1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA49118 (VCV51_033806)
 0.6 0.08 0.25 0.24 0.03 0.03 0.04 0.03 0.25 0.44 0.2 0.49 0.7 0.07 0.05 0.75 0.96 0.16 0.18 0.32 0.21 0.44 1.0
KNA49209 (VCV51_030328)
 0.43 0.19 0.21 0.26 0.29 0.27 0.29 0.28 0.3 0.33 0.29 0.67 0.32 0.19 0.58 0.88 0.92 0.35 0.41 0.32 0.32 0.34 1.0
KNA49488 (VCV51_030297)
 0.41 0.43 0.17 0.19 0.2 0.25 0.26 0.17 0.4 0.38 0.42 0.53 0.47 0.41 0.4 0.82 1.0 0.26 0.28 0.43 0.36 0.53 0.42
KNA49502 (VCV51_030306)
 0.55 0.13 0.17 0.51 0.4 0.37 0.35 0.4 0.29 0.3 0.19 0.46 0.21 0.11 0.15 0.77 1.0 0.2 0.2 0.28 0.24 0.4 0.85
KNA49518 (VCV51_033797)
 0.33 0.12 0.12 0.19 0.06 0.06 0.06 0.05 0.72 0.3 0.19 0.7 0.28 0.14 0.1 0.78 0.97 0.07 0.07 0.62 0.64 0.66 1.0
KNA49672 (VCV51_030217)
 0.5 0.06 0.24 0.36 0.15 0.16 0.17 0.11 0.28 0.56 0.11 0.51 0.74 0.06 0.08 0.86 1.0 0.13 0.15 0.31 0.31 0.37 0.56
KNA50228 (VCV51_030262)
 0.43 0.27 0.2 0.28 0.23 0.23 0.25 0.21 0.28 0.37 0.21 0.69 0.45 0.28 0.21 0.84 1.0 0.23 0.26 0.29 0.41 0.34 0.86
KNA50229 (MshI)
 0.37 0.23 0.15 0.27 0.28 0.26 0.29 0.24 0.26 0.3 0.21 0.54 0.37 0.23 0.21 0.85 1.0 0.23 0.27 0.26 0.31 0.29 0.63
KNA50230 (MshJ)
 0.53 0.28 0.27 0.42 0.25 0.28 0.3 0.23 0.31 0.34 0.25 0.66 0.39 0.31 0.33 0.85 1.0 0.27 0.3 0.33 0.41 0.35 0.74
KNA50231 (MshK)
 0.45 0.21 0.18 0.41 0.11 0.11 0.13 0.1 0.21 0.26 0.19 0.57 0.31 0.19 0.13 0.85 1.0 0.28 0.28 0.2 0.23 0.23 0.52
KNA50232 (MshL)
 0.65 0.31 0.22 0.55 0.27 0.28 0.32 0.24 0.51 0.45 0.31 0.61 0.52 0.32 0.23 0.82 1.0 0.3 0.31 0.55 0.6 0.55 0.65
KNA50233 (MshM)
 0.51 0.16 0.14 0.43 0.13 0.14 0.16 0.13 0.36 0.24 0.14 0.52 0.25 0.16 0.2 0.77 1.0 0.23 0.21 0.44 0.45 0.41 0.73
KNA50234 (MshN)
 0.54 0.21 0.21 0.47 0.26 0.27 0.29 0.24 0.57 0.33 0.24 0.59 0.34 0.23 0.31 0.86 1.0 0.43 0.39 0.54 0.6 0.57 0.59
KNA50235 (VCV51_030269)
 0.81 0.4 0.36 0.67 0.29 0.32 0.37 0.27 0.9 0.61 0.42 0.92 0.61 0.39 0.35 0.83 1.0 0.83 0.84 0.8 0.78 0.94 0.97
KNA50236 (MshG)
 0.6 0.22 0.33 0.54 0.21 0.21 0.22 0.18 0.56 0.28 0.19 0.47 0.3 0.21 0.22 0.82 1.0 0.36 0.35 0.6 0.56 0.58 0.61
KNA50237 (MshF)
 0.74 0.15 0.35 0.69 0.19 0.19 0.2 0.17 0.46 0.4 0.17 0.42 0.39 0.15 0.17 0.81 1.0 0.48 0.52 0.48 0.42 0.45 0.89
KNA50238 (VCV51_030272)
 0.51 0.22 0.2 0.46 0.17 0.19 0.22 0.15 0.62 0.38 0.23 0.33 0.32 0.24 0.12 0.66 0.75 0.47 0.4 0.59 0.46 0.59 1.0
KNA50240 (VCV51_033688)
 0.5 0.11 0.35 0.43 0.24 0.25 0.26 0.23 0.49 0.3 0.27 0.34 0.25 0.1 0.09 0.57 0.76 0.51 0.45 0.48 0.38 0.49 1.0
KNA50241 (VCV51_033689)
 0.36 0.13 0.16 0.33 0.08 0.09 0.1 0.09 0.3 0.11 0.19 0.39 0.12 0.12 0.08 0.77 1.0 0.26 0.24 0.26 0.19 0.28 0.74
KNA50242 (VCV51_030274)
 0.29 0.1 0.15 0.29 0.07 0.07 0.08 0.06 0.25 0.13 0.2 0.26 0.11 0.08 0.09 0.85 1.0 0.31 0.32 0.23 0.16 0.24 0.46
KNA50244 (MshQ)
 0.85 0.22 0.66 0.96 0.18 0.22 0.24 0.18 0.76 0.45 0.29 0.35 0.51 0.18 0.09 0.7 1.0 0.61 0.61 0.73 0.47 0.64 0.87
KNA50260 (VCV51_033694)
 0.45 0.32 0.16 0.25 0.3 0.34 0.32 0.26 0.53 0.35 0.35 0.48 0.35 0.28 0.26 0.92 1.0 0.53 0.52 0.61 0.75 0.64 0.57
KNA51812 (VCV51_030361)
 0.48 0.1 0.42 0.21 0.33 0.31 0.33 0.35 0.25 0.33 0.24 0.26 0.52 0.1 0.03 0.47 0.55 0.09 0.13 0.33 0.39 0.57 1.0
KNA51813 (VCV51_030362)
 0.56 0.07 0.39 0.2 0.32 0.32 0.34 0.31 0.32 0.45 0.22 0.3 0.7 0.06 0.03 0.83 1.0 0.1 0.14 0.39 0.4 0.75 0.77
KNA51814 (VCV51_030363)
 0.71 0.03 0.42 0.3 0.27 0.24 0.28 0.24 0.26 0.47 0.16 0.34 0.73 0.02 0.02 0.74 0.88 0.09 0.11 0.28 0.27 0.51 1.0
KNA51816 (VCV51_030365)
 0.14 0.25 0.09 0.11 0.12 0.11 0.13 0.11 0.12 0.23 0.18 0.27 0.28 0.31 0.03 0.81 1.0 0.59 0.53 0.1 0.12 0.12 0.47
KNA51826 (DegS)
 0.7 0.17 0.32 0.5 0.21 0.19 0.18 0.19 0.37 0.17 0.15 0.47 0.23 0.16 0.04 0.9 1.0 0.5 0.51 0.38 0.36 0.37 0.77
KNA51828 (VCV51_033516)
 0.5 0.24 0.12 0.27 0.32 0.37 0.38 0.29 0.68 0.29 0.31 0.43 0.44 0.2 0.27 0.91 1.0 0.33 0.33 0.65 0.62 0.73 0.5
KNA51838 (VCV51_033525)
 0.12 0.18 0.03 0.06 0.09 0.09 0.1 0.09 0.09 0.09 0.12 0.16 0.15 0.17 0.05 0.72 1.0 0.62 0.53 0.11 0.11 0.13 0.24
KNA51874 (VCV51_030404)
 0.47 0.21 0.2 0.2 0.1 0.12 0.13 0.09 0.32 0.25 0.22 0.47 0.37 0.19 0.14 0.99 1.0 0.08 0.1 0.35 0.24 0.57 0.51
KNA51879 (VCV51_030409)
 0.25 0.06 0.14 0.18 0.32 0.3 0.29 0.29 0.24 0.24 0.13 0.37 0.27 0.06 0.09 0.74 1.0 0.36 0.34 0.28 0.21 0.26 0.47
KNA51880 (VCV51_030410)
 0.38 0.06 0.23 0.28 0.36 0.31 0.32 0.32 0.29 0.24 0.12 0.4 0.27 0.06 0.06 0.8 1.0 0.47 0.41 0.34 0.28 0.32 0.48
KNA52420 (VCV51_033416)
 0.39 0.08 0.27 0.25 0.08 0.08 0.09 0.08 0.26 0.35 0.16 0.34 0.31 0.07 0.11 0.77 1.0 0.31 0.32 0.28 0.2 0.29 0.5
KNA52487 (VCV51_033399)
 0.26 0.31 0.14 0.17 0.24 0.28 0.29 0.23 0.27 0.57 0.3 0.59 0.74 0.32 0.33 0.72 0.89 0.15 0.18 0.31 0.24 0.28 1.0
KNA52489 (VCV51_033400)
 0.28 0.28 0.13 0.17 0.09 0.09 0.1 0.06 0.26 0.41 0.39 0.23 0.7 0.2 0.08 0.63 0.74 0.08 0.15 0.3 0.17 0.24 1.0
KNA52490 (RadC)
 0.14 0.11 0.06 0.07 0.04 0.05 0.05 0.05 0.13 0.19 0.17 0.17 0.22 0.09 0.04 0.88 1.0 0.05 0.06 0.2 0.09 0.19 0.26
KNA53375 (VCV51_033334)
 0.37 0.28 0.21 0.27 0.34 0.32 0.37 0.31 0.44 0.28 0.26 0.4 0.35 0.27 0.33 0.75 1.0 0.84 0.95 0.4 0.31 0.36 0.7
KNA53571 (VCV51_030052)
 0.24 0.02 0.25 0.23 0.02 0.02 0.02 0.02 0.15 0.2 0.03 0.09 0.25 0.03 0.02 0.72 1.0 0.02 0.02 0.18 0.11 0.15 0.19
KNA53575 (VCV51_030054)
 0.39 0.35 0.41 0.47 0.24 0.25 0.26 0.24 0.36 0.32 0.37 0.83 0.35 0.32 1.0 0.62 0.8 0.67 0.72 0.32 0.25 0.37 0.78
KNA53595 (VCV51_030073)
 0.24 0.12 0.16 0.16 0.18 0.17 0.18 0.15 0.17 0.25 0.16 0.37 0.32 0.13 0.18 0.84 1.0 0.19 0.2 0.18 0.19 0.21 0.63
KNA53596 (VCV51_033293)
 0.29 0.31 0.14 0.19 0.18 0.18 0.2 0.16 0.3 0.34 0.3 0.42 0.48 0.28 0.4 0.83 1.0 0.41 0.43 0.35 0.35 0.36 0.82
KNA53599 (VCV51_033294)
 0.4 0.15 0.25 0.33 0.34 0.34 0.34 0.33 0.35 0.4 0.37 0.64 0.38 0.14 0.54 0.83 1.0 0.79 0.83 0.35 0.32 0.4 0.83
KNA53605 (YsxC)
 0.44 0.22 0.19 0.37 0.33 0.31 0.3 0.32 0.38 0.23 0.3 0.36 0.23 0.22 0.36 0.82 1.0 0.25 0.28 0.37 0.3 0.31 0.74
KNA53606 (VCV51_030078)
 0.73 0.12 0.66 0.33 0.3 0.36 0.33 0.29 0.56 0.51 0.24 0.76 0.8 0.09 0.34 0.92 1.0 0.12 0.11 0.61 0.65 0.71 0.67
KNA53611 (VCV51_030082)
 0.35 0.09 0.21 0.23 0.1 0.11 0.12 0.09 0.25 0.35 0.2 0.39 0.37 0.07 0.15 0.85 1.0 0.14 0.16 0.24 0.19 0.29 0.43
KNA53613 (HemD)
 0.9 0.23 0.46 0.59 0.19 0.2 0.19 0.16 0.41 0.52 0.2 0.56 0.53 0.21 0.4 0.71 1.0 0.13 0.16 0.52 0.42 0.59 0.79
KNA53622 (VCV51_030093)
 0.21 0.18 0.09 0.11 0.19 0.23 0.27 0.15 0.18 0.38 0.16 0.53 0.54 0.14 0.23 0.96 1.0 0.29 0.35 0.19 0.11 0.21 0.51
KNA53623 (VCV51_033302)
 0.25 0.07 0.1 0.11 0.1 0.11 0.12 0.09 0.1 0.22 0.14 0.36 0.26 0.07 0.17 0.87 1.0 0.66 0.6 0.12 0.13 0.17 0.42
KNA53628 (VCV51_030098)
 0.24 0.15 0.07 0.11 0.18 0.18 0.18 0.16 0.21 0.3 0.3 0.37 0.52 0.13 0.17 0.84 1.0 0.12 0.15 0.22 0.15 0.26 0.31
KNA53634 (VCV51_033308)
 0.27 0.25 0.1 0.19 0.15 0.16 0.17 0.15 0.39 0.21 0.17 0.15 0.26 0.28 0.14 0.73 1.0 0.25 0.29 0.47 0.4 0.44 0.23
KNA53725 (CcoG)
 0.14 0.04 0.07 0.13 0.04 0.05 0.05 0.03 0.12 0.42 0.09 0.23 0.52 0.03 0.02 0.8 1.0 0.03 0.05 0.13 0.07 0.11 0.37
KNA53748 (RecF)
 0.5 0.43 0.47 0.3 0.29 0.31 0.33 0.28 0.49 0.38 0.38 0.59 0.4 0.41 0.7 0.85 1.0 0.25 0.28 0.54 0.57 0.54 0.82
KNA56839 (VCV51_030478)
 0.29 0.09 0.11 0.22 0.09 0.12 0.11 0.08 0.21 0.29 0.16 0.3 0.32 0.08 0.11 0.72 1.0 0.12 0.15 0.23 0.18 0.24 0.61
KNA56841 (VCV51_030480)
 0.6 0.22 0.28 0.46 0.28 0.27 0.27 0.25 0.57 0.33 0.18 0.53 0.31 0.21 0.31 0.89 1.0 0.65 0.68 0.58 0.55 0.67 0.81
KNA56842 (VCV51_030481)
 0.42 0.31 0.17 0.34 0.19 0.18 0.19 0.17 0.44 0.2 0.16 0.46 0.19 0.3 0.17 0.84 1.0 0.42 0.43 0.52 0.44 0.54 0.59
KNA56843 (VCV51_030482)
 0.37 0.41 0.19 0.28 0.33 0.37 0.38 0.35 0.46 0.46 0.34 0.52 0.43 0.36 0.5 0.9 1.0 0.81 0.86 0.52 0.43 0.55 0.38
KNA56844 (PhoU)
 0.3 0.08 0.13 0.23 0.26 0.39 0.33 0.27 0.25 0.6 0.14 0.29 0.48 0.07 0.11 0.86 1.0 0.24 0.27 0.28 0.29 0.32 0.33
KNA56878 (VCV51_030512)
 0.26 0.27 0.18 0.19 0.2 0.2 0.22 0.2 0.36 0.28 0.32 0.88 0.32 0.26 0.67 0.73 1.0 0.67 0.74 0.31 0.25 0.36 0.83
KNA56893 (VCV51_030528)
 0.4 0.28 0.21 0.21 0.43 0.45 0.46 0.37 0.59 0.46 0.39 0.6 0.38 0.28 0.37 0.95 1.0 0.31 0.32 0.51 0.51 0.65 0.93
KNA56921 (VCV51_032872)
 0.26 0.27 0.08 0.15 0.21 0.24 0.24 0.22 0.54 0.21 0.28 0.35 0.24 0.26 0.2 0.84 1.0 0.4 0.38 0.55 0.43 0.5 0.23
KNA56922 (VCV51_030549)
 0.46 0.31 0.1 0.36 0.34 0.41 0.43 0.34 0.57 0.46 0.38 0.35 0.44 0.31 0.21 0.87 1.0 0.44 0.44 0.58 0.5 0.57 0.46
KNA57444 (VCV51_032839)
 0.52 0.43 0.33 0.32 0.34 0.33 0.33 0.31 0.5 0.49 0.35 0.6 0.54 0.38 0.33 0.86 1.0 0.51 0.55 0.5 0.51 0.51 0.62
KNA57445 (VCV51_030442)
 0.36 0.17 0.18 0.23 0.14 0.16 0.16 0.14 0.39 0.37 0.22 0.52 0.42 0.15 0.26 0.85 1.0 0.34 0.39 0.4 0.36 0.42 0.5
KNA57462 (VCV51_032848)
 0.36 0.19 0.16 0.25 0.14 0.19 0.2 0.12 0.29 0.46 0.27 0.49 0.53 0.17 0.18 0.84 1.0 0.4 0.47 0.34 0.31 0.32 0.8
KNA57466 (VCV51_030452)
 0.37 0.26 0.2 0.22 0.29 0.29 0.3 0.25 0.39 0.32 0.23 0.34 0.44 0.2 0.46 0.84 1.0 0.07 0.08 0.43 0.32 0.5 0.37
KNA57479 (VCV51_030462)
 0.56 0.52 0.35 0.39 0.16 0.13 0.14 0.15 0.47 0.27 0.33 0.73 0.26 0.46 0.63 0.87 1.0 0.54 0.67 0.38 0.36 0.48 0.73
KNA57480 (VCV51_030463)
 0.51 0.43 0.33 0.36 0.14 0.13 0.14 0.13 0.36 0.31 0.23 0.82 0.25 0.39 0.61 0.98 1.0 0.47 0.58 0.33 0.28 0.39 0.77
KNA57725 (NlpI)
 0.37 0.21 0.17 0.26 0.14 0.14 0.14 0.14 0.41 0.17 0.39 0.38 0.19 0.21 0.21 0.89 1.0 0.28 0.31 0.44 0.38 0.44 0.55

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)