Heatmap: Cluster_10 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
GCGS0457,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,60min+PMN
FA1090,L-log,from bact
GCGS1095,reduced ceftriaxone suscept
from N. gon mtr mut mosiac transformant
WT,from L-log cell cultures
from lab,SP319,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,0min+PMN
from lab,SP316,reduced ceftriaxone suscept
FA1090cpxR::erm,L-log,from bact
FA1090 GCM77,strain+mut,untreated
GCGS1014,reduced ceftriaxone suscept
from urethra,test for azithromycin resist
FA1090/H041,60min
WT parent,FA19 WT,from p-log cells
WT,FA19,from p-L-log cells
overexp mtrCDE,FA19,from p-L-log cells
FA1090 GCM77,strain+mut,H2O2
FA1090cpxA::kan,L-log,from bact
from p-cells
AKP14150 (WX61_00061)
0.34 0.11 0.25 0.54 0.2 0.03 0.55 0.23 0.59 0.16 0.05 1.0 0.12 0.08 0.07 0.03 0.02 0.06 0.17 0.16
AKP14153 (iscS)
0.21 0.33 0.06 0.32 0.14 0.1 0.32 0.43 0.29 0.02 0.17 0.22 0.55 0.12 0.05 0.09 0.11 1.0 0.06 0.06
AKP14155 (vbhT)
0.54 0.46 0.22 0.77 0.31 0.04 0.92 0.8 0.98 0.06 0.1 1.0 0.17 0.14 0.07 0.05 0.04 0.55 0.32 0.21
AKP14156 (iscU)
0.45 0.61 0.09 0.59 0.28 0.12 0.66 0.74 0.72 0.06 0.32 0.62 0.38 0.26 0.07 0.12 0.11 1.0 0.1 0.16
AKP14159 (WX61_00070)
0.17 0.33 0.24 0.27 0.15 0.13 0.24 0.46 0.26 0.03 0.29 0.19 0.41 0.14 0.13 0.12 0.14 1.0 0.13 0.07
AKP14167 (WX61_00078)
0.77 0.29 0.11 0.88 0.4 0.27 0.82 0.33 0.54 0.18 0.18 1.0 0.42 0.21 0.39 0.31 0.22 0.21 0.06 0.43
AKP14269 (WX61_00180)
0.12 1.0 0.0 0.44 0.33 0.31 0.46 0.76 0.21 0.0 0.02 0.2 0.99 0.93 0.4 0.32 0.3 0.04 0.0 0.12
AKP14287 (WX61_00198)
0.18 1.0 0.06 0.32 0.53 0.24 0.25 0.6 0.41 0.03 0.04 0.25 0.78 0.59 0.17 0.2 0.29 0.09 0.02 0.14
AKP14288 (WX61_00199)
0.17 1.0 0.08 0.26 0.43 0.21 0.3 0.6 0.74 0.05 0.07 0.67 0.52 0.57 0.11 0.14 0.31 0.09 0.04 0.06
AKP14289 (WX61_00200)
0.09 1.0 0.03 0.13 0.46 0.1 0.04 0.63 0.21 0.03 0.0 0.22 0.44 0.49 0.01 0.08 0.12 0.03 0.04 0.12
AKP14290 (WX61_00201)
0.37 0.56 0.05 0.63 0.4 0.11 0.51 0.43 0.67 0.02 0.07 1.0 0.29 0.43 0.1 0.11 0.1 0.11 0.02 0.14
AKP14291 (WX61_00202)
0.24 0.8 0.21 1.0 0.57 0.21 0.67 0.56 0.6 0.16 0.06 0.9 0.98 0.56 0.18 0.17 0.27 0.08 0.17 0.45
AKP14292 (WX61_00203)
0.11 1.0 0.12 0.3 0.38 0.24 0.26 0.52 0.27 0.06 0.12 0.37 0.59 0.62 0.21 0.22 0.27 0.16 0.09 0.14
AKP14293 (WX61_00204)
0.22 1.0 0.29 0.51 0.42 0.55 0.48 0.56 0.34 0.08 0.09 0.63 0.67 0.53 0.72 0.42 0.75 0.1 0.2 0.2
AKP14294 (WX61_00205)
0.17 1.0 0.85 0.53 0.41 0.39 0.3 0.83 0.51 0.31 0.05 0.24 0.61 0.57 0.71 0.3 0.53 0.03 0.66 0.15
AKP14311 (WX61_00222)
0.39 0.5 1.0 0.9 0.1 0.33 0.94 0.82 0.56 0.1 0.41 0.49 0.43 0.42 0.47 0.23 0.48 0.52 0.53 0.14
AKP14314 (WX61_00225)
0.61 1.0 0.0 0.25 0.32 0.45 0.23 0.31 0.16 0.0 0.01 0.23 0.22 0.74 0.07 0.2 0.82 0.02 0.0 0.11
AKP14315 (WX61_00226)
0.23 0.58 0.03 0.15 0.44 0.69 0.12 0.17 0.11 0.01 0.01 0.15 0.2 0.4 0.22 0.49 1.0 0.03 0.02 0.21
AKP14316 (WX61_00227)
0.21 0.85 0.14 0.1 0.36 0.69 0.06 0.35 0.15 0.09 0.01 0.06 0.59 0.58 0.05 0.48 1.0 0.03 0.11 0.22
AKP14317 (WX61_00228)
0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.24 1.0 0.0 0.0 0.2
AKP14349 (serC)
0.82 0.61 0.34 1.0 0.64 0.28 0.91 0.5 0.92 0.35 0.55 0.94 0.53 0.67 0.66 0.27 0.28 0.53 0.29 0.57
AKP14359 (lrp_1)
0.57 0.32 0.48 0.62 0.62 0.03 0.88 0.7 0.66 0.11 0.05 1.0 0.2 0.08 0.05 0.04 0.02 0.07 0.33 0.22
AKP14410 (WX61_00327)
0.59 0.6 0.36 0.9 0.39 0.24 0.73 0.89 0.83 0.25 0.25 1.0 0.25 0.39 0.21 0.24 0.24 0.23 0.3 0.46
AKP14454 (WX61_00372)
0.63 0.27 0.17 0.67 0.19 0.05 1.0 0.43 0.76 0.41 0.02 0.71 0.12 0.32 0.08 0.06 0.03 0.04 0.13 0.25
AKP14480 (WX61_00398)
0.56 0.36 0.13 1.0 0.36 0.15 0.89 0.48 0.79 0.14 0.01 0.95 0.25 0.2 0.39 0.16 0.13 0.01 0.16 0.93
AKP14542 (WX61_00461)
0.49 0.66 0.66 0.88 0.52 0.24 0.86 0.79 1.0 0.34 0.21 0.93 0.55 0.46 0.39 0.29 0.17 0.15 0.51 0.34
AKP14543 (WX61_00462)
0.48 0.62 0.72 1.0 0.54 0.34 0.88 0.79 0.92 0.38 0.08 0.77 0.78 0.66 0.53 0.28 0.42 0.09 0.48 0.4
AKP14549 (WX61_00468)
0.5 0.5 0.2 0.89 0.46 0.14 0.84 0.63 0.92 0.24 0.07 1.0 0.27 0.32 0.48 0.16 0.1 0.07 0.17 0.48
AKP14570 (WX61_00489)
1.0 0.64 0.2 0.87 0.52 0.34 0.83 0.72 0.89 0.23 0.44 0.98 0.58 0.46 0.59 0.34 0.35 0.55 0.17 0.86
AKP14659 (WX61_00580)
0.63 0.27 0.17 0.67 0.19 0.05 1.0 0.43 0.76 0.41 0.02 0.71 0.12 0.32 0.08 0.06 0.03 0.04 0.13 0.25
AKP14684 (WX61_00606)
0.46 0.6 0.18 0.99 0.43 0.24 0.76 0.63 0.85 0.12 0.3 1.0 0.71 0.63 0.17 0.2 0.29 0.43 0.21 0.71
AKP14691 (WX61_00613)
0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.24 1.0 0.0 0.0 0.2
AKP14692 (WX61_00614)
0.21 0.85 0.14 0.1 0.36 0.69 0.06 0.35 0.15 0.09 0.01 0.06 0.59 0.58 0.05 0.48 1.0 0.03 0.11 0.22
AKP14693 (WX61_00615)
0.23 0.58 0.03 0.15 0.44 0.69 0.12 0.17 0.11 0.01 0.01 0.15 0.2 0.4 0.22 0.49 1.0 0.03 0.02 0.21
AKP14694 (WX61_00616)
0.61 1.0 0.0 0.25 0.32 0.45 0.23 0.31 0.16 0.0 0.01 0.23 0.22 0.74 0.07 0.2 0.82 0.02 0.0 0.11
AKP14714 (WX61_00636)
0.41 0.11 0.0 0.69 0.25 0.02 0.69 0.11 0.73 0.0 0.08 1.0 0.0 0.15 0.04 0.01 0.02 0.07 0.0 0.0
AKP14716 (WX61_00638)
0.37 0.51 0.0 1.0 0.11 0.43 0.8 0.75 0.91 0.0 0.1 0.76 0.0 0.44 0.68 0.52 0.3 0.11 0.0 0.02
AKP14723 (WX61_00645)
0.32 0.24 0.68 1.0 0.25 0.03 0.71 0.37 0.79 0.13 0.39 0.81 0.42 0.14 0.04 0.03 0.03 0.38 0.39 0.08
AKP14740 (WX61_00663)
0.41 0.11 0.0 0.69 0.25 0.02 0.69 0.11 0.73 0.0 0.08 1.0 0.0 0.15 0.04 0.01 0.02 0.07 0.0 0.0
AKP14777 (eptB)
0.98 0.5 0.2 0.91 0.44 0.32 0.93 0.74 1.0 0.17 0.34 0.88 0.79 0.53 0.44 0.31 0.34 0.38 0.13 0.46
AKP14780 (WX61_00707)
0.41 0.11 0.0 0.69 0.25 0.02 0.69 0.11 0.73 0.0 0.08 1.0 0.0 0.15 0.04 0.01 0.02 0.07 0.0 0.0
AKP14782 (WX61_00709)
0.37 0.51 0.0 1.0 0.11 0.43 0.8 0.75 0.91 0.0 0.1 0.76 0.0 0.44 0.68 0.52 0.3 0.11 0.0 0.02
AKP14790 (WX61_00717)
0.12 1.0 0.0 0.44 0.33 0.31 0.46 0.76 0.21 0.0 0.02 0.2 0.99 0.93 0.4 0.32 0.3 0.04 0.0 0.12
AKP14824 (yhhQ)
0.24 0.83 0.26 0.73 0.34 0.28 0.76 1.0 0.84 0.19 0.74 0.56 0.88 0.64 0.27 0.3 0.26 0.77 0.24 0.09
AKP14841 (WX61_00774)
0.6 0.45 0.02 0.68 0.38 0.16 0.76 0.48 0.78 0.01 0.13 1.0 0.27 0.25 0.22 0.18 0.14 0.12 0.02 0.11
AKP14849 (oatA_1)
0.54 0.75 0.08 1.0 0.42 0.33 0.53 0.96 0.47 0.19 0.27 0.95 0.63 0.53 0.6 0.34 0.31 0.32 0.05 0.37
AKP14858 (WX61_00791)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AKP14904 (msrAB)
0.07 1.0 0.04 0.27 0.15 0.08 0.2 0.09 0.32 0.05 0.1 0.31 0.54 0.07 0.06 0.08 0.08 0.57 0.05 0.08
AKP14941 (rpsI)
0.47 0.54 0.23 0.39 0.49 0.48 0.38 0.47 0.36 0.39 1.0 0.42 0.26 0.52 0.96 0.53 0.41 0.84 0.31 0.68
AKP14972 (hhaIM)
0.75 0.33 0.14 0.85 0.45 0.13 0.9 0.53 0.81 0.29 0.15 1.0 0.27 0.27 0.3 0.14 0.12 0.17 0.14 0.34
AKP15015 (WX61_00952)
0.85 1.0 0.11 0.87 0.36 0.13 0.71 0.12 0.7 0.11 0.11 0.98 0.12 0.1 0.18 0.15 0.09 0.36 0.08 0.11
AKP15016 (WX61_00953)
0.18 0.75 0.04 0.17 0.1 0.28 0.15 0.14 0.12 0.24 0.6 0.16 0.01 0.29 1.0 0.31 0.22 0.86 0.04 0.05
AKP15062 (rmlC)
0.45 0.44 0.03 0.98 0.37 0.2 0.62 0.45 0.48 0.04 0.24 1.0 0.29 0.39 0.13 0.19 0.2 0.38 0.03 0.51
AKP15063 (rmlA2)
0.51 0.58 0.04 1.0 0.26 0.18 0.93 0.61 0.88 0.06 0.37 0.91 0.55 0.43 0.18 0.18 0.18 0.46 0.04 0.4
AKP15098 (WX61_01040)
0.13 0.28 0.26 0.51 0.11 0.06 0.35 0.36 0.4 0.16 0.45 0.49 0.16 0.24 0.1 0.07 0.05 1.0 0.27 0.07
AKP15231 (WX61_01182)
0.37 0.33 0.13 0.7 0.44 0.04 0.74 0.51 0.89 0.1 0.01 1.0 0.21 0.39 0.16 0.04 0.03 0.01 0.1 0.43
AKP15431 (grxC)
0.31 0.3 0.04 0.45 0.15 0.31 0.54 0.39 0.46 0.15 0.38 0.52 0.1 0.26 0.25 0.31 0.31 1.0 0.04 0.01
AKP15499 (WX61_01453)
0.72 0.49 0.0 1.0 0.09 0.15 0.98 0.58 0.97 0.0 0.09 0.71 0.34 0.39 0.24 0.11 0.21 0.14 0.0 0.0
AKP15519 (garR)
0.5 0.49 0.12 0.97 0.28 0.16 1.0 0.52 0.75 0.05 0.54 0.73 0.89 0.55 0.17 0.13 0.21 0.82 0.08 0.39
AKP15524 (hisG)
0.57 0.64 0.05 1.0 0.35 0.35 0.84 0.91 0.75 0.03 0.1 0.74 0.67 0.55 0.32 0.31 0.4 0.11 0.05 0.84
AKP15525 (WX61_01484)
0.67 0.43 0.14 0.88 0.48 0.28 0.84 0.62 0.77 0.15 0.34 1.0 0.37 0.5 0.37 0.24 0.34 0.35 0.11 0.55
AKP15530 (arcB)
0.63 0.89 0.12 0.94 0.61 0.55 1.0 0.88 0.79 0.28 0.5 0.74 0.62 0.66 0.37 0.55 0.55 0.46 0.14 0.58
AKP15559 (WX61_01519)
0.72 0.49 0.0 1.0 0.09 0.15 0.98 0.58 0.97 0.0 0.09 0.71 0.34 0.39 0.24 0.11 0.21 0.14 0.0 0.0
AKP15590 (WX61_01550)
1.0 0.72 0.09 0.8 0.21 0.54 0.71 0.76 0.77 0.11 0.41 0.91 0.2 0.64 0.82 0.67 0.34 0.48 0.04 0.61
AKP15617 (WX61_01578)
0.36 0.21 0.42 0.49 0.32 0.11 0.39 0.26 0.34 0.15 0.63 0.46 0.23 0.37 0.22 0.11 0.12 1.0 0.35 0.38
AKP15738 (WX61_01703)
0.47 0.34 0.12 0.83 0.54 0.03 0.98 0.42 1.0 0.07 0.24 0.92 0.16 0.27 0.19 0.03 0.03 0.24 0.1 0.18
AKP15739 (WX61_01704)
0.38 0.6 0.31 1.0 0.64 0.02 0.88 0.65 0.95 0.1 0.27 0.96 0.21 0.45 0.14 0.02 0.02 0.24 0.22 0.11
AKP15770 (murB)
0.6 0.91 0.25 0.81 0.45 0.32 0.82 1.0 0.83 0.28 0.83 0.79 0.92 0.72 0.25 0.31 0.34 0.85 0.2 0.14
AKP15804 (WX61_01769)
0.28 0.16 0.11 0.69 0.38 0.09 0.72 0.33 1.0 0.02 0.03 0.91 0.19 0.18 0.15 0.09 0.08 0.02 0.09 0.11
AKP15836 (WX61_01806)
0.41 0.62 0.15 1.0 0.48 0.21 0.76 0.83 0.43 0.07 0.08 0.67 0.43 0.38 0.17 0.16 0.27 0.09 0.14 0.64
AKP15843 (WX61_01813)
0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.24 1.0 0.0 0.0 0.2
AKP15844 (WX61_01814)
0.21 0.85 0.14 0.1 0.36 0.69 0.06 0.35 0.15 0.09 0.01 0.06 0.59 0.58 0.05 0.48 1.0 0.03 0.11 0.22
AKP15845 (WX61_01815)
0.23 0.58 0.03 0.15 0.44 0.69 0.12 0.17 0.11 0.01 0.01 0.15 0.2 0.4 0.22 0.49 1.0 0.03 0.02 0.21
AKP15846 (WX61_01816)
0.61 1.0 0.0 0.25 0.32 0.45 0.23 0.31 0.16 0.0 0.01 0.23 0.22 0.74 0.07 0.2 0.82 0.02 0.0 0.11
AKP15959 (WX61_01931)
0.47 0.48 1.0 0.77 0.38 0.32 0.82 0.69 0.58 0.11 0.08 0.5 0.46 0.45 0.38 0.31 0.33 0.1 0.51 0.23
AKP15964 (WX61_01936)
0.45 0.38 0.11 0.78 0.3 0.13 0.92 0.71 0.76 0.03 0.01 1.0 0.59 0.25 0.2 0.13 0.15 0.01 0.07 0.19
AKP15985 (smpB)
0.45 0.34 0.32 1.0 0.44 0.07 0.69 0.5 0.74 0.38 0.06 0.81 0.18 0.3 0.25 0.07 0.07 0.05 0.26 0.36
AKP15986 (icsA)
0.63 0.41 0.56 1.0 0.56 0.11 0.71 0.62 0.67 0.24 0.09 0.81 0.42 0.27 0.21 0.11 0.11 0.1 0.42 0.42
AKP16051 (WX61_02024)
0.17 0.32 0.5 0.65 0.29 0.09 0.55 0.43 0.97 0.18 0.03 1.0 0.3 0.21 0.16 0.09 0.08 0.05 0.3 0.43
AKP16055 (fitB)
0.32 0.29 0.32 0.78 0.4 0.27 0.76 0.3 0.78 0.09 0.29 1.0 0.18 0.15 0.34 0.27 0.26 0.2 0.27 0.37
AKP16076 (WX61_02049)
0.17 0.32 0.5 0.65 0.29 0.09 0.55 0.43 0.97 0.18 0.03 1.0 0.3 0.21 0.16 0.09 0.08 0.05 0.3 0.43
AKP16080 (sbp_1)
0.18 1.0 0.04 0.4 0.1 0.08 0.68 0.89 0.49 0.03 0.54 0.31 0.33 0.11 0.04 0.08 0.07 0.73 0.01 0.3
AKP16081 (sbp_2)
0.19 0.51 0.02 0.42 0.06 0.12 0.69 0.4 0.58 0.08 0.57 0.35 0.18 0.1 0.04 0.12 0.12 1.0 0.01 0.73
AKP16130 (hslR)
0.58 0.56 0.19 0.86 0.33 0.44 0.68 0.73 1.0 0.14 0.24 0.98 0.42 0.49 0.6 0.44 0.45 0.27 0.12 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)