Heatmap: Cluster_105 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	AES-1R,ASMDM+	AG1,ciproflaxin	D+7bld	DK2	E01	LB	LB,log	LB,untreated	PA1201	PA14	PA14,0.25xMIC G3KL	PA14,0.25xMIC T7	PA14,0.25xMIC polymyxin-B	PA14,LB	PA14,LB,log	PA14,WT	PA14,ciproflaxin	PA14,cmrA+	PA14,late stat,NaPyruvate+Arabinose	PA14,late stat,untreated	PA14,sutA-KO,late stat,NaPyruvate+Arabinose	PA14,untreated	PA212	PA2596	PA558	PA580	PAK,LB	PAK,WT	PAK,WT,LB	PAK,pilR	PAK,pmrB6,LB	PAO1	PAO1,0.56mg/mL farnesol	PAO1,ABTGC	PAO1,DDS	PAO1,GUN,LB,glucose	PAO1,HapZ,early stat	PAO1,LB	PAO1,LB,glucose	PAO1,LB,untreated	PAO1,M9-CA,early stat	PAO1,M9-CA,log	PAO1,RsmN+	PAO1,SagS,early stat	PAO1,WT	PAO1,WT,BHI	PAO1,WT,LB	PAO1,WT,MOPS acetate	PAO1,WT,MOPS glycerol	PAO1,early stat	PAO1,ersA,BHI	PAO1,lasR rhlR,M9-CA,early stat	PAO1,lasR rhlR,M9-CA,log	PAO1,liquid culture	PAO1,mexZ,LB	PAO1,oxylipin-	PAO1,pBAD-yhjH	PAO1,pUCP18::msr(E)	PAO1,qslA,M9-CA,early stat	PAO1,qslA,M9-CA,log	PAO1,qteE,M9-CA,early stat	PAO1,qteE,M9-CA,log	PAO1,untreated	PAO1,wspFpelApslBCD,LB	PAO1,wspFpelApslBCD,LB,untreated	Y31,LB	Y71,LB	Y82,LB	Y89,LB	ciproflaxin	liquid culture	m pheno	mexT	nirS	pHerdB20T-gp68	untreated
CRO52494 (czcR_1)	0.5	0.18	0.21	0.3	1.0	0.44	0.28	0.18	0.06	0.4	0.49	0.41	0.3	0.41	0.25	0.19	0.33	0.21	0.09	0.24	0.12	0.32	0.17	0.16	0.66	0.74	0.18	0.29	0.2	0.25	0.21	0.36	0.23	0.22	0.19	0.44	0.18	0.25	0.34	0.43	0.19	0.11	0.2	0.14	0.65	0.48	0.22	0.32	0.46	0.18	0.54	0.22	0.13	0.34	0.28	0.13	0.24	0.21	0.17	0.12	0.19	0.1	0.23	0.22	0.14	0.36	0.77	0.45	0.41	0.51	0.33	0.23	0.2	0.25	0.68	0.19
CRO52522 (czcS_1)	0.34	0.15	0.3	0.29	0.99	0.38	0.26	0.07	0.06	0.24	0.18	0.19	0.21	0.16	0.17	0.21	0.12	0.14	0.14	0.19	0.21	0.15	0.11	0.08	0.52	0.57	0.32	0.15	0.18	0.13	0.56	0.26	0.35	0.19	0.17	0.22	0.06	0.19	0.16	0.14	0.16	0.22	0.11	0.04	0.23	0.27	0.19	0.14	0.23	0.05	0.26	0.15	0.21	0.27	0.23	0.02	0.35	0.06	0.13	0.2	0.11	0.23	0.07	0.06	0.05	0.7	1.0	0.8	0.76	0.28	0.18	0.2	0.14	0.16	0.89	0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)