1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_22 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
GCGS0457,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,60min+PMN
FA1090,L-log,from bact
GCGS1095,reduced ceftriaxone suscept
from N. gon mtr mut mosiac transformant
WT,from L-log cell cultures
from lab,SP319,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,0min+PMN
from lab,SP316,reduced ceftriaxone suscept
FA1090cpxR::erm,L-log,from bact
FA1090 GCM77,strain+mut,untreated
GCGS1014,reduced ceftriaxone suscept
from urethra,test for azithromycin resist
FA1090/H041,60min
WT parent,FA19 WT,from p-log cells
WT,FA19,from p-L-log cells
overexp mtrCDE,FA19,from p-L-log cells
FA1090 GCM77,strain+mut,H2O2
FA1090cpxA::kan,L-log,from bact
from p-cells
AKP14103 (WX61_00014)
 0.74 0.79 0.22 0.54 0.6 0.7 0.64 0.87 0.57 0.11 0.45 0.48 1.0 0.82 0.69 0.71 0.69 0.55 0.17 0.6
AKP14109 (WX61_00020)
 0.29 0.62 0.31 0.6 0.3 0.61 0.56 0.58 0.42 0.17 0.33 0.35 1.0 0.41 0.34 0.63 0.59 0.31 0.17 0.33
AKP14165 (mfd)
 0.47 0.37 0.1 0.38 0.4 0.47 0.36 0.51 0.32 0.05 0.39 0.29 1.0 0.34 0.45 0.44 0.52 0.43 0.07 0.19
AKP14217 (ctpB)
 0.62 0.72 0.2 0.85 0.82 0.83 0.71 0.83 0.61 0.28 0.43 0.55 0.92 0.74 1.0 0.86 0.78 0.45 0.17 0.48
AKP14241 (yabJ)
 1.0 0.67 0.14 0.81 0.61 0.61 0.85 0.58 0.86 0.09 0.25 0.73 0.99 0.61 0.96 0.66 0.54 0.32 0.1 0.52
AKP14370 (spoT)
 0.81 0.78 0.51 0.73 0.8 0.51 0.69 1.0 0.64 0.34 0.69 0.61 0.91 0.7 0.93 0.51 0.51 0.99 0.35 0.3
AKP14385 (tag)
 1.0 0.69 0.09 0.71 0.69 0.23 0.78 0.89 0.76 0.09 0.66 0.68 0.65 0.35 0.13 0.26 0.19 0.65 0.04 0.08
AKP14571 (rlmL)
 0.49 0.46 0.07 0.55 0.51 0.65 0.52 0.55 0.44 0.06 0.53 0.48 1.0 0.4 0.57 0.62 0.68 0.48 0.06 0.18
AKP14605 (ftsW)
 0.54 0.69 0.2 0.8 0.59 0.63 0.71 0.75 0.81 0.21 0.16 0.65 0.87 0.6 1.0 0.66 0.59 0.18 0.19 0.33
AKP14638 (WX61_00559)
 0.39 0.71 0.09 0.8 0.38 0.28 0.67 0.69 1.0 0.04 0.08 0.88 0.84 0.65 0.64 0.2 0.41 0.12 0.05 0.15
AKP14639 (WX61_00560)
 0.31 0.52 0.05 0.9 0.23 0.37 0.85 0.51 0.76 0.02 0.1 1.0 0.95 0.52 0.94 0.3 0.49 0.06 0.04 0.11
AKP14774 (WX61_00701)
 0.62 0.47 0.05 1.0 0.34 0.47 0.76 0.43 0.69 0.09 0.39 0.77 0.73 0.37 0.36 0.49 0.46 0.39 0.03 0.09
AKP14855 (WX61_00788)
 1.0 0.71 0.11 0.98 0.95 0.57 0.85 0.85 0.61 0.14 0.44 0.79 0.88 0.79 0.81 0.59 0.54 0.44 0.12 0.64
AKP14915 (mltA)
 0.6 0.87 0.18 0.61 0.25 0.89 0.52 0.94 0.5 0.15 0.74 0.46 1.0 0.86 0.73 0.88 0.89 0.85 0.17 0.51
AKP14930 (manX)
 0.67 0.46 0.28 0.68 0.76 0.41 0.63 0.51 0.65 0.18 0.45 0.69 0.94 0.56 0.66 0.43 0.38 0.46 0.24 1.0
AKP14955 (WX61_00889)
 0.5 0.46 0.12 0.46 0.36 0.5 0.37 0.49 0.33 0.06 0.31 0.36 1.0 0.4 0.36 0.48 0.54 0.37 0.11 0.19
AKP15006 (WX61_00943)
 0.3 0.15 0.02 0.2 0.54 0.04 0.3 0.29 0.13 0.01 0.04 0.28 1.0 0.15 0.22 0.06 0.02 0.07 0.03 0.62
AKP15009 (tamA)
 0.27 0.47 0.13 0.5 0.27 0.31 0.41 0.48 0.33 0.12 0.49 0.38 1.0 0.33 0.28 0.29 0.33 0.56 0.15 0.12
AKP15167 (cdsA)
 0.76 0.7 0.11 0.76 0.86 0.69 0.74 0.69 0.66 0.07 0.35 0.69 1.0 0.51 0.76 0.74 0.6 0.38 0.12 0.34
AKP15180 (pdxA1)
 0.53 0.67 0.13 0.77 0.53 0.53 0.68 0.75 0.54 0.11 0.86 0.66 1.0 0.46 0.69 0.55 0.51 0.75 0.13 0.36
AKP15255 (WX61_01206)
 0.53 1.0 0.1 0.58 0.6 0.52 0.51 0.76 0.5 0.06 0.55 0.5 0.79 0.84 0.61 0.52 0.52 0.62 0.08 0.09
AKP15335 (secG)
 0.78 0.44 0.23 0.75 0.84 0.22 0.8 0.8 0.85 0.15 0.56 1.0 0.6 0.28 0.24 0.21 0.23 0.52 0.18 0.14
AKP15354 (dxs)
 0.55 0.62 0.25 0.65 0.42 0.65 0.55 0.68 0.44 0.15 0.59 0.47 1.0 0.52 0.64 0.64 0.66 0.68 0.21 0.31
AKP15548 (fadD)
 0.59 0.42 0.14 0.35 0.49 0.57 0.35 0.51 0.38 0.07 0.73 0.38 1.0 0.43 0.59 0.57 0.57 0.77 0.1 0.18
AKP15562 (WX61_01522)
 0.74 0.83 0.17 0.65 0.86 0.8 0.71 0.93 0.63 0.27 0.34 0.64 0.65 0.62 1.0 0.76 0.87 0.36 0.17 0.41
AKP15629 (pyrC)
 0.29 0.39 0.28 0.4 0.31 0.49 0.34 0.44 0.25 0.15 0.39 0.27 1.0 0.3 0.33 0.51 0.47 0.34 0.19 0.14
AKP15655 (yfiH)
 0.37 0.46 0.26 0.58 0.42 0.58 0.57 0.48 0.63 0.14 0.44 0.48 1.0 0.45 0.57 0.54 0.65 0.44 0.15 0.21
AKP15712 (WX61_01677)
 0.35 0.55 0.43 0.52 0.36 0.57 0.41 0.55 0.47 0.09 0.51 0.41 1.0 0.37 0.27 0.52 0.65 0.37 0.24 0.08
AKP15724 (ycfH)
 1.0 0.84 0.23 0.72 0.99 0.63 0.68 0.91 0.59 0.23 0.58 0.54 0.83 0.71 0.9 0.64 0.6 0.64 0.2 0.7
AKP15735 (hemX)
 0.68 0.61 0.35 0.73 0.54 0.66 0.69 0.7 0.62 0.23 0.41 0.55 1.0 0.7 0.69 0.63 0.72 0.45 0.23 0.55
AKP15756 (pasI)
 0.44 0.45 0.18 0.71 0.42 0.47 0.76 0.54 0.59 0.28 0.07 0.59 1.0 0.29 0.86 0.48 0.45 0.09 0.24 0.18
AKP15791 (pcnB)
 0.53 0.59 0.25 0.54 0.41 0.52 0.46 0.72 0.38 0.17 0.25 0.38 0.63 0.43 1.0 0.54 0.48 0.24 0.21 0.19
AKP15793 (ybeZ)
 0.63 0.62 0.4 0.68 0.55 0.45 0.67 0.61 0.67 0.3 0.32 0.52 1.0 0.56 0.78 0.48 0.41 0.34 0.3 0.27
AKP15810 (panB)
 0.84 0.92 0.34 0.77 1.0 0.64 0.55 1.0 0.59 0.31 0.43 0.47 0.9 0.76 0.75 0.7 0.56 0.46 0.29 0.37
AKP15811 (panC)
 0.56 0.71 0.13 0.46 0.42 0.49 0.4 0.73 0.52 0.08 0.2 0.47 0.69 0.62 1.0 0.55 0.4 0.22 0.13 0.13
AKP15815 (prs)
 0.6 0.71 0.23 0.46 0.77 0.7 0.45 0.84 0.44 0.14 0.6 0.41 1.0 0.56 0.74 0.67 0.73 0.55 0.22 0.6
AKP15974 (dnaG)
 1.0 0.48 0.04 0.5 0.63 0.3 0.56 0.64 0.7 0.12 0.26 0.61 0.28 0.35 0.41 0.3 0.29 0.37 0.02 0.13
AKP16008 (tcdA)
 0.86 0.57 0.17 0.57 0.75 0.42 0.55 0.83 0.53 0.09 0.73 0.51 1.0 0.5 0.69 0.44 0.4 0.79 0.12 0.29
AKP16069 (WX61_02042)
 0.39 0.61 0.22 0.46 0.24 0.51 0.47 0.53 0.56 0.05 0.67 0.4 1.0 0.41 0.38 0.49 0.53 0.58 0.13 0.35
AKP16133 (rlmB_2)
 0.4 0.79 0.4 0.76 0.33 0.56 0.64 0.74 0.63 0.22 0.2 0.82 0.89 0.66 1.0 0.6 0.52 0.22 0.27 0.54
AKP16142 (cysI_2)
 0.12 0.38 0.3 0.45 0.27 0.34 0.61 0.47 0.23 0.08 0.31 0.46 1.0 0.52 0.36 0.4 0.23 0.4 0.15 0.09
AKP16144 (cysJ_2)
 0.22 0.38 0.04 0.59 0.28 0.43 0.36 0.51 0.49 0.02 0.13 0.41 1.0 0.41 0.51 0.46 0.39 0.15 0.03 0.22
AKP16186 (WX61_02162)
 0.51 0.41 0.21 1.0 0.48 0.51 0.85 0.5 0.67 0.13 0.19 0.63 0.74 0.36 0.75 0.52 0.5 0.21 0.13 0.45
AKP16202 (aroD)
 0.42 0.54 0.19 0.53 0.42 0.5 0.48 0.71 0.41 0.05 0.51 0.51 1.0 0.42 0.71 0.51 0.47 0.53 0.13 0.12
AKP16234 (mutY)
 0.31 0.35 0.19 0.52 0.3 0.4 0.48 0.46 0.35 0.05 0.53 0.33 1.0 0.34 0.34 0.39 0.41 0.59 0.13 0.23

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)