1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA46306 (VCV51_033910)
 0.2 0.02 0.14 0.17 0.05 0.08 0.06 0.03 0.08 0.16 0.04 0.35 0.08 0.01 0.03 0.04 0.07 0.06 0.06 0.08 0.06 0.07 1.0
KNA49098 (VCV51_030248)
 0.13 0.04 0.2 0.09 0.11 0.08 0.12 0.07 0.03 0.19 0.13 0.03 0.21 0.06 0.18 0.05 0.07 0.56 0.55 0.02 0.04 0.04 1.0
KNA49924 (VCV51_033752)
 0.05 0.0 0.19 0.04 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.06 0.01 0.14 0.04 0.0 0.15 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.04 1.0
KNA49928 (VCV51_033756)
 0.03 0.01 0.09 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.12 0.01 0.0 0.06 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.09 0.06 0.09 1.0
KNA50243 (MshP)
 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
KNA51542 (VCV51_033583)
 0.19 0.16 0.17 0.11 0.05 0.1 0.1 0.03 0.2 0.12 0.06 0.17 0.12 0.16 0.08 0.16 0.22 0.19 0.38 0.18 0.15 0.19 1.0
KNA52278 (VCV51_033444)
 0.07 0.01 0.07 0.07 0.04 0.04 0.04 0.03 0.12 0.12 0.02 0.24 0.1 0.01 0.01 0.11 0.14 0.03 0.04 0.17 0.47 0.13 1.0
KNA52466 (VCV51_033396)
 0.4 0.3 0.19 0.27 0.11 0.11 0.11 0.09 0.2 0.22 0.22 0.22 0.25 0.25 0.09 0.48 0.58 0.21 0.27 0.17 0.34 0.21 1.0
KNA52751 (VCV51_031532)
 0.04 0.06 0.04 0.04 0.06 0.04 0.05 0.05 0.06 0.02 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.04 0.04 0.13 0.13 0.05 0.05 0.09 1.0
KNA53376 (VCV51_033335)
 0.2 0.03 0.2 0.17 0.1 0.11 0.1 0.09 0.08 0.23 0.06 0.22 0.3 0.03 0.04 0.15 0.19 0.03 0.04 0.08 0.06 0.08 1.0
KNA53577 (VCV51_030056)
 0.08 0.03 0.04 0.08 0.04 0.04 0.04 0.05 0.09 0.04 0.04 0.07 0.02 0.03 0.02 0.09 0.12 0.02 0.02 0.09 0.08 0.07 1.0
KNA53750 (VCV51_033272)
 0.41 0.04 0.1 0.39 0.84 1.0 0.84 0.83 0.4 0.23 0.06 0.1 0.12 0.05 0.05 0.17 0.18 0.77 0.99 0.46 0.28 0.39 0.6
KNA53894 (VCV51_030823)
 0.17 0.06 0.04 0.1 0.29 0.26 0.31 0.3 0.14 0.13 0.13 0.16 0.12 0.04 0.04 0.17 0.13 0.4 0.52 0.15 0.14 0.19 1.0
KNA53895 (VCV51_030824)
 0.15 0.11 0.03 0.07 0.27 0.23 0.29 0.28 0.14 0.14 0.17 0.16 0.14 0.08 0.04 0.16 0.12 0.72 0.92 0.16 0.15 0.22 1.0
KNA53896 (VCV51_030825)
 0.16 0.1 0.04 0.08 0.6 0.52 0.62 0.63 0.16 0.14 0.11 0.13 0.12 0.07 0.1 0.21 0.15 0.55 0.64 0.15 0.19 0.22 1.0
KNA53897 (VCV51_033249)
 0.19 0.08 0.06 0.1 0.43 0.39 0.48 0.43 0.16 0.11 0.09 0.1 0.09 0.05 0.04 0.21 0.16 0.71 0.81 0.18 0.22 0.25 1.0
KNA53898 (VCV51_033250)
 0.04 0.03 0.02 0.03 0.14 0.12 0.15 0.14 0.02 0.05 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.06 0.05 0.73 1.0 0.02 0.02 0.02 0.7
KNA53899 (VCV51_030827)
 0.02 0.03 0.01 0.02 0.19 0.17 0.2 0.2 0.03 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.01 0.04 0.03 0.56 1.0 0.03 0.02 0.03 0.96
KNA54879 (VCV51_031811)
 0.04 0.03 0.02 0.03 0.03 0.04 0.04 0.03 0.04 0.05 0.03 0.08 0.05 0.02 0.04 0.04 0.06 0.06 0.06 0.04 0.06 0.04 1.0
KNA54945 (VCV51_031762)
 0.62 0.43 0.39 0.54 0.66 0.59 0.67 0.59 0.6 0.79 0.59 0.59 0.57 0.42 0.52 0.39 0.48 0.95 1.0 0.48 0.84 0.65 0.91
KNA55111 (VCV51_031830)
 0.52 0.21 0.22 0.59 0.27 0.3 0.32 0.26 0.57 0.59 0.4 0.63 0.35 0.18 0.2 0.42 0.54 1.0 0.98 0.48 0.4 0.54 0.58
KNA55260 (VCV51_033073)
 0.3 0.29 0.2 0.2 0.05 0.08 0.08 0.05 0.36 0.28 0.12 0.25 0.79 0.16 0.2 0.81 0.57 0.61 0.58 0.34 0.39 0.36 1.0
KNA55261 (VCV51_033074)
 0.2 0.19 0.14 0.12 0.03 0.04 0.04 0.03 0.19 0.1 0.06 0.12 0.35 0.12 0.12 0.52 0.38 0.3 0.27 0.16 0.18 0.17 1.0
KNA56906 (VCV51_030538)
 0.0 0.62 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.05 0.03 0.53 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0
KNA58240 (VCV51_032749)
 0.62 0.03 0.18 0.79 0.07 0.09 0.08 0.04 0.55 0.12 0.35 0.3 0.09 0.04 0.05 0.26 0.27 1.0 1.0 0.37 0.31 0.4 0.34
KNA59326 (VCV51_031349)
 0.22 0.04 0.16 0.13 0.03 0.03 0.04 0.02 0.38 0.09 0.05 0.2 0.14 0.03 0.01 0.17 0.17 0.13 0.14 0.38 0.26 0.37 1.0
KNA59806 (VCV51_032496)
 0.67 0.35 0.28 0.78 0.12 0.12 0.12 0.13 0.56 0.37 0.59 0.52 0.27 0.35 0.3 0.19 0.31 1.0 0.91 0.49 0.37 0.69 0.46
KNA59807 (VCV51_030866)
 0.51 0.83 0.23 0.56 0.29 0.29 0.28 0.29 0.8 0.47 0.56 0.67 0.49 0.84 0.36 0.23 0.45 1.0 1.0 0.58 0.44 0.6 0.63
KNA59808 (VCV51_030867)
 0.52 0.6 0.24 0.58 0.19 0.2 0.2 0.19 0.62 0.3 0.29 0.51 0.29 0.55 0.25 0.31 0.59 0.97 1.0 0.54 0.45 0.52 0.55
KNA59852 (VCV51_032263)
 0.1 0.05 0.02 0.08 0.11 0.11 0.15 0.11 0.09 0.05 0.06 0.21 0.05 0.05 0.07 0.04 0.06 0.06 0.07 0.09 0.08 0.09 1.0
KNA59882 (GlgX)
 0.2 0.09 0.07 0.17 0.1 0.14 0.11 0.07 0.26 0.25 0.1 0.31 0.23 0.07 0.07 0.19 0.33 0.65 0.65 0.22 0.23 0.24 1.0
KNA59883 (VCV51_032294)
 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0
KNA59884 (VCV51_032295)
 0.07 0.03 0.03 0.04 0.05 0.06 0.06 0.04 0.07 0.09 0.08 0.07 0.13 0.02 0.02 0.07 0.09 0.02 0.03 0.08 0.2 0.09 1.0
KNA59885 (VCV51_032296)
 0.36 0.25 0.18 0.16 0.15 0.13 0.15 0.13 0.29 0.12 0.14 0.29 0.15 0.23 0.16 0.17 0.24 0.24 0.26 0.27 0.6 0.42 1.0
KNA59904 (VCV51_032315)
 0.51 0.12 0.36 0.31 0.12 0.11 0.11 0.1 0.31 0.21 0.13 0.2 0.3 0.12 0.22 0.27 0.43 0.74 0.76 0.31 0.29 0.29 1.0
KNA59905 (AzlC)
 0.27 0.08 0.2 0.21 0.08 0.07 0.07 0.06 0.21 0.17 0.06 0.31 0.14 0.09 0.06 0.21 0.35 0.3 0.33 0.22 0.2 0.24 1.0
KNA59906 (VCV51_032317)
 0.27 0.09 0.16 0.2 0.13 0.13 0.12 0.11 0.28 0.29 0.05 0.27 0.26 0.1 0.08 0.15 0.26 0.73 0.82 0.24 0.21 0.27 1.0
KNA59944 (VCV51_032356)
 0.29 0.1 0.12 0.2 0.17 0.17 0.15 0.16 0.28 0.15 0.07 0.19 0.15 0.09 0.09 0.24 0.34 0.41 0.42 0.33 0.26 0.29 1.0
KNA59952 (VCV51_032364)
 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.04 0.02 0.03 0.08 0.01 0.08 0.01 0.01 0.1 0.12 0.01 0.01 0.01 1.0
KNA59953 (VCV51_032365)
 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.08 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 1.0
KNA59954 (VCV51_032366)
 0.04 0.03 0.01 0.02 0.03 0.04 0.04 0.02 0.03 0.02 0.08 0.03 0.1 0.02 0.01 0.01 0.02 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 1.0
KNA59955 (VCV51_032367)
 0.06 0.01 0.02 0.08 0.1 0.09 0.09 0.09 0.05 0.04 0.06 0.06 0.11 0.01 0.01 0.03 0.05 0.08 0.09 0.05 0.05 0.07 1.0
KNA60018 (VCV51_032430)
 0.05 0.02 0.01 0.04 0.03 0.03 0.03 0.02 0.06 0.05 0.05 0.05 0.21 0.02 0.02 0.04 0.06 0.16 0.2 0.05 0.03 0.04 1.0
KNA60575 (VCV51_032246)
 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 1.0
KNA60771 (VCV51_032033)
 0.17 0.11 0.14 0.16 0.01 0.02 0.02 0.01 0.11 0.24 0.11 0.25 0.18 0.08 0.04 0.25 0.35 0.04 0.09 0.15 0.14 0.12 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)