1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_37 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA49219 (VCV51_030339)
 0.7 0.02 0.09 0.43 0.02 0.03 0.03 0.02 0.79 0.09 0.03 0.08 0.2 0.02 0.01 0.29 0.51 0.11 0.1 0.76 0.79 1.0 0.11
KNA49670 (VCV51_033785)
 0.82 0.04 0.28 0.44 0.05 0.04 0.05 0.04 0.59 0.55 0.04 0.41 0.2 0.03 0.09 0.62 1.0 0.21 0.23 0.54 0.52 0.64 0.36
KNA49671 (VCV51_030215)
 1.0 0.01 0.51 0.53 0.02 0.03 0.03 0.02 0.92 0.6 0.02 0.68 0.23 0.01 0.04 0.62 0.95 0.15 0.16 0.69 0.72 0.92 0.24
KNA50121 (VCV51_033738)
 0.88 0.14 0.28 0.83 0.4 0.52 0.42 0.3 0.93 0.8 0.2 0.91 0.62 0.16 0.12 0.52 0.51 0.4 0.4 0.91 0.66 1.0 0.2
KNA50222 (VCV51_030257)
 0.75 0.04 0.62 0.42 0.12 0.12 0.12 0.1 0.38 0.64 0.14 0.9 0.57 0.04 0.1 0.78 1.0 0.13 0.15 0.32 0.32 0.46 0.3
KNA51530 (VCV51_033570)
 0.92 0.06 0.46 0.43 0.06 0.07 0.06 0.05 0.95 0.89 0.07 0.57 0.48 0.06 0.19 0.5 0.74 0.16 0.18 0.86 0.65 1.0 0.5
KNA51672 (VCV51_031489)
 0.2 0.12 0.12 0.18 0.17 0.22 0.21 0.17 0.18 0.35 1.0 0.21 0.27 0.12 0.37 0.35 0.26 0.39 0.42 0.18 0.29 0.19 0.27
KNA51864 (VCV51_030394)
 0.54 0.29 0.39 0.68 0.31 0.3 0.33 0.28 0.43 0.5 0.54 0.66 0.34 0.28 0.38 0.55 0.69 1.0 0.9 0.42 0.39 0.47 0.66
KNA51865 (VCV51_030395)
 0.16 0.24 0.11 0.13 0.19 0.19 0.21 0.17 0.19 0.44 0.65 0.57 0.34 0.22 0.21 0.67 0.59 1.0 0.93 0.17 0.18 0.2 0.38
KNA51866 (VCV51_030396)
 0.31 0.19 0.21 0.29 0.25 0.24 0.24 0.21 0.3 0.53 1.0 0.68 0.4 0.18 0.29 0.74 0.74 0.9 0.92 0.28 0.27 0.37 0.53
KNA51867 (VCV51_030397)
 0.19 0.13 0.13 0.16 0.1 0.12 0.13 0.1 0.13 0.32 0.73 0.6 0.35 0.12 0.19 0.41 0.61 1.0 0.96 0.13 0.13 0.19 0.4
KNA51869 (VCV51_030399)
 0.08 0.05 0.04 0.06 0.05 0.05 0.05 0.05 0.07 0.1 1.0 0.16 0.09 0.04 0.06 0.18 0.19 0.15 0.14 0.07 0.09 0.08 0.12
KNA51870 (VCV51_030400)
 0.06 0.05 0.03 0.05 0.06 0.06 0.06 0.05 0.08 0.1 1.0 0.08 0.09 0.04 0.06 0.15 0.19 0.12 0.13 0.07 0.07 0.09 0.11
KNA51871 (VCV51_030401)
 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.04 1.0 0.06 0.03 0.02 0.03 0.06 0.06 0.07 0.08 0.03 0.03 0.05 0.05
KNA51872 (VCV51_030402)
 0.05 0.04 0.02 0.03 0.04 0.04 0.05 0.04 0.06 0.05 1.0 0.05 0.04 0.04 0.05 0.07 0.08 0.07 0.08 0.05 0.06 0.07 0.08
KNA51873 (VCV51_030403)
 0.27 0.06 0.05 0.05 0.05 0.06 0.06 0.04 0.1 0.16 1.0 0.13 0.21 0.06 0.14 0.27 0.34 0.04 0.05 0.09 0.12 0.42 0.12
KNA51913 (VCV51_033503)
 0.77 0.07 0.28 0.63 0.34 0.37 0.3 0.25 0.97 0.31 0.16 0.6 0.27 0.1 0.33 0.15 0.26 0.29 0.25 0.84 0.61 1.0 0.44
KNA52028 (VCV51_033490)
 0.22 0.08 0.06 0.21 0.12 0.2 0.17 0.12 1.0 0.2 0.09 0.29 0.16 0.09 0.09 0.13 0.21 0.13 0.11 0.91 0.69 0.99 0.33
KNA52270 (VCV51_033436)
 0.52 0.25 0.12 0.27 0.14 0.15 0.15 0.08 0.56 0.42 0.13 0.26 1.0 0.21 0.1 0.27 0.33 0.51 0.6 0.56 0.36 0.59 0.33
KNA52273 (VCV51_033439)
 0.54 0.09 0.03 0.29 0.03 0.03 0.03 0.03 0.33 0.31 0.1 0.28 1.0 0.08 0.03 0.27 0.37 0.31 0.27 0.29 0.18 0.37 0.27
KNA55333 (VCV51_031030)
 0.84 0.03 0.2 0.72 0.11 0.11 0.12 0.09 0.42 0.95 0.06 0.35 0.6 0.04 0.05 0.84 1.0 0.42 0.45 0.55 0.55 0.45 0.19
KNA57459 (CstA)
 0.05 0.08 0.03 0.03 0.28 0.23 0.17 0.25 0.04 0.09 1.0 0.14 0.21 0.07 0.19 0.05 0.06 0.06 0.09 0.05 0.03 0.07 0.23
KNA59820 (VCV51_030880)
 0.06 0.16 1.0 0.04 0.04 0.05 0.05 0.04 0.06 0.18 0.88 0.15 0.11 0.1 0.06 0.2 0.21 0.1 0.11 0.07 0.06 0.07 0.23
KNA59823 (VCV51_030882)
 0.02 0.06 0.1 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.16 1.0 0.07 0.13 0.03 0.04 0.2 0.18 0.01 0.01 0.05 0.04 0.04 0.09
KNA59824 (VCV51_030883)
 0.05 0.06 0.16 0.04 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.27 1.0 0.17 0.2 0.03 0.05 0.36 0.34 0.09 0.09 0.05 0.04 0.04 0.11
KNA59871 (VCV51_032282)
 0.22 0.31 0.31 0.24 0.08 0.09 0.08 0.07 0.2 0.42 0.61 1.0 0.24 0.24 0.55 0.31 0.45 0.54 0.6 0.19 0.13 0.21 0.51
KNA59891 (VCV51_032302)
 0.62 0.26 0.28 0.52 0.22 0.23 0.27 0.28 0.87 0.44 0.3 0.39 0.37 0.25 0.3 0.21 0.29 0.42 0.4 0.83 0.73 1.0 0.32
KNA59923 (VCV51_032334)
 1.0 0.22 0.34 0.68 0.08 0.09 0.1 0.08 0.64 0.24 0.14 0.43 0.52 0.17 0.14 0.24 0.33 0.57 0.52 0.74 0.74 0.91 0.35
KNA59973 (VCV51_032385)
 0.19 0.19 0.32 0.17 0.09 0.1 0.1 0.09 1.0 0.13 0.05 0.2 0.19 0.19 0.07 0.12 0.2 0.37 0.37 0.86 0.81 0.72 0.36
KNA59986 (VCV51_032398)
 1.0 0.04 0.44 0.75 0.09 0.09 0.1 0.08 0.54 0.58 0.12 0.24 0.23 0.04 0.09 0.22 0.32 0.36 0.32 0.48 0.62 0.67 0.33
KNA60012 (VCV51_032424)
 0.76 0.0 0.12 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.67 0.03 0.39 1.0 0.0 0.01 0.62 0.85 0.0 0.0 0.56 0.32 0.51 0.12
KNA60014 (VCV51_032426)
 0.34 0.1 0.05 0.15 0.14 0.09 0.13 0.14 1.0 0.27 0.38 0.12 0.15 0.06 0.03 0.12 0.25 0.18 0.17 0.7 0.62 0.86 0.12
KNA60580 (VCV51_032251)
 1.0 0.03 0.19 0.66 0.08 0.06 0.04 0.08 0.71 0.25 0.06 0.76 0.57 0.03 0.05 0.35 0.5 0.01 0.01 0.77 0.8 0.65 0.03
KNA60581 (VCV51_032252)
 0.93 0.09 0.16 0.56 0.17 0.11 0.07 0.15 0.5 0.6 0.13 1.0 0.92 0.09 0.07 0.38 0.65 0.02 0.02 0.49 0.53 0.49 0.04
KNA60647 (VCV51_032086)
 1.0 0.1 0.63 0.99 0.38 0.43 0.48 0.33 0.6 0.76 0.17 0.62 0.98 0.11 0.22 0.62 0.89 0.39 0.43 0.62 0.74 0.52 0.37
KNA60648 (VCV51_032087)
 0.79 0.06 0.48 0.6 0.14 0.19 0.21 0.1 0.74 0.66 0.1 0.52 1.0 0.06 0.05 0.25 0.39 0.36 0.43 0.74 0.47 0.49 0.22
KNA60649 (VCV51_032088)
 0.43 0.05 0.24 0.3 0.06 0.08 0.08 0.05 1.0 0.3 0.07 0.34 0.71 0.04 0.06 0.3 0.48 0.16 0.18 0.94 0.46 0.55 0.14
KNA60654 (VCV51_032093)
 0.06 0.08 0.72 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.33 1.0 0.25 0.3 0.05 0.09 0.3 0.31 0.03 0.03 0.06 0.06 0.07 0.19
KNA60655 (VCV51_032094)
 0.09 0.08 0.41 0.06 0.03 0.03 0.03 0.03 0.07 0.17 1.0 0.18 0.17 0.04 0.08 0.19 0.21 0.16 0.15 0.06 0.08 0.07 0.12
KNA60660 (VCV51_032099)
 0.52 0.45 0.19 0.44 0.14 0.14 0.14 0.12 0.55 0.42 0.89 0.43 0.56 0.38 0.19 0.58 1.0 0.49 0.64 0.72 0.47 0.6 0.31
KNA60661 (VCV51_032100)
 0.92 0.4 0.16 0.88 0.05 0.06 0.07 0.05 1.0 0.47 0.61 0.59 0.59 0.31 0.16 0.56 0.82 0.12 0.11 0.92 0.69 0.81 0.58
KNA60662 (VCV51_032101)
 0.56 0.68 0.15 0.48 0.16 0.15 0.15 0.12 0.35 0.41 1.0 0.44 0.52 0.57 0.48 0.38 0.57 0.2 0.2 0.36 0.31 0.34 0.25
KNA60663 (VCV51_032102)
 0.33 0.98 0.08 0.23 0.11 0.11 0.14 0.09 0.34 0.38 1.0 0.5 0.53 0.81 0.75 0.32 0.44 0.14 0.21 0.41 0.33 0.39 0.39
KNA60664 (VCV51_032103)
 0.3 0.76 0.07 0.25 0.13 0.13 0.13 0.1 0.34 0.28 0.94 0.34 0.48 0.7 1.0 0.2 0.26 0.24 0.36 0.48 0.42 0.43 0.41
KNA60700 (VCV51_032139)
 0.15 0.23 0.07 0.12 0.25 0.13 0.12 0.28 0.2 0.31 1.0 0.68 0.36 0.16 0.24 0.2 0.23 0.05 0.06 0.17 0.27 0.17 0.15
KNA60779 (VCV51_032041)
 0.45 0.01 0.27 0.38 0.08 0.11 0.1 0.07 0.95 0.33 0.05 0.28 0.41 0.02 0.02 0.36 0.54 0.06 0.06 0.94 0.67 1.0 0.46
KNA60829 (VCV51_032019)
 0.61 0.14 0.54 0.68 0.18 0.16 0.17 0.17 1.0 0.53 0.12 0.74 0.53 0.15 0.12 0.26 0.46 0.5 0.6 0.83 0.54 0.88 0.34
KNA60917 (VCV51_031891)
 0.41 0.18 0.24 0.31 0.6 0.53 0.52 0.47 1.0 0.65 0.31 0.45 0.55 0.17 0.15 0.21 0.29 0.49 0.58 0.87 0.8 0.93 0.4
KNA60982 (VCV51_031957)
 0.01 0.08 0.29 0.01 0.03 0.03 0.03 0.02 0.04 0.02 1.0 0.1 0.01 0.05 0.21 0.07 0.05 0.01 0.02 0.05 0.08 0.05 0.08
KNA61001 (VCV51_031976)
 1.0 0.01 0.16 0.54 0.01 0.01 0.01 0.01 0.76 0.32 0.2 0.08 0.71 0.01 0.01 0.64 0.62 0.02 0.02 0.88 0.48 0.86 0.14

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)