Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	GCGS0457,reduced ceftriaxone suscept	FA1090/H041,60min+PMN	FA1090,L-log,from bact	GCGS1095,reduced ceftriaxone suscept	from N. gon mtr mut mosiac transformant	WT,from L-log cell cultures	from lab,SP319,reduced ceftriaxone suscept	FA1090/H041,0min+PMN	from lab,SP316,reduced ceftriaxone suscept	FA1090cpxR::erm,L-log,from bact	FA1090 GCM77,strain+mut,untreated	GCGS1014,reduced ceftriaxone suscept	from urethra,test for azithromycin resist	FA1090/H041,60min	WT parent,FA19 WT,from p-log cells	WT,FA19,from p-L-log cells	overexp mtrCDE,FA19,from p-L-log cells	FA1090 GCM77,strain+mut,H2O2	FA1090cpxA::kan,L-log,from bact	from p-cells
AKP14099 (WX61_00010)	0.29	0.27	0.16	0.9	0.3	0.11	0.77	0.33	0.72	0.02	0.09	0.77	1.0	0.22	0.21	0.12	0.08	0.1	0.1	0.68
AKP14178 (plsC_1)	0.21	0.29	0.07	0.47	0.25	0.25	0.37	0.25	0.43	0.03	0.07	0.39	1.0	0.32	0.33	0.24	0.27	0.11	0.05	0.18
AKP14180 (WX61_00091)	0.37	0.21	0.17	0.57	0.3	0.38	0.46	0.16	0.55	0.08	0.04	0.51	1.0	0.26	0.55	0.35	0.42	0.05	0.12	0.21
AKP14201 (WX61_00112)	0.42	0.22	0.09	0.5	0.38	0.1	0.48	0.28	0.46	0.05	0.06	0.53	1.0	0.14	0.22	0.1	0.09	0.07	0.09	0.12
AKP14202 (pcs)	0.34	0.38	0.22	0.56	0.32	0.21	0.45	0.42	0.52	0.08	0.34	0.48	1.0	0.27	0.24	0.2	0.23	0.37	0.16	0.09
AKP14203 (WX61_00114)	0.36	0.33	0.17	0.62	0.33	0.22	0.49	0.4	0.54	0.06	0.18	0.45	1.0	0.19	0.14	0.23	0.2	0.19	0.16	0.12
AKP14358 (dsbB)	0.44	0.22	0.16	0.67	0.39	0.15	0.63	0.19	0.6	0.07	0.04	0.59	1.0	0.28	0.31	0.13	0.18	0.04	0.11	0.24
AKP14470 (WX61_00388)	0.39	0.28	0.09	0.81	0.46	0.27	0.59	0.38	0.59	0.03	0.23	0.76	1.0	0.27	0.24	0.28	0.27	0.25	0.05	0.21
AKP14476 (yccM)	0.34	0.24	0.21	0.79	0.51	0.17	0.64	0.37	0.75	0.06	0.2	0.78	1.0	0.39	0.54	0.14	0.22	0.17	0.14	0.68
AKP14497 (cysE)	0.52	0.44	0.11	1.0	0.52	0.44	0.9	0.51	0.95	0.08	0.35	0.95	0.98	0.42	0.48	0.43	0.46	0.38	0.07	0.22
AKP14544 (WX61_00463)	0.29	0.24	0.24	0.42	0.33	0.08	0.46	0.27	0.47	0.07	0.23	0.45	1.0	0.1	0.14	0.09	0.07	0.19	0.15	0.34
AKP14545 (WX61_00464)	0.43	0.35	0.11	0.6	0.37	0.18	0.54	0.4	0.55	0.07	0.09	0.59	1.0	0.25	0.37	0.18	0.18	0.08	0.09	0.5
AKP14589 (ackA_1)	0.23	0.22	0.14	0.5	0.22	0.17	0.44	0.25	0.42	0.03	0.08	0.54	1.0	0.19	0.22	0.18	0.15	0.12	0.08	0.1
AKP14590 (mii)	0.3	0.26	0.07	0.84	0.28	0.16	0.68	0.29	0.78	0.02	0.04	0.79	1.0	0.2	0.2	0.16	0.17	0.04	0.07	0.28
AKP14591 (galD)	0.23	0.27	0.09	0.96	0.24	0.16	0.82	0.35	0.95	0.05	0.09	1.0	0.83	0.26	0.19	0.17	0.14	0.14	0.09	0.71
AKP14592 (acnA)	0.32	0.19	0.06	0.84	0.26	0.16	0.71	0.25	0.86	0.02	0.08	1.0	0.92	0.18	0.12	0.17	0.15	0.11	0.04	0.31
AKP14593 (acn)	0.19	0.22	0.1	0.76	0.33	0.09	0.68	0.33	0.79	0.03	0.03	0.75	1.0	0.3	0.08	0.09	0.08	0.06	0.05	0.44
AKP14594 (WX61_00513)	0.17	0.15	0.13	0.71	0.29	0.04	0.64	0.24	0.89	0.05	0.06	1.0	0.87	0.16	0.1	0.03	0.04	0.08	0.09	0.45
AKP14595 (prpC)	0.27	0.26	0.19	1.0	0.35	0.1	0.94	0.44	0.68	0.08	0.13	0.98	0.76	0.28	0.09	0.08	0.13	0.12	0.14	0.93
AKP14597 (prpB)	0.35	0.21	0.14	0.89	0.47	0.12	0.79	0.33	0.75	0.03	0.04	0.78	1.0	0.22	0.09	0.1	0.15	0.03	0.1	0.93
AKP14636 (malP_1)	0.16	0.4	0.11	0.77	0.38	0.23	0.66	0.35	0.65	0.06	0.45	0.72	1.0	0.47	0.34	0.21	0.26	0.43	0.04	0.33
AKP14637 (malP_2)	0.26	0.34	0.1	0.96	0.38	0.28	0.72	0.31	0.6	0.05	0.2	0.72	1.0	0.42	0.44	0.23	0.36	0.3	0.08	0.2
AKP14641 (WX61_00562)	0.26	0.15	0.21	0.65	0.44	0.09	0.56	0.18	0.55	0.07	0.1	0.67	1.0	0.28	0.45	0.09	0.1	0.09	0.11	0.12
AKP14642 (WX61_00563)	0.2	0.11	0.08	0.51	0.34	0.11	0.38	0.12	0.58	0.02	0.09	0.5	1.0	0.24	0.71	0.09	0.14	0.09	0.05	0.14
AKP14646 (thiL)	0.37	0.4	0.18	0.6	0.41	0.26	0.58	0.34	0.58	0.08	0.06	0.51	1.0	0.36	0.32	0.24	0.3	0.07	0.17	0.29
AKP14649 (anr)	0.69	0.54	0.28	0.63	0.42	0.37	0.56	0.59	0.58	0.18	0.31	0.62	1.0	0.48	0.23	0.36	0.39	0.52	0.23	0.44
AKP14733 (WX61_00655)	0.3	0.26	0.13	0.65	0.27	0.11	0.52	0.28	0.66	0.1	0.04	0.87	1.0	0.19	0.15	0.1	0.12	0.05	0.09	0.22
AKP14736 (thiD)	0.31	0.35	0.31	0.68	0.35	0.35	0.48	0.43	0.57	0.11	0.26	0.49	1.0	0.39	0.43	0.31	0.4	0.29	0.23	0.55
AKP14737 (tehB)	0.21	0.36	0.14	0.49	0.44	0.35	0.38	0.32	0.57	0.09	0.21	0.51	1.0	0.35	0.41	0.38	0.32	0.23	0.12	0.35
AKP14763 (WX61_00690)	0.29	0.24	0.07	0.6	0.23	0.27	0.53	0.38	0.52	0.03	0.21	0.42	1.0	0.16	0.32	0.27	0.28	0.25	0.07	0.19
AKP14984 (WX61_00921)	0.4	0.24	0.2	0.62	0.24	0.46	0.5	0.2	0.36	0.1	0.09	0.46	1.0	0.18	0.4	0.38	0.59	0.09	0.16	0.39
AKP15046 (WX61_00984)	0.34	0.24	0.14	0.39	0.33	0.13	0.37	0.33	0.24	0.06	0.04	0.38	1.0	0.16	0.1	0.12	0.14	0.05	0.18	0.11
AKP15154 (truA)	0.42	0.41	0.18	0.6	0.29	0.29	0.55	0.45	0.57	0.11	0.41	0.51	1.0	0.43	0.14	0.27	0.32	0.44	0.14	0.12
AKP15157 (dadA)	0.28	0.33	0.08	1.0	0.21	0.08	0.83	0.3	0.89	0.02	0.03	0.98	0.9	0.24	0.13	0.07	0.09	0.04	0.09	0.75
AKP15158 (alsT_2)	0.28	0.31	0.07	0.86	0.29	0.13	0.72	0.26	0.76	0.02	0.04	0.83	1.0	0.27	0.25	0.11	0.15	0.06	0.06	0.55
AKP15199 (rpoN)	0.48	0.47	0.26	0.71	0.44	0.18	0.64	0.54	0.6	0.16	0.16	0.63	1.0	0.33	0.23	0.18	0.18	0.15	0.21	0.19
AKP15225 (nadD)	0.33	0.26	0.03	0.54	0.3	0.53	0.49	0.26	0.59	0.03	0.19	0.71	1.0	0.25	0.35	0.47	0.62	0.2	0.03	0.34
AKP15274 (WX61_01225)	0.58	0.36	0.13	0.84	0.44	0.29	0.82	0.35	0.76	0.09	0.14	0.77	1.0	0.38	0.47	0.26	0.34	0.18	0.11	0.32
AKP15420 (ccsA)	0.43	0.41	0.29	0.69	0.54	0.34	0.62	0.32	0.57	0.3	0.08	0.59	1.0	0.47	0.56	0.34	0.33	0.11	0.28	0.29
AKP15429 (rssA_2)	0.56	0.49	0.08	1.0	0.35	0.34	0.92	0.47	0.85	0.04	0.13	0.94	0.9	0.38	0.57	0.35	0.34	0.16	0.06	0.35
AKP15444 (WX61_01397)	0.48	0.19	0.19	0.56	0.37	0.42	0.49	0.17	0.52	0.11	0.17	0.49	1.0	0.24	0.43	0.37	0.49	0.18	0.15	0.36
AKP15448 (WX61_01401)	0.34	0.33	0.11	0.59	0.45	0.15	0.52	0.42	0.44	0.08	0.31	0.45	1.0	0.27	0.11	0.14	0.17	0.34	0.07	0.1
AKP15450 (queE)	0.43	0.38	0.19	0.76	0.45	0.21	0.64	0.51	0.58	0.16	0.09	0.64	1.0	0.26	0.12	0.23	0.18	0.09	0.16	0.12
AKP15472 (WX61_01426)	0.42	0.28	0.0	0.41	0.15	0.05	0.36	0.32	0.5	0.0	0.16	0.76	1.0	0.24	0.0	0.05	0.06	0.28	0.0	0.0
AKP15533 (lptF)	0.41	0.34	0.1	0.64	0.57	0.23	0.63	0.47	0.58	0.08	0.15	0.59	1.0	0.28	0.19	0.23	0.22	0.15	0.08	0.18
AKP15557 (trpG)	0.49	0.33	0.21	0.69	0.47	0.51	0.59	0.23	0.63	0.09	0.23	0.51	1.0	0.37	0.43	0.53	0.49	0.39	0.17	0.58
AKP15597 (WX61_01558)	0.33	0.32	0.09	0.8	0.58	0.27	0.82	0.4	0.66	0.12	0.31	0.74	1.0	0.23	0.12	0.27	0.26	0.25	0.1	0.21
AKP15635 (lbpA_2)	0.33	0.19	0.17	0.58	0.42	0.21	0.48	0.24	0.5	0.08	0.05	0.48	1.0	0.09	0.35	0.22	0.19	0.04	0.12	0.2
AKP15757 (pasT)	0.49	0.27	0.18	0.55	0.37	0.42	0.59	0.29	0.42	0.14	0.22	0.47	1.0	0.29	0.35	0.46	0.35	0.22	0.14	0.27
AKP15863 (rusA_3)	0.1	0.07	0.06	0.5	0.12	0.19	0.26	0.12	0.23	0.02	0.01	0.24	1.0	0.05	0.21	0.13	0.26	0.03	0.04	0.31
AKP15868 (WX61_01838)	0.82	0.2	0.09	0.85	0.44	0.51	0.64	0.12	0.7	0.05	0.05	0.6	1.0	0.28	0.37	0.55	0.46	0.1	0.07	0.52
AKP15911 (gabD)	0.48	0.25	0.29	0.73	0.38	0.43	0.57	0.27	0.58	0.13	0.16	0.49	1.0	0.38	0.63	0.38	0.51	0.21	0.21	0.25
AKP15963 (WX61_01935)	0.15	0.16	0.11	0.53	0.29	0.08	0.39	0.26	0.37	0.04	0.04	0.39	1.0	0.12	0.33	0.08	0.08	0.05	0.06	0.1
AKP15965 (WX61_01937)	0.19	0.17	0.11	0.61	0.25	0.16	0.38	0.35	0.4	0.02	0.02	0.39	1.0	0.14	0.21	0.16	0.17	0.03	0.06	0.11
AKP15967 (WX61_01939)	0.3	0.1	0.24	0.65	0.12	0.17	0.55	0.23	0.57	0.04	0.01	0.45	1.0	0.09	0.39	0.16	0.17	0.02	0.12	0.18
AKP15995 (lplT)	0.38	0.28	0.21	0.62	0.34	0.15	0.61	0.28	0.78	0.05	0.1	0.75	1.0	0.3	0.19	0.15	0.17	0.12	0.15	0.32
AKP15997 (ispD)	0.49	0.4	0.07	0.78	0.46	0.41	0.75	0.32	1.0	0.03	0.16	0.81	0.92	0.42	0.48	0.41	0.42	0.22	0.06	0.26
AKP16073 (WX61_02046)	0.24	0.26	0.13	0.33	0.16	0.09	0.37	0.33	0.32	0.04	0.18	0.34	1.0	0.1	0.05	0.09	0.09	0.14	0.07	0.14
AKP16116 (bacA)	0.26	0.3	0.15	0.61	0.33	0.21	0.5	0.37	0.5	0.03	0.11	0.45	1.0	0.21	0.11	0.21	0.2	0.1	0.11	0.17
AKP16139 (capA)	0.37	0.41	0.17	0.45	0.28	0.16	0.43	0.47	0.51	0.08	0.35	0.44	1.0	0.24	0.16	0.16	0.15	0.3	0.12	0.2
AKP16149 (rnr)	0.45	0.46	0.19	0.66	0.45	0.36	0.71	0.52	0.77	0.09	0.39	0.56	1.0	0.37	0.38	0.37	0.33	0.48	0.16	0.51
AKP16182 (WX61_02158)	0.41	0.34	0.3	0.47	0.35	0.11	0.43	0.34	0.34	0.1	0.14	0.33	1.0	0.21	0.18	0.12	0.1	0.15	0.26	0.05
AKP16218 (WX61_02194)	0.15	0.14	0.02	0.61	0.23	0.18	0.44	0.16	0.41	0.01	0.01	0.39	1.0	0.13	0.22	0.2	0.15	0.01	0.01	0.07

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)