1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA44435 (VCV51_033951)
 0.17 1.0 0.22 0.15 0.46 0.37 0.4 0.41 0.23 0.75 0.44 0.49 0.54 0.72 0.19 0.51 0.46 0.16 0.18 0.22 0.19 0.19 0.39
KNA48532 (VCV51_030202)
 0.2 0.42 0.2 0.08 0.38 0.29 0.31 0.35 0.13 0.24 0.44 0.4 0.29 0.37 0.46 0.46 0.57 0.13 0.13 0.12 0.17 0.16 1.0
KNA49503 (VCV51_030307)
 0.62 0.27 0.6 0.52 0.16 0.17 0.16 0.14 0.6 0.25 0.28 0.31 0.3 0.22 0.33 0.66 0.79 0.94 1.0 0.5 0.43 0.64 0.37
KNA49658 (VCV51_033774)
 0.7 0.19 0.25 0.35 0.33 0.28 0.36 0.3 0.22 0.75 0.47 0.63 0.66 0.18 0.21 0.91 1.0 0.53 0.66 0.2 0.27 0.31 0.59
KNA49659 (VCV51_033775)
 1.0 0.13 0.26 0.62 0.35 0.35 0.46 0.4 0.4 0.58 0.48 0.37 0.62 0.12 0.52 0.88 1.0 0.5 0.55 0.51 0.43 0.57 0.74
KNA49660 (VCV51_033776)
 0.76 0.22 0.3 0.56 0.47 0.44 0.56 0.45 0.4 0.86 0.44 0.7 0.74 0.18 0.71 0.84 1.0 0.82 0.89 0.39 0.46 0.49 0.5
KNA50303 (VCV51_033682)
 0.37 1.0 0.11 0.23 0.83 0.81 0.79 0.76 0.76 0.85 0.63 0.63 0.87 0.84 0.37 0.54 0.48 0.47 0.53 0.81 0.67 0.82 0.29
KNA50316 (VCV51_031440)
 0.21 0.48 0.12 0.13 0.39 0.38 0.35 0.36 0.38 0.29 0.35 0.32 0.42 0.42 0.19 0.55 0.49 0.3 0.42 0.44 0.28 0.42 1.0
KNA50317 (VCV51_031441)
 0.19 0.15 0.24 0.13 0.38 0.37 0.32 0.35 0.09 0.22 0.22 0.31 0.31 0.12 0.14 0.67 0.67 0.13 0.16 0.12 0.08 0.11 1.0
KNA50381 (VCV51_031413)
 0.31 0.44 0.23 0.3 0.24 0.22 0.25 0.22 0.33 0.62 0.44 0.83 0.61 0.34 0.49 0.57 0.44 0.51 0.57 0.38 0.33 0.41 1.0
KNA51151 (VCV51_031641)
 0.48 1.0 0.28 0.25 0.55 0.59 0.61 0.57 0.55 0.64 0.57 0.68 0.59 0.91 0.57 0.63 0.4 0.55 0.59 0.58 0.63 0.77 0.94
KNA52109 (VCV51_033478)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
KNA52219 (VCV51_033477)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
KNA53054 (VCV51_031580)
 0.21 0.49 0.24 0.16 0.23 0.17 0.2 0.21 0.16 0.4 0.37 0.54 0.32 0.27 0.51 0.35 0.21 0.11 0.18 0.14 0.11 0.17 1.0
KNA53055 (VCV51_031578)
 0.17 0.55 0.24 0.17 0.14 0.15 0.15 0.14 0.2 1.0 0.33 0.42 0.73 0.38 0.66 0.87 0.53 0.15 0.19 0.18 0.16 0.15 0.48
KNA53056 (VCV51_033361)
 0.06 1.0 0.06 0.06 0.03 0.03 0.03 0.03 0.06 0.62 0.29 0.38 0.37 0.71 0.48 0.57 0.36 0.09 0.12 0.05 0.04 0.05 0.15
KNA53057 (VCV51_031574)
 0.2 1.0 0.14 0.2 0.04 0.04 0.05 0.04 0.19 0.84 0.51 0.73 0.52 0.7 0.53 0.78 0.48 0.18 0.21 0.18 0.13 0.16 0.26
KNA53787 (VCV51_033262)
 0.7 0.35 0.6 0.45 0.75 0.68 0.75 0.69 0.32 0.71 0.8 0.65 1.0 0.29 0.76 0.62 0.75 0.36 0.41 0.33 0.47 0.43 0.85
KNA53788 (VCV51_031850)
 0.82 0.65 0.48 0.49 0.56 0.55 0.6 0.52 0.67 0.51 0.69 0.99 0.62 0.58 0.54 0.79 1.0 0.36 0.4 0.64 0.82 0.87 0.95
KNA53789 (VCV51_033263)
 0.71 0.55 0.63 0.38 0.55 0.51 0.56 0.46 0.43 0.32 0.62 1.0 0.44 0.48 0.43 0.54 0.77 0.16 0.19 0.43 0.55 0.61 0.42
KNA53793 (VCV51_031854)
 0.27 0.61 0.46 0.27 0.04 0.04 0.04 0.03 0.19 0.47 0.59 1.0 0.15 0.48 0.86 0.28 0.46 0.03 0.04 0.21 0.24 0.18 0.05
KNA53872 (VCV51_030810)
 0.4 0.6 0.24 0.36 0.59 0.55 0.54 0.51 0.65 0.51 0.37 0.7 0.4 0.62 0.36 0.53 0.49 0.22 0.27 0.56 0.64 0.53 1.0
KNA53875 (HexR)
 0.55 0.32 0.18 0.26 0.5 0.53 0.52 0.47 0.57 0.62 0.34 0.52 0.71 0.28 0.35 0.82 0.68 0.47 0.55 0.65 0.79 0.75 1.0
KNA54641 (VCV51_030738)
 0.7 0.14 0.32 0.52 0.93 0.85 0.82 0.98 0.45 0.09 0.48 0.67 0.12 0.11 0.92 0.67 0.64 0.13 0.13 0.31 0.44 0.43 1.0
KNA54647 (VCV51_033218)
 0.37 0.46 0.21 0.37 0.83 0.71 0.72 0.8 0.59 0.22 0.5 0.66 0.22 0.35 1.0 0.52 0.4 0.29 0.29 0.53 0.45 0.47 0.8
KNA54880 (VCV51_031810)
 0.15 0.18 0.06 0.11 0.01 0.01 0.01 0.01 0.11 0.16 0.17 0.28 0.27 0.12 0.08 0.41 0.62 0.02 0.04 0.13 0.08 0.09 1.0
KNA54881 (VCV51_031809)
 0.29 0.97 0.06 0.18 0.01 0.01 0.01 0.0 0.26 0.31 0.4 0.36 0.46 0.77 0.91 0.6 1.0 0.2 0.31 0.31 0.21 0.26 0.75
KNA54884 (VCV51_031807)
 0.49 0.56 0.26 0.28 0.49 0.4 0.44 0.48 0.57 0.26 0.54 0.67 0.27 0.51 0.52 0.58 0.8 0.44 0.44 0.55 0.51 0.72 1.0
KNA54901 (FtsN)
 0.53 0.32 0.32 0.28 0.24 0.24 0.24 0.22 0.38 0.23 0.41 0.83 0.29 0.3 0.4 0.86 1.0 0.63 0.68 0.36 0.43 0.48 0.6
KNA54906 (VCV51_031791)
 0.39 0.5 0.24 0.27 0.36 0.33 0.39 0.34 0.35 0.36 0.35 1.0 0.31 0.5 0.44 0.66 0.92 0.83 0.96 0.33 0.36 0.39 0.74
KNA54933 (VCV51_033141)
 0.44 0.39 0.37 0.37 0.53 0.41 0.4 0.38 0.64 0.39 0.24 0.23 0.6 0.38 0.33 0.6 0.88 0.49 0.56 0.61 0.55 0.55 1.0
KNA54946 (VCV51_031761)
 0.27 0.51 0.15 0.2 0.45 0.45 0.45 0.45 0.23 0.24 0.51 0.5 0.21 0.52 0.55 0.32 0.38 0.23 0.24 0.22 0.3 0.26 1.0
KNA55005 (VCV51_031732)
 0.18 0.8 0.63 0.22 0.18 0.18 0.19 0.16 0.3 0.72 1.0 0.98 0.53 0.54 0.51 0.51 0.41 0.15 0.22 0.32 0.2 0.16 0.62
KNA55086 (VCV51_031847)
 0.5 0.44 0.31 0.47 0.2 0.2 0.21 0.21 0.38 0.52 0.49 0.86 0.72 0.5 0.32 0.76 1.0 0.4 0.45 0.37 0.99 0.49 0.55
KNA55121 (VCV51_031822)
 0.41 0.43 0.16 0.24 0.26 0.24 0.26 0.26 0.23 0.48 0.52 0.72 0.52 0.3 0.56 0.81 1.0 0.5 0.58 0.25 0.25 0.28 0.84
KNA55223 (VCV51_031068)
 0.42 0.16 0.04 0.3 0.17 0.18 0.19 0.16 0.87 0.33 0.25 0.4 0.37 0.15 0.3 0.38 0.36 0.29 0.34 0.7 0.8 1.0 0.42
KNA55224 (VCV51_031069)
 0.25 0.26 0.06 0.17 0.22 0.22 0.22 0.21 0.4 0.26 0.28 0.29 0.23 0.26 1.0 0.33 0.29 0.27 0.29 0.34 0.32 0.47 0.32
KNA55225 (VCV51_031070)
 0.34 0.3 0.23 0.28 0.2 0.22 0.23 0.2 0.39 0.58 0.4 0.51 0.69 0.28 1.0 0.85 0.84 0.26 0.37 0.42 0.31 0.42 0.51
KNA55226 (VCV51_031071)
 0.46 0.28 0.28 0.42 0.28 0.22 0.26 0.24 0.29 0.52 0.37 0.6 0.7 0.27 1.0 0.93 0.88 0.2 0.25 0.31 0.22 0.3 0.41
KNA55227 (VCV51_031072)
 0.29 0.72 0.08 0.2 0.55 0.63 0.64 0.61 0.63 0.38 0.71 0.46 0.41 0.69 0.49 0.75 0.56 0.57 0.61 0.57 0.44 0.63 1.0
KNA55249 (VCV51_033062)
 0.32 0.41 0.41 0.13 0.23 0.3 0.36 0.19 0.21 0.35 0.42 0.37 0.45 0.32 0.31 0.4 0.37 0.06 0.09 0.21 0.18 0.39 1.0
KNA55355 (VCV51_031047)
 0.53 0.23 0.15 0.34 0.5 0.53 0.52 0.43 0.79 0.76 0.23 0.63 0.68 0.23 0.16 0.79 0.71 0.49 0.55 0.65 0.69 0.71 1.0
KNA55686 (VCV51_033024)
 0.33 0.72 0.29 0.31 0.55 0.59 0.6 0.54 0.98 0.48 0.62 0.54 0.47 0.64 0.5 0.62 0.53 0.58 0.65 0.86 0.81 0.69 1.0
KNA55995 (VCV51_032999)
 0.28 0.22 0.1 0.21 0.3 0.25 0.27 0.23 0.37 0.31 0.21 0.35 0.44 0.18 0.15 0.49 0.45 0.31 0.31 0.35 0.31 0.4 1.0
KNA56283 (VCV51_032901)
 0.41 0.72 0.29 0.23 1.0 0.92 0.98 0.91 0.63 0.89 0.65 0.84 0.84 0.72 0.68 0.26 0.24 0.43 0.5 0.61 0.52 0.72 0.41
KNA56378 (VCV51_032943)
 0.75 0.26 0.42 0.76 0.92 0.78 0.78 0.89 0.45 0.42 0.72 0.84 0.38 0.27 0.41 0.5 0.55 0.22 0.24 0.47 0.52 0.47 1.0
KNA56379 (VCV51_032944)
 0.2 0.38 0.06 0.14 0.08 0.08 0.09 0.08 0.51 0.25 0.32 0.48 0.52 0.36 0.24 0.39 0.43 0.09 0.12 0.44 0.36 0.42 1.0
KNA57443 (MutH)
 0.41 0.61 0.16 0.26 0.4 0.48 0.49 0.42 1.0 0.84 0.71 0.99 0.81 0.61 0.73 0.65 0.68 0.59 0.61 0.84 0.6 0.84 0.87
KNA57616 (VCV51_030427)
 0.29 0.07 0.12 0.3 0.37 0.38 0.36 0.37 0.15 0.37 0.17 0.43 0.33 0.06 0.53 0.4 0.44 0.36 0.32 0.15 0.15 0.15 1.0
KNA58251 (VCV51_032759)
 0.34 0.4 0.2 0.19 0.68 0.83 0.85 0.64 0.68 0.3 0.21 0.56 0.26 0.33 0.59 0.45 0.4 0.33 0.37 0.64 0.29 0.88 1.0
KNA58521 (VCV51_032720)
 0.41 0.32 0.11 0.26 0.41 0.46 0.44 0.37 0.72 0.49 0.23 0.48 0.59 0.32 0.08 0.83 0.7 0.26 0.3 0.64 0.55 0.65 1.0
KNA58954 (VCV51_031245)
 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.29 0.75 0.77 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
KNA59418 (NhaB)
 0.39 0.73 0.16 0.22 0.35 0.38 0.39 0.3 0.32 0.31 0.48 0.55 0.46 0.74 0.17 0.59 0.51 0.26 0.37 0.31 0.24 0.41 1.0
KNA59437 (VCV51_032603)
 0.56 0.34 0.18 0.23 0.28 0.33 0.35 0.23 0.37 0.58 0.33 0.54 0.42 0.26 0.41 0.45 0.38 0.31 0.31 0.82 0.31 1.0 0.86
KNA59649 (NhaC)
 0.32 0.28 0.2 0.2 0.05 0.04 0.04 0.05 0.15 0.39 0.73 0.73 0.34 0.22 0.36 0.69 0.53 0.03 0.04 0.19 0.2 0.17 1.0
KNA59651 (VCV51_031365)
 0.15 0.23 0.05 0.11 0.15 0.14 0.15 0.15 0.13 0.18 0.2 0.24 0.24 0.23 0.12 0.32 0.32 0.13 0.17 0.16 0.14 0.13 1.0
KNA59657 (VCV51_031358)
 0.42 0.58 0.22 0.3 0.76 0.7 0.67 0.76 0.6 0.43 0.44 0.49 0.37 0.61 0.37 0.77 0.54 0.16 0.18 0.49 0.52 0.54 1.0
KNA59670 (VCV51_031352)
 0.13 0.08 0.04 0.13 0.41 0.36 0.4 0.36 0.1 0.31 0.19 0.2 0.19 0.06 0.08 0.35 0.35 0.22 0.26 0.08 0.06 0.09 1.0
KNA59851 (VCV51_032262)
 0.08 0.18 0.01 0.07 0.17 0.18 0.23 0.18 0.16 0.05 0.25 0.32 0.06 0.18 0.05 0.06 0.08 0.06 0.09 0.13 0.14 0.12 1.0
KNA60529 (VCV51_032200)
 0.23 0.1 0.22 0.19 0.09 0.12 0.11 0.05 0.19 0.67 0.34 0.49 0.41 0.08 0.03 0.22 0.34 0.26 0.42 0.18 0.11 0.21 1.0
KNA60530 (VCV51_032201)
 0.07 0.02 0.02 0.06 0.05 0.06 0.06 0.02 0.03 0.19 0.32 0.09 0.21 0.02 0.01 0.04 0.06 0.33 0.46 0.03 0.03 0.04 1.0
KNA60531 (VCV51_032202)
 0.04 0.01 0.01 0.03 0.05 0.06 0.06 0.02 0.02 0.13 0.11 0.07 0.15 0.01 0.01 0.02 0.03 0.25 0.39 0.01 0.01 0.02 1.0
KNA60730 (VCV51_032169)
 0.19 0.9 0.19 0.16 0.04 0.04 0.04 0.04 0.16 0.6 1.0 0.79 0.31 0.54 0.94 0.11 0.11 0.13 0.25 0.19 0.19 0.2 0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)