Heatmap: Cluster_19 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
GCGS0457,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,60min+PMN
FA1090,L-log,from bact
GCGS1095,reduced ceftriaxone suscept
from N. gon mtr mut mosiac transformant
WT,from L-log cell cultures
from lab,SP319,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,0min+PMN
from lab,SP316,reduced ceftriaxone suscept
FA1090cpxR::erm,L-log,from bact
FA1090 GCM77,strain+mut,untreated
GCGS1014,reduced ceftriaxone suscept
from urethra,test for azithromycin resist
FA1090/H041,60min
WT parent,FA19 WT,from p-log cells
WT,FA19,from p-L-log cells
overexp mtrCDE,FA19,from p-L-log cells
FA1090 GCM77,strain+mut,H2O2
FA1090cpxA::kan,L-log,from bact
from p-cells
AKP14125 (WX61_00036)
0.35 0.27 0.27 0.57 0.41 0.1 0.44 0.38 0.49 0.25 0.14 0.43 1.0 0.27 0.23 0.1 0.1 0.14 0.2 0.57
AKP14127 (WX61_00038)
0.68 0.71 0.12 0.98 0.63 0.33 0.74 0.78 0.72 0.11 0.1 0.76 0.7 0.46 0.67 0.36 0.3 0.12 0.11 1.0
AKP14210 (uvrC)
0.53 0.37 0.14 0.61 0.47 0.24 0.53 0.45 0.57 0.08 0.31 0.48 1.0 0.31 0.47 0.22 0.27 0.31 0.11 0.16
AKP14246 (ppiA)
0.32 0.51 0.12 0.71 0.77 0.51 0.65 0.5 0.59 0.06 0.37 0.64 1.0 0.32 0.56 0.52 0.5 0.36 0.09 0.24
AKP14253 (WX61_00164)
0.58 0.47 0.53 0.95 0.49 0.36 0.65 0.43 0.67 0.23 0.2 0.63 1.0 0.37 0.64 0.38 0.34 0.2 0.41 0.31
AKP14256 (sotB_1)
0.32 0.38 0.07 0.85 0.23 0.16 0.39 0.48 0.58 0.02 0.29 0.45 1.0 0.37 0.12 0.1 0.24 0.35 0.03 0.21
AKP14266 (WX61_00177)
0.62 0.37 0.32 0.45 0.7 0.21 0.35 0.57 0.41 0.16 0.41 0.4 1.0 0.2 0.21 0.22 0.2 0.46 0.23 0.27
AKP14322 (WX61_00233)
0.17 0.34 0.0 0.22 0.27 0.16 0.19 0.49 0.18 0.0 0.05 0.18 1.0 0.22 0.08 0.13 0.22 0.08 0.0 0.08
AKP14323 (WX61_00234)
0.18 0.27 0.05 0.25 0.34 0.04 0.17 0.5 0.15 0.0 0.08 0.11 1.0 0.15 0.03 0.04 0.04 0.11 0.03 0.02
AKP14369 (coaBC)
0.67 0.62 0.39 0.8 0.9 0.3 0.81 0.85 0.65 0.25 0.29 0.65 1.0 0.41 0.43 0.31 0.28 0.28 0.3 0.53
AKP14401 (yjjV)
0.48 0.49 0.15 0.53 0.56 0.53 0.6 0.58 0.63 0.05 0.26 0.51 1.0 0.23 0.83 0.58 0.46 0.25 0.1 0.24
AKP14408 (ubiD)
0.28 0.58 0.1 0.85 0.34 0.4 0.68 0.73 0.45 0.04 0.4 0.56 1.0 0.42 0.42 0.39 0.42 0.43 0.09 0.3
AKP14409 (WX61_00326)
0.28 0.56 0.32 0.82 0.37 0.22 0.63 0.93 0.52 0.1 0.4 0.6 1.0 0.24 0.15 0.21 0.24 0.39 0.21 0.51
AKP14415 (fabG_1)
0.17 0.22 0.05 0.23 0.31 0.06 0.12 0.38 0.14 0.01 0.08 0.15 1.0 0.18 0.04 0.06 0.06 0.09 0.02 0.08
AKP14416 (fabF_1)
0.28 0.22 0.1 0.32 0.47 0.09 0.27 0.32 0.19 0.04 0.06 0.29 1.0 0.2 0.08 0.09 0.07 0.08 0.07 0.08
AKP14420 (apbE_1)
0.5 0.52 0.28 0.44 0.44 0.41 0.44 0.63 0.52 0.15 0.13 0.43 1.0 0.37 0.66 0.41 0.42 0.16 0.21 0.49
AKP14485 (WX61_00403)
0.71 0.46 0.14 0.64 0.72 0.25 0.59 0.54 0.49 0.06 0.29 0.66 1.0 0.47 0.28 0.2 0.31 0.31 0.04 0.37
AKP14511 (priA)
0.24 0.46 0.21 0.39 0.35 0.41 0.28 0.53 0.26 0.1 0.18 0.29 1.0 0.36 0.56 0.41 0.41 0.19 0.17 0.21
AKP14529 (WX61_00447)
0.28 0.38 0.1 0.33 0.58 0.15 0.3 0.7 0.27 0.04 0.16 0.36 1.0 0.27 0.15 0.16 0.13 0.2 0.12 0.26
AKP14548 (WX61_00467)
0.3 0.42 0.28 0.32 0.49 0.19 0.24 0.51 0.26 0.12 0.08 0.26 1.0 0.3 0.31 0.17 0.21 0.09 0.22 0.68
AKP14558 (WX61_00477)
0.71 0.58 0.12 0.43 0.68 0.41 0.39 0.88 0.4 0.06 0.2 0.38 1.0 0.32 0.86 0.43 0.37 0.17 0.12 0.24
AKP14572 (WX61_00491)
0.34 0.37 0.08 0.44 0.56 0.44 0.44 0.5 0.43 0.05 0.27 0.37 1.0 0.24 0.47 0.41 0.5 0.23 0.07 0.07
AKP14576 (recO)
0.44 0.58 0.08 0.39 0.43 0.31 0.37 0.79 0.32 0.04 0.28 0.32 1.0 0.32 0.48 0.31 0.31 0.33 0.08 0.11
AKP14586 (WX61_00505)
0.36 0.52 0.2 0.36 0.45 0.53 0.27 0.57 0.38 0.08 0.19 0.33 1.0 0.51 0.37 0.49 0.58 0.28 0.22 0.31
AKP14618 (uppP)
0.78 0.36 0.72 0.78 0.76 0.07 0.86 0.4 0.83 0.2 0.11 0.89 1.0 0.27 0.26 0.06 0.07 0.14 0.51 0.39
AKP14628 (xthA)
0.8 0.71 0.09 0.98 0.96 0.61 0.97 1.0 0.86 0.05 0.26 0.85 0.9 0.42 0.26 0.69 0.49 0.28 0.05 0.37
AKP14672 (pbpF)
0.35 0.48 0.19 0.23 0.43 0.27 0.22 0.63 0.18 0.07 0.11 0.19 1.0 0.3 0.5 0.28 0.24 0.12 0.18 0.22
AKP14686 (WX61_00608)
0.17 0.34 0.0 0.22 0.27 0.16 0.19 0.49 0.18 0.0 0.05 0.18 1.0 0.22 0.08 0.13 0.22 0.08 0.0 0.08
AKP14762 (purL)
0.38 0.73 0.13 0.46 0.27 0.37 0.37 0.86 0.37 0.04 0.64 0.36 1.0 0.51 0.34 0.32 0.45 0.6 0.08 0.62
AKP14810 (coaE)
0.6 0.64 0.16 0.6 0.63 0.48 0.54 0.7 0.61 0.15 0.39 0.58 1.0 0.34 0.34 0.48 0.49 0.32 0.17 0.21
AKP14831 (WX61_00759)
0.55 0.5 0.09 0.46 0.48 0.25 0.35 0.57 0.29 0.05 0.14 0.37 1.0 0.37 0.37 0.24 0.27 0.15 0.09 0.39
AKP14877 (nuoN)
0.58 0.67 0.16 0.94 0.77 0.43 0.83 0.85 0.81 0.24 0.49 1.0 0.59 0.53 0.69 0.38 0.51 0.54 0.13 0.32
AKP14878 (nuoM)
0.54 0.54 0.09 0.86 0.65 0.43 0.72 0.79 0.84 0.53 0.13 1.0 0.42 0.5 0.91 0.42 0.46 0.15 0.05 0.4
AKP14880 (nuoL)
0.66 0.51 0.07 0.86 0.77 0.63 0.72 0.74 0.73 0.52 0.92 0.88 0.44 0.5 1.0 0.56 0.74 0.9 0.05 0.93
AKP14926 (WX61_00860)
0.47 0.5 0.3 0.99 0.85 0.47 0.84 0.71 0.75 0.09 0.15 0.86 1.0 0.33 0.47 0.48 0.45 0.15 0.29 0.31
AKP14927 (potA_1)
0.33 0.67 0.13 0.59 0.6 0.48 0.51 0.87 0.57 0.03 0.22 0.72 1.0 0.39 0.31 0.5 0.45 0.21 0.12 0.17
AKP14934 (rmuC)
0.55 0.54 0.27 0.54 0.46 0.38 0.52 0.56 0.58 0.28 0.09 0.57 1.0 0.36 0.42 0.37 0.39 0.1 0.26 0.16
AKP14947 (moeB)
0.25 0.49 0.13 0.4 0.31 0.22 0.24 0.5 0.26 0.12 0.05 0.35 1.0 0.39 0.37 0.2 0.26 0.06 0.24 0.38
AKP14958 (thiE)
0.12 0.62 0.08 0.43 0.21 0.27 0.25 0.75 0.28 0.07 0.46 0.26 1.0 0.71 0.19 0.26 0.3 0.33 0.07 0.25
AKP14960 (thiG)
0.14 0.56 0.06 0.38 0.42 0.29 0.26 0.79 0.19 0.04 0.17 0.25 1.0 0.44 0.2 0.31 0.26 0.11 0.06 0.19
AKP14962 (birA)
0.42 0.9 0.17 0.69 0.36 0.73 0.58 1.0 0.7 0.09 0.24 0.9 0.96 0.46 0.41 0.71 0.76 0.24 0.19 0.26
AKP14967 (WX61_00904)
0.45 0.8 0.13 1.0 0.45 0.43 0.77 0.81 0.8 0.13 0.16 0.98 0.94 0.53 0.28 0.39 0.49 0.13 0.11 0.29
AKP14974 (WX61_00911)
0.43 0.28 0.06 0.38 0.56 0.28 0.63 0.31 1.0 0.04 0.13 0.59 0.5 0.16 0.14 0.31 0.25 0.12 0.04 0.1
AKP15010 (tamB)
0.62 0.56 0.16 0.82 0.37 0.41 0.71 0.53 0.63 0.1 0.14 0.74 1.0 0.52 0.49 0.39 0.44 0.17 0.18 0.2
AKP15045 (alx)
0.37 0.43 0.35 0.59 0.45 0.23 0.48 0.51 0.39 0.47 0.15 0.43 1.0 0.37 0.27 0.28 0.16 0.15 0.55 0.11
AKP15090 (fmt)
0.34 0.71 0.15 0.53 0.4 0.44 0.45 0.73 0.48 0.11 0.53 0.41 1.0 0.61 0.26 0.43 0.46 0.72 0.18 0.15
AKP15091 (rsmB_2)
0.43 0.4 0.12 0.55 0.56 0.18 0.54 0.42 0.48 0.07 0.16 0.53 1.0 0.32 0.15 0.19 0.17 0.18 0.14 0.09
AKP15093 (kinB)
0.3 0.49 0.14 0.47 0.37 0.26 0.39 0.6 0.34 0.1 0.3 0.32 1.0 0.29 0.58 0.26 0.27 0.32 0.14 0.1
AKP15095 (WX61_01037)
0.79 0.69 0.07 1.0 0.65 0.41 1.0 0.71 0.84 0.06 0.35 0.91 0.98 0.52 0.51 0.42 0.39 0.37 0.07 0.13
AKP15166 (dxr)
0.7 0.7 0.13 0.75 0.58 0.47 0.73 0.7 0.61 0.07 0.46 0.65 1.0 0.41 0.62 0.48 0.45 0.42 0.1 0.44
AKP15221 (ygbN)
0.23 0.52 0.06 0.77 0.22 0.42 0.45 0.62 0.49 0.04 0.05 0.57 1.0 0.4 0.33 0.39 0.47 0.05 0.07 0.2
AKP15262 (mlaE)
0.29 0.26 0.2 0.33 0.4 0.13 0.3 0.35 0.26 0.05 0.1 0.25 1.0 0.33 0.41 0.12 0.13 0.12 0.21 0.05
AKP15287 (atpB)
0.64 0.59 0.39 0.58 0.6 0.25 0.51 0.76 0.52 0.4 0.35 0.61 1.0 0.64 0.51 0.22 0.29 0.45 0.57 0.29
AKP15321 (yidD)
0.31 0.66 0.09 0.32 0.38 0.21 0.28 0.64 0.33 0.03 0.3 0.36 1.0 0.31 0.08 0.22 0.19 0.27 0.06 0.06
AKP15359 (orn)
0.48 0.69 0.13 0.55 0.52 0.55 0.47 0.72 0.38 0.12 0.54 0.45 1.0 0.46 0.4 0.52 0.61 0.37 0.1 0.15
AKP15368 (WX61_01320)
0.38 0.78 0.36 0.34 0.53 0.64 0.31 0.82 0.36 0.22 0.55 0.41 1.0 0.68 0.46 0.65 0.64 0.75 0.25 0.23
AKP15392 (WX61_01345)
0.18 0.37 0.29 0.11 0.3 0.16 0.18 0.39 0.46 0.05 0.02 0.08 1.0 0.25 0.22 0.17 0.16 0.02 0.16 0.06
AKP15398 (avtA)
0.54 0.62 0.1 0.88 0.6 0.46 0.81 0.71 0.83 0.09 0.42 0.92 1.0 0.43 0.83 0.45 0.46 0.45 0.08 0.25
AKP15419 (ccsB)
0.56 0.59 0.67 0.81 0.68 0.27 0.73 0.62 0.65 0.44 0.15 0.6 1.0 0.44 0.71 0.28 0.26 0.25 0.66 0.4
AKP15449 (WX61_01402)
0.52 0.54 0.18 0.94 0.65 0.19 0.82 0.68 0.7 0.16 0.11 0.73 1.0 0.48 0.16 0.21 0.16 0.12 0.13 0.07
AKP15452 (mleN)
0.75 0.38 0.08 0.63 0.54 0.36 0.64 0.42 0.52 0.11 0.38 0.58 1.0 0.38 0.47 0.32 0.42 0.39 0.06 0.21
AKP15457 (nhaC)
0.52 0.72 0.15 0.61 0.56 0.21 0.46 0.74 0.43 0.14 0.23 0.71 1.0 0.49 0.3 0.21 0.22 0.24 0.17 0.35
AKP15463 (WX61_01417)
0.4 0.49 0.17 0.5 0.27 0.29 0.37 0.58 0.34 0.05 0.24 0.34 1.0 0.34 0.21 0.3 0.29 0.26 0.09 0.15
AKP15466 (dusC_1)
0.51 0.6 0.17 0.38 0.49 0.39 0.37 0.68 0.4 0.06 0.47 0.36 1.0 0.41 0.42 0.41 0.35 0.49 0.12 0.14
AKP15470 (WX61_01424)
0.56 0.68 0.15 0.59 0.27 0.22 0.56 0.69 0.59 0.09 0.06 0.53 1.0 0.34 0.3 0.19 0.26 0.07 0.13 0.35
AKP15471 (pepN)
0.27 0.61 0.08 0.51 0.23 0.45 0.53 0.57 0.52 0.04 0.36 0.51 1.0 0.33 0.34 0.42 0.5 0.39 0.07 0.51
AKP15482 (rplS)
0.48 0.86 0.29 0.46 0.49 0.48 0.53 0.85 0.53 0.19 0.36 0.5 1.0 0.47 0.16 0.42 0.57 0.25 0.29 0.48
AKP15517 (sarZ)
0.5 0.3 0.34 0.61 0.45 0.14 0.62 0.44 0.57 0.25 0.07 0.82 1.0 0.19 0.24 0.13 0.16 0.19 0.24 0.08
AKP15531 (acnB)
0.38 0.6 0.08 0.56 0.36 0.32 0.46 0.63 0.38 0.09 0.33 0.46 1.0 0.59 0.34 0.27 0.4 0.44 0.11 0.82
AKP15555 (WX61_01515)
1.0 0.54 0.41 0.7 0.68 0.51 0.71 0.57 0.63 0.26 0.1 0.87 0.46 0.65 0.85 0.5 0.53 0.12 0.35 0.51
AKP15567 (potH)
0.86 0.39 0.27 0.68 0.76 0.31 0.78 0.47 0.77 0.18 0.24 0.62 1.0 0.33 0.35 0.29 0.33 0.25 0.21 0.5
AKP15620 (WX61_01581)
0.54 0.78 0.17 0.72 0.36 0.4 0.66 0.72 0.54 0.08 0.61 0.54 1.0 0.64 0.48 0.4 0.4 0.8 0.17 0.48
AKP15657 (holA)
0.53 0.52 0.2 0.66 0.44 0.43 0.6 0.55 0.62 0.15 0.12 0.47 1.0 0.58 0.46 0.43 0.42 0.14 0.19 0.29
AKP15661 (WX61_01623)
0.67 0.26 0.44 0.59 0.62 0.05 0.49 0.43 0.58 0.09 0.05 0.64 1.0 0.12 0.13 0.04 0.05 0.04 0.4 0.2
AKP15667 (cycA)
0.71 0.5 0.21 1.0 0.66 0.25 0.81 0.53 0.77 0.22 0.52 0.72 0.9 0.55 0.3 0.23 0.28 0.34 0.15 0.2
AKP15701 (WX61_01666)
0.55 0.65 0.14 0.39 0.35 0.25 0.32 0.57 0.44 0.07 0.2 0.34 1.0 0.36 0.11 0.25 0.24 0.18 0.12 0.53
AKP15716 (WX61_01681)
0.43 0.47 0.15 0.98 0.41 0.45 0.74 0.64 0.77 0.04 0.1 0.63 1.0 0.39 0.46 0.48 0.4 0.13 0.09 0.49
AKP15736 (WX61_01701)
0.54 0.58 0.2 0.6 0.59 0.49 0.63 0.63 0.61 0.15 0.21 0.6 1.0 0.55 0.42 0.47 0.52 0.25 0.14 0.37
AKP15771 (mdtK)
0.68 0.55 0.47 0.63 0.7 0.16 0.57 0.65 0.54 0.23 0.34 0.49 1.0 0.34 0.3 0.16 0.15 0.39 0.39 0.15
AKP15782 (WX61_01747)
0.59 0.55 0.07 1.0 0.68 0.51 0.98 0.58 0.99 0.13 0.54 0.97 0.61 0.45 0.69 0.57 0.41 0.5 0.06 0.51
AKP15817 (dacC_2)
0.91 0.52 0.94 0.93 0.76 0.24 0.9 0.66 0.79 0.71 0.3 0.88 1.0 0.42 0.18 0.26 0.2 0.32 0.65 0.56
AKP15819 (cysA)
0.3 0.44 0.17 0.52 0.46 0.26 0.54 0.5 0.52 0.04 0.09 0.41 1.0 0.22 0.21 0.26 0.26 0.11 0.14 0.2
AKP15820 (cysW_3)
0.19 0.42 0.15 0.33 0.24 0.21 0.33 0.43 0.26 0.03 0.08 0.23 1.0 0.26 0.11 0.19 0.26 0.11 0.11 0.18
AKP15821 (cysT)
0.16 0.35 0.2 0.44 0.28 0.33 0.38 0.44 0.26 0.04 0.07 0.3 1.0 0.2 0.32 0.37 0.27 0.13 0.13 0.81
AKP15887 (WX61_01857)
0.16 0.36 0.15 0.18 0.1 0.27 0.18 0.47 0.18 0.03 0.12 0.19 1.0 0.36 0.25 0.26 0.29 0.15 0.11 0.13
AKP15913 (tlyC)
1.0 0.64 0.06 0.62 0.82 0.44 0.8 0.8 0.91 0.07 0.08 0.68 0.78 0.35 0.49 0.45 0.41 0.09 0.04 0.22
AKP15937 (WX61_01907)
0.41 0.39 0.19 0.54 0.71 0.24 0.38 0.5 0.34 0.07 0.33 0.28 1.0 0.46 0.48 0.24 0.25 0.5 0.18 0.12
AKP15938 (yajR)
0.64 0.5 0.16 0.52 0.69 0.42 0.44 0.62 0.31 0.12 0.26 0.34 1.0 0.41 0.61 0.44 0.41 0.26 0.16 0.14
AKP16074 (WX61_02047)
0.3 0.52 0.16 0.53 0.21 0.44 0.52 0.65 0.32 0.02 0.1 0.32 1.0 0.31 0.18 0.39 0.51 0.09 0.08 0.06
AKP16087 (WX61_02061)
0.21 0.48 0.14 0.36 0.06 0.16 0.33 0.49 0.12 0.04 0.15 0.26 1.0 0.47 0.08 0.16 0.16 0.14 0.06 0.21
AKP16093 (WX61_02067)
0.64 0.44 0.29 0.49 0.62 0.19 0.55 0.57 0.53 0.23 0.24 0.52 1.0 0.43 0.42 0.21 0.16 0.41 0.21 0.25
AKP16100 (rlmJ)
0.27 0.44 0.26 0.25 0.33 0.39 0.26 0.42 0.27 0.07 0.11 0.18 1.0 0.3 0.16 0.41 0.35 0.09 0.2 0.18
AKP16117 (WX61_02091)
0.21 0.52 0.07 0.69 0.36 0.28 0.66 0.68 0.66 0.04 0.31 0.55 1.0 0.55 0.2 0.22 0.37 0.22 0.09 0.57
AKP16123 (crtB_2)
0.35 0.55 0.16 0.33 0.27 0.39 0.26 0.51 0.23 0.08 0.28 0.2 1.0 0.51 0.46 0.45 0.3 0.24 0.12 0.18
AKP16132 (tilS)
0.45 0.51 0.26 0.5 0.4 0.36 0.48 0.57 0.43 0.1 0.08 0.36 1.0 0.26 0.72 0.41 0.29 0.09 0.17 0.1
AKP16167 (WX61_02143)
0.53 0.73 0.25 0.51 0.51 0.5 0.6 0.69 0.67 0.21 0.14 0.4 1.0 0.52 0.28 0.55 0.44 0.15 0.16 0.22
AKP16225 (WX61_02201)
0.52 0.48 0.26 0.62 0.66 0.4 0.72 0.67 0.75 0.34 0.23 0.66 1.0 0.48 0.77 0.39 0.4 0.23 0.14 0.19
AKP16237 (WX61_02213)
0.61 0.34 0.32 0.4 0.7 0.08 0.47 0.47 0.52 0.15 0.06 0.62 1.0 0.37 0.07 0.1 0.06 0.08 0.17 0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)