Heatmap: Cluster_2 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
GCGS0457,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,60min+PMN
FA1090,L-log,from bact
GCGS1095,reduced ceftriaxone suscept
from N. gon mtr mut mosiac transformant
WT,from L-log cell cultures
from lab,SP319,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,0min+PMN
from lab,SP316,reduced ceftriaxone suscept
FA1090cpxR::erm,L-log,from bact
FA1090 GCM77,strain+mut,untreated
GCGS1014,reduced ceftriaxone suscept
from urethra,test for azithromycin resist
FA1090/H041,60min
WT parent,FA19 WT,from p-log cells
WT,FA19,from p-L-log cells
overexp mtrCDE,FA19,from p-L-log cells
FA1090 GCM77,strain+mut,H2O2
FA1090cpxA::kan,L-log,from bact
from p-cells
AKP14097 (WX61_00008)
0.18 0.46 0.21 1.0 0.26 0.21 0.28 0.49 0.55 0.03 0.1 0.7 0.56 0.53 0.34 0.24 0.15 0.07 0.1 0.94
AKP14146 (rbfA)
0.64 0.67 0.6 0.51 0.46 0.42 0.45 0.68 0.44 0.66 0.95 0.37 1.0 0.84 0.24 0.44 0.41 0.83 0.4 0.61
AKP14151 (lldD)
0.49 0.57 0.14 0.88 0.4 0.24 0.87 0.45 0.92 0.06 0.24 0.73 0.3 0.55 0.19 0.24 0.24 1.0 0.14 0.51
AKP14173 (dmpP)
0.05 0.35 0.24 0.14 0.12 0.25 0.13 0.26 0.08 0.12 0.03 0.13 0.45 0.15 0.32 0.22 0.3 0.05 0.17 1.0
AKP14197 (tig)
0.84 0.59 0.4 0.62 0.62 0.86 0.62 0.56 0.61 0.54 0.36 0.6 0.52 0.55 0.63 0.95 0.72 0.34 0.32 1.0
AKP14277 (WX61_00188)
0.15 0.37 0.03 0.9 0.3 0.2 0.44 0.22 0.69 0.04 0.11 1.0 0.53 0.59 0.62 0.19 0.22 0.14 0.04 0.32
AKP14296 (WX61_00207)
0.31 0.06 0.0 0.63 0.47 0.0 0.35 0.12 0.36 0.0 0.0 0.56 0.42 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
AKP14305 (WX61_00216)
0.51 1.0 0.0 0.42 0.11 0.54 0.41 0.45 0.48 0.0 0.0 0.52 0.25 0.39 0.05 0.43 0.7 0.01 0.0 0.35
AKP14341 (norB)
0.1 0.17 0.03 0.14 0.14 0.26 0.11 0.29 0.14 0.08 0.14 0.19 0.2 0.15 0.19 0.25 0.28 0.17 0.03 1.0
AKP14367 (WX61_00279)
0.27 0.43 0.29 0.33 0.3 0.31 0.36 0.33 0.3 0.17 0.15 0.3 1.0 0.49 0.2 0.31 0.31 0.19 0.31 0.41
AKP14423 (gdhA_1)
0.2 0.54 0.17 0.72 0.29 0.19 0.61 0.22 0.61 0.08 0.43 0.64 0.51 0.77 0.3 0.14 0.25 0.52 0.16 1.0
AKP14426 (glcA)
0.06 0.09 0.07 0.1 0.09 0.02 0.09 0.05 0.09 0.17 0.02 0.08 0.59 0.29 0.02 0.01 0.03 0.02 0.36 1.0
AKP14441 (blh)
0.33 0.62 0.21 0.95 0.21 0.11 0.84 0.45 1.0 0.26 0.38 0.83 0.67 0.73 0.1 0.11 0.12 0.52 0.13 0.7
AKP14442 (exbD)
0.39 1.0 0.21 0.58 0.29 0.22 0.65 0.34 0.75 0.34 0.08 0.6 0.24 0.82 0.51 0.21 0.23 0.17 0.3 0.19
AKP14443 (exbB)
0.57 0.9 0.12 0.8 0.47 0.46 0.81 0.3 1.0 0.19 0.12 0.74 0.4 0.96 0.95 0.43 0.5 0.33 0.14 0.2
AKP14444 (WX61_00362)
0.72 1.0 0.17 0.76 0.51 0.3 0.77 0.46 0.91 0.27 0.09 0.67 0.33 0.97 0.94 0.31 0.28 0.27 0.22 0.18
AKP14474 (nosZ_1)
0.24 0.46 0.05 0.63 0.29 0.44 0.48 0.61 0.51 0.03 0.11 0.53 0.77 1.0 0.42 0.42 0.48 0.11 0.05 0.67
AKP14475 (nosZ_2)
0.34 0.33 0.12 0.95 0.49 0.72 0.8 0.41 0.93 0.11 1.0 0.94 0.76 0.88 0.83 0.59 0.91 0.56 0.09 0.61
AKP14479 (gcvH)
0.34 0.31 0.14 0.83 0.25 0.2 0.78 0.38 0.66 0.35 0.21 0.89 0.2 0.57 0.21 0.15 0.27 0.27 0.15 1.0
AKP14643 (WX61_00564)
0.25 0.19 0.09 0.64 0.33 0.25 0.51 0.2 0.8 0.04 0.6 0.94 0.46 0.62 1.0 0.21 0.31 0.38 0.04 0.44
AKP14651 (cysP)
0.17 0.16 0.06 0.11 0.22 0.14 0.07 0.15 0.09 0.19 0.04 0.13 0.27 1.0 0.42 0.11 0.18 0.1 0.08 0.73
AKP14696 (WX61_00618)
0.69 0.69 0.01 0.22 0.22 0.0 0.98 0.13 0.81 0.0 0.0 1.0 0.1 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AKP14705 (WX61_00627)
0.51 1.0 0.0 0.42 0.11 0.54 0.41 0.45 0.48 0.0 0.0 0.52 0.25 0.39 0.05 0.43 0.7 0.01 0.0 0.35
AKP14761 (glnB)
0.19 0.43 0.15 0.19 0.16 0.1 0.14 0.24 0.15 0.08 0.02 0.15 0.44 1.0 0.23 0.09 0.11 0.02 0.15 0.7
AKP14801 (gloA)
0.18 0.1 0.07 0.21 0.05 0.11 0.17 0.09 0.17 0.24 0.07 0.22 0.23 0.37 0.12 0.09 0.15 0.14 0.09 1.0
AKP14819 (rpmG)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 1.0
AKP14827 (WX61_00755)
0.49 0.81 0.32 0.72 0.43 0.66 0.55 0.36 0.69 0.42 0.12 0.63 1.0 0.85 0.84 0.66 0.67 0.21 0.38 0.18
AKP14893 (WX61_00826)
0.79 0.36 0.29 0.79 0.31 0.18 0.63 0.35 0.79 0.41 0.52 1.0 0.78 0.67 0.19 0.18 0.19 0.51 0.25 0.2
AKP14943 (zapA)
0.33 0.79 0.2 1.0 0.23 0.3 0.86 0.68 0.71 0.24 0.51 0.92 0.47 0.91 0.15 0.27 0.35 0.53 0.14 0.5
AKP15039 (resA_1)
0.53 0.53 0.33 1.0 0.36 0.13 0.73 0.51 0.61 0.22 0.31 0.59 0.53 0.67 0.13 0.1 0.17 0.4 0.25 0.53
AKP15049 (WX61_00987)
0.16 0.36 0.08 1.0 0.33 0.36 0.19 0.42 0.16 0.1 0.19 0.32 0.36 0.3 0.29 0.33 0.42 0.2 0.08 0.92
AKP15054 (WX61_00992)
0.49 0.78 0.7 0.72 0.51 0.78 0.56 0.71 0.51 0.49 0.27 0.76 0.82 0.97 0.71 0.64 1.0 0.38 0.72 0.82
AKP15061 (WX61_01003)
0.24 0.49 0.07 0.68 0.33 0.17 0.3 0.31 0.24 0.18 0.06 0.59 0.38 0.67 0.26 0.17 0.18 0.1 0.1 1.0
AKP15070 (gltS)
0.53 0.5 0.2 0.78 0.62 0.45 0.57 0.38 0.55 0.24 0.18 1.0 0.86 0.76 0.51 0.41 0.51 0.25 0.29 0.55
AKP15179 (alsT_3)
0.47 0.62 0.09 0.52 0.75 0.3 0.44 0.53 0.38 0.05 0.21 0.54 0.73 0.59 0.5 0.28 0.33 0.24 0.08 1.0
AKP15196 (ccpA)
0.04 0.07 0.01 0.06 0.1 0.16 0.04 0.03 0.05 0.02 0.29 0.07 0.08 1.0 0.42 0.09 0.26 0.06 0.01 0.37
AKP15241 (WX61_01192)
0.21 0.77 0.27 0.35 0.4 0.31 0.18 0.2 0.2 0.26 0.16 0.44 0.86 0.75 0.31 0.31 0.31 0.15 0.35 1.0
AKP15257 (WX61_01208)
0.08 0.1 0.08 0.13 0.1 0.13 0.08 0.09 0.1 0.29 0.16 0.1 0.58 0.43 0.19 0.09 0.2 0.12 0.27 1.0
AKP15318 (yceF)
0.45 0.4 0.29 0.42 0.48 0.29 0.36 0.37 0.33 0.17 0.03 0.28 1.0 0.57 0.3 0.29 0.29 0.06 0.3 0.35
AKP15319 (rsmI_2)
0.34 0.6 0.55 0.44 0.44 0.35 0.38 0.57 0.35 0.57 0.08 0.33 1.0 1.0 0.42 0.39 0.29 0.11 0.61 0.73
AKP15432 (secB)
0.51 0.27 0.03 0.83 0.16 0.09 0.85 0.26 1.0 0.13 0.14 0.82 0.18 0.62 0.12 0.08 0.11 0.27 0.03 0.22
AKP15456 (fucP)
0.17 0.2 0.04 0.34 0.26 0.16 0.3 0.12 0.41 0.09 0.06 0.48 0.18 0.4 0.18 0.15 0.19 0.07 0.04 1.0
AKP15505 (gpmA)
0.32 0.38 0.12 0.65 0.19 0.37 0.36 0.29 0.32 0.3 0.73 0.58 0.45 0.97 0.42 0.3 0.47 0.64 0.14 1.0
AKP15508 (potF_2)
0.76 0.71 0.46 0.79 0.56 0.59 0.71 0.81 0.71 0.88 1.0 0.75 0.98 0.82 0.42 0.59 0.6 0.94 0.46 0.94
AKP15512 (WX61_01466)
0.41 0.16 0.08 0.83 0.02 0.33 0.73 0.47 0.69 0.05 0.02 0.66 0.13 1.0 0.44 0.35 0.3 0.04 0.05 0.73
AKP15514 (pgsA)
0.2 0.3 0.29 0.3 0.41 0.12 0.26 0.55 0.23 0.08 0.32 0.25 0.61 1.0 0.37 0.09 0.16 0.24 0.27 0.6
AKP15527 (ilvH)
0.14 0.25 0.08 0.28 0.23 0.43 0.25 0.22 0.22 0.04 0.15 0.28 0.21 0.17 0.34 0.42 0.45 0.17 0.06 1.0
AKP15529 (ilvC)
0.24 0.48 0.04 0.45 0.3 0.47 0.43 0.38 0.43 0.11 0.23 0.42 0.24 0.52 0.32 0.45 0.5 0.22 0.03 1.0
AKP15546 (WX61_01506)
0.08 0.11 0.01 0.09 0.39 0.13 0.08 0.08 0.07 0.05 0.48 0.06 0.05 1.0 0.38 0.09 0.18 0.12 0.01 0.18
AKP15578 (potF_3)
0.34 0.63 0.14 0.82 0.25 0.42 0.84 0.65 0.8 0.14 0.91 0.7 0.72 0.6 0.18 0.44 0.38 0.97 0.12 1.0
AKP15580 (WX61_01540)
0.22 0.39 0.13 0.51 0.23 0.24 0.6 0.38 0.6 0.05 0.58 0.56 0.36 0.68 0.42 0.21 0.29 1.0 0.11 0.93
AKP15603 (WX61_01564)
0.09 0.04 0.07 0.12 0.12 0.03 0.15 0.04 0.13 0.09 0.01 0.15 0.01 0.04 0.16 0.03 0.02 0.01 0.07 1.0
AKP15659 (WX61_01621)
0.56 0.59 0.4 0.57 0.58 0.3 0.45 0.63 0.39 0.34 0.2 0.42 1.0 0.71 0.62 0.3 0.3 0.17 0.43 0.9
AKP15683 (WX61_01646)
0.0 0.43 0.53 0.3 0.26 0.68 0.34 0.51 0.44 0.57 0.02 0.28 0.78 0.58 0.5 0.61 0.8 0.04 0.34 1.0
AKP15697 (WX61_01662)
0.67 1.0 0.62 0.38 0.66 0.08 0.36 0.68 0.45 0.37 0.02 0.43 0.08 0.56 0.12 0.09 0.07 0.05 0.25 0.08
AKP15729 (WX61_01694)
0.85 0.61 0.39 0.53 0.88 0.44 0.57 0.7 0.67 0.22 0.24 0.67 1.0 0.82 0.57 0.45 0.42 0.32 0.4 0.23
AKP15752 (sdcS)
0.09 0.16 0.06 0.16 0.11 0.06 0.12 0.16 0.1 0.06 0.1 0.11 0.65 0.27 0.06 0.05 0.08 0.06 0.11 1.0
AKP15761 (hemB)
0.63 0.64 0.47 0.66 0.54 0.56 0.57 0.53 0.54 0.18 0.07 0.48 0.99 0.97 0.62 0.49 0.67 0.09 0.4 1.0
AKP15856 (WX61_01826)
0.51 1.0 0.0 0.42 0.11 0.54 0.41 0.45 0.48 0.0 0.0 0.52 0.25 0.39 0.05 0.43 0.7 0.01 0.0 0.35
AKP15905 (WX61_01875)
0.28 0.21 0.0 0.34 0.64 0.29 0.52 0.36 0.36 0.0 0.0 0.49 0.07 0.66 1.0 0.31 0.26 0.0 0.0 0.59
AKP15909 (cstA)
0.1 0.17 0.05 0.17 0.2 0.23 0.1 0.15 0.1 0.11 0.15 0.1 0.76 0.46 0.36 0.18 0.3 0.22 0.12 1.0
AKP15951 (WX61_01923)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
AKP15983 (ogt)
0.49 0.61 0.24 0.53 0.52 0.29 0.9 0.68 0.9 0.13 0.08 0.36 0.92 0.74 0.32 0.26 0.33 0.1 0.16 1.0
AKP15999 (rpiA)
0.53 0.46 0.17 0.65 0.32 0.28 0.51 0.36 0.6 0.56 0.6 0.64 0.94 0.68 0.23 0.27 0.3 0.56 0.28 1.0
AKP16015 (pip)
0.38 0.4 0.28 0.84 0.31 0.62 0.51 0.27 0.6 0.17 0.57 0.68 1.0 0.87 0.81 0.58 0.68 0.66 0.21 0.92
AKP16039 (sdhD)
0.29 0.38 0.06 0.6 0.52 0.18 0.35 0.3 0.4 0.09 0.19 0.61 0.39 0.61 0.24 0.15 0.22 0.31 0.07 1.0
AKP16043 (gltA)
0.16 0.29 0.07 0.38 0.08 0.17 0.26 0.18 0.24 0.04 0.35 0.26 0.19 0.48 0.2 0.15 0.21 0.71 0.07 1.0
AKP16096 (WX61_02070)
0.02 0.1 0.14 0.02 0.04 0.08 0.01 0.05 0.01 0.33 0.02 0.02 0.04 1.0 0.57 0.06 0.11 0.04 0.18 0.21
AKP16113 (argB)
0.21 0.45 0.32 0.33 0.3 0.2 0.3 0.27 0.3 0.07 0.12 0.2 0.57 0.45 0.25 0.18 0.21 0.12 0.23 1.0
AKP16163 (WX61_02139)
0.81 0.58 0.78 0.62 0.54 0.32 0.71 0.66 0.63 0.64 0.5 0.46 1.0 0.65 0.29 0.28 0.37 0.4 0.44 0.43
AKP16184 (rpe)
0.15 0.25 0.23 0.28 0.25 0.19 0.13 0.22 0.14 0.35 0.05 0.28 0.65 0.3 0.3 0.18 0.21 0.04 0.36 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)