Heatmap: Cluster_28 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	0.02% arabinose,A1552	0.5mM indole,N16961	37C,C6706	arabinose-,A1552	E-exponential,5uM AI-2,C6706	E-exponential,5uM CAI-1,C6706	E-exponential,5uM DPO,C6706	E-exponential,Water,C6706	empty Tn	E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706	LB(2% NaCl),30C,N16961	LB,C7258	Log,0.2% L-arabinose,C6706	Methanol,N16961	O395	Polymyxin,C6706	Polymyxin,VC1639	riboflavin-,N16961	riboflavin+,N16961	TnqstR	TntfoY	TntoX-strep	Water,Rich,N16961
KNA49057 (VCV51_033832)	0.03	0.01	0.12	0.03	1.0	0.71	0.72	0.8	0.01	0.03	0.05	0.05	0.01	0.02	0.42	0.02	0.02	0.3	0.08	0.02	0.02	0.02	0.04
KNA49222 (VCV51_030342)	0.17	0.34	0.19	0.11	0.79	0.91	1.0	0.76	0.18	0.45	0.32	0.48	0.43	0.33	0.32	0.53	0.59	0.61	0.66	0.17	0.21	0.22	0.37
KNA49510 (VCV51_033795)	0.08	0.37	0.04	0.06	0.84	1.0	0.94	0.9	0.1	0.26	0.23	0.43	0.21	0.35	0.86	0.23	0.26	0.14	0.14	0.09	0.08	0.09	0.17
KNA49524 (VCV51_030323)	0.05	0.06	0.03	0.05	0.73	0.88	1.0	0.55	0.06	0.26	0.07	0.17	0.26	0.06	0.07	0.27	0.26	0.24	0.36	0.06	0.05	0.06	0.19
KNA50221 (VCV51_030256)	0.11	0.27	0.04	0.07	0.95	0.82	0.9	1.0	0.2	0.08	0.23	0.11	0.11	0.26	0.08	0.18	0.17	0.37	0.4	0.14	0.12	0.16	0.18
KNA51124 (YgfZ)	0.19	0.31	0.17	0.14	1.0	0.91	0.92	0.96	0.28	0.41	0.37	0.47	0.34	0.27	0.49	0.42	0.25	0.3	0.33	0.23	0.25	0.25	0.47
KNA51156 (VCV51_031679)	0.42	0.12	0.1	0.28	0.9	1.0	0.99	0.99	0.21	0.47	0.2	0.37	0.39	0.12	0.11	0.66	0.35	0.82	0.8	0.25	0.32	0.3	0.21
KNA51158 (VCV51_031677)	0.23	0.13	0.06	0.12	0.96	0.93	0.96	1.0	0.11	0.66	0.24	0.63	0.5	0.14	0.12	0.48	0.24	0.53	0.66	0.11	0.14	0.15	0.15
KNA51159 (VCV51_031676)	0.12	0.09	0.03	0.06	0.92	0.91	0.93	1.0	0.15	0.27	0.11	0.18	0.21	0.11	0.1	0.23	0.11	0.36	0.52	0.12	0.15	0.18	0.1
KNA51166 (VCV51_033620)	0.35	0.07	0.18	0.24	1.0	0.85	0.99	0.88	0.26	0.31	0.2	0.28	0.41	0.06	0.09	0.44	0.28	0.57	0.47	0.27	0.27	0.29	0.23
KNA51673 (VCV51_033552)	0.06	0.03	0.11	0.04	0.8	0.82	0.83	1.0	0.03	0.16	0.06	0.05	0.26	0.03	0.02	0.13	0.12	0.18	0.15	0.03	0.04	0.03	0.33
KNA51843 (VCV51_030379)	0.11	0.21	0.05	0.08	1.0	0.88	0.87	0.98	0.09	0.31	0.33	0.36	0.24	0.2	0.39	0.31	0.35	0.2	0.23	0.08	0.07	0.09	0.63
KNA51862 (VCV51_030392)	0.2	0.62	0.15	0.16	0.92	0.86	1.0	0.87	0.21	0.37	0.59	0.97	0.24	0.64	0.34	0.54	0.56	0.49	0.54	0.2	0.17	0.21	0.68
KNA52285 (VCV51_033451)	0.04	0.01	0.1	0.05	0.54	0.59	0.78	1.0	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.04	0.03	0.03	0.07
KNA52286 (VCV51_033452)	0.11	0.11	0.18	0.1	0.66	0.75	0.9	1.0	0.18	0.09	0.1	0.11	0.18	0.09	0.08	0.11	0.17	0.14	0.09	0.17	0.16	0.15	0.44
KNA52696 (VCV51_033384)	0.14	0.19	0.11	0.08	1.0	0.8	0.89	0.95	0.13	0.28	0.25	0.17	0.35	0.17	0.18	0.35	0.27	0.07	0.08	0.12	0.12	0.13	0.21
KNA53034 (VCV51_031595)	0.08	0.02	0.06	0.06	0.94	0.94	1.0	1.0	0.04	0.1	0.14	0.09	0.09	0.03	0.06	0.08	0.04	0.51	0.49	0.04	0.04	0.05	0.14
KNA53035 (VCV51_031594)	0.05	0.04	0.04	0.03	0.96	0.94	1.0	0.98	0.04	0.08	0.21	0.09	0.08	0.05	0.03	0.06	0.03	0.38	0.5	0.03	0.03	0.04	0.11
KNA53296 (VCV51_033348)	0.18	0.26	0.24	0.11	0.87	0.93	1.0	0.96	0.19	0.4	0.84	0.97	0.47	0.23	0.43	0.43	0.25	0.28	0.41	0.15	0.14	0.21	0.55
KNA53297 (VCV51_031606)	0.2	0.14	0.39	0.16	0.88	0.9	0.96	1.0	0.12	0.49	0.61	0.66	0.51	0.12	0.65	0.37	0.19	0.37	0.53	0.13	0.14	0.17	0.4
KNA53576 (VCV51_033291)	0.1	0.07	0.11	0.12	0.73	0.67	0.75	0.72	0.11	0.09	0.19	0.14	0.08	0.09	1.0	0.11	0.11	0.2	0.14	0.1	0.08	0.12	0.17
KNA53757 (VCV51_033274)	0.12	0.32	0.13	0.1	0.97	1.0	0.94	0.98	0.15	0.36	0.33	0.29	0.42	0.26	0.16	0.34	0.38	0.13	0.16	0.12	0.12	0.13	0.24
KNA53766 (VCV51_030017)	0.2	0.19	0.1	0.04	1.0	0.84	0.87	0.89	0.05	0.17	0.12	0.32	0.13	0.17	0.34	0.15	0.15	0.09	0.1	0.42	0.05	0.24	0.15
KNA53885 (VCV51_030819)	0.14	0.24	0.07	0.09	1.0	0.83	0.94	0.94	0.19	0.55	0.44	0.32	0.5	0.23	0.18	0.5	0.4	0.47	0.54	0.15	0.15	0.19	0.42
KNA53919 (VCV51_030843)	0.35	0.24	0.19	0.24	0.94	0.99	1.0	0.93	0.28	0.6	0.53	0.48	0.74	0.26	0.23	0.64	0.48	0.62	0.73	0.26	0.24	0.32	0.34
KNA54629 (VCV51_030729)	0.1	0.13	0.2	0.06	1.0	0.93	0.9	0.98	0.11	0.13	0.62	0.31	0.1	0.11	0.46	0.27	0.2	0.44	0.28	0.1	0.11	0.11	0.37
KNA54662 (VCV51_030751)	0.17	0.36	0.06	0.16	0.92	0.85	0.87	0.87	0.33	0.35	0.67	1.0	0.21	0.41	0.34	0.3	0.24	0.15	0.14	0.26	0.2	0.28	0.39
KNA54894 (VCV51_031799)	0.1	0.1	0.06	0.07	0.78	0.82	0.69	1.0	0.07	0.29	0.16	0.22	0.28	0.09	0.12	0.21	0.24	0.39	0.42	0.07	0.08	0.08	0.15
KNA54895 (VCV51_031798)	0.13	0.13	0.08	0.08	0.8	0.85	0.72	1.0	0.1	0.39	0.22	0.38	0.37	0.14	0.16	0.11	0.13	0.29	0.36	0.09	0.09	0.12	0.14
KNA54896 (VCV51_033128)	0.17	0.41	0.16	0.1	1.0	0.86	0.84	0.85	0.14	0.27	0.43	0.34	0.29	0.37	0.2	0.17	0.21	0.06	0.06	0.16	0.14	0.13	0.33
KNA54898 (VCV51_031796)	0.05	0.27	0.27	0.04	0.97	0.84	0.85	1.0	0.03	0.36	0.26	0.29	0.36	0.28	0.46	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.03	0.33
KNA55025 (VCV51_031715)	0.06	0.04	0.03	0.05	1.0	0.87	0.91	1.0	0.05	0.06	0.07	0.11	0.08	0.04	0.15	0.07	0.05	0.48	0.52	0.04	0.03	0.05	0.4
KNA55026 (VCV51_031714)	0.12	0.15	0.13	0.12	1.0	0.84	0.96	0.88	0.09	0.24	0.2	0.28	0.13	0.16	0.48	0.25	0.2	0.54	0.66	0.1	0.09	0.1	0.63
KNA55027 (VCV51_031713)	0.11	0.31	0.09	0.08	0.87	0.83	1.0	0.91	0.09	0.28	0.38	0.58	0.22	0.28	0.63	0.43	0.29	0.49	0.65	0.1	0.08	0.09	0.76
KNA55089 (VCV51_031845)	0.09	0.43	0.09	0.06	0.88	0.95	1.0	1.0	0.17	0.36	0.4	0.35	0.46	0.46	0.11	0.2	0.21	0.33	0.36	0.15	0.17	0.16	0.65
KNA55126 (VCV51_031817)	0.23	0.53	0.18	0.29	1.0	0.97	0.92	1.0	0.27	0.52	0.44	0.71	0.33	0.5	0.38	0.17	0.25	0.3	0.3	0.23	0.19	0.21	0.77
KNA55127 (VCV51_031816)	0.01	0.12	0.02	0.01	0.91	0.91	1.0	0.95	0.03	0.14	0.73	0.33	0.18	0.12	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.02	0.14
KNA55237 (VCV51_031082)	0.13	0.1	0.07	0.13	1.0	0.7	0.94	0.81	0.3	0.14	0.43	0.37	0.08	0.1	0.74	0.28	0.25	0.37	0.21	0.33	0.26	0.34	0.07
KNA55848 (VCV51_030946)	0.19	0.38	0.19	0.18	1.0	0.88	0.92	0.93	0.09	0.26	0.54	0.33	0.21	0.4	0.74	0.1	0.07	0.17	0.16	0.09	0.09	0.1	0.26
KNA55998 (VCV51_033001)	0.06	0.08	0.09	0.04	1.0	0.8	0.93	0.96	0.08	0.21	0.57	0.57	0.1	0.08	0.58	0.29	0.22	0.23	0.12	0.08	0.07	0.1	0.09
KNA55999 (VCV51_030918)	0.09	0.05	0.23	0.07	1.0	0.76	0.9	0.87	0.1	0.25	0.63	0.99	0.11	0.06	0.87	0.55	0.41	0.38	0.19	0.14	0.11	0.15	0.15
KNA56000 (VCV51_030919)	0.2	0.08	0.2	0.17	0.93	0.74	0.89	0.82	0.29	0.3	0.64	1.0	0.12	0.07	0.98	0.62	0.46	0.62	0.36	0.4	0.27	0.46	0.22
KNA56025 (VCV51_030941)	0.18	0.26	0.07	0.07	1.0	0.87	0.96	0.97	0.17	0.3	0.43	0.25	0.36	0.27	0.18	0.24	0.17	0.52	0.61	0.13	0.15	0.24	0.31
KNA56883 (VCV51_030518)	0.03	0.09	0.02	0.02	1.0	0.86	0.92	0.7	0.05	0.05	0.66	0.23	0.04	0.1	0.86	0.1	0.07	0.15	0.08	0.05	0.04	0.06	0.11
KNA56914 (VCV51_032868)	0.25	0.53	0.17	0.31	0.98	0.83	1.0	0.8	0.27	0.45	0.18	0.6	0.32	0.42	0.93	0.3	0.34	0.26	0.27	0.23	0.2	0.24	0.41
KNA57472 (VCV51_030457)	0.2	0.15	0.19	0.15	1.0	0.95	0.98	0.86	0.25	0.32	0.14	0.26	0.29	0.1	0.21	0.53	0.67	0.51	0.58	0.27	0.26	0.27	0.41
KNA57622 (VCV51_030435)	0.07	0.18	0.03	0.06	1.0	0.61	0.67	0.95	0.08	0.13	0.26	0.35	0.18	0.25	0.25	0.19	0.19	0.22	0.27	0.07	0.07	0.1	0.14
KNA58534 (VCV51_031165)	0.08	0.3	0.26	0.07	0.99	0.88	0.86	1.0	0.2	0.24	0.31	0.16	0.2	0.32	0.28	0.11	0.1	0.02	0.02	0.24	0.17	0.2	0.49
KNA59331 (VCV51_031345)	0.07	0.16	0.06	0.06	0.97	0.87	1.0	0.9	0.12	0.16	0.67	0.35	0.12	0.16	0.31	0.25	0.18	0.09	0.09	0.11	0.1	0.12	0.21
KNA59428 (VCV51_031281)	0.2	0.58	0.07	0.13	1.0	0.67	0.7	0.95	0.24	0.18	0.51	0.42	0.24	0.54	0.79	0.38	0.34	0.56	0.62	0.21	0.25	0.24	0.47
KNA59642 (VCV51_032539)	0.09	0.19	0.14	0.06	1.0	0.87	0.84	0.98	0.07	0.17	0.47	0.3	0.26	0.16	0.52	0.19	0.14	0.14	0.12	0.06	0.06	0.07	0.36
KNA59650 (VCV51_032542)	0.25	0.25	0.09	0.13	1.0	0.85	0.97	0.88	0.24	0.79	0.65	0.39	0.63	0.23	0.18	0.47	0.37	0.31	0.38	0.21	0.23	0.3	0.31
KNA59804 (VCV51_032494)	0.35	0.19	0.19	0.26	0.51	0.78	1.0	0.67	0.26	0.29	0.25	0.44	0.5	0.18	0.21	0.15	0.24	0.47	0.36	0.28	0.24	0.29	0.37
KNA59980 (VCV51_032392)	0.01	0.03	0.01	0.01	1.0	0.66	0.91	0.85	0.02	0.02	0.44	0.31	0.01	0.03	0.46	0.02	0.02	0.42	0.05	0.03	0.02	0.04	0.03
KNA59982 (VCV51_032394)	0.03	0.04	0.02	0.02	1.0	0.71	0.81	0.92	0.04	0.02	0.38	0.36	0.02	0.04	0.91	0.03	0.03	0.35	0.05	0.06	0.04	0.07	0.04
KNA60723 (VCV51_032162)	0.19	0.05	0.12	0.17	1.0	0.69	0.91	0.95	0.22	0.18	0.63	0.6	0.15	0.05	0.5	0.14	0.24	0.32	0.27	0.23	0.22	0.22	0.27
KNA60741 (VCV51_032181)	0.15	0.09	0.05	0.04	0.73	0.42	0.55	0.68	0.09	0.12	0.29	0.2	0.15	0.1	1.0	0.07	0.08	0.06	0.04	0.08	0.1	0.18	0.09
KNA60781 (VCV51_032043)	0.09	0.19	0.07	0.06	0.83	0.72	0.71	1.0	0.11	0.09	0.1	0.4	0.07	0.19	0.51	0.11	0.16	0.12	0.13	0.09	0.08	0.1	0.29
KNA60818 (VCV51_032082)	0.05	0.36	0.07	0.06	0.98	0.87	0.91	1.0	0.09	0.16	0.28	0.35	0.12	0.37	0.25	0.05	0.06	0.03	0.03	0.09	0.11	0.09	0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)