Heatmap: Cluster_11 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	GCGS0457,reduced ceftriaxone suscept	FA1090/H041,60min+PMN	FA1090,L-log,from bact	GCGS1095,reduced ceftriaxone suscept	from N. gon mtr mut mosiac transformant	WT,from L-log cell cultures	from lab,SP319,reduced ceftriaxone suscept	FA1090/H041,0min+PMN	from lab,SP316,reduced ceftriaxone suscept	FA1090cpxR::erm,L-log,from bact	FA1090 GCM77,strain+mut,untreated	GCGS1014,reduced ceftriaxone suscept	from urethra,test for azithromycin resist	FA1090/H041,60min	WT parent,FA19 WT,from p-log cells	WT,FA19,from p-L-log cells	overexp mtrCDE,FA19,from p-L-log cells	FA1090 GCM77,strain+mut,H2O2	FA1090cpxA::kan,L-log,from bact	from p-cells
AKP14181 (mltD)	0.3	0.2	0.13	0.58	0.3	0.13	0.58	0.18	0.64	0.05	0.44	0.48	1.0	0.22	0.11	0.11	0.16	0.43	0.08	0.16
AKP14198 (WX61_00109)	0.13	0.0	0.0	0.36	0.01	0.06	0.31	0.0	0.45	0.0	0.0	0.33	1.0	0.0	0.1	0.07	0.04	0.0	0.0	0.1
AKP14237 (WX61_00148)	0.35	0.12	0.02	0.95	0.31	0.26	0.78	0.16	1.0	0.01	0.08	0.83	0.91	0.11	0.47	0.26	0.27	0.24	0.01	0.16
AKP14258 (patA)	0.46	0.25	0.21	0.52	0.34	0.24	0.39	0.24	0.36	0.15	0.2	0.44	1.0	0.32	0.27	0.24	0.25	0.24	0.18	0.11
AKP14262 (opuD)	0.54	0.31	0.29	0.79	0.5	0.25	0.7	0.3	0.72	0.11	0.26	0.74	1.0	0.33	0.32	0.24	0.25	0.27	0.19	0.46
AKP14285 (WX61_00196)	0.14	0.15	0.1	0.47	0.41	0.14	0.32	0.13	0.21	0.02	0.02	0.31	1.0	0.11	0.05	0.12	0.16	0.03	0.06	0.08
AKP14365 (WX61_00277)	0.11	0.13	0.12	0.29	0.19	0.05	0.29	0.15	0.39	0.01	0.13	0.27	1.0	0.07	0.03	0.04	0.07	0.15	0.09	0.1
AKP14383 (pqiB)	0.51	0.2	0.15	0.39	0.36	0.24	0.43	0.21	0.41	0.12	0.27	0.33	1.0	0.15	0.24	0.25	0.24	0.25	0.09	0.05
AKP14387 (WX61_00303)	0.62	0.19	0.18	0.62	0.26	0.23	0.62	0.19	0.79	0.08	0.3	0.79	1.0	0.14	0.18	0.28	0.16	0.29	0.13	0.13
AKP14418 (mshA_1)	0.5	0.3	0.12	0.49	0.37	0.23	0.48	0.33	0.45	0.13	0.42	0.41	1.0	0.34	0.5	0.24	0.21	0.39	0.09	0.2
AKP14425 (pdhR)	0.39	0.1	0.5	0.47	0.2	0.13	0.43	0.09	0.54	0.13	0.05	0.46	1.0	0.11	0.19	0.14	0.11	0.05	0.46	0.14
AKP14471 (yxlF)	0.4	0.21	0.05	0.96	0.47	0.44	0.84	0.25	0.62	0.03	0.4	0.76	1.0	0.28	0.47	0.42	0.48	0.43	0.04	0.36
AKP14472 (WX61_00390)	0.66	0.22	0.12	0.82	0.58	0.42	0.85	0.23	1.0	0.08	0.12	0.99	0.95	0.24	0.39	0.4	0.45	0.13	0.09	0.3
AKP14498 (ubiB)	0.3	0.25	0.1	0.49	0.39	0.31	0.47	0.26	0.49	0.06	0.39	0.43	1.0	0.23	0.34	0.33	0.28	0.43	0.07	0.24
AKP14504 (WX61_00422)	0.32	0.08	0.1	0.45	0.24	0.05	0.45	0.11	0.48	0.05	0.24	0.48	1.0	0.11	0.1	0.03	0.07	0.32	0.06	0.04
AKP14517 (smc)	0.53	0.38	0.19	0.78	0.35	0.54	0.86	0.36	0.8	0.12	0.47	0.51	1.0	0.34	0.48	0.53	0.55	0.43	0.15	0.2
AKP14566 (WX61_00485)	0.19	0.18	0.86	0.43	0.27	0.18	0.28	0.18	0.3	0.25	0.74	0.31	1.0	0.21	0.1	0.18	0.17	0.66	0.55	0.21
AKP14580 (WX61_00499)	0.31	0.16	0.15	0.46	0.51	0.19	0.4	0.19	0.33	0.03	0.04	0.33	1.0	0.22	0.26	0.17	0.22	0.05	0.1	0.08
AKP14617 (WX61_00536)	0.31	0.14	0.21	0.8	0.22	0.07	0.64	0.17	0.74	0.57	0.46	1.0	0.87	0.17	0.08	0.06	0.08	0.4	0.27	0.21
AKP14648 (cysB)	0.51	0.24	0.26	0.69	0.4	0.29	0.59	0.23	0.57	0.16	0.41	0.62	1.0	0.26	0.4	0.28	0.31	0.46	0.18	0.33
AKP14650 (hemN_1)	0.42	0.27	0.14	0.67	0.37	0.16	0.65	0.29	0.61	0.15	0.54	0.58	1.0	0.2	0.09	0.15	0.16	0.46	0.11	0.21
AKP14669 (WX61_00590)	0.69	0.35	0.43	0.59	0.54	0.46	0.64	0.31	0.58	0.3	0.1	0.48	1.0	0.52	0.58	0.45	0.48	0.11	0.38	0.48
AKP14673 (lptB)	0.56	0.24	0.14	0.55	0.38	0.26	0.56	0.32	0.42	0.13	0.39	0.47	1.0	0.25	0.26	0.23	0.3	0.4	0.11	0.35
AKP14681 (gluQ)	0.45	0.33	0.08	1.0	0.39	0.34	0.95	0.34	0.64	0.05	0.2	0.94	0.9	0.32	0.68	0.3	0.39	0.22	0.05	0.48
AKP14700 (WX61_00622)	0.0	0.02	0.01	0.37	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.36	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.12
AKP14735 (WX61_00657)	0.34	0.17	0.29	0.43	0.28	0.06	0.32	0.17	0.33	0.26	0.1	0.35	1.0	0.18	0.11	0.05	0.07	0.11	0.2	0.24
AKP14768 (mepH_1)	0.8	0.17	0.09	0.83	0.3	0.27	0.84	0.16	0.89	0.04	0.39	0.85	1.0	0.19	0.2	0.25	0.29	0.35	0.03	0.14
AKP14783 (WX61_00710)	0.0	0.04	0.0	0.41	0.0	0.0	0.06	0.06	0.2	0.0	0.24	0.17	1.0	0.09	0.13	0.0	0.0	0.26	0.0	0.11
AKP14792 (WX61_00719)	0.16	0.05	0.19	0.26	0.31	0.04	0.27	0.1	0.19	0.02	0.07	0.26	1.0	0.06	0.06	0.03	0.04	0.09	0.16	0.02
AKP14865 (bioH)	0.86	0.33	0.1	0.96	0.49	0.52	0.82	0.32	0.89	0.08	0.41	1.0	0.99	0.41	0.6	0.46	0.6	0.47	0.08	0.26
AKP14866 (WX61_00799)	0.44	0.19	0.12	0.62	0.38	0.26	0.53	0.17	0.54	0.06	0.17	0.51	1.0	0.21	0.37	0.27	0.25	0.18	0.11	0.18
AKP14869 (WX61_00802)	0.47	0.19	0.41	0.8	0.29	0.13	0.81	0.16	1.0	0.55	0.44	0.95	0.63	0.28	0.2	0.1	0.19	0.35	0.3	0.28
AKP14872 (WX61_00805)	0.46	0.26	0.08	0.47	0.35	0.38	0.5	0.29	0.36	0.05	0.39	0.38	1.0	0.26	0.3	0.37	0.4	0.43	0.07	0.13
AKP14894 (WX61_00827)	0.7	0.14	0.57	0.68	0.32	0.03	0.61	0.2	0.61	0.16	0.1	0.77	1.0	0.16	0.07	0.03	0.03	0.1	0.52	0.16
AKP14914 (efeU)	0.2	0.12	0.04	0.4	0.19	0.07	0.51	0.14	0.61	0.02	0.07	0.37	1.0	0.09	0.1	0.06	0.08	0.11	0.03	0.03
AKP14925 (thiC)	0.27	0.14	0.21	0.43	0.34	0.19	0.37	0.17	0.54	0.08	0.32	0.59	1.0	0.24	0.28	0.15	0.26	0.33	0.19	0.07
AKP14933 (WX61_00867)	0.43	0.24	0.21	0.54	0.37	0.31	0.54	0.21	0.78	0.11	0.51	0.72	1.0	0.2	0.27	0.31	0.29	0.44	0.18	0.08
AKP14939 (cynR)	0.45	0.25	0.38	0.62	0.22	0.16	0.66	0.36	0.72	0.1	0.3	0.7	1.0	0.19	0.13	0.16	0.16	0.3	0.27	0.11
AKP14944 (WX61_00878)	0.27	0.19	0.05	0.85	0.25	0.27	0.76	0.16	0.66	0.14	0.24	0.61	1.0	0.15	0.22	0.27	0.27	0.25	0.05	0.26
AKP14979 (WX61_00916)	0.35	0.18	0.25	0.49	0.23	0.1	0.56	0.14	0.46	0.09	0.33	0.37	1.0	0.08	0.09	0.09	0.11	0.32	0.17	0.06
AKP15021 (WX61_00958)	0.51	0.17	0.87	1.0	0.36	0.07	0.78	0.2	0.68	0.4	0.19	0.68	0.91	0.22	0.08	0.06	0.07	0.2	0.66	0.28
AKP15056 (proC)	0.39	0.25	0.14	0.5	0.45	0.34	0.41	0.3	0.36	0.1	0.19	0.36	1.0	0.38	0.41	0.33	0.37	0.25	0.16	0.22
AKP15071 (WX61_01013)	0.51	0.26	0.24	1.0	0.28	0.56	0.92	0.27	0.87	0.09	0.13	0.77	0.74	0.24	0.7	0.54	0.6	0.14	0.27	0.38
AKP15073 (WX61_01015)	0.31	0.25	0.37	0.78	0.21	0.06	0.79	0.31	0.78	0.1	0.11	0.74	1.0	0.13	0.07	0.05	0.07	0.1	0.36	0.11
AKP15115 (WX61_01061)	0.33	0.11	0.39	0.78	0.34	0.04	0.73	0.17	0.63	0.83	0.03	0.9	1.0	0.22	0.03	0.04	0.02	0.02	0.84	0.34
AKP15194 (WX61_01145)	0.4	0.24	0.09	0.67	0.4	0.3	0.59	0.21	0.62	0.04	0.29	0.61	1.0	0.26	0.56	0.27	0.35	0.36	0.08	0.24
AKP15284 (parB)	0.48	0.2	0.64	0.49	0.44	0.37	0.4	0.2	0.33	0.4	0.97	0.4	1.0	0.36	0.52	0.36	0.39	0.81	0.55	0.42
AKP15317 (WX61_01268)	0.45	0.08	0.34	0.37	0.41	0.12	0.4	0.09	0.4	0.14	0.25	0.43	1.0	0.07	0.11	0.14	0.1	0.28	0.35	0.09
AKP15320 (yidC)	0.3	0.22	0.12	0.38	0.33	0.15	0.35	0.22	0.29	0.12	0.44	0.37	1.0	0.17	0.1	0.14	0.16	0.47	0.1	0.12
AKP15351 (WX61_01303)	0.47	0.23	0.49	0.82	0.32	0.27	0.83	0.29	1.0	0.3	0.31	0.93	0.99	0.21	0.35	0.23	0.34	0.23	0.44	0.21
AKP15442 (apxIB_2)	0.35	0.08	0.2	0.63	0.17	0.07	0.62	0.09	0.61	0.07	0.05	0.59	1.0	0.07	0.06	0.07	0.06	0.05	0.14	0.13
AKP15458 (corC)	0.41	0.3	0.09	0.56	0.43	0.24	0.49	0.28	0.47	0.08	0.48	0.46	1.0	0.28	0.24	0.24	0.24	0.51	0.07	0.15
AKP15478 (WX61_01432)	0.58	0.2	0.22	0.86	0.35	0.08	0.82	0.19	1.0	0.1	0.05	0.95	1.0	0.27	0.15	0.08	0.08	0.09	0.18	0.22
AKP15492 (yhdE)	0.58	0.24	0.2	0.71	0.55	0.22	0.77	0.19	0.63	0.16	0.26	0.55	1.0	0.24	0.49	0.21	0.24	0.23	0.5	0.31
AKP15493 (tatC)	0.32	0.16	0.09	0.42	0.32	0.15	0.45	0.14	0.41	0.06	0.44	0.31	1.0	0.14	0.22	0.15	0.16	0.35	0.17	0.23
AKP15497 (hisE)	0.5	0.35	0.73	0.5	0.43	0.33	0.59	0.23	0.4	0.67	1.0	0.38	0.75	0.42	0.4	0.3	0.38	0.97	0.58	0.62
AKP15511 (rhaS)	0.44	0.27	0.31	0.82	0.44	0.42	0.79	0.29	0.91	0.1	0.1	0.63	1.0	0.28	0.4	0.36	0.51	0.1	0.19	0.86
AKP15594 (WX61_01554)	0.32	0.22	0.2	0.34	0.16	0.15	0.41	0.19	0.35	0.1	0.16	0.37	1.0	0.16	0.1	0.15	0.14	0.19	0.14	0.09
AKP15604 (trkH)	0.39	0.28	0.09	0.47	0.48	0.29	0.52	0.25	0.4	0.13	0.29	0.42	1.0	0.21	0.26	0.29	0.3	0.28	0.06	0.04
AKP15664 (lnt)	0.48	0.14	0.08	0.44	0.47	0.14	0.42	0.14	0.41	0.11	0.26	0.36	1.0	0.12	0.08	0.15	0.12	0.26	0.06	0.09
AKP15687 (ubiA)	0.52	0.21	0.11	0.64	0.53	0.11	0.68	0.23	0.72	0.08	0.13	0.62	1.0	0.28	0.42	0.09	0.13	0.18	0.08	0.34
AKP15698 (folK)	0.25	0.2	0.05	0.38	0.31	0.17	0.34	0.18	0.53	0.03	0.33	0.53	1.0	0.17	0.13	0.14	0.21	0.31	0.03	0.07
AKP15874 (WX61_01844)	0.27	0.3	0.12	0.93	0.2	0.3	0.6	0.22	0.45	0.08	0.05	0.58	1.0	0.38	0.34	0.35	0.23	0.11	0.14	0.47
AKP15877 (WX61_01847)	0.21	0.13	0.12	0.78	0.16	0.4	0.74	0.09	0.6	0.08	0.02	0.47	1.0	0.2	0.25	0.4	0.41	0.04	0.12	0.36
AKP15878 (WX61_01848)	0.27	0.13	0.03	0.77	0.14	0.31	0.69	0.11	0.75	0.02	0.06	0.57	1.0	0.16	0.4	0.36	0.23	0.09	0.02	0.11
AKP15944 (WX61_01914)	0.57	0.27	0.09	0.8	0.59	0.45	0.72	0.34	0.64	0.09	0.14	0.59	1.0	0.37	0.53	0.44	0.48	0.16	0.07	0.38
AKP15946 (polC)	0.35	0.13	0.47	0.44	0.31	0.25	0.39	0.11	0.37	0.24	0.07	0.28	1.0	0.28	0.54	0.22	0.29	0.08	0.34	0.23
AKP15947 (WX61_01919)	0.44	0.2	0.59	0.48	0.4	0.28	0.43	0.19	0.47	0.18	0.02	0.4	1.0	0.29	0.56	0.27	0.29	0.02	0.41	0.31
AKP15948 (WX61_01920)	0.54	0.07	0.05	0.57	0.42	0.04	0.57	0.09	0.53	0.01	0.04	0.66	1.0	0.09	0.05	0.04	0.04	0.05	0.03	0.23
AKP15949 (WX61_01921)	0.47	0.03	0.01	0.42	0.21	0.02	0.31	0.04	0.25	0.0	0.01	0.22	1.0	0.08	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.29
AKP15952 (WX61_01924)	0.85	0.04	0.01	0.61	0.38	0.01	0.64	0.07	0.44	0.0	0.06	0.35	1.0	0.11	0.0	0.01	0.0	0.08	0.01	0.26
AKP15960 (WX61_01932)	0.38	0.18	0.3	0.87	0.32	0.13	0.64	0.23	0.61	0.05	0.39	0.36	1.0	0.18	0.29	0.13	0.11	0.46	0.19	0.5
AKP16019 (xanQ_2)	0.25	0.22	0.16	0.34	0.14	0.11	0.32	0.21	0.5	0.1	0.06	0.43	1.0	0.21	0.33	0.11	0.11	0.06	0.24	0.35
AKP16025 (WX61_01998)	0.44	0.43	0.14	0.69	0.42	0.45	0.59	0.44	0.56	0.05	0.5	0.5	1.0	0.35	0.42	0.45	0.44	0.44	0.1	0.45
AKP16061 (mepH_2)	0.6	0.26	0.18	0.87	0.32	0.15	0.79	0.27	0.84	0.12	0.22	0.62	1.0	0.23	0.11	0.16	0.14	0.16	0.11	0.11
AKP16079 (smrA)	0.38	0.2	0.47	0.53	0.19	0.09	0.47	0.26	0.6	0.31	0.45	0.53	1.0	0.21	0.06	0.1	0.07	0.44	0.29	0.17
AKP16097 (fbp)	0.49	0.19	0.17	0.43	0.22	0.18	0.73	0.2	0.84	0.07	0.25	0.32	1.0	0.24	0.12	0.16	0.21	0.3	0.11	0.18
AKP16105 (WX61_02079)	0.56	0.12	0.22	0.72	0.37	0.14	0.76	0.14	0.87	0.06	0.26	0.79	1.0	0.13	0.16	0.13	0.17	0.3	0.15	0.09
AKP16153 (bfr_1)	0.15	0.05	0.19	0.37	0.13	0.09	0.22	0.08	0.2	0.06	0.07	0.27	1.0	0.05	0.04	0.08	0.1	0.09	0.07	0.16
AKP16154 (bfr_2)	0.18	0.08	0.5	0.46	0.18	0.25	0.25	0.12	0.25	0.12	0.23	0.41	1.0	0.09	0.07	0.25	0.25	0.28	0.17	0.32
AKP16158 (tqsA)	0.58	0.27	0.22	0.95	0.32	0.12	0.88	0.24	0.99	0.12	0.07	0.86	1.0	0.24	0.12	0.12	0.12	0.08	0.18	0.2
AKP16177 (recR)	0.62	0.29	0.13	0.78	0.56	0.4	0.75	0.29	0.83	0.11	0.35	0.65	1.0	0.23	0.61	0.39	0.41	0.31	0.11	0.36
AKP16189 (narX)	0.22	0.18	0.12	0.32	0.26	0.12	0.3	0.2	0.4	0.03	0.4	0.21	1.0	0.11	0.1	0.11	0.13	0.23	0.08	0.04
AKP16190 (degU)	0.25	0.22	0.11	0.36	0.24	0.11	0.39	0.18	0.57	0.06	0.36	0.27	1.0	0.18	0.08	0.1	0.14	0.23	0.06	0.09
AKP16206 (fpr_2)	0.43	0.25	0.12	0.93	0.26	0.07	0.86	0.24	0.94	0.07	0.21	0.84	1.0	0.2	0.05	0.07	0.07	0.27	0.07	0.12
AKP16211 (WX61_02187)	0.15	0.04	0.01	0.7	0.13	0.02	0.11	0.08	0.13	0.0	0.18	0.22	1.0	0.04	0.13	0.03	0.01	0.3	0.01	0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)