Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	0.02% arabinose,A1552	0.5mM indole,N16961	37C,C6706	arabinose-,A1552	E-exponential,5uM AI-2,C6706	E-exponential,5uM CAI-1,C6706	E-exponential,5uM DPO,C6706	E-exponential,Water,C6706	empty Tn	E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706	LB(2% NaCl),30C,N16961	LB,C7258	Log,0.2% L-arabinose,C6706	Methanol,N16961	O395	Polymyxin,C6706	Polymyxin,VC1639	riboflavin-,N16961	riboflavin+,N16961	TnqstR	TntfoY	TntoX-strep	Water,Rich,N16961
KNA44127 (VCV51_033968)	0.18	0.02	0.3	0.07	0.04	0.03	0.04	0.06	0.06	0.16	0.05	0.5	0.01	0.03	0.03	0.09	0.03	0.09	0.09	0.1	0.07	0.09	1.0
KNA44193 (VCV51_033961)	0.07	0.02	0.24	0.02	0.05	0.02	0.04	0.05	0.16	0.03	0.01	0.13	0.0	0.02	0.04	0.0	0.01	0.02	0.02	0.09	0.04	0.13	1.0
KNA44586 (VCV51_033944)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.07	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
KNA46119 (VCV51_033913)	0.01	0.0	0.18	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.23	0.01	0.01	0.08	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	1.0
KNA49218 (VCV51_030338)	0.45	0.48	0.23	0.31	0.18	0.22	0.22	0.19	0.41	0.5	0.37	0.72	0.55	0.51	0.33	0.9	1.0	0.42	0.42	0.43	1.0	0.53	0.7
KNA49229 (VCV51_030350)	0.43	0.23	0.17	0.37	0.48	0.46	0.46	0.39	0.66	0.58	0.4	0.66	0.53	0.29	0.58	0.79	0.91	0.52	0.5	0.67	0.54	0.61	1.0
KNA49654 (VCV51_030210)	0.38	0.08	0.22	0.14	0.11	0.14	0.16	0.09	0.38	0.57	0.28	0.36	0.69	0.08	0.04	0.72	0.76	0.09	0.12	0.39	1.0	0.46	0.59
KNA49867 (VCV51_033770)	0.03	0.0	0.22	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.41	0.01	0.0	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	1.0
KNA49918 (VCV51_033765)	0.15	0.01	0.38	0.21	0.06	0.1	0.06	0.04	0.11	0.07	0.03	0.25	0.04	0.01	0.26	0.02	0.03	0.04	0.03	0.11	0.05	0.1	1.0
KNA50239 (VCV51_033687)	0.0	0.0	0.23	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
KNA50365 (VCV51_033668)	0.21	0.16	0.07	0.15	0.29	0.26	0.25	0.25	0.16	0.18	0.18	0.23	0.18	0.17	0.11	0.34	0.28	0.38	0.4	0.14	0.13	0.16	1.0
KNA50390 (FliN)	0.28	0.12	0.67	0.31	0.23	0.23	0.25	0.21	0.19	0.54	0.14	0.8	0.62	0.1	0.36	0.49	0.43	0.49	0.52	0.2	0.38	0.18	1.0
KNA50406 (FlaG)	0.66	0.16	1.0	0.71	0.11	0.13	0.12	0.1	0.93	0.32	0.07	0.43	0.32	0.16	0.12	0.47	0.46	0.52	0.47	0.78	0.76	0.82	0.48
KNA50407 (VCV51_031430)	0.79	0.12	0.58	0.8	0.15	0.17	0.16	0.12	1.0	0.44	0.07	0.72	0.47	0.1	0.09	0.36	0.36	0.48	0.52	0.8	0.71	0.84	0.53
KNA50932 (VCV51_033643)	0.23	0.17	0.3	0.2	0.28	0.27	0.3	0.24	0.41	0.43	0.14	0.44	0.64	0.15	0.2	0.68	0.45	0.23	0.28	0.36	0.28	0.34	1.0
KNA51125 (VCV51_033626)	0.53	0.05	1.0	0.53	0.2	0.2	0.22	0.17	0.1	0.58	0.19	0.51	0.76	0.04	0.27	0.66	0.45	0.13	0.2	0.14	0.09	0.11	0.6
KNA51169 (VCV51_031669)	0.57	0.17	0.14	0.49	0.22	0.25	0.29	0.24	0.43	0.24	0.3	0.63	0.22	0.18	0.78	0.66	0.46	0.45	0.5	0.35	0.25	0.36	1.0
KNA51528 (VCV51_033567)	0.39	0.18	0.21	0.36	0.17	0.19	0.18	0.18	0.34	0.27	0.14	0.49	0.22	0.16	0.12	0.36	0.45	0.2	0.22	0.33	0.24	0.33	1.0
KNA51651 (VCV51_033549)	0.29	0.01	0.52	0.33	0.03	0.04	0.04	0.03	0.13	0.2	0.03	0.25	0.26	0.01	0.03	0.55	0.53	0.06	0.07	0.14	0.11	0.14	1.0
KNA51657 (VCV51_031503)	0.67	0.21	0.24	0.34	0.3	0.31	0.29	0.29	0.41	0.46	0.24	0.49	0.48	0.22	0.22	0.88	0.76	0.45	0.53	0.44	0.47	0.59	1.0
KNA51658 (VCV51_031502)	0.81	0.5	0.19	0.43	0.1	0.12	0.11	0.1	0.45	0.33	0.31	0.69	0.24	0.47	0.23	0.95	0.82	0.46	0.5	0.41	0.4	0.54	1.0
KNA51868 (VCV51_030398)	0.08	0.03	0.34	0.08	0.04	0.05	0.04	0.04	0.06	0.06	0.32	0.08	0.05	0.03	0.04	0.15	0.19	0.19	0.19	0.07	0.07	0.1	1.0
KNA52119 (VCV51_033488)	0.07	0.02	0.24	0.02	0.05	0.02	0.04	0.05	0.16	0.03	0.01	0.13	0.0	0.02	0.04	0.0	0.01	0.02	0.02	0.09	0.04	0.13	1.0
KNA52254 (VCV51_033419)	0.23	0.09	0.29	0.25	0.15	0.15	0.14	0.14	0.2	0.11	0.07	0.42	0.12	0.11	0.28	0.39	0.45	0.07	0.08	0.22	0.18	0.21	1.0
KNA52421 (VCV51_030197)	0.59	0.19	0.38	0.33	0.11	0.13	0.12	0.1	0.32	0.71	0.33	1.0	0.65	0.18	0.2	0.86	0.95	0.48	0.56	0.34	0.29	0.41	0.63
KNA52478 (VCV51_030140)	0.26	0.11	0.03	0.08	0.25	0.24	0.25	0.25	0.23	0.47	0.49	0.32	1.0	0.1	0.72	0.68	0.76	0.32	0.43	0.3	0.32	0.3	0.3
KNA52701 (NrdR)	0.72	0.18	0.77	0.51	0.48	0.49	0.48	0.49	0.25	0.81	0.38	0.86	0.8	0.14	1.0	0.67	0.56	0.21	0.49	0.27	0.26	0.3	0.78
KNA53058 (VCV51_033362)	0.05	0.0	0.22	0.04	0.16	0.12	0.12	0.14	0.0	0.27	0.12	0.33	0.19	0.01	0.25	0.01	0.0	0.04	0.04	0.0	0.01	0.0	1.0
KNA53580 (VCV51_030058)	0.0	0.0	0.4	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.15	0.01	0.0	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0
KNA53633 (VCV51_033307)	0.25	0.04	0.2	0.18	0.24	0.26	0.25	0.21	0.18	0.46	0.13	0.24	0.45	0.05	0.17	0.48	0.57	0.15	0.2	0.21	0.19	0.2	1.0
KNA53678 (VCV51_030033)	0.33	0.16	0.09	0.25	0.12	0.12	0.12	0.12	0.31	0.16	0.15	0.23	0.17	0.16	1.0	0.29	0.35	0.23	0.24	0.32	0.28	0.42	0.72
KNA53926 (VCV51_030849)	0.35	0.1	0.2	0.37	0.07	0.08	0.09	0.07	0.36	0.55	0.33	0.27	0.78	0.1	0.17	0.74	0.49	0.34	1.0	0.37	0.36	0.29	0.96
KNA54648 (VCV51_033219)	0.4	0.13	0.39	0.31	0.13	0.17	0.15	0.13	0.29	0.71	0.38	0.73	0.48	0.12	0.51	0.67	0.58	0.12	0.15	0.33	0.19	0.32	1.0
KNA54962 (VCV51_033147)	0.33	0.11	0.26	0.26	0.1	0.09	0.09	0.09	0.21	0.13	0.16	0.33	0.14	0.11	0.31	0.24	0.36	0.18	0.18	0.28	0.24	0.23	1.0
KNA55002 (VCV51_031734)	0.19	0.06	0.13	0.11	0.03	0.04	0.03	0.03	0.13	0.08	0.11	0.12	0.09	0.07	0.03	0.27	0.24	0.18	0.19	0.11	0.11	0.14	1.0
KNA55045 (VCV51_033194)	0.0	0.0	0.25	0.0	0.03	0.01	0.01	0.04	0.0	0.01	0.0	0.44	0.0	0.01	0.24	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0
KNA55232 (VCV51_031077)	0.73	0.13	0.3	0.6	0.38	0.34	0.33	0.25	0.94	0.46	0.15	0.45	0.34	0.11	0.16	0.9	0.85	0.67	0.72	1.0	0.76	0.99	0.94
KNA55254 (VCV51_033067)	0.23	0.3	0.12	0.15	0.05	0.09	0.08	0.05	0.14	0.41	0.14	0.48	0.69	0.18	0.12	0.58	0.53	0.18	0.17	0.14	0.08	0.14	1.0
KNA55255 (VCV51_033068)	0.28	0.41	0.12	0.16	0.08	0.14	0.13	0.07	0.34	0.5	0.23	0.25	0.96	0.24	0.15	0.34	0.25	0.28	0.26	0.43	0.25	0.37	1.0
KNA55256 (VCV51_033069)	0.69	0.29	0.22	0.42	0.15	0.15	0.15	0.13	0.4	0.79	0.25	0.91	0.81	0.31	0.25	1.0	0.81	0.35	0.43	0.46	0.41	0.51	0.88
KNA55259 (VCV51_033072)	0.29	0.57	0.32	0.23	0.16	0.23	0.24	0.19	0.43	0.38	0.34	0.42	0.9	0.37	0.37	0.92	0.71	0.59	0.5	0.38	0.4	0.35	1.0
KNA55337 (VCV51_031033)	1.0	0.37	0.78	0.8	0.39	0.31	0.31	0.25	0.82	0.36	0.58	0.3	0.42	0.31	0.28	0.37	0.31	0.66	0.72	0.83	0.79	0.78	0.14
KNA55645 (VCV51_030962)	0.8	0.03	0.13	0.38	0.02	0.02	0.02	0.02	0.25	0.19	0.12	0.34	0.28	0.06	0.03	0.82	0.76	0.4	0.43	0.26	0.22	0.46	1.0
KNA55658 (VCV51_030973)	0.15	0.01	0.04	0.08	0.02	0.03	0.03	0.02	0.08	1.0	0.02	0.26	0.03	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.03	0.07	0.07	0.08	0.04
KNA55659 (VCV51_033020)	0.12	0.0	0.04	0.05	0.03	0.04	0.04	0.02	0.21	1.0	0.01	0.22	0.03	0.0	0.01	0.03	0.04	0.04	0.03	0.16	0.12	0.17	0.85
KNA55660 (VCV51_030974)	0.11	0.0	0.06	0.06	0.01	0.02	0.02	0.01	0.21	1.0	0.01	0.09	0.02	0.0	0.0	0.04	0.03	0.02	0.01	0.13	0.1	0.16	0.02
KNA55678 (VCV51_030994)	0.84	0.12	0.98	0.88	0.26	0.29	0.27	0.2	1.0	0.48	0.12	0.21	0.39	0.12	0.12	0.62	0.65	0.55	0.58	0.8	0.66	0.77	0.44
KNA55699 (VCV51_031010)	0.98	0.27	0.35	0.77	0.43	0.36	0.39	0.39	0.57	0.2	0.31	0.54	0.27	0.24	0.23	0.91	0.84	0.31	0.31	0.57	0.56	0.49	1.0
KNA55851 (VCV51_033011)	0.79	0.18	0.16	0.72	0.12	0.15	0.15	0.14	0.9	0.49	0.26	0.53	0.51	0.2	0.41	0.77	0.69	0.67	0.69	1.0	0.69	0.85	0.91
KNA56021 (VCV51_030937)	0.3	0.52	0.09	0.17	0.34	0.34	0.37	0.33	0.45	0.46	0.32	0.53	0.55	0.53	0.2	1.0	0.85	0.2	0.24	0.44	0.84	0.46	0.75
KNA56285 (VCV51_030603)	0.9	0.23	0.85	0.84	0.24	0.24	0.24	0.21	1.0	0.64	0.17	0.58	0.72	0.21	0.35	0.99	0.93	0.65	0.71	0.96	1.0	0.93	0.85
KNA56291 (VCV51_030609)	0.42	0.31	0.05	0.2	0.2	0.19	0.2	0.19	0.46	0.21	0.29	0.37	0.4	0.33	0.37	0.88	0.73	0.42	0.47	0.44	1.0	0.6	0.53
KNA56427 (VCV51_030697)	0.56	0.31	0.13	0.38	0.34	0.38	0.4	0.31	0.71	0.65	0.39	0.58	0.72	0.27	0.52	1.0	0.79	0.33	0.35	0.77	0.87	0.78	0.8
KNA56840 (VCV51_030479)	0.6	0.26	0.12	0.34	0.15	0.16	0.15	0.12	0.66	0.64	0.25	0.51	0.71	0.23	0.11	0.78	1.0	0.32	0.37	0.74	0.55	0.9	0.71
KNA56845 (VCV51_030484)	0.92	0.11	0.41	0.87	0.06	0.09	0.08	0.06	0.83	0.43	0.2	0.69	0.51	0.1	0.17	0.82	1.0	0.4	0.43	0.79	0.51	0.85	0.9
KNA56967 (VCV51_030586)	0.24	0.1	0.1	0.13	0.05	0.05	0.04	0.05	0.11	0.34	0.26	0.22	0.27	0.07	0.18	0.46	0.33	0.03	0.04	0.12	0.16	0.22	1.0
KNA57463 (VCV51_032849)	0.31	0.28	0.15	0.19	0.09	0.11	0.13	0.08	0.4	0.55	0.26	0.53	0.66	0.24	0.25	0.82	1.0	0.35	0.5	0.41	0.35	0.5	0.86
KNA58540 (VCV51_031159)	0.51	0.08	0.16	0.49	0.08	0.28	0.23	0.05	0.65	1.0	0.23	0.47	0.45	0.07	0.07	0.52	0.48	0.1	0.13	0.6	0.36	0.53	0.52
KNA58541 (VCV51_032723)	0.63	0.14	0.37	0.59	0.18	0.25	0.26	0.15	0.81	0.92	0.43	0.57	0.57	0.11	0.21	1.0	0.99	0.31	0.39	0.76	0.52	0.66	0.88
KNA58542 (VCV51_031158)	0.81	0.29	0.39	0.65	0.37	0.35	0.41	0.31	0.95	0.53	0.47	1.0	0.45	0.26	0.44	0.67	0.63	0.5	0.58	0.87	0.66	0.98	0.88
KNA58564 (VCV51_031139)	0.27	0.11	0.24	0.61	0.6	0.75	0.7	0.66	0.39	0.77	0.09	0.35	0.55	0.1	0.33	0.48	0.48	0.19	0.2	0.43	0.56	0.27	1.0
KNA58578 (VCV51_031128)	0.31	0.19	0.21	0.13	0.04	0.04	0.04	0.04	0.13	0.2	0.14	0.29	0.22	0.15	0.06	0.38	0.33	0.08	0.15	0.16	0.26	0.3	1.0
KNA58603 (VCV51_031106)	0.87	0.25	0.26	0.56	0.32	0.4	0.33	0.44	0.65	0.44	0.34	1.0	0.33	0.24	0.25	0.89	0.78	0.53	0.59	0.67	0.57	0.89	0.72
KNA58608 (VCV51_031103)	0.62	0.24	0.16	0.43	0.1	0.1	0.12	0.08	0.66	0.31	0.18	0.43	0.34	0.22	0.17	1.0	0.92	0.52	0.54	0.69	0.52	0.8	0.84
KNA58609 (VCV51_031102)	0.68	0.27	0.18	0.42	0.09	0.12	0.12	0.1	0.73	0.34	0.25	0.55	0.36	0.28	0.32	0.84	0.69	0.72	0.74	0.73	0.58	0.87	1.0
KNA58931 (RuvC)	0.23	0.05	0.3	0.26	0.12	0.11	0.13	0.13	0.2	0.13	0.15	0.49	0.13	0.07	0.64	0.11	0.08	0.33	0.28	0.17	0.13	0.17	1.0
KNA59328 (VCV51_031347)	0.56	0.3	0.13	0.26	0.34	0.44	0.45	0.27	0.34	0.58	0.35	0.63	0.63	0.28	0.67	0.94	0.83	0.12	0.19	0.41	0.6	0.5	1.0
KNA59343 (DinG)	0.8	0.57	0.58	0.64	0.32	0.33	0.33	0.29	0.6	0.35	0.52	0.79	0.25	0.58	0.62	1.0	0.85	0.37	0.44	0.52	0.52	0.76	0.98
KNA59385 (VCV51_031305)	0.7	0.08	0.64	0.28	0.18	0.22	0.2	0.17	0.6	0.37	0.28	0.53	1.0	0.08	0.17	0.61	0.66	0.25	0.33	0.71	0.6	0.65	0.55
KNA59403 (VCV51_032582)	0.33	0.07	0.18	0.33	0.34	0.31	0.29	0.3	0.15	0.45	0.19	0.17	0.65	0.07	0.15	0.44	0.35	0.13	0.13	0.17	0.15	0.15	1.0
KNA59421 (VCV51_031284)	0.38	0.15	0.17	0.22	0.19	0.19	0.18	0.17	0.32	0.21	0.23	0.34	0.41	0.13	0.13	0.76	0.64	0.2	0.33	0.42	0.29	0.35	1.0
KNA59648 (VCV51_031368)	0.47	0.07	0.09	0.28	0.16	0.16	0.18	0.13	0.42	0.25	0.08	0.28	0.63	0.09	0.15	0.63	0.7	0.24	0.26	0.33	0.23	0.49	1.0
KNA59929 (VCV51_032340)	0.26	0.23	0.08	0.2	0.26	0.26	0.28	0.25	0.38	0.44	0.28	0.57	0.44	0.22	0.27	0.28	0.36	0.28	0.3	0.33	0.24	0.37	1.0
KNA59997 (VCV51_032409)	0.32	0.06	0.13	0.25	0.09	0.08	0.09	0.07	0.59	0.09	0.1	0.22	0.18	0.07	0.06	0.21	0.3	0.13	0.16	0.4	0.29	0.46	1.0
KNA61013 (VCV51_031988)	0.33	0.21	0.22	0.32	0.11	0.2	0.22	0.08	0.42	0.36	0.06	0.54	0.29	0.16	0.1	0.3	0.42	0.06	0.08	0.5	0.08	0.31	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)