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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)
| Gene | AES-1R,ASMDM+ | AG1,ciproflaxin | D+7bld | DK2 | E01 | LB | LB,log | LB,untreated | PA1201 | PA14 | PA14,0.25xMIC G3KL | PA14,0.25xMIC T7 | PA14,0.25xMIC polymyxin-B | PA14,LB | PA14,LB,log | PA14,WT | PA14,ciproflaxin | PA14,cmrA+ | PA14,late stat,NaPyruvate+Arabinose | PA14,late stat,untreated | PA14,sutA-KO,late stat,NaPyruvate+Arabinose | PA14,untreated | PA212 | PA2596 | PA558 | PA580 | PAK,LB | PAK,WT | PAK,WT,LB | PAK,pilR | PAK,pmrB6,LB | PAO1 | PAO1,0.56mg/mL farnesol | PAO1,ABTGC | PAO1,DDS | PAO1,GUN,LB,glucose | PAO1,HapZ,early stat | PAO1,LB | PAO1,LB,glucose | PAO1,LB,untreated | PAO1,M9-CA,early stat | PAO1,M9-CA,log | PAO1,RsmN+ | PAO1,SagS,early stat | PAO1,WT | PAO1,WT,BHI | PAO1,WT,LB | PAO1,WT,MOPS acetate | PAO1,WT,MOPS glycerol | PAO1,early stat | PAO1,ersA,BHI | PAO1,lasR rhlR,M9-CA,early stat | PAO1,lasR rhlR,M9-CA,log | PAO1,liquid culture | PAO1,mexZ,LB | PAO1,oxylipin- | PAO1,pBAD-yhjH | PAO1,pUCP18::msr(E) | PAO1,qslA,M9-CA,early stat | PAO1,qslA,M9-CA,log | PAO1,qteE,M9-CA,early stat | PAO1,qteE,M9-CA,log | PAO1,untreated | PAO1,wspFpelApslBCD,LB | PAO1,wspFpelApslBCD,LB,untreated | Y31,LB | Y71,LB | Y82,LB | Y89,LB | ciproflaxin | liquid culture | m pheno | mexT | nirS | pHerdB20T-gp68 | untreated |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| - | - | -2.42 | 5.23 | -4.01 | -2.01 | - | 4.66 | - | -1.71 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | -3.04 | - | - | -1.72 | - | - | -1.36 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -2.6 | -0.8 | 3.31 | |
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 6.25 | - | - | |
| - | - | 1.89 | 2.64 | - | -0.88 | - | 5.43 | - | -1.62 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.13 | - | - | - | - | - | - | - | - | -2.24 | - | - | -0.95 | - | - | -0.19 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.39 | 1.25 | 1.68 | |
| - | 0.86 | 2.44 | - | - | - | -0.29 | 5.16 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.03 | -1.16 | 1.18 | -1.97 | -0.89 | -1.6 | 1.52 | -5.5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | 2.48 | -2.56 | 0.66 | -1.8 | -1.69 | - | -0.8 | 1.68 | 3.37 | |
| - | - | 5.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.39 | - | 4.24 | - | - | |
| -0.81 | - | -1.9 | - | 3.09 | - | 0.43 | 0.92 | -0.98 | 0.03 | -2.37 | -2.36 | -0.55 | - | - | -2.92 | -1.42 | - | - | - | - | -2.4 | - | - | -8.0 | -2.2 | -2.62 | -0.96 | -1.76 | - | -0.51 | 0.34 | -0.14 | - | -4.82 | 0.6 | -1.41 | -0.08 | 1.48 | 0.98 | 2.79 | 1.8 | -17.37 | -0.4 | -3.55 | - | - | - | - | -1.19 | - | 2.79 | 1.67 | 1.15 | - | -7.15 | 0.9 | -13.94 | 2.45 | 0.62 | 2.97 | 1.65 | -1.69 | - | - | - | - | - | - | -0.85 | - | 1.55 | - | - | - | -0.55 | |
| 0.03 | -1.18 | -0.16 | 1.1 | 1.77 | -0.0 | 1.16 | 2.9 | -0.18 | -0.33 | -1.21 | -1.05 | -1.28 | -0.52 | 0.14 | -1.1 | -0.79 | -2.14 | -1.22 | -0.04 | -0.64 | -1.09 | -0.11 | - | 0.76 | 0.71 | -1.86 | -1.1 | -2.1 | -1.1 | -1.88 | 0.04 | -0.06 | -1.15 | 1.11 | 1.36 | -0.47 | -1.89 | 1.44 | 1.68 | -2.45 | -2.04 | -0.51 | -0.29 | -1.59 | -0.85 | -3.91 | -0.85 | -0.7 | -0.23 | -1.05 | -3.25 | -2.75 | -1.33 | -2.84 | -7.07 | -0.4 | -0.52 | -2.47 | -2.61 | -2.58 | -2.29 | -0.84 | -1.15 | -0.49 | -1.11 | -1.53 | -1.27 | -1.42 | 0.83 | -0.62 | 0.69 | -2.04 | 1.96 | 1.19 | 2.72 | |
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 6.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | 6.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | 3.53 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 6.01 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | 6.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | 5.51 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.93 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | 0.21 | 5.33 | - | -2.39 | - | 4.16 | - | -2.19 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.64 | - | - | - | - | - | - | - | - | -2.0 | - | - | - | - | - | -2.74 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.82 | 1.49 | |
| -0.49 | -1.54 | 0.66 | -2.39 | 0.63 | 0.57 | -2.07 | 3.86 | -2.36 | -0.02 | -0.78 | -0.83 | -0.35 | 0.4 | -2.7 | -1.6 | -0.67 | -3.56 | 0.77 | -3.57 | -0.68 | -0.64 | -0.32 | -1.48 | -1.12 | -1.32 | 0.67 | -0.8 | 0.39 | -1.25 | 0.21 | 0.95 | -0.59 | -8.51 | 0.01 | -1.06 | -0.73 | -0.13 | 0.5 | 1.29 | -1.23 | -6.03 | -2.16 | -1.34 | -0.28 | -1.64 | -2.93 | -6.32 | -6.62 | -1.33 | -1.97 | -2.33 | -5.23 | -1.46 | -2.85 | -1.06 | 0.1 | -0.63 | -2.24 | -6.79 | -2.38 | -6.24 | 0.17 | 0.04 | -1.66 | -1.03 | -1.33 | -2.37 | -1.14 | -2.59 | -1.12 | -1.45 | -3.84 | 3.58 | 2.45 | 0.42 | |
| -3.13 | -5.12 | -1.12 | -1.1 | -2.5 | 0.3 | 0.33 | -0.69 | 0.47 | -0.39 | -1.74 | -1.73 | -1.78 | - | 0.93 | -2.42 | -1.09 | -1.19 | -2.35 | - | -1.7 | -0.8 | 1.5 | -1.56 | -3.81 | -2.97 | -2.77 | -0.12 | -0.68 | -0.44 | -3.13 | 0.42 | -0.89 | -7.06 | -0.85 | -0.44 | -1.97 | 1.07 | -1.06 | -2.29 | 2.88 | 1.14 | 0.38 | -1.84 | -0.9 | -1.27 | -1.31 | -1.6 | -1.77 | -2.07 | -1.07 | 3.03 | 1.3 | -3.23 | -1.25 | 0.86 | -2.2 | -2.87 | 2.81 | 1.1 | 2.99 | 1.41 | -2.48 | -2.69 | -2.14 | -7.59 | -7.67 | -7.16 | -7.1 | -3.39 | - | -1.44 | -1.04 | -0.01 | -1.06 | 1.32 | |
| -4.35 | - | -2.74 | -0.81 | -1.9 | -4.41 | -2.73 | 1.96 | -4.4 | -1.89 | -1.72 | -1.78 | -1.62 | - | -2.2 | -1.83 | -5.18 | -3.57 | -1.5 | - | -1.41 | -1.95 | -3.76 | -3.25 | -2.84 | -3.13 | -1.53 | -2.46 | -2.82 | -2.34 | -1.16 | -0.15 | -1.81 | - | -3.5 | -0.94 | -4.94 | 2.64 | -0.36 | -2.3 | 3.79 | -1.8 | -4.01 | -5.44 | -3.45 | -3.74 | -2.47 | - | - | -5.63 | -4.04 | 3.01 | 2.95 | 0.53 | -3.46 | -8.4 | -1.72 | -5.39 | 2.83 | 2.41 | 2.76 | 0.74 | -2.84 | -5.55 | -5.77 | - | - | - | - | 0.02 | - | -3.44 | -3.13 | -1.94 | -1.14 | 1.01 | |
| - | 5.37 | 2.87 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.25 | - | - | -0.54 | - | - | - | - | - | 0.66 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -2.88 | - | 3.93 | - | - | - | - | |
| - | 5.47 | 3.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.03 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -4.42 | - | 4.16 | - | - | - | - | |
| - | 5.86 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.16 | - | - | - | - | |
| - | 6.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.13 | - | - | - | - | |
| - | 5.94 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.87 | - | - | - | - | |
| - | 5.79 | -6.02 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.99 | - | - | - | - | - | - | - | - | -3.51 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.22 | - | - | - | - | |
| - | 5.61 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.76 | - | - | - | - | |
| - | 2.29 | 6.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -5.81 | - | 0.9 | - | - | - | - | |
CRO33356 (Int-Tn) | - | 3.43 | 5.29 | - | - | - | - | - | - | -1.91 | -1.6 | -1.74 | -1.42 | -3.06 | -1.26 | -2.46 | -1.55 | -2.25 | -3.08 | -3.54 | -2.94 | -1.78 | -1.79 | -3.33 | - | - | - | - | - | - | - | -3.54 | - | - | - | - | - | -10.37 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -5.66 | -6.74 | 4.32 | - | -0.22 | -7.04 | 0.18 | -1.76 | - | - | - |
| - | 4.8 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.32 | - | - | - | 3.03 | - | - | - | - | |
| - | 3.66 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -9.84 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -3.81 | -5.63 | 5.8 | -6.19 | - | - | 2.92 | - | - | - | - | |
CRO33524 (hsdR_1) | - | 4.23 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -14.48 | - | - | - | - | - | -9.38 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -9.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -3.63 | -6.17 | 5.72 | -6.15 | - | - | 2.11 | - | - | - | - |
CRO33563 (namA_2) | - | 2.7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.57 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -9.65 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -5.36 | 4.52 | 3.88 | 4.1 | - | 1.93 | 2.31 | - | - | - | - |
CRO33599 (qorA_2) | - | 2.69 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.42 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -9.51 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -3.63 | 4.49 | 3.94 | 3.94 | - | 1.75 | 2.93 | - | - | - | - |
CRO33629 (ycnE_2) | - | 2.61 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.78 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.91 | 4.06 | 3.9 | - | 2.33 | 3.51 | - | - | - | - |
| - | 2.95 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.96 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -9.9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -6.18 | 3.98 | 3.98 | 3.61 | - | 1.92 | 3.7 | - | - | - | - | |
CRO33692 (nhaA) | - | 2.23 | - | - | - | - | - | 1.68 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -7.47 | 2.41 | - | 2.58 | - | - | - | - | - | -1.68 | - | - | - | - | - | -9.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -4.66 | 4.33 | 4.02 | 3.88 | -0.24 | -1.89 | 0.63 | - | - | - | 1.42 |
CRO33724 (uvrA_1) | - | 2.66 | - | - | - | - | - | 3.15 | -7.06 | -12.2 | - | - | - | -6.8 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.76 | - | 2.88 | - | - | - | - | - | -1.31 | - | - | - | - | - | -9.14 | - | - | - | - | -7.3 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -7.24 | 3.85 | 3.96 | 3.08 | -0.68 | -0.42 | 1.6 | - | - | - | 2.77 |
| - | 2.38 | -2.69 | - | - | - | -6.03 | -2.07 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.35 | - | -3.06 | - | - | - | - | - | -6.84 | - | - | - | - | - | -10.98 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -4.95 | 4.98 | 3.51 | 4.29 | -3.68 | -2.45 | 0.8 | - | - | -2.04 | -2.03 | |
| - | 3.64 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.43 | 2.99 | - | - | - | - | - | - | - | -0.99 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -4.59 | 3.85 | 3.72 | 4.05 | 0.84 | 1.13 | 0.51 | - | - | - | - | |
CRO33846 (luxA) | - | 3.22 | - | - | - | - | - | - | - | -11.09 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.89 | 2.76 | - | - | - | - | - | - | - | -0.76 | - | - | - | - | - | -11.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -3.82 | 4.25 | 3.75 | 4.21 | 0.35 | 0.05 | 1.17 | - | - | - | - |
CRO33881 (nemA_1) | - | 2.61 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -8.03 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.34 | 2.09 | - | - | - | - | - | - | - | -0.73 | - | - | - | - | - | -12.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -8.44 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -5.84 | 4.6 | 3.11 | 4.55 | 0.44 | -0.17 | 0.41 | - | - | - | - |
| - | 3.06 | - | - | - | - | -4.86 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.89 | 2.87 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.23 | 3.49 | 4.13 | -0.34 | 0.07 | 1.21 | - | - | - | - | |
CRO33942 (dmlR_9) | - | 4.44 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -6.23 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.8 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -10.71 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.92 | 5.03 | 2.27 | - | 1.57 | 2.73 | - | - | - | - |
| - | 4.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.58 | - | - | - | - | - | - | - | -5.65 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -4.5 | 3.86 | 3.68 | 3.92 | - | -0.16 | 1.32 | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | - | - | 5.93 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -1.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.86 | |
CRO34072 (frmA_2) | - | 0.89 | - | - | - | - | - | 4.58 | -8.89 | -13.92 | - | - | - | -9.89 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.49 | - | 0.72 | - | - | - | - | -10.48 | -4.23 | - | - | - | - | - | -10.79 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -6.75 | 3.43 | 1.67 | 3.52 | 0.33 | -1.23 | -0.48 | - | - | - | 3.23 |
| - | 1.67 | - | - | - | - | - | 4.32 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.26 | - | 3.01 | - | - | - | - | - | -2.82 | - | - | - | - | - | -11.04 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.51 | 2.0 | 3.58 | 1.02 | -0.79 | 0.05 | - | - | - | 2.05 | |
| - | 1.42 | - | - | - | - | - | 3.72 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.32 | - | -0.15 | - | - | - | - | - | -4.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -4.58 | 4.04 | 3.21 | 3.59 | -1.75 | -0.81 | 1.0 | - | - | - | 3.08 | |
| - | 3.53 | - | - | - | - | - | 1.04 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.18 | - | -1.28 | - | - | - | - | - | -4.78 | - | - | - | - | - | -11.77 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -3.89 | 4.42 | 3.35 | 4.0 | -2.29 | 0.58 | 0.87 | - | - | - | 0.77 | |
CRO34188 (rhaS_1) | - | 2.63 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.13 | - | - | - | - | - | - | - | -9.2 | - | - | - | - | - | -10.4 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -3.69 | 4.39 | 3.94 | 4.2 | - | 0.93 | 2.13 | - | - | - | - |
| - | 3.38 | - | - | - | - | - | - | - | -10.48 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.01 | - | - | - | - | - | - | - | -8.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -4.43 | 4.0 | 4.02 | 3.99 | - | 1.84 | 2.52 | - | - | - | - | |
| - | 1.96 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.7 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.83 | 3.56 | 4.02 | - | -0.8 | 1.12 | - | - | - | - | |
CRO34272 (dmlR_10) | - | 4.04 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.59 | - | - | - | - | - | - | - | -12.9 | - | - | - | - | - | -10.68 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -4.65 | 3.96 | 3.95 | 4.1 | - | 1.13 | 1.6 | - | - | - | - |
CRO34304 (qorA_3) | - | 3.96 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -6.54 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.42 | - | - | - | - | - | - | - | -12.07 | - | - | - | - | - | -10.69 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -7.01 | - | - | - | - | - | - | - | - | -4.97 | 3.73 | 4.12 | 3.68 | - | -0.27 | 3.43 | - | - | - | - |
| 1.08 | -0.55 | 2.78 | -0.69 | 0.8 | -0.35 | -0.26 | -1.01 | 0.6 | -0.08 | 1.09 | 0.73 | -0.04 | 0.0 | -0.42 | -0.02 | -1.3 | -1.44 | -0.71 | -0.11 | -0.53 | 0.14 | 0.39 | 0.79 | 0.58 | 0.33 | 0.02 | -0.48 | -0.41 | -0.55 | 0.0 | -0.04 | 0.74 | -0.58 | -0.74 | 0.23 | -1.28 | 0.22 | -0.38 | -0.51 | -0.02 | -1.2 | -0.8 | -1.47 | -0.36 | 0.47 | -0.94 | -0.98 | -0.81 | -1.15 | 0.74 | 0.05 | -0.76 | -0.88 | -1.03 | 0.48 | -0.9 | -0.0 | -0.08 | -0.94 | 0.11 | -1.03 | -0.65 | -0.6 | -0.13 | 0.53 | 0.13 | 0.29 | 0.38 | -0.33 | -1.01 | -1.19 | -1.55 | 0.14 | 0.83 | -0.75 | |
CRO38074 (hupB_2) | -2.08 | -0.29 | 1.2 | -1.52 | -2.47 | 0.48 | -0.17 | -1.51 | -0.25 | -0.22 | -1.34 | -1.24 | -1.26 | -1.41 | -0.27 | -1.02 | -2.92 | -0.78 | 0.37 | -1.23 | 0.35 | -1.35 | -0.59 | -1.08 | 0.1 | 0.68 | -0.9 | -0.91 | -0.02 | -1.35 | -0.85 | 0.11 | 0.51 | -0.26 | 0.21 | -1.23 | -2.35 | 0.8 | -1.54 | -1.79 | 2.09 | 0.88 | -0.46 | -2.43 | -1.82 | 0.17 | -0.9 | 1.14 | 0.34 | -2.07 | 0.04 | 2.19 | 1.33 | 0.4 | -0.84 | -1.21 | 0.6 | -0.05 | 1.85 | 1.17 | 1.84 | 1.12 | -0.05 | -0.6 | -0.08 | -0.89 | -1.75 | -1.58 | -1.32 | 0.53 | -0.59 | -0.33 | -0.67 | -1.24 | -1.58 | -0.23 |
CRO47144 (acpP_2) | -1.16 | 0.53 | 1.08 | -1.45 | -1.56 | 0.67 | 0.75 | -0.27 | -1.48 | -0.61 | -0.58 | -0.57 | -0.6 | -0.82 | 0.36 | -2.0 | -3.83 | 0.86 | 0.28 | 0.04 | 0.25 | -0.61 | -0.95 | -1.81 | -1.2 | -0.82 | 0.45 | -0.34 | 1.34 | -0.65 | 0.28 | 0.13 | -0.01 | 0.21 | -0.52 | 0.94 | -1.5 | 0.13 | 0.42 | 0.68 | 0.81 | 0.91 | -0.67 | -1.52 | -0.45 | -0.99 | 0.84 | 0.23 | -0.51 | -1.43 | -0.08 | 1.25 | 1.05 | -0.07 | 0.81 | -0.75 | 0.46 | -1.56 | 0.45 | 0.76 | 0.51 | 0.74 | -0.68 | -1.63 | -1.78 | -0.55 | -1.25 | -0.84 | -0.98 | -0.08 | -0.2 | -0.3 | 0.86 | -3.79 | -2.03 | 1.56 |
| -3.04 | -1.88 | 4.69 | -0.69 | 1.23 | 0.74 | -0.3 | -0.68 | -2.65 | -1.16 | 0.24 | -0.02 | -0.72 | -0.22 | -1.9 | -1.32 | -1.67 | -1.76 | -0.9 | -3.0 | -0.7 | -0.02 | -2.55 | -3.17 | -1.81 | -1.31 | -1.33 | -0.56 | 0.25 | -1.54 | -0.95 | -0.89 | -2.15 | -2.57 | -1.7 | 1.01 | 0.45 | 0.3 | 0.88 | -0.5 | 0.38 | -1.26 | -1.76 | 0.65 | -0.73 | -1.58 | -1.48 | -0.4 | 0.41 | 0.53 | -1.92 | 0.23 | -0.66 | -1.26 | -2.25 | -8.67 | -0.81 | -1.59 | 0.13 | -0.96 | 0.26 | -1.37 | -0.89 | -1.05 | -1.87 | -2.65 | -0.91 | -1.49 | -1.19 | 0.86 | -0.22 | -1.1 | -1.69 | -1.0 | -0.87 | -0.1 | |
| - | 5.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.17 | - | - | - | 2.82 | - | - | - | - | |
| - | 5.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -2.31 | - | 4.59 | - | - | - | 3.63 | - | -3.79 | - | - | |
CRO74372 (rpmJ) | - | - | 5.64 | 2.97 | -1.96 | -3.57 | - | 0.26 | - | 1.88 | - | - | - | - | - | - | -0.46 | - | - | - | - | - | 2.18 | -2.23 | - | - | - | - | - | - | - | 0.36 | - | - | 1.37 | - | - | -1.99 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.93 | 0.85 | 0.34 |
| 0.55 | -2.45 | - | -0.0 | 1.78 | -1.06 | -0.36 | 3.34 | 1.76 | -2.34 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.53 | - | 1.25 | 0.89 | - | - | - | - | - | 1.16 | 1.25 | -7.2 | 0.55 | 0.94 | 0.2 | -0.28 | 1.16 | 1.73 | -0.44 | -2.33 | -2.85 | -0.05 | 0.84 | -0.11 | -0.09 | -4.16 | -4.36 | 0.11 | -0.39 | -0.58 | -2.58 | -0.87 | 0.13 | 1.65 | 1.05 | 0.27 | -0.61 | -3.03 | -0.63 | -1.69 | 0.37 | -0.34 | -1.24 | -2.86 | -3.52 | -2.69 | -4.52 | -0.2 | 0.6 | -0.06 | - | 0.69 | 0.91 | 2.09 | |
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
CRO95203 (minE) | -0.59 | -0.66 | 0.26 | -1.85 | -2.84 | 0.98 | 1.19 | -1.01 | -1.13 | -0.43 | 0.06 | 0.01 | -0.08 | -0.2 | 1.07 | -1.23 | -1.83 | 0.24 | -0.1 | 0.26 | 0.11 | -0.2 | -0.76 | -1.58 | 0.64 | 0.54 | 0.19 | -0.14 | 0.1 | -0.07 | 0.08 | -0.07 | -0.66 | 0.29 | -0.35 | 0.12 | -3.35 | -0.47 | 0.06 | -0.25 | 0.92 | 0.28 | 0.43 | -3.8 | -0.57 | 0.24 | 0.16 | 1.24 | 0.69 | -2.99 | 0.55 | 0.7 | 0.37 | -0.28 | 0.18 | 0.23 | 0.36 | -1.17 | 0.75 | 0.18 | 0.62 | 0.51 | -0.21 | -2.09 | -2.05 | -0.17 | -0.03 | 0.16 | 0.24 | -0.48 | -0.07 | 0.37 | 0.33 | -2.42 | -0.53 | 0.61 |
| - | - | 6.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
CRP04348 (rcsB_3) | 0.72 | -0.42 | -1.06 | -0.01 | 1.17 | -0.57 | 0.14 | -1.18 | -0.48 | 3.24 | 0.89 | 0.8 | 0.78 | 0.14 | -0.13 | 0.54 | 0.51 | -0.6 | 0.48 | 1.08 | 0.54 | 0.44 | -1.17 | 0.26 | 0.63 | 0.92 | -0.54 | 0.09 | -1.57 | 0.24 | -0.43 | -0.18 | 0.38 | -0.39 | -1.03 | -0.82 | 0.07 | -1.34 | -1.59 | -1.93 | -2.13 | -3.54 | -0.73 | -0.28 | -0.09 | -0.87 | -2.09 | -0.19 | 0.43 | 0.13 | -1.09 | -2.37 | -3.63 | -0.53 | -1.83 | -0.97 | -0.41 | -0.61 | -1.77 | -3.29 | -2.26 | -3.09 | -0.81 | -0.58 | -1.21 | -0.11 | 0.78 | 0.53 | 0.17 | 0.36 | -1.36 | -0.16 | -0.62 | 0.74 | 0.92 | -1.49 |
| - | 6.04 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.36 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | 2.73 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -3.43 | 4.96 | 3.33 | 4.61 | - | 1.92 | - | - | - | - | - | |
| - | 5.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.28 | - | - | - | -0.01 | - | - | - | - | |
| - | - | 2.03 | 2.59 | 2.95 | -0.06 | - | 4.45 | -1.78 | 0.62 | 0.16 | -0.19 | 0.44 | - | - | 1.42 | 0.8 | - | - | - | - | 0.1 | 0.17 | 1.59 | - | - | -0.6 | -3.13 | -0.45 | - | -0.55 | -0.31 | 0.17 | - | -0.45 | - | -2.29 | -2.2 | - | - | -3.43 | -5.41 | - | -2.53 | -3.66 | - | - | - | - | -3.03 | - | -4.17 | -5.3 | - | - | - | -1.2 | -2.86 | -3.73 | -4.41 | -2.97 | -4.54 | -3.23 | -1.8 | -2.9 | - | - | - | - | - | - | -0.86 | - | 1.25 | 1.52 | 2.9 | |
| - | - | -3.48 | 4.87 | 1.03 | -0.84 | - | 4.94 | - | -1.01 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.9 | - | - | - | - | - | - | - | - | -1.48 | - | - | -0.59 | - | - | -0.96 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -1.57 | 1.37 | 2.95 | |
| -0.12 | 0.28 | -0.31 | -0.52 | 0.11 | 0.31 | -1.84 | -2.02 | -0.61 | 0.26 | 1.06 | 0.96 | 0.87 | 1.9 | -0.28 | 0.35 | -0.68 | -1.46 | 0.32 | 1.37 | 0.4 | 0.65 | -0.31 | 0.17 | -0.56 | -0.33 | -1.83 | -0.72 | -1.86 | -0.34 | -1.55 | 0.03 | 0.3 | -0.4 | -1.68 | -0.22 | 1.58 | -0.03 | -0.63 | -0.63 | -0.66 | -1.75 | -0.71 | 1.34 | 0.02 | 0.3 | -1.46 | -0.67 | 0.24 | 1.51 | 0.09 | -0.99 | -1.8 | -0.48 | -1.38 | -1.34 | -0.22 | -0.05 | -0.57 | -1.61 | -0.66 | -1.75 | 0.05 | -0.36 | -0.49 | 0.64 | 0.69 | 0.41 | 0.47 | -0.64 | 0.34 | 1.1 | -1.44 | -0.61 | -0.05 | -2.21 | |
| -1.93 | 0.3 | 2.52 | 3.06 | -1.22 | -0.53 | 1.59 | 0.34 | -0.64 | -0.53 | 0.49 | 0.49 | 1.55 | -1.39 | -1.25 | -0.74 | -2.45 | -1.67 | -1.62 | -2.05 | -1.14 | 0.29 | -0.37 | -1.5 | 1.6 | 2.1 | 1.25 | -1.81 | -2.36 | -2.94 | 1.39 | 0.22 | 0.47 | -1.89 | -0.96 | -2.98 | -2.06 | 0.18 | -3.12 | -2.55 | -1.9 | -2.2 | -1.56 | -2.4 | -0.52 | 0.31 | -0.76 | -2.85 | -1.96 | -2.22 | 0.42 | -2.24 | -2.5 | -2.41 | -0.69 | -5.15 | -0.14 | -1.21 | -2.08 | -3.28 | -1.98 | -2.77 | -1.57 | -2.83 | -1.96 | 0.53 | 0.89 | -0.01 | -0.4 | 0.26 | -2.95 | 1.66 | -1.32 | -0.74 | 0.82 | 1.52 | |
| - | - | 4.61 | 5.36 | -0.34 | -1.11 | - | 1.36 | - | -1.04 | - | - | - | - | - | - | 1.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -1.11 | - | - | 0.55 | - | - | -3.81 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.41 | -0.6 | -0.6 | |
| -1.9 | 1.77 | 2.24 | 3.81 | -0.67 | 1.39 | 0.82 | -1.75 | -2.68 | -1.37 | -1.23 | -1.15 | 1.82 | -1.9 | -2.57 | -2.43 | -2.41 | -3.17 | -1.87 | -2.31 | -1.57 | -1.5 | -2.81 | -2.79 | -0.51 | 0.8 | 1.3 | -2.76 | -3.42 | -2.8 | 1.78 | -0.58 | -2.15 | -0.63 | -2.47 | -3.16 | -2.95 | -0.08 | -3.48 | -3.57 | -2.6 | -3.21 | -2.31 | -3.56 | -1.67 | -0.93 | -2.11 | -2.47 | -1.33 | -3.04 | -1.18 | -2.65 | -3.24 | -2.89 | -1.9 | -6.13 | -0.58 | -1.48 | -2.65 | -3.44 | -2.73 | -2.97 | -1.94 | -3.97 | -3.8 | 1.92 | 2.42 | 0.98 | 0.71 | 0.81 | -3.54 | 0.27 | -2.88 | -2.32 | 0.34 | 2.67 | |
CRP68242 (xerD_3) | - | -0.63 | 4.97 | - | - | -13.39 | - | -12.84 | - | 0.3 | - | - | - | - | - | - | -3.74 | - | -3.16 | -11.82 | -6.56 | - | -9.6 | - | - | - | - | -0.25 | -10.97 | - | - | 2.45 | - | - | - | - | -11.24 | -13.92 | - | - | - | - | 4.33 | -10.88 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.41 | - | - | - | - | - | -2.7 | - | - | -9.05 | 0.75 | -0.21 | 0.46 | - | 0.54 | - | - | - | - | - |
| - | - | - | - | - | - | 5.37 | - | - | 2.36 | - | - | - | - | - | - | 3.87 | - | - | - | - | - | 1.21 | - | - | - | - | - | - | - | - | -3.71 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.62 | - | - |
Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.