Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA49913 (VCV51_033759)
1.02 -1.48 -0.63 0.8 0.01 0.1 -0.18 -0.17 0.23 0.02 -1.35 -1.26 0.32 -1.42 -2.43 -0.21 0.49 0.59 0.51 0.5 0.15 0.54 -1.37
KNA51534 (VCV51_033574)
-0.35 -0.4 -1.57 -0.56 -0.18 -0.12 -0.1 -0.3 -0.1 0.52 -0.32 0.77 -0.15 -0.49 -0.69 -0.12 0.57 0.7 0.78 -0.09 -0.5 -0.27 0.66
KNA51536 (VCV51_033576)
0.34 -0.82 -0.79 -0.02 -0.82 -0.99 -1.02 -1.03 0.28 -0.17 -0.66 0.08 -0.33 -0.96 -1.36 0.29 0.81 1.1 0.87 0.26 -0.12 0.08 0.95
KNA51537 (VCV51_033577)
-0.56 0.68 -0.37 -0.84 -0.35 -0.63 -0.77 -0.51 -0.08 0.27 0.47 0.53 -0.21 0.46 1.61 -1.03 -0.62 -1.67 -1.55 0.43 -0.26 -0.32 0.69
KNA51549 (VCV51_033592)
-0.22 -0.04 -1.04 -0.75 -0.04 -0.2 -0.18 -0.13 -0.07 -0.14 -0.72 -0.28 -0.11 -0.13 0.96 0.15 0.67 0.22 0.59 -0.12 0.04 -0.09 0.15
KNA51550 (VCV51_033593)
0.01 -0.71 -1.01 -0.35 0.31 0.23 0.1 0.18 0.6 -0.36 -1.06 -0.46 -0.35 -0.82 0.07 -0.11 0.64 -0.04 0.1 0.46 0.35 0.59 -0.19
KNA51552 (VCV51_033595)
0.25 -1.7 -0.11 -0.07 -0.13 -0.08 -0.31 -0.4 0.5 0.08 -1.68 0.01 -0.49 -2.0 -0.71 -0.22 0.39 0.55 0.62 0.47 0.43 0.52 0.58
KNA51553 (YlqF)
-0.45 0.33 -1.47 -1.23 -0.39 -0.36 -0.3 -0.36 0.44 -0.87 0.09 -0.19 -0.75 0.35 0.04 -0.7 -0.27 0.94 1.02 0.25 0.36 0.34 0.28
KNA51566 (VCV51_033609)
-0.64 -0.65 -1.52 -1.43 -0.11 0.01 0.05 -0.09 0.64 -0.08 0.03 -0.23 -0.13 -0.83 -1.2 -0.77 -0.42 1.08 1.22 0.27 0.41 0.56 0.04
KNA52029 (VCV51_033491)
0.56 -1.49 -0.99 0.63 0.05 0.44 0.2 -0.09 0.51 0.17 -1.0 -0.39 0.04 -1.55 -2.06 0.12 1.09 0.02 -0.14 0.17 0.13 0.48 -1.1
KNA52211 (VCV51_033469)
0.32 -0.27 0.39 -1.48 -0.85 -1.04 -1.04 -1.02 0.1 0.23 0.43 -0.27 0.63 -0.73 -2.02 -0.51 -0.72 -2.81 -2.21 0.55 1.06 1.19 1.54
KNA52267 (VCV51_033432)
-0.22 -1.25 -0.81 -0.61 -0.69 -0.53 -0.64 -0.87 0.62 -0.19 -0.1 0.29 -0.3 -1.01 -0.85 -0.11 0.55 0.56 0.69 0.41 0.77 0.58 0.62
KNA52268 (VCV51_033433)
-0.1 -1.08 -0.98 -0.55 -1.44 -0.92 -0.93 -1.27 0.73 -0.17 -0.09 0.16 -0.41 -1.03 -0.74 -0.05 0.61 0.31 0.65 0.68 0.83 0.77 0.8
KNA52269 (VCV51_033435)
0.79 -1.49 -2.58 -0.19 -2.47 -2.08 -2.43 -2.49 0.27 0.2 -1.52 -0.39 1.78 -1.43 -2.07 0.94 1.22 0.43 0.52 0.33 -0.24 0.2 0.38
KNA52271 (VCV51_033437)
0.59 -0.78 -1.76 -0.04 -2.73 -1.62 -1.71 -2.35 0.44 0.61 -1.24 -0.08 1.62 -1.52 -0.93 0.6 0.73 0.43 0.64 0.36 -0.22 0.54 -0.31
KNA52272 (VCV51_033438)
0.96 -1.11 -3.24 0.13 -2.63 -2.89 -2.48 -3.16 0.66 -0.27 -1.54 0.88 1.31 -1.89 -2.82 0.74 1.03 0.21 0.3 0.6 -0.01 0.82 -0.09
KNA52274 (VCV51_033440)
1.1 -2.43 -2.94 0.57 -2.78 -2.06 -2.33 -2.47 0.7 0.38 -1.36 -0.15 1.66 -2.74 -3.53 -0.26 0.43 -0.04 0.13 0.85 0.03 0.72 0.95
KNA52276 (VCV51_033442)
0.03 -1.27 -2.8 -0.46 -0.27 0.08 -0.13 -0.28 0.61 0.85 0.5 -0.35 0.91 -1.39 -1.11 -0.5 -0.2 -0.51 -0.27 0.54 0.22 0.48 0.76
KNA52289 (VCV51_033456)
-0.47 -0.18 -2.34 -0.54 -0.89 -0.53 -0.36 -0.93 1.21 -0.08 -0.74 0.1 -0.39 0.0 -0.84 -0.2 0.39 0.1 0.29 0.85 0.45 0.88 0.29
KNA52290 (VCV51_033457)
0.23 -1.7 -1.09 0.11 -0.67 -0.57 -0.59 -1.07 1.05 -0.14 -2.26 -0.31 -0.79 -1.71 -1.95 -0.38 0.54 -0.2 0.08 1.05 0.73 0.95 1.37
KNA52456 (VCV51_033394)
0.21 -2.48 -0.24 -0.58 -0.15 0.19 0.09 -0.32 -0.2 0.87 -0.86 1.08 1.18 -2.87 -1.75 -0.29 -0.27 -2.06 -1.94 -0.03 -0.07 -0.11 1.67
KNA59740 (YjeH)
0.27 -1.28 -1.26 -0.16 0.06 -0.11 0.08 -0.21 0.64 -0.65 -2.75 0.63 -1.6 -1.18 -2.5 -0.48 0.01 1.32 1.32 0.35 -0.25 0.43 0.2
KNA59752 (VCV51_032447)
-0.71 -0.4 -1.32 -1.01 0.07 0.39 0.4 0.08 0.46 0.54 -0.34 0.37 0.32 -0.4 -1.06 -0.4 -0.23 0.14 0.14 0.2 0.08 0.23 0.5
KNA59753 (VCV51_032448)
-0.1 -1.35 0.07 -1.04 0.23 0.33 0.28 0.05 -0.2 0.57 -0.47 0.8 0.67 -1.41 -0.92 -0.53 -0.08 -0.49 -0.19 -0.12 -0.31 0.04 1.11
KNA59766 (VCV51_032461)
-0.06 0.91 -2.28 -0.82 -0.49 -0.55 -0.39 -0.48 -0.49 0.29 0.44 0.57 -0.17 0.66 0.1 -0.06 0.26 0.26 0.46 -0.58 -0.6 -0.26 0.4
KNA59767 (VCV51_032462)
-0.29 0.43 -1.76 -1.06 -0.29 -0.18 -0.21 -0.32 -0.04 0.38 -0.0 0.88 0.09 0.33 0.42 -0.46 -0.23 -0.09 0.11 -0.19 -0.07 0.19 0.44
KNA59775 (VCV51_032470)
-0.05 -1.16 -1.42 -0.47 -0.68 -0.48 -0.3 -0.74 0.84 0.5 0.0 -0.53 1.06 -1.37 -1.66 -0.17 0.44 -1.2 -1.04 0.79 0.63 0.7 0.99
KNA59788 (VCV51_032483)
-0.05 0.05 -1.03 -0.13 -0.27 -0.24 -0.21 -0.32 -0.01 0.11 0.37 0.53 -0.07 -0.16 -0.1 -0.56 0.02 0.47 0.64 -0.14 -0.37 -0.08 0.48
KNA59789 (VCV51_032484)
0.32 -1.41 -0.92 -0.1 -1.2 -1.07 -1.18 -1.33 0.75 -1.16 0.85 0.4 -1.4 -1.8 -1.88 0.1 0.58 0.85 0.72 0.41 0.22 0.87 0.71
KNA59793 (VCV51_032489)
0.61 -1.08 -0.77 0.29 -0.89 -0.85 -0.97 -0.81 0.58 -0.79 -1.42 0.31 -0.93 -0.86 -1.36 0.24 0.9 0.33 0.32 0.66 0.21 0.76 0.93
KNA59795 (VCV51_032491)
0.1 -0.99 -1.06 -0.77 -0.54 -0.78 -0.55 -0.58 -0.76 -0.14 -0.58 1.04 0.3 -1.12 -0.12 0.23 0.64 1.18 0.95 -0.97 -0.98 -0.2 1.05
KNA59796 (VCV51_030857)
0.54 -0.81 -0.39 -0.31 -1.44 -1.31 -1.3 -1.32 0.41 -0.37 -0.88 0.2 -0.02 -1.05 -2.12 0.39 0.84 0.8 0.93 0.12 0.2 0.64 0.83
KNA59797 (VCV51_032492)
0.07 -0.39 -1.34 -1.1 -0.32 -0.14 -0.09 -0.25 0.25 0.68 -0.51 0.82 0.79 -0.59 -0.28 -0.53 -0.17 -0.29 -0.1 -0.12 -0.04 0.78 0.51
KNA59800 (VCV51_030861)
-0.62 0.61 -2.28 -0.37 0.38 0.37 0.58 0.39 -0.87 0.43 0.9 0.74 -0.39 0.74 0.02 -0.47 -0.18 -0.41 -0.28 -1.5 -1.48 -0.91 0.19
KNA59813 (VCV51_030873)
-0.25 -0.47 -1.5 -0.78 -0.08 0.17 0.22 -0.09 -0.01 0.33 -0.45 0.48 0.31 -0.5 -0.55 0.45 0.89 0.04 0.28 -0.27 -0.16 -0.01 0.2
KNA59816 (VCV51_030877)
-0.83 -0.61 -1.8 -0.82 0.76 0.77 0.8 0.5 0.16 0.67 -2.06 -1.03 0.84 -0.69 -0.05 -0.82 -0.03 -0.63 -0.49 -0.14 -0.46 0.2 0.91
KNA59832 (LuxP)
0.55 -0.56 -1.02 0.48 -1.51 -1.5 -1.44 -1.7 0.75 0.47 -1.08 0.76 -0.04 -0.61 -1.13 -0.7 0.13 0.33 0.46 0.59 0.08 0.78 0.72
KNA59855 (VCV51_032266)
-0.21 -0.71 -2.23 -0.63 -0.14 -0.08 0.07 -0.32 0.11 0.83 -1.09 0.67 0.57 -0.83 0.01 0.01 0.59 -0.02 -0.03 -0.04 -0.04 0.34 0.38
KNA59858 (VCV51_032269)
0.32 -1.31 -0.44 0.21 -0.57 -0.41 -0.49 -0.51 0.82 0.14 -1.63 0.15 -0.42 -1.48 -0.77 -0.51 0.41 -0.05 0.13 0.68 0.61 0.8 0.74
KNA59861 (VCV51_032272)
0.09 -1.51 0.49 -0.33 0.1 0.09 0.15 -0.07 0.09 0.22 -1.3 0.89 -0.23 -1.52 0.17 -1.25 -0.86 0.45 0.46 -0.24 0.12 0.21 0.64
KNA59862 (VCV51_032273)
-0.07 -0.41 -1.2 -0.75 0.49 -0.04 0.17 0.01 -0.28 -0.03 -1.51 0.56 0.23 -0.17 -1.45 -0.19 -0.76 0.73 0.89 -0.2 -0.07 -0.24 1.04
KNA59864 (VCV51_032275)
0.21 -1.25 -1.6 -0.41 -0.45 -0.4 -0.55 -0.9 0.37 0.03 -2.21 -0.06 0.16 -1.37 -1.02 -0.11 0.51 0.86 1.03 0.9 0.49 0.48 0.35
KNA59865 (VCV51_032276)
0.16 -0.7 -0.45 -0.56 -0.81 -0.75 -0.74 -0.94 0.62 -0.13 -0.46 -0.11 -0.27 -1.07 -0.64 0.08 0.3 0.44 0.58 0.76 0.68 0.76 0.49
KNA59872 (VCV51_032283)
0.65 -1.45 -0.78 0.63 -0.97 -0.84 -1.1 -1.25 0.34 0.67 -0.3 0.62 -0.41 -1.66 -1.43 -0.7 -0.25 1.04 1.17 0.07 -0.11 0.24 0.49
KNA59873 (VCV51_032284)
0.15 -1.75 -0.75 0.24 -1.19 -0.68 -1.22 -1.43 0.65 0.73 -0.76 0.88 -0.39 -1.84 -2.1 -0.54 -0.04 0.68 0.81 0.49 0.33 0.61 0.87
KNA59911 (VCV51_032322)
0.03 -0.09 -0.63 -0.43 -0.37 -0.34 -0.4 -0.51 -0.18 0.53 -0.09 1.33 0.31 -0.38 -0.8 -0.18 0.23 0.33 0.33 -0.42 -1.11 -0.08 0.64
KNA59916 (VcmN)
-0.09 -1.03 -1.84 -0.27 -0.17 0.61 0.3 -0.19 0.25 0.75 -0.81 0.52 0.09 -0.68 -0.13 0.23 0.56 0.01 -0.12 0.07 -0.09 0.18 -0.4
KNA59931 (VCV51_032342)
-0.15 -0.24 -1.32 -0.91 0.18 -0.02 -0.03 -0.2 0.64 -0.61 -1.76 -0.07 -0.51 -0.12 -1.5 -0.82 -0.42 0.93 1.08 0.62 0.69 0.71 -0.31
KNA59934 (VCV51_032345)
-0.26 -0.77 -1.24 -0.65 -0.96 -0.8 -0.5 -1.06 0.47 0.16 -1.46 0.39 0.08 -1.14 0.45 0.04 0.51 0.65 0.73 0.31 0.08 0.53 0.83
KNA59936 (VCV51_032347)
-0.27 -3.87 -2.54 0.43 -2.76 -2.08 -2.25 -3.11 1.09 0.33 -3.46 0.03 -0.12 -3.27 -5.25 -0.73 0.34 1.86 1.51 0.96 0.15 0.3 0.76
KNA59939 (VCV51_032351)
0.11 -0.64 -1.97 -0.34 -1.21 -1.14 -1.15 -1.54 1.0 0.06 -1.35 0.43 0.38 -0.39 -1.14 -0.29 0.18 0.56 0.62 0.79 0.48 0.61 0.72
KNA59943 (VCV51_032355)
0.14 -0.73 -1.49 0.21 0.04 0.08 0.02 -0.05 0.71 0.44 -1.75 -0.17 -0.06 -0.75 -1.47 -0.59 0.01 0.36 0.43 0.41 0.28 0.39 0.56
KNA59948 (VCV51_032360)
-1.87 -0.72 -0.82 -1.97 0.21 -0.04 0.29 0.36 -1.37 0.32 0.63 0.98 1.28 -0.88 -1.13 0.34 0.76 -0.28 -0.16 -2.12 -1.93 -1.49 1.36
KNA59956 (VCV51_032368)
0.45 -1.09 -1.75 0.01 -0.44 -0.43 -0.5 -0.42 1.42 -1.51 -1.7 -0.5 -1.0 -1.06 -0.68 -0.5 0.43 -0.9 -0.9 1.13 0.86 0.95 1.16
KNA59958 (VCV51_032370)
0.09 -1.26 -1.36 -0.59 0.15 0.05 0.14 -0.12 0.41 0.58 -0.39 0.21 0.43 -1.26 -0.6 -0.27 0.36 -0.73 -0.31 0.38 0.43 0.51 0.61
KNA59961 (VCV51_032373)
-0.37 -0.39 -1.73 -0.55 -0.97 -0.49 -0.48 -0.66 0.38 0.23 -1.03 0.47 0.06 -0.39 -0.5 -0.11 0.5 0.84 0.99 0.06 0.18 0.15 0.71
KNA59966 (VCV51_032378)
0.18 -0.34 -0.65 -0.18 -0.14 -0.5 -0.28 -0.66 0.44 0.13 -0.68 0.76 0.09 -0.49 -0.22 -1.44 -0.75 0.58 0.76 0.27 0.3 0.6 -0.01
KNA59967 (RumB)
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KNA59968 (VCV51_032380)
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KNA59969 (VCV51_032381)
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KNA59971 (VCV51_032383)
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KNA59994 (VCV51_032406)
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KNA59999 (VCV51_032411)
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KNA60541 (VCV51_032212)
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KNA60543 (VCV51_032214)
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KNA60552 (VCV51_032223)
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KNA60570 (VCV51_032241)
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KNA60573 (VCV51_032244)
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KNA60578 (VCV51_032249)
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KNA60585 (VCV51_032256)
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KNA60656 (VCV51_032095)
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KNA60657 (VCV51_032096)
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KNA60687 (VCV51_032126)
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KNA60689 (VCV51_032128)
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KNA60690 (VCV51_032129)
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KNA60691 (VCV51_032130)
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KNA60706 (VCV51_032145)
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KNA60710 (VCV51_032149)
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KNA60731 (VCV51_032171)
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KNA60735 (VCV51_032175)
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KNA60770 (VCV51_032032)
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KNA60788 (VCV51_032050)
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KNA60791 (VCV51_032053)
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KNA60801 (VCV51_032063)
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KNA60802 (VCV51_032064)
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KNA60803 (VCV51_032065)
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KNA60804 (VCV51_032066)
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KNA60905 (VCV51_031879)
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KNA60910 (VCV51_031884)
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KNA60930 (VCV51_031904)
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KNA60936 (VCV51_031910)
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KNA60940 (VCV51_031915)
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KNA60941 (VCV51_031916)
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KNA60944 (VCV51_031919)
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KNA60955 (VCV51_031930)
-0.02 -1.65 -1.77 -0.75 -0.36 -0.52 -0.39 -0.48 -0.53 0.65 -0.18 0.46 1.7 -1.92 -3.18 0.31 0.65 0.56 0.65 -0.45 -0.53 -0.53 0.79
KNA60956 (VCV51_031931)
-0.22 -1.19 -1.55 -0.89 -0.83 -1.12 -1.09 -1.14 -0.04 0.22 0.2 0.0 1.58 -1.45 -3.3 0.66 0.98 0.33 0.53 -0.22 -0.18 -0.11 1.15
KNA60957 (VCV51_031932)
-0.15 -1.16 -1.18 -1.28 -0.21 -0.24 -0.06 -0.28 0.12 0.31 0.21 -0.25 1.6 -1.68 -3.17 -0.79 -0.17 0.81 0.86 -0.14 -0.06 0.17 0.59
KNA60958 (VCV51_031933)
-0.28 -1.85 -1.31 -1.33 0.44 0.26 0.29 0.34 -0.46 0.66 -0.2 0.33 1.63 -1.83 -2.61 -0.59 -0.71 -0.44 -0.29 -0.46 -0.44 -0.48 1.62
KNA60960 (VCV51_031935)
-0.17 -0.6 -1.3 -0.75 -0.58 -0.51 -0.47 -0.41 -0.16 -0.07 -0.53 0.63 -0.03 -0.73 0.18 0.16 0.51 0.78 1.03 -0.28 -0.51 -0.2 1.08
KNA60979 (VCV51_031954)
-0.25 -0.75 -1.7 -0.63 -0.59 -0.27 -0.12 -0.84 0.48 0.2 -0.38 0.09 0.62 -0.87 0.14 -0.5 0.22 0.44 0.79 0.44 0.0 0.53 0.43
KNA60999 (VCV51_031974)
0.67 -2.28 -0.84 -0.04 -1.18 -0.97 -0.84 -1.3 0.9 0.6 -0.35 0.24 1.11 -2.02 -2.26 -0.5 0.14 -2.28 -1.76 1.11 0.37 0.96 1.07
KNA61019 (VCV51_031994)
0.11 -1.85 -1.04 -0.57 -1.19 -0.97 -0.89 -1.36 0.09 0.36 -1.26 0.6 0.7 -2.05 -0.45 -0.1 0.57 1.24 1.25 0.04 0.3 0.22 0.21
KNA61026 (VCV51_032001)
-1.0 -0.22 -2.28 -1.91 -0.18 0.24 0.3 -0.18 -0.92 1.19 0.2 0.88 0.91 -0.63 -0.31 -0.01 0.37 0.21 0.3 -0.8 -0.93 -0.8 0.59
KNA61027 (VCV51_032002)
-0.28 -0.55 -1.08 -0.51 -1.31 -0.94 -0.92 -1.17 -0.38 0.73 -0.17 1.06 0.55 -0.58 -0.62 0.41 0.9 0.72 0.88 -0.47 -0.72 -0.33 0.51
KNA61029 (VCV51_032004)
-0.31 0.04 -0.78 -0.88 -0.12 -0.02 -0.09 -0.29 -0.23 -0.28 -0.21 0.75 -0.12 0.02 0.33 0.22 0.65 -0.02 0.27 -0.27 -0.31 -0.2 0.61
KNA61039 (CobQ)
-0.47 0.45 -1.33 -1.0 0.18 0.06 0.13 0.01 -0.25 0.47 0.04 1.33 -0.04 0.46 0.26 -0.33 -0.02 -0.46 -0.2 -0.67 -0.67 -0.2 -0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.