Heatmap: Cluster_28 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA49057 (VCV51_033832)
0.03 0.01 0.12 0.03 1.0 0.71 0.72 0.8 0.01 0.03 0.05 0.05 0.01 0.02 0.42 0.02 0.02 0.3 0.08 0.02 0.02 0.02 0.04
KNA49222 (VCV51_030342)
0.17 0.34 0.19 0.11 0.79 0.91 1.0 0.76 0.18 0.45 0.32 0.48 0.43 0.33 0.32 0.53 0.59 0.61 0.66 0.17 0.21 0.22 0.37
KNA49510 (VCV51_033795)
0.08 0.37 0.04 0.06 0.84 1.0 0.94 0.9 0.1 0.26 0.23 0.43 0.21 0.35 0.86 0.23 0.26 0.14 0.14 0.09 0.08 0.09 0.17
KNA49524 (VCV51_030323)
0.05 0.06 0.03 0.05 0.73 0.88 1.0 0.55 0.06 0.26 0.07 0.17 0.26 0.06 0.07 0.27 0.26 0.24 0.36 0.06 0.05 0.06 0.19
KNA50221 (VCV51_030256)
0.11 0.27 0.04 0.07 0.95 0.82 0.9 1.0 0.2 0.08 0.23 0.11 0.11 0.26 0.08 0.18 0.17 0.37 0.4 0.14 0.12 0.16 0.18
KNA51124 (YgfZ)
0.19 0.31 0.17 0.14 1.0 0.91 0.92 0.96 0.28 0.41 0.37 0.47 0.34 0.27 0.49 0.42 0.25 0.3 0.33 0.23 0.25 0.25 0.47
KNA51156 (VCV51_031679)
0.42 0.12 0.1 0.28 0.9 1.0 0.99 0.99 0.21 0.47 0.2 0.37 0.39 0.12 0.11 0.66 0.35 0.82 0.8 0.25 0.32 0.3 0.21
KNA51158 (VCV51_031677)
0.23 0.13 0.06 0.12 0.96 0.93 0.96 1.0 0.11 0.66 0.24 0.63 0.5 0.14 0.12 0.48 0.24 0.53 0.66 0.11 0.14 0.15 0.15
KNA51159 (VCV51_031676)
0.12 0.09 0.03 0.06 0.92 0.91 0.93 1.0 0.15 0.27 0.11 0.18 0.21 0.11 0.1 0.23 0.11 0.36 0.52 0.12 0.15 0.18 0.1
KNA51166 (VCV51_033620)
0.35 0.07 0.18 0.24 1.0 0.85 0.99 0.88 0.26 0.31 0.2 0.28 0.41 0.06 0.09 0.44 0.28 0.57 0.47 0.27 0.27 0.29 0.23
KNA51673 (VCV51_033552)
0.06 0.03 0.11 0.04 0.8 0.82 0.83 1.0 0.03 0.16 0.06 0.05 0.26 0.03 0.02 0.13 0.12 0.18 0.15 0.03 0.04 0.03 0.33
KNA51843 (VCV51_030379)
0.11 0.21 0.05 0.08 1.0 0.88 0.87 0.98 0.09 0.31 0.33 0.36 0.24 0.2 0.39 0.31 0.35 0.2 0.23 0.08 0.07 0.09 0.63
KNA51862 (VCV51_030392)
0.2 0.62 0.15 0.16 0.92 0.86 1.0 0.87 0.21 0.37 0.59 0.97 0.24 0.64 0.34 0.54 0.56 0.49 0.54 0.2 0.17 0.21 0.68
KNA52285 (VCV51_033451)
0.04 0.01 0.1 0.05 0.54 0.59 0.78 1.0 0.04 0.03 0.04 0.03 0.04 0.01 0.01 0.02 0.03 0.05 0.04 0.04 0.03 0.03 0.07
KNA52286 (VCV51_033452)
0.11 0.11 0.18 0.1 0.66 0.75 0.9 1.0 0.18 0.09 0.1 0.11 0.18 0.09 0.08 0.11 0.17 0.14 0.09 0.17 0.16 0.15 0.44
KNA52696 (VCV51_033384)
0.14 0.19 0.11 0.08 1.0 0.8 0.89 0.95 0.13 0.28 0.25 0.17 0.35 0.17 0.18 0.35 0.27 0.07 0.08 0.12 0.12 0.13 0.21
KNA53034 (VCV51_031595)
0.08 0.02 0.06 0.06 0.94 0.94 1.0 1.0 0.04 0.1 0.14 0.09 0.09 0.03 0.06 0.08 0.04 0.51 0.49 0.04 0.04 0.05 0.14
KNA53035 (VCV51_031594)
0.05 0.04 0.04 0.03 0.96 0.94 1.0 0.98 0.04 0.08 0.21 0.09 0.08 0.05 0.03 0.06 0.03 0.38 0.5 0.03 0.03 0.04 0.11
KNA53296 (VCV51_033348)
0.18 0.26 0.24 0.11 0.87 0.93 1.0 0.96 0.19 0.4 0.84 0.97 0.47 0.23 0.43 0.43 0.25 0.28 0.41 0.15 0.14 0.21 0.55
KNA53297 (VCV51_031606)
0.2 0.14 0.39 0.16 0.88 0.9 0.96 1.0 0.12 0.49 0.61 0.66 0.51 0.12 0.65 0.37 0.19 0.37 0.53 0.13 0.14 0.17 0.4
KNA53576 (VCV51_033291)
0.1 0.07 0.11 0.12 0.73 0.67 0.75 0.72 0.11 0.09 0.19 0.14 0.08 0.09 1.0 0.11 0.11 0.2 0.14 0.1 0.08 0.12 0.17
KNA53757 (VCV51_033274)
0.12 0.32 0.13 0.1 0.97 1.0 0.94 0.98 0.15 0.36 0.33 0.29 0.42 0.26 0.16 0.34 0.38 0.13 0.16 0.12 0.12 0.13 0.24
KNA53766 (VCV51_030017)
0.2 0.19 0.1 0.04 1.0 0.84 0.87 0.89 0.05 0.17 0.12 0.32 0.13 0.17 0.34 0.15 0.15 0.09 0.1 0.42 0.05 0.24 0.15
KNA53885 (VCV51_030819)
0.14 0.24 0.07 0.09 1.0 0.83 0.94 0.94 0.19 0.55 0.44 0.32 0.5 0.23 0.18 0.5 0.4 0.47 0.54 0.15 0.15 0.19 0.42
KNA53919 (VCV51_030843)
0.35 0.24 0.19 0.24 0.94 0.99 1.0 0.93 0.28 0.6 0.53 0.48 0.74 0.26 0.23 0.64 0.48 0.62 0.73 0.26 0.24 0.32 0.34
KNA54629 (VCV51_030729)
0.1 0.13 0.2 0.06 1.0 0.93 0.9 0.98 0.11 0.13 0.62 0.31 0.1 0.11 0.46 0.27 0.2 0.44 0.28 0.1 0.11 0.11 0.37
KNA54662 (VCV51_030751)
0.17 0.36 0.06 0.16 0.92 0.85 0.87 0.87 0.33 0.35 0.67 1.0 0.21 0.41 0.34 0.3 0.24 0.15 0.14 0.26 0.2 0.28 0.39
KNA54894 (VCV51_031799)
0.1 0.1 0.06 0.07 0.78 0.82 0.69 1.0 0.07 0.29 0.16 0.22 0.28 0.09 0.12 0.21 0.24 0.39 0.42 0.07 0.08 0.08 0.15
KNA54895 (VCV51_031798)
0.13 0.13 0.08 0.08 0.8 0.85 0.72 1.0 0.1 0.39 0.22 0.38 0.37 0.14 0.16 0.11 0.13 0.29 0.36 0.09 0.09 0.12 0.14
KNA54896 (VCV51_033128)
0.17 0.41 0.16 0.1 1.0 0.86 0.84 0.85 0.14 0.27 0.43 0.34 0.29 0.37 0.2 0.17 0.21 0.06 0.06 0.16 0.14 0.13 0.33
KNA54898 (VCV51_031796)
0.05 0.27 0.27 0.04 0.97 0.84 0.85 1.0 0.03 0.36 0.26 0.29 0.36 0.28 0.46 0.03 0.03 0.04 0.04 0.03 0.02 0.03 0.33
KNA55025 (VCV51_031715)
0.06 0.04 0.03 0.05 1.0 0.87 0.91 1.0 0.05 0.06 0.07 0.11 0.08 0.04 0.15 0.07 0.05 0.48 0.52 0.04 0.03 0.05 0.4
KNA55026 (VCV51_031714)
0.12 0.15 0.13 0.12 1.0 0.84 0.96 0.88 0.09 0.24 0.2 0.28 0.13 0.16 0.48 0.25 0.2 0.54 0.66 0.1 0.09 0.1 0.63
KNA55027 (VCV51_031713)
0.11 0.31 0.09 0.08 0.87 0.83 1.0 0.91 0.09 0.28 0.38 0.58 0.22 0.28 0.63 0.43 0.29 0.49 0.65 0.1 0.08 0.09 0.76
KNA55089 (VCV51_031845)
0.09 0.43 0.09 0.06 0.88 0.95 1.0 1.0 0.17 0.36 0.4 0.35 0.46 0.46 0.11 0.2 0.21 0.33 0.36 0.15 0.17 0.16 0.65
KNA55126 (VCV51_031817)
0.23 0.53 0.18 0.29 1.0 0.97 0.92 1.0 0.27 0.52 0.44 0.71 0.33 0.5 0.38 0.17 0.25 0.3 0.3 0.23 0.19 0.21 0.77
KNA55127 (VCV51_031816)
0.01 0.12 0.02 0.01 0.91 0.91 1.0 0.95 0.03 0.14 0.73 0.33 0.18 0.12 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.02 0.14
KNA55237 (VCV51_031082)
0.13 0.1 0.07 0.13 1.0 0.7 0.94 0.81 0.3 0.14 0.43 0.37 0.08 0.1 0.74 0.28 0.25 0.37 0.21 0.33 0.26 0.34 0.07
KNA55848 (VCV51_030946)
0.19 0.38 0.19 0.18 1.0 0.88 0.92 0.93 0.09 0.26 0.54 0.33 0.21 0.4 0.74 0.1 0.07 0.17 0.16 0.09 0.09 0.1 0.26
KNA55998 (VCV51_033001)
0.06 0.08 0.09 0.04 1.0 0.8 0.93 0.96 0.08 0.21 0.57 0.57 0.1 0.08 0.58 0.29 0.22 0.23 0.12 0.08 0.07 0.1 0.09
KNA55999 (VCV51_030918)
0.09 0.05 0.23 0.07 1.0 0.76 0.9 0.87 0.1 0.25 0.63 0.99 0.11 0.06 0.87 0.55 0.41 0.38 0.19 0.14 0.11 0.15 0.15
KNA56000 (VCV51_030919)
0.2 0.08 0.2 0.17 0.93 0.74 0.89 0.82 0.29 0.3 0.64 1.0 0.12 0.07 0.98 0.62 0.46 0.62 0.36 0.4 0.27 0.46 0.22
KNA56025 (VCV51_030941)
0.18 0.26 0.07 0.07 1.0 0.87 0.96 0.97 0.17 0.3 0.43 0.25 0.36 0.27 0.18 0.24 0.17 0.52 0.61 0.13 0.15 0.24 0.31
KNA56883 (VCV51_030518)
0.03 0.09 0.02 0.02 1.0 0.86 0.92 0.7 0.05 0.05 0.66 0.23 0.04 0.1 0.86 0.1 0.07 0.15 0.08 0.05 0.04 0.06 0.11
KNA56914 (VCV51_032868)
0.25 0.53 0.17 0.31 0.98 0.83 1.0 0.8 0.27 0.45 0.18 0.6 0.32 0.42 0.93 0.3 0.34 0.26 0.27 0.23 0.2 0.24 0.41
KNA57472 (VCV51_030457)
0.2 0.15 0.19 0.15 1.0 0.95 0.98 0.86 0.25 0.32 0.14 0.26 0.29 0.1 0.21 0.53 0.67 0.51 0.58 0.27 0.26 0.27 0.41
KNA57622 (VCV51_030435)
0.07 0.18 0.03 0.06 1.0 0.61 0.67 0.95 0.08 0.13 0.26 0.35 0.18 0.25 0.25 0.19 0.19 0.22 0.27 0.07 0.07 0.1 0.14
KNA58534 (VCV51_031165)
0.08 0.3 0.26 0.07 0.99 0.88 0.86 1.0 0.2 0.24 0.31 0.16 0.2 0.32 0.28 0.11 0.1 0.02 0.02 0.24 0.17 0.2 0.49
KNA59331 (VCV51_031345)
0.07 0.16 0.06 0.06 0.97 0.87 1.0 0.9 0.12 0.16 0.67 0.35 0.12 0.16 0.31 0.25 0.18 0.09 0.09 0.11 0.1 0.12 0.21
KNA59428 (VCV51_031281)
0.2 0.58 0.07 0.13 1.0 0.67 0.7 0.95 0.24 0.18 0.51 0.42 0.24 0.54 0.79 0.38 0.34 0.56 0.62 0.21 0.25 0.24 0.47
KNA59642 (VCV51_032539)
0.09 0.19 0.14 0.06 1.0 0.87 0.84 0.98 0.07 0.17 0.47 0.3 0.26 0.16 0.52 0.19 0.14 0.14 0.12 0.06 0.06 0.07 0.36
KNA59650 (VCV51_032542)
0.25 0.25 0.09 0.13 1.0 0.85 0.97 0.88 0.24 0.79 0.65 0.39 0.63 0.23 0.18 0.47 0.37 0.31 0.38 0.21 0.23 0.3 0.31
KNA59804 (VCV51_032494)
0.35 0.19 0.19 0.26 0.51 0.78 1.0 0.67 0.26 0.29 0.25 0.44 0.5 0.18 0.21 0.15 0.24 0.47 0.36 0.28 0.24 0.29 0.37
KNA59980 (VCV51_032392)
0.01 0.03 0.01 0.01 1.0 0.66 0.91 0.85 0.02 0.02 0.44 0.31 0.01 0.03 0.46 0.02 0.02 0.42 0.05 0.03 0.02 0.04 0.03
KNA59982 (VCV51_032394)
0.03 0.04 0.02 0.02 1.0 0.71 0.81 0.92 0.04 0.02 0.38 0.36 0.02 0.04 0.91 0.03 0.03 0.35 0.05 0.06 0.04 0.07 0.04
KNA60723 (VCV51_032162)
0.19 0.05 0.12 0.17 1.0 0.69 0.91 0.95 0.22 0.18 0.63 0.6 0.15 0.05 0.5 0.14 0.24 0.32 0.27 0.23 0.22 0.22 0.27
KNA60741 (VCV51_032181)
0.15 0.09 0.05 0.04 0.73 0.42 0.55 0.68 0.09 0.12 0.29 0.2 0.15 0.1 1.0 0.07 0.08 0.06 0.04 0.08 0.1 0.18 0.09
KNA60781 (VCV51_032043)
0.09 0.19 0.07 0.06 0.83 0.72 0.71 1.0 0.11 0.09 0.1 0.4 0.07 0.19 0.51 0.11 0.16 0.12 0.13 0.09 0.08 0.1 0.29
KNA60818 (VCV51_032082)
0.05 0.36 0.07 0.06 0.98 0.87 0.91 1.0 0.09 0.16 0.28 0.35 0.12 0.37 0.25 0.05 0.06 0.03 0.03 0.09 0.11 0.09 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)