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Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
AES-1R,ASMDM+
AG1,ciproflaxin
D+7bld
DK2
E01
LB
LB,log
LB,untreated
PA1201
PA14
PA14,0.25xMIC G3KL
PA14,0.25xMIC T7
PA14,0.25xMIC polymyxin-B
PA14,LB
PA14,LB,log
PA14,WT
PA14,ciproflaxin
PA14,cmrA+
PA14,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,late stat,untreated
PA14,sutA-KO,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,untreated
PA212
PA2596
PA558
PA580
PAK,LB
PAK,WT
PAK,WT,LB
PAK,pilR
PAK,pmrB6,LB
PAO1
PAO1,0.56mg/mL farnesol
PAO1,ABTGC
PAO1,DDS
PAO1,GUN,LB,glucose
PAO1,HapZ,early stat
PAO1,LB
PAO1,LB,glucose
PAO1,LB,untreated
PAO1,M9-CA,early stat
PAO1,M9-CA,log
PAO1,RsmN+
PAO1,SagS,early stat
PAO1,WT
PAO1,WT,BHI
PAO1,WT,LB
PAO1,WT,MOPS acetate
PAO1,WT,MOPS glycerol
PAO1,early stat
PAO1,ersA,BHI
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,early stat
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,log
PAO1,liquid culture
PAO1,mexZ,LB
PAO1,oxylipin-
PAO1,pBAD-yhjH
PAO1,pUCP18::msr(E)
PAO1,qslA,M9-CA,early stat
PAO1,qslA,M9-CA,log
PAO1,qteE,M9-CA,early stat
PAO1,qteE,M9-CA,log
PAO1,untreated
PAO1,wspFpelApslBCD,LB
PAO1,wspFpelApslBCD,LB,untreated
Y31,LB
Y71,LB
Y82,LB
Y89,LB
ciproflaxin
liquid culture
m pheno
mexT
nirS
pHerdB20T-gp68
untreated
0.56 -0.83 0.05 -0.95 2.71 1.12 -0.76 -0.77 -2.4 -0.35 -0.58 -0.53 -0.58 -1.06 -1.19 0.69 0.47 -0.96 -0.49 -0.8 0.09 -0.81 -0.72 -2.46 0.24 0.43 -0.29 -0.39 -1.09 -0.35 0.02 0.06 -0.79 0.03 -1.06 0.19 -1.92 -0.69 -0.22 -0.28 0.03 0.04 -2.28 -2.14 -0.71 -0.3 -0.15 -0.35 -0.27 -1.65 0.1 -0.17 0.1 0.95 -0.21 -1.61 0.47 -1.31 -0.34 0.14 -0.73 0.16 -1.76 -1.81 -2.85 1.41 1.81 1.05 1.22 0.51 -1.32 -0.88 -0.83 -1.33 2.27 -1.22
0.02 -0.75 -0.31 -0.48 1.47 1.13 0.13 -0.54 0.2 -0.04 -0.03 -0.0 -0.08 0.22 0.25 0.68 0.46 -0.3 -0.19 0.2 0.2 -0.32 -1.17 -1.04 0.72 1.01 -1.28 0.05 -0.46 -0.24 -0.94 0.2 -1.19 0.54 -1.47 -0.31 -1.83 -0.62 -0.57 -1.11 0.16 -0.49 -0.97 -1.91 -0.34 0.27 -0.67 0.59 0.14 -1.59 0.17 0.19 -0.4 0.88 -0.77 -0.36 0.42 -0.4 0.24 -0.39 0.03 -0.2 -0.6 -2.05 -2.18 1.12 1.01 1.0 0.8 -0.37 -0.31 -0.46 -0.36 -1.33 1.58 -0.49
0.07 -0.51 -0.14 -0.09 1.01 0.26 -0.03 -0.51 0.18 -0.22 -0.54 -0.43 -0.46 -0.2 -0.52 -0.03 0.21 -0.66 -0.64 -0.29 -0.21 -0.89 -0.25 -1.68 0.61 0.64 -0.85 0.56 -0.97 0.31 -0.74 0.15 -0.56 0.38 -1.4 -0.17 0.01 -0.2 -0.76 -0.91 0.41 -0.34 -0.29 -0.25 -0.09 0.37 0.02 0.42 0.1 0.13 0.81 0.12 -0.41 0.95 -0.04 -1.05 0.11 -0.19 0.23 -0.54 0.25 -0.33 -0.3 -1.26 -1.05 1.36 1.31 1.14 0.87 0.13 -0.64 -0.41 -0.78 -1.15 1.07 -1.05
CRN89501 (vanW)
 -0.53 -0.67 0.18 -0.92 0.56 0.87 -0.06 -0.8 -1.19 -0.06 -0.31 -0.24 -0.25 0.1 -0.07 0.09 -0.41 -0.81 -0.28 1.5 0.22 -0.48 -0.74 -1.25 0.6 1.26 -0.74 -0.38 -1.2 -0.76 -0.4 -0.05 -0.54 -0.07 -0.63 0.85 -2.03 -0.32 0.19 0.09 -0.04 -0.42 -1.0 -2.58 -0.68 0.74 0.61 0.3 0.23 -2.34 1.64 -0.13 -0.39 0.46 0.63 -1.99 0.44 -1.11 -0.31 -0.49 -0.4 -0.43 -0.87 -0.48 -1.45 1.01 1.42 1.02 0.93 0.09 -0.26 -1.08 -0.55 -1.26 0.66 0.07
0.1 -0.62 0.07 0.26 1.06 0.84 -0.73 -1.69 0.29 0.05 -0.44 -0.43 -0.49 0.35 -0.9 1.47 0.2 -0.78 0.85 2.02 1.06 -0.62 -1.74 -1.98 0.78 0.78 -1.11 -0.27 -0.23 -1.04 -0.77 0.03 -1.16 0.84 -1.15 -0.14 -1.69 -0.69 -0.1 0.0 -0.0 -1.5 -0.95 -1.32 -1.28 -0.38 -2.06 0.89 0.8 -1.44 -0.45 -0.32 -1.48 1.42 -2.49 -1.19 0.86 -0.67 -0.28 -1.49 -0.46 -1.45 -0.67 -2.29 -2.24 0.95 1.11 0.81 0.98 0.43 -0.12 -0.71 -0.95 -2.95 1.59 -1.91
0.14 -1.32 0.04 -0.07 1.5 0.7 -0.25 -0.83 0.28 0.12 0.14 0.15 0.09 -0.34 0.02 0.53 0.53 -0.57 0.43 0.73 0.51 -0.05 -0.91 -0.77 1.02 0.51 -0.82 -0.37 -1.13 -0.61 -0.55 -0.02 -0.22 0.24 -1.78 -0.3 -0.46 -0.5 -1.08 -0.9 0.85 0.04 -1.31 -0.66 -0.74 0.67 -0.81 0.12 0.38 -0.47 0.68 0.28 -0.18 0.83 -0.94 -2.29 0.26 -1.05 0.5 -0.45 0.44 0.01 -0.86 -1.89 -1.56 0.81 0.98 -0.35 0.76 -0.57 -0.5 -1.11 -0.49 -0.28 1.29 -0.56
CRN99778 (afsK)
 0.3 -2.1 0.22 -0.43 2.04 1.28 -0.84 -1.82 0.6 0.08 0.08 0.09 -0.04 0.04 -0.04 0.8 0.26 -0.56 0.3 0.31 0.38 -0.39 -1.17 -1.71 0.77 0.62 -0.82 -0.5 -0.23 -1.13 -0.39 0.04 -1.25 0.54 -1.82 0.31 -2.28 -0.37 0.06 0.03 -0.26 -0.64 -1.38 -2.14 -0.77 1.09 -0.91 0.56 0.5 -2.27 0.77 -0.38 -0.8 0.93 -0.77 -1.24 0.33 -0.48 -0.57 -0.85 -0.67 -0.48 -0.55 -1.45 -1.6 1.24 1.01 -0.24 0.84 -0.96 0.04 -0.84 -0.66 -1.52 1.91 -1.1
-0.44 -3.02 0.03 -0.69 2.71 1.25 -0.33 -1.33 0.1 0.17 0.23 0.33 0.26 0.69 0.24 0.31 1.14 -0.71 0.48 0.37 0.35 -0.07 -0.81 -1.62 0.46 0.51 -1.84 -0.18 -0.7 -1.2 -1.55 0.04 -2.74 0.38 -2.24 0.87 -3.47 -0.87 1.24 1.05 -2.49 -2.9 -1.77 -2.87 -0.4 0.73 -0.46 0.36 0.23 -3.43 0.25 -2.61 -2.87 1.22 -0.5 -0.56 -0.08 -0.36 -2.58 -3.15 -2.86 -2.94 -0.68 -2.88 -2.8 1.1 0.56 -0.1 0.5 -1.0 0.17 -1.39 -0.86 -1.16 2.5 -1.02
CRO15402 (cph2_2)
 0.95 -0.44 0.01 0.64 0.41 0.31 0.15 -0.22 -0.05 0.3 -0.03 0.03 0.11 0.52 0.1 0.8 -0.16 -0.52 0.53 0.74 0.97 -0.03 -0.3 -0.64 0.33 0.22 -0.29 -0.24 -0.33 -0.14 -0.17 0.02 0.37 0.11 -1.4 0.08 -0.42 0.0 -0.13 -0.06 0.29 -0.66 0.34 -0.41 -0.67 0.08 -0.73 -0.29 -0.2 -0.51 0.19 0.0 -0.63 -0.41 -0.77 -1.23 0.22 0.22 0.31 -0.64 0.44 -0.63 -0.09 -1.57 -1.0 0.11 0.36 0.26 0.24 -0.67 0.51 0.15 -0.49 -0.3 0.18 -0.25
CRO15435 (cheB)
 1.14 -1.06 0.06 0.92 0.73 0.31 -0.03 -0.6 0.2 0.11 -0.09 0.09 0.19 0.27 0.09 0.08 -0.7 -0.3 0.37 1.19 0.78 0.08 -0.15 -0.85 1.25 0.91 0.41 0.01 -0.22 0.13 0.55 0.02 -0.14 0.45 -1.61 0.0 -0.28 -0.58 -0.54 -0.44 -1.02 -0.97 0.13 -0.21 -0.37 0.55 -0.4 -0.29 -0.13 -0.2 0.94 -1.65 -1.35 -0.32 -0.31 -4.0 0.26 -0.07 -0.97 -1.36 -0.95 -1.13 -0.11 -2.86 -2.29 0.67 0.63 0.4 0.62 -0.86 0.04 -0.01 -0.19 -0.13 0.16 -0.46
CRO15467 (cheA_1)
 1.37 -1.19 -0.01 0.72 0.73 -0.34 -0.64 -0.71 -0.27 0.18 -0.06 0.11 0.31 -0.2 0.35 0.7 -0.97 0.03 0.13 -0.46 0.5 -0.22 -1.22 -1.14 1.17 0.97 0.27 -0.51 0.23 -0.39 0.42 -0.17 0.05 0.19 -1.98 -0.53 -1.32 -0.16 -0.41 -0.08 0.48 0.37 -0.29 -1.04 -1.05 0.13 -0.66 -0.14 -0.47 -1.23 0.4 0.17 0.21 0.25 -0.73 -4.01 1.04 -0.61 0.43 0.21 0.29 0.4 -0.63 -2.98 -2.26 0.88 0.47 0.44 0.6 -1.15 0.23 0.15 0.02 -0.64 0.18 -0.62
1.33 -0.94 0.04 0.26 0.4 -0.21 -0.19 -0.1 -0.46 0.22 -0.23 -0.12 -0.09 0.57 0.37 0.03 -0.94 -0.1 -0.21 -0.04 0.29 -0.17 -0.2 -1.2 0.43 0.39 -0.22 -0.11 -0.18 -1.0 -0.01 -0.2 0.01 0.05 -1.38 -0.45 -1.27 0.1 -0.13 0.31 0.99 0.86 -0.41 -0.97 -0.89 0.27 -1.02 -0.55 -0.7 -1.08 0.48 0.91 0.72 0.29 -0.89 -2.35 0.72 -0.68 0.92 0.46 1.0 0.6 -0.55 -2.76 -2.28 0.57 0.66 0.18 0.56 -0.79 0.32 -0.38 -0.15 -1.74 0.06 -0.79
CRO15606 (mcpB_2)
 1.23 -0.35 0.19 0.73 0.24 -0.13 -0.48 0.39 0.4 -0.08 -0.04 0.01 0.02 0.0 -0.16 0.48 0.13 -0.39 -0.16 -0.59 0.38 -0.1 -0.4 -0.41 0.51 0.35 -0.13 0.39 0.33 0.3 -0.15 0.02 0.41 0.43 -1.07 -0.51 0.27 -0.11 -0.58 -0.84 -0.52 -1.35 0.55 0.03 0.03 0.45 -0.25 -0.45 0.05 0.21 0.49 -0.77 -1.44 0.14 -0.18 -0.41 0.5 0.01 -0.39 -1.44 -0.43 -1.35 0.04 -1.49 -1.48 0.59 0.67 0.26 0.86 -0.58 -0.08 -0.32 -0.39 0.47 -0.36 0.0
CRO39531 (dctB_1)
 0.82 -0.56 -0.17 1.07 1.51 0.39 0.59 -0.98 -1.34 0.07 0.49 0.6 0.52 0.48 0.58 0.19 -0.22 0.46 0.05 -0.56 -0.06 0.21 -1.34 -1.61 -0.01 0.78 -0.23 -0.49 -0.82 -0.76 0.04 -0.33 -0.53 0.38 -1.62 -0.38 -2.05 -0.08 -0.58 -0.22 0.2 0.1 -0.74 -2.13 0.01 -0.16 -0.8 -0.2 -0.46 -2.19 -0.22 0.2 -0.19 0.82 -0.79 -1.75 0.42 -1.23 -0.06 -0.11 0.1 -0.19 -1.04 -3.15 -2.57 1.16 1.52 0.92 0.21 -0.13 0.37 -0.36 0.22 -1.21 1.11 -0.72
CRO39560 (dctD_1)
 0.94 -0.12 0.01 0.72 1.26 0.24 -0.36 -1.41 -0.95 -0.19 0.47 0.51 0.62 -0.65 -0.68 0.31 -0.95 0.22 -0.02 -1.12 -0.0 0.22 -0.7 -1.57 0.59 0.85 -0.65 -0.44 -0.59 -0.15 -0.38 -0.07 0.63 0.86 -1.43 -0.75 -0.7 0.15 -1.31 -1.18 0.54 0.02 -0.54 -0.75 -0.53 1.03 -1.34 0.1 0.04 -0.76 0.57 0.57 0.1 0.4 -1.34 -2.0 0.54 -0.77 0.35 0.08 0.39 0.1 -0.72 -2.09 -1.36 0.83 0.74 0.48 -0.01 -0.22 0.02 -0.09 0.15 -0.38 1.02 -1.62
-0.45 -0.18 -0.46 2.41 1.82 0.74 -0.49 -2.0 -0.13 -0.15 0.29 0.26 0.28 -0.99 -1.25 0.22 0.54 -0.82 0.02 0.55 0.42 -0.03 -0.68 -0.74 1.0 0.62 -1.04 0.57 -1.12 1.05 -1.0 0.39 1.45 0.28 -0.9 -1.04 0.18 -0.73 -1.25 -1.81 -0.02 -1.61 -0.19 -0.16 -0.64 -0.18 -4.13 -0.27 0.38 0.02 -0.34 -0.57 -1.15 0.08 -2.64 -4.95 0.26 -0.72 -0.1 -1.34 -0.57 -1.22 -0.41 -1.85 -1.02 0.09 0.68 0.36 0.19 -0.15 -0.14 0.63 -0.95 -0.52 1.42 -1.98
CRO49591 (glpQ1_2)
 0.66 0.11 -0.3 2.98 1.98 0.45 -0.83 -0.77 0.44 -0.66 -0.93 -1.03 -0.94 -0.83 -1.72 -0.48 -0.92 -2.33 -1.07 -0.11 -0.27 -1.18 -0.34 -0.93 0.7 0.34 -0.59 0.59 -0.2 0.63 -0.56 0.68 1.09 0.54 -1.79 -0.42 -0.27 -0.89 -1.26 -1.44 -0.15 -2.98 0.3 -0.49 -0.63 1.16 -2.44 -0.45 0.38 -0.16 0.81 -1.07 -2.66 0.19 -2.17 -2.43 -0.04 -0.02 -0.35 -2.66 -0.7 -2.37 0.05 -0.66 0.37 -0.24 0.9 -0.15 0.17 -1.24 -0.45 0.24 -2.33 0.95 1.4 -1.32
CRO49991 (selB)
 1.04 0.24 0.34 1.05 1.2 0.43 -1.2 -0.72 -0.52 0.13 0.12 0.25 0.42 -0.3 -0.24 0.67 0.58 -0.06 -0.37 -0.08 0.15 -0.09 -1.75 -0.38 0.69 0.48 -0.71 -0.32 -1.15 -0.16 -0.23 -0.18 0.66 -0.41 -0.98 -0.95 -1.42 -0.32 -1.16 -1.48 0.78 0.21 0.06 -1.5 -1.24 0.48 -1.69 -0.44 -0.21 -1.31 0.48 0.41 0.17 0.35 -1.77 -4.0 0.9 -0.99 0.42 0.07 0.22 0.28 -1.09 -2.14 -1.65 0.93 0.65 0.53 0.68 -0.5 -0.1 -0.09 -0.2 0.12 1.31 -1.33
CRO50015 (selA)
 0.26 -0.09 0.17 0.79 0.89 0.35 -0.56 -0.77 -0.44 0.1 0.02 0.12 0.19 -0.54 -0.23 0.33 1.13 0.04 -0.92 -0.18 -0.56 -0.06 -1.51 -0.47 0.38 0.33 -0.68 0.12 -0.19 -0.07 -0.28 -0.36 0.3 -0.64 -0.84 -0.94 -1.47 -0.03 -0.71 -0.94 0.63 0.21 -0.36 -1.53 -1.1 0.71 -1.65 -0.42 0.01 -1.47 0.82 0.31 0.11 0.51 -1.39 -3.43 0.63 -1.06 0.3 0.17 0.28 0.31 -1.0 -2.35 -1.93 1.19 1.17 0.97 1.17 -0.21 0.13 -0.63 -0.07 0.01 1.24 -1.02
0.64 -0.47 -0.26 -0.88 1.14 -0.79 -1.41 -0.41 -1.42 0.56 0.35 0.3 0.47 -0.28 -0.51 1.12 2.13 0.59 -0.28 -0.51 -0.22 0.22 -1.41 -0.54 0.14 -0.18 0.23 0.51 -0.42 0.61 0.66 -0.7 -0.24 -0.9 -0.98 -1.47 -0.3 -0.78 -0.93 -1.52 -0.55 -0.23 0.24 -1.2 -0.62 -0.86 -1.98 -1.12 -1.4 -0.28 -0.99 -1.03 -0.23 0.06 -1.9 -3.69 0.63 -2.78 -1.07 -0.41 -1.29 0.08 -1.75 -3.6 -3.76 1.77 1.43 1.34 1.4 -0.77 0.36 0.33 0.33 0.38 1.55 -0.5
CRO50084 (fdoI)
 0.6 -0.2 1.07 -1.68 -1.57 -1.46 -2.13 -0.96 -1.74 0.2 -0.16 -0.04 0.07 -0.4 -0.82 -0.36 0.81 0.38 -0.63 -1.57 -0.67 -0.41 -0.82 -0.77 0.26 -0.1 0.55 0.58 -1.23 1.14 1.2 -0.29 0.39 -1.29 -0.89 -1.36 1.93 -0.49 -1.52 -1.24 -1.41 -1.63 1.44 0.79 0.23 -0.32 -2.36 -1.98 -2.53 2.21 -0.37 -2.15 -1.8 -0.27 -2.24 -4.13 0.47 -3.73 -1.96 -1.36 -2.53 -0.9 -1.03 -4.57 -4.59 1.85 1.35 1.25 1.6 -0.26 0.03 -0.43 0.21 1.69 -0.38 -0.94
CRO50118 (fdoH)
 0.51 -0.45 0.31 -2.33 -2.15 -1.47 -1.8 0.07 -2.57 0.12 -0.53 -0.39 -0.29 -0.54 -0.74 -1.05 0.74 0.04 -1.33 -3.04 -1.52 -0.53 -1.6 -0.91 -0.49 -0.84 -0.14 0.25 -1.35 0.84 0.47 -1.0 -0.81 -1.5 -2.02 -1.16 1.86 1.24 -1.11 -1.01 0.64 0.52 0.57 0.79 -0.05 0.42 -2.01 -2.44 -3.25 2.07 0.17 0.49 0.29 -0.67 -2.15 -2.1 -0.28 -4.09 1.17 0.54 0.95 0.46 -1.36 -5.1 -5.26 1.47 1.13 1.26 1.45 -0.58 0.65 -0.51 -0.23 0.9 -0.04 -0.09
CRO50155 (fdoG)
 0.5 -0.18 -0.23 -1.99 -1.64 -0.94 -1.21 -0.34 -2.28 0.5 -0.16 -0.03 0.11 -0.29 -0.38 -0.08 1.61 0.76 -0.66 -1.71 -0.77 -0.2 -1.24 -1.17 -0.57 -0.98 -0.3 0.51 -0.43 1.03 0.34 -0.76 -0.71 -1.0 -1.88 -0.62 1.67 -0.18 -0.74 -0.7 -0.47 -0.59 0.63 0.6 0.36 -0.21 -1.9 -1.57 -2.12 1.88 -0.35 -1.33 -0.4 0.19 -1.78 -2.15 0.19 -3.5 -0.34 -0.05 -0.71 0.01 -0.84 -4.76 -4.23 1.68 1.38 1.34 1.7 0.0 0.72 -0.34 0.44 0.6 0.33 -0.08
CRO50186 (fdnG)
 -0.55 -0.57 -0.75 -0.68 -2.45 0.74 -0.25 -0.19 -1.57 0.09 -0.25 -0.13 -0.02 0.72 0.17 0.06 0.83 -0.07 0.05 -1.26 -0.29 -0.28 -0.76 -1.48 -0.21 -0.94 -1.03 0.83 -0.36 1.59 -0.5 -0.51 -0.48 -0.69 -1.99 0.1 2.04 -0.52 -0.16 -0.28 -1.58 -2.73 1.38 1.93 0.23 -0.46 -1.52 0.09 -0.44 2.08 -0.2 -2.73 -2.45 0.01 -1.4 -0.35 -0.09 -2.29 -1.11 -1.79 -1.69 -1.93 -0.67 -2.71 -1.82 0.69 0.57 0.49 1.03 0.17 1.16 0.05 -0.26 -0.13 0.13 0.35
CRO53656 (yvdD)
 -0.43 -1.24 -0.16 -0.91 1.36 0.17 -0.32 -1.14 -1.18 0.29 0.23 0.21 0.24 -0.14 0.25 0.46 0.42 1.38 -0.62 -0.09 -0.48 -0.16 -1.69 -1.76 0.63 0.94 -0.73 -0.16 0.45 -0.97 -0.64 -0.2 -0.59 -0.58 -0.31 -0.61 -2.86 -0.56 0.2 -0.2 -0.31 1.05 -1.57 -2.91 -0.94 -0.04 -0.46 0.09 -0.32 -2.98 0.46 -0.01 1.16 0.52 -0.2 -3.2 0.73 -2.09 -0.3 0.91 -0.64 1.29 -1.2 -3.05 -2.5 0.47 0.9 0.56 0.41 0.58 0.08 -0.44 1.37 -0.99 1.04 -0.72
-0.32 -0.93 -0.35 -0.18 1.41 0.89 -0.05 -1.22 -0.94 0.3 0.3 0.42 0.31 0.51 0.12 0.57 0.87 0.22 -0.35 0.0 -0.18 0.03 -1.62 -1.68 0.33 0.53 -0.68 -0.07 -0.49 -0.22 -0.57 -0.13 -0.6 -0.27 -1.47 0.01 -2.49 -0.73 0.04 -0.21 0.16 0.58 -1.64 -2.69 -1.17 -0.19 -0.74 0.23 0.24 -2.54 -0.23 0.01 0.4 0.71 -0.68 -3.49 0.44 -0.99 -0.1 0.4 -0.09 0.6 -0.89 -2.82 -2.63 0.93 1.6 0.85 1.05 -0.17 0.09 -0.33 0.19 -0.81 1.59 -0.97
1.1 -0.65 0.16 1.46 1.29 1.19 -0.71 -1.33 0.03 0.16 0.42 0.44 0.4 -0.13 -0.33 0.15 -0.91 -0.82 0.02 0.24 -0.19 0.04 0.11 -0.07 1.45 1.06 -0.19 0.68 -0.06 1.37 0.05 0.13 1.54 -0.07 -1.05 -0.73 -1.28 -0.6 -1.3 -2.14 -0.42 -1.48 0.08 -0.93 -1.59 0.04 -1.75 0.24 0.23 -1.6 0.21 -0.96 -1.76 0.0 -1.89 -5.1 0.66 -1.01 -0.21 -1.78 -0.43 -1.79 -1.34 -2.52 -1.6 0.13 0.75 0.29 0.25 -0.96 -0.03 0.05 -0.69 -1.34 1.69 -1.42
CRP04455 (cobJ)
 1.6 -1.37 -0.22 1.15 1.32 0.66 -0.21 -2.61 -1.55 0.23 0.57 0.78 0.63 -1.48 -0.52 1.1 -0.56 0.77 0.12 1.43 0.56 0.18 -1.74 -1.87 0.92 1.28 0.28 -1.16 0.3 -2.02 0.34 -0.28 -0.32 0.15 -0.37 -1.36 -2.89 -0.67 -0.68 -0.81 -2.15 0.17 -2.0 -3.22 -1.77 -0.4 -0.92 0.03 -0.16 -2.96 -0.14 -1.94 -0.1 0.78 -1.02 -5.17 1.08 -2.77 -2.44 -0.0 -2.15 0.08 -2.0 -4.27 -3.51 1.02 0.91 1.06 0.74 0.17 -0.53 0.52 0.69 -1.06 1.56 -1.98
CRP04516 (cobH)
 0.97 -1.17 -0.72 0.98 0.86 1.19 0.05 -3.22 -1.96 0.37 0.22 0.52 0.32 -0.26 0.07 1.66 -1.2 0.99 -0.06 0.93 0.41 0.31 -1.67 -1.71 0.63 0.81 0.43 -1.27 0.66 -1.6 0.48 -0.37 -0.32 0.4 -0.03 -0.57 -5.2 -0.78 0.4 -0.0 -2.18 0.26 -2.38 -3.69 -2.01 -0.44 -1.0 0.55 0.23 -4.21 -0.06 -1.39 0.12 0.94 -1.28 -7.44 0.58 -3.43 -2.65 0.21 -2.45 0.13 -2.51 -4.65 -4.9 0.61 0.66 0.7 0.56 0.92 0.16 0.4 0.85 -2.45 1.67 -2.21
CRP04545 (sir_3)
 0.89 -1.3 -0.82 1.01 1.71 0.77 -0.21 -3.41 -2.56 0.08 -0.01 0.1 0.01 -1.33 -0.55 1.3 -0.08 0.85 -0.51 1.17 0.02 -0.05 -2.52 -2.09 1.08 1.33 0.19 -1.35 -0.71 -1.88 0.27 -0.27 -0.47 -0.16 -0.41 -0.97 -4.15 -0.4 -0.77 -0.27 -1.32 1.07 -2.29 -4.58 -1.82 -1.06 -1.21 -0.22 0.07 -4.74 -0.34 -0.97 0.64 0.35 -1.07 -4.01 1.22 -3.12 -1.68 0.73 -1.51 0.88 -2.78 -4.81 -5.7 0.81 1.74 1.19 1.05 0.62 -0.24 0.13 0.75 -3.91 1.58 -3.42
CRP06166 (ndoR)
 -0.27 -0.46 0.01 0.49 1.42 0.2 -1.47 -1.92 -0.15 0.58 0.33 0.3 0.31 -0.56 -0.27 0.75 -0.23 -1.32 0.48 0.81 0.81 -0.15 -0.22 0.11 1.78 1.69 -1.15 0.21 -1.32 0.07 -0.76 0.04 0.2 -0.0 -1.02 -1.06 -1.34 0.01 -1.76 -1.46 1.09 -0.95 -0.99 -1.35 -1.48 -0.17 -1.8 -0.1 0.26 -1.3 0.25 1.03 -0.9 0.3 -1.77 -3.75 0.38 -1.28 1.56 -0.87 1.23 -0.57 -1.32 -2.05 -1.81 0.77 0.45 -0.17 -0.14 -0.6 -1.36 -1.06 -1.26 -0.18 1.46 -2.55
CRP21349 (recD)
 1.01 -0.53 0.11 0.64 1.34 0.55 -1.23 -1.97 -1.26 0.23 0.52 0.62 0.66 -0.67 -0.58 1.12 0.17 0.03 0.42 0.12 0.58 0.14 -1.51 -0.25 1.14 1.02 -0.37 -0.7 -0.2 -0.1 -0.17 -0.01 0.35 -0.04 -1.31 -1.3 -1.63 -0.68 -1.22 -1.42 -0.97 -0.99 0.2 -1.36 -1.21 0.64 -1.21 0.25 0.08 -1.6 0.55 -1.09 -1.24 0.54 -1.26 -3.91 0.93 -0.24 -0.99 -1.33 -1.01 -1.05 -0.62 -1.55 -1.34 1.54 0.99 0.9 0.83 -0.79 -0.32 0.29 -0.02 0.4 1.2 -1.74
CRP21385 (recB)
 1.1 -0.34 0.08 0.3 0.98 0.96 -0.57 -1.52 -1.5 0.01 0.32 0.43 0.45 -0.5 -0.16 0.54 -0.1 0.06 -0.0 -0.48 0.3 0.02 -1.5 -0.71 0.71 0.61 -0.42 -0.94 -0.38 -0.69 -0.18 -0.1 0.4 -0.06 -1.26 -0.2 -1.63 -0.43 -0.35 -0.47 -0.44 -0.18 1.48 -1.45 -1.14 1.14 -0.81 -0.09 -0.18 -1.57 1.05 -0.6 -0.31 0.33 -0.8 -2.22 0.79 -0.48 -0.57 -0.29 -0.53 -0.27 -0.72 -1.07 -0.89 1.3 0.66 0.81 0.56 -0.7 -0.25 -0.02 -0.01 0.16 0.69 -1.05
CRP21417 (recC)
 0.83 -0.62 -0.13 0.21 0.95 0.77 -1.16 -1.59 -1.31 0.04 0.35 0.5 0.48 -0.35 -0.03 0.93 -0.19 0.09 0.06 -0.12 0.39 0.07 -1.28 -1.34 1.07 0.95 -0.33 -0.64 -0.38 -0.65 -0.09 -0.11 0.2 -0.3 -1.27 -0.83 -1.43 -0.46 -0.79 -0.77 -0.1 0.2 -0.12 -1.35 -1.12 0.81 -0.96 -0.16 -0.13 -1.42 0.85 -0.21 -0.01 0.24 -0.81 -2.75 1.12 -0.7 -0.05 -0.16 -0.23 0.06 -0.88 -1.47 -1.3 1.22 1.0 1.0 0.87 -0.36 0.27 -0.07 0.05 -0.23 0.77 -1.04
CRP36924 (hrpB_1)
 0.63 -0.26 0.08 0.55 2.48 0.84 -1.32 -2.13 -3.47 0.24 -0.13 -0.01 -0.06 0.35 -1.04 0.95 0.97 0.1 0.23 1.29 0.65 -0.27 -0.17 -1.97 1.59 1.57 -0.92 -0.84 -0.26 -1.73 -0.79 0.11 0.43 -0.66 0.85 -0.51 -2.39 -1.12 -0.88 -0.6 -3.25 -2.61 -1.43 -2.67 -0.28 -0.22 -0.95 0.0 0.09 -2.23 0.36 -2.72 -3.13 0.03 -0.94 -2.29 1.47 -1.88 -2.71 -2.43 -2.79 -2.68 -1.4 -1.79 -2.51 0.33 0.72 1.16 0.49 0.85 -0.08 -0.67 0.11 -3.97 2.19 -3.01
CRP59494 (rpfC_3)
 0.79 -0.91 -0.58 -1.37 2.0 0.67 -0.95 -0.72 -1.61 -0.21 -0.69 -0.71 -0.78 -0.33 -0.7 0.48 -0.69 -1.5 -0.73 0.3 -0.26 -1.07 -0.61 -1.49 0.48 1.27 -1.08 -0.74 -1.94 -1.47 -0.65 -0.04 -1.23 0.3 -1.85 -0.41 -2.49 -0.57 -0.96 -0.72 -0.04 -0.25 -2.3 -2.71 -0.38 0.25 0.18 0.1 -0.48 -2.31 1.5 0.08 -0.26 1.09 0.17 -1.14 -0.09 -2.41 -0.37 -0.73 -0.57 -0.32 -2.0 -2.41 -3.33 2.28 1.91 2.26 1.2 -0.03 -1.7 -1.5 -1.54 -1.78 2.17 -0.89
CRP59914 (pspB)
 0.36 -1.63 -0.14 -0.94 1.58 0.6 0.01 -3.19 -1.39 0.75 0.9 1.08 1.17 -0.39 0.69 0.88 -0.25 1.03 0.02 0.1 0.32 0.49 -2.23 -1.68 1.13 1.16 0.58 -1.02 0.38 -1.47 0.79 -0.58 -1.38 -1.21 -1.29 -1.14 -4.31 -0.98 -0.12 -0.86 -2.34 -0.26 -2.2 -4.01 -1.96 0.5 0.05 -1.02 -1.37 -4.78 0.81 -3.02 -0.72 0.53 0.22 -5.46 1.18 -2.77 -2.55 -0.72 -2.64 -0.45 -2.1 -4.08 -3.99 1.49 1.2 1.53 1.23 -0.65 -0.43 0.15 1.0 -1.74 1.41 -2.24
CRP59938 (cobT)
 0.3 -1.3 -0.08 0.29 1.06 1.4 -0.31 -4.28 -1.32 0.33 0.62 0.68 0.74 -0.86 -0.33 1.27 -0.09 0.79 0.18 0.27 0.41 0.21 -1.61 -1.96 1.75 1.79 -0.56 -1.07 0.58 -1.07 -0.44 -0.39 -0.33 -0.27 -0.26 -0.69 -3.15 -1.25 -0.57 -0.68 -3.36 -1.11 -2.09 -3.61 -2.38 -0.79 -2.05 0.04 -0.21 -4.03 -0.75 -3.38 -1.35 1.35 -1.77 -6.19 1.16 -3.02 -3.73 -1.37 -3.59 -1.18 -2.44 -5.51 -4.04 2.08 1.28 1.28 1.35 -0.09 0.4 0.37 0.76 -1.83 1.73 -3.31
CRP59963 (cobP)
 0.14 -1.29 0.08 -1.62 0.31 0.78 -0.9 -4.24 -1.42 0.21 0.14 0.31 0.48 -1.17 -0.73 0.4 -0.78 0.75 -0.74 -0.82 -0.72 -0.14 -1.48 -2.64 1.08 1.21 -0.15 -1.78 0.36 -1.62 0.05 -0.76 -1.28 -0.81 -0.76 -1.52 -3.76 -0.43 -1.44 -1.23 -0.77 1.98 -2.63 -4.35 -2.4 1.14 -0.12 -1.18 -1.67 -3.83 1.49 -0.7 1.66 0.53 0.22 -4.14 0.41 -2.61 -1.3 1.63 -1.03 1.86 -2.05 -4.52 -3.57 1.82 1.04 1.17 1.21 -0.3 -0.12 -0.59 0.65 -1.44 0.81 -2.57
CRP59994 (cobQ)
 1.55 -1.37 -0.35 -1.14 1.13 1.29 0.21 -3.24 -1.35 0.4 0.67 0.78 0.81 -0.55 0.68 0.48 -0.09 1.13 -0.28 0.03 0.05 0.33 -1.38 -2.59 1.09 1.3 0.02 -1.24 0.47 -1.59 0.34 -0.47 -1.12 -0.45 -0.33 0.3 -4.71 -0.97 0.63 0.44 -2.94 -0.16 -2.78 -4.83 -1.91 0.5 -0.54 -0.81 -1.07 -5.37 0.88 -2.99 -0.54 0.8 -0.32 -3.66 0.94 -3.33 -3.05 -0.42 -3.04 -0.26 -1.88 -4.83 -3.32 1.55 0.94 0.96 0.97 -0.08 0.24 -0.25 1.07 -0.99 1.06 -1.61
CRP60019 (cobD)
 1.02 -1.23 -0.19 -0.57 1.32 1.81 -0.07 -4.09 -2.39 0.35 0.61 0.69 0.8 -0.64 -0.0 0.64 -0.49 1.28 -0.15 -0.14 0.11 0.14 -1.57 -2.26 1.28 1.57 -0.12 -0.69 0.39 -2.22 0.1 -0.53 -0.64 -0.36 -0.33 -0.96 -4.69 -0.77 -1.21 -0.62 -2.13 0.39 -2.27 -5.09 -2.21 -0.4 -1.85 -0.2 -0.44 -4.35 -0.49 -2.13 0.27 0.97 -1.75 -4.42 1.56 -3.99 -2.57 0.31 -2.28 0.4 -2.47 -5.56 -4.75 1.32 1.07 1.01 0.96 0.42 0.36 0.16 1.23 -2.2 1.49 -3.15
1.35 -1.53 0.29 -0.66 1.65 1.14 -0.05 -3.82 -2.01 0.56 0.45 0.66 0.5 -0.85 -0.24 0.31 -0.07 1.27 -0.1 -0.13 0.17 0.09 -1.16 -2.24 1.46 1.78 -0.25 -1.35 0.01 -1.11 0.12 -0.42 -0.76 -0.85 -0.06 -0.75 -3.63 -1.14 -0.36 -0.42 -2.64 0.2 -2.72 -3.95 -1.98 -0.27 -0.23 -0.56 -0.91 -3.64 0.64 -2.45 -0.14 0.73 -0.13 -2.93 0.96 -4.07 -2.87 -0.25 -2.66 0.08 -2.57 -5.36 -4.02 1.54 0.92 1.01 1.06 0.18 0.06 -0.18 1.19 -3.21 1.85 -3.02
CRP60089 (cobB_1)
 1.21 -1.07 -0.02 -0.3 1.54 0.71 0.19 -3.11 -0.78 0.27 0.44 0.56 0.38 -1.18 0.19 0.6 0.12 1.32 -0.3 -0.09 0.2 0.08 -1.32 -2.03 1.22 1.26 -0.09 -0.97 -0.01 -1.51 0.1 -0.36 -0.65 -0.64 -0.29 -1.65 -3.1 -0.8 -1.01 -0.92 -1.72 1.04 -1.75 -3.25 -1.68 0.42 0.04 0.18 -0.16 -2.95 1.05 -1.69 0.75 0.74 0.17 -2.87 0.92 -3.16 -1.88 0.73 -1.55 0.88 -2.01 -4.38 -3.69 0.41 0.53 0.51 0.28 0.04 -0.09 0.17 1.23 -0.79 1.16 -2.33
CRP61017 (oprM_6)
 -2.35 -1.83 1.01 0.1 2.82 -1.28 -1.12 -3.19 -3.63 1.26 1.81 1.84 2.07 0.67 -0.73 2.42 -0.21 -0.94 1.86 2.14 2.05 1.45 -1.41 0.23 0.01 -0.29 -4.1 -1.65 -3.05 -0.68 -3.96 -0.62 -0.99 -2.35 -2.43 -0.82 0.33 -3.0 -1.79 -2.81 -2.72 -3.63 -1.25 -0.11 -2.51 -1.07 - -2.32 -1.4 -0.12 -2.41 -2.67 -3.44 -2.91 -2.91 - -1.82 -2.72 -1.67 -3.63 -2.1 -3.15 -2.47 -3.31 -2.6 -1.89 0.83 -1.63 -0.89 -0.92 -2.5 -0.24 -0.84 -1.85 2.79 -4.73
CRP63072 (dapE)
 0.27 -1.17 -1.15 1.87 0.95 0.08 0.11 -1.27 -1.51 0.33 0.07 0.11 -0.01 -0.03 0.19 0.54 0.54 0.82 -0.71 0.42 -0.7 0.14 -2.69 -1.18 0.25 0.73 -0.19 -1.12 -0.54 -2.21 -0.01 -0.22 -1.65 0.62 -1.33 -0.22 -2.96 -0.68 0.15 -0.21 0.77 0.94 -1.38 -3.2 -0.57 -1.23 -0.77 -0.59 -0.13 -2.68 -1.15 0.46 0.83 0.03 -0.56 -1.01 0.25 -1.29 -0.25 0.66 -0.15 0.87 -1.03 -1.61 -1.94 1.47 1.46 1.02 0.95 -0.03 -0.17 -0.28 0.58 -1.33 0.44 -0.67
CRP63101 (rlmA)
 0.57 -1.23 -0.94 1.95 1.18 0.43 -0.53 -0.94 -1.58 0.04 -0.16 -0.13 -0.18 -0.87 -0.79 0.63 0.36 0.56 -0.68 0.09 -0.35 -0.27 -2.52 -1.7 0.2 0.65 -0.59 -1.63 -0.39 -2.77 -0.23 -0.31 -1.24 0.46 -1.67 -1.11 -1.72 -0.77 -0.7 -0.7 1.25 1.55 -1.8 -1.61 -1.11 -1.32 -0.94 -0.94 -0.82 -2.02 -0.94 0.88 1.39 -0.17 -0.86 -2.35 0.57 -1.84 0.41 1.27 0.5 1.38 -1.66 -3.27 -3.02 1.48 1.22 1.03 0.64 -0.36 -0.61 -0.33 0.34 -2.18 1.3 -1.28
CRP75098 (hrpB_4)
 0.65 -0.89 - 0.45 1.53 1.08 -2.13 -1.23 -1.74 0.24 0.5 0.64 0.68 -0.19 0.05 1.2 -0.31 0.14 0.13 0.99 0.43 0.16 -0.96 -0.7 1.17 1.0 -0.39 -0.29 -0.29 -0.64 -0.26 -0.0 0.69 -0.06 -1.0 -0.64 -1.86 -0.88 -0.48 -0.42 -0.76 -0.72 -0.79 -2.01 -0.76 0.37 -0.93 0.02 0.24 -1.99 0.66 -0.84 -1.05 0.4 -0.77 -4.27 1.1 -1.61 -0.89 -0.91 -1.34 -0.83 -1.4 -2.06 -2.21 1.24 1.57 -0.63 1.19 0.07 -0.05 -0.25 0.17 -0.49 1.49 -1.52
CRP78868 (cobB_3)
 0.77 -0.51 -0.62 0.7 1.22 0.53 -0.7 -1.57 -0.68 -0.09 -0.16 -0.04 -0.19 -0.35 -0.7 0.93 0.43 -1.24 -0.14 0.31 0.26 -0.27 -0.77 -0.33 1.85 0.77 -1.22 0.0 -1.79 0.25 -1.11 0.07 0.62 -0.19 -1.11 -0.45 -1.87 -0.6 -0.94 -0.99 1.4 -1.11 -0.61 -1.84 -1.08 0.51 -0.69 -0.12 0.79 -1.73 0.57 1.09 -0.97 0.0 -0.49 -4.17 0.58 -0.96 1.61 -1.3 1.31 -0.98 -1.28 -1.74 -1.28 0.01 0.74 0.16 0.25 -0.87 -0.22 -0.17 -1.34 -0.81 1.49 -1.57

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.