17 0.21 0.18 0.17 0.31 0.24 0.12 0.14 0.19 0.08 0.11 0.31 0.29 1.0 0.85 0.28 0.31 0.32 0.37
KNA53021 (VCV51_033368)
0.23 0.31 0.11 0.23 0.09 0.08 0.08 0.08 0.39 0.36 0.24 0.19 0.32 0.24 0.1 0.28 0.26 0.89 1.0 0.35 0.4 0.42 0.69
KNA53048 (VCV51_031582)
0.44 0.22 0.17 0.3 0.17 0.18 0.2 0.15 0.5 0.42 0.37 0.48 0.42 0.21 0.28 0.84 0.58 0.89 1.0 0.49 0.48 0.54 0.66
KNA53053 (VCV51_033360)
0.43 0.18 0.18 0.31 0.15 0.14 0.14 0.14 0.27 0.42 0.24 0.63 0.41 0.16 0.29 1.0 0.62 0.59 0.69 0.3 0.25 0.3 0.8
KNA53346 (VCV51_033339)
0.34 0.17 0.19 0.2 0.12 0.1 0.11 0.11 0.24 0.28 0.19 0.36 0.27 0.16 0.3 0.31 0.22 0.99 1.0 0.26 0.28 0.37 0.43
KNA54614 (VCV51_030714)
0.48 0.43 0.54 0.35 0.16 0.16 0.18 0.15 0.43 0.43 0.38 0.74 0.49 0.4 0.43 0.89 0.75 0.92 1.0 0.42 0.39 0.52 0.71
KNA54616 (VCV51_030717)
0.14 0.06 0.07 0.09 0.12 0.16 0.16 0.11 0.13 0.25 0.26 0.52 0.4 0.06 0.46 0.4 0.35 0.67 1.0 0.12 0.16 0.14 0.12
KNA54617 (VCV51_030718)
0.26 0.19 0.14 0.21 0.12 0.13 0.15 0.1 0.23 0.36 0.38 1.0 0.51 0.18 0.99 0.69 0.58 0.7 0.96 0.26 0.31 0.28 0.16
KNA54618 (VCV51_030719)
0.31 0.17 0.09 0.24 0.16 0.17 0.19 0.15 0.2 0.4 0.34 0.58 0.63 0.15 0.5 0.39 0.33 0.66 1.0 0.26 0.29 0.28 0.18
KNA54619 (VCV51_033209)
0.34 0.11 0.11 0.26 0.25 0.24 0.27 0.2 0.23 0.4 0.29 0.79 0.53 0.1 0.97 0.94 0.95 0.72 1.0 0.27 0.35 0.29 0.21
KNA54663 (VCV51_030752)
0.08 0.02 0.12 0.06 0.05 0.05 0.06 0.05 0.09 0.08 0.04 0.11 0.1 0.03 0.04 0.14 0.1 0.87 1.0 0.12 0.1 0.11 0.52
KNA54664 (VCV51_030753)
0.2 0.11 0.12 0.12 0.14 0.14 0.15 0.13 0.22 0.16 0.11 0.16 0.19 0.12 0.1 0.5 0.42 0.91 1.0 0.33 0.22 0.25 0.46
KNA54921 (VCV51_031781)
0.3 0.48 0.19 0.29 0.14 0.13 0.14 0.14 0.34 0.36 0.34 0.47 0.32 0.47 0.3 0.24 0.33 0.91 1.0 0.26 0.29 0.28 0.49
KNA54934 (VCV51_031770)
0.15 0.23 0.07 0.11 0.09 0.09 0.09 0.09 0.1 0.21 0.1 0.24 0.21 0.32 0.11 0.2 0.26 0.9 1.0 0.09 0.09 0.12 0.33
KNA54935 (VCV51_031769)
0.07 0.25 0.03 0.05 0.08 0.08 0.08 0.09 0.06 0.07 0.09 0.11 0.07 0.35 0.08 0.07 0.09 0.84 1.0 0.06 0.08 0.1 0.16
KNA54969 (VCV51_033153)
0.31 0.18 0.2 0.17 0.06 0.06 0.06 0.06 0.28 0.16 0.33 0.39 0.19 0.17 0.16 0.14 0.18 0.9 1.0 0.25 0.41 0.39 0.26
KNA54970 (VCV51_031736)
0.39 0.29 0.29 0.26 0.13 0.13 0.15 0.13 0.37 0.19 0.41 0.44 0.21 0.25 0.33 0.2 0.28 0.87 1.0 0.34 0.56 0.47 0.54
KNA55011 (VCV51_033187)
0.38 0.12 0.24 0.21 0.27 0.33 0.24 0.26 0.42 0.16 0.14 0.21 0.2 0.12 0.05 0.38 0.31 0.9 1.0 0.38 0.38 0.42 0.41
KNA55035 (VCV51_031706)
0.63 0.2 0.46 0.57 0.12 0.14 0.15 0.11 0.71 0.6 0.21 0.63 0.56 0.2 0.2 0.81 0.74 1.0 0.87 0.76 0.89 0.72 0.44
KNA55099 (VCV51_031837)
0.64 0.65 0.36 0.3 0.3 0.29 0.32 0.25 0.52 0.66 0.88 0.88 0.55 0.68 0.51 0.48 0.56 0.4 0.41 0.47 1.0 0.76 0.46
KNA55100 (VCV51_031836)
0.52 0.4 0.31 0.31 0.23 0.25 0.27 0.22 0.3 0.52 0.59 1.0 0.51 0.4 0.26 0.58 0.71 0.44 0.48 0.31 0.73 0.45 0.36
KNA55101 (VCV51_031835)
0.56 0.23 0.3 0.37 0.17 0.18 0.19 0.16 0.26 0.55 0.41 0.9 0.45 0.22 0.28 0.82 1.0 0.33 0.3 0.31 0.68 0.42 0.28
KNA55102 (VCV51_031834)
0.56 0.2 0.3 0.38 0.2 0.21 0.23 0.18 0.36 0.54 0.35 1.0 0.4 0.2 0.38 0.62 0.76 0.34 0.32 0.38 0.84 0.53 0.31
KNA55103 (VCV51_033115)
0.65 0.25 0.45 0.48 0.36 0.35 0.38 0.32 0.44 0.51 0.59 0.46 0.45 0.21 0.22 0.33 0.47 0.65 0.57 0.47 1.0 0.58 0.32
KNA55104 (VCV51_033116)
0.45 0.18 0.2 0.33 0.16 0.18 0.19 0.15 0.5 0.31 0.29 0.65 0.29 0.2 0.22 0.47 0.54 0.59 0.52 0.51 1.0 0.66 0.42
KNA55105 (VCV51_033117)
0.71 0.24 0.27 0.53 0.21 0.21 0.23 0.22 0.49 0.37 0.27 0.86 0.27 0.2 0.22 0.65 0.87 0.61 0.53 0.53 1.0 0.69 0.51
KNA55106 (VCV51_033118)
0.62 0.24 0.35 0.44 0.16 0.16 0.17 0.14 0.5 0.32 0.25 0.42 0.26 0.22 0.16 0.55 0.69 0.69 0.65 0.55 1.0 0.69 0.26
KNA55107 (VCV51_031833)
0.67 0.26 0.46 0.46 0.17 0.16 0.18 0.14 0.57 0.27 0.35 0.6 0.29 0.24 0.26 0.53 0.69 0.88 0.83 0.53 1.0 0.72 0.41
KNA55108 (VCV51_031832)
0.41 0.41 0.4 0.29 0.26 0.29 0.29 0.23 0.5 0.63 0.59 0.79 0.49 0.43 0.57 0.48 0.61 0.96 1.0 0.44 0.81 0.62 0.36
KNA55109 (VCV51_033119)
0.42 0.27 0.49 0.34 0.19 0.22 0.24 0.19 0.25 0.6 0.58 0.84 0.55 0.24 0.48 0.66 0.78 0.96 1.0 0.24 0.46 0.35 0.52
KNA55110 (VCV51_031831)
0.54 0.38 0.46 0.42 0.16 0.16 0.18 0.15 0.39 0.7 0.54 0.77 0.53 0.38 0.42 0.71 0.82 0.98 1.0 0.36 0.61 0.5 0.55
KNA55114 (VCV51_031827)
0.28 0.18 0.23 0.15 0.27 0.25 0.28 0.21 0.31 0.17 0.12 0.27 0.09 0.16 0.21 0.1 0.13 1.0 0.88 0.53 0.27 0.53 0.28
KNA55230 (VCV51_031075)
0.1 0.08 0.04 0.08 0.09 0.07 0.08 0.09 0.18 0.11 0.06 0.1 0.08 0.08 0.05 0.19 0.15 1.0 0.79 0.2 0.17 0.19 0.1
KNA55231 (VCV51_031076)
0.24 0.13 0.09 0.22 0.11 0.07 0.09 0.09 0.26 0.13 0.08 0.21 0.1 0.13 0.08 0.32 0.28 1.0 0.87 0.3 0.23 0.31 0.22
KNA55344 (VCV51_031037)
0.34 0.23 0.55 0.26 0.13 0.13 0.14 0.11 0.33 0.44 0.12 0.7 0.33 0.21 0.13 1.0 0.81 0.64 0.82 0.25 0.25 0.29 0.54
KNA55345 (VCV51_031038)
0.52 0.33 0.41 0.48 0.25 0.3 0.3 0.22 0.82 0.75 0.27 0.74 0.56 0.29 0.17 1.0 0.79 0.66 0.83 0.63 0.7 0.76 0.65
KNA55855 (VCV51_030952)
0.27 0.17 0.14 0.18 0.15 0.17 0.19 0.14 0.39 0.42 0.17 0.7 0.46 0.17 0.25 1.0 0.45 0.64 0.73 0.33 0.31 0.41 0.39
KNA55856 (VCV51_030953)
0.57 0.12 0.4 0.41 0.18 0.16 0.18 0.14 0.43 0.47 0.16 0.44 0.52 0.12 0.16 0.65 0.4 0.85 1.0 0.49 0.46 0.49 0.4
KNA56024 (VCV51_030940)
0.48 0.28 0.17 0.28 0.19 0.18 0.19 0.18 0.75 0.38 0.44 0.65 0.27 0.24 0.46 0.52 0.45 0.84 1.0 0.59 0.64 0.72 0.47
KNA56026 (VCV51_030942)
0.47 0.12 0.28 0.53 0.52 0.48 0.51 0.56 1.0 0.52 0.26 0.5 0.27 0.12 0.21 0.57 0.6 0.85 0.86 0.76 0.7 0.79 0.4
KNA56288 (VCV51_030606)
0.45 0.39 0.18 0.26 0.21 0.17 0.24 0.17 0.4 0.32 0.23 0.43 0.34 0.43 0.22 0.28 0.25 1.0 0.98 0.41 0.53 0.55 0.29
KNA56414 (VCV51_030685)
0.5 0.21 0.1 0.33 0.18 0.21 0.2 0.17 0.5 0.5 0.36 0.56 0.4 0.19 0.25 0.89 0.76 0.98 1.0 0.5 0.72 0.65 0.53
KNA58244 (VCV51_032752)
0.35 0.42 0.07 0.23 0.27 0.24 0.23 0.22 0.53 0.26 0.16 0.47 0.36 0.58 0.17 0.73 0.2 1.0 0.97 0.44 0.38 0.54 0.36
KNA58245 (VCV51_032753)
0.4 0.44 0.15 0.3 0.24 0.24 0.26 0.21 0.4 0.41 0.24 0.85 0.37 0.38 0.38 0.96 0.75 0.92 1.0 0.4 0.33 0.44 0.66
KNA58527 (VCV51_031170)
0.33 0.52 0.12 0.24 0.16 0.15 0.16 0.14 0.3 0.39 0.21 0.46 0.33 0.42 0.26 0.61 0.53 0.88 1.0 0.28 0.25 0.32 0.35
KNA58528 (VCV51_031171)
0.18 0.12 0.07 0.14 0.07 0.07 0.07 0.09 0.35 0.25 0.08 0.1 0.11 0.11 0.06 0.29 0.25 0.84 1.0 0.33 0.31 0.32 0.22
KNA58600 (VCV51_031109)
0.43 0.37 0.23 0.34 0.36 0.4 0.4 0.37 0.57 0.47 0.37 0.8 0.48 0.36 0.39 1.0 0.87 0.83 0.87 0.69 0.36 0.6 0.88
KNA58616 (VCV51_031095)
0.51 0.17 0.35 0.6 0.14 0.18 0.17 0.13 0.8 0.33 0.12 0.69 0.24 0.15 0.58 0.68 0.7 0.9 0.94 0.74 1.0 0.68 0.61
KNA58619 (VCV51_032742)
0.17 0.09 0.05 0.08 0.01 0.02 0.02 0.01 0.17 0.06 0.06 0.02 0.07 0.06 0.02 0.08 0.04 1.0 0.95 0.28 0.26 0.23 0.01
KNA59353 (VCV51_031333)
0.34 0.29 0.1 0.19 0.16 0.13 0.17 0.17 0.29 0.43 0.35 0.55 0.45 0.28 0.25 0.37 0.32 0.97 1.0 0.28 0.81 0.38 0.27
KNA59426 (VCV51_031282)
0.48 0.18 0.23 0.43 0.25 0.27 0.28 0.24 0.38 0.68 0.28 0.91 0.52 0.19 0.3 0.96 0.84 0.93 0.98 0.36 0.3 0.38 1.0
KNA59743 (VCV51_032438)
0.11 0.14 0.06 0.07 0.09 0.08 0.09 0.09 0.18 0.06 0.08 0.27 0.04 0.15 0.04 0.2 0.08 1.0 0.79 0.14 0.13 0.16 0.19
KNA59744 (VCV51_032439)
0.12 0.1 0.08 0.08 0.03 0.02 0.02 0.03 0.17 0.04 0.09 0.19 0.04 0.13 0.02 0.23 0.07 1.0 0.92 0.15 0.16 0.16 0.01
KNA59901 (VCV51_032312)
0.13 0.06 0.13 0.22 0.21 0.21 0.21 0.2 0.35 0.19 0.06 0.18 0.17 0.04 0.1 0.1 0.14 0.95 1.0 0.22 0.23 0.26 0.54
KNA59970 (VCV51_032382)
0.26 0.02 0.02 0.15 0.09 0.04 0.07 0.09 0.51 0.03 0.03 0.07 0.26 0.02 0.02 0.14 0.26 1.0 0.73 0.3 0.33 0.42 0.09
KNA60546 (VCV51_032217)
0.1 0.07 0.04 0.09 0.07 0.08 0.08 0.06 0.1 0.17 0.02 0.17 0.09 0.06 0.05 0.09 0.1 1.0 0.9 0.09 0.07 0.13 0.13
KNA60923 (VCV51_031897)
0.25 0.13 0.04 0.18 0.11 0.11 0.08 0.09 0.38 0.11 0.22 0.17 0.32 0.13 0.03 0.29 0.34 1.0 0.92 0.29 0.23 0.33 0.17
KNA61033 (VCV51_032008)
0.02 0.07 0.03 0.01 0.12 0.11 0.1 0.11 0.02 0.08 0.19 0.14 0.1 0.08 0.07 0.11 0.17 1.0 0.8 0.02 0.03 0.02 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)