Heatmap: Cluster_35 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	0.02% arabinose,A1552	0.5mM indole,N16961	37C,C6706	arabinose-,A1552	E-exponential,5uM AI-2,C6706	E-exponential,5uM CAI-1,C6706	E-exponential,5uM DPO,C6706	E-exponential,Water,C6706	empty Tn	E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706	LB(2% NaCl),30C,N16961	LB,C7258	Log,0.2% L-arabinose,C6706	Methanol,N16961	O395	Polymyxin,C6706	Polymyxin,VC1639	riboflavin-,N16961	riboflavin+,N16961	TnqstR	TntfoY	TntoX-strep	Water,Rich,N16961
KNA47890 (VCV51_033872)	0.53	0.38	0.16	0.49	0.77	0.81	0.88	0.66	0.53	0.85	0.36	1.0	0.63	0.39	0.26	0.43	0.6	0.87	0.89	0.48	0.44	0.47	0.95
KNA50361 (VCV51_031434)	0.38	0.32	0.17	0.25	0.71	0.67	0.71	0.76	0.4	0.58	0.36	0.44	0.49	0.3	0.28	0.84	0.75	0.85	1.0	0.42	0.46	0.43	0.32
KNA51127 (RpoE)	0.17	0.21	0.06	0.14	0.08	0.08	0.09	0.08	0.63	0.11	0.27	0.35	0.24	0.21	0.1	0.77	0.5	1.0	0.84	0.6	0.49	0.46	0.24
KNA51129 (VCV51_031660)	0.29	0.31	0.11	0.26	0.14	0.15	0.17	0.14	0.66	0.19	0.34	0.65	0.37	0.32	0.21	1.0	0.65	0.71	0.72	0.59	0.48	0.5	0.4
KNA51130 (VCV51_033630)	0.12	0.09	0.11	0.11	0.13	0.13	0.14	0.13	0.17	0.14	0.17	0.44	0.28	0.11	0.16	1.0	0.53	0.38	0.37	0.17	0.13	0.14	0.33
KNA51165 (VCV51_031672)	0.34	0.1	0.12	0.23	0.89	0.92	1.0	0.87	0.36	0.53	0.3	0.42	0.64	0.08	0.09	0.58	0.32	0.66	0.63	0.29	0.29	0.39	0.28
KNA53013 (VCV51_033367)	0.52	0.38	0.19	0.44	0.77	0.77	0.87	0.78	0.64	0.71	0.44	0.83	0.56	0.37	0.32	0.74	0.69	0.94	1.0	0.53	0.41	0.41	0.79
KNA53582 (VCV51_030059)	0.55	0.36	0.33	0.49	0.88	0.98	1.0	0.76	0.7	0.79	0.63	0.79	0.8	0.42	0.36	0.71	0.84	0.82	0.94	0.6	0.52	0.62	0.78
KNA53931 (VCV51_030854)	0.55	0.15	0.15	0.41	0.26	0.23	0.22	0.23	0.8	0.23	0.15	0.29	0.32	0.15	0.08	0.95	1.0	0.78	0.74	0.64	0.7	0.74	0.5
KNA54634 (VCV51_033210)	0.23	0.49	0.1	0.17	0.41	0.46	0.44	0.45	0.72	0.28	0.41	0.41	0.34	0.6	0.21	0.66	0.58	1.0	0.91	0.49	0.48	0.48	0.38
KNA54654 (VCV51_033222)	0.37	0.41	0.24	0.27	0.21	0.16	0.18	0.15	0.89	0.2	0.22	0.25	0.18	0.5	0.2	1.0	0.95	0.65	0.64	0.72	0.67	0.74	0.95
KNA54687 (VCV51_030772)	0.58	0.07	0.09	0.29	0.94	0.94	1.0	0.79	0.48	0.29	0.19	0.32	0.62	0.08	0.1	0.85	0.66	0.8	0.92	0.44	0.39	0.48	0.48
KNA54688 (VCV51_030773)	0.7	0.08	0.15	0.42	0.98	0.84	1.0	0.86	0.47	0.34	0.19	0.54	0.48	0.08	0.12	0.52	0.45	0.76	0.75	0.5	0.43	0.53	0.44
KNA54689 (VCV51_030774)	0.67	0.08	0.14	0.39	1.0	0.72	0.94	0.8	0.67	0.21	0.22	0.53	0.35	0.09	0.15	0.53	0.41	0.84	0.85	0.73	0.62	0.7	0.35
KNA54791 (VCV51_033205)	0.57	0.53	0.22	0.42	0.43	0.47	0.51	0.39	0.8	0.61	0.34	0.85	0.55	0.46	0.28	0.97	0.84	0.88	0.86	0.78	0.79	0.85	1.0
KNA55092 (VCV51_031843)	0.33	0.4	0.26	0.26	0.68	0.69	0.71	0.58	0.33	0.63	0.49	1.0	0.47	0.51	0.41	0.24	0.32	0.41	0.48	0.35	0.38	0.37	0.56
KNA55220 (VCV51_033052)	0.26	0.23	0.06	0.2	0.51	0.54	0.57	0.48	0.67	0.32	0.2	0.36	0.35	0.26	0.16	1.0	0.91	0.75	0.77	0.67	0.48	0.56	0.46
KNA55221 (VCV51_033053)	0.53	0.16	0.22	0.38	0.51	0.5	0.5	0.47	0.59	0.47	0.42	0.39	0.46	0.22	0.2	0.85	0.83	0.92	1.0	0.6	0.53	0.65	0.34
KNA55685 (VCV51_030999)	0.56	0.36	0.25	0.41	0.73	0.66	0.67	0.74	0.63	0.35	0.26	0.45	0.4	0.38	0.39	1.0	0.92	0.84	0.91	0.63	0.55	0.6	0.66
KNA55994 (VCV51_030912)	0.58	0.26	0.24	0.22	0.75	0.75	0.78	0.82	0.74	0.44	0.36	0.81	0.45	0.23	0.55	0.73	0.62	0.72	0.73	0.73	0.8	1.0	0.67
KNA56001 (VCV51_030920)	0.54	0.14	0.09	0.39	0.42	0.4	0.42	0.4	0.77	0.33	0.32	0.35	0.53	0.11	0.15	1.0	0.98	0.8	0.87	0.62	0.69	0.81	0.64
KNA56007 (VCV51_030924)	0.31	0.12	0.22	0.24	1.0	0.88	0.84	0.97	0.31	0.45	0.27	0.36	0.53	0.13	0.06	0.25	0.21	0.31	0.37	0.25	0.27	0.29	1.0
KNA56008 (VCV51_030925)	0.57	0.16	0.43	0.58	0.94	0.86	0.89	0.88	0.57	0.68	0.35	0.56	0.69	0.16	0.15	0.79	0.62	0.68	0.75	0.5	0.49	0.56	1.0
KNA56154 (VCV51_030894)	0.47	0.33	0.31	0.34	0.5	0.55	0.5	0.47	0.38	0.41	0.37	0.59	0.33	0.33	0.42	1.0	0.87	0.87	0.88	0.39	0.41	0.38	0.78
KNA56155 (VCV51_032991)	0.4	0.57	0.12	0.24	0.45	0.48	0.46	0.38	0.52	0.39	0.38	0.57	0.3	0.55	0.29	1.0	0.88	0.55	0.64	0.64	0.67	0.63	0.21
KNA56171 (VCV51_030907)	0.21	0.1	0.26	0.15	0.2	0.25	0.25	0.19	0.31	0.39	0.16	0.39	0.59	0.1	0.14	0.89	0.78	0.95	1.0	0.42	0.32	0.27	0.36
KNA56282 (VCV51_030600)	0.36	0.86	0.17	0.26	0.59	0.64	0.7	0.6	0.5	0.78	0.63	1.0	0.8	0.89	0.78	0.92	0.82	0.98	0.9	0.46	0.39	0.51	0.7
KNA56289 (VCV51_030607)	0.35	0.35	0.1	0.18	0.28	0.32	0.32	0.28	0.53	0.4	0.35	1.0	0.39	0.35	0.67	0.64	0.53	0.55	0.61	0.48	0.45	0.63	0.59
KNA56411 (VCV51_032966)	0.36	0.28	0.1	0.22	0.33	0.56	0.33	0.22	0.41	1.0	0.93	0.81	0.27	0.29	0.22	0.57	0.46	0.69	0.8	0.37	0.37	0.46	0.86
KNA56412 (VCV51_030683)	0.25	0.36	0.05	0.15	0.28	0.5	0.29	0.19	0.38	0.74	1.0	0.73	0.25	0.35	0.24	0.5	0.39	0.61	0.69	0.3	0.3	0.41	0.89
KNA56417 (VCV51_032967)	0.47	0.13	0.27	0.3	0.59	0.57	0.61	0.55	0.67	0.52	0.46	0.91	0.54	0.16	0.64	0.67	0.59	0.87	1.0	0.56	0.55	0.59	0.44
KNA56876 (VCV51_030511)	0.64	0.43	0.33	0.5	0.78	0.77	0.78	0.7	0.95	0.52	0.71	0.37	0.56	0.43	0.44	0.94	0.97	0.77	0.86	1.0	0.66	0.84	0.83
KNA56925 (VCV51_032876)	0.65	0.24	0.25	0.46	0.46	0.39	0.43	0.34	0.53	0.42	0.28	0.64	0.54	0.25	0.37	0.8	0.73	0.92	1.0	0.56	0.47	0.51	0.44
KNA56927 (RadC)	0.74	0.08	0.2	0.54	0.13	0.2	0.19	0.13	0.97	0.26	0.15	0.44	0.18	0.09	0.22	1.0	0.69	0.52	0.56	0.77	0.8	0.78	0.82
KNA57123 (VCV51_032855)	0.43	0.34	0.12	0.25	0.74	0.59	0.47	0.68	0.94	0.37	0.57	0.15	0.4	0.41	0.31	0.24	0.28	0.75	0.86	0.87	1.0	0.94	0.19
KNA57442 (VCV51_030441)	0.25	0.17	0.1	0.19	0.88	0.88	0.9	1.0	0.81	0.26	0.48	0.32	0.37	0.17	0.21	0.5	0.47	0.94	0.99	0.63	0.56	0.63	0.62
KNA57476 (VCV51_030460)	0.28	0.55	0.08	0.16	0.97	0.98	1.0	1.0	0.73	0.31	0.65	0.42	0.31	0.52	0.45	0.74	0.74	0.67	0.75	0.55	0.6	0.68	0.62
KNA58529 (VCV51_031169)	0.16	0.13	0.05	0.13	0.02	0.02	0.02	0.02	0.52	0.25	0.12	0.19	0.04	0.14	0.03	0.87	0.66	0.99	1.0	0.39	0.32	0.37	0.22
KNA58596 (VCV51_031114)	0.39	0.27	0.21	0.22	0.49	0.51	0.5	0.45	0.42	0.59	0.97	0.85	0.53	0.25	0.22	0.74	0.63	0.86	1.0	0.39	0.32	0.49	0.54
KNA59417 (DsbB)	0.13	0.31	0.12	0.1	0.51	0.56	0.61	0.52	0.26	0.59	0.45	0.6	0.69	0.35	0.17	0.7	0.57	1.0	0.9	0.25	0.28	0.26	0.73
KNA59419 (FadR)	0.42	0.54	0.14	0.3	0.29	0.33	0.34	0.29	0.88	0.29	0.43	0.49	0.36	0.53	0.34	1.0	0.88	0.65	0.63	0.81	0.79	0.81	0.58
KNA59647 (VCV51_031369)	0.39	0.51	0.21	0.24	0.76	0.67	0.68	0.69	0.55	0.42	0.39	0.59	0.5	0.5	0.67	0.92	0.79	0.99	1.0	0.47	0.49	0.5	0.65
KNA59860 (VCV51_032271)	0.37	0.06	0.36	0.3	1.0	0.88	0.9	0.96	0.28	0.71	0.15	0.57	0.55	0.05	0.11	0.28	0.41	0.32	0.36	0.26	0.24	0.31	0.32
KNA59881 (VCV51_032292)	0.17	0.18	0.1	0.13	0.38	0.49	0.51	0.37	0.14	0.47	0.24	0.36	0.44	0.17	0.49	0.09	0.11	0.52	0.49	0.12	0.11	0.11	1.0
KNA59898 (VCV51_032309)	0.42	0.43	0.27	0.49	0.64	1.0	0.92	0.95	0.54	0.72	0.19	0.66	0.51	0.41	0.38	0.29	0.5	0.49	0.47	0.51	0.42	0.48	0.81
KNA59946 (VCV51_032358)	0.41	0.3	0.3	0.31	1.0	0.9	0.87	0.85	0.37	0.56	0.32	0.7	0.31	0.27	0.41	0.35	0.45	0.37	0.4	0.31	0.31	0.35	1.0
KNA59949 (VCV51_032361)	0.22	0.6	0.1	0.18	1.0	0.83	0.88	0.89	0.48	0.32	0.12	0.28	0.46	0.65	0.14	0.28	0.4	0.35	0.38	0.31	0.27	0.42	0.69
KNA60006 (VCV51_032418)	0.11	0.07	0.12	0.08	0.72	0.56	0.58	0.69	0.16	0.16	0.09	0.19	0.15	0.06	0.04	0.14	0.19	0.16	0.16	0.13	0.14	0.15	1.0
KNA60604 (VCV51_032193)	0.4	0.11	0.58	0.32	1.0	0.87	0.98	0.92	0.29	0.57	0.43	0.38	0.43	0.1	0.3	0.08	0.11	0.25	0.32	0.32	0.34	0.42	0.65
KNA60769 (VCV51_032031)	0.36	0.11	0.24	0.26	0.58	0.58	0.58	0.55	0.29	0.32	0.34	0.29	0.31	0.1	0.37	0.08	0.14	0.46	0.53	0.28	0.27	0.29	1.0
KNA60971 (VCV51_031946)	0.68	0.03	0.23	1.0	0.54	0.79	0.64	0.87	0.51	0.78	0.06	0.42	0.3	0.03	0.06	0.18	0.36	0.78	0.69	0.4	0.31	0.41	0.51
KNA60972 (VCV51_031947)	0.79	0.03	0.13	1.0	0.63	0.67	0.64	0.73	0.65	0.68	0.07	0.41	0.2	0.03	0.02	0.15	0.28	0.8	0.72	0.53	0.39	0.47	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)