1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA49074 (VCV51_033847)
 0.56 0.03 0.22 0.78 0.13 0.15 0.16 0.09 0.79 0.56 0.07 0.41 0.51 0.05 0.11 0.53 1.0 0.32 0.21 0.58 0.43 0.72 0.31
KNA50258 (VCV51_030288)
 0.22 0.07 0.14 0.15 0.25 0.2 0.22 0.24 0.16 0.74 0.3 0.71 0.98 0.07 0.09 0.99 1.0 0.13 0.15 0.15 0.14 0.18 0.26
KNA50259 (VCV51_030289)
 0.33 0.1 0.16 0.15 0.28 0.19 0.2 0.25 0.2 0.46 0.54 1.0 0.72 0.08 0.06 0.8 0.83 0.33 0.35 0.18 0.15 0.22 0.27
KNA50261 (VCV51_030290)
 0.34 0.03 0.16 0.14 0.04 0.07 0.08 0.03 0.16 0.75 0.18 0.69 1.0 0.02 0.03 0.47 0.56 0.04 0.05 0.17 0.11 0.24 0.41
KNA51661 (VCV51_031499)
 0.97 0.03 0.22 0.44 0.04 0.06 0.06 0.04 0.74 0.25 0.06 0.8 0.63 0.02 0.05 0.4 0.43 0.15 0.13 0.75 0.94 1.0 0.19
KNA51831 (VCV51_030373)
 0.5 0.08 0.15 0.3 0.21 0.25 0.26 0.19 0.49 0.84 0.13 0.5 1.0 0.05 0.05 0.74 0.93 0.05 0.06 0.46 0.39 0.51 0.49
KNA51832 (VCV51_033519)
 0.35 0.04 0.15 0.23 0.15 0.19 0.2 0.13 0.24 0.71 0.11 0.34 0.85 0.02 0.04 0.85 1.0 0.05 0.05 0.24 0.22 0.25 0.27
KNA51833 (VCV51_033520)
 0.48 0.05 0.24 0.36 0.22 0.27 0.27 0.2 0.3 0.77 0.11 0.35 0.89 0.03 0.07 0.89 1.0 0.06 0.06 0.32 0.3 0.31 0.36
KNA51857 (VCV51_030389)
 0.48 0.03 0.19 0.3 0.07 0.1 0.1 0.07 0.29 0.53 0.14 0.84 0.8 0.02 0.04 0.8 1.0 0.19 0.17 0.25 0.25 0.34 0.19
KNA51858 (VCV51_030390)
 0.71 0.31 0.58 0.54 0.69 0.58 0.63 0.53 0.52 0.42 0.55 0.5 0.66 0.3 0.23 0.88 1.0 0.51 0.56 0.49 0.54 0.5 0.73
KNA52208 (VCV51_033466)
 0.05 0.03 0.07 0.03 0.06 0.05 0.06 0.07 0.04 1.0 0.21 0.42 0.77 0.02 0.01 0.23 0.21 0.04 0.05 0.05 0.05 0.08 0.26
KNA52209 (VCV51_033467)
 0.19 0.06 0.2 0.1 0.2 0.17 0.17 0.2 0.15 1.0 0.22 0.33 0.87 0.04 0.01 0.24 0.21 0.03 0.04 0.17 0.17 0.19 0.55
KNA52210 (VCV51_033468)
 0.26 0.11 0.18 0.12 0.06 0.06 0.07 0.06 0.27 0.76 0.39 0.39 1.0 0.07 0.03 0.19 0.17 0.04 0.05 0.27 0.25 0.39 0.57
KNA52212 (VCV51_033470)
 0.1 0.03 0.08 0.04 0.07 0.08 0.09 0.06 0.09 1.0 0.2 0.35 0.72 0.02 0.05 0.12 0.09 0.01 0.02 0.1 0.09 0.15 0.25
KNA52457 (VCV51_030121)
 0.8 0.05 0.48 0.78 0.27 0.22 0.24 0.26 0.5 0.38 0.22 0.4 1.0 0.05 0.07 0.76 0.9 0.58 0.64 0.41 0.33 0.49 0.54
KNA52458 (VCV51_030122)
 1.0 0.02 0.51 0.94 0.83 0.58 0.57 0.76 0.69 0.36 0.15 0.45 0.98 0.02 0.02 0.77 0.91 0.35 0.37 0.6 0.48 0.61 0.39
KNA52459 (VCV51_030123)
 0.26 0.01 0.1 0.26 0.37 0.26 0.31 0.38 0.12 0.33 0.09 0.58 0.78 0.01 0.02 0.91 1.0 0.08 0.08 0.12 0.1 0.14 0.24
KNA52460 (VCV51_030124)
 0.76 0.01 0.63 0.68 0.83 0.52 0.65 0.76 0.34 0.35 0.17 0.62 0.85 0.02 0.03 0.94 1.0 0.19 0.2 0.34 0.3 0.35 0.54
KNA52479 (VCV51_030141)
 0.16 0.11 0.05 0.11 0.14 0.15 0.19 0.14 0.26 0.67 0.41 0.13 1.0 0.11 0.39 0.28 0.41 0.16 0.21 0.21 0.14 0.26 0.18
KNA52698 (VCV51_033385)
 0.34 0.01 0.05 0.2 0.12 0.26 0.22 0.11 0.14 1.0 0.03 0.39 0.81 0.01 0.02 0.23 0.19 0.02 0.03 0.15 0.16 0.24 0.56
KNA53009 (VCV51_033365)
 0.22 0.16 0.13 0.13 0.2 0.18 0.22 0.17 0.2 0.59 0.18 1.0 0.4 0.15 0.11 0.63 0.53 0.22 0.26 0.18 0.15 0.17 0.19
KNA53010 (VCV51_031564)
 0.14 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.19 0.79 0.03 0.0 1.0 0.01 0.02 0.08 0.06 0.02 0.03 0.2 0.18 0.11 0.08
KNA53612 (VCV51_030083)
 0.6 0.22 0.2 0.37 0.12 0.15 0.15 0.1 0.39 0.56 0.39 0.76 0.7 0.18 0.18 0.87 1.0 0.18 0.21 0.41 0.33 0.52 0.48
KNA53627 (VCV51_033303)
 0.14 0.1 0.03 0.1 0.31 0.29 0.3 0.28 0.27 0.48 0.26 0.3 1.0 0.11 0.13 0.41 0.48 0.08 0.08 0.18 0.1 0.26 0.31
KNA53638 (VCV51_033312)
 0.6 0.06 0.23 0.43 0.06 0.11 0.11 0.05 0.47 0.61 0.34 0.77 0.99 0.04 0.08 0.75 1.0 0.18 0.18 0.44 0.35 0.48 0.44
KNA53868 (VCV51_030807)
 0.44 0.12 0.2 0.22 0.32 0.34 0.38 0.3 0.38 0.7 0.41 0.72 1.0 0.11 0.19 0.92 0.73 0.28 0.3 0.37 0.28 0.47 0.21
KNA53893 (VCV51_030821)
 0.29 0.06 0.05 0.06 0.63 0.29 0.37 0.68 0.17 0.23 0.17 0.14 1.0 0.05 0.01 0.33 0.25 0.03 0.03 0.13 0.13 0.31 0.15
KNA53911 (VCV51_030837)
 0.41 0.15 0.04 0.04 0.07 0.07 0.08 0.07 0.05 0.7 0.18 0.26 1.0 0.11 0.14 0.27 0.2 0.17 0.2 0.28 0.25 0.35 0.1
KNA54635 (FadI)
 0.49 0.03 0.28 0.22 0.07 0.09 0.09 0.06 0.4 0.42 0.12 0.54 1.0 0.02 0.06 0.34 0.32 0.06 0.06 0.4 0.25 0.49 0.11
KNA54636 (VCV51_033212)
 0.7 0.05 0.29 0.42 0.08 0.1 0.1 0.07 0.54 0.52 0.12 0.65 1.0 0.03 0.06 0.38 0.37 0.13 0.11 0.55 0.37 0.65 0.12
KNA54658 (VCV51_030747)
 0.27 0.33 0.08 0.19 0.29 0.27 0.3 0.27 0.24 0.66 0.38 0.58 1.0 0.34 0.27 0.39 0.29 0.39 0.4 0.21 0.18 0.26 0.17
KNA54659 (VCV51_030748)
 0.42 0.19 0.16 0.4 0.27 0.27 0.31 0.25 0.3 0.8 0.29 0.52 1.0 0.18 0.26 0.7 0.58 0.49 0.52 0.29 0.31 0.35 0.25
KNA54660 (VCV51_030749)
 0.33 0.3 0.14 0.27 0.33 0.32 0.34 0.27 0.31 0.67 0.24 1.0 0.64 0.29 0.3 0.83 0.7 0.34 0.37 0.29 0.29 0.31 0.38
KNA54677 (VCV51_030763)
 0.58 0.09 0.34 0.32 0.61 0.54 0.56 0.63 0.66 0.55 0.28 0.71 1.0 0.1 0.08 0.56 0.49 0.04 0.07 0.58 0.53 0.61 0.37
KNA54678 (VCV51_030764)
 0.22 0.08 0.11 0.16 0.26 0.19 0.2 0.27 0.22 0.58 0.45 0.53 1.0 0.09 0.02 0.71 0.5 0.03 0.03 0.19 0.16 0.21 0.14
KNA54679 (VCV51_030765)
 0.23 0.11 0.25 0.13 0.36 0.28 0.26 0.37 0.22 0.69 0.52 1.0 0.94 0.17 0.04 0.78 0.53 0.04 0.05 0.2 0.19 0.22 0.22
KNA54680 (VCV51_030766)
 0.28 0.07 0.24 0.17 0.24 0.22 0.21 0.25 0.19 0.79 0.39 0.81 1.0 0.1 0.07 0.94 0.64 0.07 0.07 0.21 0.21 0.23 0.22
KNA54681 (VCV51_030767)
 0.41 0.04 0.39 0.27 0.28 0.29 0.25 0.3 0.19 0.87 0.35 0.78 1.0 0.04 0.08 0.99 0.72 0.05 0.05 0.22 0.23 0.22 0.23
KNA55356 (VCV51_031048)
 0.14 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.35 0.82 0.02 0.57 1.0 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.02 0.44 0.43 0.22 0.03
KNA55357 (VCV51_033041)
 0.13 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.29 0.79 0.02 1.0 0.93 0.01 0.01 0.03 0.03 0.03 0.03 0.27 0.26 0.15 0.03
KNA55358 (VCV51_031050)
 0.15 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.37 0.68 0.02 1.0 0.84 0.02 0.01 0.04 0.03 0.05 0.06 0.35 0.29 0.17 0.04
KNA55653 (VCV51_030969)
 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.33 0.0 0.64 1.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.13 0.06 0.05 0.02
KNA55654 (VCV51_030970)
 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.43 0.01 0.31 1.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.1 0.05 0.04 0.01
KNA55655 (VCV51_030971)
 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.4 0.01 0.2 1.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.02 0.02 0.01
KNA55664 (VCV51_030979)
 0.42 0.02 0.69 0.24 0.1 0.12 0.14 0.09 0.31 0.75 0.07 0.55 1.0 0.03 0.05 0.63 0.47 0.15 0.15 0.25 0.28 0.4 0.4
KNA55665 (VCV51_030981)
 0.54 0.03 0.6 0.35 0.06 0.07 0.08 0.06 0.23 0.72 0.06 1.0 0.72 0.03 0.06 0.46 0.32 0.22 0.21 0.19 0.2 0.31 0.47
KNA56006 (VCV51_030923)
 0.31 0.07 0.11 0.22 0.12 0.15 0.14 0.11 0.37 0.26 0.08 0.21 1.0 0.06 0.13 0.48 0.42 0.29 0.32 0.39 0.37 0.44 0.45
KNA56152 (VCV51_030892)
 0.32 0.28 0.19 0.18 0.16 0.16 0.17 0.15 0.34 0.49 0.26 1.0 0.47 0.22 0.35 0.9 0.78 0.61 0.6 0.37 0.24 0.31 0.43
KNA56837 (PhoR)
 0.23 0.27 0.28 0.2 0.36 0.36 0.35 0.33 0.2 0.55 0.26 1.0 0.36 0.27 0.34 0.82 0.86 0.41 0.47 0.2 0.2 0.26 0.45
KNA56838 (VCV51_030477)
 0.36 0.2 0.35 0.31 0.42 0.42 0.42 0.37 0.3 0.66 0.24 1.0 0.42 0.22 0.48 0.84 0.95 0.43 0.53 0.37 0.36 0.4 0.62
KNA56895 (VCV51_030530)
 0.8 0.03 0.26 0.41 0.32 0.37 0.42 0.25 0.63 0.36 0.21 0.45 0.87 0.02 0.02 0.73 1.0 0.02 0.02 0.66 0.52 0.66 0.19
KNA56896 (VCV51_030531)
 0.4 0.04 0.07 0.29 0.17 0.21 0.18 0.17 0.23 0.47 0.06 0.19 1.0 0.04 0.05 0.53 0.58 0.21 0.21 0.23 0.21 0.26 0.41
KNA56898 (VCV51_032864)
 0.39 0.16 0.13 0.25 0.23 0.3 0.32 0.25 0.28 0.61 0.55 0.7 1.0 0.14 0.18 0.49 0.65 0.79 0.75 0.24 0.29 0.28 0.3
KNA56978 (VCV51_030594)
 0.21 0.03 0.04 0.09 0.17 0.18 0.13 0.16 0.12 0.48 0.3 0.45 1.0 0.01 0.11 0.5 0.31 0.44 0.45 0.12 0.1 0.15 0.05
KNA57440 (VCV51_032836)
 0.72 0.05 0.16 0.57 0.17 0.23 0.23 0.16 0.67 0.66 0.77 0.59 0.5 0.04 0.04 0.72 1.0 0.22 0.2 0.49 0.78 0.78 0.66
KNA57835 (VCV51_032804)
 0.27 0.02 0.1 0.23 0.11 0.13 0.13 0.11 0.2 0.45 0.06 0.28 0.61 0.01 0.03 1.0 0.79 0.02 0.02 0.2 0.22 0.19 0.22
KNA57836 (FixQ)
 0.32 0.01 0.27 0.26 0.14 0.18 0.2 0.14 0.04 0.76 0.03 0.0 1.0 0.01 0.37 0.0 0.0 0.03 0.02 0.04 0.06 0.05 0.0
KNA57837 (VCV51_032806)
 0.34 0.04 0.07 0.26 0.1 0.13 0.13 0.09 0.32 0.57 0.09 0.34 0.85 0.03 0.04 1.0 0.83 0.03 0.03 0.32 0.36 0.31 0.25
KNA57838 (VCV51_032807)
 0.3 0.02 0.08 0.21 0.09 0.12 0.12 0.08 0.19 0.81 0.08 0.42 1.0 0.01 0.03 0.66 0.55 0.02 0.02 0.19 0.19 0.19 0.32
KNA57854 (VCV51_032778)
 0.22 0.09 0.12 0.15 0.12 0.13 0.13 0.1 0.28 1.0 0.31 0.62 0.66 0.08 0.13 0.64 0.44 0.11 0.14 0.27 0.19 0.25 0.2
KNA58531 (VCV51_031167)
 0.41 0.02 0.11 0.2 0.03 0.04 0.05 0.03 0.33 0.19 0.05 0.5 1.0 0.02 0.03 0.37 0.41 0.09 0.07 0.32 0.21 0.36 0.08
KNA59340 (VCV51_031339)
 0.67 0.02 0.28 0.35 0.02 0.03 0.03 0.01 0.52 0.32 0.07 0.73 1.0 0.01 0.02 0.54 0.54 0.07 0.07 0.55 0.84 0.6 0.12
KNA59348 (VCV51_032567)
 0.37 0.21 0.25 0.22 0.13 0.16 0.17 0.13 0.3 0.55 0.37 0.58 1.0 0.18 0.34 0.82 0.68 0.3 0.34 0.32 0.33 0.34 0.35
KNA59414 (VCV51_032595)
 0.18 0.05 0.06 0.12 0.13 0.11 0.1 0.12 0.16 0.78 0.22 0.39 1.0 0.04 0.06 0.9 0.66 0.25 0.23 0.15 0.15 0.19 0.25
KNA59594 (VCV51_031407)
 0.48 0.37 0.12 0.42 0.31 0.36 0.37 0.31 0.69 0.48 0.47 0.5 0.46 0.36 0.48 0.67 0.61 0.15 0.14 0.65 1.0 0.69 0.69
KNA59596 (VCV51_031405)
 0.46 0.04 0.16 0.28 0.18 0.24 0.24 0.16 0.44 0.62 0.29 0.53 1.0 0.03 0.04 0.81 0.7 0.07 0.07 0.44 0.42 0.49 0.24
KNA59597 (VCV51_032521)
 0.42 0.01 0.26 0.27 0.08 0.14 0.14 0.07 0.34 0.71 0.14 0.51 1.0 0.01 0.05 0.56 0.53 0.02 0.03 0.34 0.39 0.39 0.42
KNA59599 (VCV51_031404)
 0.47 0.02 0.3 0.31 0.05 0.08 0.09 0.04 0.33 0.71 0.15 0.61 1.0 0.01 0.08 0.78 0.72 0.04 0.03 0.33 0.37 0.38 0.15
KNA59600 (VCV51_031402)
 0.57 0.01 0.53 0.47 0.05 0.08 0.08 0.04 0.22 0.72 0.08 0.68 0.85 0.01 0.07 1.0 0.95 0.05 0.04 0.26 0.32 0.27 0.17
KNA59601 (VCV51_032523)
 0.27 0.04 0.15 0.18 0.07 0.09 0.09 0.06 0.14 0.61 0.1 1.0 0.7 0.04 0.09 0.77 0.69 0.09 0.09 0.14 0.17 0.18 0.1
KNA59602 (VCV51_031398)
 0.41 0.03 0.26 0.3 0.07 0.09 0.09 0.06 0.23 0.64 0.13 1.0 0.71 0.02 0.08 0.85 0.75 0.13 0.12 0.22 0.23 0.28 0.18
KNA59603 (VCV51_031397)
 0.38 0.02 0.24 0.26 0.14 0.19 0.21 0.12 0.29 0.84 0.22 0.8 1.0 0.02 0.08 0.78 0.7 0.08 0.07 0.26 0.28 0.31 0.14
KNA59604 (VCV51_031396)
 0.44 0.02 0.29 0.3 0.1 0.16 0.17 0.08 0.29 0.9 0.23 0.58 1.0 0.02 0.07 1.0 0.88 0.09 0.09 0.26 0.26 0.3 0.21
KNA59745 (VCV51_032440)
 0.26 0.05 0.09 0.13 0.06 0.1 0.09 0.04 0.23 0.75 0.11 0.47 1.0 0.03 0.06 0.48 0.64 0.02 0.02 0.24 0.23 0.29 0.1
KNA59798 (VCV51_030859)
 0.39 0.21 0.42 0.19 0.12 0.12 0.12 0.08 0.21 0.66 0.31 0.43 1.0 0.15 0.23 0.34 0.56 0.18 0.27 0.25 0.27 0.29 0.83
KNA59918 (VCV51_032329)
 0.09 0.03 0.02 0.05 0.1 0.11 0.11 0.09 0.04 0.74 0.02 0.31 1.0 0.02 0.04 0.25 0.29 0.22 0.24 0.04 0.06 0.05 0.11
KNA59921 (VCV51_032332)
 0.03 0.02 0.03 0.04 0.02 0.02 0.02 0.05 0.02 0.25 0.01 0.32 1.0 0.01 0.02 0.07 0.08 0.24 0.15 0.02 0.02 0.02 0.06
KNA59922 (VCV51_032333)
 0.06 0.03 0.04 0.05 0.03 0.03 0.03 0.06 0.04 0.14 0.02 0.2 1.0 0.02 0.03 0.06 0.08 0.23 0.2 0.04 0.04 0.05 0.11
KNA59941 (VCV51_032353)
 0.28 0.02 0.15 0.18 0.05 0.1 0.09 0.04 0.21 0.46 0.05 0.34 1.0 0.02 0.04 0.23 0.4 0.1 0.1 0.22 0.17 0.23 0.12
KNA60579 (VCV51_032250)
 0.25 0.02 0.08 0.11 0.04 0.03 0.03 0.04 0.1 0.31 0.05 0.38 1.0 0.02 0.05 0.21 0.35 0.01 0.01 0.12 0.12 0.12 0.02
KNA60740 (VCV51_032180)
 0.2 0.11 0.11 0.12 0.22 0.32 0.34 0.2 0.17 0.87 0.32 0.43 1.0 0.09 0.22 0.31 0.35 0.06 0.07 0.22 0.19 0.2 0.34
KNA60965 (VCV51_031940)
 0.14 0.1 0.05 0.14 0.07 0.12 0.09 0.05 0.08 0.7 0.06 0.22 1.0 0.06 0.67 0.1 0.21 0.16 0.17 0.09 0.08 0.12 0.12
KNA60966 (VCV51_031941)
 0.15 0.11 0.11 0.11 0.1 0.14 0.1 0.07 0.11 0.85 0.05 0.4 1.0 0.08 0.98 0.09 0.18 0.14 0.12 0.1 0.07 0.16 0.17
KNA60967 (VCV51_031942)
 0.07 0.09 0.07 0.12 0.12 0.15 0.15 0.09 0.1 0.48 0.03 0.11 1.0 0.04 0.44 0.05 0.15 0.04 0.03 0.09 0.06 0.14 0.04
KNA60968 (VCV51_031943)
 0.11 0.04 0.03 0.11 0.09 0.14 0.11 0.04 0.04 0.45 0.04 0.03 1.0 0.04 0.02 0.03 0.06 0.11 0.12 0.04 0.03 0.07 0.0
KNA60969 (VCV51_031944)
 0.25 0.09 0.12 0.24 0.14 0.21 0.19 0.11 0.16 0.77 0.1 0.33 1.0 0.08 0.17 0.15 0.25 0.22 0.23 0.15 0.1 0.23 0.28
KNA61002 (VCV51_031977)
 0.32 0.0 0.03 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.32 0.1 0.03 1.0 0.0 0.0 0.43 0.4 0.01 0.01 0.32 0.17 0.31 0.05
KNA61003 (VCV51_031978)
 0.18 0.0 0.02 0.12 0.01 0.01 0.01 0.01 0.16 0.31 0.09 0.02 1.0 0.0 0.0 0.4 0.34 0.04 0.03 0.15 0.09 0.14 0.03
KNA61004 (VCV51_031979)
 0.33 0.0 0.05 0.24 0.01 0.02 0.01 0.01 0.24 0.34 0.09 0.06 1.0 0.0 0.0 0.63 0.53 0.03 0.03 0.25 0.15 0.22 0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)