1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_15 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA44039 (VCV51_033980)
 0.59 0.11 0.18 0.52 0.21 0.35 0.27 0.15 1.0 0.51 0.12 0.36 0.5 0.08 0.01 0.52 0.77 0.24 0.21 0.98 0.55 0.92 0.77
KNA44741 (VCV51_033943)
 0.03 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.64 0.0 0.05 0.0 0.58 1.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.03 0.1
KNA47425 (VCV51_033889)
 0.03 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.64 0.0 0.05 0.0 0.58 1.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.03 0.1
KNA50141 (VCV51_033728)
 0.59 0.11 0.18 0.52 0.21 0.35 0.27 0.15 1.0 0.51 0.12 0.36 0.5 0.08 0.01 0.52 0.77 0.24 0.21 0.98 0.55 0.92 0.77
KNA50147 (VCV51_033734)
 0.41 0.1 0.18 0.27 0.22 0.29 0.24 0.17 0.56 0.55 0.18 0.49 0.58 0.1 0.12 0.41 0.52 0.08 0.09 0.57 0.36 0.59 1.0
KNA51522 (VCV51_033561)
 0.13 0.34 0.06 0.1 0.36 0.33 0.33 0.34 0.18 0.22 0.23 0.42 0.31 0.36 0.2 0.72 1.0 0.22 0.25 0.15 0.14 0.15 0.26
KNA51529 (VCV51_033569)
 0.96 0.25 0.31 0.51 0.37 0.37 0.35 0.34 0.64 0.61 0.21 0.54 0.52 0.22 0.23 0.64 1.0 0.51 0.56 0.65 0.54 0.73 0.73
KNA51538 (VCV51_033578)
 0.65 0.04 0.07 0.9 0.01 0.0 0.0 0.01 0.23 0.23 0.06 0.03 0.33 0.04 0.0 0.48 1.0 0.01 0.01 0.39 0.41 0.37 0.02
KNA51545 (VCV51_033587)
 0.65 0.09 0.18 0.3 0.15 0.23 0.23 0.15 0.52 0.55 0.21 0.65 0.74 0.08 0.08 0.47 0.51 0.18 0.23 0.56 0.45 0.54 1.0
KNA51558 (VCV51_033601)
 0.8 0.13 0.29 0.53 0.13 0.18 0.19 0.1 0.59 0.49 0.08 0.43 0.4 0.1 0.13 0.46 0.76 0.16 0.21 0.78 0.49 0.61 1.0
KNA52117 (VCV51_033486)
 0.5 0.13 0.25 0.4 0.15 0.25 0.19 0.12 0.98 0.19 0.14 0.35 0.2 0.14 0.09 0.51 0.82 0.32 0.3 0.87 0.72 1.0 0.78
KNA52287 (VCV51_033453)
 0.55 0.32 0.11 0.49 0.5 0.56 0.51 0.47 0.46 0.6 0.38 0.7 0.48 0.29 0.26 0.69 1.0 0.58 0.6 0.45 0.41 0.43 0.73
KNA59749 (VCV51_032444)
 0.37 0.22 0.25 0.3 0.23 0.22 0.25 0.23 0.44 0.33 0.39 0.91 0.31 0.2 0.27 0.56 1.0 0.36 0.43 0.44 0.43 0.45 0.54
KNA59750 (VCV51_032445)
 0.64 0.47 0.4 0.59 0.21 0.21 0.23 0.18 0.46 0.36 0.39 1.0 0.34 0.39 0.26 0.64 0.92 0.41 0.45 0.44 0.42 0.46 0.76
KNA59755 (VCV51_032450)
 0.52 0.32 0.27 0.54 0.22 0.3 0.28 0.18 0.64 0.65 0.39 1.0 0.51 0.33 0.25 0.59 0.92 0.27 0.29 0.51 0.47 0.58 0.47
KNA59768 (VCV51_032463)
 0.33 1.0 0.27 0.23 0.27 0.27 0.26 0.26 0.24 0.6 0.32 0.8 0.67 0.91 0.48 0.44 0.62 0.22 0.3 0.28 0.19 0.26 0.39
KNA59769 (VCV51_032464)
 0.31 1.0 0.19 0.25 0.19 0.19 0.2 0.18 0.24 0.56 0.22 0.58 0.54 0.89 0.39 0.57 0.85 0.18 0.2 0.27 0.2 0.26 0.35
KNA59786 (VCV51_032481)
 0.31 0.17 0.05 0.19 0.19 0.24 0.24 0.21 0.45 0.57 0.16 0.56 0.29 0.19 0.06 0.48 1.0 0.49 0.6 0.38 0.36 0.39 0.32
KNA59818 (VCV51_032500)
 0.87 0.56 0.55 0.56 0.25 0.29 0.28 0.25 0.81 0.65 0.68 0.95 0.85 0.52 0.26 0.66 0.96 0.65 0.78 0.73 0.81 0.95 1.0
KNA59833 (LuxQ)
 0.71 0.22 0.25 0.74 0.15 0.15 0.15 0.14 0.47 0.31 0.13 0.53 0.22 0.2 0.2 0.59 1.0 0.31 0.33 0.51 0.38 0.53 0.78
KNA59888 (VCV51_032299)
 0.37 0.36 0.14 0.47 0.42 0.46 0.45 0.44 0.56 0.63 0.14 0.59 0.61 0.34 0.31 0.64 1.0 0.29 0.31 0.48 0.36 0.44 0.57
KNA59919 (VCV51_032330)
 0.46 0.25 0.15 0.38 0.24 0.31 0.31 0.24 0.47 0.53 0.15 0.64 0.83 0.23 0.15 0.59 0.95 0.57 0.63 0.61 0.48 0.55 1.0
KNA59932 (VCV51_032343)
 0.75 0.24 0.28 0.79 0.27 0.27 0.27 0.24 0.85 0.24 0.09 0.23 0.24 0.26 0.3 0.49 0.69 0.28 0.29 0.83 0.77 0.71 1.0
KNA59959 (VCV51_032371)
 0.55 0.04 0.15 0.67 0.05 0.06 0.06 0.05 0.43 0.12 0.03 0.19 0.2 0.05 0.04 0.25 0.42 0.24 0.23 0.46 0.34 0.42 1.0
KNA60539 (VCV51_032210)
 0.39 0.09 0.25 0.46 0.05 0.06 0.05 0.05 0.55 0.27 0.16 0.33 0.12 0.13 0.39 0.49 1.0 0.29 0.22 0.41 0.36 0.44 0.34
KNA60551 (VCV51_032222)
 0.75 0.12 0.5 0.66 0.17 0.2 0.23 0.15 0.66 0.59 0.18 0.91 0.55 0.1 0.13 0.63 1.0 0.29 0.31 0.69 0.38 0.59 0.96
KNA60571 (VCV51_032242)
 0.51 0.26 0.14 0.38 0.4 0.44 0.45 0.38 0.96 0.57 0.19 0.73 0.67 0.25 0.11 0.62 0.95 0.78 0.77 0.84 0.8 0.91 1.0
KNA60572 (VCV51_032243)
 0.66 0.3 0.17 0.58 0.26 0.24 0.27 0.23 0.76 0.28 0.13 0.47 0.37 0.29 0.18 0.5 1.0 0.6 0.57 0.78 0.72 0.83 0.7
KNA60576 (VCV51_032247)
 0.63 0.31 0.16 0.35 0.34 0.35 0.35 0.32 0.39 0.48 0.13 0.62 0.69 0.28 0.25 0.72 1.0 0.38 0.44 0.41 0.36 0.5 0.87
KNA60577 (VCV51_032248)
 0.91 0.26 0.18 0.52 0.33 0.31 0.29 0.32 0.74 0.39 0.13 0.46 0.55 0.26 0.19 0.59 0.83 0.17 0.2 0.72 0.71 0.87 1.0
KNA60583 (VCV51_032254)
 0.11 0.11 0.09 0.09 0.02 0.03 0.03 0.02 0.17 0.29 0.21 0.31 0.57 0.08 0.08 0.63 0.92 0.06 0.11 0.11 0.24 0.17 1.0
KNA60650 (VCV51_032089)
 0.49 0.12 0.23 0.44 0.2 0.21 0.23 0.18 0.43 0.62 0.21 0.61 0.78 0.09 0.19 0.55 1.0 0.51 0.56 0.41 0.34 0.43 0.52
KNA60651 (VCV51_032090)
 0.49 0.1 0.24 0.35 0.07 0.1 0.09 0.07 0.43 0.24 0.13 0.33 0.29 0.08 0.14 0.47 0.74 0.16 0.2 0.54 0.38 0.5 1.0
KNA60658 (PnuC)
 0.33 0.19 0.16 0.21 0.29 0.33 0.34 0.29 0.38 0.62 0.27 0.38 0.58 0.16 0.17 0.69 1.0 0.17 0.19 0.42 0.29 0.35 0.57
KNA60659 (VCV51_032098)
 0.41 0.25 0.14 0.3 0.13 0.13 0.14 0.12 0.45 0.67 0.41 0.78 0.91 0.22 0.25 0.46 0.83 0.35 0.51 0.49 0.31 0.48 1.0
KNA60725 (VCV51_032164)
 0.44 0.1 0.64 0.5 0.25 0.26 0.23 0.22 0.3 0.19 0.12 0.23 0.28 0.06 0.04 0.7 1.0 0.17 0.18 0.34 0.55 0.36 0.5
KNA60732 (VCV51_032172)
 0.47 0.18 0.35 0.27 0.2 0.22 0.23 0.2 0.37 0.36 0.16 0.44 0.51 0.14 0.17 0.68 1.0 0.34 0.37 0.39 0.39 0.53 0.59
KNA60780 (VCV51_032042)
 0.62 0.37 0.4 0.36 0.35 0.36 0.37 0.33 0.77 0.53 0.61 1.0 0.55 0.35 0.35 0.67 0.94 0.55 0.61 0.69 0.61 0.78 0.99
KNA60800 (VCV51_032062)
 0.2 0.77 0.04 0.15 0.25 0.29 0.33 0.23 0.23 0.83 0.32 0.6 1.0 0.9 0.08 0.6 0.82 0.52 0.54 0.23 0.15 0.25 0.75
KNA60807 (VCV51_032069)
 0.6 0.2 0.19 0.26 0.28 0.29 0.29 0.28 0.56 0.35 0.13 0.68 0.35 0.19 0.26 0.59 1.0 0.17 0.17 0.55 0.37 0.68 0.37
KNA60808 (VCV51_032070)
 0.32 0.02 0.19 0.12 0.05 0.09 0.07 0.06 0.1 0.09 0.04 0.39 0.33 0.02 0.07 0.4 1.0 0.0 0.01 0.06 0.07 0.09 0.08
KNA60809 (VCV51_032071)
 0.1 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.38 1.0 0.0 0.0 0.42 0.87 0.0 0.0 0.08 0.04 0.06 0.0
KNA60810 (VCV51_032072)
 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.01 0.12 1.0 0.0 0.0 0.48 0.95 0.01 0.01 0.04 0.02 0.03 0.01
KNA60812 (VCV51_032076)
 0.89 0.02 0.25 1.0 0.03 0.03 0.03 0.02 0.65 0.7 0.02 0.88 0.27 0.02 0.01 0.45 0.93 0.23 0.23 0.65 0.43 0.76 0.6
KNA60813 (VCV51_032077)
 0.75 0.01 0.16 1.0 0.03 0.05 0.05 0.03 0.56 0.52 0.01 0.65 0.2 0.01 0.01 0.34 0.68 0.14 0.12 0.53 0.35 0.6 0.56
KNA60814 (VCV51_032078)
 0.8 0.01 0.14 1.0 0.03 0.06 0.06 0.03 0.39 0.46 0.01 0.58 0.18 0.02 0.01 0.31 0.71 0.15 0.13 0.38 0.29 0.46 0.33
KNA60815 (VCV51_032079)
 0.69 0.03 0.13 1.0 0.04 0.06 0.05 0.04 0.39 0.57 0.02 0.49 0.22 0.03 0.02 0.36 0.8 0.21 0.2 0.41 0.28 0.46 0.61
KNA60907 (VCV51_031881)
 0.98 0.09 0.3 0.84 0.06 0.09 0.09 0.05 0.63 0.63 0.1 0.81 0.66 0.07 0.06 0.6 1.0 0.14 0.17 0.82 0.67 0.7 0.77
KNA60927 (VCV51_031901)
 0.62 0.14 0.21 0.46 0.16 0.16 0.17 0.13 0.59 0.43 0.19 0.45 0.37 0.12 0.26 0.35 0.59 0.51 0.48 0.58 0.64 0.61 1.0
KNA60939 (VCV51_031914)
 0.41 0.03 0.1 0.26 0.01 0.01 0.01 0.01 0.19 0.3 0.1 0.6 0.49 0.02 0.04 0.57 0.91 0.28 0.29 0.24 0.17 0.25 1.0
KNA60945 (MoeB)
 0.68 0.31 0.35 0.48 0.28 0.3 0.3 0.23 0.42 1.0 0.5 0.67 0.69 0.26 0.46 0.52 0.8 0.58 0.71 0.44 0.45 0.53 0.55
KNA60947 (VCV51_031922)
 0.72 0.2 0.38 0.61 0.07 0.09 0.08 0.07 0.46 0.46 0.37 0.75 0.51 0.18 0.23 0.63 1.0 0.42 0.46 0.52 0.67 0.5 0.97
KNA60954 (VCV51_031929)
 0.37 0.06 0.13 0.29 0.26 0.22 0.25 0.23 0.26 0.43 0.16 0.81 0.79 0.05 0.06 0.72 1.0 0.32 0.35 0.25 0.21 0.24 0.8
KNA61000 (UhpB)
 0.5 0.06 0.2 0.35 0.1 0.12 0.12 0.09 0.51 0.37 0.16 0.34 0.42 0.04 0.05 0.58 1.0 0.1 0.11 0.59 0.3 0.5 0.54
KNA61017 (VCV51_031992)
 0.22 0.06 0.1 0.18 0.03 0.04 0.04 0.03 0.18 0.46 0.11 0.34 0.79 0.04 0.03 0.55 1.0 0.09 0.15 0.21 0.33 0.17 0.63
KNA61018 (VCV51_031993)
 0.41 0.2 0.15 0.27 0.35 0.34 0.35 0.25 0.47 0.33 0.26 0.82 0.42 0.17 0.13 0.53 0.82 0.38 0.33 0.46 0.41 0.5 1.0
KNA61024 (TorS)
 0.63 0.22 0.37 0.41 0.33 0.35 0.32 0.31 0.58 0.4 0.26 0.58 0.43 0.19 0.29 0.63 1.0 0.55 0.63 0.61 0.54 0.71 0.66
KNA61036 (VCV51_032011)
 0.46 0.27 0.34 0.39 0.32 0.32 0.36 0.33 0.53 0.78 0.27 0.97 0.67 0.22 0.34 0.75 1.0 0.89 0.94 0.5 0.58 0.54 0.75
KNA61037 (VCV51_032012)
 0.63 0.26 0.25 0.54 0.27 0.23 0.24 0.23 0.52 0.53 0.22 1.0 0.41 0.25 0.23 0.63 0.98 0.35 0.39 0.6 0.7 0.59 0.75
KNA61038 (VCV51_032013)
 0.62 0.25 0.65 0.58 0.45 0.41 0.44 0.35 0.46 0.95 0.23 0.87 0.77 0.24 0.49 0.58 1.0 0.69 0.77 0.44 0.61 0.5 0.83

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)