1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_26 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA45866 (VCV51_033916)
 0.01 0.4 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.0 0.6 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
KNA45867 (VCV51_033917)
 0.01 0.25 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 1.0 0.01 0.4 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA47428 (VCV51_033892)
 0.0 0.03 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.05 0.04 0.07 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.4
KNA49522 (VCV51_033798)
 0.27 0.72 0.15 0.17 0.14 0.12 0.13 0.14 0.46 0.12 0.83 1.0 0.04 0.49 0.33 0.33 0.32 0.03 0.04 0.31 0.2 0.34 0.17
KNA49523 (VCV51_030322)
 0.18 0.64 0.29 0.09 0.21 0.18 0.19 0.18 0.22 0.21 1.0 0.62 0.13 0.52 0.42 0.27 0.2 0.09 0.14 0.2 0.13 0.24 0.15
KNA50262 (VCV51_030291)
 0.46 1.0 0.28 0.5 0.38 0.35 0.34 0.32 0.57 0.36 0.59 0.53 0.28 0.97 0.49 0.49 0.61 0.37 0.42 0.61 0.49 0.55 0.59
KNA51557 (VCV51_033600)
 0.21 0.05 0.12 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.39 0.07 1.0 0.29 0.05 0.02 0.29 0.48 0.08 0.12 0.3 0.26 0.35 0.24
KNA51567 (VCV51_033610)
 0.3 0.08 0.08 0.22 0.02 0.02 0.02 0.02 0.15 0.33 0.04 0.21 0.4 0.06 0.04 0.39 0.57 0.07 0.1 0.15 0.25 0.19 1.0
KNA51568 (VCV51_033611)
 0.31 0.12 0.07 0.18 0.01 0.02 0.02 0.01 0.17 0.62 0.08 0.22 0.71 0.08 0.05 0.36 0.58 0.1 0.13 0.18 0.35 0.24 1.0
KNA51853 (VCV51_030385)
 0.31 0.96 0.15 0.3 0.49 0.42 0.51 0.38 0.21 0.7 0.22 0.53 0.49 1.0 0.36 0.58 0.66 0.44 0.41 0.2 0.17 0.25 0.65
KNA51859 (VCV51_030391)
 0.09 0.9 0.09 0.06 0.38 0.15 0.15 0.33 0.13 0.11 0.12 0.06 0.24 1.0 0.05 0.15 0.16 0.1 0.18 0.13 0.11 0.14 0.47
KNA51860 (VCV51_033534)
 0.13 0.38 0.48 0.09 0.64 0.36 0.37 0.73 0.16 0.39 0.19 0.29 0.65 0.49 0.1 0.21 0.22 0.23 0.39 0.15 0.16 0.16 1.0
KNA51917 (VCV51_033507)
 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
KNA53011 (VCV51_031563)
 0.46 0.08 0.16 0.15 0.09 0.09 0.09 0.08 0.38 0.39 0.16 1.0 0.55 0.07 0.16 0.17 0.14 0.16 0.21 0.42 0.32 0.43 0.22
KNA54622 (VCV51_030722)
 0.22 0.01 0.01 0.24 0.01 0.0 0.01 0.0 0.39 0.01 0.01 1.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.3 0.4 0.39 0.03
KNA54623 (VCV51_030723)
 0.21 0.4 0.3 0.23 0.01 0.01 0.01 0.0 0.21 0.14 0.28 1.0 0.1 0.31 0.49 0.15 0.13 0.32 0.45 0.21 0.2 0.22 0.28
KNA54661 (VCV51_030750)
 0.34 0.3 0.19 0.31 0.16 0.22 0.2 0.14 0.37 0.34 0.18 1.0 0.27 0.22 0.62 0.49 0.38 0.67 0.68 0.33 0.53 0.37 0.38
KNA55657 (VCV51_030972)
 0.28 0.21 0.07 0.15 0.26 0.29 0.23 0.22 0.43 0.34 0.27 1.0 0.47 0.21 0.24 0.46 0.33 0.09 0.12 0.32 0.31 0.35 0.32
KNA56317 (VCV51_030641)
 0.18 0.09 0.05 0.13 0.06 0.07 0.06 0.04 0.37 0.09 0.46 1.0 0.1 0.08 0.02 0.71 0.83 0.07 0.06 0.24 0.28 0.4 0.14
KNA56899 (VCV51_032865)
 0.13 0.32 0.16 0.09 0.04 0.04 0.04 0.05 0.11 0.07 0.06 0.11 1.0 0.32 0.05 0.16 0.2 0.11 0.09 0.13 0.15 0.13 0.22
KNA56900 (VCV51_030533)
 0.16 0.14 0.04 0.09 0.03 0.03 0.03 0.02 0.11 0.06 0.04 0.05 1.0 0.13 0.03 0.22 0.25 0.14 0.12 0.11 0.08 0.12 0.57
KNA56901 (VCV51_030534)
 0.2 0.35 0.03 0.11 0.03 0.03 0.03 0.02 0.22 0.08 0.04 0.06 1.0 0.37 0.07 0.26 0.31 0.1 0.1 0.22 0.13 0.23 0.27
KNA56902 (VCV51_030535)
 0.01 0.32 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.3 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.06
KNA56903 (VCV51_030536)
 0.01 0.58 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 1.0 0.54 0.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.06
KNA56904 (VCV51_032866)
 0.0 1.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.64 0.89 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.07
KNA56905 (VCV51_030537)
 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17
KNA56907 (VCV51_030539)
 0.0 0.76 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 1.0 0.57 0.0 0.02 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.51
KNA56908 (VCV51_030540)
 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.75 0.92 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.3
KNA56909 (VCV51_030541)
 0.0 0.42 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 1.0 0.35 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.13
KNA56910 (VCV51_030542)
 0.0 0.62 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 1.0 0.67 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.25
KNA56911 (CitG)
 0.0 0.31 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 1.0 0.29 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.15
KNA56917 (VCV51_030547)
 0.3 0.3 0.16 0.17 0.32 0.35 0.36 0.33 0.35 0.42 0.39 0.96 0.36 0.3 0.48 0.67 0.78 0.49 0.56 0.32 1.0 0.38 0.49
KNA56918 (VCV51_032869)
 0.16 0.19 0.07 0.1 0.19 0.21 0.2 0.17 0.13 0.12 0.11 1.0 0.12 0.27 0.1 0.53 0.55 0.05 0.05 0.1 0.16 0.13 0.3
KNA56924 (VCV51_032874)
 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 1.0 0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.03 0.01
KNA56929 (VCV51_030552)
 0.27 0.25 0.07 0.25 0.13 0.12 0.12 0.14 0.38 0.1 0.09 1.0 0.11 0.47 0.07 0.41 0.42 0.31 0.27 0.33 0.27 0.3 0.23
KNA56930 (VCV51_030553)
 0.01 0.22 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.56 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
KNA56931 (VCV51_030555)
 0.05 0.15 0.02 0.03 0.04 0.05 0.04 0.04 0.05 0.02 0.05 1.0 0.02 0.26 0.03 0.16 0.19 0.02 0.02 0.04 0.06 0.05 0.11
KNA56932 (VCV51_030556)
 0.02 0.15 0.01 0.01 0.09 0.1 0.09 0.07 0.01 0.08 0.07 1.0 0.07 0.29 0.04 0.08 0.09 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.06
KNA56936 (TcpA)
 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.0 0.59 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
KNA56941 (VCV51_030564)
 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 1.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA56942 (VCV51_030565)
 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 1.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA56943 (VCV51_030567)
 0.0 0.49 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.56 0.01 1.0 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
KNA56944 (VCV51_030568)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
KNA56948 (AcfC)
 0.0 0.7 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.43 0.01 1.0 0.06 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02
KNA56949 (VCV51_030573)
 0.0 0.65 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.87 0.01 1.0 0.1 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
KNA56950 (VCV51_030574)
 0.01 0.77 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.65 0.01 1.0 0.1 0.03 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01
KNA56951 (AcfA)
 0.01 0.33 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.0 0.57 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
KNA56952 (AcfD)
 0.06 0.64 0.02 0.03 0.04 0.04 0.04 0.03 0.09 0.03 0.04 0.84 0.04 1.0 0.08 0.12 0.16 0.05 0.06 0.09 0.11 0.11 0.05
KNA58524 (VCV51_031173)
 0.32 1.0 0.08 0.24 0.24 0.22 0.22 0.2 0.41 0.22 0.16 0.35 0.19 0.8 0.22 0.6 0.52 0.26 0.28 0.42 0.32 0.39 0.42
KNA58525 (VCV51_031172)
 0.2 1.0 0.06 0.19 0.21 0.17 0.17 0.15 0.41 0.18 0.14 0.29 0.11 0.89 0.12 0.28 0.24 0.18 0.18 0.36 0.29 0.39 0.31
KNA58526 (VCV51_032721)
 0.33 1.0 0.12 0.26 0.23 0.25 0.27 0.22 0.41 0.46 0.26 0.31 0.43 0.88 0.26 0.38 0.37 0.39 0.45 0.35 0.38 0.42 0.45
KNA58580 (VCV51_031126)
 0.1 1.0 0.06 0.1 0.05 0.05 0.05 0.04 0.09 0.44 0.15 0.12 0.34 0.97 0.11 0.29 0.19 0.35 0.29 0.09 0.08 0.08 0.44
KNA58612 (VCV51_032741)
 0.13 0.01 0.0 0.14 0.01 0.01 0.01 0.01 0.12 0.01 0.03 1.0 0.0 0.02 0.12 0.06 0.04 0.01 0.01 0.12 0.22 0.15 0.01
KNA58613 (VCV51_031098)
 0.41 0.23 0.17 0.49 0.16 0.19 0.19 0.13 0.47 0.28 0.13 1.0 0.19 0.27 0.8 0.54 0.51 0.6 0.62 0.39 0.21 0.36 0.54
KNA58614 (VCV51_031097)
 0.28 0.15 0.14 0.34 0.09 0.12 0.12 0.08 0.39 0.25 0.1 0.83 0.15 0.15 1.0 0.51 0.5 0.62 0.72 0.32 0.18 0.29 0.3
KNA58615 (VCV51_031096)
 0.31 0.36 0.12 0.35 0.11 0.12 0.13 0.1 0.35 0.21 0.11 0.8 0.15 0.39 1.0 0.65 0.63 0.7 0.74 0.34 0.22 0.29 0.3
KNA59377 (VCV51_031313)
 0.05 0.05 0.04 0.05 0.03 0.03 0.03 0.02 0.1 0.06 0.04 1.0 0.04 0.05 0.02 0.11 0.1 0.1 0.11 0.1 0.28 0.09 0.11
KNA59378 (VCV51_031312)
 0.04 0.05 0.02 0.02 0.04 0.04 0.04 0.04 0.06 0.09 0.15 1.0 0.08 0.05 0.03 0.15 0.14 0.16 0.16 0.06 0.39 0.07 0.08
KNA60696 (VCV51_032135)
 0.02 0.01 0.01 0.02 0.05 0.05 0.04 0.05 0.01 0.02 0.05 1.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.22 0.01 0.0
KNA60714 (VCV51_032153)
 0.23 0.07 0.06 0.17 0.07 0.07 0.07 0.06 0.39 0.1 0.06 1.0 0.09 0.05 0.13 0.15 0.28 0.17 0.17 0.54 0.39 0.56 0.23
KNA60715 (VCV51_032154)
 0.11 0.04 0.03 0.08 0.05 0.06 0.06 0.05 0.25 0.1 0.04 1.0 0.07 0.03 0.04 0.07 0.1 0.14 0.17 0.3 0.26 0.35 0.08
KNA60716 (VCV51_032155)
 0.17 0.02 0.04 0.11 0.08 0.07 0.07 0.07 0.22 0.1 0.04 1.0 0.07 0.03 0.02 0.09 0.15 0.17 0.2 0.27 0.24 0.34 0.1
KNA60717 (VCV51_032156)
 0.33 0.03 0.09 0.17 0.1 0.08 0.08 0.08 0.66 0.07 0.03 1.0 0.07 0.03 0.01 0.1 0.16 0.12 0.14 0.85 0.59 0.93 0.23
KNA60747 (VCV51_032187)
 0.45 0.36 0.16 0.7 0.14 0.15 0.14 0.14 0.25 0.2 0.05 0.2 1.0 0.44 0.07 0.34 0.68 0.26 0.28 0.22 0.18 0.18 0.97
KNA60748 (VCV51_032188)
 0.04 0.63 0.01 0.03 0.07 0.07 0.06 0.07 0.06 0.04 0.05 0.04 0.3 1.0 0.04 0.13 0.2 0.13 0.12 0.05 0.07 0.05 0.43
KNA60764 (VCV51_032026)
 0.25 0.07 0.07 0.21 0.02 0.01 0.01 0.01 0.36 0.42 0.15 0.18 1.0 0.05 0.02 0.43 0.67 0.04 0.05 0.35 0.32 0.4 0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)