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Heatmap: Cluster_61 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
AES-1R,ASMDM+
AG1,ciproflaxin
D+7bld
DK2
E01
LB
LB,log
LB,untreated
PA1201
PA14
PA14,0.25xMIC G3KL
PA14,0.25xMIC T7
PA14,0.25xMIC polymyxin-B
PA14,LB
PA14,LB,log
PA14,WT
PA14,ciproflaxin
PA14,cmrA+
PA14,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,late stat,untreated
PA14,sutA-KO,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,untreated
PA212
PA2596
PA558
PA580
PAK,LB
PAK,WT
PAK,WT,LB
PAK,pilR
PAK,pmrB6,LB
PAO1
PAO1,0.56mg/mL farnesol
PAO1,ABTGC
PAO1,DDS
PAO1,GUN,LB,glucose
PAO1,HapZ,early stat
PAO1,LB
PAO1,LB,glucose
PAO1,LB,untreated
PAO1,M9-CA,early stat
PAO1,M9-CA,log
PAO1,RsmN+
PAO1,SagS,early stat
PAO1,WT
PAO1,WT,BHI
PAO1,WT,LB
PAO1,WT,MOPS acetate
PAO1,WT,MOPS glycerol
PAO1,early stat
PAO1,ersA,BHI
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,early stat
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,log
PAO1,liquid culture
PAO1,mexZ,LB
PAO1,oxylipin-
PAO1,pBAD-yhjH
PAO1,pUCP18::msr(E)
PAO1,qslA,M9-CA,early stat
PAO1,qslA,M9-CA,log
PAO1,qteE,M9-CA,early stat
PAO1,qteE,M9-CA,log
PAO1,untreated
PAO1,wspFpelApslBCD,LB
PAO1,wspFpelApslBCD,LB,untreated
Y31,LB
Y71,LB
Y82,LB
Y89,LB
ciproflaxin
liquid culture
m pheno
mexT
nirS
pHerdB20T-gp68
untreated
CRN66006 (lspA_1)
 1.3 -0.36 0.54 -1.23 -0.5 1.24 0.1 -0.27 -1.43 0.48 0.08 0.21 0.23 0.34 0.63 0.21 -0.33 0.55 -0.77 -1.06 -0.49 -0.22 -2.1 -0.64 -0.47 -0.04 0.7 -0.66 0.52 -1.59 0.8 -0.33 -0.57 0.14 -1.12 -0.37 -4.68 -0.18 0.28 0.44 -0.45 0.67 -1.0 -4.49 -0.45 0.83 0.58 0.31 0.3 -4.51 1.11 -0.51 0.48 0.46 0.38 -1.97 0.36 -2.35 -0.79 0.46 -0.9 0.57 -1.1 -2.05 -1.63 0.62 0.12 0.15 0.07 1.09 0.72 -0.64 0.55 -1.18 -0.9 0.65
CRN71514 (ask)
 1.33 -0.8 0.15 -0.69 -1.14 0.64 0.07 -0.65 -0.58 -0.1 -0.43 -0.37 -0.36 -0.09 0.37 -0.66 -0.73 0.21 -0.67 -0.32 -0.58 -0.42 -2.04 -1.1 -0.6 -0.31 0.16 -0.67 0.65 -1.24 0.24 -0.42 -0.83 0.31 -0.66 -0.1 -3.08 0.19 0.59 0.29 -0.76 0.62 -0.57 -3.19 -0.21 0.51 0.54 0.93 0.86 -3.07 0.73 -0.39 0.4 0.66 0.51 1.75 -0.01 -1.87 -0.86 0.45 -0.56 0.42 -0.59 -2.01 -1.38 1.02 0.27 0.69 0.53 0.09 0.3 -0.68 0.12 0.35 -0.07 0.38
0.39 -0.73 -0.62 -0.34 -0.35 0.58 0.77 0.2 -0.86 0.2 0.24 0.29 0.26 1.29 1.12 -0.28 0.9 0.13 -0.29 1.07 0.0 0.16 -1.44 -0.36 0.11 0.27 0.07 -0.2 -0.85 -0.34 0.08 -0.35 -1.05 -1.0 -0.96 0.27 -1.22 -0.21 0.65 0.71 -0.01 1.26 -1.26 -1.11 -0.18 -1.4 -0.61 -0.89 -0.83 -1.41 -1.5 -0.06 0.63 -0.7 -0.85 -0.4 -0.09 -1.17 -0.27 1.25 -0.27 0.84 -1.02 -2.06 -1.95 0.09 0.73 0.79 0.33 -0.15 0.36 -0.6 0.04 -1.43 0.07 0.47
CRN72671 (hda)
 -0.58 -0.85 -0.6 -2.62 -1.91 1.03 1.48 -0.59 -3.59 -0.35 -0.81 -0.65 -0.79 0.55 1.43 -1.21 -1.12 0.38 -2.68 -0.91 -2.12 -0.96 -2.17 -3.21 0.39 0.92 -0.42 -1.61 -0.74 -2.48 -0.11 -0.82 -0.93 -1.23 -0.39 1.44 -4.18 -0.66 2.12 2.1 0.52 1.12 -2.35 -4.16 -1.28 -1.02 0.23 -0.51 -0.59 -4.1 -0.16 0.58 1.39 -0.27 0.07 -1.0 -0.38 -2.85 -0.11 1.29 0.07 1.03 -2.05 -3.4 -3.06 0.67 0.89 0.87 0.38 0.98 0.73 -1.58 0.2 -2.84 -1.19 1.18
0.08 -0.64 -0.64 -0.59 -0.27 0.99 1.27 0.65 0.39 -0.15 0.11 0.12 0.02 0.85 0.47 -0.17 -2.04 -0.42 -0.28 0.55 -0.39 0.01 -0.73 0.14 -0.4 -0.62 -0.25 0.0 -1.13 -0.08 -0.06 -0.12 -0.83 0.24 -1.67 1.54 0.54 -0.24 1.02 1.22 0.26 -0.23 0.46 0.48 0.46 -1.95 -0.7 -0.2 0.31 0.48 -1.89 0.13 -0.22 -0.67 -0.75 0.34 -0.3 -0.5 0.11 -0.38 0.09 -0.29 -0.2 -1.34 -1.45 -0.46 -0.09 -0.2 -0.6 -0.2 0.62 -0.38 -0.43 -2.11 -0.55 0.68
CRN97047 (purB_1)
 0.57 -0.48 -1.03 -1.36 -1.1 0.15 0.62 -0.89 -2.78 0.04 -0.06 -0.09 -0.31 -0.12 0.1 -0.05 -0.32 1.18 -0.6 0.7 -0.65 -0.1 -2.33 -1.55 -1.0 -0.59 0.36 -1.38 -1.19 -2.3 0.33 -0.85 -0.81 -0.45 -1.21 0.54 -2.48 -0.38 1.61 1.66 0.57 1.57 -0.92 -3.04 0.21 -1.95 0.42 -0.57 -0.26 -2.54 -1.72 1.17 1.64 -0.5 0.5 -0.4 -0.2 -3.4 0.12 1.56 0.37 1.43 -1.71 -3.57 -3.66 -0.08 0.2 0.05 -0.08 0.76 -0.09 -0.61 0.88 -1.43 -0.44 0.55
CRN98093 (queD)
 -0.27 -0.84 -1.14 -2.03 0.14 -0.01 0.79 0.67 -2.17 0.24 0.37 0.32 0.12 1.37 0.87 -1.07 0.02 0.27 -1.49 0.56 -1.38 0.53 -1.85 -1.21 -1.6 -1.14 0.03 -0.99 -1.02 -1.29 0.27 -0.69 -1.21 -0.38 0.19 1.2 -1.08 -0.39 1.31 1.88 -0.69 0.02 -2.76 -1.52 1.17 -2.11 1.28 -1.39 -1.0 -0.94 -1.79 -0.74 0.28 -0.67 1.14 2.09 -0.53 -1.79 -1.34 0.01 -1.46 -0.14 -1.73 -2.31 -2.75 0.35 0.11 0.31 -0.06 0.42 0.59 -0.19 0.19 -2.79 -0.63 1.45
-0.65 -0.49 -0.8 -0.94 -0.07 0.42 0.71 -0.64 -1.22 0.14 -0.04 0.07 -0.14 -0.13 0.55 -0.53 0.45 1.13 -1.07 -0.7 -0.82 -0.06 0.78 -1.38 -0.28 0.33 -0.41 -0.24 -0.32 -0.29 -0.12 -0.17 -0.85 -0.62 0.05 0.48 -2.33 -0.5 1.2 1.23 -0.2 1.01 -1.84 -2.09 -0.23 -0.34 0.88 0.52 0.15 -2.13 0.59 0.69 0.83 0.05 1.05 0.28 -0.38 -2.07 -0.88 0.8 -0.73 0.8 -0.82 -2.73 -2.52 -0.44 -0.09 -0.18 -0.65 0.68 -0.5 -0.71 1.0 -0.88 -0.09 0.92
-0.14 -0.74 -0.6 -1.31 -1.37 0.59 1.35 0.31 -1.74 0.02 0.2 0.16 -0.03 0.99 1.11 -0.89 -0.81 0.86 -0.83 0.56 -0.93 0.63 -2.98 -1.51 -1.54 -1.12 0.85 -0.56 -0.82 -1.4 0.89 -0.82 -1.81 0.48 -1.74 1.45 -3.01 -0.68 1.5 1.41 -0.8 -0.94 -2.11 -2.93 0.76 -2.73 1.19 -0.33 -0.47 -2.86 -2.74 -0.73 -0.77 0.09 1.0 1.07 -0.02 -2.33 -1.37 -1.01 -1.72 -0.95 -1.74 -2.55 -3.08 1.56 0.9 0.92 0.92 0.49 0.74 -0.52 0.62 -2.98 -0.95 1.13
CRO07407 (ppsR)
 0.05 0.43 0.23 0.11 0.08 0.08 0.95 0.36 0.06 -0.16 1.07 0.94 0.6 0.75 -0.41 -0.71 -0.85 -0.76 -0.23 -0.06 0.09 0.82 -0.51 0.06 -0.55 -0.98 0.25 0.13 -0.9 -0.17 0.25 -0.27 0.56 0.32 -0.75 0.11 -0.79 -0.12 -0.32 -0.41 -0.32 -1.77 -0.12 -1.05 0.46 -0.47 0.13 -0.64 -0.33 -0.71 -0.34 -0.47 -1.58 -0.35 0.02 1.48 0.03 -0.53 -0.34 -1.44 -0.45 -1.51 -0.69 -0.55 -0.71 0.85 0.5 0.55 0.53 0.3 0.56 0.77 -0.73 -1.19 -0.22 0.14
CRO13664 (bamA)
 0.66 -0.58 -0.34 -1.76 -1.33 0.59 0.56 -0.7 -1.35 -0.0 0.0 0.04 -0.12 0.19 0.77 -0.03 -0.13 0.58 -0.14 -0.19 0.2 0.23 -1.24 -1.13 -0.49 -0.56 0.29 -0.76 -0.41 -1.51 0.46 -0.59 -0.91 0.04 -1.86 0.04 -1.99 -0.2 0.48 0.57 -0.14 0.6 -0.99 -2.16 0.58 -0.39 1.15 -0.37 -0.76 -2.07 0.21 0.08 0.49 -0.12 1.14 2.05 0.2 -1.9 -0.54 0.45 -0.34 0.54 -0.75 -1.8 -1.67 0.2 0.56 0.74 0.41 0.69 0.48 -0.35 0.52 -1.65 -1.44 0.42
CRO17589 (mltF_1)
 -0.29 -1.12 -0.19 -1.5 0.06 1.15 0.61 -0.37 -1.77 -0.22 -0.03 0.16 -0.09 0.72 0.77 0.42 -0.69 -0.53 -0.39 0.45 -0.25 -0.24 -1.88 -0.95 0.14 0.26 -0.12 -0.45 -0.91 -1.0 -0.13 -0.67 -1.09 -0.48 -1.07 0.75 -4.27 -0.08 0.42 0.81 1.17 0.96 -1.72 -4.3 -0.34 -0.61 -0.02 -1.05 -1.13 -4.06 0.11 1.21 1.11 -0.15 0.05 -0.3 -0.34 -2.16 0.59 1.03 0.85 1.01 -1.5 -2.54 -2.77 0.73 0.85 0.85 0.75 0.73 0.87 -0.61 -0.59 -2.57 -0.76 0.41
CRO20612 (carA)
 0.8 -0.0 -1.51 -0.62 -0.26 -0.66 -0.3 1.09 -1.55 0.46 0.96 0.84 0.83 0.21 1.13 0.83 0.65 0.86 0.44 1.12 0.43 0.81 -2.54 0.86 -0.93 -0.7 0.6 0.01 -0.47 -0.63 0.65 -0.85 -0.88 0.06 -2.04 -0.23 -3.25 -0.45 0.2 0.04 -0.39 0.65 -1.64 -3.35 0.03 -2.24 0.05 -0.27 -0.49 -3.38 -1.84 -0.2 0.48 -0.06 -0.21 -0.57 0.37 -2.04 -1.15 0.43 -1.1 0.48 -1.41 -2.21 -2.54 0.48 0.42 0.4 0.35 -0.01 -0.02 0.05 0.7 -0.38 0.05 0.25
CRO20648 (leuE_2)
 0.3 -0.26 -1.21 -0.51 -0.12 -0.28 -0.29 0.78 -1.68 0.57 0.55 0.51 0.48 0.87 0.5 0.16 -0.29 0.67 0.37 0.91 0.43 0.41 -2.04 0.18 -1.29 -1.06 0.41 -0.57 -0.47 -1.1 0.45 -0.77 -0.43 -0.45 -2.42 0.39 -1.53 -0.53 0.86 1.3 0.06 0.9 -1.72 -1.68 0.11 -0.56 0.77 -0.32 -0.68 -1.6 -0.66 0.36 0.75 -0.12 0.46 -3.48 0.09 -1.85 -0.37 0.8 -0.57 0.89 -1.5 -2.09 -2.4 0.61 0.53 0.43 0.26 0.03 0.42 -0.65 0.53 -1.3 -0.27 0.05
CRO27984 (dut)
 0.18 -1.37 -1.05 -0.34 -0.12 0.14 -0.09 0.11 -0.43 0.59 0.61 0.71 0.6 1.2 1.21 0.24 2.02 0.36 -0.69 -0.24 -0.45 0.55 -2.45 -1.12 0.09 0.22 0.6 -0.45 0.82 -0.82 0.72 -0.52 -0.92 -0.06 -2.32 -0.35 -4.04 -0.8 0.23 -0.02 -0.56 0.26 -0.85 -4.31 -0.3 -0.94 -0.13 0.04 0.07 -4.19 -0.8 -0.34 0.29 0.38 -0.18 -3.89 0.89 -1.58 -0.92 0.12 -0.99 -0.03 -1.26 -3.1 -3.08 0.99 0.87 0.85 0.82 0.38 0.02 -0.68 0.23 0.02 0.15 0.17
CRO28742 (xpt)
 0.17 -1.11 -1.38 -2.06 -1.88 0.73 1.64 -0.87 -1.69 -0.23 -0.24 -0.17 -0.3 0.78 2.16 -1.06 0.4 1.04 -1.29 -0.25 -1.18 -0.09 -1.87 -1.51 -0.05 0.27 -0.04 -1.07 -0.7 -2.03 -0.1 -0.84 -1.18 -0.95 -1.21 0.6 -2.07 -0.82 1.53 1.66 0.16 1.53 -2.13 -2.88 -1.06 -1.82 0.03 -1.08 -0.89 -2.12 -1.23 0.18 1.47 -0.27 0.08 -2.09 -0.67 -2.28 -0.75 1.48 -0.93 1.69 -1.63 -3.0 -2.74 -0.09 0.58 -0.05 -0.06 0.6 0.92 -1.21 0.91 -1.77 -0.93 1.11
CRO46823 (rne)
 -0.1 -0.6 -1.2 -0.45 -0.49 -0.19 0.94 0.34 -1.01 0.53 -0.1 -0.11 -0.03 0.57 0.54 1.56 0.71 0.5 -0.8 0.85 -0.79 0.0 -2.5 -1.28 -1.33 -1.18 -0.06 -0.56 -0.56 -1.57 0.07 -0.72 -1.73 0.88 -1.41 0.86 -3.78 -0.71 1.68 1.68 -0.56 -0.13 -1.02 -3.71 0.59 -2.02 -0.06 -0.32 -0.18 -3.66 -2.03 -0.63 -0.26 0.09 -0.11 -0.3 -0.61 -1.55 -0.82 -0.26 -0.91 -0.18 -1.51 -2.49 -2.41 1.73 1.2 1.39 1.2 0.14 0.83 -0.67 0.24 -1.32 -0.43 0.63
0.64 -0.77 0.13 -0.4 -0.21 0.87 1.05 -0.02 -1.58 0.34 0.33 0.41 0.36 0.4 0.45 0.37 -0.3 0.36 -0.17 0.19 -0.09 0.24 -1.21 -1.1 0.09 0.43 0.67 -0.8 -0.97 -1.07 0.72 -0.58 -0.19 -0.35 -1.04 0.07 -2.13 -0.42 0.27 0.26 0.09 -0.12 -1.2 -2.19 -0.14 -0.51 0.09 -0.97 -0.56 -2.06 -0.02 0.26 -0.12 -0.15 -0.05 -1.39 0.28 -2.09 0.53 -0.05 0.23 -0.35 -1.81 -2.09 -1.85 1.33 1.54 1.06 1.12 -0.16 0.39 0.06 0.22 -1.0 -0.08 -0.03
CRO47438 (icaR)
 1.19 -0.14 -0.73 -0.84 -1.09 0.74 0.67 -0.67 -0.93 -0.29 0.14 -0.06 -0.4 0.12 0.43 -0.35 -1.33 -0.07 -0.11 -0.21 0.46 -0.35 -0.59 -1.53 0.32 0.56 0.48 -0.93 -1.24 -1.58 0.23 -0.07 0.69 -0.02 -1.07 0.76 0.69 -0.12 0.81 0.86 0.28 0.55 -0.07 0.52 0.14 -0.42 -0.56 0.17 0.58 0.58 -0.23 0.51 0.45 -0.82 -0.2 0.46 -0.21 -0.93 -0.08 0.36 -0.07 0.62 -0.69 -1.47 -0.76 -1.26 -0.47 -0.86 -0.88 -0.42 0.6 -0.69 -0.15 -0.91 0.3 0.63
CRO57149 (hemE)
 0.63 -0.71 -0.5 -0.9 -0.18 0.47 0.41 -1.06 -1.4 0.1 0.7 0.68 0.47 -0.08 0.58 -0.35 0.65 0.42 -1.15 -0.08 -1.03 0.4 -1.68 -2.06 0.32 0.75 1.06 0.52 -0.57 -0.14 1.01 -0.45 -0.48 -0.03 -1.06 0.36 -2.74 -0.38 0.9 0.62 0.14 0.11 -0.98 -3.18 -0.21 -0.78 0.17 0.56 0.2 -2.34 -0.06 0.49 0.09 0.25 0.32 -0.96 0.53 -2.49 -0.57 0.0 -0.78 0.08 -1.04 -2.83 -3.11 0.46 0.67 0.5 0.42 0.64 0.68 -0.97 0.37 -0.2 0.21 0.09
CRO57283 (aroB)
 0.8 -0.45 0.36 -1.26 -0.55 0.59 0.1 -0.07 -1.25 0.37 0.25 0.36 0.13 0.96 0.49 0.11 -0.03 0.13 -0.63 0.5 -0.45 -0.03 -1.86 -0.73 0.13 -0.02 0.64 -0.03 -0.08 -0.7 0.65 -0.41 -1.22 -0.56 -1.58 -0.64 -2.03 -0.19 -0.89 -0.6 0.54 0.5 -0.58 -2.11 -0.16 0.21 0.38 0.12 0.15 -1.91 0.33 0.5 0.46 -0.31 0.4 -0.95 0.38 -0.82 -0.01 0.38 0.05 0.5 -0.58 -1.18 -1.5 0.68 0.63 1.01 0.71 0.71 -0.19 -0.06 0.14 -0.77 -0.46 0.3
0.33 -1.27 -1.03 -0.43 -0.96 1.11 0.96 -0.52 -2.09 -0.26 -0.17 -0.15 -0.35 0.57 1.1 -0.47 -0.95 0.5 -1.06 -0.25 -0.55 -0.23 -1.81 -1.91 -0.44 0.16 0.18 -0.8 -0.78 -1.29 0.28 -0.55 -0.93 -0.3 -1.53 0.46 -0.57 -0.56 0.8 0.82 0.46 1.04 -0.61 -0.74 -0.47 -0.71 -0.16 -0.28 -0.1 -0.65 -0.12 0.56 1.09 -0.45 -0.02 0.84 0.13 -1.55 -0.2 1.03 -0.29 0.99 -1.07 -1.67 -1.76 0.51 1.38 0.34 0.86 0.65 0.56 -0.75 0.35 -1.91 -0.55 0.63
CRO61743 (hpt)
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CRO73245 (birA)
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CRO81407 (tyrS_1)
 0.71 0.17 -0.89 -1.69 -0.88 1.52 1.49 -0.05 -2.26 -0.09 -0.38 -0.29 -0.4 -0.08 0.68 -0.9 -1.76 -0.15 -1.04 -0.91 -0.64 -0.53 -0.99 -1.37 -0.83 -0.36 0.27 -0.89 -0.49 -1.33 0.53 -0.4 -0.56 -0.28 -1.2 1.31 -0.76 -0.56 1.59 1.74 -0.27 0.14 -1.15 -1.17 0.09 -0.55 0.36 -0.27 -0.28 -0.78 0.35 -0.17 0.34 -0.14 0.23 0.92 0.31 -1.74 -0.81 0.42 -0.45 0.35 -0.92 -1.58 -1.43 0.96 0.58 0.66 0.31 0.92 0.37 -0.03 -0.17 -1.85 -0.97 0.55
-0.28 0.04 -0.22 -1.12 0.06 -0.53 0.85 -0.53 -1.33 0.12 0.47 0.42 0.24 1.34 0.94 0.24 0.17 0.03 0.39 0.57 0.62 0.35 -1.08 -0.86 -0.68 -0.59 -0.16 -0.64 -1.21 -1.33 -0.07 -0.6 0.45 -0.16 -1.13 1.44 -2.14 -1.0 1.42 1.6 -0.46 -1.14 -0.42 -2.5 0.63 -1.06 1.45 -0.41 -0.5 -2.09 -0.66 -0.57 -1.0 -0.3 1.34 0.43 0.18 -1.54 -0.69 -1.11 -0.87 -0.9 -0.98 -1.92 -1.87 0.13 0.42 0.54 0.37 0.42 0.66 -0.14 0.01 -1.42 -0.94 0.04
CRO83215 (surA_2)
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CRO94643 (fklB_2)
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CRO95170 (rluA_1)
 -0.8 -2.13 -1.98 -0.54 0.1 0.98 1.84 -0.64 -1.9 0.82 0.36 0.32 0.27 1.46 2.0 -0.25 0.05 0.64 0.02 0.44 -0.19 0.56 -2.29 -1.0 -0.33 -0.32 -0.25 -0.84 -1.02 -1.07 -0.22 -0.61 -2.62 -0.69 -1.58 0.92 -1.55 -1.11 1.99 1.95 -1.79 -0.26 -1.21 -1.76 -0.17 -2.67 0.01 -0.68 -0.44 -1.64 -2.1 -1.35 -0.4 0.12 -0.21 -1.75 -0.59 -2.08 -2.51 -0.56 -2.28 -0.46 -1.54 -2.85 -2.83 0.56 1.33 0.7 0.78 0.6 0.75 -0.4 0.41 -2.08 0.32 0.9
CRO95230 (minD_2)
 -0.24 -0.84 -0.54 -0.84 -1.63 0.71 1.09 -0.99 -1.51 0.02 0.31 0.29 0.13 0.34 0.43 -0.98 0.53 0.55 -1.11 -0.11 -1.07 0.46 -1.38 -1.06 0.41 0.36 0.43 -0.11 -0.32 -0.0 0.39 -0.34 -1.28 0.29 -0.93 0.14 -3.1 -0.23 0.63 0.97 0.45 0.09 -0.64 -3.28 -0.34 -1.09 0.28 0.52 0.32 -3.02 -0.39 0.3 0.0 0.01 0.26 1.26 0.42 -1.52 0.1 0.04 0.19 0.21 -0.86 -2.33 -2.08 0.41 0.65 0.61 0.72 0.65 0.52 0.51 0.44 -1.47 -0.59 0.24
CRO95259 (minC)
 -0.64 -0.71 -0.49 0.11 0.38 1.1 1.33 -0.77 -1.72 0.07 0.28 0.29 0.09 1.05 0.67 0.0 -0.18 0.24 -0.54 0.49 -0.32 0.27 -0.86 -1.23 0.95 0.65 -0.42 0.18 -0.07 0.65 -0.29 -0.07 -0.05 0.08 -0.48 0.6 -1.69 -0.04 0.49 0.75 -0.96 -2.53 -0.94 -1.95 -0.23 -0.32 -0.6 0.46 0.4 -1.78 0.42 -1.33 -2.27 0.3 -0.35 -3.08 0.63 -1.33 -1.18 -2.34 -1.18 -2.16 -0.93 -1.82 -1.8 0.61 0.77 0.56 0.74 0.61 0.64 1.05 0.07 -0.32 0.77 0.21
CRO98630 (uvrY_2)
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CRP08791 (lpoA)
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CRP09848 (lptA)
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CRP21614 (pitA_2)
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CRP22511 (efp)
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CRP23205 (alaA)
 0.07 -0.99 -0.81 -0.38 -0.65 0.57 0.96 -0.36 -1.11 0.23 0.14 0.12 -0.09 0.43 1.11 -0.11 1.01 1.0 -0.89 -0.22 -0.53 0.08 -1.65 -1.59 -0.64 -0.41 0.01 -0.94 -0.51 -1.89 0.21 -0.5 -0.74 0.17 -0.79 0.69 -3.17 -0.51 0.78 0.76 0.3 0.65 -0.83 -3.4 -0.28 -0.8 0.09 0.35 0.67 -2.88 -0.44 0.55 0.64 -0.13 0.28 0.36 0.02 -2.56 -0.24 0.49 -0.18 0.59 -1.17 -3.52 -2.75 0.18 0.74 0.39 0.56 0.76 0.45 -0.46 0.86 -1.1 -0.28 1.19
CRP28619 (luxQ_2)
 0.64 -0.08 0.76 -0.32 0.86 1.59 1.01 -0.48 -0.48 0.07 0.49 0.53 0.4 0.52 0.31 0.03 -1.57 -0.09 -0.4 0.41 -0.19 0.25 -0.49 -0.4 -0.43 -0.26 0.31 -0.49 -0.7 -0.63 0.61 -0.41 -0.33 -0.09 -1.27 0.17 -1.28 -0.31 -0.21 -0.16 -0.95 -1.12 -1.11 -1.69 0.37 0.72 0.58 -0.69 -0.55 -1.3 0.85 -0.97 -1.12 -0.43 0.38 -2.59 -0.19 -1.27 -0.93 -1.22 -0.73 -0.95 -1.06 -1.79 -1.16 1.77 1.04 1.13 0.93 0.01 -0.12 0.42 -0.12 -1.21 0.13 -0.23
CRP29541 (sdhD)
 0.32 -0.62 -0.43 -1.55 -1.91 -0.78 -0.51 0.37 -2.43 0.17 0.18 0.08 0.07 0.82 -0.46 -0.34 -1.08 1.06 -1.15 0.02 -0.54 -0.12 -3.19 -1.78 -2.45 -1.97 0.27 -1.47 -0.17 -1.59 0.38 -1.09 -1.69 -0.54 -2.0 -0.41 -4.76 -0.14 -0.19 0.4 0.81 1.47 -0.47 -4.59 0.09 -1.98 0.89 1.62 0.78 -4.61 -1.61 0.88 1.3 -0.02 0.8 -1.18 -0.8 -3.28 0.24 1.42 0.22 1.47 -1.46 -3.7 -4.2 1.21 0.65 0.8 0.7 1.16 0.63 -0.36 0.79 -3.24 -1.57 1.11
CRP36268 (ybeY)
 -0.15 -0.89 -0.12 -1.62 -1.32 0.9 0.56 0.08 -2.13 0.52 0.6 0.65 0.61 0.92 0.55 -0.61 1.13 0.99 -1.22 -0.4 -1.28 0.61 -2.46 -0.97 -1.32 -1.24 0.47 -0.58 0.1 -1.52 0.57 -0.88 -2.66 0.14 -2.28 0.73 -3.88 -0.82 1.49 1.74 -1.04 -0.34 -2.35 -3.68 0.32 -0.33 1.3 -0.81 -0.76 -3.82 -0.09 -1.71 -0.56 0.76 1.24 -0.2 -0.23 -1.72 -1.85 -0.63 -1.62 -0.4 -1.39 -2.93 -2.9 1.48 1.05 1.17 1.08 -0.11 0.62 -0.9 0.79 -1.3 -0.99 0.23
-0.07 -1.7 -1.22 -2.82 -0.89 0.66 1.45 -0.44 -2.95 0.51 0.26 0.3 0.12 1.46 1.49 -0.81 -1.16 0.97 -1.31 0.46 -1.2 0.09 -0.95 -3.26 0.49 0.99 1.07 -1.31 -1.44 -2.93 0.97 -0.37 -0.28 -0.92 -0.31 0.88 -2.42 -0.62 1.37 1.28 -0.96 0.17 -2.18 -2.7 0.72 -1.29 1.0 -1.08 -0.35 -2.49 -1.6 -0.98 0.18 -0.59 0.99 -2.49 -0.17 -2.81 -1.33 0.12 -1.72 0.2 -2.05 -3.83 -3.66 0.03 1.26 0.57 0.56 0.61 -0.14 -0.62 0.83 -0.94 0.33 1.26
CRP39932 (lolA)
 0.62 -0.13 0.25 -1.35 -0.68 0.75 0.17 -0.46 -1.04 0.31 0.26 0.44 0.42 1.02 0.46 0.26 0.23 0.12 -0.63 -0.06 -0.54 0.22 -2.33 -0.7 -0.66 -0.56 0.53 -0.33 0.08 -1.3 0.7 -0.48 -0.52 -0.0 -1.35 -0.66 -2.85 0.38 -0.4 -0.4 0.04 -0.01 -1.58 -2.74 -0.09 0.18 0.77 -0.4 -0.57 -2.91 0.46 0.4 -0.03 0.17 0.83 1.21 0.4 -0.84 -0.21 -0.15 -0.2 -0.06 -1.01 -1.26 -1.64 0.97 0.83 1.16 0.94 0.27 0.72 -0.35 -0.02 -0.87 -0.67 -0.17
CRP40862 (ccmE)
 1.38 0.15 0.84 -1.86 -1.56 0.57 0.46 -0.47 -1.25 0.48 0.14 0.17 0.07 0.43 0.44 -0.17 -0.67 -0.22 -0.45 -0.15 -0.45 -0.16 -1.25 -1.43 -0.39 0.13 0.26 -0.37 -0.98 -1.37 0.48 -0.75 0.7 -0.53 -1.14 0.23 -3.35 0.54 0.4 0.3 1.02 1.03 -0.32 -3.78 -0.92 0.34 -0.18 0.29 -0.48 -2.99 0.82 1.6 0.73 -0.49 0.1 0.25 -0.48 -3.25 0.83 0.65 0.73 0.89 -1.58 -3.77 -2.92 0.78 -0.2 0.16 -0.32 -0.1 0.24 -1.1 -0.35 -1.05 -0.6 -0.06
CRP40919 (dsbE)
 2.13 -0.2 1.06 -1.34 -0.19 0.59 -0.28 -0.35 -0.85 0.3 0.59 0.67 0.53 0.35 -0.13 0.03 0.75 0.02 -0.25 -0.43 -0.24 0.25 -1.91 -1.0 -0.56 -0.05 0.6 -0.21 -0.29 -0.96 0.71 -0.59 0.41 -0.24 -1.38 0.31 -4.05 -0.29 0.29 0.32 0.05 0.36 -0.09 -4.12 -0.36 0.19 0.13 0.69 -0.12 -4.13 0.54 0.13 0.03 -0.03 0.19 0.33 -0.2 -2.83 0.1 -0.13 -0.19 0.13 -1.37 -3.62 -2.43 0.85 -0.26 0.24 -0.1 -0.51 0.43 -0.67 -0.12 0.1 -0.2 0.15
0.5 -0.75 0.18 -0.7 0.46 0.58 0.46 0.67 -1.98 0.18 0.65 0.7 0.62 0.67 0.12 0.03 -0.44 -1.0 -0.99 0.03 -0.89 0.27 -1.75 -0.87 0.01 0.05 -0.03 -0.4 -0.79 -1.29 0.12 -0.67 0.15 -0.55 -1.43 -0.04 -2.95 -0.43 -0.41 -0.46 0.85 -0.43 -2.18 -2.99 -0.26 -0.12 0.22 -1.19 -0.84 -2.83 0.16 0.23 0.08 0.48 0.31 -3.49 0.25 -2.02 0.37 0.28 -0.53 0.13 -2.13 -2.68 -3.25 1.59 1.96 1.54 1.66 0.57 0.35 -0.13 -0.96 -0.64 0.7 -0.69
CRP47946 (fbp_2)
 0.13 -0.94 -0.49 -0.37 -0.9 0.75 0.68 0.09 -0.85 -0.02 0.49 0.49 0.42 -0.07 -0.06 0.32 0.76 0.35 -0.37 0.28 -0.29 0.2 -1.57 -0.71 -0.31 -0.24 0.23 -0.3 0.74 -1.03 0.18 -0.34 -0.75 0.28 -1.16 0.01 -2.36 -0.63 0.58 0.5 -1.14 -0.78 -1.03 -2.94 0.13 0.07 0.71 -0.47 -0.24 -2.32 0.41 -1.34 -0.83 1.23 0.64 1.2 0.59 -1.3 -1.8 -0.66 -1.82 -0.75 -0.67 -1.73 -1.84 0.47 0.91 0.78 1.09 0.93 0.78 0.28 0.2 -0.45 -0.21 0.31
CRP48485 (secB)
 -0.73 -0.31 -0.51 -1.86 -1.83 0.17 -0.35 -1.04 -1.82 0.27 0.42 0.39 0.34 0.01 0.78 -0.34 0.91 0.85 -0.85 0.65 -0.76 0.51 -2.18 -1.75 -0.64 0.14 -0.09 -0.4 0.74 -0.74 -0.34 -0.26 -1.17 1.07 -0.62 -0.36 -4.43 -0.3 0.31 0.19 -0.09 0.37 -1.52 -4.67 -0.36 -1.49 0.89 0.99 -0.22 -4.62 -1.01 0.28 0.34 1.15 0.95 1.86 0.75 -1.6 -0.76 0.32 -0.74 0.44 -0.14 -1.66 -1.42 -0.02 0.02 0.13 0.21 1.02 0.46 -1.08 0.72 -0.31 -0.61 0.33
CRP48516 (grxC)
 0.0 -2.44 -0.57 -1.54 -1.78 1.12 1.29 -0.77 -1.5 -0.03 0.47 0.42 0.29 0.55 1.23 -0.79 -0.63 0.37 -1.74 -0.59 -1.51 0.79 -2.01 -1.23 -1.28 -0.74 -0.01 -1.17 -0.93 -1.52 0.02 -0.55 -2.38 -1.32 -1.06 1.62 -4.85 -0.65 2.18 2.51 -0.53 0.33 -2.18 -5.82 0.17 -0.62 1.6 -0.65 -1.05 -4.8 0.49 -0.78 0.27 -0.34 1.86 -0.87 -0.13 -2.73 -1.7 0.07 -1.82 0.37 -1.57 -3.06 -2.63 0.13 0.27 -0.04 0.2 0.82 0.57 -1.23 0.15 -1.4 -0.74 0.83
CRP48958 (hisB)
 0.1 -1.43 -0.9 -1.7 -1.38 0.96 1.09 -0.7 -1.89 -0.21 -0.04 0.01 -0.13 0.4 1.26 -0.46 0.8 0.18 -0.73 0.26 -0.62 -0.1 -2.26 -1.74 0.42 0.19 -0.59 -0.4 -0.76 -1.14 -0.44 -0.85 -1.03 -0.57 -1.42 1.12 -0.86 -0.1 1.47 1.49 0.92 0.84 -1.18 -1.1 -0.6 -0.32 -0.23 -0.54 -0.15 -1.06 0.52 1.13 0.83 -0.38 -0.2 0.02 -0.09 -2.16 0.43 0.94 0.39 0.7 -1.48 -2.44 -2.49 0.06 0.24 0.01 0.36 0.39 0.68 -1.28 0.12 -1.71 -0.88 0.61
0.09 -0.98 -1.31 -1.14 0.41 0.79 1.5 -0.96 -1.85 -0.02 -0.38 -0.34 -0.55 0.14 1.13 -0.15 0.08 0.95 -1.68 -1.1 -1.65 -0.26 -1.5 -2.56 0.3 0.47 0.47 -0.57 -0.66 -1.99 0.37 -0.46 -1.37 -0.04 -0.92 0.81 -2.21 -0.57 1.58 1.62 -0.17 1.01 -1.7 -2.2 -0.49 -2.01 0.17 -0.48 -0.32 -2.25 -1.29 0.02 0.89 0.2 0.36 -0.91 0.35 -3.04 -0.94 0.77 -0.94 1.01 -1.43 -3.63 -3.73 0.53 0.74 0.61 0.39 0.51 0.83 -0.32 0.8 -1.79 0.59 1.15
0.12 -0.67 -1.27 0.39 0.13 0.57 1.84 1.74 0.88 -0.29 -0.55 -0.65 -0.89 1.11 0.87 -0.53 -2.33 -2.68 0.56 0.5 1.26 -0.87 0.02 -0.35 0.22 -0.06 -1.54 0.75 -2.47 0.67 -1.38 -0.09 0.09 0.29 -1.35 2.4 0.48 -1.52 1.03 0.95 -1.84 -4.2 0.83 0.77 -0.23 -1.43 -2.33 -0.5 0.11 0.61 -0.7 -1.92 -4.13 -0.82 -2.34 -2.66 -0.65 -0.15 -1.39 -4.09 -1.41 -4.09 -0.36 -0.91 -0.43 -0.42 0.07 -0.7 -0.53 -0.63 0.0 -0.45 -2.67 -1.08 0.88 1.08
CRP57553 (folD)
 0.04 -1.48 -0.6 -0.27 -0.16 0.31 0.6 0.22 -1.44 0.19 0.26 0.25 0.13 0.37 0.58 0.23 0.46 0.9 -0.59 0.44 -0.46 0.27 -1.82 -1.51 -0.08 0.36 0.23 -0.45 -0.11 -1.22 0.27 -0.37 -1.52 0.01 -1.04 0.39 -3.98 -0.35 0.63 0.92 -0.27 0.17 -0.72 -3.96 -0.25 -1.82 0.95 0.23 0.09 -3.66 -1.37 -0.28 0.21 0.6 0.9 -0.95 0.69 -1.9 -0.86 0.25 -0.66 0.11 -1.28 -2.12 -2.59 1.02 0.97 0.78 0.87 0.71 0.32 -0.36 0.73 -1.3 -0.44 1.15
CRP70019 (recF)
 0.35 -0.07 0.3 -1.7 -0.08 0.87 0.1 -0.4 -1.51 0.12 -0.01 0.17 0.14 0.67 0.61 -0.85 -0.43 0.66 -1.14 -0.03 -1.06 -0.06 -2.74 -0.62 -0.69 -0.34 0.3 -0.18 0.36 -1.06 0.44 -0.63 -1.31 -0.2 -1.82 0.03 -2.84 -0.28 0.45 0.72 0.81 0.87 -0.89 -3.13 0.02 -0.67 0.81 -0.73 -0.57 -2.65 -0.4 0.45 0.66 0.26 0.74 -2.03 0.24 -1.44 0.2 0.81 0.12 0.78 -0.92 -1.89 -2.24 1.2 0.91 1.08 1.13 0.31 0.4 -1.13 0.75 -0.84 -1.1 0.12
CRP70319 (soj_8)
 -0.21 -1.48 -1.19 -1.63 -1.18 0.47 1.71 -0.12 -1.81 0.52 0.5 0.58 0.42 0.89 1.68 -0.52 1.2 0.47 -0.06 0.06 0.04 0.45 -2.94 -1.39 -0.77 -0.52 -0.16 -0.77 -0.69 -1.08 -0.12 -0.72 -1.62 -0.31 -2.09 1.25 -3.17 -0.27 1.24 1.38 -0.24 0.58 -1.71 -2.95 -0.31 -1.75 -0.32 -0.75 -0.93 -3.19 -1.06 -0.09 0.56 0.29 -0.21 0.18 -0.16 -2.32 -0.47 0.53 -0.39 0.52 -1.48 -2.9 -2.66 1.02 1.22 0.8 1.06 0.32 0.09 -0.93 0.44 -2.38 -0.88 0.49
1.78 0.15 -0.66 -0.7 0.14 0.42 0.11 0.31 0.12 0.61 0.72 0.86 1.02 0.62 -0.06 -0.13 -3.07 -0.69 0.84 1.7 0.97 0.63 -1.25 0.37 0.09 -0.73 0.58 0.17 -1.0 -0.25 0.9 -0.44 -0.25 -0.31 -1.65 -0.67 0.87 -0.92 -0.99 -0.65 0.03 -1.83 0.55 -0.11 0.65 0.42 -0.43 -0.75 -0.53 0.7 0.57 -0.48 -1.15 -1.07 -0.41 -2.64 -0.74 -0.75 -0.03 -1.39 -0.43 -1.36 -0.84 -1.04 -0.95 0.15 0.33 0.09 0.3 -0.79 -1.15 -0.13 -0.65 -0.75 -0.76 -0.62
CRP82138 (purC)
 -0.14 -0.55 0.31 -1.01 -0.16 0.55 0.2 -0.84 -0.91 0.22 0.05 0.1 0.16 -0.2 0.38 0.23 2.13 0.49 -0.6 -0.41 -0.31 0.04 -1.75 -0.51 -0.57 -0.08 0.26 -0.36 0.57 -0.87 0.28 -0.17 -1.01 0.47 -0.03 -0.33 -2.3 -0.34 0.24 -0.36 -0.54 0.1 -0.51 -2.27 -0.41 -0.46 0.04 0.51 0.01 -2.21 -0.23 -0.39 0.14 0.62 0.0 1.46 0.74 -0.84 -1.03 -0.0 -0.83 0.14 -0.09 -1.54 -0.96 0.21 -0.5 -0.12 -0.16 0.89 0.4 -0.6 0.43 0.89 0.0 0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.