Heatmap: Cluster_8 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
GCGS0457,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,60min+PMN
FA1090,L-log,from bact
GCGS1095,reduced ceftriaxone suscept
from N. gon mtr mut mosiac transformant
WT,from L-log cell cultures
from lab,SP319,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,0min+PMN
from lab,SP316,reduced ceftriaxone suscept
FA1090cpxR::erm,L-log,from bact
FA1090 GCM77,strain+mut,untreated
GCGS1014,reduced ceftriaxone suscept
from urethra,test for azithromycin resist
FA1090/H041,60min
WT parent,FA19 WT,from p-log cells
WT,FA19,from p-L-log cells
overexp mtrCDE,FA19,from p-L-log cells
FA1090 GCM77,strain+mut,H2O2
FA1090cpxA::kan,L-log,from bact
from p-cells
AKP14144 (aruC)
0.51 0.63 0.49 0.53 0.45 0.88 0.47 0.39 0.43 0.22 0.34 0.4 0.98 0.8 1.0 0.84 0.93 0.33 0.4 0.62
AKP14179 (mutM)
0.3 0.36 0.34 0.6 0.31 0.87 0.41 0.29 0.51 0.11 0.14 0.42 1.0 0.48 0.73 0.82 0.94 0.18 0.23 0.33
AKP14193 (rlmN)
0.63 0.62 0.14 0.59 0.7 0.72 0.5 0.68 0.48 0.12 0.47 0.4 1.0 0.63 0.59 0.68 0.76 0.5 0.11 0.85
AKP14271 (WX61_00182)
0.06 0.05 0.05 0.44 0.2 0.72 0.15 0.11 0.16 0.04 0.01 0.48 1.0 0.1 0.63 0.6 0.9 0.03 0.03 0.13
AKP14326 (ribA)
0.49 0.91 0.2 0.7 0.47 0.89 0.6 0.66 0.45 0.11 0.35 0.32 1.0 0.62 0.59 0.89 0.89 0.32 0.17 0.54
AKP14354 (WX61_00266)
0.41 0.35 0.39 0.38 0.32 0.5 0.28 0.33 0.23 0.23 0.1 0.31 1.0 0.5 0.75 0.45 0.59 0.11 0.31 0.38
AKP14361 (WX61_00273)
0.84 0.63 0.21 0.54 0.79 0.89 0.64 0.62 0.65 0.11 0.52 0.54 1.0 0.71 0.78 0.83 0.98 0.53 0.17 0.7
AKP14396 (parE)
0.45 0.33 0.23 0.38 0.41 0.59 0.34 0.29 0.3 0.16 0.45 0.28 1.0 0.37 0.41 0.56 0.62 0.36 0.18 0.2
AKP14405 (folP)
0.2 0.21 0.11 0.39 0.2 0.81 0.31 0.18 0.24 0.05 0.13 0.26 0.56 0.23 0.7 0.69 1.0 0.18 0.1 0.26
AKP14406 (aroF)
0.39 0.58 0.16 0.65 0.36 0.68 0.51 0.56 0.5 0.1 0.14 0.4 1.0 0.62 0.72 0.63 0.77 0.2 0.15 0.3
AKP14488 (nqrB)
0.37 0.51 0.09 0.38 0.59 0.87 0.3 0.51 0.26 0.22 0.5 0.34 0.82 0.49 0.65 0.79 1.0 0.33 0.12 0.51
AKP14553 (yflS)
0.67 0.65 0.3 0.68 0.61 0.7 0.71 0.55 0.82 0.32 0.32 0.77 0.8 0.62 0.84 0.65 0.78 0.36 0.23 1.0
AKP14555 (speA)
0.47 0.62 0.42 0.53 0.45 0.7 0.46 0.53 0.56 0.36 0.47 0.47 0.9 0.56 0.58 0.72 0.66 0.39 0.3 1.0
AKP14600 (ftsA)
0.57 0.78 0.25 1.0 0.59 0.87 0.8 0.74 0.85 0.47 0.39 0.81 0.65 0.64 0.83 0.79 1.0 0.34 0.22 0.64
AKP14614 (ftsL)
0.33 0.46 0.43 0.36 0.32 0.32 0.44 0.38 0.38 0.22 0.16 0.53 1.0 0.38 0.69 0.29 0.36 0.21 0.21 0.45
AKP14640 (WX61_00561)
0.13 0.31 0.52 0.53 0.38 0.19 0.57 0.34 0.44 0.08 0.06 0.45 1.0 0.49 0.82 0.13 0.28 0.09 0.32 0.05
AKP14809 (outO)
0.37 0.53 0.37 0.4 0.54 0.57 0.37 0.59 0.31 0.31 0.25 0.39 1.0 0.32 0.32 0.57 0.58 0.23 0.38 0.26
AKP14814 (ispB)
0.9 0.58 0.32 0.65 0.44 0.49 0.56 0.63 0.54 0.23 0.56 0.57 1.0 0.56 0.71 0.55 0.41 0.64 0.32 0.5
AKP14825 (mepM)
0.38 0.6 0.23 0.63 0.43 0.91 0.52 0.37 0.49 0.17 0.14 0.47 0.97 0.73 0.91 0.84 1.0 0.16 0.23 0.38
AKP14839 (ffh)
0.38 0.42 0.2 0.5 0.54 0.81 0.44 0.49 0.38 0.17 0.33 0.37 1.0 0.45 0.77 0.85 0.75 0.35 0.2 0.36
AKP14851 (ygdH)
0.45 0.63 0.18 0.88 0.39 0.93 0.71 0.56 0.9 0.13 0.25 0.9 0.78 0.5 0.89 1.0 0.83 0.23 0.17 0.39
AKP14854 (lptD)
0.65 0.52 0.26 0.5 0.51 0.8 0.44 0.57 0.34 0.16 0.48 0.4 1.0 0.46 0.83 0.74 0.88 0.52 0.23 0.38
AKP14864 (WX61_00797)
0.56 0.53 0.25 0.6 0.28 0.97 0.58 0.47 0.5 0.18 0.44 0.35 0.59 0.52 0.87 1.0 0.92 0.57 0.17 0.43
AKP14874 (xseB)
0.3 0.51 0.13 0.28 0.26 0.92 0.26 0.42 0.26 0.29 0.29 0.3 0.62 0.45 1.0 0.89 0.97 0.29 0.12 0.07
AKP14875 (ispA)
0.44 0.45 0.11 0.44 0.38 0.68 0.42 0.41 0.39 0.19 0.31 0.37 1.0 0.44 0.47 0.73 0.62 0.33 0.1 0.26
AKP14932 (ligA_1)
0.37 0.68 0.3 0.53 0.73 0.73 0.44 0.67 0.47 0.17 0.48 0.52 1.0 0.51 0.41 0.77 0.68 0.41 0.31 0.12
AKP14975 (rsmI_1)
0.69 0.64 0.19 0.65 0.74 0.97 0.87 0.76 0.91 0.13 0.31 0.73 0.89 0.54 0.77 0.94 1.0 0.28 0.16 0.29
AKP15013 (prfB)
0.84 0.71 0.37 0.74 0.4 0.86 0.64 0.66 0.64 0.4 0.7 0.53 1.0 0.84 0.77 0.89 0.81 0.69 0.35 0.5
AKP15051 (yccS)
0.52 0.52 0.41 0.9 0.39 0.86 0.87 0.34 0.67 0.22 0.39 0.61 0.7 0.5 0.46 0.76 1.0 0.35 0.4 0.06
AKP15174 (WX61_01121)
0.39 0.32 0.22 0.45 0.33 0.45 0.43 0.29 0.78 0.08 0.02 0.4 1.0 0.54 0.56 0.39 0.55 0.06 0.18 0.19
AKP15182 (rluC)
0.45 0.41 0.13 0.36 0.41 0.67 0.3 0.48 0.25 0.13 0.46 0.3 0.76 0.49 1.0 0.65 0.72 0.43 0.13 0.42
AKP15223 (cysW_1)
0.42 0.43 0.12 0.58 0.36 0.98 0.46 0.35 0.49 0.12 0.03 0.54 0.8 0.4 0.74 0.97 1.0 0.04 0.12 0.41
AKP15227 (rlmH)
0.47 0.27 0.15 0.4 0.43 0.91 0.38 0.23 0.37 0.09 0.23 0.39 0.7 0.32 0.5 0.85 1.0 0.28 0.14 0.26
AKP15252 (mnmE)
0.71 0.48 0.31 0.59 0.35 0.71 0.55 0.47 0.57 0.18 0.22 0.5 1.0 0.45 0.7 0.68 0.75 0.23 0.31 0.09
AKP15303 (rsmE)
0.29 0.37 0.29 0.38 0.33 0.44 0.37 0.3 0.4 0.18 0.18 0.32 1.0 0.32 0.46 0.42 0.47 0.2 0.24 0.14
AKP15304 (suhB_2)
0.28 0.49 0.23 0.38 0.27 0.56 0.34 0.38 0.36 0.14 0.06 0.31 0.87 0.42 1.0 0.56 0.56 0.07 0.23 0.41
AKP15305 (WX61_01256)
0.52 0.81 0.17 0.31 0.89 0.68 0.38 1.0 0.37 0.16 0.62 0.44 0.89 0.31 0.17 0.69 0.66 0.47 0.11 0.17
AKP15325 (dnaN)
0.47 0.77 0.07 0.57 0.57 0.94 0.54 0.78 0.52 0.06 0.61 0.6 0.78 0.78 0.92 0.91 1.0 0.81 0.07 0.54
AKP15340 (fhuE)
0.27 0.41 0.08 0.45 0.26 0.5 0.28 0.38 0.28 0.06 0.08 0.36 1.0 0.43 0.84 0.53 0.46 0.11 0.08 0.06
AKP15344 (WX61_01296)
0.7 0.76 0.02 0.68 0.51 0.92 0.64 0.57 0.56 0.15 0.45 0.6 0.5 0.79 1.0 0.95 0.87 0.49 0.02 0.32
AKP15356 (hemL)
0.44 0.6 0.1 0.54 0.41 0.97 0.48 0.61 0.44 0.08 0.64 0.38 0.97 0.6 0.96 0.95 1.0 0.71 0.1 0.35
AKP15374 (hpaC)
0.28 0.42 0.29 0.25 0.35 0.68 0.2 0.45 0.18 0.08 0.09 0.19 1.0 0.2 0.29 0.62 0.76 0.07 0.23 0.11
AKP15375 (rmlA)
0.27 0.76 0.17 0.43 0.35 0.86 0.28 0.76 0.23 0.05 0.26 0.23 1.0 0.43 0.44 0.82 0.9 0.33 0.16 0.32
AKP15379 (oatA_2)
0.3 0.49 0.16 0.34 0.4 0.77 0.3 0.59 0.22 0.07 0.22 0.23 1.0 0.24 0.54 0.84 0.66 0.21 0.14 0.1
AKP15383 (ileS)
0.56 0.77 0.2 0.89 0.52 0.99 0.69 0.86 0.58 0.16 0.52 0.69 1.0 0.71 0.85 0.98 0.99 0.5 0.16 0.65
AKP15394 (dnaE)
0.85 0.55 0.15 0.65 0.78 0.98 0.61 0.55 0.47 0.13 0.74 0.54 1.0 0.5 0.97 0.99 0.96 0.7 0.12 0.36
AKP15397 (WX61_01350)
0.46 0.46 0.2 0.43 0.35 0.69 0.38 0.51 0.39 0.08 0.22 0.32 0.64 0.39 1.0 0.68 0.7 0.22 0.15 0.09
AKP15428 (qseB)
0.23 0.19 0.17 0.34 0.28 0.51 0.3 0.17 0.34 0.06 0.06 0.24 1.0 0.18 0.26 0.46 0.58 0.06 0.12 0.35
AKP15526 (ilvI)
0.28 0.42 0.16 0.57 0.43 0.54 0.48 0.36 0.48 0.13 0.15 0.51 0.78 0.33 0.42 0.53 0.57 0.15 0.14 1.0
AKP15539 (WX61_01499)
0.45 0.4 0.36 0.3 0.51 0.77 0.28 0.5 0.3 0.18 0.07 0.25 0.64 0.49 1.0 0.69 0.88 0.14 0.22 0.34
AKP15542 (glpR)
0.54 0.49 0.15 0.55 0.52 0.6 0.46 0.55 0.43 0.09 0.59 0.4 1.0 0.54 0.92 0.58 0.62 0.65 0.12 0.29
AKP15574 (ppsR)
0.39 0.47 0.37 0.87 0.38 0.94 0.65 0.34 0.69 0.17 0.14 0.77 0.86 0.63 0.85 1.0 0.86 0.16 0.28 0.73
AKP15651 (WX61_01613)
0.36 0.51 0.15 0.65 0.47 0.57 0.65 0.38 0.73 0.09 0.09 0.48 1.0 0.54 0.52 0.54 0.62 0.09 0.12 0.2
AKP15679 (pheT)
0.35 0.86 0.27 0.39 0.62 0.98 0.37 0.62 0.39 0.39 0.43 0.3 0.69 0.6 0.77 1.0 0.96 0.37 0.24 0.45
AKP15713 (dapF)
0.55 0.46 0.23 0.51 0.51 0.61 0.45 0.41 0.48 0.15 0.3 0.42 0.95 0.52 1.0 0.6 0.62 0.29 0.19 0.61
AKP15720 (mtnN)
0.49 0.63 0.17 0.39 0.3 0.89 0.32 0.58 0.28 0.13 0.23 0.28 0.54 0.6 1.0 0.86 0.94 0.25 0.14 0.21
AKP15758 (ftsH)
0.74 0.64 0.21 0.8 0.72 0.88 0.82 0.64 0.66 0.4 0.44 0.78 1.0 0.62 0.73 0.91 0.83 0.83 0.2 0.83
AKP15780 (WX61_01745)
0.1 0.52 0.04 0.18 0.66 0.96 0.16 0.44 0.23 0.2 0.58 0.2 0.66 0.38 1.0 0.95 0.98 0.53 0.03 0.32
AKP15783 (hsdR_1)
0.34 0.68 0.14 0.81 0.79 0.79 0.74 0.7 0.74 0.26 0.55 0.76 0.92 0.59 1.0 0.77 0.82 0.52 0.09 0.73
AKP15801 (WX61_01766)
0.67 0.51 0.13 0.49 0.47 0.54 0.48 0.55 0.47 0.17 0.37 0.39 1.0 0.43 0.78 0.59 0.47 0.38 0.12 0.16
AKP15812 (WX61_01778)
0.45 0.63 0.3 0.74 0.38 1.0 0.52 0.49 0.5 0.21 0.43 0.43 0.77 0.44 0.97 1.0 0.99 0.45 0.3 0.54
AKP15835 (intA_1)
0.43 0.47 0.24 0.74 0.44 0.78 0.87 0.38 0.95 0.14 0.08 0.68 0.6 0.27 0.77 0.63 1.0 0.09 0.2 0.5
AKP15872 (WX61_01842)
0.32 0.07 0.01 0.45 0.2 0.8 0.42 0.05 0.34 0.0 0.02 0.35 0.89 0.09 0.4 0.66 1.0 0.03 0.01 0.1
AKP15890 (WX61_01860)
0.19 0.36 0.34 0.16 0.38 0.74 0.12 0.37 0.12 0.1 0.14 0.09 1.0 0.42 0.71 0.67 0.85 0.16 0.24 0.15
AKP15939 (ssb)
0.48 0.58 0.18 0.41 0.55 0.99 0.4 0.54 0.3 0.34 0.57 0.25 0.78 0.51 0.62 0.99 1.0 0.49 0.2 0.34
AKP15981 (virF)
0.36 0.49 0.07 0.44 0.29 0.56 0.38 0.48 0.38 0.04 0.08 0.34 0.74 0.51 1.0 0.54 0.59 0.08 0.05 0.14
AKP16021 (WX61_01994)
0.83 0.49 0.19 0.59 0.49 0.63 0.53 0.54 0.55 0.13 0.46 0.46 1.0 0.42 0.52 0.6 0.68 0.37 0.16 0.15
AKP16030 (metX)
0.48 0.45 0.32 0.42 0.4 0.9 0.37 0.43 0.32 0.18 0.51 0.34 0.77 0.62 1.0 0.94 0.84 0.48 0.24 0.36
AKP16037 (pdhD)
0.54 0.73 0.27 0.57 0.47 0.97 0.53 0.42 0.44 0.17 0.41 0.34 0.7 0.48 0.69 0.95 1.0 0.82 0.24 0.33
AKP16102 (folB)
0.33 0.24 0.28 0.53 0.31 0.83 0.46 0.16 0.49 0.06 0.03 0.46 0.76 0.22 0.84 0.71 1.0 0.03 0.27 0.25
AKP16131 (accA)
0.6 0.5 0.14 0.45 0.51 0.51 0.42 0.61 0.42 0.08 0.41 0.32 1.0 0.44 0.94 0.5 0.53 0.42 0.08 0.37
AKP16147 (nnr)
0.5 0.49 0.26 0.78 0.35 0.84 0.69 0.44 0.75 0.13 0.3 0.64 0.94 0.5 1.0 0.79 0.91 0.37 0.2 0.42
AKP16166 (hom)
0.37 0.28 0.13 0.36 0.45 0.94 0.38 0.27 0.41 0.08 0.36 0.25 0.9 0.29 0.73 0.9 1.0 0.37 0.09 0.31
AKP16180 (uup_2)
0.7 0.63 0.31 0.58 0.67 0.89 0.52 0.64 0.54 0.23 0.69 0.52 1.0 0.5 0.66 0.94 0.82 0.63 0.23 0.43
AKP16196 (WX61_02172)
0.7 0.29 0.26 0.42 0.38 0.51 0.37 0.3 0.38 0.15 0.2 0.3 1.0 0.46 0.49 0.47 0.58 0.23 0.22 0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)